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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1341 | 2024-08-27 |
Integrated Metabolomic and Transcriptomic Analysis and Identification of Dammarenediol-II Synthase Involved in Saponin Biosynthesis in Gynostemma longipes
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.852377
PMID:35401630
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学和转录组学分析,鉴定了参与Gynostemma longipes中皂苷生物合成的达玛烯二醇-II合酶 | 首次鉴定了新的达玛烯二醇-II合酶,并通过生物信息学分析、酵母表达实验和酶活性测定验证了其功能 | NA | 揭示达玛烯二醇-II的生物合成机制,以提高珍贵的人参皂苷和绞股蓝皂苷的产量 | Gynostemma longipes中的皂苷生物合成相关基因和代谢物 | 代谢组学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS) | NA | 代谢物和基因表达数据 | 46种三萜类化合物在不同组织中被检测 |
1342 | 2024-08-26 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2024-Aug-23, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成遗传修饰的人类多能干细胞系 | STRAIGHT-IN平台通过精确插入或替换特定基因组区域,并利用Bxb1整合酶和Cre重组酶,实现了大DNA载体的靶向整合,提高了整合效率并减少了克隆变异性 | NA | 开发一种新的技术平台,用于快速生成遗传修饰的人类多能干细胞系,以应用于合成生物学、疾病模型和药物发现等领域 | 人类多能干细胞 | 生物技术 | NA | 基因编辑技术 | NA | 细胞系 | 多个遗传修饰的人类多能干细胞系 |
1343 | 2024-08-26 |
Design of a self-regulating mRNA gene circuit
2024-08-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70363-0
PMID:39169208
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研究论文 | 本文设计了一种基于噬菌体MS2的自我调节mRNA基因电路,通过计算工具模拟核糖体动力学和mRNA共翻译折叠,优化了下游基因的翻译和抑制效率 | 提出了一种新的自我调节mRNA设计方法,可用于疫苗和其他合成生物学应用,实现细胞内蛋白质水平的精确控制 | NA | 探索设计自我调节mRNA基因电路的可能性,以实现细胞内蛋白质合成的自我调节 | 自我调节mRNA的设计及其在蛋白质表达控制中的应用 | 合成生物学 | NA | 计算模拟 | NA | mRNA | NA |
1344 | 2024-08-26 |
Ultrasound-controllable engineered bacteria for cancer immunotherapy
2022-03-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29065-2
PMID:35332124
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研究论文 | 本文开发了一种可通过聚焦超声控制的工程化细菌,用于癌症免疫治疗 | 利用聚焦超声非侵入性地控制工程化细菌在特定解剖部位(如实体肿瘤)释放治疗性负载,通过温度激活的遗传状态开关实现治疗输出 | 目前方法中,系统性给药的细菌在健康组织中也可能释放有害负载 | 开发一种新型的癌症免疫治疗方法,通过工程化细菌在肿瘤微环境中释放免疫检查点抑制剂 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 聚焦超声 | 遗传状态开关 | NA | NA |
1345 | 2024-08-26 |
Using single-cell models to predict the functionality of synthetic circuits at the population scale
2022-03-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2114438119
PMID:35271387
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研究论文 | 本文展示了如何基于化学主方程的增强,获得同时跟踪单细胞和群体过程的多尺度随机动力学模型,以量化预测酵母光遗传分化系统的复杂群体动态 | 提出了基于化学主方程增强的多尺度随机动力学模型,能够同时跟踪单细胞和群体过程 | NA | 预测合成电路在群体规模上的功能性 | 单细胞模型在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 化学主方程 | 多尺度随机动力学模型 | NA | NA |
1346 | 2024-08-26 |
Engineering microbial consortia of Elizabethkingia meningoseptica and Escherichia coli strains for the biosynthesis of vitamin K2
2022-Mar-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-022-01768-7
PMID:35279147
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研究论文 | 本研究报道了设计和优化Elizabethkingia meningoseptica和Escherichia coli共培养系统,以提高维生素K2的生物合成 | 通过共培养策略,成功提高了维生素K2的产量,并建立了进一步工程化MK-n的基础 | NA | 研究微生物共培养在代谢工程和合成生物学领域的应用 | Elizabethkingia meningoseptica和Escherichia coli菌株 | 代谢工程 | NA | 扫描电子显微镜, 共聚焦激光扫描显微镜, 流式细胞术 | NA | 微生物 | Elizabethkingia meningoseptica sp. F2和Escherichia coli共培养系统 |
1347 | 2024-08-26 |
Penicillium chrysogenum, a Vintage Model with a Cutting-Edge Profile in Biotechnology
2022-Mar-06, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10030573
PMID:35336148
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综述 | 本文综述了青霉菌从发现青霉素到成为次级代谢产物生产和调控的模型生物的历史,以及其在合成生物学领域的最新进展 | 介绍了青霉菌在合成生物学领域的应用,以及如何利用分子工具进一步提高生产效率 | NA | 回顾青霉菌的历史,并更新其在次级代谢产物生产和调控方面的研究进展 | 青霉菌及其在工业生物技术中的应用 | 生物技术 | NA | 分子工具 | NA | NA | NA |
1348 | 2024-08-26 |
Genome Sequencing and Analysis of Trichoderma (Hypocreaceae) Isolates Exhibiting Antagonistic Activity against the Papaya Dieback Pathogen, Erwinia mallotivora
2022-Feb-28, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof8030246
PMID:35330248
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研究论文 | 本研究分析了五株来自马来西亚的根际Trichoderma分离株对木瓜萎蔫病原体Erwinia mallotivora的拮抗活性,并通过牛津纳米孔和Illumina测序技术对其基因组进行了研究 | 首次揭示了Trichoderma分离株的基因组特征,并探讨了其潜在的次级代谢途径与其抗菌特性的关系 | NA | 探索Trichoderma分离株作为木瓜萎蔫病生物防治剂的潜力及其分子机制 | Trichoderma分离株的基因组及其对Erwinia mallotivora的拮抗活性 | NA | 木瓜萎蔫病 | 牛津纳米孔测序技术, Illumina测序技术 | NA | 基因组数据 | 三株Trichoderma分离株(UKM-M-UW RA5, UKM-M-UW RA6, UKM-M-UW RA3a) |
1349 | 2024-08-26 |
From Sharks to Yeasts: Squalene in the Development of Vaccine Adjuvants
2022-Feb-22, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph15030265
PMID:35337064
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综述 | 本文综述了角鲨烯基疫苗佐剂增强免疫反应的生物机制,并比较了现有角鲨烯来源及其环境影响 | 提出使用基因工程微生物作为可持续的角鲨烯生产替代方案,有望成为未来制药级角鲨烯的唯一来源 | NA | 探讨角鲨烯在疫苗佐剂开发中的应用及其可持续生产方法 | 角鲨烯及其在疫苗佐剂中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1350 | 2024-08-26 |
Xanthopsin-Like Systems via Site-Specific Click-Functionalization of a Retinoic Acid Binding Protein
2022-01-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202100449
PMID:34647400
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研究论文 | 本文展示了利用Morita-Baylis-Hillman加合物进行位点特异性、不可逆和立体选择性的点击功能化,从而在疏水结合口袋中埋藏的赖氨酸残基上生成具有扩展π系统的不自然发色团,为体外合成类似黄视蛋白的细菌光感受器结构的人工蛋白质库提供了可能性。 | 本文引入了一种新的方法,通过位点特异性的点击功能化,扩展了人工蛋白质库的范围,使其类似于黄视蛋白的光感受器,并作为光遗传学和“分子实验室”工具。 | NA | 开发一种新的方法来准备光响应蛋白质系统,以扩展光遗传学和合成生物学的工具箱。 | 研究如何通过位点特异性的点击功能化方法,在蛋白质中引入不自然的发色团,以模拟黄视蛋白的光感受器结构。 | 合成生物学 | NA | 点击功能化 | NA | 蛋白质 | NA |
1351 | 2024-08-26 |
Tracing back variations in archaeal ESCRT-based cell division to protein domain architectures
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0266395
PMID:35358274
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研究论文 | 本文通过生物信息学方法分析了古菌中ESCRT系统的蛋白质域结构,以探讨细胞分裂机制的进化 | 首次在蛋白质域水平上分析古菌ESCRT系统,揭示了至少三种不同的细胞分裂机制,并重建了ESCRT机制的进化历程 | 由于技术挑战,实验数据有限 | 探讨古菌和真核生物细胞分裂机制的进化关系 | 古菌中的ESCRT系统蛋白质 | 细胞生物学 | NA | 生物信息学分析 | NA | 蛋白质域数据 | NA |
1352 | 2024-08-25 |
CRISPR-Cas gene editing technology and its application prospect in medicinal plants
2022-Mar-04, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-022-00584-w
PMID:35246186
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas基因编辑技术的发展历程、结构特征、工作机制及其最新衍生技术,并首次讨论了其在药用植物中的应用前景 | 首次讨论了CRISPR-Cas技术在药用植物中的应用,并提出了该技术在药用植物基因编辑中的发展方向 | CRISPR-Cas技术在药用植物中的应用仍处于早期阶段 | 探讨CRISPR-Cas技术在药用植物中的应用,为药用植物的基因组功能研究、合成生物学、遗传改良和种质创新提供参考 | 药用植物 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
1353 | 2024-08-25 |
Comparative analysis of genome code complexity and manufacturability with engineering benchmarks
2022-02-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-06723-5
PMID:35181687
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研究论文 | 本文通过比较自然基因组与现有工程基准的复杂性和可制造性,评估了合成生物学设计的实际限制 | 本文首次将自然基因组的复杂性与大型软件程序的规模进行比较,揭示了两者在复杂性上的相似性 | 文章未详细讨论合成生物学在实际应用中的具体挑战和解决方案 | 评估和比较自然基因组的复杂性与工程基准,探讨合成生物学设计的可行性 | 自然基因组的复杂性和可制造性 | NA | NA | NA | NA | 基因组序列 | 从几百万到超过1000亿个碱基对的不同自然基因组 |
1354 | 2024-08-25 |
Viral protein instability enhances host-range evolvability
2022-02, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010030
PMID:35176040
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研究论文 | 研究病毒蛋白热稳定性如何影响其适应新受体的能力,从而影响宿主范围的进化 | 提出了蛋白质热稳定性与进化能力之间关系的新模型,并指出蛋白质不稳定性可能是预测病毒宿主范围进化的潜在指标 | 研究仅基于一种模型病毒(噬菌体λ),可能需要进一步研究以验证在其他病毒中的适用性 | 探讨病毒蛋白热稳定性对宿主范围进化的影响 | 噬菌体λ的宿主识别蛋白 | NA | NA | 定向进化和合成生物学技术 | NA | 蛋白质稳定性数据 | 多个稳定性不同的宿主识别蛋白变体 |
1355 | 2024-08-25 |
Undefining life's biochemistry: implications for abiogenesis
2022-02, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2021.0814
PMID:35193384
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研究论文 | 本文探讨了生命起源的生物化学基础及其可能的变化 | 文章提出了对生命中心法则的重新定义,探讨了生命起源前的生物化学步骤 | 文章未明确指出具体的实验或数据支持其理论 | 旨在理解生命起源的生物化学基础及其可能的变化 | 研究对象包括RNA、蛋白质及其遗传代码 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1356 | 2024-08-25 |
Identification and Cross-Characterisation of Artificial Promoters and 5' Untranslated Regions in Vibrio natriegens
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.826142
PMID:35155395
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研究论文 | 本研究报告了在Vibrio natriegens中人工启动子和5'非翻译区(ARES)的识别与交叉表征,这些元件能产生广泛表达水平的荧光蛋白 | 本研究扩展了可用于以Vibrio natriegens为宿主的生物技术应用的特征化遗传DNA元件库 | NA | 识别并交叉表征Vibrio natriegens中的人工启动子和5'非翻译区,以扩大可用的遗传元件库 | Vibrio natriegens中的人工启动子和5'非翻译区 | 合成生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 52个构建体 |
1357 | 2024-08-25 |
Protein Splicing of Inteins: A Powerful Tool in Synthetic Biology
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.810180
PMID:35265596
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综述 | 本文综述了内含子在合成生物学中的应用及其近年来的发展 | 内含子作为蛋白质工程的有力工具,近年来在合成生物学中得到了功能增强和多样化利用 | NA | 探讨内含子在合成生物学中的应用及未来发展方向 | 内含子及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质剪接 | NA | NA | NA |
1358 | 2024-08-24 |
[Biomanufacturing of propionic acid]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240097
PMID:39174476
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综述 | 本文综述了丙酸的生物制造过程,包括代谢工程和途径重构在异源宿主中的研究,以及通过合成生物学设计改良途径从L-苏氨酸或生物基1,2-丙二醇合成高纯度丙酸的最新进展 | 利用微生物转化可再生资源生产丙酸,减少环境污染并提高可持续性 | NA | 探讨丙酸的生物制造方法及其在食品、医药和化工领域的应用 | 丙酸的生物制造过程及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1359 | 2024-08-24 |
[Construction of microbial cell factories for synthesizing value-added chemicals with xylose]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240161
PMID:39174477
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研究论文 | 本文介绍了利用木糖合成高价值化学品的微生物细胞工厂的构建策略 | 深入理解微生物代谢机制和合成生物学的进步提高了微生物代谢木糖的效率并扩展了木糖衍生产品的范围 | 木糖的代谢效率低于葡萄糖,限制了其在大多数微生物中的应用 | 实现对木质纤维素的全利用,构建能高效代谢木糖的微生物细胞工厂 | 木质纤维素中的木糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
1360 | 2024-08-24 |
The art of designed coiled-coils for the regulation of mammalian cells
2024-Aug-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.06.001
PMID:38971158
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综述 | 本文综述了卷曲螺旋(CC)二聚体形成模块在哺乳动物细胞调控中的应用及其设计规则 | 卷曲螺旋模块提供了高度特异性和正交的蛋白质-蛋白质相互作用,设计规则使其能够精确控制和调节这些相互作用 | NA | 探讨卷曲螺旋在哺乳动物细胞中的多样化应用及其在推进细胞过程理解和调控中的作用 | 卷曲螺旋模块在哺乳动物细胞中的应用,包括合成生物电路设计、转录和变构调控、细胞组装、嵌合抗原受体(CAR)T细胞调控和基因组编辑 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |