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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-07-07 |
Cut the noise or couple up: Coordinating circadian and synthetic clocks
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103051
PMID:34568785
|
综述 | 本文综述了生物钟与合成生物钟之间的协调机制,强调了耦合与异质性在昼夜节律钟中的重要作用,并整合了时间生物学与合成生物学领域,探讨其振荡器的关键设计原理 | 揭示了昼夜节律钟之间耦合与异质性的有趣二分法,并首次将合成生物学振荡器与昼夜节律振荡器进行平行比较,整合两个领域的设计原则 | NA | 探讨生物钟与合成生物钟的协调机制,并整合时间生物学与合成生物学的设计原则 | 昼夜节律钟和合成生物钟振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 振荡器 | 农业,生态学,发育生物学,医学 |
| 1182 | 2026-07-06 |
Riboregulation in bacteria: From simple switches to complex regulatory networks
2026-06-07, Postepy biochemii
DOI:10.18388/tkbrr231
PMID:42400427
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综述 | 本文综述了细菌中核糖调控从简单开关到复杂调控网络的作用机制和应用 | 系统总结了核糖调控的多层网络特性,包括sRNA结合蛋白和RNA海绵的调控作用,并强调了Hfq-CLASH等现代方法在体内识别这些相互作用的应用 | 未提供具体实验数据或定量分析来支持所述机制 | 阐述细菌核糖调控在适应性中的关键作用及其在合成生物学和抗抗生素耐药性中的应用 | 细菌的核糖调控元件,包括核糖开关、温度传感器、反义RNA和sRNA网络 | 合成生物学 | NA | Hfq-CLASH | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 核糖调控网络,包括开关、传感器和调控回路 | 合成生物学, 医学 |
| 1183 | 2026-07-06 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
|
综述 | 综述了mRNA化学和拓扑工程的最新进展,涵盖酶促、化学和混合方法扩展修饰库、线性/环状/分支mRNA拓扑合成策略、结构-活性关系及下一代mRNA治疗应用 | 首次系统性整合mRNA的化学可编程性与拓扑工程(如环状RNA、分支结构、合成套索结构)两个维度,突破传统序列设计范式 | 部分拓扑结构(如合成套索)的体内稳定性与免疫原性数据尚不充分,大规模临床应用仍需验证 | 系统阐述化学与拓扑工程如何调控mRNA稳定性、免疫原性和翻译效率,推动下一代mRNA疗法发展 | 信使RNA(mRNA)分子及其化学修饰与拓扑结构 | 数字生物学, 合成生物学 | 传染病, 肿瘤, 遗传病 | 化学合成, 酶促修饰, 拓扑工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 环状RNA, 分支mRNA, 合成套索结构 | 医学 |
| 1184 | 2026-07-06 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 本文综述了超声响应工程菌在靶向癌症治疗中的策略、机制及应用 | 首次系统整合超声与工程菌联合应用的交互机制,提出超声调控生物活性分子和智能药物递送系统的新方向 | 该综述主要总结当前研究进展,未包含具体实验数据或临床验证案例 | 全面理解工程菌修饰方法、作用机制及其与超声联合应用的交互机制,为开发超声响应智能治疗系统提供理论基础 | 工程菌与超声联合应用于肿瘤治疗的研究进展 | 合成生物学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 1185 | 2026-07-06 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
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研究论文 | 通过大肠杆菌表达的人工随机序列蛋白质实现数据存储与检索 | 将数字数据编码为氨基酸序列并整合到类胶原蛋白模板中,利用大肠杆菌表达实现数据存储;通过胰蛋白酶消化结合LC-MS/MS分析实现完整数据恢复,并展示蛋白质比DNA更高的稳定性以及利用亲和标签实现随机访问和加密数据保护 | 文中未明确提及局限性 | 建立基于蛋白质的数据存储框架,实现高效、稳定的数据存储与检索 | 人工随机序列蛋白质、类胶原蛋白模板、大肠杆菌表达系统 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | 氨基酸序列、数字数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 数据存储、合成生物学、蛋白质工程 |
