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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2026-06-04 |
Synthetic biology development of microbial strains for liquid biofuel production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108891
PMID:41950978
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综述 | 综述了利用合成生物学开发液体生物燃料生产微生物菌株的最新进展 | 从底盘菌株选择、合成生物学工具开发和代谢调控工具三个角度系统总结了合成生物学在菌株工程中的应用进展,并通过重要生物燃料的菌株开发案例展示了其巨大潜力 | 未提及当前合成生物学方法在工业化应用中面临的具体挑战或局限性 | 总结合成生物学在开发液体生物燃料生产菌株方面的最新进展,为生物燃料技术发展提供参考 | 液体生物燃料生产菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 能源 |
| 1462 | 2026-06-07 |
Unveiling the mechanistic principles and engineered exploitation of bacteria and derivatives in precision drug delivery
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108902
PMID:42019701
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综述 | 系统探索了四种前沿细菌衍生递送系统的工程策略与应用潜力,包括活体生物治疗产品、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统和细菌细胞外囊泡 | 系统比较了四种细菌衍生递送平台(LBPs、T1SS-T7SS、eCISs、bEVs)的递送机制、载荷特性、工程灵活性及临床转化挑战 | 临床转化挑战包括安全性控制、工程稳定性及免疫原性问题 | 探索细菌及其衍生物在精准药物递送中的工程化应用原理与机制 | 四种细菌衍生递送系统:活体生物治疗产品、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统、细菌细胞外囊泡 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 遗传电路、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统、细菌细胞外囊泡 | 医学 |
| 1463 | 2026-06-07 |
Astaxanthin biomanufacturing under hierarchical constraints: Integrating synthetic biology and artificial intelligence for scalable production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108915
PMID:42105954
|
综述 | 重新概念化虾青素生物合成过程为分层约束管理问题,并提出与层级对齐、AI辅助的框架 | 将虾青素生物合成重新构想为分层约束管理问题,并提出层级对齐的AI辅助框架,使人工智能在分子、途径和系统层面分别利用蛋白质语言模型、图学习模型及卷积神经网络等进行结构化优化 | 属于概念框架,未在实际系统中进行实验验证或比较传统方法的效果 | 解决虾青素规模化生物制造中由生物学复杂性导致的生产性能瓶颈 | 虾青素(高价值酮类胡萝卜素)的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 蛋白质语言模型、序列-结构感知方法、图学习模型、卷积神经网络、多模态学习、大型语言模型 | 蛋白质语言模型、图学习模型、卷积神经网络、多模态模型、大语言模型 | 文本、序列、结构数据、多组学数据 | NA | NA | 未指定宿主,但适用于多种微生物或细胞系统 | 虾青素生物合成途径 | 工业生物技术, 医药, 食品 |
| 1464 | 2026-06-07 |
Toward predictable and programmable genetic circuits in plants
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108924
PMID:42140530
|
综述 | 探讨植物基因线路的定量预测设计方法,构建可预测和可编程的基因线路 | 提出将植物合成生物学中的预测性设计作为跨基因、生理和环境尺度的系统工程挑战,并系统整理新兴的定量工程框架 | 主要基于文献综述,缺乏实际实验验证;未解决具体植物物种间的生理差异性对预测性能的影响 | 实现植物基因线路的可预测性和可编程设计,推动从定性开关向定量传感和信息处理转变 | 植物基因线路的定量工程框架及其影响因素 | 合成生物学 | NA | 量化表征、标准化测量、多尺度建模 | NA | NA | NA | NA | 模式植物、农作物 | 基因线路(包括定量传感、信息处理、模型指导设计) | 农业 |
| 1465 | 2026-06-07 |
Automated, modular assembly of reconstituted cell-free systems from in vitro-produced components
2026-Jun-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.002
PMID:42248716
|
研究论文 | 开发了一种基于体外生产组分的模块化无细胞蛋白合成系统i-POPFLEX,通过自动化液体处理实现快速组装 | 首次实现将34种翻译因子和分裂T7 RNA聚合酶分别体外合成并自动化组装成无细胞系统,大幅降低成本并提高产量 | 目前仅测试了有限数量的翻译因子和RNA聚合酶组合,系统对复杂蛋白表达的支持能力仍需验证 | 构建一种低成本、可定制且可扩展的无细胞蛋白合成平台,以推动合成生物学应用 | 无细胞蛋白合成系统i-POPFLEX及其组成因子 | 合成生物学 | NA | 体外蛋白合成、自动化液体处理 | NA | 蛋白产量数据、成本分析数据 | 无具体样本数量,涉及34种翻译因子和T7 RNA聚合酶的体外合成与组装 | 自动化液体处理系统 | 大肠杆菌(用于体外合成组分) | 无细胞蛋白表达系统(模块化组装) | 生物制造、合成生物学 |
| 1466 | 2026-06-07 |
Synthetic Biology for Next-Generation Lactic Acid Bacteria: Engineering the Future of Food
2026-Jun-03, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00333
PMID:42183823
|
综述 | 回顾乳酸菌在食品工业中的传统应用与当前限制,重点介绍合成生物学驱动的基因编辑、代谢工程和基因回路等策略,以精确设计和扩展乳酸菌功能 | 系统阐述了利用合成生物学工具(如基因编辑、定向进化)优化乳酸菌基因表达效率和代谢通路的创新方法,并展望其在个性化食品开发中的应用前景 | 当前乳酸菌菌株仍面临质粒不稳定、基因表达效率低和代谢通量调控复杂等挑战,限制了其广泛应用 | 探讨如何通过合成生物学策略改进乳酸菌以推动下一代发酵食品发展 | 乳酸菌 | NA | NA | 基因编辑、代谢工程、合成基因回路、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 乳酸菌 | 代谢通路、基因回路 | 食品 |
| 1467 | 2026-06-07 |
From toxin to biofuel: engineering microbes for methanol biomanufacturing
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103442
PMID:41610456
|
综述 | 综述甲醇生物转化合成生物燃料的最新进展,包括甲醇细胞毒性机制及工程化策略 | 系统总结了甲醇细胞毒性机制并提出了整合系统生物学和合成生物学以实现可持续甲醇生物制造的新路径 | 未提及 | 探讨将甲醇作为一碳原料用于生物燃料生产的可行性和工程化改造策略 | 天然和合成甲基营养菌中的甲醇利用与耐受性工程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢通路重编程、区室化、适应性进化 | 天然甲基营养菌、合成甲基营养菌 | 甲醇毒性耐受回路、甲醇生物转化代谢通路 | 能源、工业生物技术 |
| 1468 | 2026-06-07 |
The mini revolution: application of mini-bioreactors in adaptive laboratory evolution
2026-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2608012
PMID:41592901
|
综述 | 系统探讨微型生物反应器在适应性实验室进化中的应用及其优势 | 全面综合了微型生物反应器技术的最新进展和操作策略,特别强调为ALE定制或适配的集成自动化、先进传感器和新型控制算法等创新 | 未明确提及具体局限性 | 为新手和经验丰富的研究人员提供有关微型生物反应器在ALE中当前技术限制和未来方向的深入资源 | 微生物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 生物技术, 合成生物学, 微生物生态学 |
| 1469 | 2026-06-07 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
|
综述 | 分析微生物胞外多糖作为益生元候选物和工艺功能性添加剂的双重功能,并探讨其对人类健康和食品系统的影响 | 系统阐述“EPS-微生物群-宿主轴”,区分益生元EPS和生物活性EPS的不同作用机制,并探讨合成生物学在工程化设计多糖中的应用潜力 | 主要关注技术经济障碍,尤其是生产规模化问题,限制了广泛采用 | 明确微生物EPS作为可持续、多功能成分在开发下一代健康食品中的精确作用 | 微生物胞外多糖 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药 |
| 1470 | 2026-06-07 |
Gene insertion and transcriptional regulation of Escherichia coli based on CRISPR-associated transposases
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149850
PMID:41628878
|
研究论文 | 基于CRISPR相关转座酶开发了大肠杆菌基因插入和转录调控工具 | 开发了基于Type IF CRISPR相关转座酶(CAST)系统Tn6677的可编程工具MUSCULAR-CAST,实现了多种大小的多顺反子表达盒(1-10K)的高效基因组整合,并构建了基于MUSCULAR-CAST靶向模块的基因抑制工具Tn-CRISPRi,实现了高单基因抑制和近完全双基因抑制 | 未明确说明 | 解决合成生物学中高效整合多顺反子表达盒入基因组和灵活调控基因表达的难题 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶(CAST)、Tn-CRISPRi | NA | NA | 涉及3-FL生产菌株和角质酶重组表达菌株的构建,以及17个基因的抑制实验 | CRISPR-Cas | 大肠杆菌 | 转座元件、CRISPRi基因抑制回路 | 工业生物技术 |
| 1471 | 2026-06-07 |
Biosynthesis of Indigoidine in Microorganisms: Strategies and Applications
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00800
PMID:41576205
|
综述 | 系统综述了微生物合成靛蓝苷的策略与应用进展 | 聚焦于合成生物学驱动的微生物细胞工厂工程化优化靛蓝苷产量,并总结代谢工程与酶工程方法 | 靛蓝苷的途径优化、产量提升及应用多样性方面仍存在挑战 | 为下一代微生物细胞工厂生产颜料提供路线图 | 微生物宿主系统(如大肠杆菌、酵母等)及靛蓝苷生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶(NRPS) | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 微生物底盘菌株(如大肠杆菌、酵母等) | 靛蓝苷生物合成途径及代谢工程修饰 | 纺织工业、颜料制造 |
| 1472 | 2026-06-07 |
Exploring the frontier of rapid prototyping technologies for plant synthetic biology and what could lie beyond
2024-05, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19650
PMID:38426415
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综述 | 综述了植物合成生物学中快速原型技术的进展,探讨如何通过设计-构建-测试循环加速研究 | 系统分析了多种快速原型技术的互补优势,并提出未来整合这些策略的可能性以实现植物合成生物学的快速规模化部署 | 现有技术各有局限,限制了广泛适用性,且快速原型技术的结合策略仍处于理论阶段 | 探索快速原型技术如何克服植物合成生物学中基因转化周期长、世代时间长和实验规模限制等瓶颈 | 植物合成生物学中的快速原型技术 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 设计-构建-测试循环(含快速原型技术) | 农业, 生物学研究 |
| 1473 | 2026-06-07 |
Visioning synthetic futures for yeast research within the context of current global techno-political trends
2023-10, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3897
PMID:37653687
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综述 | 本文综述了酵母研究在当前全球技术政治趋势下的新方向,重点关注酿酒酵母,并将这些趋势置于其地缘政治背景中 | 将酵母研究的新科学工具和方向与全球技术竞争的地缘政治背景相结合,强调生命科学与信息科学的融合 | 作为综述,未提供具体实验数据或验证新方法 | 概述酵母研究的新方向,并探讨其在全球技术政治背景下的机遇和挑战 | 酿酒酵母 | 合成生物学, 生命科学 | NA | 计算机辅助设计, AI工具, 合成基因组技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 计算机辅助设计工具 | 酿酒酵母 | 合成基因组, 最小基因组, 泛基因组, 新染色体, 宏基因组 | 工业生物技术, 农业, 环境, 医学 |
| 1474 | 2026-06-06 |
Melatonin-enabled omics: understanding plant responses to single and combined abiotic stresses for climate-smart agriculture
2026-Dec, GM crops & food
DOI:10.1080/21645698.2026.2614130
PMID:41589633
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综述 | 本文综述了褪黑素在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学层面调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制,并探讨了多组学整合(泛组学)方法及遗传工程和合成生物学在气候变化智慧农业中的应用潜力 | 首次系统整合褪黑素在多组学层面(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学)调控植物非生物胁迫耐受性的机制,并强调多组学交叉和泛组学方法的应用 | 作为综述,未提供新的实验数据,且各研究间方法、物种和胁迫条件差异较大,限制了结论的直接可比性 | 阐明褪黑素通过多组学调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制,并为培育气候智慧型作物提供策略 | 植物在单一和复合非生物胁迫下的多组学响应 | 机器学习 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学) | NA | 多组学数据 | NA | 遗传工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 1475 | 2026-06-06 |
Living buildings with living electronics: towards biologically intelligent biohybrids
2026-Jun-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.015
PMID:42242980
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观点文章 | 探讨将电活性生物膜作为生物智能组件融入建筑,实现从实验室原型到集成架构的转型 | 提出将电活性生物膜编程为生物晶体管和逻辑处理器等生物智能组件,而非简单生物催化剂,实现建筑功能化 | 未明确提及局限,可能涉及从实验室原型到实际建筑集成的技术挑战和规模化问题 | 规划电活性生物膜混合生物-人工系统从实验室原型向分布式资源回收集成架构的转型路线 | 电活性生物膜及其在建筑中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 电活性生物膜 | 生物晶体管、逻辑处理器 | 建筑、环境、工业生物技术 |
