合成生物学相关文章
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当前共找到 3019 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2024-08-07 |
Microbial Nanotechnology for Precision Nanobiosynthesis: Innovations, Current Opportunities and Future Perspectives for Industrial Sustainability
2024-Jul-01, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-03772-z
PMID:38954017
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综述 | 本文综述了微生物纳米技术在精准纳米生物合成中的应用，重点讨论了微生物合成的纳米颗粒及其在农业和植物科学中的应用 | 本文介绍了利用微生物进行纳米颗粒的绿色生产方法，并探讨了其在多个前沿技术领域的潜力 | NA | 探讨微生物纳米技术在工业可持续发展中的创新、当前机遇和未来展望 | 微生物合成的纳米颗粒及其在农业和植物科学中的应用 | 生物技术 | NA | 微生物纳米技术 | NA | NA | NA |
| 1562 | 2024-08-07 |
Unlocking the formate utilization of wild-type Yarrowia lipolytica through adaptive laboratory evolution
2024-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400290
PMID:38900053
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研究论文 | 本研究通过使用碱基编辑工具促进适应性进化，成功提高了Yarrowia lipolytica对甲酸盐的耐受性和利用能力 | 本研究揭示了Yarrowia lipolytica中自然存在的甲酸盐代谢途径，并展示了其通过适应性进化增强甲酸盐利用的潜力 | NA | 探索和优化Yarrowia lipolytica对甲酸盐的利用，以促进全球净负碳经济的发展 | Yarrowia lipolytica的甲酸盐耐受性和利用能力 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 转录组数据 | 两个突变株M25-70和M25-14 |
| 1563 | 2024-08-07 |
Drug Resistance and the Prevention Strategies in Food Borne Bacteria: An Update Review
2019-Aug, Advanced pharmaceutical bulletin
IF:3.1Q2
DOI:10.15171/apb.2019.041
PMID:31592430
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综述 | 本文综述了食品源性细菌的抗药性及其预防策略 | 探讨了多种替代传统抗生素的方法，如使用农业实践、天然抗生素、纳米抗生素、乳酸菌、细菌素、环肽、噬菌体、合成生物学和捕食性细菌 | NA | 探讨和更新食品源性细菌抗药性的预防策略 | 食品源性细菌的抗药性问题 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1564 | 2024-08-07 |
Specifications of Standards in Systems and Synthetic Biology: Status and Developments in 2019
2019-Jul-13, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2019-0035
PMID:31301675
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review | 本文概述了COMBINE标准及其最新规范，涵盖了合成生物学和系统生物学中的计算模型表示格式 | 更新了SBGN、SBML、SBOL及其视觉版本的最新规范 | NA | 介绍合成生物学和系统生物学中标准规范的最新进展 | COMBINE标准及其在合成生物学和系统生物学中的应用 | systems biology | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1565 | 2024-08-07 |
PARAGEN 1.0: A Standardized Synthetic Gene Library for Fast Cell-Free Bacteriocin Synthesis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00213
PMID:31552239
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研究论文 | 本文介绍了PARAGEN 1.0，一个标准化的合成基因库，用于快速的无细胞 bacteriocin 合成 | PARAGEN 1.0是首个物理集合的bacteriocin库，允许对不同应用进行测试和比较 | NA | 开发一个用于快速无细胞bacteriocin合成的标准化合成基因库 | bacteriocin的合成及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成技术 | NA | 基因序列 | 164种不同的bacteriocin |
| 1566 | 2024-08-07 |
Design and Characterization of a Generalist Biosensor for Indole Derivatives
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00736
PMID:38875315
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研究论文 | 本文设计并表征了一种基于IclR家族抑制因子TtgV的吲哚衍生物生物传感器 | 发现了TtgV的新型生理相关配体，如粪臭素，并展示了其广泛的特异性，为定向进化和蛋白质工程提供了新的目标 | NA | 优化生物传感器的设计并扩展对TtgV的研究 | 基于TtgV的吲哚衍生物生物传感器及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1567 | 2024-08-07 |
Graded-CRISPRi, a Tool for Tuning the Strengths of CRISPRi-Mediated Knockdowns in Vibrio natriegens Using gRNA Libraries
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00056
PMID:38916455
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研究论文 | 本文介绍了一种名为graded-CRISPRi的工具，用于在Vibrio natriegens中通过gRNA库调节CRISPRi介导的敲降强度 | 开发了一种新的graded-CRISPRi系统，利用gRNA变体实现不同程度的抑制强度 | NA | 开发一种有效的工具，逐步降低原生基因的表达水平 | Vibrio natriegens中的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | 基因序列 | 涉及四个不同的报告基因 |
| 1568 | 2024-08-07 |
Engineering cyanobacteria as a new platform for producing taxol precursors directly from carbon dioxide
2024-Jul-16, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02555-9
PMID:39014505
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研究论文 | 本文通过工程化改造蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803，构建了模块化代谢途径，实现了从二氧化碳直接生产紫杉醇前体taxadiene-5α-ol | 首次在蓝细菌中通过光合作用生产taxadiene-5α-ol，展示了工程化蓝细菌作为生物太阳能电池工厂生产有价值萜类化合物的广阔前景 | NA | 开发一种新的平台，利用工程化蓝细菌直接从二氧化碳生产紫杉醇前体 | 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803及其代谢途径 | 合成生物学 | 多种恶性肿瘤 | 代谢工程 | NA | 转录组数据 | 最佳菌株DIGT-P560生产了高达17.43 mg/L的氧化紫杉烷和4.32 mg/L的T5α-ol |
| 1569 | 2024-08-07 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法研究生物能量应激对抗生素疗效的直接影响 | 首次探讨了生物能量应激如何通过增强ROS产生、突变断裂修复和转录偶联修复来促进抗微生物耐药性的发展，并提出了一个统一模型解释抗生素诱导的抗微生物耐药性和持久性 | NA | 更好地理解抗微生物耐药性机制 | 生物能量应激对抗生素疗效的影响 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1570 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-Based Bioanalysis
2024-Jul, Annual review of analytical chemistry (Palo Alto, Calif.)
|
综述 | 本文综述了基于噬菌体的生物传感器的发展及其在噬菌体生物学和工程领域的最新进展 | 介绍了噬菌体生物传感器在合成生物学、机器学习和遗传工程等邻近领域的应用，以及采用自下而上的设计合成定制噬菌体的新方法 | NA | 探讨噬菌体生物传感器的发展及其在生物传感领域的应用潜力 | 噬菌体生物传感器及其在生物传感领域的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1571 | 2024-08-07 |
Engineering Native Biological Complexity from the Inside-out and Outside-in
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00013-1
PMID:39015819
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研究论文 | 本文探讨了在组织发育和再生中，通过'由外而内'和'由内而外'信号的平衡来控制细胞功能和命运的工程化方法 | 强调了新兴策略，如生物材料设计和合成生物学，以影响这一微妙的平衡并微调细胞反应 | NA | 研究如何通过工程化方法控制细胞功能和命运 | 细胞功能和命运的控制 | 合成生物学 | NA | 生物材料设计，合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1572 | 2024-08-07 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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研究论文 | 本研究利用激活域预测工具PADDLE，对两种模式真核生物的整个蛋白质组进行挖掘，系统识别非转录因子蛋白中的转录激活域 | 首次大规模识别非转录因子蛋白中的转录激活域，并验证其在酵母中的转录激活能力 | NA | 探索非转录因子蛋白中的转录激活域及其在转录调控中的作用 | 植物和酵母中的非转录因子蛋白 | 生物信息学 | NA | PADDLE激活域预测工具 | NA | 蛋白质序列 | 18,000个片段，覆盖>800个非转录因子基因 |
| 1573 | 2024-08-07 |
Engineered calprotectin-sensing probiotics for IBD surveillance in humans
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221121120
PMID:37523538
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研究论文 | 本文介绍了一种能够检测炎症性肠病（IBD）生物标志物——钙卫蛋白的工程化益生菌 | 利用合成生物学技术，开发了一种能够在IBD患者中特异性检测钙卫蛋白的工程化益生菌 | 目前仅在啮齿动物模型和患者粪便样本中进行了测试，需要进一步的人体临床试验验证 | 开发一种非侵入性的方法来监测IBD患者的疾病活动 | 工程化益生菌在IBD患者中的应用 | 生物技术 | 炎症性肠病 | 合成生物学 | NA | 粪便样本 | 啮齿动物模型和人类患者粪便样本 |
| 1574 | 2024-08-07 |
De novo design of bioactive protein switches
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1432-8
PMID:31341284
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研究论文 | 本文探讨了从头设计可切换蛋白质系统的可能性，通过调节分子间和分子内相互作用来实现 | 本文设计了一种静态的五螺旋'笼'结构，具有单一界面，可以与终端'闩锁'螺旋或肽'钥匙'进行分子内或分子间相互作用，实现了功能性蛋白质开关的设计 | NA | 探索从头设计可切换蛋白质系统的可能性，并开发新的合成生物学和细胞工程方法 | 蛋白质功能的全局调控 | 生物工程 | NA | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质结构 | NA |
| 1575 | 2024-08-07 |
Design Principles for Perfect Adaptation in Biological Networks with Nonlinear Dynamics
2024-Jul-03, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-024-01318-9
PMID:38958824
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研究论文 | 本文提出了一种基于非线性系统理论的框架，用于识别针对任意幅度外部扰动的完美适应的设计原则 | 本文通过非线性系统理论推导出完美适应的数学条件，并将其转化为网络结构的具体必要要求，提出了两种能够提供全局适应性的网络架构 | 本文的方法不假设任何关于底层速率动力学的明确知识，仅有一些最小的假设 | 建立生物网络结构与涌现生物特性之间的映射关系 | 生物网络中的完美适应性 | 系统生物学 | NA | 非线性系统理论 | NA | NA | NA |
| 1576 | 2024-08-07 |
Light-Oxygen-Voltage (LOV)-sensing Domains: Activation Mechanism and Optogenetic Stimulation
2024-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.168356
PMID:37944792
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研究论文 | 本文探讨了光氧电压（LOV）传感域的激活机制及其在光遗传学刺激中的应用 | LOV域作为多功能的光感受器，能够非侵入性地感知和控制细胞内过程，具有高时空精度，适用于光遗传学领域 | NA | 研究LOV域的激活机制及其在光遗传学中的应用，推动生物系统研究和新型治疗策略的发展 | LOV域及其在光遗传学中的应用 | 生物技术 | NA | 结构生物学、光谱学、计算方法和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1577 | 2024-08-07 |
Fungal-bacterial consortia: A promising strategy for the removal of petroleum hydrocarbons
2024-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116543
PMID:38833981
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综述 | 本文综述了利用真菌-细菌共生体系去除石油烃污染的研究进展 | 介绍了真菌和细菌混合微生物群落通过多种协同机制降解复杂烃类污染物的新策略 | 存在微生物竞争等拮抗作用以及抑制剂或毒素的产生，且需要优化环境因素以提高共生体系性能 | 探讨利用真菌-细菌共生体系进行生物修复的方法和挑战 | 石油烃污染物 | NA | NA | 合成生物学和基因编辑工具 | NA | NA | NA |
| 1578 | 2024-08-07 |
Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices
2024-Jul-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104
PMID:38920331
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研究论文 | 研究利用DNA折纸技术构建纳米装置，实现特定器官的基因表达控制 | 开发了坚韧的DNA折纸结构，并将其封装在脂质纳米颗粒(LNPs)中，以在恶劣条件下(低pH)实现器官特异性基因递送 | 目前仍面临DNA纳米结构的脆弱性和低靶向能力的挑战 | 探索利用DNA折纸纳米装置进行特定器官基因表达控制的可能性 | DNA折纸纳米装置及其在特定器官中的基因递送效果 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术，脂质纳米颗粒(LNPs)，低温电子显微镜(Cryo-EM) | NA | 基因(mRNA和siRNA) | 小鼠器官 |
| 1579 | 2024-08-07 |
Engineering Microorganisms for Cancer Immunotherapy
2024-Jul, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202304649
PMID:38598792
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综述 | 本文综述了利用工程化微生物进行癌症免疫治疗的方法，包括通过合成生物学和遗传工程技术设计改造细菌和病毒，以靶向癌细胞并调节免疫系统 | 工程化微生物作为一种新兴的癌症免疫治疗策略，具有提供个性化创新治疗方案的巨大潜力 | NA | 探讨基于微生物的癌症免疫治疗方法，同时考虑安全性和伦理问题 | 工程化微生物在癌症免疫治疗中的应用 | NA | 癌症 | 合成生物学和遗传工程技术 | NA | NA | NA |
| 1580 | 2024-08-07 |
Systematic engineering for production of anti-aging sunscreen compound in Pseudomonas putida
2024-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.06.001
PMID:38839037
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研究论文 | 本研究旨在通过系统工程方法提高Pseudomonas putida生产具有抗衰老特性的防晒化合物shinorine的效率 | 本研究结合了代谢通量分析的元分析、基因组规模代谢模型、合成生物学、CRISPRi介导的基因下调和组学分析，以提高shinorine的生产效率 | NA | 建立一个高效的微生物平台，用于生产具有抗衰老特性的UV光吸收化合物shinorine | shinorine的生产效率和其生物合成途径的优化 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 组学分析 | 基因组规模代谢模型 | 代谢通量分布数据, 蛋白质组数据 | NA |