| 1186 | 2026-07-06 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-06-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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研究论文 | 表征一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶,用于苯乙烯的生物合成 | 首次通过真菌阿魏酸脱羧酶的多重序列比对的共识蛋白设计,获得一种高效的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,并解析了其高分辨率的晶体结构(2.1 Å),揭示了关键催化残基 | 苯乙烯对微生物的毒性仍然是一个挑战,且该酶的工业应用还需进一步优化 | 实现从L-苯丙氨酸两步法生物合成苯乙烯,并表征关键酶PSC1的物理化学性质和三维结构 | 共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,以及溶剂耐受菌株DOT-T1E | 合成生物学 | NA | NA | NA | 结构数据(蛋白质晶体结构) | NA | NA | DOT-T1E(溶剂耐受菌株) | 两步法苯乙烯生物合成途径:L-苯丙氨酸→肉桂酸→苯乙烯 | 工业生物技术 |
| 1187 | 2026-07-05 |
The critical patch size problem on networks
2026-Sep, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109749
PMID:42320745
|
研究论文 | 研究网络环境中人口持续存活的临界斑块大小问题 | 首次在图论框架内系统研究临界斑块大小,推导出随机网络中保证种群持久生存的谱图参数界限 | 分析依赖于线性化算子特征值条件,可能未完全捕捉非线性动态行为的复杂性 | 探讨强异质介质(网络)中种群动态的临界斑块大小及其影响因素 | 离散晶格、多连接晶格及随机网络上的种群动态 | 网络科学 | NA | NA | 图拉普拉斯算子 | 网络结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生态网络、合成生物学、脑连接组神经退行性疾病传播建模 |
| 1188 | 2026-07-05 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-02-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
|
研究论文 | 提出一种利用肿瘤归巢聚合物实现CAR-T细胞空间激活控制的新框架IMPACT | 首次结合合成生物学与生物材料方法,通过聚合物介导的解剖学控制实现IF-THEN门控CAR-T细胞的靶向激活 | 仅在小鼠肿瘤模型中进行了初步验证,未涉及人体临床试验 | 开发一种通过聚合物介导的肿瘤定位策略,以提高CAR-T细胞治疗的特异性并减少脱靶毒性 | CAR-T细胞及肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学, 生物材料 | 肿瘤 | 合成生物学, 生物材料工程 | NA | 动物实验数据 | 小鼠肿瘤模型中的实验样本 | NA | 小鼠 | IF-THEN门控CAR-T细胞电路,通过荧光素标记聚合物触发条件性蛋白表达 | 医学 |
| 1189 | 2026-07-05 |
YF17D-based vaccines - standing on the shoulders of a giant
2024-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250133
PMID:38571392
|
综述 | 综述基于YF17D的黄热病疫苗平台的研究进展及其在预防和治疗多种疾病中的应用 | 系统总结了YF17D作为疫苗平台的独特免疫原性机制,并展示了其在开发新型重组活疫苗(包括已获批的日本脑炎和登革热疫苗)以及针对新兴病毒感染、寄生虫病、慢性感染和癌症的临床前候选疫苗中的广泛应用 | 历史安全担忧和制造挑战仍需克服,且YF17D疫苗的广泛使用仍需进一步研究 | 综述YF17D作为疫苗平台的最新见解,并探讨其在满足未满足的医疗需求和应对大流行准备中的作用 | 基于YF17D的疫苗及其在预防和治疗疾病中的应用 | NA | 黄热病、日本脑炎、登革热、拉沙热、寨卡病毒病、COVID-19、疟疾、HIV、慢性肝炎、癌症 | 分子病毒学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1190 | 2026-07-05 |
Designing synthetic RNA for delivery by nanoparticles
2017-Mar-29, Journal of physics. Condensed matter : an Institute of Physics journal
DOI:10.1088/1361-648X/aa5561
PMID:28004640
|
综述 | 本文综述了用于纳米颗粒递送的合成RNA设计,涵盖RNA纳米颗粒的类型、结构分析与建模、功能化以及细胞应用 | 系统整合了RNA纳米颗粒从设计、建模、合成到功能化和细胞应用的完整路径,并强调RNA递送后的细胞内加工过程 | 未报道具体实验验证,仅基于现有研究进行综述 | 概述用于纳米颗粒递送的合成RNA设计方法及其在基因表达调控和潜在治疗中的应用 | RNA纳米颗粒及核酸纳米结构 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术、结构预测工具 | NA | 综述文献 | NA | NA | NA | RNA纳米颗粒,用于基因表达调控的纳米结构 | 医学 |
| 1191 | 2026-07-04 |
Deploying Artificial Metalloenzymes in Complex Environments: Strategies and Applications
