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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1381 | 2025-10-05 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2025-Jan-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
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综述 | 本文综述了微生物适应性和基因工程方法在低渗透性土壤生物修复中的应用与进展 | 整合了微生物自然适应机制与合成生物学技术,提出了定制微生物群落协同修复低渗透性土壤污染的新策略 | NA | 提高低渗透性土壤中生物修复的有效性 | 低渗透性土壤中的微生物及其基因工程改造 | 环境生物技术 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 定制微生物群落 | 环境 |
| 1382 | 2025-10-05 |
Harnessing promoter elements to enhance gene editing in plants: perspectives and advances
2025-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14533
PMID:40013512
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综述 | 探讨利用启动子元件增强植物基因编辑效率的策略与进展 | 系统阐述组织特异性启动子、诱导型启动子和合成启动子在植物基因编辑中的创新应用 | NA | 提升植物基因编辑的精准性、效率和特异性 | 植物基因编辑系统中的启动子元件 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 组织特异性表达系统、诱导型表达系统、合成启动子设计 | 农业 |
| 1383 | 2025-10-05 |
Producing multiple chemicals through biological upcycling of waste poly(ethylene terephthalate)
2025-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.10.018
PMID:39581772
|
研究论文 | 开发罗尔斯顿菌RPET菌株的基因工具,实现从废弃PET塑料生物升级回收生产多种化学品 | 开发了针对非模式微生物RPET的可诱导可滴定表达系统和基于丝氨酸整合酶的重组编辑工具,建立了从消费后PET废瓶生产番茄红素、脂质和琥珀酸的微生物供应链 | 非模式微生物合成生物学工具稀缺限制了生物产品范围的扩展 | 开发塑料生物升级回收技术,实现可持续化学生产 | 罗尔斯顿菌RPET菌株和消费后PET废弃塑料 | 合成生物学 | NA | 基因工程、微生物代谢工程 | NA | 实验数据 | NA | 丝氨酸整合酶重组工具 | Rhodococcus jostii RPET | 代谢通路工程、微生物供应链 | 环境,工业生物技术 |
| 1384 | 2025-10-05 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-Mar, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文系统综述了玉米氮素吸收、同化和再利用的遗传与分子调控机制 | 整合了根系发育、微生物互作和氮信号转导等多维度机制,提出利用遗传多样性和合成生物学的综合研究策略 | NA | 提高玉米氮素利用效率以实现可持续农业 | 玉米 | 植物遗传学 | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 1385 | 2025-10-05 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2025-Feb-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
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综述 | 本微型综述重点介绍了合成共凝聚液滴在模拟生物分子凝聚物方面的最新设计进展及其在生物医学领域的应用潜力 | 通过动态相分离控制构建具有细胞样特征的合成凝聚物,为细胞仿生建模和功能材料工程提供创新解决方案 | NA | 探索合成生物分子凝聚物的相分离控制机制及其在生物医学中的应用 | 合成共凝聚液滴及其仿生结构 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生凝聚物结构、活性共凝聚物工程 | 生物医学, 材料科学 |
| 1386 | 2025-10-05 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2025-Jan, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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研究论文 | 本研究揭示了丹参根中ABC转运蛋白SmABCG1介导丹参酮从周皮细胞向外转运的机制 | 首次发现丹参酮可从周皮细胞转运至土壤环境,并鉴定出负责丹参酮IIA和丹参酮I外排的ABC转运蛋白SmABCG1 | NA | 探究植物二萜类化合物的转运机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根中的丹参酮转运过程 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、异源表达、基因敲除和过表达 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据、细胞定位数据 | 丹参毛状根培养体系 | CRISPR-Cas9 | 非洲爪蟾卵母细胞, 丹参毛状根 | NA | 代谢工程, 合成生物学 |
| 1387 | 2025-10-05 |
Regulatory and retrograde signaling networks in the chlorophyll biosynthetic pathway
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13837
PMID:39853950
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综述 | 本文综述了叶绿素生物合成途径中的调控机制和逆行信号网络 | 深入探讨了叶绿素合成中的调控机制,包括TBS酶的活性和稳定性控制、TBS途径的转录和翻译后调控,以及叶绿体到细胞质和细胞核的逆行信号传导 | NA | 阐明叶绿素生物合成途径的调控机制及其在合成生物学和农业中的应用前景 | 植物、藻类和光合细菌的叶绿素生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 藻类, 光合细菌 | 叶绿素生物合成途径调控网络 | 农业, 合成生物学 |
| 1388 | 2025-10-05 |
Leveraging the versatile properties of bacterial spores in materials
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.018
PMID:39472253
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综述 | 本文综述了基于细菌孢子特性的工程生物材料最新进展及其未来发展挑战 | 利用细菌孢子的休眠特性和环境抗性克服传统工程生物材料的寿命短和冷链运输限制 | NA | 开发高性能、时间效率和成本效益的孢子基材料 | 细菌孢子及其在材料科学中的应用 | 合成生物学与材料科学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌孢子 | NA | 材料科学, 工业生物技术 |
| 1389 | 2025-10-05 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
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综述 | 本文从多组学和技术视角全面探讨叶绿体在植物生长、防御和遗传创新中的多功能作用 | 独特整合叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学最新进展,提出通过组学数据与纳米技术、合成生物学结合优化植物生长和胁迫耐受性的新视角 | NA | 探索叶绿体在协调植物生长与防御平衡中的核心作用,推动可持续农业发展 | 叶绿体及其在植物生长、防御机制中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学)、合成生物学、纳米技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 1390 | 2025-10-05 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
|
研究论文 | 本研究利用植物代谢工程合成动物来源的氨基酸衍生物,通过合成模块化方法成功在植物中生产肌酸、肌肽和牛磺酸 | 开发了合成模块化框架,首次在植物中实现多种动物来源氨基酸衍生物的重定向合成,并发现模块整合可显著提高产量并减少对植物代谢的影响 | 牛磺酸模块的引入意外抑制了植物半胱氨酸生物合成,表明外源途径引入可能导致复杂的代谢调整 | 通过合成生物学方法增强植物性饮食的营养价值,实现动物来源必需营养素的可持续生产 | 肌酸、肌肽和牛磺酸等动物来源氨基酸衍生物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | 代谢产物定量数据 | NA | 合成模块化框架 | 植物 | 专门设计的合成代谢模块,包括肌酸模块、肌肽模块和牛磺酸模块,通过模块堆叠实现代谢通量重定向 | 农业,食品 |
| 1391 | 2025-10-05 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
|
研究论文 | 开发了一种铱催化的定向烯醇化策略,用于高效合成具有连续立体中心的β-取代α-氨基酸 | 利用甘氨酸衍生物N-H单元的内源性导向能力实现铱催化的定向烯醇化,实现两个连续立体中心的高效构建 | NA | 开发合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法 | β-取代α-氨基酸的合成 | 有机合成化学 | NA | 铱催化、定向烯醇化、交叉偶联 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物设计、手性催化剂合成、合成生物学 |
| 1392 | 2025-10-05 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
|
研究论文 | 本研究开发了通过酶催化聚合诱导自组装合成能够表达蛋白质的聚合物人工细胞 | 首次利用肌红蛋白催化的原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达功能的人工细胞 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并实现其生物学功能模拟 | 基于聚合物的人工细胞微结构 | 合成生物学 | NA | 原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 分子系统工程, 合成生物学 |
| 1393 | 2025-10-05 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本研究开发了一种基于PYR1受体、具有可重编程配体结合特异性的正交化化学诱导二聚化模块 | 设计了带有二聚界面盐桥的正交化PYR1*模块,创建了对特定配体具有纳摩尔级敏感性的新型CID系统 | NA | 扩展PYR1化学诱导二聚化系统,开发可重编程配体结合特异性的正交化模块 | PYR1受体、HAB1磷酸酶及其正交化变体 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化分析、体内分析 | NA | 晶体结构数据、生化数据、体内功能数据 | NA | CID系统设计 | 拟南芥, 酿酒酵母 | 化学诱导二聚化模块、多输入/输出遗传电路、生物传感器 | 环境监测, 合成生物学 |
| 1394 | 2025-10-05 |
Designing microbial consortia with defined social interactions
2018-08, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0091-7
PMID:29942078
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研究论文 | 通过社会相互作用工程开发具有可预测动态的合成微生物群落 | 结合模块化途径重构与模型创建,建立了六种独特相互作用模式的双菌群体系,并扩展至多菌群生态系统设计 | NA | 开发具有可预测动态的合成微生物群落 | 微生物群落及其社会相互作用 | 合成生物学 | NA | 社会相互作用工程、模块化途径重构 | 种群动态模型 | 微生物种群动态数据 | 六个双菌群体系,扩展至三菌群和四菌群生态系统 | NA | 微生物 | 六种社会相互作用模式:偏利共生、偏害共生、中性关系、合作、竞争和捕食 | 微生物组工程 |
| 1395 | 2025-10-05 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了利用'特洛伊木马'策略开发抗生素偶联物以克服细菌耐药性的研究现状 | 系统总结了三种抗生素偶联物(单克隆抗体、抗菌肽和铁载体)的作用机制及临床前/临床证据 | 抗生素偶联物的临床转化仍面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对多重耐药细菌感染 | 抗生素与生物活性成分(单克隆抗体、抗菌肽、铁载体)的偶联物 | NA | 细菌感染 | 基因工程、合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1396 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-Apr-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) | NA | NA | NA | NA |
| 1397 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在玉米胚胎发育研究中的协同应用 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术相结合研究玉米胚胎发育,实现基因表达模式在单细胞分辨率和空间背景下的协同分析 | 单细胞技术缺乏已知细胞标记物难以识别特定细胞簇,空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 研究玉米胚胎发育的基因表达模式和调控网络 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 1398 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红与远红光组合能显著提高本氏烟草中异源蛋白和代谢物的产量 | 首次系统研究不同光质对本氏烟草瞬时表达效率的影响,发现红与远红光组合能显著提升异源蛋白和代谢物产量 | 研究仅针对本氏烟草和特定异源产物,未验证在其他植物或蛋白体系中的普适性 | 探究光质对植物瞬时表达系统效率的影响机制 | 本氏烟草植株及其表达的绿色荧光蛋白和紫杉二烯代谢物 | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 分子生物学数据、组学数据 | 五种不同光质处理下的本氏烟草植株 | 农杆菌浸润 | 本氏烟草 | 异源蛋白表达和代谢物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1399 | 2025-10-05 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
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研究论文 | 本研究结合扩散模型和Transformer模型,开发了一种用于合成启动子设计和强度预测的深度学习平台 | 首次将扩散模型应用于启动子设计,并结合Transformer模型进行强度预测,相比传统方法能生成更接近天然启动子的合成序列 | NA | 开发高效的合成启动子设计和筛选方法,优化外源基因表达和代谢通路效率 | 合成启动子序列及其转录活性 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 扩散模型, Transformer, CNN, 变分自编码器 | 启动子序列数据 | NA | NA | 模型细菌, 蓝细菌 | 合成启动子设计 | 工业生物技术 |
| 1400 | 2025-10-05 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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研究论文 | 通过阐明NADPH依赖酶的电子传递机制,系统改造酿酒酵母细胞工厂实现胆固醇和孕烯醇酮的高效生物合成 | 首次系统阐明NADPH依赖酶的电子传递机制,并通过缩短和稳定电子传递链显著加速去质子化和质子耦合电子传递过程 | NA | 提高类固醇化合物的生物合成效率 | 酿酒酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 电子传递工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 电子传递链工程、NADPH再生途径、碳流导向的电子传递组件 | 医药, 工业生物技术 |