合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1741	2024-08-07	Exploration of the Native Sucrose Operon Enables the Development of an Inducible T7 Expression System in Paenibacillus polymyxa 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00689 PMID:38319655	研究论文	本研究在Paenibacillus polymyxa中识别了天然蔗糖操纵子，并通过其结构和功能关系分析，建立了一个由蔗糖操纵子和T7启动子调控的级联T7表达系统，实现了可控的基因表达和表达效率的提高。	本研究首次在Paenibacillus polymyxa中建立了基于蔗糖操纵子的级联T7表达系统，实现了基因表达的可控性和效率的显著提升。	NA	开发适用于Paenibacillus polymyxa的合成生物学工具，提高其作为工业生产者的应用潜力。	Paenibacillus polymyxa中的蔗糖操纵子及其在基因表达调控中的应用。	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
1742	2024-08-07	Progress in Gene Editing and Metabolic Regulation of Saccharomyces cerevisiae with CRISPR/Cas9 Tools 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00685 PMID:38326929	综述	本文综述了CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢工程中的应用，包括基本原理和实际应用	CRISPR/Cas9系统通过减少时间和劳动力，加速了微生物工程的发展，并增强了分子遗传学的理解	NA	总结CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢调控中的研究进展	CRISPR/Cas9系统在酵母中的应用	基因工程	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	NA
1743	2024-08-07	Biofoundry-Scale DNA Assembly Validation Using Cost-Effective High-Throughput Long-Read Sequencing 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00589 PMID:38329009	研究论文	本文介绍了一种利用成本效益高的长读长测序技术在生物铸造厂规模上验证DNA组装的方法	采用了牛津纳米孔测序技术，并开发了配套的Nextflow管道和Python包，以进行深入分析并生成详细报告	NA	验证组装、克隆或编辑的质粒的准确性	工程化/合成DNA构建体（质粒）	合成生物学	NA	牛津纳米孔测序技术	NA	DNA序列	NA
1744	2024-08-07	Beyond the Organism versus Machine Dichotomy: A Review of Ethical Concerns in Synthetic Biology 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00456 PMID:38070167	综述	本文对合成生物学领域的伦理和社会问题进行了系统性回顾和主题分析	探讨了合成生物学中的伦理问题，特别是关于生命操作和生物安全与生物安全的义务论和后果论问题	缺乏对实验室日常工作中合成生物学研究人员面临的伦理问题的系统研究	分析合成生物学中的伦理和社会问题	合成生物学领域的伦理和社会问题	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1745	2024-08-07	RNA Aptamer-Mediated Gene Activation Systems for Inducible Transgene Expression in Animal Cells 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00472 PMID:38073086	研究论文	本文开发了一种基于RNA适配体的基因激活系统RAMGA，用于在动物细胞中诱导RNA触发的基因表达激活	该系统利用合成生物学策略，通过目标RNA连接DNA结合域和转录激活因子，实现对目标mRNA水平的检测和报告基因表达的调控，不影响原始mRNA编码基因的表达	NA	开发新的RNA触发基因表达系统，用于建立基因电路、评估内源基因表达和开发新型RNA检测器	动物细胞中的RNA表达分析	合成生物学	NA	合成生物学	NA	RNA	重组CHO细胞
1746	2024-08-07	A Sirtuin-Dependent T7 RNA Polymerase Variant 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00607 PMID:38117980	研究论文	本文通过遗传密码扩展技术，将T7 RNA聚合酶催化核心中的赖氨酸（K631）替换为N-乙酰-L-赖氨酸（AcK），设计了一种依赖于NAD依赖性去乙酰化酶（sirtuins）的T7 RNA聚合酶变体。	该变体需要sirtuins的去乙酰化酶活性来恢复其酶活性，从而在活细胞（包括细菌和哺乳动物细胞）以及体外系统中维持sirtuin依赖的基因转录。	NA	探索通过转录调控控制合成生物学和生物工程中的生物过程的新方法。	T7 RNA聚合酶变体及其在细胞中的转录调控作用。	生物工程	NA	遗传密码扩展	NA	NA	包括细菌和哺乳动物细胞以及体外系统
