本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-05 |
Synthetic Whole-Cell Bioelectronic Chemical Sensing with In Situ Genetic Computing
2025-Sep-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00015
PMID:41031321
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了结合全细胞细菌生物传感器与电化学传感技术的生物电子化学传感器 | 将全细胞生物传感器的多功能性与电化学传感灵敏度相结合,开发了具有遗传计算能力的模块化生物电子传感器 | NA | 开发可编程的模块化生物电子传感器用于化学检测 | 汞污染物检测、双输入逻辑计算、多通道电化学信号输出 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、电化学传感 | NA | 电化学信号 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 细菌 | T7 RNAP信号放大器、布尔逻辑计算模块、双通道电化学输出系统 | 环境监测 |
| 122 | 2025-10-05 |
Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00741-25
PMID:40801494
|
研究论文 | 本研究在酿酒酵母中开发了高分辨率分析平台,评估杀开关系统的生物防护效果及逃逸机制 | 建立了首个在实验室和工业酵母菌株中系统评估杀开关逃逸机制的高分辨率分析平台,揭示了多种逃逸途径 | 多拷贝整合杀开关系统虽能显著减少逃逸但仍无法建立持续生物防护 | 开发有效的生物防护策略并理解其逃逸机制 | 酿酒酵母实验室和工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR介导的整合、基因组重测序 | NA | 基因组测序数据、表型数据 | 实验室和工业酵母菌株 | CRISPR | 酿酒酵母 | 樟脑调控的RelE毒素杀开关系统 | 工业生物技术 |
| 123 | 2025-10-05 |
SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05386
PMID:40787351
|
研究论文 | 本研究通过SpyRing系统实现TEV蛋白酶环化,结合AlphaFold结构预测优化设计,显著提高了酶的热稳定性 | 首次将SpyTag/SpyCatcher介导的环化系统与AlphaFold结构预测相结合,成功实现了N端和C端相距较远(约40 Å)的TEV蛋白酶环化 | 研究仅针对特定TEVp变体(L56V, S135G, S219V, Δ238-242),未验证在其他蛋白酶或蛋白质中的普适性 | 开发一种计算引导的蛋白质环化策略,提高蛋白酶的热稳定性 | 烟草蚀纹病毒蛋白酶(TEVp)及其环化变体 | 蛋白质工程 | NA | SpyTag/SpyCatcher环化系统,AlphaFold结构预测 | NA | 蛋白质结构数据,酶活性数据 | NA | SpyRing系统 | NA | 通过SpyTag和SpyCatcher结构域融合实现分子内环化 | 合成生物学,工业生物技术 |
| 124 | 2025-10-05 |
Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c03077
PMID:40787363
|
综述 | 本文探讨巴西合成生物学发展现状及国家合成生物学网络的建立意义 | 首次系统阐述巴西合成生物学网络的建设框架与发展潜力 | 国际社会对巴西科研监管环境认知不足 | 分析巴西合成生物学生态系统关键要素并推动国家生物技术能力建设 | 巴西合成生物学研究群体与基础设施 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 125 | 2025-10-05 |
Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis
2025-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85266-x
PMID:39775135
|
研究论文 | 通过比较猫须草不同组织的转录组分析,揭示与黄酮类化合物生物合成相关的差异表达基因 | 首次对猫须草所有组织进行黄酮类化合物合成生物学的比较转录组分析,发现根部黄酮含量更高并鉴定出212个与根部黄酮积累强相关的差异表达基因 | 研究仅限于猫须草单一物种,未进行功能验证实验 | 探究猫须草不同组织中黄酮类化合物生物合成的分子机制 | 猫须草(Orthosiphon aristatus)的根、茎、叶等不同组织 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | 高效液相色谱分析, 转录组分析, 实时定量PCR | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 猫须草不同组织样本 | NA | 猫须草(Orthosiphon aristatus) | 黄酮类化合物生物合成通路 | 医药 |
| 126 | 2025-10-05 |
KDBI-RP: Kinetic Data of RNA-Protein Interactions Database
2025-Nov-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169357
PMID:40716733
|
研究论文 | 介绍专门用于RNA-蛋白质相互作用动力学数据的数据库KDBI-RP | 首个专注于RNA-蛋白质相互作用动力学的专用数据库,扩展了原有的KDBI数据库 | NA | 建立RNA-蛋白质相互作用动力学数据的系统化数据库资源 | RNA-蛋白质相互作用动力学数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 动力学数据、序列数据、结构数据 | 包含3657个结合速率常数条目、3761个解离速率常数条目和175,932个平衡解离常数条目 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 127 | 2025-10-05 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2025-Sep-30, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
|
综述 | 本文探讨了受控环境农业如何加速植物科学成果向农业应用的转化 | 提出将受控环境农业作为多功能研究平台和高产生产系统,整合新兴育种、基因组和合成生物学工具 | NA | 通过受控环境农业加速植物科学基础研究成果向农业应用的转化 | 作物设计和农业生产系统 | 农业生物技术 | NA | 育种技术、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 128 | 2025-10-05 |
Beyond Purification: Evolving Roles of Fusion Tags in Biotechnology
2025-Sep-17, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090768
PMID:41020890
|
综述 | 本文总结了融合标签在生物技术中的多样化应用及其发展历程 | 系统阐述了融合标签从传统纯化功能向实时成像、空间定位、靶向递送和蛋白质活性调控等新型多功能工具的演变 | 未完全涵盖所有相关研究内容 | 帮助研究人员针对特定目标设计合适的标签格式 | 蛋白质标签和肽标签及其去除方法 | 生物技术 | NA | 基因融合技术、下拉实验、免疫沉淀 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、治疗设计 |
| 129 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Terpenoid Biosynthesis in Medicinal Plants: From Genomic Insights to Biotechnological Applications
2025-Sep-05, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090723
PMID:41020846
|
综述 | 本文综述了药用植物中萜类化合物生物合成的代谢工程策略及其生物技术应用 | 提出'从基因组见解到生物技术应用'的研究范式,整合多组学技术和CRISPR工具实现萜类化合物产量的显著提升 | 面临代谢通量平衡、细胞毒性和规模化经济性等持续挑战 | 加速萜类化合物生物制造从发现到商业化应用的转化 | 萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学、CRISPR | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 药用植物、微生物系统、异源植物宿主 | 萜类化合物生物合成代谢途径 | 医药、工业生物技术 |
| 130 | 2025-10-05 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
|
研究论文 | 本文提出DySEEP方法,通过动态通量平衡分析和经济指标评估工业生物产品的生产潜力,并以PHB生产为案例进行研究 | 开发了结合动态通量平衡分析和经济指标评估的新型方法DySEEP,用于系统评估生物产品生产的经济潜力 | 由于DFBA模拟的性质,无法预测某些关键聚合物性质 | 评估不同微生物生产PHB的经济潜力,优化生物塑料生产工艺 | 重组大肠杆菌、重组谷氨酸棒杆菌和重组罗尔斯通氏菌的PHB生产能力 | 代谢工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | 代谢网络模型 | 代谢通量数据 | 三种重组微生物的模拟分析 | CRISPR-Cas9, 基因敲除, 合成生物学 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌, 罗尔斯通氏菌 | 遗传拨动开关, NADPH依赖的PHB合成途径, 代谢途径调控 | 工业生物技术, 环境 |
| 131 | 2025-10-05 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
|
研究论文 | 本研究通过冷冻电镜解析了蓝藻噬菌体A4的完整结构,揭示了其双稳定衣壳内的五聚体预喷射体结构 | 首次发现由四种喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构,并观察到基因组DNA沿带正电荷环形裂隙分布的独特特征 | NA | 阐明蓝藻噬菌体A4的结构特征及其基因组包装和喷射机制 | 蓝藻噬菌体A4病毒颗粒 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜 | NA | 冷冻电镜图像数据 | NA | NA | 蓝藻 | NA | 合成生物学 |
| 132 | 2025-10-05 |
From nonexistence to novel applications: Nullomers and related k-mer based concepts in bioinformatics
2025, Advances in clinical chemistry
DOI:10.1016/bs.acc.2025.06.009
PMID:41033729
|
综述 | 本章节系统阐述了生物信息学中未被充分代表的k-mer序列(包括空位体和相关概念)的研究进展与应用前景 | 提出了基于缺失序列(空位体和新位体)的创新研究框架,为癌症检测、组织溯源和进化研究提供了新方法 | 讨论了分析缺失序列时面临的计算挑战 | 探索k-mer序列在基因组学和蛋白质组学中的基础与应用研究价值 | 空位体、新位体和准素数等未被充分代表的k-mer序列 | 生物信息学 | 癌症 | k-mer分析,液体活检 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | 医学诊断,药物发现,合成生物学 |
| 133 | 2025-10-05 |
Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01677-3
PMID:38977789
|
研究论文 | 开发基于邻近触发蛋白质反式剪接技术的时控蛋白质合成方法,用于解析细胞信号传导的动态过程 | 利用邻近触发蛋白质反式剪接技术实现目标蛋白质的时控合成,可区分起始材料和产物的细胞定位及活性状态 | NA | 开发合成生物学工具以操纵细胞状态并解析细胞信号传导动态过程 | 多种蛋白质包括BCR-ABL和DNAJ-PKAc激酶融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 邻近触发蛋白质反式剪接技术 | NA | 蛋白质活性数据 | NA | 蛋白质反式剪接 | 哺乳动物细胞 | 蛋白质合成控制系统 | 医学 |
| 134 | 2025-10-05 |
Transcriptional regulation of living materials via extracellular electron transfer
