本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2025-10-05 |
Engineering electrogenetic interfaces for mammalian cell control
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.01.003
PMID:39879984
|
研究论文 | 本文概述了设计直接电遗传接口以控制治疗工程哺乳动物细胞行为的研究 | 提出了电遗传学这一新兴概念,探索数字电子设备产生的电子如何编程活细胞内的电子响应生物单元 | NA | 设计直接电遗传接口控制哺乳动物细胞行为 | 治疗工程哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 电遗传学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 电子响应生物单元 | 医学 |
| 1422 | 2025-10-05 |
Activation of Caged Functional RNAs by An Oxidative Transformation
2025-Apr-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202401056
PMID:39740778
|
研究论文 | 本研究展示了通过氧化处理激活含有2-硫代尿苷的功能性RNA分子 | 首次利用2-硫代尿苷的氧化脱硫反应实现RNA功能的可控激活,拓展了RNA作为环境响应性功能聚合物的应用 | NA | 开发通过氧化转化激活笼状功能性RNA的方法 | 功能性RNA(适配体和核酶) | 合成生物学 | NA | 氧化脱硫技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 氧化响应型RNA开关 | 医学, 合成生物学 |
| 1423 | 2025-10-05 |
p-Hydroxycinnamic Acids: Advancements in Synthetic Biology, Emerging Regulatory Targets in Gut Microbiota Interactions, and Implications for Animal Health
2025-Apr, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.01.034
PMID:39900184
|
综述 | 本文综述了对羟基肉桂酸的合成生物学进展、与肠道微生物的相互作用机制及其对动物健康的影响 | 强调对羟基肉桂酸与肠道微生物相互作用的复杂机制,并探索其合成生物学的最新进展 | NA | 探讨对羟基肉桂酸的生物活性、与肠道微生物相互作用及其对动物健康的影响 | 对羟基肉桂酸及其与肠道微生物的相互作用 | 合成生物学 | NA | 生物合成技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 动物饲料 |
| 1424 | 2025-10-05 |
Pepticombisomes: Biomimetic Vesicles Crafted From Recombinant Supercharged Polypeptides with Uniformly Distributed Side-Chains
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411497
PMID:39985267
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型仿生囊泡pepticombisomes,通过重组超带电多肽与表面活性剂自组装形成 | 开发了具有均匀聚合度、组成和序列的pepticombs作为超分子构建模块,能精确模拟膜厚度和柔韧性 | NA | 开发能更好模拟天然细胞膜特性的仿生膜结构 | 基于重组弹性蛋白样超带电多肽的仿生囊泡 | 合成生物学 | NA | 显微镜技术、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | 重组蛋白技术 | NA | 自组装膜结构 | 生物技术 |
| 1425 | 2025-10-05 |
Integrated Metabolomic and Transcriptomic Analysis Reveals the Molecular Regulatory Mechanism of Gamma-Aminobutyric Acid Accumulation in White Quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) in Response to Dark and Ultrasound Stress
2025-Mar-28, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14071186
PMID:40238367
|
研究论文 | 通过整合代谢组和转录组分析揭示白藜麦在黑暗和超声波胁迫下γ-氨基丁酸积累的分子调控机制 | 首次系统阐明黑暗和超声波胁迫下藜麦中GABA积累的分子通路,发现两条GABA合成途径分别涉及谷氨酸脱羧酶和醛脱氢酶 | 未进行基因功能验证实验,分子调控网络需要进一步确认 | 探究黑暗和超声波胁迫下藜麦中GABA积累的分子调控机制 | 白藜麦(Chenopodium quinoa Willd.) | 植物分子生物学 | NA | 转录组分析,代谢组分析 | NA | 基因表达数据,代谢物数据 | 经过不同胁迫处理的藜麦样品 | NA | 藜麦 | NA | 农业,合成生物学 |
| 1426 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica for Enhanced De Novo Biosynthesis of Icaritin
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00754
PMID:40106718
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母,实现了黄酮类化合物淫羊藿苷元的从头生物合成 | 通过整合EsPT和OsOMTm合成途径、优化甲羟戊酸途径提高DMAPP供应、采用截断策略优化酶催化效率,将ICT产量提升至247.02 mg/L,创下目前微生物合成最高产量纪录 | NA | 开发高效的淫羊藿苷元微生物合成方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | 肝癌 | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 解脂耶氏酵母 | 淫羊藿苷元合成途径,包含EsPT和OsOMTm基因,甲羟戊酸途径优化 | 医药 |
| 1427 | 2025-10-05 |
ON-OFF nanopores for optical control of transmembrane ionic communication
2025-Mar, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01823-x
PMID:39838209
|
研究论文 | 通过将α-溶血素蛋白孔与芳基偶氮吡唑光开关共价修饰,开发出可在不同波长光照下在离子电阻器和二极管模式间转换的'光孔' | 创建了首个通过正交波长光照在电阻器和二极管模式间切换的光控纳米孔,实现了仅依赖波长而非强度的电流调控 | NA | 开发纳米级光开关蛋白以实现跨膜通信的精确时空控制 | α-溶血素蛋白孔与芳基偶氮吡唑光开关的复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、光控技术 | NA | 电生理数据、光学数据 | NA | 蛋白质共价修饰 | NA | 光控离子通道、分子二极管 | 合成生物学、神经科学、生物电子学 |
| 1428 | 2025-10-05 |
Recent advances in the Design-Build-Test-Learn (DBTL) cycle for systems metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2501021
PMID:40195836
|
综述 | 本文综述了基于设计-构建-测试-学习(DBTL)循环的系统代谢工程在谷氨酸棒杆菌中的最新进展 | 将现代工程策略整合到DBTL循环框架中,革新了高价值化合物的生物合成方法 | NA | 优化微生物细胞工厂作为石化行业可持续替代品的潜力 | 谷氨酸棒杆菌及其L-赖氨酸衍生的C5平台化学品 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统生物学、系统代谢工程、合成生物学、酶工程、组学技术、进化工程 | NA | NA | NA | DBTL循环 | 谷氨酸棒杆菌 | 代谢途径优化、L-赖氨酸生产途径 | 工业生物技术 |
| 1429 | 2025-10-05 |
Synthetic biology strategies for sustainable bioplastic production by yeasts
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2501022
PMID:40195837
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学策略开发酵母细胞工厂生产可生物降解塑料的最新进展 | 整合计算工具和机器学习到Design-Build-Test-Learn循环中以促进菌株开发 | 在提高菌株鲁棒性和扩大工业生产规模方面仍面临挑战 | 开发可持续生物塑料生产的合成生物学策略 | 酿酒酵母和解脂耶氏酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程、适应性进化 | 机器学习 | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母 | 基因、途径和细胞系统水平的遗传元件整合 | 环境, 工业生物技术 |
| 1430 | 2025-10-05 |
Untranslated region engineering strategies for gene overexpression, fine-tuning, and dynamic regulation
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2501033
PMID:40195839
|
综述 | 探讨非翻译区工程策略在细菌基因表达优化中的最新进展 | 系统整合了多种UTR工程策略(包括AU富集元件、RG4结构、核糖开关等),为细菌基因表达调控提供了模块化框架 | NA | 优化细菌基因表达以实现精确可调的生物技术应用 | mRNA非翻译区调控元件 | 合成生物学 | NA | UTR工程、核糖开关、toehold开关 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 合成双UTR、代谢通路平衡、动态基因调控回路 | 工业生物技术 |
| 1431 | 2025-10-05 |
