合成生物学相关文章
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当前共找到 3019 篇文献，本页显示第 1841 - 1860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1841 | 2024-08-07 |
Nudix hydrolase WvNUDX24 is involved in borneol biosynthesis in Wurfbainia villosa
2024-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16669
PMID:38323895
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研究论文 | 本文研究了Nudix水解酶WvNUDX24在Wurfbainia villosa中参与龙脑生物合成的作用 | 首次报道了负责将龙脑二磷酸（BPP）水解生成龙脑的酶 | NA | 鉴定并功能性表征参与龙脑生物合成的Nudix水解酶WvNUDX24 | Nudix水解酶WvNUDX24及其在龙脑生物合成中的作用 | NA | NA | 定点突变实验 | NA | NA | NA |
| 1842 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of optogenetics in microbial applications
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102404
PMID:38039932
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综述 | 本文综述了光遗传学在微生物应用中的关键特征及其在理解生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | 光遗传学通过光动态操纵细胞行为，实现了其他方法无法达到的高时空精度 | 光遗传学主要被用作传统化学诱导剂的替代品 | 探讨光遗传学在微生物应用中的潜力和应用 | 微生物及其在生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | NA | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 1843 | 2024-08-07 |
Exploring the transcriptional landscape of phage-host interactions using novel high-throughput approaches
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102419
PMID:38271748
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研究论文 | 本文探讨了使用新型高通量方法研究噬菌体与宿主相互作用的转录组景观 | 本文首次将高通量测序技术应用于噬菌体等微生物病毒，以详细描绘感染过程中未充分探索的RNA生物学和分子过程 | NA | 研究噬菌体感染细菌时引发的应激和扰动对细菌代谢和基因调控的新基本机制 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1844 | 2024-08-07 |
Evolution and synthetic biology
2023-12, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102394
PMID:37801925
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综述 | 本文综述了进化观察如何启发合成生物学的三个广泛领域：细胞为基础的生物分子进化组合方法、建立微生物共生体的工程相互依赖性以及合成免疫学 | NA | NA | 探讨进化观察如何影响合成生物学的设计 | 合成生物学的三个主要领域 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1845 | 2024-08-07 |
The Biosynthetic Pathways of Tanshinones and Phenolic Acids in Salvia miltiorrhiza
2015-Sep-08, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules200916235
PMID:26370949
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综述 | 本文综述了丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 系统总结了丹参酮和酚酸生物合成途径的最新进展，并探讨了这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用 | NA | 旨在阐明丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径，并探讨这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用 | 丹参中的丹参酮和酚酸的生物合成途径及其相关基因 | NA | 心血管疾病 | 高通量测序 | NA | 基因 | NA |
| 1846 | 2024-08-07 |
Developed and emerging 1,4-butanediol commercial production strategies: forecasting the current status and future possibility
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2176740
PMID:37286203
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研究论文 | 本文讨论了1,4-丁二醇（1,4-BDO）的商业生产策略，包括化学和生物技术方法的现状及未来发展前景 | 文章介绍了通过微生物利用重组菌株、代谢工程、合成生物学等技术进行可持续生物生产的新方法 | 文章指出环境友好和生物基商业生产策略面临的困难 | 探讨1,4-BDO的当前生产技术和未来可能的发展方向 | 1,4-BDO及其在化学反应中的应用，如聚氨酯、斯潘德克斯中间体和聚乙烯吡咯烷酮（PVP） | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、生物信息学、人工智能引导算法 | NA | NA | NA |
| 1847 | 2024-08-07 |
Bacterial genome reduction for optimal chassis of synthetic biology: a review
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2208285
PMID:37380345
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综述 | 本文综述了通过细菌基因组简化构建合成生物学最优底盘的进展 | 介绍了通过识别必需基因集和多种基因组删除技术来促进细菌基因组简化的方法 | 一些基因组简化菌株的生长减少和生理表型扰动可能限制其作为优化细胞工厂的应用 | 评估细菌基因组简化在构建合成生物学最优底盘方面的进展 | 细菌基因组简化的方法、特性及其在工业应用中的潜力 | 合成生物学 | NA | 基因组删除技术 | NA | 基因组数据 | 多种细菌 |
| 1848 | 2024-08-07 |
Circular single-stranded DNA as a programmable vector for gene regulation in cell-free protein expression systems
2024-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49021-6
PMID:38821953
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研究论文 | 本文介绍了一种可编程的载体——环状单链DNA（CssDNA），用于在基于酵母的无细胞蛋白表达系统中进行基因表达调控 | CssDNA不仅可用于通过正义CssDNA和反义CssDNA的不同途径进行基因调控，还可构建为无细胞蛋白表达系统中的几种基因调控逻辑门 | NA | 探索CssDNA在基因表达和基因调控中的应用，丰富合成生物学工具箱 | 环状单链DNA（CssDNA）在无细胞蛋白表达系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1849 | 2024-08-07 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-May-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
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研究论文 | 本文提出了一种基于mRNA结构预测的新方法，用于系统筛选候选信号肽序列，以改进骨形态发生蛋白2（BMP2）的生产 | 首次将mRNA结构预测应用于信号肽选择，结合多种计算工具进行信号肽活性、定位目标和mRNA结构的预测 | mRNA结构预测的准确性有待提高，且实验结果显示在不同细胞系中信号肽活性的表现不一 | 开发一种系统筛选候选信号肽序列的方法，以提高BMP2的生产效率和降低成本 | 骨形态发生蛋白2（BMP2）的信号肽 | 生物信息学 | NA | 计算工具（SignalP, DeepLoc, MXFold2） | NA | 氨基酸序列, mRNA结构 | 2,611个来自TGF-β超家族的信号肽序列 |
| 1850 | 2024-08-07 |
ORBIT for E. coli: kilobase-scale oligonucleotide recombineering at high throughput and high efficiency
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae227
PMID:38587185
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ORBIT的高效高通量方法，用于在E. coli中进行千碱基规模的基因组修饰 | ORBIT方法使用DNA寡核苷酸指导非复制性质粒的整合，显著提高了效率并支持高吞吐量操作 | NA | 开发一种新的基因组修饰方法，以克服现有方法的低效率和难以规模化的问题 | E. coli的基因组 | 合成生物学 | NA | DNA寡核苷酸重组技术 | NA | 基因组数据 | 数千个独特的基因组条码（>30k） |
| 1851 | 2024-08-07 |
Instructional materials that control cellular activity through synthetic Notch receptors
2023-06, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MATRIX的平台，通过结合工程化材料和表达相应合成生物学控制模块的细胞，实现对生物材料细胞反应的定制化定义 | 该平台通过激活合成Notch受体，能够调控多种细胞活动，如转录组工程、炎症抑制和多能干细胞分化，并且这些反应仅限于编程的生物材料表面 | NA | 开发一种新的方法来可靠地调控治疗细胞的行为，以支持细胞疗法和组织替代 | 工程化生物材料和表达合成Notch受体的细胞 | 再生工程 | NA | 合成生物学 | 合成Notch受体 | 生物材料 | NA |
| 1852 | 2024-08-07 |
A systematic comparison of error correction enzymes by next-generation sequencing
2017-Sep-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx691
PMID:28911123
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研究论文 | 本文通过下一代测序技术对合成DNA中的错误进行量化，并系统比较了六种不同的错误校正酶在11种条件下的效果 | 开发了一种新的实验和计算流程，用于快速、可扩展和可扩展地分析基因组装中的错误，并评估错误校正方法 | NA | 量化合成DNA中的错误并比较不同错误校正酶的效果 | 六种不同的错误校正酶在基因组装中的效果 | 分子生物学 | NA | 下一代测序 | NA | DNA序列 | 11种条件下的模型基因组装 |
| 1853 | 2024-08-07 |
Engineering Therapeutic T Cells: From Synthetic Biology to Clinical Trials
2017-Jan-24, Annual review of pathology
|
综述 | 本文综述了工程化T细胞疗法在治疗癌症、器官移植和自身免疫疾病中的临床试验现状及面临的挑战 | NA | 工程化T细胞疗法的设计和制造尚未标准化，且主要在学术环境中进行；需要开发可靠的方法来定义剂量和药代动力学 | 探讨工程化T细胞疗法的进一步发展所需的免疫学、合成生物学、制造过程和政府监管方面的进展 | 工程化T细胞疗法在临床应用中的挑战和病理学家在此领域的贡献 | NA | 癌症, 器官移植, 自身免疫疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 1854 | 2024-08-07 |
Quorum Sensing Communication Modules for Microbial Consortia
2016-09-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00286
PMID:27172092
|
研究论文 | 本文开发了微生物共生体的通信系统，以促进社区内不同成员之间的复杂社交行为 | 通过修改启动子和蛋白质，设计了两种新的群体感应系统（rpa和tra），并测试了它们与其他系统的交叉对话，发现了几个表现出有用正交性的系统对 | NA | 旨在克服单一微生物遗传改造的限制，通过工程化微生物共生体来实现复杂任务 | 微生物共生体的通信系统及其在复杂任务中的应用 | 合成生物学 | NA | 群体感应 | NA | NA | NA |
| 1855 | 2024-08-07 |
FlowCal: A User-Friendly, Open Source Software Tool for Automatically Converting Flow Cytometry Data from Arbitrary to Calibrated Units
2016-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00284
PMID:27110723
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研究论文 | 介绍了一种名为FlowCal的用户友好型开源软件工具，用于自动将流式细胞仪数据从任意单位转换为校准单位 | FlowCal提供了一个非专有的工具，可以通过直观的Microsoft Excel界面或可定制的Python脚本运行，自动进行数据校准和生成高质量图表 | 目前大多数研究者报告的数据仍使用任意单位，限制了解释的准确性 | 开发一种工具，以简化流式细胞仪数据的定量分析，并促进标准化荧光单位在合成生物学等领域的应用 | 流式细胞仪数据、校准颗粒、荧光探针和细胞类型 | 生物技术 | NA | 流式细胞术 | NA | 数据文件 | 10种不同的检测器灵敏度设置下的E. coli表达superfolder GFP (sfGFP)测量数据，以及S. cerevisiae Venus表达数据 |
| 1856 | 2024-08-07 |
A Delicate Nanoscale Motor Made by Nature-The Bacterial Flagellar Motor
2015-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201500129
PMID:27980978
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研究论文 | 本文研究了细菌鞭毛马达（BFM），一种直径约45纳米的分子复合体，它使几乎所有细菌能够游泳 | BFM是进化的顶峰，为合成生物学新时代的纳米技术设计提供了信息和灵感 | NA | 研究细菌鞭毛马达的结构和功能 | 细菌鞭毛马达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1857 | 2024-08-07 |
Computation-guided transcription factor biosensor specificity engineering for adipic acid detection
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.05.002
PMID:38817964
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研究论文 | 本研究通过计算方法改进了转录因子（TF）的特异性，使其能够检测己二酸 | 首次应用生物分子建模方法改变BenM的特异性，并分析突变如何影响其结构动力学 | NA | 开发一种计算引导的方法来工程化转录因子的特异性，以检测特定的分子 | 转录因子BenM及其对己二酸的特异性 | 合成生物学 | NA | 分子对接，分子动力学 | NA | 蛋白质结构 | 单个氨基酸替换 |
| 1858 | 2024-08-07 |
Recent advancements in mogrosides: A review on biological activities, synthetic biology, and applications in the food industry
2024-Aug-15, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2024.139277
PMID:38608607
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综述 | 本文综述了魔芋甘的生物活性、合成生物学进展及其在食品工业中的应用 | 探讨了合成生物学在降低魔芋甘生产成本方面的潜力，并介绍了最新的魔芋甘生物合成途径 | 主要挑战在于魔芋醇转化为多种魔芋甘的过程中，由于当前UDP-葡萄糖基转移酶（UGTs）的底物选择性差、产物特异性和催化效率低 | 综述魔芋甘的生物活性、合成生物学进展及其在食品工业中的应用 | 魔芋甘及其在食品工业中的应用 | NA | 糖尿病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1859 | 2024-08-07 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-Apr-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 本文综述了通过遗传电路设计实现代谢网络优化控制的方法 | 提出了一种新的方法来推断和设计遗传电路，以在动态条件下实现代谢网络的最大通量 | NA | 探讨如何通过遗传电路设计实现代谢网络的优化控制，并为合成生物学提供设计标准 | 遗传电路在代谢网络中的作用及其设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1860 | 2024-08-07 |
On the pursuit to reconstitute the Escherichia coli ribosome from purified components
2024-Apr-29, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvad121
PMID:38236695
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评论 | 本文讨论了从纯化组件中体外重建大肠杆菌核糖体的历史和最新进展 | Aoyama等人最近报道了使用33种重组核糖体蛋白重建50S核糖体，这是向使用重组蛋白和体外转录rRNA完全重建全核糖体复合体迈出的新一步 | 本文未提及具体限制 | 探讨体外重建核糖体的意义及其在生物技术和合成生物学中的潜在应用 | 大肠杆菌的核糖体 | NA | NA | 重组核糖体蛋白和体外转录rRNA | NA | NA | 33种重组核糖体蛋白 |