2026-Jul-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70446
PMID:42390013
|
综述 | 本文综述了人工金属酶在复杂环境(细胞裂解液、全细胞催化剂和活体动物)中部署的策略与应用,重点讨论了其设计原则、瓶颈和机遇 | 系统总结了人工金属酶在三种复杂生物环境(细胞裂解液、全细胞催化剂和活体动物)中的稳定化策略和适应方法,突出了其作为鲁棒工具的设计突破 | 人工金属酶在复杂环境中的组装困难、金属辅因子不稳定及细胞组分干扰仍是主要挑战 | 推动人工金属酶在合成生物学、化学生物学和生物医学等领域的实际应用 | 人工金属酶 (ArMs) | 合成生物学, 化学生物学 | NA | 金属蛋白工程, 辅因子修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 化学生物学, 生物医学 |
| 1192 | 2026-07-04 |
A caspase-3-activated protein expression system for apoptosis visualization and apoptosis-pyroptosis conversion to boost antitumor activity
2026-Jul-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.06.009
PMID:42392927
|
研究论文 | 开发了一种由caspase-3激活的蛋白表达系统,用于凋亡可视化和凋亡-焦亡转换以增强抗肿瘤活性 | 首次利用caspase-3作为开关设计可编程合成生物学平台,实现凋亡的高分辨率活细胞成像和体内肿瘤生物发光成像,并通过工程化表达焦亡效应子实现凋亡偶联的焦亡,增强抗癌效果 | 摘要未提及明显局限性 | 开发一种由caspase-3激活的蛋白表达系统,用于凋亡检测及凋亡-焦亡转换以增强抗肿瘤疗效 | caspase-3激活的蛋白表达系统及其在癌症治疗中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 荧光蛋白、荧光素酶成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | caspase-3激活的蛋白表达系统 | 医学 |
| 1193 | 2026-07-04 |
Toward development of soil-derived Bacillus isolates as lung cancer cytotoxic agents
2026-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100074
PMID:42396176
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研究论文 | 探索土壤来源的芽孢杆菌分离物作为肺癌细胞毒性药物的潜力 | 通过结合环境微生物筛选、代谢物抗癌活性测试和数学模型构建,建立了一种从土壤细菌中发掘肺癌治疗用工程化微生物底盘和分子载体的平台 | 未明确说明,但隐含可能包括所需进一步体内验证及工程化改造的复杂性 | 开发土壤来源的芽孢杆菌分离物作为肺癌细胞毒性药物 | 从纽约曼哈顿公园土壤中收集和表征的芽孢杆菌分离物及其分泌代谢物 | 微生物组学、合成生物学、癌症治疗 | 肺癌 | 代谢物分析、共培养实验、数学模型 | 常微分方程模型 | 细胞生长数据、代谢物毒性数据 | 来自25个城市公园的土壤样本 | NA | 芽孢杆菌分离物 | NA | 医学 |
| 1194 | 2026-07-04 |
Sulfolobales: Acidothermophilic archaea as models for biology and biotechnological applications
2026-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100262
PMID:42396182
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review | 综述了酸热古菌目Sulfolobales的生物学研究进展及其在生物技术中的应用 | 强调Sulfolobales作为古菌生物学、真核特征起源研究模型以及合成生物学平台的独特优势,并聚焦其专性异养菌在生物质降解中的应用 | 未涵盖所有Sulfolobales物种的详细代谢机制或大规模工业应用案例 | 总结Sulfolobales生物学研究进展并探讨其在生物技术中的应用潜力 | 酸热古菌目Sulfolobales | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | Sulfolobales | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 1195 | 2026-07-04 |
[Cloning of cytochrome P450 reductase genes from Carthamus tinctorius and comparison of electron donation activity]
2026-May, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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research paper | 本研究从红花中克隆了三个细胞色素P450还原酶基因,并比较了它们与不同CYP450酶组合时的电子供体活性 | 首次从红花中克隆并鉴定了三个CPR基因,发现CtCPR1与红花内源KO酶组合时电子供体活性增强,而CtCPR3与拟南芥AtKO组合时活性更优,揭示了CPR与CYP450之间的高合作伙伴兼容性 | NA | 克隆红花中CPR基因并评估其电子供体活性,为通过合成生物学高效生产红花生物活性化合物提供遗传资源 | 红花中的细胞色素P450还原酶基因CtCPR1、CtCPR2和CtCPR3 | machine learning | NA | 克隆、测序、序列比对、系统发育分析、酵母发酵 | NA | 序列数据、文本 | 3个CPR基因 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 代谢途径工程(将CPR与KO基因共表达生产ent-kaurenoic acid) | medicine, industrial biotechnology |
| 1196 | 2026-07-04 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
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综述 | 综述了利用无细胞系统(CFS)开发生物传感器的设计、功能及应用,涵盖基因电路构建、信号输出策略和多种设备格式 | 整合了无细胞生物传感器的设计原理、多种设备格式(如纸基平台、微流控系统、可穿戴技术)及工程解决方案(包括AI辅助设计、分子优化和先进材料集成),并展望了与物联网和分布式制造等智能技术的融合 | 当前无细胞生物传感器在保质期、灵敏度和可扩展性方面存在局限性 | 全面阐述无细胞系统在生物传感器开发中的设计、功能、应用现状及未来发展方向 | 基于无细胞系统的生物传感器及其在医疗、环境科学、农业和食品质量保证等领域的传感应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统(体外) | 基因电路(包括逻辑门、生物传感器) | 医疗, 环境科学, 农业, 食品质量保证 |
| 1197 | 2026-07-04 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
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综述 | 探讨无细胞系统与自动化和机器人技术的融合,及其在生物技术和生物工程领域的应用 | 将无细胞系统与自动化和机器人技术结合,实现高通量筛选、快速原型设计和按需生物制造,强调了人工智能和机器学习在实验设计和过程优化中的集成 | 面临标准化挑战,需要开发更稳健和经济的无细胞提取物 | 研究无细胞系统在自动化平台中的设计、功能和局限性,以加速生物技术应用 | 无细胞蛋白质合成系统、微流控装置、液体处理机器人和集成分析平台 | 机器学 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | NA | 无细胞合成生物学电路 | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 1198 | 2026-07-04 |
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.11.001
PMID:41581987
|
综述 | 探讨基于无细胞系统的高通量筛选技术原理、平台和应用 | 详细阐述无细胞系统如何规避活细胞筛选的局限性,并整合微孔板、液滴微流控和纸基装置等平台实现可扩展的高通量分析 | 无细胞系统存在试剂成本高和翻译后修饰能力有限等挑战 | 综述无细胞系统在合成生物学、药物发现、诊断和蛋白质工程等领域的应用进展 | 生物分子(化合物、核酸、蛋白质) | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 小麦胚芽, 兔网织红细胞 | 生物传感器 | 医学, 工业生物技术 |
| 1199 | 2026-07-04 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
|
综述 | 综述了无细胞转录翻译系统的发展历程、优势、挑战和未来展望 | 系统总结了无细胞转录翻译系统从1960年代至今的演变,涵盖多种提取物来源及在合成生物学和生物制药中的广泛应用 | 成本高、蛋白质产量有限、缺乏复杂的翻译后修饰、提取物不稳定 | 推动无细胞系统的发展以降低成本、提高产量、增强稳定性并拓展应用 | 无细胞转录翻译系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译(TXTL) | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌、酵母菌、真核细胞 | NA | 合成生物学,生物制药 |
| 1200 | 2026-07-04 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
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综述 | 探讨人工智能与无细胞系统在合成生物学中的整合,涵盖近期进展、工业应用及未来方向 | 将人工智能(机器学习、深度学习、生成模型等)应用于无细胞系统优化,实现了抗菌肽发现、蛋白质产量34倍提升等突破,并推动代谢路径设计、酶工程和产量预测的智能化 | 面临数据需求大、模型可迁移性差及可扩展性不足等挑战 | 研究人工智能如何与无细胞系统融合,以提升合成生物学中的实验优化、产物设计和应用效率 | 无细胞系统(如蛋白质合成和代谢反应)及其与人工智能技术的结合 | 机器学习 | NA | 有监督学习、无监督学习、强化学习、贝叶斯优化、神经网络 | CNN、RNN、GAN、VAE、强化学习模型 | 文本、实验数据 | NA | NA | NA | NA | 生物制造、制药、诊断 |