1747	2024-08-07	A Novel RNA Aptamer as Synthetic Inducer of DasR Controlled Transcription 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00553 PMID:38127784	研究论文	本文研究了一种新型RNA适配体作为合成诱导DasR控制转录的工具	本文通过结合选择和后续筛选，成功选出了一种能够结合细菌抑制因子DasR的RNA适配体，从而激活DasR控制的转录，为合成生物学工具箱增加了新的调控层次	NA	开发新的合成电路工程工具，扩展合成生物学领域的应用	RNA适配体及其在细菌抑制因子DasR控制转录中的应用	合成生物学	NA	下一代测序	NA	RNA	NA
1748	2024-08-07	Cell-Penetrating Peptide Delivery of Nucleic Acid Cargo to Emiliania huxleyi, a Calcifying Marine Coccolithophore 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00670 PMID:38147049	研究论文	本文研究了使用细胞穿透肽（CPP）将核酸货物递送到一种钙化的海洋颗石藻（Emiliania huxleyi）中	设计了一种包含高脯氨酸含量的CPP，并评估了其对颗石藻细胞的递送性能	NA	探索合成生物学在颗石藻生物矿化中的应用	海洋颗石藻（Emiliania huxleyi）	NA	NA	细胞穿透肽（CPP）	NA	合成肽核酸（PNA）	NA
1749	2024-08-07	Fine-Tuned Gene Expression Elements from Hybrid Promoter Libraries in Pichia pastoris 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00534 PMID:38150419	研究论文	本文构建了一个梯度强度启动子库，通过随机杂交和高通量筛选，优化了Pichia pastoris中的基因表达组件。	通过构建和筛选新型杂交启动子，实现了基因表达水平的精细调控，并在生物技术生产中验证了其广泛应用性。	NA	优化Pichia pastoris中的基因表达组件，扩展其在代谢工程中的应用潜力。	Pichia pastoris中的启动子和上游调控序列。	合成生物学	NA	高通量筛选	NA	基因表达数据	涉及多个启动子和调控序列的变体。
1750	2024-08-07	Plant Artificial Chromosomes: Construction and Transformation 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00555 PMID:38163256	综述	本文综述了植物人工染色体的结构、构建方法及其在作物改良中的应用潜力	介绍了植物人工染色体技术在作物改良和基因功能研究中的进展	目前人工染色体技术在合成重复序列和转化大DNA片段方面仍存在局限	探讨如何通过人工染色体技术提高作物产量、品质和抗病性	植物人工染色体及其在农业革命中的应用	合成生物学	NA	人工染色体技术	NA	NA	NA
1751	2024-08-07	Cloning and sequencing analysis of whole Spiroplasma genome in yeast 2024, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2024.1411609 PMID:38881660	研究论文	本文通过合成生物学技术，成功在酵母中克隆并测序了螺旋体细菌的全基因组	首次在酵母中成功克隆了与昆虫相关的螺旋体细菌的全基因组，并验证了克隆效率高且突变率低	文中未明确提及具体的局限性	探索在酵母中进行全基因组克隆和移植的可行性，以及其在合成生物学中的应用	螺旋体细菌的全基因组	合成生物学	NA	Illumina测序	NA	DNA序列	1.12 Mbp的全基因组
1752	2024-08-07	Automated Platform for the Plasmid Construction Process 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00292 PMID:37948662	研究论文	本文报道了名为DNAda的应用程序的开发，该程序能够为J5 DNA组装程序生成的任何给定DNA构建体设计编写自动化指令，并描述了自动化流程及其多个实用功能	开发了一个能够自动化编写DNA构建体设计指令的应用程序DNAda，并展示了其在组合DNA组装构建中的实用性	NA	开发一个自动化平台，用于处理大型合成生物学实验中的质粒构建过程	DNA构建体设计的自动化指令编写及组合DNA组装的构建	合成生物学	NA	DNA组装	NA	DNA序列	构建了一个包含120个质粒的库，这些质粒大小从7到14 kb不等，由4到7个DNA片段组成
1753	2024-08-07	GENETTA: a Network-Based Tool for the Analysis of Complex Genetic Designs 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00333 PMID:37963232	研究论文	GENETTA 是一种基于网络的工具，利用图论将合成生物学设计转化为网络进行分析和操作	GENETTA 能够将复杂数据表示为互联点，允许动态定制可视化，包括交互网络和部件层次结构，并能合并来自多个数据库的设计数据	NA	开发一种用于分析复杂遗传设计的网络工具	合成生物学设计	生物信息学	NA	图论	NA	网络数据	NA
1754	2024-08-07	The Laboratory Automation Protocol (LAP) Format and Repository: A Platform for Enhancing Workflow Efficiency in Synthetic Biology 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00397 PMID:37982688	研究论文	本文介绍了实验室自动化协议（LAP）格式和存储库，旨在提高合成生物学中的工作流程效率	LAP采用标准化脚本格式，模块化设计，可无缝组合创建定制的目标特定工作流程，并经过实验验证确保可靠性	NA	解决实验科学家在实施开源自动化解决方案时缺乏标准化工具包的问题	实验室自动化协议（LAP）格式和存储库	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
1755	2024-08-07	Using Methyl Bromide for Interspecies Cell-Cell Signaling and As a Reporter in a Model Soil Consortium 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00559 PMID:37991716	研究论文	研究评估了在土壤微生物群落中，通过合成生物学工具编程单一成员来报告基因表达的可能性，无需破坏土壤基质。	通过将甲基卤素转移酶表达与组成型启动子耦合，实现了在土壤中合成甲基卤素，并能通过气体色谱直接读取或通过土壤衍生生物间接响应甲基卤素。	NA	开发用于研究土壤微生物群落响应动态水分条件的合成生物学工具。	五成员土壤模型群落（MSC）及其在不同环境相关水分条件下的行为。	合成生物学	NA	气体色谱	NA	气体信号	五成员土壤模型群落
1756	2024-08-07	Tunable Dynamics in a Multistrain Transcriptional Pulse Generator 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00434 PMID:38016068	研究论文	本文展示了通过调整合成微生物群落中菌株的比例来调节电路动态	开发了一种由三种工程菌株组成的微生物群落，利用同型丝氨酸内酯介导的细胞间信号传导形成多菌株不一致类型1前馈环路，作为基因表达的脉冲发生器	数学模型在极端比例下的预测准确性有待验证	研究如何在合成微生物群落中通过调节菌株比例来实现基因电路的特定行为	合成微生物群落中的基因电路动态调节	合成生物学	NA	细胞间信号传导	不一致类型1前馈环路	数学模型	三种工程菌株组成的微生物群落
1757	2024-08-07	Establishing Tunable Genetic Logic Gates with Versatile Dynamic Performance by Varying Regulatory Parameters 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00554 PMID:38033235	研究论文	本研究通过调整调节参数，设计并构建了具有多功能动态性能的可调遗传逻辑门	本研究首次将香豆酸生物传感器系统与tetR或lacI调控系统结合，构建了AND遗传逻辑门，并结合反义RNA或单导RNA构建了香豆酸触发的NOT遗传逻辑门	NA	扩展遗传逻辑门在代谢工程和合成生物学中的应用	遗传逻辑门的设计与构建	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
1758	2024-08-07	Creation of Architecturally Minimal Transcriptionally Activating Riboswitches Responsive to Theophylline Reveals an Unconventional Design Strategy 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00519 PMID:38052004	研究论文	本研究开发了一种新型设计策略，用于创建结构最小化的转录激活型茶碱响应性核糖开关	提出了一种新的设计方法，通过合成茶碱RNA适配体和设计表达平台，实现了高效且广泛兼容的转录激活型核糖开关	NA	开发简化的合成核糖开关，以便于集成到复杂的基因电路中	转录激活型核糖开关的设计与应用	合成生物学	NA	RNA适配体设计	NA	RNA序列	设计并构建了多个序列，通过虚拟筛选确定了两种转录激活型核糖开关
1759	2024-08-07	Navigating the Frontier of Synthetic Biology: An AI-Driven Analytics Platform for Exploring Research Trends and Relationships 2023-11-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00192 PMID:37648657	研究论文	本研究利用主题建模技术全面映射合成生物学领域的研究主题，揭示子主题及其关系和时间趋势	本研究通过分析合成生物学的文献，揭示了研究主题的子领域和它们之间的关系，以及时间趋势	NA	旨在深入理解合成生物学并为其分析提供基础	合成生物学的研究主题、子主题及其关系和时间趋势	合成生物学	NA	主题建模	NA	文本	NA
1760	2024-08-07	Nonsterilized Fermentation of Crude Glycerol for Polyhydroxybutyrate Production by Metabolically Engineered Vibrio natriegens 2023-11-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00498 PMID:37856147	研究论文	本文通过基因工程改造快速生长的盐和有毒物质耐受性强的细菌Vibrio natriegens，实现了从非灭菌发酵的有机废物中高效生产聚羟基丁酸酯（PHB）	通过基因编辑和过表达关键基因，成功提高了PHB的产量和耐受性，且在非灭菌条件下表现出色	NA	探索通过基因工程提高微生物发酵生产聚羟基丁酸酯的效率和成本效益	Vibrio natriegens细菌及其在PHB生产中的应用	合成生物学	NA	基因编辑	NA	微生物发酵	NA