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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2025-05-31 |
Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842
PMID:40319965
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综述 | 本文总结了葡萄糖脱氢酶(GDH)在工业生物催化、辅因子再生、葡萄糖传感器和生物燃料电池等多方面的应用及其最新研究进展 | 关注通过分子工程或新型固定化技术提高酶的性能,并扩展其应用领域 | NA | 总结葡萄糖脱氢酶的最新研究进展,特别是在酶分子工程、性能提升、新型固定化策略及其在生物传感器、生物催化和生物燃料电池中的最新应用 | 葡萄糖脱氢酶(GDH) | 分子生物学 | NA | 分子工程、固定化技术 | NA | NA | NA |
122 | 2025-05-31 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-May-29, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文综述了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学影响 | 探讨了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸作为新兴核苷酸类似物的化学构建方法及其在药物设计、核苷酸酶学研究和合成生物学中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于文献综述 | 研究5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学功能 | 5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸 | 药物化学与生物技术 | NA | 磷酸酰胺化策略、催化方法、绿色化学技术 | NA | NA | NA |
123 | 2025-05-31 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在非豆科植物中实现固氮酶功能的研究进展与挑战 | 利用合成生物学和AI驱动设计在酵母线粒体中部分重建固氮酶功能,以解决氧敏感性和能量需求问题 | 尚未完全克服能量成本和氮水平反馈调节的挑战 | 实现在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性,以减少对氮肥的依赖 | 非豆科植物、固氮酶、酵母线粒体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI驱动设计 | NA | NA | NA |
124 | 2025-05-31 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和基于CRISPR的基因组编辑这两种方法在病毒基因组操作和功能表征中的应用 | 结合深度突变扫描和CRISPR技术,实现对病毒蛋白的全面突变和功能表征,为病毒进化和适应提供深入理解 | NA | 探讨深度突变扫描和CRISPR基因组编辑在病毒进化、功能基因组学研究中的应用及其对未来疫苗开发和治疗策略的影响 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
125 | 2025-05-31 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN进行基因工程改造,成功表达多种异源基因并优化荧光蛋白表达条件,同时实现生物活性化合物的生物合成 | 首次在原生肠道大肠杆菌中应用CRAGE技术实现多基因表达及生物活性化合物合成,拓展了合成生物学在肠道菌群中的应用潜力 | 研究仅针对两种特定菌株进行验证,尚未在更广泛的肠道菌群中测试该技术的普适性 | 开发基于原生肠道大肠杆菌的合成生物学平台 | 肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN | 合成生物学 | NA | CRAGE(底盘独立重组酶辅助基因组工程技术) | NA | 基因表达数据、荧光信号数据 | 2种工程菌株(EcAZ-1和EcN) |
126 | 2025-05-31 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 本文全面探讨了T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的创新、挑战及未来发展方向 | 拓宽了T7RNA聚合酶的研究范围,不仅涵盖分子结构和功能动态,还包括其在合成生物学中的应用及工程化改进 | 未提及具体实验数据或样本量,主要以理论探讨和文献综述为主 | 优化微生物细胞工厂中的转录系统,提升生物生产效率和可持续性 | T7RNA聚合酶及其变体在微生物细胞工厂中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
127 | 2025-05-31 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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research paper | 该研究开发了一种基于巨大芽孢杆菌和CMOS技术的便携式砷传感器,用于实时检测水和土壤中的砷含量 | 通过合成生物学改造巨大芽孢杆菌用于砷检测,并将其与CMOS芯片集成,实现了可现场部署的砷检测技术 | 巨大芽孢杆菌的合成生物学工具包尚不完善,且传统全细胞传感器需要专业实验室设备读取输出 | 开发一种便携式砷检测传感器,用于资源有限环境中的实时砷检测 | 巨大芽孢杆菌及其孢子,CMOS芯片 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA |
128 | 2025-05-31 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
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研究论文 | 本文介绍了一种简化的定向进化系统,用于提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶(PylRS)的活性,并探索其在遗传密码扩展中的应用 | 提出了一种简化的定向进化系统,仅需基础实验室设备即可实施,适合研究生操作,并通过深度测序验证了方法的效率 | 研究主要聚焦于PylRS的活性提升,未涉及其他tRNA合成酶的进化或更广泛的生物体系应用 | 提高非经典氨基酸(ncAAs)在蛋白质中的掺入效率,推动合成生物学和蛋白质工程的发展 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶(PylRS)及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化、深度测序 | NA | 测序数据 | 针对三种不同底物进化出的PylRS变体 |
129 | 2025-05-31 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
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research paper | 本文介绍了RT-EZ工具包,一种基于Golden Gate组装的工具,旨在简化Rhodotorula toruloides的基因工程操作 | RT-EZ工具包引入了双向启动子、2A肽、基于RFP的颜色筛选等新特性,显著提高了载体构建的速度和效率 | NA | 解决Rhodotorula toruloides基因工程操作中的高GC含量和缺乏复制质粒的问题 | Rhodotorula toruloides酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
130 | 2025-05-31 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
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研究论文 | 本研究探讨了基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响,特别是对重组苯并恶唑生产的影响 | 通过连续移除生物合成基因簇(BGCs),显著提高了重组天然产物的产量,并发现某些BGCs的组合消除是不可行的 | 研究仅针对粘球菌,未涉及其他微生物,且某些BGCs的组合消除对细菌的耐受性有影响 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响,以提高重组天然产物的产量 | 粘球菌(Myxococcus xanthus) | 合成生物学 | NA | 基因组缩减技术 | NA | 基因组数据 | NA |
131 | 2025-05-31 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
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研究论文 | 本文探讨了光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 光遗传学作为一种合成生物学方法,通过光激活工程细胞实现用户控制的激素分泌,为糖尿病管理提供了新的治疗策略 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用,以实现光遗传学在临床中的全面应用 | 探索光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 胰腺和非胰腺来源的转基因细胞 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | 小鼠模型 |
132 | 2025-05-31 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
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research paper | 该研究开发了一种基于RfpABC信号系统的正交远红光传感器,用于在大肠杆菌中控制基因表达 | 首次在细菌中建立了动态范围超过230倍的正交远红光传感器,并鉴定了远红光调控(FLR)基序 | 研究主要局限于大肠杆菌,未在其他细菌中验证传感器的适用性 | 开发用于合成生物学应用的远红光传感器 | 大肠杆菌和蓝藻的远红光光适应(FaRLiP)基因簇 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA |
133 | 2025-05-31 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
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research paper | 开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法,用于构建表达可调库 | 提出了一种自动化的一步多基因组装方法,优化了穿梭载体以提高组装效率,并实现了高通量基因组装 | 未提及该方法在不同生物体系中的适用性或潜在的技术挑战 | 改进基因组装方法,提高合成生物学中的并行和高通量遗传工程效率 | 酵母基于的多基因库 | synthetic biology | NA | in vivo homologous recombination | NA | genetic data | NA |
134 | 2025-05-31 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
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research paper | 该研究调查了四种常用质粒骨架在克隆菌株和野生型菌株中多聚体的形成情况,并提出了避免多聚体产生的单基因敲除方法 | 首次系统调查了不同质粒骨架在克隆和野生型菌株中多聚体的形成情况,并开发了避免多聚体产生的解决方案 | 研究仅针对大肠杆菌的两种菌株(JM109和MG1655),未涉及其他宿主系统 | 优化基于质粒的合成生物学电路设计和可靠性 | 四种常用质粒骨架在JM109和MG1655菌株中的多聚体形成情况 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的测试 |
135 | 2025-05-31 |
dFLASH; dual FLuorescent transcription factor activity sensor for histone integrated live-cell reporting and high-content screening
