合成生物学相关文章
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当前共找到 3873 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2025-10-05 |
A novel interpretability framework for enzyme turnover number prediction boosted by pre-trained enzyme embeddings and adaptive gate network
2025-May, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.02.010
PMID:40021034
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研究论文 | 开发了一种名为GELKcat的新型可解释性框架，用于预测酶转换数(kcat) | 结合图变换器进行底物分子编码和CNN进行酶word2vec嵌入，采用自适应门网络整合特征，并具备识别关键分子子结构的能力 | NA | 提高酶转换数(kcat)预测的准确性和可解释性 | 多物种酶-底物对的转换数数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图变换器, CNN, word2vec, 自适应门网络 | 酶-底物对转换数数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物发现 |
| 1202 | 2025-10-05 |
Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270
PMID:39978295
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综述 | 本文综述了通过代谢工程、合成生物学和实验室进化技术扩展假单胞菌细胞工厂底物利用范围的最新进展 | 提出将假单胞菌作为新一代工业生物技术平台，通过工程化改造增强其对木质纤维素残渣、合成塑料、C1化合物等废弃底物的降解和利用能力 | NA | 探索具有理想特性的新型微生物宿主，开发利用废弃底物的生物工艺 | 假单胞菌物种 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程, 合成生物学, 实验室进化 | NA | NA | NA | NA | 假单胞菌 | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 1203 | 2025-10-05 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-Mar-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
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研究论文 | 本研究展示了细菌细胞通过天然生物分子触发原子转移自由基反应，实现多种丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸单体的细胞内聚合 | 首次利用细菌细胞内天然生物分子作为引发剂实现原子转移自由基聚合，开发了基于细胞内聚合的生物正交细胞工程工具 | NA | 探索细菌细胞作为活体催化剂进行细胞内自由基聚合的潜力 | 细菌细胞和多种丙烯酰胺、丙烯酸、甲基丙烯酸单体 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱、凝胶渗透色谱、荧光标记、荧光显微镜、流式细胞术、代谢和膜完整性检测 | NA | 光谱数据、色谱数据、荧光图像、细胞活力数据 | NA | 原子转移自由基聚合 | 细菌细胞 | 基于细胞内天然生物分子触发的原子转移自由基聚合反应 | 工业生物技术,材料 |
| 1204 | 2025-10-05 |
A long road ahead to reliable and complete medicinal plant genomes
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57448-8
PMID:40032878
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评论 | 本文探讨药用植物基因组研究的现状、挑战与未来发展方向 | 提出基于完善现有基因组、借鉴作物基因组学经验并应用前沿基因组技术来推进药用植物基因组研究的策略 | NA | 提高药用植物基因组组装质量和完整性，促进功能基因组学和合成生物学应用 | 药用植物基因组 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序 | NA | 基因组数据 | 截至2025年2月已测序203种植物的400多个基因组 | NA | NA | NA | 医药 |
| 1205 | 2025-10-05 |
Advancements in Escherichia coli secretion systems for enhanced recombinant protein production
2025-Mar-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04302-0
PMID:40025370
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综述 | 探讨大肠杆菌天然和工程化分泌系统在增强重组蛋白生产中的应用 | 系统比较天然一步/两步分泌系统与新型工程平台（ESETEC、BacSec），提出通过基因工程和合成生物学策略提升蛋白分泌效率 | 主要适用于非糖基化蛋白，天然分泌能力有限且易形成包涵体 | 提高大肠杆菌重组蛋白的分泌产量和效率 | 大肠杆菌分泌系统与重组蛋白 | 合成生物学 | NA | 基因工程、诱变、合成生物学、细胞壁修饰、分子伴侣共表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 分泌系统工程化改造（Type I/III、Sec/Tat途径） | 工业生物技术 |
| 1206 | 2025-10-05 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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研究论文 | 开发了一种名为SHIP的算法，用于系统识别真核生物中的基因组安全港位点 | 首次提出基于基因组通用特征注释的系统性GSH识别算法，突破了传统经验方法的局限 | 目前仅在酿酒酵母中进行了实验验证，在其他真核生物中的适用性需要进一步验证 | 开发系统性识别基因组安全港位点的工具，满足合成生物学对多基因模块研究的需求 | 真核生物的基因组安全港位点 | 合成生物学 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | SHIP算法 | 基因组注释数据、测序数据 | 在酿酒酵母中实验验证了5个GSH位点 | 基因组工程 | 酿酒酵母 | 基因组安全港位点整合系统 | 工业生物技术 |
| 1207 | 2025-10-05 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本研究开发了一种基于脂质的毫米级泡沫状组织模拟物，通过整合活性细菌实现了组织张力的网络级波动和结构重塑 | 首次在脂质泡沫原型组织中实现了由游泳细菌驱动的网络级张力波动，促进了原型组织的流体化和重组 | 未明确说明原型组织的长期稳定性及在复杂生物环境中的应用限制 | 开发具有重塑能力的合成原型组织，用于理解和模拟生物组织 | 脂质泡沫组织模拟物及其与细菌的相互作用 | 合成生物学 | NA | 脂质双层自组装技术 | NA | 结构特性数据、力学性能数据 | NA | 自下而上合成生物学方法 | 细菌 | 基于脂质双层的微米级隔室网络结构 | 医学, 基础生物学研究 |
| 1208 | 2025-10-05 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
|
研究论文 | 介绍一款名为Dsembler的网页软件工具，用于优化DNA组装设计并促进寡核苷酸组装 | 开发了能提供最佳解链温度和GC重叠的寡核苷酸组设计工具，解决了合成生物学中寡聚体组装的关键难题 | NA | 开发促进DNA组装设计的软件工具，解决合成生物学中的基因组装挑战 | DNA序列组装和寡核苷酸设计 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 1209 | 2025-10-05 |
Synthetic biology routes to new and extinct natural products
2025-May-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00047e
PMID:40171247
|
研究论文 | 通过合成生物学方法探索天然产物生物合成途径并开发新型代谢产物 | 通过基因敲除和结构域交换技术获得多种新型代谢产物，并成功构建高产单一组分 pseudomonic acid 的工程菌株 | NA | 阐明细菌和真菌中天然产物的生物合成途径，并通过遗传工程优化代谢产物生产 | 假单胞菌产生的假单胞菌酸、沙雷氏菌产生的硫马林醇、真菌产生的tenellin和bassianin、链霉菌产生的二聚黄酮 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、基因敲除、结构域交换、异源表达 | NA | NA | NA | 基因敲除, 结构域交换, 异源表达 | 假单胞菌, 沙雷氏菌, 链霉菌 | 模块化PKS途径、PKS-NRPS杂合系统、二聚黄酮生物合成途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 1210 | 2025-10-05 |
Functional investigation of Zur in metal ion homeostasis, motility and multiple stresses resistance in cyanobacteria Synechocystis sp. PCC 6803
2025-May-07, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00224-x
PMID:40332629
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探讨了Zur调控因子在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中金属离子稳态、运动性和多重胁迫抗性的功能 | 首次系统揭示Zur在蓝藻中作为全局转录调控因子的多重功能，包括同时调控锌/铁离子平衡、菌毛基因簇表达和生物膜形成 | NA | 探究Zur调控因子在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中的生物学功能及其调控网络 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803的Δzur突变株和野生型菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Δzur突变株和野生型菌株 | NA | Synechocystis sp. PCC 6803 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 1211 | 2025-10-05 |
Sustainable production of porphyrins through synthetic biology
2025-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.009
PMID:39341742
|
综述 | 本文聚焦合成生物学促进卟啉化合物可持续生产的最新突破 | 系统总结不同物种中卟啉生物合成途径的最新研究进展 | NA | 推动通过合成生物学实现卟啉的可持续生产 | 卟啉化合物及其在不同物种中的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多种物种 | 卟啉生物合成途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 1212 | 2025-10-05 |
A synthetic biology approach for identifying de-SUMOylation enzymes of substrates
2025-May, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13838
PMID:39835880
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研究论文 | 本研究开发了一种在大肠杆菌中使用的合成生物学方法，用于识别负责从特定蛋白质底物中去除SUMO修饰的植物泛素样蛋白酶 | 利用大肠杆菌中的稳健重构系统来识别植物去SUMO化酶 | NA | 识别能够去除特定蛋白质底物SUMO修饰的植物泛素样蛋白酶 | 植物泛素样蛋白酶和SUMO修饰的蛋白质底物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 稳健的重构系统 | 基础研究 |
| 1213 | 2025-10-05 |
Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI
2025-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010
PMID:40000312
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综述 | 本文探讨了整合多组学数据与人工智能技术加速植物生物合成途径发现的策略 | 提出结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的整合工作流程，并引入AI驱动方法革新途径发现 | NA | 促进可持续生物经济发展，通过合成生物学实现对复杂天然产物的高效获取 | 植物生物合成途径 | 计算生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学、分子网络、反应对分析 | AI | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | 生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1214 | 2025-10-05 |
CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00757
PMID:39989320
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于Cupriavidus necator H16的高效无标记基因组编辑系统CnRed | 首次在Cupriavidus necator H16中建立lambda Red重组工程系统，并首次实现使用线性PCR产物进行基因删除 | NA | 开发高效的基因组编辑方法以改进Cupriavidus necator H16的工程化应用 | Cupriavidus necator H16细菌 | 合成生物学 | NA | lambda Red重组工程、电穿孔、PCR | NA | NA | 三个不同基因组位点 | lambda Red重组工程系统,Cre/loxP系统 | Cupriavidus necator H16 | 植酸酶基因的基因组整合 | 工业生物技术 |
| 1215 | 2025-10-05 |
Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00840
PMID:39991792
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研究论文 | 本研究开发了在真核无细胞系统中工作的蛋白质响应型上调核糖开关，用于构建多步基因调控级联 | 首次在真核无细胞系统中开发蛋白质响应型ON-核糖开关，并成功构建了多步基因调控级联 | 最初设计的两种ON-核糖开关效率较低，多步级联的总体开关效率受限于其中效率最差的步骤 | 构建在真核无细胞系统中工作的复杂基因调控电路 | 蛋白质响应型ON-核糖开关和基因调控级联 | 合成生物学 | NA | 核糖开关设计、锤头状核酶自切割 | NA | 基因表达数据 | NA | 核糖开关、杂交开关 | 小麦胚芽提取物（无细胞系统） | 蛋白质响应型ON-核糖开关、两步骤和三步骤基因调控级联、基于HHR的核糖开关 | 工业生物技术 |
| 1216 | 2025-10-05 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究通过优化哺乳动物剪接核糖开关调控ALOX5基因的可变剪接，实现了外显子跳跃依赖性基因表达和亚型转换 | 开发了基于上下文序列适配的核糖开关优化策略，首次实现了5-LO野生型向缺失外显子13亚型(5-LOΔ13)的转换 | 在真核系统中控制基因表达的功能可能受限于特定基因或细胞类型 | 优化合成核糖开关在哺乳动物细胞中调控可变剪接的能力 | ALOX5基因和人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因在HEK293细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | 可变剪接调控，核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 核糖开关 | 哺乳动物细胞，HEK293细胞 | 剪接核糖开关，外显子跳跃调控，亚型转换系统 | 医学，合成生物学 |
| 1217 | 2025-10-05 |
Review of Recent Advances in Microbial Production and Applications of Nerolidol
2025-Mar-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12579
PMID:40013722
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综述 | 总结了橙花叔醇的生物活性、应用领域及微生物细胞工厂生产方法的最新研究进展 | 系统整合了代谢工程和合成生物学策略构建微生物细胞工厂生产橙花叔醇及其衍生物的最新进展 | NA | 综述橙花叔醇的生物活性、应用前景和微生物生产方法 | 橙花叔醇及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | NA | 医药, 农业, 食品工业 |
| 1218 | 2025-10-05 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417695122
PMID:40009642
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析揭示了绿藻双顺反子mRNA通过渗漏核糖体扫描机制实现多ORF翻译的分子机制 | 首次在绿藻中证实渗漏核糖体扫描是双顺反子翻译的关键机制，并展示了通过调控Kozak-like序列强度可逆调节双报告基因表达 | 研究主要聚焦于两种绿藻物种，机制在其他真核生物中的普适性仍需验证 | 探究绿藻双顺反子mRNA中多个开放阅读框的翻译机制 | 两种分歧绿藻（Chlamydomonas reinhardtii和Chlorella variabilis）的双顺反子基因座 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组序列、荧光和发光报告基因表达数据 | 两种绿藻物种的高可信度手动注释双顺反子基因座数据集 | 合成双顺反子双报告基因系统 | 绿藻 | 双顺反子表达系统，包含可调控的Kozak-like序列和双报告基因（GFP和荧光素酶） | 合成生物学 |
| 1219 | 2025-10-05 |
CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models
2025-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13780-2
PMID:40000974
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研究论文 | 本研究设计了一种靶向PD-L1和MICA/B的双靶向CAR-NK细胞，并在肺癌模型中验证其疗效 | 首次设计并验证了同时靶向PD-L1和MICA/B的双靶向CAR结构，可诱导肿瘤细胞焦亡 | 研究仅限于H1299肺癌细胞模型，尚未在其他癌症类型中验证 | 开发新型CAR-NK细胞免疫疗法用于肺癌治疗 | NK92细胞和人类肺癌H1299细胞 | 合成生物学 | 肺癌 | CAR工程技术、细胞共培养、动物模型 | NA | 细胞实验数据、动物实验数据 | NK92细胞系和H1299肺癌细胞系 | 合成生物学方法 | NK92细胞（人类自然杀伤细胞系） | 双靶向CAR结构，包含PD-L1纳米抗体和NKG2D作为胞外域，CD28跨膜区和胞内域，4-1BB和CD3ζ胞内域 | 医学 |
| 1220 | 2025-10-05 |
A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57280-0
PMID:39988594
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研究论文 | 设计简洁酶级联反应从廉价底物高效生产天然和非天然原小檗碱生物碱 | 通过酶发现与工程改造，系统性优化小檗碱桥酶，实现药物罗通定的克级规模高效生产，并能生物合成多种非天然卤代原小檗碱生物碱 | NA | 解决植物源天然产物含量低和结构多样性不足的限制，开发高效生物合成方法 | 原小檗碱生物碱（包括天然和非天然卤代衍生物） | 合成生物学 | NA | 酶工程、酶级联反应、生物合成 | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | 酶级联反应系统 | 医药、工业生物技术 |