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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 1841 - 1860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1841 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
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综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 1842 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用，包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术，并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合，推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 1843 | 2026-05-03 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种通过cDNA合成抑制核酶催化活性以实现准确RT-qPCR测量上下文依赖性核酶活性的方法 | 在样本制备工作流程中引入寡核苷酸以抑制核酶活性，恢复RT-qPCR测量的准确性，首次解决了RNA提取和逆转录条件诱发核酶裂解导致测量不准确的问题 | 研究仅在体外已知上下文依赖性核酶裂解的RNA组上验证，未涉及体内复杂环境或多种核酶类型，潜在限制于实际应用场景的泛化能力 | 准确测量不同遗传和环境上下文中的核酶活性，以验证新核酶序列及基于核酶的生物技术 | 自裂解核酶及其上下文依赖性活性 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, cDNA合成 | NA | RNA定量数据 | 一组已知体外上下文依赖性裂解的RNA样本 | NA | NA | 自裂解核酶（自切割RNA） | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 1844 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
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研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 1845 | 2026-05-02 |
Mass spectrometry integrates protein design into structural biology method development
2026, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2025.10018
PMID:42063620
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综述 | 概述了质谱如何通过验证多种设计目标来补充蛋白质设计，并探讨了工程蛋白作为方法开发测试平台的价值 | 提出将机器学习与原生质谱整合形成反馈循环的新观点，即新设计挑战分析技术，改进的方法提供更丰富数据以指导未来预测 | 未提及具体实验数据或量化分析，缺乏对整合方法实际效能的评估 | 阐述质谱在蛋白质设计验证中的作用及其与机器学习的协同关系 | 人工设计蛋白质及其结构特征（寡聚化、折叠、配体结合、动态构象变化） | 机器学习 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工原细胞开发 |
| 1846 | 2026-05-02 |
PSMA-directed CAR-T cell therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer: a next-generation engineering perspective on stem cell-derived immune effectors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819701
PMID:42064077
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综述 | 这篇综述回顾了针对转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）的PSMA导向CAR-T细胞疗法的临床翻译现状，并提出了一种三重协同框架来克服TME免疫抑制、抗原异质性和T细胞适应性等核心挑战 | 提出了三重协同框架系统解构实体瘤障碍，并聚焦于干细胞衍生免疫效应器（如iPSC衍生CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞）作为新一代细胞产品范式，同时纳入基于证据的等级评估提升学术严谨性 | NA | 为PSMA-CAR-T疗法提供战略蓝图，以将其推进至mCRPC的治愈性治疗，并广泛适用于新一代干细胞衍生免疫疗法 | PSMA导向CAR-T细胞疗法及其在mCRPC中的临床应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | 人 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 1847 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
|
研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素，支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |
| 1848 | 2026-05-01 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-01-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
|
研究论文 | 利用合成生物学重构DELTA-NOTCH信号通路，研究分节时钟中细胞间振荡通讯的动态机制 | 首次通过合成生物学方法重建DELTA-NOTCH通路，并结合光遗传学验证配体呈现动态对细胞通讯的关键作用 | 结果主要基于小鼠PSM类器官模型，需进一步在体内验证 | 验证DELTA-NOTCH信号在分节时钟中耦合细胞间振荡的作用 | 小鼠前体节中胚层类器官中的DELTA缺陷细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学构建、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成DELTA-NOTCH通路 | 小鼠 | DELTA-NOTCH信号振荡回路 | 发育生物学 |
| 1849 | 2026-05-01 |
Decoding biology with massively parallel reporter assays and machine learning
2024-10-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351800.124
PMID:39362779
|
综述 | 本文综述了大规模并行报告基因检测与机器学习在解码生物学中的应用 | 结合大规模并行报告基因检测和机器学习，系统解析调控基因表达的顺式调控密码 | 未详细讨论方法的计算复杂度和实验验证挑战 | 通过MPRA和机器学习量化序列变异对基因表达的影响，并预测新序列功能 | 顺式调控元件、基因表达调控机制 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因检测、高通量测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、mRNA和基因治疗 |
| 1850 | 2026-05-01 |
Artificial Diploid Escherichia coli by a CRISPR Chromosome-Doubling Technique
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205855
PMID:36642845
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研究论文 | 利用CRISPR染色体加倍技术构建人工二倍体大肠杆菌细胞 | 首次通过CRISPR技术构建稳定的人工二倍体大肠杆菌单细胞，并验证其特性 | 二倍体大肠杆菌生长显著减慢，且仅限于细菌中应用 | 探索合成生物学中人工多倍体细胞构建方法及其基础生命科学问题 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR、流式细胞术、定量PCR、荧光原位杂交、第三代基因组测序 | NA | 基因组序列、细胞图像 | 多个大肠杆菌菌株样本 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 染色体加倍电路 | 基础生命科学、工业生物技术 |
| 1851 | 2026-04-30 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
|
研究论文 | 通过半理性筛选和理性设计组合策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶，实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 结合理性计算设计（结构、进化和稳定性预测）与半理性筛选（基于L-岩藻糖响应生物传感器），首次获得五重突变体M5，实现了124.25 g/L的2'-FL产量且无副产物DFL | 未明确讨论该策略对其他岩藻糖基转移酶或不同底物的普适性，也未评估长期工业生产的稳定性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定点饱和突变、理性计算设计、生物传感器筛选 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | L-岩藻糖响应生物传感器（FcsR-P） | 工业生物技术、食品 |
| 1852 | 2026-04-30 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
|
综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制，包括酶学原理、系统工程策略以及绿色高值化利用的前景 | 将棉酚活性酶分为四个功能模块（官能团修饰、芳环裂解、增溶缀合和自由基介导环化），并提出产物解析验证方法以明确定义解毒终点 | 现有解毒方法主要依据总棉酚减少而非产物解析证据，缺乏解毒转化的明确验证 | 系统阐述棉酚的生物解毒机制，并提出绿色高值化利用的策略 | 棉酚及其解毒酶与微生物系统 | NA | NA | 酶工程, 多酶级联, 人工智能辅助酶/通路挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 解毒代谢通路（包括棉酚活性酶的功能模块） | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 1853 | 2026-04-30 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
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review | 综述了小沟四联体（MGTs）作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 | 揭示了MGT能稳定i-motif结构，使其在中性pH下折叠，并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型，同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 | 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 | 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 | 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光光谱、化学修饰（2'-氟取代、荧光胞苷类似物） | NA | NA | NA | NA | NA | i-motif纳米结构（含MGT封盖） | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 1854 | 2026-04-30 |
AI-Driven De Novo Binder Design: From Structure Prediction to Closed-Loop Optimization
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0070
PMID:42052042
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综述 | 总结了人工智能驱动从头设计蛋白结合物的标准化技术栈，涵盖从结构预测到闭环优化的实用工作流程 | 系统整合了结构预测、蛋白质语言模型和扩散生成建模等前沿技术，提出了从计算设计到实验反馈的完整闭环优化框架 | 面临诱导契合、负设计和数据集偏差等关键挑战，端到端复合物生成尚未实现 | 综述人工智能驱动的从头蛋白结合物设计方法，建立标准化技术栈 | 蛋白结合物（包括抗体和非抗体支架，如单抗体和设计的锚蛋白重复蛋白） | 机器学习 | NA | 结构预测、蛋白质语言模型、扩散生成建模 | 扩散模型、蛋白质语言模型 | 蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 1855 | 2026-04-30 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
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综述 | 综述合成免疫学在编程免疫细胞以实现新型复杂逻辑功能方面的进展，特别是针对CAR T细胞疗法的局限性提出合成生物学解决方案 | 提出“合成免疫疗法”这一新子领域概念，强调通过合成生物学工具赋予T细胞更高级的布尔逻辑能力，如多抗原识别和增强持久性 | CAR T细胞疗法仍不成熟，存在对表达抗原的正常组织的毒性以及细胞因子毒性等严重局限性 | 探讨如何利用合成生物学解决CAR T细胞疗法的局限性，推动免疫疗法向合成免疫疗法方向发展 | 嵌合抗原受体（CAR）T细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1856 | 2026-04-30 |
Budding yeast as a factory to engineer partial and complete microbial genomes
2020-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2020.09.003
PMID:33015421
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综述 | 该论文综述了利用芽殖酵母作为工厂来工程化部分和完整微生物基因组的最新进展 | 总结了酵母在合成生物学中作为宿主进行高效基因组编辑的新方法，以及快速合成、组装和修改病毒与细菌基因组以应对新兴病原体的潜力 | 大型DNA分子（超过2百万碱基对）难以克隆、细菌基因组的拯救困难，以及技术的双重用途潜力需谨慎考虑 | 探讨酵母细胞在微生物基因组工程中的应用及其生物学意义 | 芽殖酵母及微生物基因组（包括病毒和细菌基因组） | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 芽殖酵母 | 基因组合成与组装 | 医学、工业生物技术 |
| 1857 | 2026-04-29 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Jul, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
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综述 | 该综述文章全面回顾了微生物脂肪酶在工业创新中的应用，涵盖其来源、筛选、生产、纯化及表征等方面 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程及AI辅助建模在识别和定制具有所需特性的脂肪酶中的革命性作用 | 未明确说明，但作为综述可能缺乏对特定系统验证的深度讨论 | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业创新和绿色化学中的关键作用 | 微生物脂肪酶，包括来自细菌、真菌和酵母的脂肪酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 宏基因组学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程 | 芽孢杆菌属, 无色杆菌属, 产碱菌属, 节杆菌属, 假单胞菌属, 青霉属 | NA | 工业生物技术, 医药, 食品与饮料, 纺织, 皮革, 洗涤剂, 生物燃料 |
| 1858 | 2026-04-29 |
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500981
PMID:42046273
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综述 | 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 | 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构，并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性，从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 | 未明确提及现有研究的局限性 | 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略，探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 | 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 古菌脂质生物合成途径，包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 | 工业生物技术、医药 |
| 1859 | 2026-04-29 |
GAN-GA: A Deep-Evolutionary Approach for Synthesizing Functionally Similar Heat Shock Proteins
2026-Apr-27, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3688058
PMID:42043999
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研究论文 | 提出GAN-GA混合框架，结合生成对抗网络与遗传算法以设计功能相似的热激蛋白 | 将Wasserstein GAN与多目标遗传算法NSGA-II结合，在蛋白质序列生成后加入理化性质优化阶段，克服传统生成方法缺乏功能验证的局限 | 未详细说明对生成蛋白质的湿实验验证结果，论文仅描述序列优化阶段未提及实际蛋白质表达与功能测试 | 开发一种无需天然模板的从头蛋白质设计方法，生成具有生物学相关性的功能蛋白序列 | 合成热激蛋白HSP70和HSP90的序列设计 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列生成 | Wasserstein GAN, NSGA-II, ProtBert, ESM, 变分自编码器, 强化学习 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 1860 | 2026-04-29 |
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-026-02201-5
PMID:41991721
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研究论文 | 利用系统发育组学、代谢组学和异源表达方法，调查了82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成基因簇及其天然产物 | 首次系统性地对肉座菌目生防真菌的生物合成能力进行大规模调查，揭示了约80%的基因簇编码未知产物，并表征了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 | 仅涉及82种真菌，样品量有限，且主要关注生物合成基因簇与分子的关联，未能覆盖所有潜在生物活性化合物 | 探索肉座菌目真菌作为生物防治剂的生物合成潜力，为可持续农业害虫防治奠定基础 | 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 系统发育组学, 代谢组学, 异源表达 | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | 82种真菌物种 | 异源表达 | NA | 生物合成基因簇 | 农业 |