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01628-y
PMID:38783133
|
研究论文 | 本研究通过胞外电子转移机制实现了活细胞代谢与合成材料性能的可编程调控 | 首次利用微生物胞外电子转移作为桥梁,通过基因电路设计控制合成聚合物网络的力学性能 | NA | 开发可编程的工程活材料,实现生物系统与合成材料的智能整合 | 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)和合成聚合物水凝胶 | 合成生物学 | NA | 胞外电子转移(EET)、荧光参数化、基因电路设计 | 布尔逻辑门 | NA | NA | 合成生物学 | Shewanella oneidensis | 转录布尔逻辑门、基因表达调控电路 | 材料科学 |
| 135 | 2025-10-05 |
De Novo Synthesis of Error-Free Long Oligos
2024-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70028
PMID:39422193
|
研究论文 | 介绍无错误长寡核苷酸从头合成的完整实验方案 | 结合CBP纯化方法与克隆测序筛选,首次实现长达401-mer无错误寡核苷酸的合成 | NA | 开发高精度长链寡核苷酸合成技术 | 寡核苷酸合成与纯化 | 合成生物学 | NA | 固相合成、CBP方法、克隆、Sanger测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程,合成生物学 |
| 136 | 2025-10-05 |
ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799
PMID:39301026
|
综述 | 本文全面探讨如何通过合成生物学、工程学和经济视角解决CAR-T细胞疗法在实体瘤疗效、安全性和可及性方面的挑战 | 整合合成生物学与工程学方法开发同种异体CAR-T细胞,提出新型抗原靶向策略及联合治疗方案 | NA | 突破CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限并提升其安全性与可及性 | CAR-T细胞疗法及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学 | 血液恶性肿瘤与实体瘤 | CAR-T细胞工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 嵌合抗原受体设计 | 医学 |
| 137 | 2025-10-05 |
Dynamic Gene Expression Mitigates Mutational Escape in Lysis-Driven Bacteria Cancer Therapy
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0049
PMID:39301524
|
研究论文 | 本研究探讨了通过动态基因表达策略优化工程化细菌在癌症治疗中的疗效,防止突变逃逸 | 首次发现PFO表达会导致细菌裂解并引发突变逃逸,并提出动态诱导策略来维持治疗性细菌种群 | NA | 优化工程化细菌在肿瘤治疗中的持久定植和持续有效载荷释放 | 表达Perfringolysin O(PFO)细菌毒素的非致病性工程细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 分子动力学,数学模型,微流体系统,测序 | 种群动态数学模型 | 实验数据,测序数据,模拟数据 | NA | 合成生物学工具 | 工程细菌 | 动态基因表达系统,PFO毒素表达回路 | 医学 |
| 138 | 2025-10-05 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
|
研究论文 | 本文描述了使用高通量培养平台对Komagataella phaffii菌株进行基于13C的代谢通量分析的详细实验方案 | 开发了适用于高通量培养平台的13C代谢通量分析方案,能够快速表征大量工程菌株 | NA | 建立高通量代谢通量分析方案以加速菌株工程循环 | Komagataella phaffii(毕赤酵母)工程菌株 | 代谢系统工程 | NA | 13C代谢通量分析(C-MFA)、高通量培养技术 | NA | 代谢通量数据 | 多株工程菌株 | 合成生物学工具 | Komagataella phaffii(毕赤酵母) | NA | 工业生物技术 |
| 139 | 2025-10-05 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2025-Oct, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
|
综述 | 本文全面综述了虾青素生物合成的研究进展,重点关注微生物发酵生产策略 | 系统比较了天然宿主Xanthophyllomyces dendrorhous与异源宿主Yarrowia lipolytica和Saccharomyces cerevisiae在虾青素生物合成中的应用 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法实现虾青素的大规模微生物生产 | 虾青素生物合成途径及相关微生物宿主 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | Xanthophyllomyces dendrorhous, Yarrowia lipolytica, Saccharomyces cerevisiae | 虾青素生物合成途径 | 饲料,食品,化妆品,医药 |
| 140 | 2025-10-05 |
Bio-Photo Dual Action of Intracellular Radical Polymerization
2025-Oct-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c10871
PMID:40977043
|
研究论文 | 开发了一种生物标志物和光门控的细胞内自由基聚合策略,用于精确细胞器干预 | 首次提出刺激响应型光催化剂策略,通过AND门控机制实现生物标志物和光照双重控制的细胞内聚合 | NA | 实现细胞内聚合的时空控制,推进治疗发现和合成生物学应用 | 细胞内自由基聚合过程 | 合成生物学 | NA | 光诱导电子/能量转移-可逆加成-断裂链转移(PET-RAFT)聚合 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | AND门控生物传感器,响应内源性活性氧/硫物种(ROS/RSS)或酶 | 医学, 合成生物学 |