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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2025-10-05 |
Innovative applications and research advances of bacterial biosensors in medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1507491
PMID:40336836
|
综述 | 本文综述了细菌生物传感器在医学领域的应用进展与挑战 | 系统总结了合成生物学和基因工程在细菌生物传感器设计中的突破性进展 | 讨论了细菌生物传感器在研究和应用中仍存在的挑战与障碍 | 探讨细菌生物传感器在医学诊断和治疗监测中的应用 | 细菌生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | 细菌 | 生物传感器,基因表达调控回路 | 医学 |
| 1242 | 2025-10-05 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 本研究开发了INSPIRE-seq方法,利用纳米抗体库和二代测序技术从肿瘤微环境中筛选免疫细胞结合纳米抗体 | 开发了INSPIRE-seq这一无偏倚方法,能够并行富集穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | NA | 开发用于发现治疗性生物制剂靶向分子的技术 | 肿瘤微环境中的免疫细胞(树突状细胞等) | 合成生物学 | 肿瘤 | 二代测序,单细胞RNA测序,免疫荧光,结构建模与对接研究 | NA | 测序数据,图像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1243 | 2025-10-05 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-May-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 本研究阐明了大豆抗毒素甘氨酸素的完整生物合成途径,并通过合成生物学方法在酵母中实现了从头合成 | 发现了甘氨酸素生物合成中未表征的还原酶基因和五个介导氧化环化的P450酶,首次实现了甘氨酸素在酵母中的从头合成 | NA | 阐明甘氨酸素的完整生物合成途径并实现其可持续生产 | 甘氨酸素生物合成途径及相关酶基因 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 本氏烟草, 酿酒酵母 | 甘氨酸素生物合成途径 | 农业, 生物学 |
| 1244 | 2025-10-05 |
Engineering a newly identified alcohol dehydrogenase from Sphingobium Sp. for efficient utilization of nicotinamide cofactors biomimetics
2025-May-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00870-z
PMID:40325297
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研究论文 | 本研究鉴定并改造了鞘氨醇菌来源的醇脱氢酶SpADH2,使其能高效利用烟酰胺辅因子仿生物作为辅因子 | 首次发现能利用全合成烟酰胺辅因子仿生物(tsNCBs)的天然醇脱氢酶,并通过半理性工程显著提升其催化效率和辅因子特异性 | NA | 开发能够高效利用低成本烟酰胺辅因子仿生物的醇脱氢酶 | 鞘氨醇菌来源的醇脱氢酶SpADH2及其突变体 | 合成生物学 | NA | 酶工程、半理性设计、酶催化表征 | NA | 酶活性数据、相互作用分析 | 野生型SpADH2及三个关键突变体(H43L、A290I、H43L/A290I) | 酶工程 | Sphingobium sp. SYK-6 | NA | 工业生物技术 |
| 1245 | 2025-10-05 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
|
研究论文 | 通过定向进化羟化酶XcP4H并改造大肠杆菌Nissle 1917,开发能生物合成5-HTP的工程益生菌用于治疗抑郁症 | 首次将基于遗传密码扩展的高通量筛选方法应用于XcP4H的定向进化,创建了5-HTP产量提高22倍的酶变体,并构建了能同时改善肠道和大脑功能的活体治疗剂 | 研究目前仅在小鼠模型中验证效果,尚未进行人体临床试验 | 开发能有效生产5-HTP的工程益生菌,克服5-HTP药代动力学差的限制,为抑郁症治疗提供新策略 | 羟化酶XcP4H、大肠杆菌Nissle 1917、抑郁症小鼠模型 | 合成生物学 | 抑郁症 | 酶定向进化、分子动力学模拟、基因编辑、高通量筛选 | NA | 生物化学数据、行为学数据、微生物组数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9, 基因编辑 | 大肠杆菌 | 5-HTP生物合成途径 | 医药 |
| 1246 | 2025-10-05 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
|
研究论文 | 本研究揭示了丹参中NAC36-MYB18-TAT2分子模块调控酚酸生物合成的分子机制 | 首次发现SmTAT2正向调控酚酸积累,并解析了SmNAC36通过激活SmMYB18间接调控及直接激活SmTAT2的双重调控通路 | NA | 探究丹参酚酸生物合成的分子调控机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)中的酚酸合成关键酶基因SmTAT2及其转录调控因子 | 合成生物学 | NA | 转基因技术(过表达和CRISPR/Cas9)、酵母单杂交、双荧光素酶报告基因检测、EMSA | NAC36-MYB18-TAT2调控模型 | 分子生物学实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 丹参 | 酚酸生物合成调控通路 | 医药 |
| 1247 | 2025-10-05 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
|
综述 | 本文综述了酿酒酵母中纤维素酶表达策略及理性设计优化CBP菌株的最新进展 | 系统总结了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的理性设计策略 | 目前一步法转化纤维素底物为乙醇的滴度和生产率远低于工业要求 | 开发能够将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品的CBP酵母菌株 | 酿酒酵母及其纤维素酶表达系统 | 合成生物学 | NA | 组学策略、理性菌株设计 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 纤维素酶表达系统、核心纤维素酶组合 | 能源, 工业生物技术 |
| 1248 | 2025-10-05 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
|
研究论文 | 通过蛋白质组学和代谢组学联合分析探究嗜碱盐单胞菌CICC 11012s的碱性抗性分子机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术系统揭示嗜碱盐单胞菌应对碱性胁迫的多层次适应策略 | NA | 研究嗜碱盐单胞菌对极端碱性环境的耐受机制 | 嗜碱盐单胞菌CICC 11012s野生型及tonb基因突变株 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学,代谢组学,CRISPR | NA | 蛋白质组数据,代谢组数据 | 野生型和突变株菌株 | CRISPR-Cas9 | Halomonas alkalicola | tonb基因突变体 | 工业生物技术,环境治理 |
| 1249 | 2025-10-05 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
|
研究论文 | 提出一种基于单核苷酸分辨率条形码识别的寡核苷酸子集选择方法 | 采用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断技术,无需引物即可实现选择性杂交,且能用少于五个核苷酸的条形码编码选择数百个子集 | NA | 开发可扩展且经济高效的复杂寡核苷酸文库处理方法 | 寡核苷酸文库 | 合成生物学 | NA | 循环核苷酸合成、模板阻断技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 基因组学, 合成生物学, DNA数据存储 |
| 1250 | 2025-10-05 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
|
研究论文 | 提出一种通过3'-突出末端引物对介导的优化定点诱变方法 | 利用部分互补的3'-突出末端引物对提高诱变效率并降低错误率 | NA | 开发更高效可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | 合成生物学 | NA | 定点诱变 | NA | NA | 每个诱变反应仅需分析3个菌落 | Gibson Assembly | DH5α大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1251 | 2025-10-05 |
Colored Proteins Act as Biocolorants in Escherichia coli
2025-Jan-21, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30030432
PMID:39942539
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研究论文 | 本研究评估了多种彩色蛋白在大肠杆菌中作为生物着色剂的性能,重点发现GfasPurple蛋白在恶劣条件下的出色稳定性 | 系统比较了多种彩色蛋白的着色性能,首次详细评估了GfasPurple蛋白在热、乙醇、氧化剂等恶劣条件下的稳定性,并通过诱变技术扩展了色蛋白的彩色库 | 研究主要集中在大肠杆菌系统中,对其他宿主生物的适用性未充分验证 | 探索彩色蛋白作为生物着色剂的应用潜力 | 绿色荧光蛋白(eGFP和sfGFP)、红色荧光蛋白(mKate2)和三种色蛋白(GfasPurple、AmilCP、AeBlue) | 合成生物学 | NA | 诱变技术、吸收光谱分析 | NA | 光谱数据、视觉观察数据 | 6种彩色蛋白在大肠杆菌中的表达 | NA | 大肠杆菌 | 生物着色系统 | 工业生物技术 |
| 1252 | 2025-10-05 |
Challenges and limitations in using bacterial metabolites as immunomodulators
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1535394
PMID:39944722
|
综述 | 探讨利用细菌代谢物作为免疫调节剂面临的挑战与限制 | 系统梳理细菌代谢物免疫调节应用中从发现到临床转化的全链条限制因素 | 代谢物生物利用度有限、脱靶效应风险、个体差异性及微生物组复杂相互作用 | 分析细菌代谢物作为免疫调节剂的转化医学挑战 | 细菌代谢物及其免疫调节机制 | 免疫学与微生物组研究 | 免疫相关疾病 | 宏基因组学、代谢组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1253 | 2025-10-05 |
Enhancing active ingredient biosynthesis in Chinese herbal medicine: biotechnological strategies and molecular mechanisms
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18914
PMID:39950047
|
综述 | 探讨现代生物技术增强中草药活性成分生物合成的策略与分子机制 | 整合生物合成、分子调控和合成生物学策略,建立增强中草药活性成分生产的理论框架 | NA | 通过生物技术手段解决中草药活性成分稀缺和提取困难的问题 | 中草药活性成分及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1254 | 2025-10-05 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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荟萃分析 | 通过分析炎症性肠病患者的肠道微生物组,鉴定出与疾病相关的小分子及其对肠道通透性的影响 | 首次通过多队列分析发现梭菌来源的生物合成基因簇与IBD的关联,并解析了六种脂肪酸酰胺的结构和功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探索肠道微生物组在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组和小分子代谢物 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序,合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | 5,306个宏基因组样本(来自2,033名IBD患者和833名健康对照) | 合成生物学 | 小鼠 | NA | 医学 |
