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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2026-06-26 |
Microbial Ecology at the Nexus of Food Safety and Biotechnology With Ecological Mechanisms, Risks, and Emerging Innovations
2026, International journal of food science
IF:2.7Q3
DOI:10.1155/ijfo/6618960
PMID:42344006
|
综述 | 综述了微生物生态学在食品安全与生物技术交叉领域的作用、生态机制、风险及新兴创新 | 将微生物生态学作为整合框架,系统连接食品安全和生物技术,并强调生态机制在两者中的应用 | 由于微生物复杂性、数据整合限制和安全考虑,将生态见解转化为可靠的工业和监管实践仍面临挑战 | 综合当前关于微生物生态学在食品安全与食品生物技术交叉领域的文献,并识别关键研究空白和未来方向 | 食品安全和食品生物技术中的微生物群落 | 微生物生态学 | NA | 高通量测序, 全基因组测序, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | 文献 | NA | NA | NA | NA | 食品, 生物技术 |
| 1282 | 2026-06-26 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-10-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
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研究论文 | 利用集成学习技术基于分子指纹预测利什曼病活性 | 首次引入集成模型方法用于利什曼病药物发现,结合三种分子指纹算法和多种机器学习模型,实现了83.65%的高精度预测 | 数据集仅来自PubChem数据库,且依赖Alamar Blue法评估,可能限制化合物的多样性;模型尚未经过体外或体内实验验证 | 开发基于机器学习和化学信息学的计算方法,预测化合物抗利什曼原虫前鞭毛体的活性 | 65,057个分子(来自PubChem数据库)以及其抗利什曼原虫活性数据 | 机器学习 | 利什曼病 | 分子指纹编码(Avalon、MACCS Key、Pharmacophore)、Alamar Blue法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 分子结构数据(SMILES符号) | 65,057个分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 1283 | 2026-06-26 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-08-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 开发了一种具有多酶纳米酶活性的仿生脂质体,用于调节外源植入物引起的促炎因子,从而促进组织再生 | 首次将CeO纳米颗粒与人工膜自组装形成仿生脂质体,兼具抗血液成分粘附和调节生化微环境稳态的双重功能 | NA | 设计并构建能在初始移植阶段复制天然细胞功能的治疗性脂质体,用于组织工程中的合成生物学 | 多酶纳米酶脂质体及CeO纳米颗粒 | NA | NA | 自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1284 | 2026-06-26 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-08-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法,解析多因素条件下三链DNA的热稳定性和pH稳定性 | 首次预测了不同温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性,并揭示了离子强度对Hoogsteen氢键的双重作用机制 | 未明确提及 | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA稳定性,并建立预测模型 | 三链DNA结构 | 分子生物学、核酸结构生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光信号、熔解温度数据 | 414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 基因靶向治疗、合成生物学应用 |
| 1285 | 2026-06-26 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 通过体外重建和突变分析,揭示了两种聚酮链通过非经典缩合结构域融合形成马来环丙醇活性丁烯内酯核心的机制 | 首次阐明硫模板介导的聚酮链头对头融合及还原环化构建丁烯内酯的非常规生物合成途径,扩展了合成生物学工具箱 | 未明确提及该反应在体内的效率或对病原菌整体毒力的定量影响 | 揭示马来环丙醇中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 类鼻疽伯克霍尔德菌群的毒力因子马来环丙醇及其生物合成酶系 | 合成生物学 | 类鼻疽伯克霍尔德菌感染 | 化学合成、体外重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(用于突变分析) | NA | 由PKS-NRPS杂合合成酶催化的聚酮链融合及还原环化丁烯内酯形成途径 | 医学(抗毒力策略开发) |
| 1286 | 2026-06-26 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 通过光响应DNA液滴动态相分离控制酶级联途径 | 提出利用光响应DNA液滴通过液-液相分离选择性隔离酶,实现紫外光和可见光调控酶级联反应,无需改变总酶浓度 | 未提及在复杂生物环境中的稳定性和长期应用效果 | 开发光响应DNA液滴用于精确调控酶级联途径 | 光响应DNA液滴和酶级联系统(GOx、HRP、CAT和GAO、MPO、CAT) | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 光响应DNA液滴(Y-motif序列与偶氮苯修饰的粘性末端)和酶级联途径 | 合成生物学, 微反应器设计, 生物工程 |
