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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2026-06-20 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
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研究论文 | 提出Nullsettes评估框架,测试基因组语言模型对合成表达盒中功能丧失突变的预测能力 | 通过进化上不可信的序列设计,区分模型对序列功能的理解与对天然基因组模式的记忆 | 未能检测到强功能丧失突变,预测准确性严重依赖进化模式匹配而非基因表达机制理解 | 评估基因组语言模型对DNA序列功能的理解程度 | 合成表达盒中的功能丧失突变序列 | 机器学习 | NA | 基因组语言模型 | Transformer | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1322 | 2026-06-20 |
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00063
PMID:42267686
|
研究论文 | 开发基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的模块化可编程益生菌策略,整合代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫,在抗生素暴露后预防铜绿假单胞菌感染 | 首次将代谢物补充(丁酸)与抗原特异性黏膜免疫模块整合于同一益生菌平台,实现独立模块的灵活组合与协同保护 | 仅在抗生素暴露后的小鼠模型中验证,尚未评估在无菌动物或人类中的效果 | 开发一种抗生素暴露后恢复微生物稳态并激发黏膜免疫的益生菌策略,用于预防铜绿假单胞菌感染 | 抗生素暴露后的小鼠模型 | 合成生物学 | 铜绿假单胞菌感染 | NA | NA | NA | 小鼠模型(具体数量未说明) | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 丁酸过量生产模块、外膜囊泡展示PcrV或OprL抗原模块 | 医学 |
| 1323 | 2026-06-20 |
Special Issue on Mammalian Cell Synthetic Biology
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00447
PMID:42317055
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1324 | 2026-06-20 |
T-cell engagers in cancer immunotherapy: mechanisms, challenges, and future perspectives
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755512
PMID:42317371
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综述 | 本文综述了T细胞衔接器在癌症免疫治疗中的机制、挑战和未来前景 | 系统比较了T细胞衔接器与CAR-T细胞疗法的疗效、安全性、毒性和成本,并探讨了提高特异性和降低毒性的新策略,如肿瘤选择性激活和CD3亲和力调节 | 实体瘤中仍面临抗原异质性和免疫抑制肿瘤微环境的挑战 | 总结T细胞衔接器平台的发展现状,分析其临床成功案例与挑战,并展望未来方向 | T细胞衔接器平台,包括双特异性(BiTE)和三特异性(TriTE)T细胞衔接器、双重亲和力重定向(DART)及其他新兴格式 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤,实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 人类 | T细胞衔接器(包括双特异性和三特异性结构) | 医学 |
| 1325 | 2026-06-20 |
Metabolic engineering strategies for optimized lignan production in plants
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1827862
PMID:42318117
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综述 | 本文综述了植物中优化木脂素生产的代谢工程策略,提出了“推-拉-释放”框架,并探讨了合成生物学原理在植物系统中的应用 | 提出了“推-拉-释放”整合框架,系统组织转录调控、代谢流优化和CRISPR基因组编辑等多层策略,并讨论了空间时间调控和系统表型评估的需求 | 木脂素产量最大化需平衡植物结构完整性和抗病性之间的权衡,缺乏对实际应用效果的全面验证 | 总结现有木脂素代谢工程方法,提出未来整合策略以实现可持续生产的同时保持植物适应性 | 植物中木脂素(如芝麻素、鬼臼毒素、SDG)的生产优化 | 代谢工程 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物(如亚麻) | 推-拉-释放框架:推策略(增加前体供应)、拉策略(重定向代谢流)、释放策略(缓解途径抑制),以及模块化途径重建、多组分基因组编辑和时空调控 | 医药 |
| 1326 | 2026-06-20 |
A Survey of Recent Practice of Artificial Life in Visual Art
2024-02-01, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl_a_00433
PMID:38393968
|
