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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-06-23 |
Metabolic engineering of Vibrio natriegens for the efficient biosynthesis of ergothioneine from sucrose using non-sterile fed-batch fermentation
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.041
PMID:42325659
|
研究论文 | 通过代谢工程改造快速生长的Vibrio natriegens,从蔗糖高效合成麦角硫因并采用非无菌补料分批发酵 | 首次成功在Vibrio natriegens中构建麦角硫因生物合成途径,并利用低蔗糖成本、高盐度非无菌条件实现高效生产 | Vibrio natriegens的转化效率低、基因编辑方法有限以及发酵成本高仍是主要挑战 | 建立基于Vibrio natriegens的高效经济平台,用于麦角硫因及其他高价值化合物的生物合成 | 快速生长的Vibrio natriegens菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、电穿孔转化、补料分批发酵 | NA | NA | 2-L生物反应器中的补料分批发酵 | CRISPR-Cas9 | Vibrio natriegens | 麦角硫因生物合成途径(包括超强P启动子与弱RBS7组合,以及副产物和ATP降解基因的敲除、SAM循环和ATP合成基因的过表达) | 工业生物技术、医药 |
| 1302 | 2026-06-23 |
Streptomyces: boost chassis strains for production of invaluable natural products
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.005
PMID:42325658
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综述 | 综述2020-2025年间链霉菌底盘工程的前沿进展,探讨其成为高效天然产物生产平台的策略与未来方向 | 提出5M策略(机制-模型-操控-测量-制造),将底盘工程重构为基于工程原理的迭代系统级过程,并融合AI设计工具、多重基因组编辑等新兴技术 | NA | 系统总结链霉菌底盘工程关键策略(如基因组精简、前体重分配、调控电路重编程等),为天然产物高产提供结构化路线图 | 链霉菌底盘菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | 约150个案例(2020-2025年文献) | CRISPR-Cas9, TALEN | 链霉菌 | 代谢通路重编程,逻辑门 | 生物技术,工业生物技术 |
| 1303 | 2026-06-23 |
Advanced materials for non-alcoholic fatty liver disease and cardiovascular disease comorbidity therapeutics
2026-Oct, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 综述先进材料在非酒精性脂肪肝病与心血管疾病共病治疗中的应用 | 以材料为中心重新定义NAFLD-CVD共病,提出结合病理生理学与工程原理的转化设计框架,并涵盖多器官协同靶向、闭环系统及AI引导设计 | NA | 探讨先进材料在NAFLD-CVD共病治疗中的转化设计框架,推动从单器官症状控制向系统性代谢重编程的转变 | 非酒精性脂肪肝病与心血管疾病共病的病理机制及治疗材料 | 材料科学, 生物医学工程 | 非酒精性脂肪肝病, 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR, RNA payloads | NA | 合成生物学电路 | 医学 |
| 1304 | 2026-06-23 |
Amino acids in yeast fermentation: A review of their roles from nutrients to modulators
2026-Jul-02, International journal of food microbiology
IF:5.0Q1
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综述 | 综述酵母发酵过程中氨基酸从营养源到调控因子的多重角色 | 系统整合了氨基酸在发酵系统中的动态来源及其对酵母生理、风味代谢和胁迫耐受性的多层面调控机制 | 对非酿酒酵母及真实发酵环境异质性的理解仍存在显著知识空白 | 阐明氨基酸-酵母相互作用以优化发酵品质和效率 | 酵母(包括酿酒酵母和非酿酒酵母)及发酵系统中的氨基酸 | 微生物学 | NA | 多组学、合成生物学、生态建模 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 酵母(酿酒酵母、非酿酒酵母) | NA | 食品工业 |
| 1305 | 2026-06-23 |
Emerging porous materials for cell encapsulation
2026-Jun-22, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00071d
PMID:42132741
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综述 | 从合成生物学和材料科学角度综述细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料的最新进展 | 系统总结多孔框架材料封装细胞的合成策略,并整合细胞表面化学与活性评估方法 | 未深入讨论不同框架材料在长期稳定性与免疫原性方面的比较 | 探讨框架材料在合成细胞工程和增强细胞功能中的应用前景与挑战 | 细胞@MOF、细胞@COF、细胞@HOF复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多孔框架封装系统(MOF、COF、HOF) | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 1306 | 2026-06-23 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 综述了增强溶瘤病毒在癌症治疗中特异性和功效的策略 | 系统总结了转录靶向、微小RNA去靶向、病毒进入重定向等多层次逻辑门调控系统,以及免疫调节、纳米包裹、载体细胞运输等最新工程技术进展 | 虽然综述了多种策略,但未讨论这些方法在临床试验中的实际转化障碍或长期安全性数据 | 分析当前溶瘤病毒工程化进展,以解决肿瘤选择性不足和治疗效果有限的问题 | 溶瘤病毒及其工程化改造策略 | 机器学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 哺乳动物细胞 | 逻辑门调控系统, 开关, 代谢通路 | 医学 |
| 1307 | 2026-06-23 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
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review | 综述了乳酸杆菌的工程化改造及其在治疗递送和生物传感中的应用,重点讨论了其生态位适应机制带来的启示 | 系统总结了乳酸杆菌通过合成生物学工具(如CRISPR-Cas系统)从传统益生菌向多功能治疗递送和生物传感平台转化的最新进展 | 工程化乳酸杆菌的稳定性和法规监管方面仍存在挑战 | 探讨乳酸杆菌作为活体生物治疗产品和生物传感器的工程化应用潜力 | 乳酸杆菌及其工程化改造产物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 基因工程, 包囊技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸杆菌 | 治疗递送系统(重组蛋白、疫苗、细胞因子、靶向酶、多肽),生物传感器(全细胞或无细胞平台检测病原体、毒素、临床生物标志物) | 医学, 食品安全, 环境监测, 诊断 |
| 1308 | 2026-06-23 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
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研究论文 | 提出通过逆转录和同源重组实现RNA模板化多样性生成的进化假说 | 首次系统提出逆转录酶介导的多样性生成机制,认为细胞或外源RNA通过逆转录和同源重组整合入基因组,从而利用模块化遗传信息偏向性地改变序列空间的探索分布 | 该机制目前仅为进化假说,缺乏直接实验证据支持,且逆转录活性的细胞调控频率尚不清楚 | 探讨RNA介导的多样性生成机制及其在基因组进化和遗传变异中的作用 | 多样性生成逆转录元件、逆转录转座子、端粒酶、体细胞高频突变等生物机制,以及转录假基因和重复序列 | 进化生物学 | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe方法 | NA | NA | 医学 |
| 1309 | 2026-06-23 |
Global reports on Glutamicibacter: a mini review
2026-Feb-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2025.72.2.2
PMID:42322567
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综述 | 这篇综述全面整合了最新关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识 | 提供关于谷氨酸杆菌这一稀有放线菌群的综合当代视角,并指出通过基因组挖掘、代谢组学和合成生物学方法开展未来研究的方向 | 大多数物种中的生物合成基因簇尚未表征,植物-微生物和昆虫-微生物相互作用的机制了解有限,酶和代谢产物的工业开发受到限制 | 整合关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识,并识别未来研究前景 | 谷氨酸杆菌物种 | NA | NA | 16S rRNA测序, 系统基因组学, 基因组挖掘, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 生态数据 | NA | NA | 谷氨酸杆菌(Glutamicibacter) | NA | 食品安全, 农业, 生物修复, 治疗 |
| 1310 | 2026-06-23 |
Bacteriophage therapy against multidrug resistant bacterial infections demonstrates clinical advances and engineering innovations between 2020-2026
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1865548
PMID:42326420
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综述 | 本文综述了2020至2026年间噬菌体疗法对抗多重耐药细菌感染的临床进展和工程创新 | 系统总结了噬菌体疗法的最新临床经验、基因工程进展(包括CRISPR系统)、组合疗法及合成噬菌体颗粒等创新技术 | 随机对照试验数据有限,监管标准、规模化生产和耐药管理仍面临挑战 | 评估噬菌体疗法作为多重耐药细菌感染治疗策略的潜力 | 多重耐药细菌感染的噬菌体疗法 | 机器学习 | 多重耐药细菌感染 | NA | NA | 文献 | NA | CRISPR-Cas系统 | 噬菌体 | 噬菌体递送的CRISPR抗菌剂、杂交递送平台、合成噬菌体颗粒 | 医学 |
| 1311 | 2026-06-22 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
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研究论文 | 提出了一种基于蛋白质语言模型嵌入的深度学习模型DeepSolNet,用于准确预测蛋白质溶解度 | 利用先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian结合双向长短期记忆网络、卷积神经网络和注意力机制的多模块架构,显著提升了溶解度预测性能 | 在独立测试集上的准确率仅为0.53,性能仍有提升空间 | 提高蛋白质溶解度的预测准确性,以促进合成生物学和蛋白质工程中的应用 | 蛋白质溶解度预测相关的序列数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, 注意力机制 | 序列 | 验证集和独立测试集包含γ-抗体、转谷氨酰胺酶和醛脱氢酶序列 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1312 | 2026-06-21 |
Efficient site-specific gene addition using R2 retrotransposons in tobacco and rice
2026-Jun-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03181-6
PMID:42321491
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研究论文 | 本文介绍了一种利用R2逆转录转座子在烟草和水稻中进行高效位点特异性基因添加的方法 | 首次在植物中重建非长末端重复R2逆转录转座子活性,实现无双链断裂的RNA模板化多位点基因整合,效率高达75% | 仅针对rDNA位点进行整合,可能存在位置效应,且转化效率在愈伤组织中最高仅为17% | 开发一种高效、精确的植物基因整合技术,用于作物改良和合成生物学 | 烟草(Nicotiana benthamiana)和水稻(Oryza sativa) | 合成生物学 | NA | R2逆转录转座子、重组RNA病毒介导的供体递送 | NA | NA | 烟草和水稻细胞及愈伤组织,具体数量未明确 | R2逆转录转座子 | 烟草(Nicotiana benthamiana),水稻(Oryza sativa) | 位点特异性基因整合系统(含R2逆转录转座酶和重组酶兼容着陆垫) | 农业, 合成生物学 |
| 1313 | 2026-06-21 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
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综述 | 该综述综合了2020-2026年微生物生物复合材料在制备、修饰及功能应用方面的最新进展,重点涉及细菌纤维素和真菌菌丝体 | 将微生物生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法相结合,突出了跨学科协同创新的潜力 | 讨论了当前工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面的监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员和专业人士提供关键且全面的视角,强调微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交汇平台的潜力 | 微生物生物复合材料,重点包括细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学,应用微生物学 | NA | 3D打印,合成生物学,矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药,环境,工业生物技术 |
| 1314 | 2026-06-20 |
Bacterial mRNA Vaccines: Programming Immunity Against Antimicrobial Resistance
2026-Aug, Drug development research
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/ddr.70335
PMID:42318873
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综述 | 这篇综述概述了细菌mRNA疫苗在应对抗菌药物耐药性方面的最新进展,包括抗原设计、mRNA工程和递送平台优化 | 整合了人工智能引导的抗原发现、合成生物学和下一代递送系统以加速临床转化,强调克服现有障碍以建立mRNA疫苗作为对抗耐药感染的可行策略 | 细菌抗原结构的复杂性、实现有效黏膜和细胞递送的挑战、诱导平衡Th1/Th17主导免疫反应的困难以及免疫持久性问题 | 应对抗菌药物耐药性威胁,开发细菌mRNA疫苗 | 结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎链球菌等关键细菌病原体 | 合成生物学, 疫苗学 | 细菌感染性疾病, 抗菌药物耐药性 | mRNA工程, 脂质纳米颗粒递送, 人工智能引导的抗原发现, 合成生物学 | NA | NA | NA | 脂质纳米颗粒, 人工智能, 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 1315 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力,提出周质体腔(PPC)作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔(PPC)作为工程化细胞区室的萜类合成潜力,揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证,需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔(PPC)用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔(PPC)、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径(包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达) | 工业生物技术 |
| 1316 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能,并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR、AND等) | 合成生物学应用(计算、生物传感、人类健康) |
| 1317 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器,实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链,通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制,并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及,但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |
| 1318 | 2026-06-20 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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研究论文 | 提出一种通过后插入蛋白-脂质偶联物自下而上构建病毒样颗粒的方法 | 创新性地利用SNAP-tag/BG生物正交反应将蛋白质共价偶联到脂质上,实现无需去垢剂的脂质体膜插入,解耦了蛋白质设计与脂质体设计,便于快速系统优化VLP | 未提及具体限制,但可能涉及蛋白质-脂质偶联效率、颗粒稳定性及体内应用时的免疫原性问题 | 开发一种模块化、可优化的病毒样颗粒构建策略,用于疫苗、药物递送和合成生物学应用 | GFP蛋白和SARS-CoV-2 Spike蛋白 | 合成生物学 | 新型冠状病毒病 | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染色透射电子显微镜、酶联免疫吸附测定 | NA | 图像(电子显微镜)、荧光信号(流式细胞术) | 研究所用样本包括GFP蛋白和Spike蛋白修饰的脂质体,具体数量未提及 | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物构建及后插入脂质体形成病毒样颗粒 | 医学, 合成生物学 |
| 1319 | 2026-06-20 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 系统综述了通过代谢工程和合成生物学方法改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 | 首次全面总结了利用Rhodobacter sphaeroides作为底盘生物生产辅酶Q10和卟啉的工程策略,包括前体供应增强、代谢路径优化、氧化还原和能量平衡调控、全局调控系统操纵及发酵控制 | 未提及具体实验数据或定量比较不同工程策略的效果,主要基于文献综述 | 梳理Rhodobacter sphaeroides的代谢特性、天然调控网络和工程方法,突出其作为合成生物学底盘生产辅酶Q10和卟啉类化合物的潜力 | Rhodobacter sphaeroides紫色非硫光合细菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径的优化 | 工业生物技术, 医药 |
| 1320 | 2026-06-20 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 该文章综述了二萜合酶在生物活性二萜类化合物合成中的关键作用,并建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的数据库,为通过合成生物学和代谢工程高效生产二萜类化合物提供了资源 | 首次建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库,并通过整合生物信息学分析阐明了不同功能类别二萜合酶的催化机制、产物多样性及系统发育分布,为二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的开发提供了新方向 | 未提及具体局限性,但可能包括数据库的更新频率、部分二萜合酶功能验证的局限性以及实际工业生产中面临的产量和纯度挑战 | 总结代表性二萜类化合物的生物活性和应用,建立功能二萜合酶数据库,并探讨二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的未来发展方向 | 二萜合酶和二萜类化合物 | 机器学习和数字病理学之外的合成生物学与代谢工程领域 | 不适用 | 合成生物学、代谢工程、生物信息学分析 | 不适用 | 序列和功能数据(562个功能表征的二萜合酶) | 562个功能表征的二萜合酶 | 不适用 | 微生物细胞工厂(具体未指定,如大肠杆菌、酿酒酵母等) | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药、农业、化妆品、食品 |