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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2025-10-06 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
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研究论文 | 开发了一种用于创建SBOL表示构建计划的软件工具,以模拟IIS型介导的组装反应并存储相关元数据 | 首次实现了使用SBOL标准化表示Golden Gate组装元数据的软件工具 | NA | 为合成生物学领域提供标准化的DNA组装元数据表示方法 | DNA组装构建计划 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA | Golden Gate Assembly, SBOL | NA | DNA组装构建计划 | 工业生物技术 |
| 1662 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文详细介绍了MoClo系统标准部件的Golden Gate克隆方案 | 提供了标准部件克隆的详细步骤方案,包括大片段标准部件的中间构建策略 | NA | 开发合成生物学中DNA组装的高效方法 | MoClo系统的标准部件(level 0模块) | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,PCR,DNA测序 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 标准部件(启动子、编码序列、终止子等遗传元件) | 工业生物技术 |
| 1663 | 2025-10-06 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文提供了使用声波分配器在1μL总体积中执行和并行化Golden Gate克隆反应的逐步方案 | 首次将声波分配技术应用于Golden Gate DNA组装反应,实现反应体积从10-25μL缩小至1μL的微型化 | NA | 开发自动化和小型化的DNA组装方法 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, 声波分配器 | NA | 模块化分层DNA片段组装 | 工业生物技术 |
| 1664 | 2025-10-06 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文提出了一种使用纳米孔测序平台进行高度多重双条形码扩增子测序的详细方案,用于验证Golden Gate组装结果 | 开发了名为DuBA.flow的完整工作流程,实现从单菌落到最终易解读测序报告的一站式解决方案 | NA | 为Golden Gate组装提供高效可靠的序列验证方法 | Golden Gate组装产物 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序, 双条形码扩增子测序, PCR | NA | DNA测序数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元组装, 多基因构建体 | 工业生物技术 |
| 1665 | 2025-10-06 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 介绍开源Python软件包AssemblyTron如何通过低成本开源机器人实现Golden Gate克隆的自动化 | 开发了AssemblyTron的升级功能,包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变库组装和索引质粒库组装 | NA | 为合成生物学提供经济高效的Golden Gate组装自动化解决方案 | DNA构建体和组合文库 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、易错PCR | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, OpenTrons OT-2 | NA | 模块化克隆系统、组合突变库、索引质粒库 | 工业生物技术 |
| 1666 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 介绍基于Golden Gate组装技术快速构建细菌合成小RNA表达质粒的方法和工具 | 开发了用于大肠杆菌的质粒系列和G-GArden工具,支持无疤痕组装策略的寡核苷酸设计 | NA | 建立合成小RNA表达质粒的快速高效构建方法 | 细菌小RNA和合成生物学构建模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, G-GArden | Escherichia coli | 合成小RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 1667 | 2025-10-06 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 开发了一种基于Golden Gate组装的无克隆工作流程,用于快速生产线性DNA模板以用于无细胞转录翻译系统 | 通过Golden Gate组装和PCR扩增实现无细胞快速原型设计,无需耗时的大肠杆菌转化和克隆步骤 | NA | 加速合成生物学中设计-构建-测试-学习周期的新功能开发 | 线性DNA模板和遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、PCR、无细胞转录翻译(TXTL) | NA | 遗传元件功能数据 | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 转录单元组装,包括启动子、核糖体结合位点(RBS)、编码序列和终止子 | 工业生物技术 |
| 1668 | 2025-10-06 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 本文描述了利用Golden Gate组装和模块化克隆技术在莱茵衣藻中构建转基因表达遗传盒的方法 | 将模块化克隆技术应用于单细胞模型藻类莱茵衣藻的转基因表达 | NA | 开发快速高效的克隆策略用于合成生物学中转基因单元或通路的组装 | 莱茵衣藻中的转基因表达遗传盒 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, Modular Cloning | Chlamydomonas reinhardtii | 转基因表达遗传盒 | 工业生物技术 |
| 1669 | 2025-10-06 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-Dec-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
|
综述 | 本文综述了基于仿生材料构建人工细胞的研究进展,重点关注自下而上的构建策略 | 系统探讨了从简单细胞支架到多室系统、从功能模块构建到关键代谢行为模拟的人工细胞仿生策略 | 对该领域的瓶颈进行了初步分析 | 开发人工细胞构建技术并弥合材料工程与生命科学之间的鸿沟 | 人工细胞及其构建材料 | 合成生物学 | NA | 仿生技术、自下而上构建策略 | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞支架、多室系统、功能模块、代谢行为模拟、通信网络仿生 | 医学, 工业生物技术 |
| 1670 | 2025-10-06 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
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综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins抗菌肽的结构多样性、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的治疗潜力 | 聚焦农场动物特异性cathelicidins,系统阐述其结构多样性、多重作用机制及作为抗生素替代品的临床前景 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的免疫机制及其对抗菌素耐药性的治疗应用 | 农场动物中的cathelicidins抗菌肽家族 | NA | 感染性疾病 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | 农场动物 | NA | 医药 |
| 1671 | 2025-10-06 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 提出使用线性混合效应模型来分析和量化合成基因布尔逻辑门性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路分析,提出固定效应β作为布尔逻辑门性能的统一描述符 | NA | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法 | 合成基因布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, k-means聚类, 蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 基因电路性能数据 | 144个已发表的布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR、AND等), 嵌套阻遏蛋白OR门 | 计算, 生物传感, 人类健康 |
| 1672 | 2025-10-06 |
Expression of Viral DNA Polymerase in Synthetic Recombinant Adeno-Associated Virus Producer Cell Line Enhances Full Particle Productivity
2025-Feb, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28885
PMID:39578398
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在HEK293细胞系中整合HSV-1 DNA聚合酶基因,显著提高了重组腺相关病毒(rAAV)的完整病毒颗粒产量 | 首次在合成rAAV生产细胞系中整合HSV-1 DNA聚合酶复合体(UL30/UL42),通过增强AAV基因组扩增来提高完整病毒颗粒比例 | 研究仅验证了rAAV2和rAAV8两种血清型,未涉及其他血清型或大规模生产工艺验证 | 开发可扩展的rAAV生产技术以满足基因治疗临床需求 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | 基因治疗 | 合成生物学、病毒载体技术 | NA | 病毒滴度检测数据 | GX6B细胞系及其改造克隆 | 基因整合、诱导表达系统 | HEK293细胞 | 诱导型启动子控制的HSV-1 DNA聚合酶表达系统 | 医药 |
| 1673 | 2025-10-06 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 本文综述了工程化酿酒酵母在医学领域的三大应用方向:作为药物和疫苗的细胞工厂、诊断用生物传感器以及肠道疾病活体治疗产品 | 系统梳理了酿酒酵母从食品工业到医学应用的身份转变,聚焦其在合成生物学推动下的创新医疗应用场景 | 该领域仍面临技术挑战和商业化障碍(文中未具体说明样本规模或实验数据局限) | 探讨工程化酿酒酵母在医学应用中的发展现状与前景 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的基因工程改造体 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 基因工程技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 生物传感器、活体治疗系统 | 医学 |
| 1674 | 2025-10-06 |
Light-activated channelrhodopsins: a revolutionary toolkit for the remote control of plant signalling
2025-Feb, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20311
PMID:39632281
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综述 | 本文综述了光敏通道蛋白在高等植物光遗传学中的应用进展及其在植物信号远程控制中的潜力 | 将源自藻类的光敏通道蛋白工具包创新应用于植物信号调控领域,为植物生物学研究开辟新维度 | NA | 探索光敏通道蛋白在高等植物信号远程控制和合成生物学中的应用前景 | 光敏通道蛋白及其在高等植物中的信号调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光敏通道蛋白 | 高等植物 | 膜电位调控、离子通道信号传导 | 农业 |
| 1675 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the production and secretion of the saffron ingredient crocetin
2025-Jan-07, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02598-y
PMID:39773299
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母,实现了藏红花成分藏花酸的生物合成与分泌 | 首次在工业酵母解脂耶氏酵母中实现藏花酸的从头生物合成,并通过两步温度转换发酵策略使产量提高2.3倍 | 研究仅限于摇瓶发酵规模,尚未进行大规模发酵验证 | 开发藏花酸的可持续生物生产方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵优化 | NA | 代谢物分析数据、发酵参数 | 工程酵母菌株 | CRISPR-Cas9, 吉布森组装 | 解脂耶氏酵母 | 藏花酸生物合成途径、β-胡萝卜素代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 1676 | 2025-10-06 |
Synthetic biology approaches and bioseparations in syngas fermentation
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.008
PMID:39168757
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综述 | 本文深入探讨了合成气发酵技术,涵盖微生物利用、气体成分影响、分离技术及商业化进展 | 系统综述了遗传工具和代谢工程在扩展合成气发酵产品范围方面的最新进展,特别关注非模式生物的菌株开发加速技术 | NA | 探讨合成气发酵作为化石燃料替代方案的技术发展现状和挑战 | 合成气发酵微生物、气体成分、分离技术和商业化应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传工具开发 | NA | NA | NA | NA | 乙酰原核生物及其他非模式微生物 | Wood-Ljungdahl代谢途径 | 能源, 环境 |
| 1677 | 2025-10-06 |
Programming mammalian cell behaviors by physical cues
2025-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.014
PMID:39179464
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综述 | 本文综述了通过物理信号调控哺乳动物细胞行为的合成生物学研究进展 | 探讨了利用光、磁场、温度、机械力、超声波和电信号等物理线索精确控制细胞行为的转基因开关设计 | 现有工具存在精度和效率方面的限制 | 开发响应物理信号的合成生物学工具以调控哺乳动物细胞行为 | 工程化哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因开关设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 物理信号响应开关 | 医学 |
| 1678 | 2025-10-06 |
Bacterial imaging in tumour diagnosis
2024-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14474
PMID:38808743
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综述 | 本文综述了细菌成像技术在肿瘤诊断中的应用与进展 | 整合多种成像技术(光学、声学、MRI、核医学)与合成生物学/纳米材料工程改造细菌,实现肿瘤的动态实时监测 | 肿瘤内细菌丰度较低且分布不均、空间数据集维度高、成像标记工具存在限制 | 开发细菌成像方法用于肿瘤诊断 | 肿瘤相关细菌(如大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌) | 医学影像 | 肿瘤 | 光学成像、声学成像、磁共振成像、核医学成像(PET/SPECT) | NA | 影像数据 | NA | 合成生物学改造、纳米材料工程 | 大肠杆菌, 鼠伤寒沙门氏菌 | 外源治疗基因表达 | 医学 |
| 1679 | 2025-10-06 |
Intratumoral Injection of Engineered Mycobacterium smegmatis Induces Antitumor Immunity and Inhibits Tumor Growth
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0130
PMID:39780958
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研究论文 | 通过合成生物学改造耻垢分枝杆菌,使其表达Flt3L和CD40激动剂融合蛋白,瘤内注射可激活树突状细胞并诱导抗肿瘤免疫反应 | 首次利用合成生物学技术改造非致病性分枝杆菌作为活体免疫激动剂递送平台,实现瘤内原位激活树突状细胞 | 研究仅限于小鼠黑色素瘤模型,尚未在更多肿瘤类型或临床环境中验证 | 开发新型肿瘤免疫治疗方法,通过激活树突状细胞增强抗肿瘤免疫应答 | B16F10小鼠黑色素瘤模型和工程化耻垢分枝杆菌 | 合成生物学与免疫治疗 | 黑色素瘤 | 合成生物学改造、蛋白质工程 | NA | 动物实验数据、免疫细胞分析数据 | 小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 耻垢分枝杆菌 | Flt3L与CD40激动剂融合蛋白表达系统 | 医学 |
| 1680 | 2025-10-06 |
Ion-Selective Mobility Differential Amplifier: Enhancing Pressure-Induced Voltage Response in Hydrogels
2025-Jan-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415000
PMID:39545315
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研究论文 | 提出使用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器来增强离子型聚乙烯醇水凝胶压力诱导电压响应的策略 | 首次采用冠醚作为离子选择性迁移率差分放大器,将压电离子系数提升30倍至1490 nV/Pa | NA | 增强压电离子器件的刺激响应能力 | 离子型聚乙烯醇水凝胶 | 材料科学 | NA | 压电离子技术 | NA | 电信号数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 软体机器人, 合成生物学 |