综述 | 对过去40年视觉艺术中人工生命实践的文献综述,提出分类标准与分类体系 | 首次系统梳理视觉艺术领域中人工生命作品,建立分类标准与术语体系 | 仅关注计算与软件领域,未涵盖硬件艺术实现形式 | 系统性概述艺术家如何理解自然并用现代技术创造新生命 | 视觉艺术中的人工生命作品 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 艺术 |
| 1327 | 2026-06-20 |
IMP: bridging the gap for medicinal plant genomics
2024-01-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad898
PMID:37870445
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研究论文 | 开发了一个整合药用植物基因组和转录组数据的综合平台IMP | 提供了一个公开可访问的一站式平台,包含84个高质量基因组组装和2156个转录组样本,集成了10个分析模块 | 未提及注释数据的准确性验证或与其他数据库的整合情况 | 促进药用植物分子代谢途径的理解,推动合成生物学和药物发现 | 药用植物的基因组和转录组数据 | 数字病理学 | NA | 基因组测序, 转录组测序 | NA | 基因组序列, 转录组表达数据 | 84个高质量基因组组装和2156个转录组测序样本 | NA | 药用植物 | NA | 医学, 药物发现, 合成生物学 |
| 1328 | 2026-06-19 |
Marine bioactive compounds in the management of zoonotic parasitic diseases: public health ramifications, mechanisms, and translational prospects
2026-Aug, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108574
PMID:42155906
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综述 | 探讨海洋生物活性化合物在管理人畜共患寄生虫病中的潜力,涵盖作用机制、药物发现新方法和可持续生产途径 | 整合了海洋来源抗寄生虫化合物的多种作用机制,并提出了AI辅助筛选、网络药理学和纳米技术递送系统等创新药物开发方法 | 海洋生物活性化合物的药代动力学、安全性和临床应用仍需进一步研究 | 评估海洋生物活性物质作为抗人畜共患寄生虫病创新药物的潜力 | 海洋生物活性化合物 | 数字病理学 | 人畜共患寄生虫病(包括溶组织内阿米巴、十二指肠贾第鞭毛虫、微孢子虫和阴道毛滴虫感染) | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1329 | 2026-06-19 |
CRISPR-Cas9: Genome Engineering and Future Vaccine Applications
2026-Jul, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01563-4
PMID:41840308
|
综述 | 综合评述CRISPR-Cas9系统在理性疫苗设计中的应用进展与挑战 | 将CRISPR衍生平台(碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a)从治疗性基因编辑重新定位为疫苗学不可或缺的工具,提出从经验方法转向理性免疫的范式转变 | 存在脱靶编辑风险、体内递送效率低下以及基因修饰疫苗的监管路径未明确等转化障碍 | 探讨CRISPR技术用于开发程序化精准疫苗应对新发和重现病原体的前景 | CRISPR-Cas9及其衍生平台(碱基编辑、先导编辑、CRISPRi/a) | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 1330 | 2026-06-19 |
Bacteria as anticancer agents: bioactive metabolites, engineered platforms, and translational mechanisms
2026-Jun-12, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovag050
PMID:42240519
|
综述 | 本文综述了细菌作为抗癌剂的潜力,包括其产生的生物活性代谢物、工程化平台及转化机制 | 系统总结了细菌来源的多种生物活性代谢物及其抗癌机制,并结合宏基因组学、基因组挖掘和合成生物学技术,突出了工程化细菌平台在肿瘤靶向治疗中的创新应用 | 尽管具有前景,但细菌衍生物在毒性、产量、选择性和临床转化方面仍存在挑战 | 探讨细菌衍生物在抗癌治疗中的现状与未来发展方向 | 细菌及其产生的生物活性代谢物和相关工程化平台 | NA | 癌症 | 宏基因组学, 基因组挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌(放线菌、芽孢杆菌、假单胞菌、海洋来源菌等) | 工程化细菌平台(选择性定植肿瘤、递送治疗分子、激活前药疗法) | 医学 |
| 1331 | 2026-06-19 |
Engineered suppressor tRNAs enable precise translational control of genetic circuits in E. coli
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag623
PMID:42312487
|
研究论文 | 通过工程化携带标准氨基酸的抑制性tRNA,在大肠杆菌中实现遗传电路的精确翻译调控 | 首次系统筛选了20种抑制性tRNA变体,明确了tRNA反密码子与琥珀终止密码子相似性决定翻译通读效率的设计规律,并展示了其在生物传感器和代谢工程中的应用 | 未探讨在多种宿主或复杂环境中的普适性;长期稳定性及脱靶效应未被评估 | 开发用于遗传电路精确正交翻译调控的工程化抑制性tRNA工具 | 大肠杆菌中的抑制性tRNA及其对遗传电路的调控效果 | 合成生物学 | NA | 抑制性tRNA工程化、糖酵解通量动态平衡 | NA | NA | 20种tRNA变体;涉及LacI生物传感器和代谢工程菌株 | 抑制性tRNA | 大肠杆菌 | LacI生物传感器、代谢通路(pykA/pykF调控)用于N-乙酰神经氨酸增产 | 工业生物技术、医学 |
| 1332 | 2026-06-19 |
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03036-4
PMID:42243878
|
综述 | 本文综述了药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 | 强调了多组学技术、合成生物学与生物技术工具在解锁内生真菌生物合成潜力中的整合应用 | 低产量、沉默基因簇及大规模生产困难仍是主要障碍 | 探索药用植物内生真菌作为下一代治疗药物生物工厂的潜力 | 药用植物内生真菌及其产生的次生代谢产物 | NA | NA | OSMAC, 共培养, 表观遗传修饰, 基因组学, 转录组学, 代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 药用植物 | NA | 医药 |
| 1333 | 2026-06-19 |
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jun, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01549-8
PMID:41485148
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综述 | 本文综述了除虫菊酯生物合成的最新进展,并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现其可持续生产的可能性 | 将除虫菊酯生产从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新思路,总结了关键酶的发现与异源合成进展 | 异源合成仍面临代谢路径瓶颈和工程技术挑战,具体解决方略尚需进一步验证 | 探索除虫菊酯的异源生物合成途径,并利用工程细胞工厂实现规模化、可持续生产 | 除虫菊酯及其生物合成途径中的关键酶和代谢路径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程微生物、酵母 | 除虫菊酯生物合成途径 | 农业、环境 |
| 1334 | 2026-06-19 |
A review on Mitragyna alkaloids pharmacology, biosynthesis and biotechnological insights
2026-Jun, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2026.100710
PMID:42309612
|
综述 | 综述九种帽柱木属植物的民族植物学、药理特性、植物化学组成及生物技术方法 | 更新了2022至2024年间九种帽柱木属植物的研究,并全面回顾了其植物生物技术方法及吲哚生物碱的代谢工程和合成生物学进展 | NA | 总结帽柱木属植物的药理特性、生物合成途径及生物技术应用,以促进可持续的药用化合物生产 | 九种帽柱木属植物(美丽帽柱木、多裂帽柱木、托叶帽柱木等)及其次生代谢产物如帽柱木碱、钩藤碱和异钩藤碱 | NA | 心血管疾病、神经系统疾病、消化系统疾病 | 植物生物技术(培养基操控、前体喂饲、植物生长调节、诱导),代谢工程,合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 帽柱木属植物 | 吲哚生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 1335 | 2026-06-19 |
Hypergraph learning with multi-dimensional metabolite feature extractions and static-dynamic attention mechanisms to fill missing reactions in metabolic networks
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag314
PMID:42308419
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研究论文 | 提出一种基于超图学习的多维代谢物特征提取与静动态注意力机制方法,用于预测和填补代谢网络中的缺失反应 | 首次结合超图神经网络、多种预训练语言模型和静动态多头注意力机制,实现代谢网络中缺失反应的高精度预测 | 仅在计算层面验证,未在湿实验中对预测的缺失反应进行生物学验证 | 提高基因组规模代谢模型重建质量,自动填补知识空白中的缺失反应 | 108个BiGG数据库中的基因组规模代谢模型及24种细菌的表型数据 | 机器学习 | NA | 超图学习、预训练语言模型、多头注意力机制 | 超图神经网络、有向图神经网络 | 代谢物特征和反应数据 | 108个GEMs和24种细菌生物体 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学、生物制造、生物医学 |
| 1336 | 2026-06-19 |
Genetically engineered pig-to-human liver xenotransplantation
2026-Mar, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.044
PMID:41076089
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研究论文 | 本文报道了全球首例基因编辑猪肝向活体人类进行辅助异种移植并存活171天的病例 | 首次在活体人类中进行10基因编辑猪肝辅助异种移植,实现171天存活,并详细记录了异种移植相关血栓性微血管病的免疫学和组织病理学分析 | 患者最终因反复上消化道出血死亡,且移植后38天因xTMA移除辅助肝,长期成功率尚待改进 | 探索基因编辑猪肝作为人类肝移植桥接策略的可行性 | 接受10基因编辑猪肝辅助异种移植的右叶大肝细胞癌患者 | 合成生物学与临床移植 | 肝细胞癌,肝衰竭 | 基因编辑(10个靶向基因编辑) | NA | 临床监测数据 | 1例患者 | CRISPR-Cas9(基于10基因编辑平台) | 猪 | 基因敲除(异种抗原基因)和基因敲入(7个人类免疫和凝血相容性基因) | 医学 |
| 1337 | 2026-06-19 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于2325个宏基因组样本,构建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录(CRMC),揭示了维生素合成微生物的路径选择和基因共选择模式 | 首次构建大规模反刍动物胃肠道维生素合成微生物参考基因组目录,发现不同反刍动物宿主间维生素合成微生物存在高度趋同的路径选择和基因共选择模式,且与人类肠道微生物组具有一致性 | 未提及因果关系验证和功能实验验证 | 系统解析反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征和生态分布模式 | 8种反刍动物宿主的2325个宏基因组样本 | 微生物组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本,来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物(8种宿主) | NA | 农业, 医学 |
| 1338 | 2026-06-19 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-11-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
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研究论文 | 通过将葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶共封装于二氧化硅纳米胶囊内,构建自放大质子生成的类线粒体ATP纳米发生器,实现人工细胞自主能量供应和代谢耦合 | 首次通过定量共封装葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶于二氧化硅纳米胶囊中,建立自增强酶级联反应放大质子生成,并结合ATP酶整合脂质体双层涂层,实现高效ATP合成 | 研究主要基于人工细胞模型(巨型单层囊泡),在更复杂细胞环境中长期稳定性和集成效率有待验证 | 构建能够自主供应能量并耦合代谢的人工线粒体,推动自下而上合成生物学发展 | 人工细胞模型中的线粒体模拟ATP纳米发生器 | 合成生物学 | NA | 酶共封装、纳米胶囊合成、ATP酶整合脂质体涂层 | NA | NA | NA | NA | NA | 自增强酶级联反应(葡萄糖氧化酶-过氧化氢酶)驱动的质子梯度,耦合ATP合酶实现ATP合成 | 合成生物学 |
| 1339 | 2026-06-19 |
Transforming Crowded Coacervates into Multi-Compartmental Hybrid Microreactors for Practical Enzymatic Catalysis
2025-10-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502479
PMID:40884011
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研究论文 | 提出一种基于Pickering乳液的封装方法,将无膜凝聚层转化为多室混合微反应器,用于高效酶催化 | 首次利用Pickering乳液封装法将无膜凝聚层转化为具有层级分隔结构、分子拥挤环境、选择性渗透能力和机械增强稳定性的多室混合微反应器,实现空间有序调控生物和非生物催化反应,显著提升催化活性、热稳定性和长期耐久性 | 未提及限制,但可能涉及方法的普适性和规模化应用挑战 | 设计构建具有组织复杂性、功能多样性和实际应用性的人工原细胞,用于体外合成生物学和生物工程 | 无膜凝聚层(凝聚层室)和混合微反应器 | 合成生物学 | NA | Pickering乳液封装、脂肪酶催化动力学拆分 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 多室混合微反应器(分级结构、分子拥挤环境、选择性渗透膜) | 医学、工业生物技术 |
| 1340 | 2026-06-19 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-10-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
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综述 | 本文综述了拓扑工程引导RNA(TE-gRNA)在实现CRISPR/Cas系统可编程调控中的应用 | 通过设计聚合物、环状和树枝状等拓扑结构,TE-gRNA实现了CRISPR活性的精确空间控制、可逆性和可编程激活,优于传统线性gRNA | TE-gRNA在合成可行性、稳定性及降低脱靶效应方面仍面临挑战,其在大规模应用中表现有待进一步验证 | 探讨拓扑工程引导RNA如何实现对CRISPR/Cas活动的精准时序和条件控制 | 拓扑工程引导RNA(TE-gRNA)及其在CRISPR/Cas系统中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 功能基因组学, 治疗干预 |