合成生物学相关文章
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当前共找到 3022 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2024-08-24 |
Design, modeling and in silico simulation of bacterial biosensors for detecting heavy metals in irrigation water for precision agriculture
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35050
PMID:39170417
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研究论文 | 本文提出了一种新的工作流程，用于设计、建模和模拟可重编程微生物，作为检测灌溉水中重金属的生物传感器 | 该工作流程基于合成生物学的两种技术：合成遗传电路设计和合成工程，允许使用软件和硬件开发理论模型，预测复杂生物系统的行为 | NA | 设计新型生物设备以替代目前用于精准农业中检测灌溉水重金属的传感器 | 设计、建模和模拟用于检测灌溉水中重金属（砷、汞和铅）的微生物生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路设计、合成工程 | NA | 基因组数据（SBOL、GenBank和FASTA格式） | 三种全细胞重金属生物传感器 |
| 1362 | 2024-08-24 |
Biophysical characterization of synthetic adhesins for predicting and tuning engineered living material properties
2024-Jun-05, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.03.019
PMID:39165662
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研究论文 | 本文通过多种生物物理方法对细菌合成粘附工具箱进行了定量表征 | 本文展示了通过关键参数对工程活体材料（ELM）宏观性质（拉伸强度）的预测和定量调节 | 合成粘附蛋白的表征和控制仍有待进一步发展 | 研究细菌合成多细胞系统的粘附特性，以优化工程活体材料的应用 | 细菌合成粘附工具箱及其在工程活体材料中的应用 | 生物工程 | NA | 生物物理方法 | NA | 生物数据 | NA |
| 1363 | 2024-08-24 |
From Farms to Pharma: A "Natural" History of Vaccine Production and Vaccine Skepticism
2024-02, American journal of public health
IF:9.6Q1
DOI:10.2105/AJPH.2023.307508
PMID:38175968
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研究论文 | 本文从历史角度探讨了疫苗与“自然”概念之间的关系，特别是通过分析19世纪中后期牛痘疫苗的生产过程及其对公众信任的影响。 | 文章通过历史案例展示了疫苗生产与公众信任建立的过程，强调了“自然”概念在公共卫生领域的多变性。 | NA | 探讨疫苗生产的历史背景及其与公众信任的关系。 | 疫苗生产的历史过程及其对公众信任的影响。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1364 | 2024-08-24 |
Decoding and recoding plant development
2021-10-05, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab336
PMID:35237818
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综述 | 本文综述了利用CRISPR/Cas9和噬菌体整合酶等技术追踪细胞分化和解码细胞分子状态的最新进展，并探讨了这些技术在植物发育研究中的应用前景 | 结合合成生物学和分子生物学的方法，为理解生物学开辟了新的途径，并能塑造新的形态 | 目前这些工具主要在动物中实施，植物领域的应用尚处于起步阶段 | 探讨如何利用这些工具监测多种植物物种的发育过程，并指导感兴趣的程序的重编码 | 多细胞生物的发育过程及其调控机制 | NA | NA | CRISPR/Cas9, 噬菌体整合酶 | NA | NA | NA |
| 1365 | 2024-08-23 |
Construction of a high-efficiency GjCCD4a mutant and its application for de novo biosynthesis of five crocins in Escherichia coli
2024-Oct, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.133985
PMID:39033887
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研究论文 | 本文通过突变构建了一个高效GjCCD4a突变体（N212m），并将其应用于大肠杆菌中五种藏红素的从头生物合成 | 构建的N212m突变体催化效率比野生型高25.08倍，实现了在大肠杆菌中五种藏红素的从头生物合成 | NA | 研究藏红素的生物合成，以降低成本并促进其应用 | 藏红素及其在大肠杆菌中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 突变技术 | NA | NA | 大肠杆菌E57和E579菌株用于藏红素的合成 |
| 1366 | 2024-08-23 |
Deciphering GB1's Single Mutational Landscape: Insights from MuMi Analysis
2024-Aug-22, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c04916
PMID:39115184
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研究论文 | 本研究通过计算机模拟突变扫描和分子动力学模拟，探讨了GB1与IgG-Fc结合的分子基础 | 本研究展示了MuMi作为一种可靠且计算高效的工具，用于预测蛋白质适应性景观，相较于传统方法具有显著优势 | NA | 研究GB1与IgG-Fc结合的分子机制，并评估MuMi在预测蛋白质适应性景观中的应用 | GB1蛋白与IgG-Fc的结合 | 生物信息学 | NA | 深度突变扫描（DMS），分子动力学（MD） | NA | 蛋白质结构 | 所有可能的单突变 |
| 1367 | 2024-08-23 |
Degradable living plastics programmed by engineered spores
2024-Aug-21, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01713-2
PMID:39169270
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研究论文 | 本文报道了一种利用合成生物学和聚合物工程技术制备的可生物降解的活体塑料 | 通过工程化的枯草芽孢杆菌孢子携带木糖诱导分泌表达的伯克霍尔德菌脂酶（BC-脂酶）基因回路，实现了塑料的生物降解 | NA | 开发一种环境友好的塑料材料，能够在孢子休眠时保持功能，在孢子激活时进行降解 | 工程化的枯草芽孢杆菌孢子和聚己内酯 | 生物工程 | NA | 合成生物学和聚合物工程 | NA | 材料 | NA |
| 1368 | 2024-08-23 |
Construction of a Calibration Curve for Lycopene on a Liquid-Handling Platform─Wider Lessons for the Development of Automated Dilution Protocols
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00031
PMID:39096303
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研究论文 | 本文在伦敦Biofoundry at SynbiCITE进行的研究中，探讨了液体处理及其可靠自动化的重要性，特别是通过构建番茄红素在二甲基亚砜（DMSO）中的校准曲线来实现 | 研究开发了适用于其他自动化应用的灵活液体处理方法，并通过番茄红素/DMSO混合物对自动化液体处理协议进行了压力测试 | 由于液体处理步骤的普遍存在，需要将错误控制在高标准，以避免错误传播到协议的其他部分 | 研究液体处理的自动化，以提高通量和可重复性 | 液体处理操作的自动化，特别是番茄红素在DMSO中的校准曲线的构建 | 合成生物学 | NA | 液体处理平台 | NA | 校准曲线 | NA |
| 1369 | 2024-08-23 |
Artificial Intelligence Methods and Models for Retro-Biosynthesis: A Scoping Review
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00091
PMID:39047143
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综述 | 本文综述了人工智能方法和模型在逆合成和逆生物合成路径设计中的最新进展 | 人工智能推动了合成规划和化学空间探索的新前沿，促进了与绿色化学相符的生物生产 | 讨论了该领域的局限性和有前景的研究方向 | 总结人工智能在逆合成和逆生物合成路径设计中的应用 | 逆合成和逆生物合成路径设计 | NA | NA | 人工智能 | 基于反应模板或生成模型 | NA | NA |
| 1370 | 2024-08-23 |
The BioRECIPE Knowledge Representation Format
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00096
PMID:39051984
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研究论文 | 介绍了一种名为BioRECIPE的知识表示格式，旨在标准化并促进创建、验证、评估、管理和扩展细胞内及细胞间信号的可执行模型时的人机交互 | BioRECIPE格式允许用户轻松预览和修改任何模型组件，同时可被机器读取并由一系列模型开发和分析工具处理 | NA | 开发一种标准化的知识表示格式，以促进生物系统模型的创建和管理 | 细胞内及细胞间信号的可执行模型 | 系统生物学 | NA | 自然语言处理 | NA | 模型 | NA |
| 1371 | 2024-08-23 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 研究通过控制胆色素代谢来修饰蓝细菌中的藻蓝蛋白和藻胆体 | 开发了一种新型7942 PEB1菌株，通过精细调控PEB生物合成，实现了藻胆体颜色从绿色到棕色和粉红色的可逆变化 | 遗传不稳定，且由PEB结合的藻胆体复合物的性质尚未被充分表征 | 探索藻胆体适应不同光环境的机制，并为生物工程、合成生物学和可再生能源领域的未来研究提供基础 | 蓝细菌中的藻蓝蛋白和藻胆体 | 生物工程 | NA | 胆色素代谢控制 | NA | NA | NA |
| 1372 | 2024-08-23 |
Development of a Recombineering System for the Acetogen Eubacterium limosum with Cas9 Counterselection for Markerless Genome Engineering
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00253
PMID:39033464
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研究论文 | 本文开发了一种基于病毒重组酶RecT的高效寡核苷酸重组系统，并结合Cas9反选择系统，实现了无标记基因组工程，用于乙酸菌Eubacterium limosum的精确基因组修饰。 | 本文首次开发了一种高效的重组系统，结合Cas9反选择系统，实现了无标记的基因组点突变，无需繁琐的同源臂克隆，可快速简单地应用于几乎任何基因组位点。 | NA | 开发一种新的基因组工程方法，用于乙酸菌Eubacterium limosum的合成生物学和代谢工程，以促进可持续的CO基生物燃料生产和人类肠道微生物群的研究。 | 乙酸菌Eubacterium limosum的基因组 | 合成生物学 | NA | 重组酶RecT，Cas9反选择系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1373 | 2024-08-23 |
Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00117
PMID:39028299
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研究论文 | 本文介绍了一种从不同植物物种中提取的叶绿体无细胞基因表达系统，用于快速原型设计和基因表达分析 | 开发了一种多功能的叶绿体无细胞基因表达系统，适用于多种植物物种，并能使用传统和内源性叶绿体聚合酶进行基因表达分析 | NA | 解决气候变化对全球农业的威胁，通过叶绿体工程提供创新解决方案 | 叶绿体无细胞基因表达系统在不同植物物种中的应用 | 植物合成生物学 | NA | 叶绿体无细胞基因表达 | NA | 基因表达数据 | 分析了23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子 |
| 1374 | 2024-08-23 |
Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00036
PMID:39115381
