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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1401 | 2024-08-16 |
Genome Engineering for Next-Generation Cellular Immunotherapies
2023-12-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.2c00340
PMID:35930700
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研究论文 | 本文探讨了通过基因组工程技术改进下一代细胞免疫疗法的策略 | 利用CRISPR-Cas系统和合成生物学方法,开发具有更高效力和精细模块控制的细胞疗法,并提供同种异体疗法开发的工具包 | 目前尚未提及具体限制 | 克服现有细胞免疫疗法中的挑战,如抗原逃逸、肿瘤微环境中的免疫抑制、毒性和靶向非肿瘤效应 | CAR-T、TCR-T、NK细胞疗法及其他免疫细胞类型 | 基因组学 | 癌症 | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因数据 | 未具体说明样本数量 |
1402 | 2024-08-16 |
Plant Metabolic Gene Clusters: Evolution, Organization, and Their Applications in Synthetic Biology
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.697318
PMID:34490002
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综述 | 本文综述了植物代谢基因簇的进化、组织结构及其在合成生物学中的应用 | 探讨了基因簇通过基因重复和新功能化进化而来的机制,并强调了其在代谢工程和合成生物学策略中的重要性 | NA | 总结基因簇的进化,讨论其在特化代谢物生物合成中的组织和重要性,并强调其在未来代谢工程或合成生物学策略中的应用 | 植物代谢基因簇及其在特化代谢物生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因簇 | 超过20个基因簇 |
1403 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析,鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子,并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时,通过基因组数据和蛋白质组分析,识别了534个操纵子,并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域,用于识别核糖体结合位点(RBSs)。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,包括启动子元件和核糖体结合位点,为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析,荧光报告系统 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | 48个天然启动子,534个操纵子,15个基因间区域 |
1404 | 2024-08-15 |
Transcriptional upregulation of the myo-inositol biosynthesis pathway is enhanced by NFAT5 in hyperosmotically stressed tilapia cells
2024-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00187.2024
PMID:38946247
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研究论文 | 本文研究了莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下肌醇生物合成途径的上调,并探讨了NFAT5在此过程中的作用 | 首次证明了NFAT5作为罗非鱼转录因子,参与高渗应激下肌醇生物合成途径的激活 | 除了NFAT5外,还需要其他强渗透应激信号机制来完全激活罗非鱼基因 | 探讨NFAT5在罗非鱼细胞高渗应激下肌醇生物合成途径中的作用 | 莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下的生理调整 | NA | NA | NA | NA | mRNA | 使用OmB细胞系进行实验 |
1405 | 2024-08-15 |
Engineered Bacteria for Visualization and Localization of Gastrointestinal Bleeding: A Promising Application
2024-Aug-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01699
PMID:39141424
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研究论文 | 本文开发了一种利用合成生物技术智能工程化的细菌,用于体内定位检测胃肠道出血 | 通过构建三个基因电路模块,实现了对血红素的特异性感应和实时光学信号的体内生成,克服了现有诊断方法的局限 | NA | 提高胃肠道出血的诊断准确性和治疗效果 | 胃肠道出血,特别是隐匿性胃肠道出血 | 合成生物学 | 胃肠道疾病 | 合成生物技术 | 基因电路模块 | NA | NA |
1406 | 2024-08-14 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化条件性gRNA的dCas9调节器,用于精确控制内源基因表达 | 本研究首次实现了基于多输入逻辑处理的条件性gRNA,能够高效调节内源代谢过程 | NA | 开发一种新的方法来精确控制CRISPR-Cas系统,以调节内源基因表达 | Escherichia coli中的内源代谢基因和细胞骨架基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | 涉及Escherichia coli中的多个基因,包括lacZ, malT, poxB, ftsZ和mreB |
1407 | 2024-08-14 |
Advances in functional studies of plant MYC transcription factors