Evaluation of the Salmonella type 3 secretion system (T3SS) as part of a protein production platform for space biology applications
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1567596
PMID:40242353
|
研究论文 | 评估沙门氏菌III型分泌系统作为太空生物学应用中蛋白质生产平台的可行性 | 首次在模拟微重力条件下评估SPI-1 T3SS的蛋白质分泌能力,为太空生物学应用提供新型生物技术平台 | 研究基于地面模拟微重力环境,未在真实太空环境中验证;仅针对沙门氏菌单一系统进行评估 | 开发适用于太空环境的微生物蛋白质生产平台 | 沙门氏菌SPI-1 III型分泌系统 | 合成生物学 | NA | NASA设计的微重力模拟生物反应器系统 | NA | 细胞生长数据、应激反应数据、蛋白质分泌数据 | NA | NA | 沙门氏菌 | 病原岛1(SPI-1)III型分泌系统作为蛋白质分泌平台 | 太空生物学 |
| 1432 | 2025-10-05 |
Current advances in microalgae-based fucoxanthin production and downstream processes
2025-Jul, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132455
PMID:40157580
|
综述 | 本文综述了基于微藻的岩藻黄质生产及下游工艺的最新进展 | 对岩藻黄质生物合成进行了定量荟萃分析,并评估了CRISPR基因编辑技术在增强岩藻黄质生产中的应用潜力 | 面临成本控制、规模化生产和监管限制等挑战 | 探索提高微藻源岩藻黄质商业化可行性的综合生物技术解决方案 | 微藻(如三角褐指藻)和岩藻黄质 | 生物技术 | NA | 超临界流体萃取、超声波辅助萃取、微波辅助萃取、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | 微藻(三角褐指藻) | 岩藻黄质生物合成途径 | 营养保健品, 制药, 化妆品 |
| 1433 | 2025-10-05 |
Synthetic pathways for microbial biosynthesis of valuable pyrazine derivatives using genetically modified Pseudomonas putida KT2440
2025-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2025.e00258
PMID:40236303
|
研究论文 | 本研究通过基因工程改造Pseudomonas putida KT2440,构建了合成吡嗪衍生物的新型代谢途径 | 结合微生物宿主与非血红素二铁单加氧酶的异源表达,首次实现了2,5-二甲基吡嗪及其羧酸和氧化物衍生物的微生物生物合成 | 研究仍处于早期阶段,产物滴度有待进一步提高 | 开发微生物合成高价值吡嗪衍生物的生物技术方法 | 基因工程改造的Pseudomonas putida KT2440菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因编辑、异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas putida KT2440 | L-苏氨酸代谢途径改造、吡嗪合成途径、单加氧酶催化途径 | 工业生物技术 |
| 1434 | 2025-10-05 |
Towards electrospray-assisted production of lipid-based synthetic cell assemblies
2025-Apr-16, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01284d
PMID:40035737
|
研究论文 | 开发了一种基于电喷雾的技术ATLAES,用于形成基于脂质的囊泡组装体 | 提出无有机溶剂的水相两相系统(ATPS)模板化电喷雾技术,可形成具有高度稳定脂质涂层的微观囊泡 | NA | 扩展合成生物学工具箱,探索替代性脂质组装体和新生产方法 | 脂质基囊泡和合成细胞组装体 | 合成生物学 | NA | 电喷雾技术、水相两相系统(ATPS) | NA | NA | NA | ATLAES | NA | 脂质囊泡组装体 | 合成生物学 |
| 1435 | 2025-10-05 |
Characterization of the Biosynthesis of Pimprinine-Type Indolyloxazoles Unravels an Unusual d-Configurational Substrate Metabolic Streamline
2025-Apr-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01705
PMID:40178231
|
研究论文 | 本研究揭示了皮姆普林型吲哚恶唑生物碱的生物合成机制,发现了一条以前未知的D-构型底物代谢流线 | 首次阐明了PIAs生物合成途径,发现了三个关键酶(PimA、PimB、PimC)参与的D-构型底物代谢流线,其中PimB作为门控酶从L-色氨酸池中提供D-色氨酸前体 | NA | 解析皮姆普林型吲哚恶唑生物碱的生物合成途径 | 链霉菌NZY3中的PIAs生物合成基因簇及其编码的酶 | 合成生物学 | NA | 氘标记实验、18O标记实验、比较基因组挖掘 | NA | 实验数据、基因组数据 | NA | NA | 链霉菌 | D-构型底物代谢流线,涉及色氨酸消旋、N-酰化和自由基重排介导的环化机制 | 医药, 农业 |
| 1436 | 2025-10-05 |
Engineering biology applications for environmental solutions: potential and challenges
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58492-0
PMID:40229265
|
综述 | 本文概述了工程生物学在环境解决方案中的应用潜力与挑战 | 整合工程生物学与纳米技术、物联网和人工智能等其他技术,并提出加速环境解决方案应用的策略 | NA | 探讨工程生物学在解决全球环境挑战中的应用前景和障碍 | 工程生物学技术在环境领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 1437 | 2025-10-05 |
Integrating microbial communities into algal biotechnology: a pathway to enhanced commercialization
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1555579
PMID:40236480
|
综述 | 本文系统阐述了藻类微生物组的分类多样性、生态功能及其在增强藻类生物技术商业化应用中的潜力 | 首次综合探讨微生物组工程通过调控藻类-微生物互作来突破藻类培养经济与环境壁垒的变革潜力 | NA | 探索藻类微生物组在促进微藻培养可持续性和经济可行性方面的生物技术潜力 | 微藻及其关联的微生物群落 | 生物技术 | NA | 合成生物学、生态学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | 通过营养交换、生长调控、病原防御和环境调节增强藻类-微生物互作的工程化设计 | 环境,能源,工业生物技术 |
| 1438 | 2025-10-05 |
Logic "AND Gate Circuit"-Based Gasdermin Protein Expressing Nanoplatform Induces Tumor-Specific Pyroptosis to Enhance Cancer Immunotherapy
2024-03-05, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c09405
PMID:38377037
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于逻辑“与门”电路的纳米平台,通过特异性诱导肿瘤细胞焦亡来增强癌症免疫治疗 | 采用合成生物学策略构建了基于Hif-1α和Sox4双输入信号的逻辑“与门”电路,实现肿瘤特异性焦亡诱导 | 未明确说明动物模型类型和长期毒性评估 | 开发具有肿瘤特异性的焦亡诱导系统以增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤细胞和免疫系统 | 合成生物学 | 癌症 | 纳米技术、基因工程 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学电路设计 | 哺乳动物细胞 | 逻辑“与门”电路,以Hif-1α和Sox4为输入信号,gasdermin D诱导焦亡为输出信号 | 医学 |
| 1439 | 2025-10-05 |
Deciphering the biosynthetic potential of microbial genomes using a BGC language processing neural network model
2025-Apr-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf305
PMID:40226917
|
研究论文 | 开发基于Transformer的BGC-Prophet模型用于微生物基因组中生物合成基因簇的预测和分类 | 首创基于Transformer编码器的超高通量BGC预测工具,能够捕捉基因间位置依赖关系 | NA | 挖掘微生物基因组和宏基因组中隐藏的生物合成基因簇潜力 | 微生物基因组和宏基因组中的生物合成基因簇 | 自然语言处理 | NA | Transformer语言模型 | Transformer | 基因组序列数据 | 85203个基因组和9428个宏基因组 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1440 | 2025-10-05 |
Derepression of transposable elements in mouse prefrontal cortex disrupts social behavior
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646358
PMID:40236017
|
研究论文 | 通过合成生物学方法研究小鼠前额叶皮层中TRIM28蛋白功能改变对社会行为的影响 | 首次通过重构TRIM28蛋白的转录调控域来逆转其功能,揭示TE去抑制导致社会行为缺陷的新机制 | 研究仅针对小鼠前额叶皮层,未涉及其他脑区;性别差异分析不够深入 | 探究TRIM28-KZFP相互作用在调控转座元件和社会行为中的功能 | 雄性和雌性小鼠的前额叶皮层 | 合成生物学 | 社会行为障碍 | RNA测序,病毒介导的基因传递 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 雄性和雌性小鼠 | 病毒载体 | 小鼠 | TRIM28转录调控域的重编程:用VP64-p65-Rta激活域替换抑制域,或切除调控域 | 医学 |