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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2025-10-06 |
The Establishment of Artificial RNA Cascade Circuits for Gene Regulation Based on Doxycycline-Induced Pre-mRNA Alternative Splicing
2025-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031163
PMID:39940931
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研究论文 | 本研究开发了基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路用于基因调控 | 开发了具有相反调控功能的开关模块(CTM和C2ITetR>4A),并构建了内含子剪接双开关RNA级联系统,能够使用相同配体同时激活和抑制剪接机制 | NA | 建立人工RNA级联电路用于基因调控 | 肿瘤细胞、基因表达调控 | 合成生物学 | 肿瘤 | RNA剪接调控、基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 人工嵌合内含子模块、RNA核糖开关、TetR适体、内含子剪接双开关RNA级联系统、L7Ae/k-turn模块 | 医学 |
| 1502 | 2025-10-05 |
Synthetic biology in Mexico: Brief history, current landscape, and perspectives towards a bio-based economy
2025 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12037
PMID:39950160
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综述 | 概述墨西哥合成生物学的发展历程、现状及其在生物经济中的潜力 | 首次系统梳理墨西哥合成生物学发展脉络,强调iGEM竞赛对本国合成生物学发展的推动作用 | 未提供具体研究数据支撑,主要基于宏观现状描述 | 分析墨西哥合成生物学发展现状及向生物经济转型的潜力 | 墨西哥合成生物学教育、科研、产业及政策体系 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本资料 | NA | iGEM | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 1503 | 2025-10-05 |
Engineering artificial photosynthetic life-forms through endosymbiosis
2022-04-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29961-7
PMID:35474066
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研究论文 | 通过设计光合蓝细菌与酵母的内共生系统,构建人工光合生命形式 | 首次在光合蓝细菌与芽殖酵母之间建立可遗传调控的人工内共生关系 | 对自然内共生进化过程的理解仍有限 | 研究内共生进化机制并开发合成生物学应用平台 | 光合蓝细菌与芽殖酵母的内共生系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | 多种光合蓝细菌突变株 | CRISPR-Cas9 | 芽殖酵母 | 内共生能量供给系统 | 合成生物学, 进化研究 |
| 1504 | 2025-10-05 |
Modular plasmid design for autonomous multi-protein expression in Escherichia coli
2025-Feb-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00483-2
PMID:39930458
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研究论文 | 本研究开发了一套用于大肠杆菌中多蛋白自主表达的模块化质粒系统 | 设计了包含四种不同表达盒的质粒系统,可实现最多三个基因的单顺反子自主表达 | 研究中发现了表达盒之间的串扰可能影响异源表达 | 开发独立可控的多基因共表达系统 | 大肠杆菌表达系统 | 合成生物学 | NA | 分子克隆 | NA | NA | NA | Golden Standard Molecular Cloning | Escherichia coli | 多基因表达系统,包含RhaS/RhaBAD、LacI/Trc、AraC/AraBAD和XylS/Pm四种表达盒 | 工业生物技术 |
| 1505 | 2025-10-05 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Feb-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
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研究论文 | 本研究构建了一个合成可调启动子库,用于在哺乳动物细胞中实现多基因表达的灵活调控 | 开发了同时包含通用激活位点和特异性激活位点的合成启动子设计,通过CRISPRa系统实现多层级基因表达控制 | NA | 构建合成可调启动子库以实现哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 哺乳动物细胞中的多基因表达系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统, 大规模平行报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 24,960个非冗余启动子 | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 合成启动子设计,包含通用激活位点和特异性激活位点,实现多层级基因表达控制 | 医学, 生物技术 |
| 1506 | 2025-10-05 |
Effectors of the Future: Universal Chimeric Antigen Receptor
2025-Feb, Transfusion medicine and hemotherapy : offizielles Organ der Deutschen Gesellschaft fur Transfusionsmedizin und Immunhamatologie
IF:1.9Q4
DOI:10.1159/000539609
PMID:39944409
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综述 | 阐述通用适配器嵌合抗原受体技术如何解决肿瘤抗原异质性和免疫逃逸问题 | 提出抗原识别与信号传导解耦的通用CAR技术,可结合现货抗体实现多靶向免疫治疗 | NA | 开发新一代免疫效应细胞疗法以克服当前肿瘤治疗挑战 | 通用嵌合抗原受体技术及其在肿瘤免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | B系恶性肿瘤 | 基因组编辑、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 免疫效应细胞 | 通用适配器CAR系统(抗原识别与信号传导分离设计) | 医学 |
| 1507 | 2025-10-05 |
Elucidation of the key flavonol biosynthetic pathway in golden Camellia and its application in genetic modification of tomato fruit metabolism
2025-Feb, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae308
PMID:39944987
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研究论文 | 本研究阐明了金花茶中黄酮醇生物合成的关键途径,并通过基因工程成功改良了番茄果实代谢 | 首次发现黄酮醇是金花茶金色花瓣的主要色素成分,鉴定出CnFLS1为关键基因,并成功将该途径应用于番茄果实代谢工程 | NA | 解析金花茶金色花瓣色素生物合成机制并应用于作物改良 | 23种金花茶物种和转基因番茄 | 合成生物学 | NA | 转录组学、共表达网络分析、酶活性测定、瞬时表达 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | 23种金花茶物种 | 遗传转化 | 烟草, 番茄 | 黄酮醇生物合成途径 | 农业, 食品 |
| 1508 | 2025-10-05 |
Challenges in observing transcription-translation for bottom-up synthetic biology
2025, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2024.27
PMID:39944880
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综述 | 本文详细讨论了体外重构转录-翻译系统的挑战与方法,并展望了合成生物学的前景 | 系统评估PURE系统和细胞裂解液在重构转录-翻译过程中的应用,并提出解耦这两个系统的解决方案 | NA | 实现合成细胞的构建,深入理解细胞系统的重构与功能追踪 | 转录-翻译系统、PURE系统、细胞裂解液、GUVs(巨型单层囊泡) | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜技术、探针标记 | NA | NA | NA | PURE系统 | NA | 转录-翻译系统重构 | 医学, 工业生物技术 |
| 1509 | 2025-10-05 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科药用植物的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究进展,并探讨了组学技术在药物开发和农业生物技术中的应用潜力 | 将新兴的草药基因组学应用于罂粟科药用植物研究,整合多组学数据解析药用活性成分的生物合成途径 | NA | 通过组学技术揭示药用植物的遗传信息和调控网络,促进药用植物的定向育种和合成生物学应用 | 罂粟科药用植物,包括罂粟和白屈菜等含乳胶植物 | 生物信息学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 罂粟科植物 | 次生代谢物生物合成途径 | 医药, 农业生物技术 |
| 1510 | 2025-10-05 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
|
研究论文 | 介绍通过光遗传学调控细胞器功能的方法,重点关注线粒体-溶酶体接触的光学调控 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控,为细胞工程提供创新范式 | NA | 开发通过光遗传学动态调控细胞器功能的技术方法 | 真核细胞中的细胞器,特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 线粒体-溶酶体接触调控系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 1511 | 2025-10-05 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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研究论文 | 本研究通过定向内共生方法在酵母细胞内引入光合蓝细菌,构建能进行光合固碳的酵母/蓝细菌嵌合体 | 开发了定向内共生方法将光合固碳能力引入酵母,无需传统代谢工程和实验室进化 | NA | 将异养酵母转化为具有光合自养能力的生物 | 芽殖酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向内共生 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 蓝细菌 | 光合固碳和糖分泌系统 | 可持续生物技术, 工业生物技术 |
| 1512 | 2025-10-05 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 本研究证明在大肠杆菌中,基因的局部染色体背景效应可以超越经典顺式调控元件对转录的影响 | 发现低GC含量的侧翼合成序列能显著降低报告基因表达,且这种遗传背景效应独立于启动子等调控序列 | 未阐明染色体位置依赖性表达变异的根本原因 | 探究遗传背景对基因转录的影响机制 | 大肠杆菌中的报告基因表达 | 合成生物学 | NA | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学构建 | 大肠杆菌 | 报告基因构建体,包含不同GC含量的侧翼序列 | 工业生物技术 |
| 1513 | 2025-10-05 |
Enhancing rufomycin production by CRISPR/Cas9-based genome editing and promoter engineering in Streptomyces sp. MJM3502
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.01.002
PMID:39925944
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研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因组编辑和启动子工程增强链霉菌MJM3502中rufomycin的产量 | 首次建立该菌株的遗传操作平台,并利用CRISPR/Cas9技术在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子 | 对菌株基因组序列和生物合成途径的理解仍存在显著空白 | 提高rufomycin类抗结核先导化合物的产量 | 链霉菌MJM3502及其rufomycin生物合成基因簇 | 合成生物学 | 结核病 | CRISPR/Cas9基因组编辑,启动子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Streptomyces sp. MJM3502 | 在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子,在细胞色素P450酶编码基因上游插入启动子 | 医药 |
| 1514 | 2025-10-05 |
A versatile in situ cofactor enhancing system for meeting cellular demands for engineered metabolic pathways
2024-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105598
PMID:38159859
|
研究论文 | 开发了一种通过增加细胞糖磷酸盐水平来增强工程代谢途径中辅因子供应的通用方法 | 利用木糖还原酶/乳糖系统在不显著干扰细胞代谢的情况下提高多种辅因子的生物合成前体水平 | 葡萄糖脱氢酶系统的产量提升效果不如木糖还原酶系统 | 解决代谢工程细胞中辅因子不平衡问题,提高工程代谢途径的生产效率 | 大肠杆菌代谢工程细胞系统 | 合成生物学 | NA | 非靶向代谢组学分析,转录组学分析 | NA | 代谢组数据,转录组数据 | 三种不同的代谢工程细胞系统(脂肪醇生物合成、生物发光光生成和烷烃生物合成) | NA | 大肠杆菌 | 辅因子生物合成途径工程,代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 1515 | 2025-10-05 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 开发了一种在氢凝胶颗粒中测量XNA聚合酶保真度的无纯化方法 | 通过在氢凝胶包被的磁性颗粒基质内完成XNA转录和逆转录步骤,无需传统凝胶电泳纯化过程 | NA | 开发更高效的XNA聚合酶保真度测量方法 | 人工遗传聚合物(XNAs)和XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 氢凝胶颗粒技术,DNA扩增,克隆测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1516 | 2025-10-05 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
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综述 | 本章回顾了非编码RNA介导的细胞命运决策电路建模方法,从系统生物学延伸到合成生物学应用 | 整合数学建模与合成生物学方法揭示ncRNA介导的双稳态开关设计原理 | 主要基于理论框架和已有研究综述,缺乏原始实验数据验证 | 阐明ncRNA调控细胞命运决策的分子机制和设计原则 | 非编码RNA(miRNA、ceRNA)与转录因子构成的基因调控网络 | 系统生物学 | NA | 数学建模、合成生物学 | NA | 理论模型 | NA | NA | NA | 双稳态开关、正反馈回路、miRNA-mRNA互作调控网络 | 医学 |
| 1517 | 2025-10-05 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
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综述 | 本文探讨微生物组工程如何通过调控微生物群落来提升食品安全与质量 | 整合合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术来优化食品生产体系 | 需要进一步研究复杂食品系统中的微生物动力学并建立统一监管框架 | 探索微生物组工程在食品安全与质量提升中的应用潜力 | 食品生产系统中的微生物群落 | NA | NA | 合成生物学, 人工智能, 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业 |
| 1518 | 2025-10-05 |
Development of robust constitutive synthetic promoter using genetic resources of plant pararetroviruses
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1515921
PMID:39911660
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研究论文 | 本研究利用植物副逆转录病毒遗传资源开发了一种高效的三元合成启动子MFH17,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 首次将三种副逆转录病毒来源的启动子元件(MMV、FMV、HRLV)通过理性设计和DNA改组技术组合成新型三元杂交启动子MFH17 | NA | 开发适用于高水平基因表达的高效合成启动子,丰富植物组成型启动子库 | 植物副逆转录病毒启动子元件及其合成变体 | 合成生物学 | NA | DNA改组技术、转基因技术 | NA | 基因表达数据 | 转基因拟南芥和烟草植物 | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 拟南芥, 烟草 | 组成型启动子设计,包含as-1元件的合成启动子 | 农业, 工业生物技术 |
| 1519 | 2025-10-05 |
Closing the loop: establishing an autonomous test-learn cycle to optimize induction of bacterial systems using a robotic platform
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1528224
PMID:39911814
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研究论文 | 开发了一个软件框架,使机器人平台能够自主调整测试参数,实现完全自动化的设计-构建-测试-学习循环 | 将静态机器人平台转变为动态平台,实现无需人工干预的自主测试-学习循环 | 仅使用绿色荧光蛋白作为目标产物进行评估,未涉及更复杂的生物系统 | 建立完全自动化的设计-构建-测试-学习循环来优化细菌系统的诱导条件 | 细菌系统中的诱导浓度优化和诱导剂与饲料释放的组合优化 | 合成生物学 | NA | 机器人平台自动化技术 | 探索与利用平衡的优化算法 | 测量数据 | NA | 机器人平台 | 细菌 | 诱导表达系统 | 工业生物技术 |
| 1520 | 2025-10-05 |
Public attitudes to genetic technology for invasive pest control and preferences for engagement and information: a segmentation analysis
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1388512
PMID:39911817
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研究论文 | 通过调查分析公众对基因技术用于入侵害虫控制的态度、参与偏好和信息需求 | 首次将公众对基因技术的态度分为四个细分群体,并针对不同群体提出差异化的公众参与策略 | 样本仅来自澳大利亚,可能无法代表其他国家的公众态度 | 了解公众对基因技术用于入侵害虫控制的认知和态度,探索公众参与路径和信息需求 | 1149名澳大利亚公众 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | 调查问卷数据 | 1149名澳大利亚受访者 | NA | NA | NA | 环境 |