| 1255 | 2025-10-05 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了合成最小细胞系统中信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的概念设计 | 通过囊泡系统人工重构了展示递归生长和分裂周期的合成最小细胞,避免了使用生物细胞中复杂的分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装体中产生,以及支撑这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的简化设计 | NA |
| 1256 | 2025-10-05 |
A simeprevir-inducible molecular switch for the control of cell and gene therapies
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43484-9
PMID:38012128
|
研究论文 | 开发了一种基于simeprevir药物的可诱导分子开关系统,用于控制细胞和基因治疗 | 首次利用已获批口服药物simeprevir及其靶点HCV NS3/4A蛋白酶构建化学诱导二聚化系统 | NA | 开发适用于临床环境的分子开关系统以控制细胞和基因治疗 | 化学诱导二聚化模块、肿瘤细胞、异种移植小鼠模型 | 合成生物学 | 癌症 | 化学诱导二聚化技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 分子开关、基因表达控制系统、细胞凋亡诱导系统 | 医学 |
| 1257 | 2025-10-05 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-May-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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研究论文 | 开发了一种在活细胞内合成近红外量子点的细胞适应性策略,通过精确调控前驱体耦合抑制ROS爆发 | 发现细胞适应性硒代胱氨酸可转化为生物相容性前驱体,与银-谷胱甘肽耦合合成近红外AgSe量子点,显著提高细胞活性和荧光强度 | NA | 实现活细胞内无机纳米晶体的生物合成并维持细胞功能 | 量子点合成、细胞成像、疾病进展追踪 | 合成生物学 | NA | 量子点合成、荧光成像 | NA | 荧光图像、细胞活性数据 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 前驱体转化与耦合生物合成途径 | 医学 |
| 1258 | 2025-10-05 |
Coacervates as enzymatic microreactors
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01203h
PMID:40084439
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综述 | 探讨基于凝聚层的酶促微反应器最新进展及其在生物催化中的应用潜力 | 系统阐述凝聚层通过提高底物浓度、稳定中间体和提供分子拥挤环境加速酶促反应的机制 | NA | 总结凝聚层微反应器的设计原理、工作机制和应用前景 | 基于合成聚合物、肽类和核酸的凝聚层系统及酶促反应模型 | 合成生物学 | NA | 荧光技术、色谱法、核磁共振波谱 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶促微反应器系统 | 生物催化, 合成生物学, 纳米技术 |
| 1259 | 2025-10-05 |
Cell-free synthetic biology for natural product biosynthesis and discovery
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01198h
PMID:40104998
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综述 | 本文综述了无细胞合成生物学在天然产物生物合成与发现中的应用 | 将无细胞合成生物学技术系统应用于天然产物生物合成途径表征和新代谢物发现 | NA | 探讨无细胞合成生物学在天然产物生产中的生物化学基础及其与全细胞/化学生产路线的比较 | 天然产物生物合成基因簇及其编码的酶类 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌,真菌,植物 | 天然产物生物合成途径,包括核糖体肽、非核糖体肽、聚酮化合物和萜类化合物的生物合成通路 | 医药,农业,工业生物技术 |
| 1260 | 2025-10-05 |
Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00981a
PMID:40151987
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综述 | 本文综述了蛋白质衍生辅因子的生物合成、反应机制及其在酶催化和合成生物学中的应用 | 系统整理了20年间蛋白质衍生辅因子种类从17种扩展到38种的进展,揭示了远程催化和氧化还原调控分子开关等新范式 | 对辅因子组装机制的理解仍滞后,传统诱变方法会破坏辅因子组装 | 探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新如何扩展酶催化功能 | 蛋白质衍生辅因子及其催化机制 | 生物化学 | NA | 非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱学 | NA | 文献综述数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 生物技术、生物催化 |