2025-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58488-w
PMID:40195317
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dFLASH的双荧光转录因子活性传感器,用于组蛋白整合的活细胞报告和高通量筛选 | dFLASH系统能够均匀且特异性地检测内源性HIF和PGR活性,以及合成转录因子的共激活因子招募,具有双色核荧光输出,实现了标准化、动态的活细胞转录因子活性检测 | NA | 开发一种用于活细胞转录因子活性报告的模块化、基因组整合的传感器系统 | 缺氧诱导因子(HIF)和孕酮受体(PGR)的活性以及合成转录因子的共激活因子招募 | 合成生物学 | NA | 双荧光报告系统、高通量筛选、高内涵成像 | NA | 荧光信号 | 1600种化合物的天然产物库 |
136 | 2025-05-31 |
Advanced Strategies for Ultrasound Control and Applications in Sonogenetics and Gas Vesicle-Based Technologies: A Review
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S507322
PMID:40433121
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综述 | 本文综述了超声波控制在声遗传学和基于气体囊泡技术中的先进策略及其应用 | 探讨了基于合成生物学的超声波控制系统,特别是声遗传学和气体囊泡技术,克服了传统纳米材料的功能复杂性和毒性问题 | 当前面临的挑战包括超声波效应的精确控制以及技术的进一步优化和验证 | 研究超声波控制在医学诊断和治疗中的应用,特别是在声遗传学和气体囊泡技术中的激活策略 | 超声波控制系统、声遗传学、气体囊泡技术 | 生物医学工程 | 癌症、神经系统疾病、视觉障碍 | 超声波控制、合成生物学 | NA | NA | NA |
137 | 2025-05-31 |
Construction of a Calibration Curve for Lycopene on a Liquid-Handling Platform─Wider Lessons for the Development of Automated Dilution Protocols
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00031
PMID:39096303
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研究论文 | 本文介绍了在伦敦生物铸造厂SynbiCITE进行的一项研究,从构建番茄红素在二甲基亚砜(DMSO)中的校准曲线的角度探讨了液体处理及其可靠自动化 | 开发了灵活的液体处理方法,可推广到其他自动化应用,并通过番茄红素/DMSO这一难混合体系揭示了自动化液体处理协议的问题并进行了压力测试 | 研究主要集中在番茄红素/DMSO这一特定体系,可能对其他体系的普适性有待验证 | 开发可靠的液体处理自动化方法,提高合成生物学实验的吞吐量和可重复性 | 番茄红素在二甲基亚砜(DMSO)中的校准曲线构建 | 合成生物学 | NA | 液体处理自动化技术 | 基于回归的实用框架 | 实验数据 | NA |
138 | 2025-05-31 |
Towards Self-regeneration: Exploring the Limits of Protein Synthesis in the Protein Synthesis Using Recombinant Elements (PURE) Cell-free Transcription-Translation System
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00304
PMID:39066734
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研究论文 | 探索在PURE无细胞转录翻译系统中蛋白质合成的自我再生极限 | 显著降低非核糖体PURE蛋白质浓度达97.3%,同时提高蛋白质合成效率,并发现6%右旋糖酐在高度稀释的PURE配方中能显著增加蛋白质合成速率和总产量 | 未明确提及具体局限性 | 开发支持蛋白质自我再生的无细胞合成生物学系统,为构建通用生化构造器和活体合成细胞迈出关键一步 | PURE无细胞转录翻译系统中的蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA |
139 | 2025-05-31 |
Artificial Intelligence Methods and Models for Retro-Biosynthesis: A Scoping Review
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00091
PMID:39047143
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review | 本文总结了人工智能在逆合成和逆生物合成路径设计中的应用进展 | 探讨了人工智能在推动绿色化学和环境友好型生物生产中的新前沿 | 讨论了该领域的局限性和未来研究方向 | 促进与绿色化学更契合的生物生产,提升环境实践 | 逆合成和逆生物合成路径设计 | synthetic biology | NA | AI-based methods | generative models | chemical data | NA |
140 | 2025-05-31 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 本研究通过调控藻胆蛋白和藻胆体的胆色素代谢,实现了对淡水蓝藻7942 PEB1菌株的光合作用适应性的工程改造 | 开发了一种新型的PEB1菌株,能够通过精细调控PEB生物合成实现培养物颜色的可逆变化,并揭示了部分PCB-to-PEB替代形成稳定嵌合藻胆体复合物的机制 | 未对工程菌株在自然环境中的适应性和稳定性进行全面评估 | 研究藻胆体在不同光环境下的适应机制及其在合成生物学和可再生能源中的应用潜力 | 淡水蓝藻PCC 7942及其工程菌株PEB1 | 合成生物学 | NA | 基因工程、异源表达PEB合成酶(PebA和PebB) | NA | NA | NA |