| 1476 | 2026-06-06 |
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Jun, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.03.006
PMID:42034479
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综述 | 本文综述了在遗传编码中同时引入多种非规范氨基酸的研究进展 | 介绍了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子库实现多种非规范氨基酸同时编码的突破性技术,特别是哺乳动物系统中稀有密码子重新编码与终止密码子抑制的整合实现了五种不同非规范氨基酸的遗传编码 | 未明确阐述当前技术的局限性 | 总结在遗传编码中同时编码多种不同非规范氨基酸的变革性进展 | 多种非规范氨基酸及其遗传编码系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码, 非规范氨基酸(ncAA)引入, 密码子重新编码, 终止密码子抑制 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医药, 合成生物学 |
| 1477 | 2026-06-06 |
Antimicrobial discovery from underexplored environments: unlocking specialized metabolism
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102745
PMID:41880737
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综述 | 探讨从未充分探索环境中发现抗生素的新策略,重点介绍先进培养技术、多组学、合成生物学和人工智能如何解锁隐秘的微生物代谢途径以应对抗生素耐药性危机 | 整合生态学、组学、合成生物学和人工智能等新兴方向,覆盖从稀有微生物群落到古菌及古代蛋白质组挖掘的跨维度创新方法 | 未具体讨论这些新策略在实际应用中的可扩展性、成本效益及潜在生态环境影响 | 总结和推进从新环境中发现抗生素的研究方向,填补抗生素发现创新缺口 | 常规土壤微生物以外的未被充分探索的微生物资源(稀有分类群、古菌、未培养微生物、古代蛋白质组) | 机器学习 | 抗微生物耐药性相关疾病 | 多组学、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 1478 | 2026-06-06 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
|
研究论文 | 构建了一个综合合成基因电路,将生物化学信号(NO)转化为电信号,实现电化学生物传感 | 通过合成生物学工具设计间接电子传递(IET)通路,结合NO响应模块和PCA合成模块,创制电活性细菌以增强电信号输出,首次实现单细胞水平NO的原位电化学检测 | 受限于合成基因电路的复杂性和工程改造细菌的稳定性,实际应用可能面临长期运行和转化效率挑战 | 开发基于工程电活性微生物的电化学生物传感器,用于细胞内信号分子的高灵敏检测 | 作为电活性细菌模型的大肠杆菌(Escherichia coli),以及信号分子一氧化氮(NO) | 合成生物学、电化学生物传感 | NA | 合成生物学、电化学检测、间接电子传递通路、基因电路工程 | NA | 电化学信号数据 | 单细胞水平检测,具体样本数量未提及 | Synthetic Biology, 基因电路设计 | 大肠杆菌 (Escherichia coli) | NO响应模块与PCA合成模块耦合的合成基因电路,实现生化信号转电信号 | 医学(如生物传感诊断)、环境监测、生物技术 |
| 1479 | 2026-06-06 |
One-step construction of robust protocells and prototissues in water
2026-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71650-2
PMID:41951631
|
研究论文 | 提出一种气液微流控辅助扩散抑制络合策略,实现原细胞和原组织的一步法稳健构建 | 首次实现低成本、高通量原细胞制造及厘米级三维原组织精确构建,所得原组织在水和空气中均具良好机械完整性 | 未说明具体限制 | 开发稳健原细胞和原组织的构建方法并模拟复杂生命行为 | 原细胞和原组织 | NA | NA | 气液微流控辅助扩散抑制络合 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物工程 |
| 1480 | 2026-06-06 |
Engineering microbial therapeutics for metabolic disorders: synthetic biology strategies and future direction
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103440
PMID:41592357
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review | 综述利用合成生物学设计工程微生物疗法治疗代谢紊乱的策略和未来方向 | 提出将合成生物学应用于工程益生菌和微生物系统作为自我调节的活体疗法,实现精准治疗与可持续生物生产的融合 | 主要讨论临床前研究,缺乏临床应用的详细分析和挑战 | 评估合成生物学如何使工程益生菌和微生物系统成为治疗代谢紊乱的自调节疗法 | 代谢紊乱,包括2型糖尿病、肥胖症和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎等 | NA | 代谢紊乱 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 可分泌治疗分子、降解有害代谢物、重塑宿主代谢微环境、响应生理信号的自适应反馈控制回路 | 医学 |