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研究论文 | 本研究开发了一种针对炎症性肠病（IBD）的靶向治疗系统，通过工程化改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN），构建了一个包含转录因子基传感器、I型溶血素分泌系统和治疗性纳米抗体库的模块化系统。 | 本研究首次在EcN中验证了纳米抗体库的治疗潜力，并首次在EcN中表征了分泌系统，为筛选和纯化感兴趣的蛋白质提供了一个平台。此外，提供了评估益生菌系统关键参数的数学框架。 | 尽管系统对一氧化氮（NO）的响应是浓度依赖性的，但灵敏度有所降低。 | 开发一种针对炎症性肠病（IBD）的靶向治疗系统。 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN）及其在肠道炎症疾病治疗中的应用。 | NA | 炎症性肠病 | 转录因子基传感器（NorR）、I型溶血素分泌系统、酶联免疫吸附测定 | NA | NA | NA |
| 1375 | 2024-08-23 |
Peptide-Dependent Growth in Yeast via Fine-Tuned Peptide/GPCR-Activated Essential Gene Expression
2022-02-01, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.1c00661
PMID:35023728
|
研究论文 | 本文研究了通过精细调节肽/GPCR激活关键基因表达来实现酵母中肽依赖性生长的方法 | 开发了一种基于真菌交配GPCR及其分泌肽配体的可扩展细胞间通信语言，允许工程酵母菌株组装成多细胞通信网络，并通过肽信号使它们相互依赖 | NA | 实现多细胞微生物群落的细胞间通信，并执行编程功能 | 酵母细胞的肽依赖性生长 | 合成生物学 | NA | G蛋白偶联受体(GPCR)激活技术 | NA | NA | NA |
| 1376 | 2024-08-22 |
Single-round QuikChange PCR for engineering multiple site-directed mutations in plasmid DNA
2024-Nov, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2024.115621
PMID:39019205
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研究论文 | 本研究开发了一种简单且节省时间的方法，通过使用质粒作为模板和兼容的寡核苷酸引物，按照QuikChange策略，在一次聚合酶链反应中引入多个核苷酸插入、删除和替换 | 该方法能够在一次聚合酶链反应中实现多个位点的突变，提高了基因工程的效率 | 通常需要筛选5个克隆才能找到所有期望突变的成功克隆 | 开发一种新的突变研究方法，以促进蛋白质生物化学、正向遗传学和合成生物学的研究 | 质粒DNA中的多个位点定向突变 | 生物化学 | NA | 聚合酶链反应 | NA | DNA | 通常筛选5个克隆 |
| 1377 | 2024-08-22 |
Therapeutic applications of synthetic gene/genetic circuits: a patent review
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1425529
PMID:39161351
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综述 | 本文综述了合成基因/遗传电路在治疗应用中的专利情况，展示了其在精确控制基因表达和细胞行为方面的潜力 | 合成基因电路能够定制精确控制治疗干预，实现个性化治疗，提高治疗效果并减少副作用 | 该技术面临商业盈利挑战，设计需针对特定应用调整，可能存在多重调控的毒性、同源重组、上下文依赖性、资源过度使用和环境变异性等缺点 | 探讨合成基因/遗传电路在治疗应用中的潜力和挑战 | 合成基因/遗传电路及其在治疗领域的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因/遗传电路 | NA | 专利 | 38项专利，15个最频繁的国际分类 |
| 1378 | 2024-08-22 |
Turing pattern design principles and their robustness
2021-Dec-27, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2020.0272
PMID:34743598
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综述 | 本文回顾了近期大规模数学分析尝试缩小潜在设计原则范围的研究，并探讨了这些模型的不同方面的鲁棒性 | 本文提出了鲁棒性视角在寻找合成图灵模式系统中的重要性 | NA | 探讨图灵模式设计原则及其鲁棒性 | 图灵模式在合成生物学中的应用 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1379 | 2024-08-21 |
Production of pyrimidine nucleosides in microbial systems via metabolic engineering: Theoretical analysis research and prospects
2024-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108419
PMID:39053562
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研究论文 | 本研究探讨通过代谢工程和合成生物学策略在微生物系统中生产嘧啶核苷的方法 | 利用微生物发酵合成嘧啶核苷，提供了一种更可持续的生产替代方案 | 微生物生产嘧啶核苷的复杂且严格调控的生物合成途径是一个重大挑战 | 旨在通过代谢工程和合成生物学策略提高嘧啶核苷的生产效率 | 嘧啶核苷的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 1380 | 2024-08-21 |
Blue light-mediated gene expression as a promising strategy to reduce antibiotic resistance in Escherichia coli
2024-May, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400023
PMID:38719589
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研究论文 | 本文研究了利用蓝光调控基因表达系统来减少大肠杆菌对抗生素的耐药性 | 首次成功应用蓝光调控基因表达系统，有效降低了工程化大肠杆菌对氨苄西林和链霉素的耐药性 | NA | 开发新兴的非传统技术以应对抗生素耐药性的挑战 | 大肠杆菌的抗生素耐药性 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 工程化大肠杆菌细胞 |