| 1287 | 2026-06-26 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-06-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路,用于实现原始细胞与活细胞群落中的自我调节双向通信 | 设计了包含识别、激活和反馈模块的DNA电路,使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号,自我调节与活细胞的相互作用,并具备可再生能力,能连续与多个目标活细胞互动 | 仅描述了原理验证,未提及在复杂生物环境中的应用限制或长期稳定性问题 | 开发合成生物学工具,控制细胞间信号传递,实现原始细胞与活细胞群落中的动态信号传播调控 | 原始细胞(非生物细胞模拟物)与活细胞(目标细胞) | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA | DNA组装技术 | 原始细胞(非生物) | 信号电路,包含识别模块、激活模块和反馈模块,用于自我调节双向通信 | 医学(细胞疗法) |
| 1288 | 2026-06-26 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 开发了一种基于水凝胶颗粒的无纯化方法,用于测量合成人工遗传聚合物(XNA)的聚合酶保真度 | 通过在磁性水凝胶颗粒基质内进行XNA转录和逆转录步骤,避免了传统方法中耗时的聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化步骤 | NA | 简化XNA聚合酶保真度测量流程 | XNA聚合酶 | NA | NA | 水凝胶颗粒技术, DNA/RNA合成 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1289 | 2026-06-26 |
Choreographing root architecture and rhizosphere interactions through synthetic biology
2024-02-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45272-5
PMID:38355570
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综述 | 通过合成生物学方法调控根系结构及其与根际微生物的互作,以应对气候变化对农业的挑战 | 首次系统阐述将合成遗传电路从微生物扩展到多细胞植物,用于调控根系形态、分泌物及根际微生物活动的创新策略 | NA | 探索利用合成生物学工具设计气候适应型作物的根系功能及根际互作 | 植物根系及其相关微生物群落 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路 | NA | NA | NA | NA | 植物(多细胞物种) | 用于调控根系结构、分泌作用和根表面微生物活动的合成遗传电路 | 农业, 环境 |
| 1290 | 2026-06-25 |
Synthetic biology of oncolytic bacteria: Comparative microbial chassis and precise killing strategies
2026-Dec, Toxicology reports
DOI:10.1016/j.toxrep.2026.102292
PMID:42339179
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综述 | 综述利用合成生物学工程改造溶瘤细菌的最新进展,包括不同微生物底盘及精确杀灭策略 | 系统比较了多种微生物底盘(沙门氏菌、李斯特菌、大肠杆菌、梭菌、双歧杆菌、酵母等)在癌症治疗中的应用,并总结了CRISPR/Cas9基因编辑、遗传逻辑电路和自杀开关等合成生物学技术增强安全性和特异性的方法 | NA | 为开发具有精确靶向能力和增强治疗稳定性的溶瘤细菌提供合成生物学视角 | 溶瘤细菌及其微生物底盘 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 沙门氏菌, 李斯特菌, 大肠杆菌, 梭菌, 双歧杆菌, 酵母 | 遗传逻辑电路, 自杀开关 | 医学 |
| 1291 | 2026-06-25 |
Haplotype-resolved T2T genome and population resequencing provide insights into the domestication and mogroside biosynthesis of Siraitia grosvenorii (Cucurbitaceae)
2026-Jul, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhag103
PMID:42338566
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研究论文 | 通过单倍型解析的T2T基因组和群体重测序,揭示了罗汉果的驯化历史及其罗汉果甜苷生物合成机制 | 首次构建了罗汉果单倍型解析的端粒到端粒无缺口基因组,并结合群体基因组分析阐明了驯化瓶颈和选择性清除对基因组结构的影响 | 未明确提及,但可能受限于样本量(173个重测序基因组)和功能验证实验的缺失 | 解析罗汉果的驯化过程及罗汉果甜苷V的生物合成机制,为分子育种和合成生物学提供基因组基础 | 罗汉果(Siraitia grosvenorii)及其基因组、群体和转录组数据 | 基因组学 | NA | T2T基因组组装、群体重测序、比较基因组学、转录组分析 | NA | 基因组序列、重测序数据、转录组数据 | 单倍型基因组(2个单倍型)及173个重测序基因组 | NA | NA | NA | 农业、食品 |
| 1292 | 2026-06-25 |
Genetically engineered outer membrane vesicles as next-generation bionanomaterials for therapeutic and diagnostic applications
2026-Jun-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00650g
PMID:42300204
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综述 | 本文系统综述了基因工程外膜囊泡作为下一代生物纳米材料在治疗和诊断应用中的设计策略与转化前景 | 整合合成生物学与基因工程技术将天然外膜囊泡转化为可编程智能生物纳米平台,并系统阐述表面展示、货物装载及膜调控三大工程策略 | 临床转化面临规模化生产、安全性评估和监管路径等关键挑战 | 探讨基因工程外膜囊泡在精准治疗与诊断中的设计原则及未来发展方向 | 基因工程外膜囊泡(geOMVs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性菌 | 表面展示、货物封装、膜调控 | 医学 |
| 1293 | 2026-06-25 |
Expanding the genetic toolset: using serine recombinases to integrate riboregulatory elements into industrially relevant microbial chassis
2026-Jan-08, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuag015
PMID:42228948
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研究论文 | 本论文展示了联合使用顺式抑制子(CR)与丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE)技术,将核糖调控元件整合到工业相关微生物底盘中的方法。 | 创新点在于实现了两种合成生物学工具(顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程)的联合应用,成功将核糖调控元件高效整合到多种工业微生物中,并验证了其在不同遗传背景下的高度可移植性。 | 限制因素可能包括对更多微生物宿主的适用性需进一步验证,以及顺式抑制子调控效果的绝对范围可能受限于特定宿主基因表达环境。 | 旨在扩展生物制造中工业微生物的基因操作工具集,实现多种宿主简便的基因组操作和精确基因表达调控。 | 工业相关微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌和富养罗尔斯通氏菌。 | 合成生物学 | NA | 顺式抑制子、丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | NA | 荧光报告基因表达数据 | 三种微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌,每种宿主整合多种顺式抑制子,但未明确样本数量 | 丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | 恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌 | 顺式抑制子(CR)核糖调控元件整合至染色体 | 工业生物技术、生物制造 |
| 1294 | 2026-06-24 |
Sustainable production of natural sweeteners through synthetic biology
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.04.001
PMID:42103513
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综述 | 系统总结了12种代表性天然甜味剂的代谢途径和微生物合成方法 | 通过代谢工程和酶工程构建微生物细胞工厂,为天然甜味剂的高效可持续生产提供了创新途径,并系统分析了不同合成方案的优缺点和核心技术瓶颈 | 仅总结了当前生产过程中的核心技术瓶颈,并未深入探讨大规模工业化的具体挑战 | 为天然甜味剂的工业化优化和生产提供理论支持和技术参考 | 12种代表性天然甜味剂(包括甜蛋白、萜类苷、黄酮类、多元醇和单糖) | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物(微生物细胞工厂) | 代谢途径 | 食品, 医药 |
| 1295 | 2026-06-24 |
Common γ-chain cytokines in brain tumor immunotherapy: Biological barriers and advances in macromolecular delivery systems
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152288
PMID:42092664
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综述 | 探讨常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的应用,重点关注生物屏障和递送系统的进展 | 系统总结了基于纳米颗粒、外泌体和细胞载体的递送平台如何克服脑肿瘤免疫治疗中细胞因子面临的生物屏障、半衰期短和毒性等挑战 | 缺乏具体的临床试验数据支持,多数讨论仍基于体外和动物模型结果,临床转化前景尚不明确 | 研究常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的潜力和递送策略 | 常见γ链细胞因子(如IL-2、IL-7、IL-15等)以及脑肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1296 | 2026-06-24 |
Elucidating the regulatory role of the Shine-Dalgarno sequence in structural gene expression of the malolactic enzyme operon using a GFP/mCherry model
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04999-7
PMID:42101569
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研究论文 | 通过GFP/mCherry报告系统研究苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列在结构基因表达中的调控作用 | 揭示了翻译耦合系统中Shine-Dalgarno序列通过上游翻译和局部mRNA结构的整合效应实现精确蛋白质表达调控的非线性、架构特异性调控逻辑 | 未提及明确局限性 | 阐明苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列在翻译后水平调控结构基因表达的作用机制 | 苹果酸乳酸酶操纵子中的mleA和mleP基因,以及Shine-Dalgarno序列SD2 | 分子生物学 | NA | 定点突变、16S rRNA杂交能预测、mRNA二级结构最小自由能计算 | NA | 序列和表达数据 | 多个SD2变体在大肠杆菌和乳酸乳球菌的翻译耦合和非耦合系统中表达 | NA | 大肠杆菌 (Escherichia coli),乳酸乳球菌 (Lactococcus lactis) | 翻译耦合系统及非耦合系统的GFP/mCherry双报告系统 | 葡萄酒发酵,合成生物学 |
| 1297 | 2026-06-24 |
Engineering a high-efficiency expression system in Tremella fuciformis using novel promoters and optimized transformation conditions
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05004-x
PMID:42101779
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研究论文 | 报道了通过鉴定内源强启动子和优化农杆菌介导转化方法,在金耳中建立高效表达系统 | 首次在金耳中鉴定出三个超强内源启动子,其表达效率最高可达对照的1476.74%,并通过扫描电镜发现棕色氧化铝处理酵母样细胞表面损伤可提高转化效率2.25倍 | 未说明长期稳定性或在不同遗传背景下的适用性 | 开发金耳的高效表达系统以推进分子育种和合成生物学 | 金耳(Tremella fuciformis)的酵母样细胞 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、扫描电镜、荧光蛋白表达分析 | NA | 图像(扫描电镜)、荧光强度数据 | 三种启动子(P4、P5、P7)分别在转化酵母样细胞中测试,对照为野生型菌株 | 农杆菌介导转化 | 金耳(Tremella fuciformis) | 强内源启动子驱动的eGFP表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 1298 | 2026-06-24 |
AI-microbial hybrid biosensors: the next generation of intelligent detection systems
2026-May, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2678101
PMID:42212947
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综述 | 本文全面综述了人工智能与微生物生物传感器融合技术,用于病原体检测和环境监测 | 首次系统整合了AI-微生物混合生物传感器的系统架构、计算策略、转化障碍和监管考量,并强调了合成生物学、CRISPR传感和边缘计算等新兴方向 | 领域仍分散,缺乏统一的理论框架,且临床转化和监管方面存在挑战 | 全面分析和总结AI-微生物混合生物传感器在实时病原体检测和自适应生物监测中的应用现状与未来方向 | AI-微生物混合生物传感器的设计原理、集成方法、性能指标及关键挑战 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 人工智能, 机器学习, 深度神经网络 | CNN, 集成模型 | 电化学阻抗数据, 拉曼光谱数据, 高光谱显微图像 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 微生物 | 生物传感器 | 医学, 环境 |
| 1299 | 2026-06-24 |
The renaissance of Salmonella-based cancer therapy: convergence of AI, synthetic circuits, and TME remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1790215
PMID:42099610
|
综述 | 综述沙门氏菌在癌症治疗中的应用进展,重点探讨人工智能和合成生物学如何克服历史障碍 | 提出沙门氏菌从静态减毒到动态理性设计的转变,结合人工智能工具和可编程基因线路实现智能肿瘤治疗,并强调肿瘤微环境代谢重塑的作用 | 未提及具体临床转化中的安全性挑战及长期效果评估 | 概述沙门氏菌癌症疗法复兴的现状及未来方向 | 减毒沙门氏菌及工程化菌株 | 合成生物学, 人工智能 | 癌症 | 合成生物学, AI驱动工具(Cello, SHASI-ML) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 同步裂解系统, 缺氧响应逻辑门 | 沙门氏菌 | 同步裂解系统, 缺氧响应逻辑门, 可编程遗传线路 | 医学, 工业生物技术 |
| 1300 | 2026-06-24 |
Global health preparedness for biosecurity threats: a review of emerging technologies and solutions
2026, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2026.1786846
PMID:42326940
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综述 | 合成关于新兴技术在增强全球卫生生物安全威胁防范中的作用的证据 | 系统梳理了人工智能、基因组监测、合成生物学等多种新兴技术在全球生物安全防范中的应用,并提出了治理框架需求 | 仅纳入2015-2026年间51篇文献,可能存在选择性偏倚 | 评估新兴技术在增强全球卫生生物安全威胁防范中的角色 | 生物安全威胁防范新兴技术 | NA | NA | 人工智能, 基因组监测, 合成生物学, 生物传感器, 机器人技术, 数字健康平台 | NA | NA | 51篇论文 | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |