本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价5元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1321 | 2024-09-01 |
Reprogramming Microbial CO2-Metabolizing Chassis With CRISPR-Cas Systems
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.897204
PMID:35814004
|
综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在微生物CO2代谢底盘中的应用及其在碳负性生物技术中的革命性作用 | 介绍了CRISPR-Cas系统在蓝藻、醋酸菌和甲烷菌中的最新进展,并展望了未来基于CRISPR-Cas系统的创新技术,如碱基编辑、前导编辑和转座子介导的基因组编辑 | NA | 探讨如何利用合成生物学工具,特别是CRISPR-Cas系统,开发和应用微生物CO2代谢底盘,以实现碳中和和碳负性生物技术,从而应对全球变暖问题 | 微生物CO2代谢底盘,包括蓝藻、醋酸菌和甲烷菌 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
1322 | 2024-09-01 |
Molecular Advancements Establishing Chlamydomonas as a Host for Biotechnological Exploitation
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.911483
PMID:35845675
|
综述 | 本文综述了近期在利用莱茵衣藻作为生物技术平台的进展,包括核转基因表达的改进、MoClo合成生物学策略的应用、转基因设计和表达的优化以及CRISPR/Cas9基因编辑技术的进步。 | 文章介绍了莱茵衣藻作为生物技术平台的多个创新点,包括核转基因表达的稳定性和效率提升、MoClo合成生物学策略的发展、转基因设计的系统性改进以及CRISPR/Cas9技术的应用。 | NA | 探讨莱茵衣藻作为生物技术平台的潜力和应用前景。 | 莱茵衣藻的生物技术应用和合成生物学潜力。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
1323 | 2024-08-31 |
Lipid-Based Catalysis Demonstrated by Bilayer-Enabled Ester Hydrolysis
2024-Jul-30, Membranes
IF:3.3Q2
DOI:10.3390/membranes14080168
PMID:39195420
|
研究论文 | 本文展示了脂质双层膜的疏水区域为催化反应提供适宜环境的能力,并通过酯水解反应验证了这一概念 | 首次展示了脂质双层膜在生物系统中作为催化剂的可能性 | 催化反应速度比酶催化慢,催化转化数在10-7到10-8 s之间 | 探索脂质及其聚集体在生物化学、药理学和合成生物学中的催化作用 | 脂质双层膜的催化能力及其在酯水解反应中的应用 | NA | NA | H-NMR | NA | 荧光 | NA |
1324 | 2024-08-31 |
Bifurcation drives the evolution of assembly-line biosynthesis
2022-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30950-z
PMID:35715397
|
研究论文 | 本文探讨了生物合成装配线的重编程及其在抗生素结构进化中的作用 | 揭示了基因重复和新功能化如何导致生物合成途径的分支,以及这种分支如何促进抗生素结构的进化 | NA | 深入了解生物合成装配线的设计过程及其进化机制 | 抗结核药物wollamides的生物合成途径 | 生物技术 | 结核病 | 基因重复和新功能化 | NA | 基因组数据 | NA |
1325 | 2024-08-31 |
Chemical Communication in Artificial Cells: Basic Concepts, Design and Challenges
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.880525
PMID:35720123
|
综述 | 本文综述了人工细胞间分子通信的基本概念、设计及挑战 | 强调了人工细胞间通信的重要性,并分类讨论了不同通信模式,如自分泌、邻分泌、旁分泌和内分泌信号 | NA | 探讨人工细胞间通信的设计及其在生物技术、高级胶体材料和再生医学中的应用潜力 | 人工细胞间的分子通信 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1326 | 2024-08-30 |
Multi-modal deep learning enables efficient and accurate annotation of enzymatic active sites
2024-Aug-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51511-6
PMID:39187482
|
研究论文 | 介绍了一种名为EasIFA的酶活性位点注释算法,该算法结合了蛋白质语言模型和3D结构编码器的潜在酶表示,并通过多模态交叉注意力框架将蛋白质级信息与酶反应知识对齐 | EasIFA算法在速度和准确性上均优于现有算法,实现了10倍的加速和显著的性能提升 | NA | 开发一种高效且准确的酶活性位点注释算法,以推动药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学等多个领域的发展 | 酶活性位点的自动注释 | 机器学习 | NA | 多模态深度学习 | 多模态交叉注意力框架 | 蛋白质结构数据 | NA |
1327 | 2024-08-30 |
Synthetic spatial patterning in bacteria: advances based on novel diffusible signals
2022-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13979
PMID:34843638
|
综述 | 本文综述了细菌中合成空间模式化的进展,特别是基于新型可扩散信号的研究 | 介绍了新的潜在候选小分子信号,这些信号可以调节大肠杆菌中的基因表达,有助于合成生物学家设计更复杂、稳健和可调的空间结构 | NA | 探讨工程化多细胞模式化在理解模式形成基本规律中的作用,并可能对发育生物学领域做出贡献 | 细菌中的合成空间模式化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1328 | 2024-08-30 |
Phylogeny-Informed Synthetic Biology Reveals Unprecedented Structural Novelty in Type V Glycopeptide Antibiotics
2022-May-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.1c01389
PMID:35647273
|
研究论文 | 本文通过结合系统发育引导的基因组挖掘策略和异源生产技术,利用GPAHex合成生物学平台,发现了五种新型V型糖肽抗生素,并对其结构和生物活性进行了表征 | 本文发现了具有前所未有结构新颖性的V型糖肽抗生素,包括rimomycin和misaugamycin,后者具有独特的N-C交叉连接和N-端酰化 | NA | 旨在发现能够克服糖肽抗生素抗性的新型糖肽抗生素 | 五种新型V型糖肽抗生素:rimomycin-A/B/C和misaugamycin-A/B | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘策略,异源生产技术 | GPAHex合成生物学平台 | 糖肽抗生素结构 | 五种新型V型糖肽抗生素 |
1329 | 2024-08-29 |
Posttranscriptional tuning of gene expression over a large dynamic range in synthetic tobacco chloroplast operons
2024-Sep, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16930
PMID:39031552
|
研究论文 | 本研究探讨了烟草叶绿体中gfp报告基因的表达,通过使用叶绿体atpH 5' UTR的变体,揭示了内源性烟草PPR10在不同设计背景下与烟草和玉米atpH 5' UTR结合时对报告基因激活的不同水平 | 研究发现了PPR10通过一种独立于其稳定单顺反子转录本的机制激活翻译,并且引入tRNA上游的UTR几乎消除了gfp mRNA和GFP蛋白,这表明tRNA促进了RNA切割和5'外切核酸酶降解,导致PPR10没有足够时间结合和保护gfp RNA | NA | 探索在合成烟草叶绿体操纵子中实现基因表达的转录后调控 | gfp报告基因在烟草叶绿体中的表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | RNA | 不同设计的烟草和玉米atpH 5' UTR变体 |
1330 | 2024-08-29 |
A Self-Assembling γPFD-SpyCatcher Hydrogel Scaffold for the Coimmobilization of SpyTag-Enzymes to Facilitate the Catalysis of Regulated Enzymes
2024-Aug-28, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c03403
PMID:39194331
|
研究论文 | 本研究建立了一种能够自发组装的γPFD-SpyCatcher水凝胶支架,用于共固定化SpyTag-酶,以促进受调控酶的催化作用 | 该研究展示了γPFD-SpyCatcher水凝胶在提高酶的热稳定性和pH稳定性的同时,还能快速提供纯酶,并在体外实验中显著提高了酶的活性 | NA | 探索γPFD-SpyCatcher水凝胶在共固定化酶中的应用,以提高酶的稳定性和活性 | γPFD-SpyCatcher水凝胶、SpyTag-酶(如SpyTag-己糖激酶、SpyTag-磷酸果糖激酶和SpyTag-丙酮酸激酶) | 生物技术 | NA | 水凝胶技术 | NA | 酶活性数据 | NA |
1331 | 2024-08-28 |
Over the rainbow: structural characterization of the chromoproteins gfasPurple, amilCP, spisPink and eforRed
2022-May-01, Acta crystallographica. Section D, Structural biology
DOI:10.1107/S2059798322002625
PMID:35503208
|
研究论文 | 本文介绍了四种开放源代码的色蛋白gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed的高分辨率X射线晶体结构 | 首次提供了这四种色蛋白的高分辨率结构信息,有助于蛋白质工程和合成生物学应用 | 色蛋白在合成生物学中的应用不如相关荧光蛋白广泛,部分原因是缺乏结构表征 | 研究色蛋白的结构特性,以促进其在蛋白质工程和合成生物学中的应用 | gfasPurple、amilCP、spisPink和eforRed四种色蛋白 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 四种色蛋白 |
1332 | 2024-08-28 |
Engineering Light-Control in Biology
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.901300
PMID:35573251
|
综述 | 本文综述了在生物学中利用工程技术创建和优化光调控蛋白的方法 | 探讨了通过蛋白质工程和合成生物学方法开发新型光遗传蛋白的创新策略 | 并非对光敏感调节剂的百科全书式总结,而是通过选定实例讨论光调控蛋白工程的重要方面 | 旨在讨论通过选定实例进行光调控蛋白工程的重要方面 | 光遗传蛋白的开发和优化 | 生物工程 | NA | 光遗传学 | NA | 蛋白质 | NA |
1333 | 2024-08-28 |
Natural Composition and Biosynthetic Pathways of Alkaloids in Medicinal Dendrobium Species
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.850949
PMID:35599884
|
综述 | 本文综述了药用石斛属植物中生物碱的自然组成及其生物合成途径 | 探讨了高通量测序技术在生物碱途径发现中的应用以及合成生物学在大规模生产生物碱中的应用 | NA | 深入研究生物碱的组成及其生物合成途径 | 石斛属植物中的生物碱 | NA | NA | 高通量测序技术 | NA | 基因组注释 | NA |
1334 | 2024-08-27 |
Exploring genetic codon expansion for unnatural amino acid incorporation in filamentous fungus Aspergillus nidulans
2024-Sep-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.018
PMID:39067577
|
研究论文 | 本研究在丝状真菌Aspergillus nidulans中开发了遗传密码扩展技术,实现了非天然氨基酸的掺入 | 首次在丝状真菌中成功开发遗传密码扩展技术,为研究真菌蛋白质结构和功能提供了新方法 | NA | 旨在填补丝状真菌在遗传密码扩展技术应用方面的空白 | Aspergillus nidulans中的蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质 | NA |
1335 | 2024-08-27 |
Advanced Wound Diagnostics: Toward Transforming Wound Care into Precision Medicine
2022-06, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2020.1319
PMID:34128387
|
综述 | 本文综述了先进的伤口诊断技术,包括生物标志物和成像系统,以及它们在将伤口护理转变为精准医学中的应用 | 介绍了多种生物标志物和成像技术,如蛋白酶、急性期反应物、挥发性排放物和超声、自体荧光、光谱成像及光学相干断层扫描等,这些技术正在改变我们对分子伤口环境的理解,并引入现代治疗策略 | 尽管已经识别出许多潜在的生物标志物并开发了多种成像系统,但仍需要更多高质量的随机对照试验来阐明这些工具在临床环境中改变愈合动态或预测伤口闭合的作用 | 推动伤口护理向精准医学转变,开发基于证据的方法,这些方法具有预测性、规定性和个性化 | 非愈合伤口的诊断和治疗 | NA | NA | 生物标志物检测和成像技术 | NA | 生物标志物数据和成像数据 | NA |
1336 | 2024-08-27 |
Bottlenecks and opportunities for synthetic biology biosafety standards
2022-04-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29889-y
PMID:35449163
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1337 | 2024-08-27 |
A hierarchy of biomolecular proportional-integral-derivative feedback controllers for robust perfect adaptation and dynamic performance
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29640-7
PMID:35440114
|
研究论文 | 本文探讨了通过生物分子反应实现比例-积分-微分(PID)控制器的方法,并提出了一系列在简单性和高性能之间取得平衡的拓扑结构。 | 本文首次展示了不同生物分子PI控制器的性能增强能力,并介绍了基于非一致前馈环的微分控制器,以及通过将分子积分器置于负反馈环中实现微分器的方法。 | NA | 研究如何通过生物分子反应实现PID控制器,以提高系统的稳定性和动态性能。 | 生物分子PID控制器的实现及其在合成生物学和网络遗传学领域的应用。 | 合成生物学 | NA | 生物分子反应 | PID控制器 | 生物分子 | 单个酵母细胞 |
1338 | 2024-08-27 |
A Versatile Transcription Factor Biosensor System Responsive to Multiple Aromatic and Indole Inducers
2022-04-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00063
PMID:35316041
|
研究论文 | 本文构建了一种基于TetR家族抑制子CmeR的变构转录因子(aTF)遗传回路,该回路作为水杨酸盐生物传感器在模型生物中发挥作用,并能响应多种芳香族和吲哚诱导物 | 本文展示了CmeR调控的启动子对多种芳香族和吲哚诱导物的响应能力,扩展了aTF生物传感器的应用范围 | NA | 开发多功能变构转录因子生物传感器系统,以促进代谢工程、生物技术和合成生物学中的应用 | 变构转录因子CmeR及其在微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1339 | 2024-08-27 |
Harnessing phosphonate antibiotics argolaphos biosynthesis enables a synthetic biology-based green synthesis of glyphosate
2022-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29188-6
PMID:35365617
|
research paper | 本文通过合成生物学方法优化了氨基甲基膦酸(AMP)的生产,并开发了一种将AMP转化为草甘膦的高效化学工艺 | 利用合成生物学策略提高了AMP的生产效率,并开发了一种新的化学转化工艺 | NA | 开发一种环保的草甘膦生产方法 | 氨基甲基膦酸(AMP)和草甘膦的生产 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 化学物质 | NA |
1340 | 2024-08-27 |
Harnessing the Algal Chloroplast for Heterologous Protein Production
2022-Mar-30, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10040743
PMID:35456794
|
综述 | 本文综述了利用藻类叶绿体作为异源蛋白生产的宿主,并讨论了当前的技术工具和需要解决的技术瓶颈 | 藻类叶绿体因其基因组较小,成为合成生物学方法的理想目标,并可作为产品分隔积累和储存的便利亚细胞位点 | 需要解决的主要技术瓶颈包括开发稳健和可持续的绿色细胞生物工厂 | 探讨利用藻类叶绿体进行异源蛋白生产的技术现状和未来发展 | 藻类叶绿体作为异源蛋白生产的宿主 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |