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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1601 | 2024-08-07 |
Prediction and large-scale analysis of primary operons in plastids reveals unique genetic features in the evolution of chloroplasts
2019-04-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz151
PMID:30828719
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研究论文 | 本文通过结合实验工具和预测模型,创建了一个针对叶绿体的操纵子数据库,并进行了大规模分析,揭示了叶绿体进化中的独特遗传特征 | 本文首次大规模分析了叶绿体中的操纵子,并利用随机森林分类器进行操纵子预测,准确率高达84% | NA | 研究叶绿体操纵子的基本特征,并利用这些特征进行操纵子预测,以促进叶绿体中的代谢工程和合成生物学 | 叶绿体中的操纵子 | 生物信息学 | NA | 逆转录聚合酶链反应(Reverse-Transcription-PCR) | 随机森林分类器 | 基因序列 | 213个基因对,来自四个进化上不同的叶绿体 |
1602 | 2024-08-07 |
Rational design of inducible CRISPR guide RNAs for de novo assembly of transcriptional programs
2017-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14633
PMID:28256578
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研究论文 | 本文报道了一种模块化和多功能框架,用于在哺乳动物细胞中快速实现可诱导的CRISPR-TRs | 该策略依赖于在单引导RNA(sgRNA)的5'端设计间隔区阻断发夹(SBH)结构,通过替换SBH环与配体控制的RNA切割单元,实现了对静默sgRNA的条件激活 | NA | 开发一种新的方法,用于在哺乳动物细胞中快速实现可诱导的CRISPR-TRs,以促进对天然基因回路的理解和细胞治疗策略的设计 | CRISPR-TRs在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | RNA | NA |
1603 | 2024-08-07 |
Synthetic biology approaches to fluorinated polyketides
2015-03-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/ar500415c
PMID:25719427
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法开发新的氟化学,以扩大生物合成可及的有机氟化物多样性 | 利用合成生物学方法,通过工程化生物合成机制将氟化构建块选择性引入复杂天然产物中,以扩展生物合成有机氟化物的多样性 | 生物系统中氟化学的范围有限,已识别的有机氟天然产物不到20种 | 开发新的氟化学方法,以扩展生物合成有机氟化物的多样性 | 研究酶活性位点和代谢途径如何进化以管理和选择氟化化合物,并设计工程化的有机氟酶、途径和宿主 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | 研究了土壤微生物Streptomyces cattleya,一种已知的有机氟生物合成天然宿主 |
1604 | 2024-08-07 |
Expanding the fluorine chemistry of living systems using engineered polyketide synthase pathways
2013-09-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1242345
PMID:24009388
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研究论文 | 本文展示了通过工程化的聚酮合成酶途径,利用氟乙酸作为氟化构建块,将氟引入天然产物骨架的方法 | 首次展示了通过工程化的聚酮合成酶途径,在体外和体内将氟选择性地引入聚酮骨架 | NA | 探索利用合成生物学生产复杂氟化天然产品的可能性 | 氟化天然产物 | NA | NA | 聚酮合成酶系统 | NA | NA | NA |
1605 | 2024-08-07 |
Synthetic biology. Fluorine-adding bacteria may transform natural product medicines
2013-Sep-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.341.6150.1052-a
PMID:24009367
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1606 | 2024-08-07 |
Racial/Ethnic Disparities and Immunotherapeutic Advances in the Treatment of Hepatocellular Carcinoma
2024-Jul-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16132446
PMID:39001508
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综述 | 本文综述了肝细胞癌(HCC)的治疗现状,特别是种族/民族差异及其对治疗结果的影响,并探讨了基于基因工程和分子合成生物学的新兴治疗策略。 | 介绍了基于基因工程和分子合成生物学的新兴治疗策略,这些策略显示出潜在的治疗效果。 | NA | 总结过去治疗策略,探讨当前治疗方式的形成,并展望未来可能更有效的HCC治疗策略。 | 肝细胞癌及其在不同种族/民族群体中的治疗差异。 | NA | 肝细胞癌 | 基因工程,分子和合成生物学 | NA | NA | NA |
1607 | 2024-08-07 |
Editorial: Advanced microfluidics for synthetic biology and/or biomedical applications
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1440206
PMID:39007054
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1608 | 2024-08-07 |
Direct sequencing of 2'-deoxy-2'-fluoroarabinonucleic acid (FANA) using nanopore-induced phase-shift sequencing (NIPSS)
2019-03-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c8sc05228j
PMID:30996894
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研究论文 | 本文首次展示了使用纳米孔诱导相移测序(NIPSS)直接测序2'-脱氧-2'-氟阿拉伯核酸(FANA)的方法 | 首次实现了糖修饰XNA的直接测序,并发现phi29 DNA聚合酶具有先前未知的FANA逆转录酶活性 | NA | 探索和验证FANA的直接测序方法 | 2'-脱氧-2'-氟阿拉伯核酸(FANA)及其测序技术 | 分子医学 | NA | 纳米孔诱导相移测序(NIPSS) | NA | NA | 不同FANA同聚物 |
1609 | 2024-08-07 |
Towards control of cellular decision-making networks in the epithelial-to-mesenchymal transition
2019-03-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aaffa1
PMID:30654341
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综述 | 本文从实验/技术与理论两个角度综述了上皮-间质转化(EMT)的调控网络,并探讨了其在胚胎发育、伤口愈合和转移中的生理背景 | 介绍了新兴的合成生物技术以监测和控制细胞状态,并提出了如何驱动网络动态向所需动态吸引子(如上皮细胞状态)的理论 | NA | 旨在将关于EMT调控网络的理解转化为控制表型结果的方法,特别是在癌症治疗策略的背景下 | EMT的调控网络及其在不同生理环境中的作用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
1610 | 2024-08-07 |
Challenges and opportunities for natural product discovery, production, and engineering in native producers versus heterologous hosts
2019-Mar, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10295-018-2094-5
PMID:30426283
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研究论文 | 本文探讨了天然产物发现、生产和工程化在原生生产者和异源宿主中的挑战与机遇 | 利用自然进化的力量,发现具有所需遗传适应性和更高目标天然产物产量的替代生产者,以及携带编码目标天然产物骨架进化优化同类物的基因簇的新菌株 | 在理解生物合成基因簇的沉默或激活方面仍存在许多挑战,包括关键生物合成和调节基因转录的变化 | 通过利用自然进化的力量,开发新的研究策略,填补知识空白 | 天然产物的发现、生产和工程化 | 合成生物学 | NA | 代谢途径工程 | NA | 基因簇 | NA |
1611 | 2024-08-07 |
Synthetic Mutualism and the Intervention Dilemma
2019-Jan-28, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life9010015
PMID:30696090
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review | 本文综述了合成生物学在构建合成互利共生系统中的应用及其对生态系统的影响 | 探讨了合成生物学在改变特定互利共生关系中的潜力,并评估了其伦理和法律影响 | 文章主要基于理论模型和实验系统的结合,实际应用中的效果和影响可能存在不确定性 | 旨在理解合成生物学在生态系统中的应用及其对复杂关系的预测 | 合成互利共生系统和生态系统 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1612 | 2024-08-07 |
Moulding the mould: understanding and reprogramming filamentous fungal growth and morphogenesis for next generation cell factories
2019, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-019-1400-4
PMID:30988699
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综述 | 本文综述了丝状真菌生长和形态发生与产品产量的多方面动态关系,并探讨了通过合成生物学工具进行理性菌株优化的策略 | 介绍了基于omics数据解锁关键基因以进行理性菌株优化的可能策略,并讨论了如何通过靶向遗传操作优化真菌形态以提高性能 | NA | 探讨丝状真菌生长和形态发生与产品产量的关系,以及如何通过合成生物学工具进行理性菌株优化 | 丝状真菌及其在工业应用中的生长和形态发生 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | omics数据 | NA |
1613 | 2024-08-07 |
Genome-Editing Technologies: Principles and Applications
2016-Dec-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a023754
PMID:27908936
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综述 | 本文综述了三种基础的基因编辑技术:CRISPR-Cas9、TALENs和ZFNs,并讨论了这些技术的工程进展及其在基因工程中的应用 | 介绍了这些技术在基因治疗和合成生物学中的新应用 | NA | 回顾基因编辑技术的发展及其在人类疾病研究和基因治疗中的应用 | 基因编辑技术及其在生物学和医学中的应用 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas9, TALENs, ZFNs | NA | NA | NA |
1614 | 2024-08-07 |
Reversible Control of Gene Expression by Guest-Modified Adenosines in a Cell-Free System via Host-Guest Interaction
2024-Jul-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c04262
PMID:38941287
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研究论文 | 本研究展示了通过葫芦[7]脲(CB[7])与客体修饰的腺苷之间的宿主-客体相互作用,实现了无细胞基因表达(CFE)系统的可逆控制 | 首次利用宿主-客体相互作用在CFE系统中控制基因表达,为基于DNA的技术开发开辟了新途径 | NA | 探索无细胞基因表达系统的可逆和可编程控制,以扩展其在合成生物学和医学中的应用 | 无细胞基因表达系统中的基因表达控制 | 生物技术 | NA | 宿主-客体相互作用 | NA | DNA | NA |
1615 | 2024-08-07 |
Morphological Engineering of Filamentous Fungi: Research Progress and Perspectives
2024-Jun-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02007
PMID:38693049
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综述 | 本文综述了丝状真菌形态工程的研究进展和前景 | 介绍了真菌形态发生的机制以及当前形态调控方法和策略的发展,包括物理化学和代谢工程方法 | NA | 探讨丝状真菌形态工程的未来发展 | 丝状真菌的形态调控 | 生物工程 | NA | 合成生物学和遗传操作工具 | NA | NA | NA |
1616 | 2024-08-07 |
A library of reporters of the global regulators of gene expression in Escherichia coli
2024-Jun-18, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00065-24
PMID:38687030
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research paper | 本文开发了一个包含16种全局调节因子(GR)的荧光报告基因库,用于追踪大肠杆菌中基因表达的全局调节因子的生产速率 | 该报告基因库由单拷贝质粒组成,编码与天然启动子全长的绿色荧光蛋白(GFP)融合,能够高灵敏度和特异性地检测各种应激条件下的转录活性,并揭示单细胞转录速率的变异性 | NA | 旨在开发一种工具,用于追踪和分析大肠杆菌中全局调节因子的活性,以深入理解其对转录因子网络(TFN)的影响 | 大肠杆菌中的全局调节因子(GR)及其在不同生长阶段和应激条件下的活性 | molecular biology | NA | 荧光报告基因技术 | NA | 荧光信号 | 16种全局调节因子的报告基因库 |
1617 | 2024-08-07 |
Glycan-decorated protocells: novel features for rebuilding cellular processes
2019-Apr-06, Interface focus
IF:3.6Q1
DOI:10.1098/rsfs.2018.0084
PMID:30842879
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综述 | 本文综述了在合成生物学中,如何利用脂质囊泡作为原细胞模型,特别是通过整合糖萼成分到脂质双层中,来研究细胞过程的新特性 | 本文首次介绍了将糖缀合物整合到巨型单层脂质囊泡(GUVs)的膜中,并探讨了这些最小膜系统在揭示细胞过程分子机制中的作用 | NA | 探讨糖基修饰的原细胞在研究细胞间相互作用(如粘附和通信)中的应用潜力 | 脂质囊泡、糖萼成分、糖脂质介导的内吞作用、原组织 | 合成生物学 | NA | 脂质囊泡制备、生物物理特性表征 | NA | NA | NA |
1618 | 2024-08-07 |
Comparative proteomic analysis of four biotechnological strains Lactococcus lactis through label-free quantitative proteomics
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13305
PMID:30341804
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研究论文 | 本研究通过无标记定量蛋白质组学分析了四种生物技术菌株Lactococcus lactis的核心蛋白质组 | 本研究首次通过无标记定量蛋白质组学技术,详细分析了四种Lactococcus lactis菌株的核心蛋白质组,并发现了与翻译过程相关的高丰度蛋白质以及特定亚种独有的保守蛋白质 | NA | 旨在深入理解Lactococcus lactis的细胞功能及其在合成生物学中的应用 | 四种生物技术菌株Lactococcus lactis的核心蛋白质组 | 生物技术 | NA | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 四种Lactococcus lactis菌株,包括L. lactis subsp. lactis NCDO2118, L. lactis subsp. lactis IL1403, L. lactis subsp. cremoris NZ9000和L. lactis subsp. cremoris MG1363 |
1619 | 2024-08-07 |
Engineering and modification of microbial chassis for systems and synthetic biology
2019-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2018.12.001
PMID:30560208
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综述 | 本文综述了微生物底盘的工程化与改造,及其在系统生物学和合成生物学中的应用 | 介绍了通过基因组缩减和基因组合成的两种主要策略来构建微生物底盘,并举例说明了相关项目的成果 | NA | 探讨微生物底盘的工程化与改造,以揭示生命基本原理并增强其在多个工业领域的应用 | 微生物底盘及其在健康、医药、农业、兽医和食品行业的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组缩减,基因组合成 | NA | NA | NA |
1620 | 2024-08-07 |
Twenty-first-century chemical odyssey: fuels versus commodities and cell factories versus chemical plants
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13379
PMID:30793487
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学开发新型生物合成途径,以替代传统工业方法合成化学品的潜力 | 提出了一种利用非食用木质纤维素作为可持续有机碳源的新型能源生物过程 | 目前基于淀粉或木质纤维素的工业过程数量仍然很少,需要更有效的植物材料分解方法和新的有用基因的识别 | 研究如何通过合成生物学实现工业向可再生能源的转变 | 非食用木质纤维素和合成生物学在化学品生物合成中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |