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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1601 | 2026-05-28 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
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综述 | 系统总结了利用微生物细胞工厂生产L-酪氨酸及其衍生物的工程策略 | 聚焦酪醇、对香豆酸和左旋多巴三大关键节点,综述近五年在酶、代谢和细胞水平上的前沿工程策略 | 未深入探讨工业放大中的工艺瓶颈和成本问题 | 为加速L-酪氨酸衍生物的绿色生物制造提供战略路线图 | L-酪氨酸及其衍生物(酪醇、对香豆酸、左旋多巴) | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母 | 代谢通路 | 食品, 医药, 化工 |
| 1602 | 2026-05-28 |
Bioethics-in-Science : An Invitation
2026-May-27, Journal of bioethical inquiry
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11673-025-10533-5
PMID:42201630
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研究论文 | 提出“科学中的生物伦理学”概念,探讨将生物伦理探究直接融入科学实践的方法论途径 | 重新定义伦理与科学关系,将科学实践视为内在地承载价值,并开发具体方法(如伦理笔记本、协作研讨会、概念映射)实现持续伦理反思而非外部评估 | 跨学科边界挑战与操作实践中的困难分析 | 为生物伦理探究提供超越科学边缘位置、积极参与知识生产规范维度的新路径 | 合成生物学、神经多样性研究、蛋白质组学案例 | 生物伦理学 | NA | NA | NA | 案例研究 | 三个案例(合成生物学、神经多样性、蛋白质组学) | NA | NA | NA | NA |
| 1603 | 2026-05-28 |
Synthetic biology-driven bioinspired delivery systems for RNA therapeutics in neural repair
2026-May-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-01801
PMID:42199149
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综述 | 综述基于合成生物学的仿生递送系统在RNA神经修复治疗中的应用 | 提出了将RNA递送转化为可编程生物机器的系统工程框架,融入设计-构建-测试-学习循环和人工智能辅助工具 | 未详细说明具体实验验证结果和定量比较分析 | 探讨合成生物学在神经修复中RNA治疗递送系统的前沿应用与挑战 | 基于合成生物学的仿生递送系统、RNA疗法、神经修复 | 机器学习 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 生物电路、递送系统、可编程生物机器 | 医学 |
| 1604 | 2026-05-28 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
|
综述 | 系统综述了生物分子凝聚体液-固转变的分子机制、工程调控策略及其在合成生物学中的应用 | 首次将液-固转变作为设计原则整合到系统化学和合成生物学中 | 当前对液-固转变的时空控制仍面临挑战,需进一步探索其在实际生物系统中的可靠性 | 阐明液-固转变的分子语法及工程策略,推动其在合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体的液-固转变过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 液-固转变调控回路 | 医学,系统化学,合成生物学 |
| 1605 | 2026-05-28 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
|
研究论文 | 本文展示了一个双蛋白系统McdAB可被重新编程以实现对细菌多种细胞器的空间控制 | 首次证明McdAB系统可以重新编程以控制所有已知类型的细菌细胞器(包括类囊体、包囊体、生物分子凝聚体和膜结合细胞器)的空间组织,为合成生物学建立了新的设计原理 | 未明确说明局限性 | 研究细菌细胞器的空间组织是否可以被工程化控制 | McdAB双蛋白系统和细菌细胞器(羧酶体、包囊体、生物分子凝聚体、膜结合细胞器) | 合成生物学 | NA | 异源表达、蛋白重新编程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | McdAB系统用于细胞器空间定位调控 | 工业生物技术 |
| 1606 | 2026-05-28 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
|
研究论文 | 提出了一种基于自发光真菌生物发光循环的定量报告系统,用于植物合成生物学中的基因表达测量 | 首次利用Neonothopanus nambi真菌全生物发光循环构建自维持报告系统,无需外源供应荧光素酶底物,并通过设置HispS基因作为转录入口点显著提高动态范围 | 未明确说明,但可能包括植物中自发光系统的长期稳定性和组织特异性表达等潜在问题 | 开发低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统,以优化合成基因回路 | 本氏烟草(N. benthamiana)和拟南芥(推测) | 植物合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 发光和荧光数据 | 涉及多种合成基因回路,包括植物激素传感器和光遗传传感器等,具体样本数量未明确 | NA | 本氏烟草(N. benthamiana) | 自发光报告回路(NeoLuc/eGFP系统),包括激素传感器、光遗传传感器和化学/光双开关 | 农业、工业生物技术 |
| 1607 | 2026-05-28 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
|
研究论文 | 结合大规模测量和机器学习,提出了两种精确设计遗传传感器的方法:计算机模拟选择和机器学习前向工程 | 首次将计算机模拟选择与机器学习相结合,实现遗传传感器剂量响应的定量精确工程,包括多目标优化和反向剂量响应工程 | NA | 开发定量精确工程生物功能的方法,特别是遗传传感器的编程响应 | 遗传传感器及其DNA序列 | 机器学习 | NA | 大规模基因型-表型数据集分析 | 机器学习模型 | 序列数据 | 大规模基因型-表型数据集 | NA | NA | 遗传传感器(剂量响应电路) | 工业生物技术 |
| 1608 | 2026-05-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
|
综述 | 该文章概述了无细胞系统及其在合成生物学中的应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜屏障、实现高通量蛋白质合成、非规范氨基酸掺入、生物传感、药物发现和代谢工程中的创新应用 | 未明确提及局限性 | 突出无细胞系统的基础及其在生物技术和工业中的快速、适应性解决方案 | 无细胞系统及其应用案例 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 1609 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
|
综述 | 全面概述基于无细胞系统的低成本诊断技术的原理、设计方法和突破 | 系统性地总结了无细胞诊断平台在资源贫乏环境中的应用,包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物和PURE系统,并融合合成生物学基因回路、CRISPR-Cas工具和RNA适体以提高诊断灵敏度和特异性 | 试剂稳定性、可扩展性和监管问题仍是主要挑战 | 阐明无细胞系统在低成本诊断中的潜力,推动即时诊断和全球健康改善 | 基于无细胞表达的诊断平台 | 数字病理学 | 未提及 | 无细胞表达,CRISPR-Cas,RNA适体 | 未提及 | 未提及 | 未提及 | CRISPR-Cas | 大肠杆菌,小麦,纯化系统 | 基因回路,生物传感器 | 医学 |
| 1610 | 2026-05-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
|
研究论文 | 提供无细胞蛋白合成系统的制备方案,包括细胞提取物制备、反应优化及蛋白质表征方法 | 详细阐述了从宿主菌选择、机械裂解到能量离子平衡优化的完整流程,并整合了常见瓶颈的解决方案,为无细胞系统在合成生物学和诊断领域的应用提供了可复现的标准化方法 | 未涉及大规模生产中的成本控制问题,且对复杂蛋白质(如膜蛋白)的合成效率优化讨论有限 | 建立高效制备无细胞蛋白合成系统的标准化协议,并展望其与机器学习结合的未来应用 | 无细胞蛋白合成系统(细胞提取物、反应体系优化及蛋白质功能分析) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 实验数据(蛋白质表达与功能分析) | NA | NA | 大肠杆菌 | 无细胞表达反应体系(代谢通路) | 合成生物学,诊断,生物制造,食品,医疗 |
| 1611 | 2026-05-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
|
综述 | 综述无细胞系统在合成生物学中的应用和进展 | 强调了无细胞系统在快速原型构建、与人工智能和微流控技术集成以及实现去中心化、可编程生物技术方面的范式转变 | 仍面临试剂成本高、批次差异大和可扩展性有限等挑战 | 系统阐述无细胞系统在合成生物学中的变革性作用及其未来发展方向 | 无细胞系统技术及其应用场景 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | 无细胞系统, PURE系统 | NA | 基因回路, 代谢途径, 生物传感器 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 1612 | 2026-05-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-02, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
|
研究论文 | 研究表明抑制琥珀终止密码子会减弱沙门氏菌的致病性 | 首次揭示终止密码子抑制对细菌致病性的影响具有选择性,仅琥珀密码子抑制影响沙门氏菌毒力 | 未详细阐明琥珀抑制如何调控HilD活性的具体分子机制 | 探究终止密码子抑制对细菌致病性的影响及其机制 | 沙门氏菌的毒力基因表达及巨噬细胞感染过程 | 微生物学 | 沙门氏菌感染 | NA | NA | NA | NA | NA | 沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 1613 | 2026-05-27 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
|
综述 | 探讨非编码RNA的结构预测及其在生物学和医学中的重要性 | 融合计算方法和实验技术,提升RNA结构预测准确度,并探讨多组学数据整合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模和RNA折叠动态特性理解仍存在挑战 | 提高非编码RNA结构预测能力,推动其在诊断和治疗中的应用 | 非编码RNA,包括microRNA、siRNA和长链非编码RNA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 药物发现, 生物标志物, 合成生物学 |
| 1614 | 2026-05-27 |
The effect of pseudoknot base pairing on cotranscriptional structural switching of the fluoride riboswitch
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae231
PMID:38567721
|
研究论文 | 本研究通过实验和模拟揭示假结碱基配对对氟化物核糖开关共转录结构转换的影响 | 首次系统阐明单一摆动碱基对在氟化物核糖开关功能中的关键作用,并利用全原子分子动力学模拟可视化结构转换过程 | 未具体说明其他离子或环境条件对核糖开关功能的影响,且仅限于两种温度变体 | 探究RNA序列变化如何影响共转录折叠过程中的动态构象变化 | 中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体 | 机器学习 | NA | 体外转录, 细胞基因表达分析, 全原子分子动力学模拟 | NA | DNA序列, RNA结构数据, 实验数据 | 多种中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体, 具体数量未提供 | NA | 大肠杆菌, 水生栖热菌 | 氟化物核糖开关(含假结适体域和下游终止子表达平台) | 医学, 工业生物技术 |
| 1615 | 2026-05-27 |
A pilot oral history of plant synthetic biology
2024-04-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad585
PMID:38163646
|
综述 | 通过采访8位植物合成生物学领域的创始人,回顾该领域的起源和早期发展 | 首次通过口述历史的方式记录植物合成生物学的起源和早期发展,为未来的历史研究提供原始资料 | 仅采访了8位创始人,可能无法全面覆盖领域内所有关键人物和事件;作为综述而非系统性分析,可能存在主观性 | 记录植物合成生物学的起源和早期发展历程 | 植物合成生物学领域的8位创始人(来自5个国家和3个大洲) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 访谈记录和事件时间线 | 8位创始人 | NA | NA | NA | 环境科学、能源、农业 |
| 1616 | 2026-05-27 |
Novel strategies for drug repurposing
2024, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2024.03.021
PMID:38789188
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评论 | 本文从合成生物学、精准医学和纳米生物技术角度,探讨了药物重定位在癌症精准医学中的新策略,并报告了一种优化的伤口愈合实验方法用于验证药物敏感性和重定位 | 提出了一个优化的伤口愈合实验方法,可用于验证药物敏感性和药物重定位,并以HeLa细胞为基准展示了该方法在限制细胞增殖药物筛选中的应用 | 该方法目前仅在HeLa细胞上验证,未来扩展至实体瘤二维培养和白血病三维培养仍需进一步研究 | 探讨药物重定位在癌症精准医学中的新策略,并提供一种实验方法用于药物筛选和验证 | 药物重定位策略、伤口愈合实验方法、HeLa细胞 | 精准医学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | HeLa细胞 | NA | 医学 |
| 1617 | 2026-05-26 |
Development of an efficient genome editing system using recombinase-mediated cassette exchange in E. coli Nissle 1917 for large gene cluster integration and heterologous astaxanthin production
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.020
PMID:42182969
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研究论文 | 通过优化电转和重组酶介导的盒式交换,在Nissle 1917中建立了高效基因编辑系统,用于大基因簇整合和异源虾青素生产 | 首次在EcN中系统优化电转条件和RMCE系统,实现了大片段(29 kb)基因簇的高效整合,并成功用于异源虾青素生产 | 未详细评估RMCE系统在长期培养中的稳定性及对宿主细胞生长的影响 | 建立高效的EcN基因编辑系统以促进异源天然产物合成 | 大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的盒式交换(RMCE)、电穿孔 | NA | DNA | NA | CRISPR-Cas9(未明确提及,但RMCE依赖重组酶) | 大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 虾青素生物合成操纵子 | 工业生物技术、医学 |
| 1618 | 2026-05-26 |
Combination of adaptive laboratory evolution and metabolic engineering on Vibrio natriegens for efficient production of 3-hydroxypropionic acid from ethanol
2026-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134757
PMID:42067166
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研究论文 | 通过适应性实验室进化和代谢工程改造Vibrio natriegens,实现从乙醇高效生产3-羟基丙酸 | 首次利用适应性实验室进化筛选出能利用乙醇的Vibrio natriegens菌株,并通过启动子优化、背景菌株理性设计和添加浅蓝菌素显著提升3-羟基丙酸产量 | 未提及乙醇利用效率低和耐受性差的具体机制,以及工业化规模放大的可行性 | 开发一种高效从乙醇生产3-羟基丙酸的Vibrio natriegens工程菌株 | Vibrio natriegens菌株及3-羟基丙酸生物合成途径 | NA | NA | 适应性实验室进化、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | 3-羟基丙酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1619 | 2026-05-26 |
RNA-based cancer immunotherapy: Harnessing the power of RNA nanoparticles for melanoma treatment
2026-Aug, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156512
PMID:42119359
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综述 | 本文综述了基于RNA的癌症免疫疗法在黑色素瘤治疗中的应用,重点介绍了RNA纳米颗粒的作用 | 总结了环状RNA、PIWI相互作用RNA和自扩增RNA等新型RNA在黑色素瘤免疫治疗中的机制,并探讨了RNA纳米颗粒在递送中的创新作用 | NA | 综合评估基于RNA的癌症免疫疗法在黑色素瘤治疗中的机制、临床前和临床证据,并突出RNA纳米颗粒的潜力 | 黑色素瘤和RNA纳米颗粒 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序、信使RNA疫苗、小干扰RNA、微小RNA、环状RNA、PIWI相互作用RNA、自扩增RNA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1620 | 2026-05-26 |
Functions and optimization of soft law in the international governance of synthetic biology: The predicament of hard law vs. the rise of soft law
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.005
PMID:42179736
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研究论文 | 探讨合成生物学国际治理中软法与硬法的功能分工与协作模式,指出软法在应对伦理风险方面的优势及与硬法协同的必要性 | 提出“软法引导、硬法固化、软法反馈”的混合治理模型,强调软法在技术适应性、共识构建和灵活性方面的不可替代作用 | 未具体讨论软法实施效果和定量评估指标,缺乏对各国实际采纳情况的实证分析 | 分析合成生物学国际治理中软法与硬法的现有困境,提出优化协作的治理框架 | 合成生物学领域的国际法律体系(BWC、CBD)及软法工具(伦理指南、政策建议、行为准则) | 政策与法律研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学国际治理 |