2024-Aug-05, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-024-04697-8
PMID:39103657
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综述 | 本文综述了植物MYC转录因子在调控多种生理过程中的功能研究进展 | 通过基因克隆和利用全基因组'omics'及蛋白质-蛋白质相互作用技术,深入理解了MYC的多方面调控功能 | NA | 探讨MYC作为分子开关在调控植物激素和光敏色素介导的信号转导途径中的作用 | 植物MYC转录因子及其在植物生长、发育、逆境适应和次生代谢中的作用 | NA | NA | 全基因组'omics'技术,蛋白质-蛋白质相互作用技术 | NA | 基因组数据 | NA |
1408 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1409 | 2024-08-14 |
Biofunctional coacervate-based artificial protocells with membrane-like and cytoplasm-like structures for the treatment of persistent hyperuricemia
2024-01, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2023.11.030
PMID:37992873
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研究论文 | 本文研究了基于生物功能化凝聚层滴的人工原细胞,用于治疗持续性高尿酸血症 | 开发了具有生理稳定性的聚赖氨酸-多核苷酸复合凝聚层滴,并通过PEG化磷脂膜改善其生物相容性,形成具有膜样和细胞质样结构的人工原细胞 | NA | 研究人工原细胞在治疗持续性高尿酸血症中的应用 | 人工原细胞的制备及其在降尿酸和预防肾脏损伤中的效果 | 生物技术 | 高尿酸血症 | 凝聚层滴技术 | NA | 生物分子 | 小鼠模型 |
1410 | 2024-08-14 |
Towards a Yersinia pestis lipid A recreated in an Escherichia coli scaffold genome
2024, Access microbiology
DOI:10.1099/acmi.0.000723.v3
PMID:39130741
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研究论文 | 本文利用CRISPR/Cas9重组技术将脂多糖A生物合成基因插入到表达脂多糖IV亚单位的菌株基因组中 | 成功插入三个基因并通过RT-PCR验证其表达,但通过MALDI-TOF质谱分析发现脂多糖A结构未在背景中重现 | 尽管基因表达,但脂多糖A结构未能在背景中重现 | 探索在Escherichia coli基因组中重现Yersinia pestis脂多糖A的可能性 | 脂多糖A生物合成基因及其在Escherichia coli中的表达 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9重组技术,MALDI-TOF质谱分析 | NA | 基因组 | 一个菌株 |
1411 | 2024-08-14 |
Step-by-step design of proteins for small molecule interaction: A review on recent milestones
2021-08, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4098
PMID:33934427
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综述 | 本文综述了蛋白质设计领域中针对小分子相互作用的最新进展,详细介绍了从活性结合位点的构思到支架设计、序列优化及定制蛋白质的实验表达的每一步骤 | 近期计算技术在硬件和软件方面的进步为高通量筛选和新型折叠及功能改进的详细设计铺平了道路 | NA | 开发定制的蛋白质和多肽以满足特定应用需求 | 蛋白质设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1412 | 2024-08-14 |
Two-Phase Synthesis of Taxol
2020-06-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.0c03592
PMID:32406238
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研究论文 | 本文介绍了一种基于萜类合成生物机制的互补发散合成方法,用于合成紫杉醇 | 提出了一种新的合成紫杉醇的方法,该方法模仿了萜类合成的生物机制 | NA | 探索紫杉醇的新合成途径 | 紫杉醇的合成方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1413 | 2024-08-13 |
AFP: Finding pathways accounting for stoichiometry along with atom group tracking in metabolic network
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.004
PMID:39009230
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研究论文 | 本文提出了一种名为AFP的新方法,通过将原子组追踪融入反应化学计量学,利用混合整数线性规划(MILP)来寻找代谢途径 | AFP方法结合了原子组追踪与反应化学计量学,构建MILP模型以搜索包含原子组交换的反应途径,并能从任意或给定的化合物搜索到目标化合物 | NA | 旨在自动发现合成生物学和代谢工程中代谢途径的初始设计中的新途径 | 代谢途径的自动发现方法 | 代谢工程 | NA | 混合整数线性规划(MILP) | MILP模型 | 代谢途径数据 | NA |
1414 | 2024-08-13 |
A new synthetic biology system for investigating the biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites in streptomycetes
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.007
PMID:39004405
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研究论文 | 本文介绍了一种新的合成生物学表达系统,用于研究链霉菌中抗生素和其他次级代谢产物的生物合成 | 该系统允许将生物合成基因簇(BGCs)重构为单顺反子转录单元,并基于含有强kasOp*启动子、RBS和终止子的质粒 | NA | 开发一种新的合成生物学系统,用于研究链霉菌中次级代谢产物的生物合成 | 链霉菌中的生物合成基因簇(BGCs) | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因序列 | 涉及两种已知的生物合成基因簇,用于芳香聚酮类抗生素landomycin和mithramycin的合成 |
1415 | 2024-08-13 |
Enhancing Withanolide Production in the Withania Species: Advances in In Vitro Culture and Synthetic Biology Approaches
2024-Aug-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13152171
PMID:39124289
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研究论文 | 本文探讨了通过体外培养技术和合成生物学方法提高茄科植物中甾体内酯类化合物生产的最新进展 | 利用合成生物学和机器学习技术,通过异源系统和代谢工程改造甾体内酯的生物合成途径 | 甾体内酯的生物合成途径复杂,是提高生产的主要障碍 | 提高甾体内酯的生产以满足现代医学的需求 | 茄科植物中的甾体内酯类化合物 | 合成生物学 | NA | CRISPR | 机器学习 | 生物过程数据 | NA |
1416 | 2024-08-13 |
Strategies in engineering sustainable biochemical synthesis through microbial systems
2024-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102493
PMID:38971129
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综述 | 本文综述了利用微生物系统进行可持续生物化学合成的策略 | 结合系统生物学和合成生物学,以及将人工智能与代谢工程整合,以精确和数据驱动的方式设计生物合成途径 | 讨论了当前的限制并提出了优化生物系统的策略 | 开发可持续替代品以替代化石燃料和化学品,并推动绿色生物技术的发展 | 微生物系统的生物合成能力 | 生物技术 | NA | 代谢工程 | 人工智能 | 数据 | NA |
1417 | 2024-08-13 |
Biosynthesis and recruitment of reactive amino acids in nonribosomal peptide assembly lines
2024-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102494
PMID:38936328
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研究论文 | 本文探讨了非核糖体肽装配线上反应性氨基酸侧链的生物合成及其招募机制 | 本文揭示了多种反应性氨基酸在非核糖体肽中的生物合成途径及其在药物开发中的应用潜力 | NA | 研究反应性氨基酸在非核糖体肽合成中的作用及其在制药领域的应用 | 反应性氨基酸及其在非核糖体肽中的生物合成和功能 | 生物化学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA |
1418 | 2024-08-13 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 本文探讨了如何利用系统生物学和单细胞测序技术来识别协调植物生长和发育的候选基因 | 结合系统生物学和单细胞测序技术,以及合成生物学方法来测试假设和定义基因型-表型关系 | 识别候选基因仍然是一个挑战,由于复杂的基因网络和通路以及多效性现象 | 探索如何通过工程化植物激素信号来协调植物生长、发育和环境响应 | 植物生长和发育的候选基因及其在特定时间和组织背景下的功能 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因序列 | NA |
1419 | 2024-08-13 |
AI-Assisted Rational Design and Activity Prediction of Biological Elements for Optimizing Transcription-Factor-Based Biosensors
2024-Jul-26, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29153512
PMID:39124917
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综述 | 本文综述了人工智能算法在合成生物学中生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器响应性能调控中的应用 | 探讨了人工智能算法在分析生物数据中的强大潜力,并提出了针对该领域挑战的创新解决方案 | NA | 探索人工智能在合成生物学中的应用,以推动学术研究和生物技术的实际应用 | 生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器的调控 | 合成生物学 | NA | 机器学习、深度学习 | AI算法 | 生物数据 | NA |
1420 | 2024-08-13 |
Proton gradients from light-harvesting E. coli control DNA assemblies for synthetic cells
2021-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24103-x
PMID:34172734
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研究论文 | 本文通过基因工程改造大肠杆菌,使其过量表达光驱动的向内质子泵,并将其封装在人工细胞大小的隔室中,利用光暗循环实现pH值的可逆调节,进而触发DNA结构与隔室边缘的附着 | 本文创新地将自下而上和自上而下的合成生物学方法结合,利用光驱动质子泵实现对合成细胞系统的控制 | NA | 实现光转化为质子梯度,用于驱动合成细胞系统的动作 | 大肠杆菌、人工细胞大小的隔室、DNA结构 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 生物分子 | NA |