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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1881 | 2024-08-07 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了如何从非生命分子组装中产生生命系统,并通过人工重构最小合成细胞系统展示了递归生长和分裂周期 | 作者开发了基于囊泡系统的合成最小细胞,避免了使用生物细胞复杂的分子机制,并尝试以最简单的形式重新设计细胞 | NA | 探讨生物细胞与合成最小细胞在细胞概念上的异同,为合成生物学、人工细胞和原细胞研究领域的读者提供分子组装的见解 | 生物细胞与合成最小细胞的比较 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1882 | 2024-08-07 |
Advancing Engineered Plant Living Materials through Tobacco BY-2 Cell Growth and Transfection within Tailored Granular Hydrogel Scaffolds
2024-May-22, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c00338
PMID:38799669
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研究论文 | 本研究介绍了一种创新的方法,利用合成生物学和工程学的复杂相互作用,在定制的颗粒水凝胶支架内精确空间图案化和遗传转化烟草BY-2细胞系 | 本研究开发了一种3D生物打印技术,能够在定制的颗粒水凝胶支架内同时促进烟草BY-2细胞的生长和遗传转化,展示了EPLMs的独特结构和功能特性 | NA | 推动工程化植物活体材料的发展 | 烟草BY-2细胞系及其在定制水凝胶支架内的生长和转化 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA |
1883 | 2024-08-07 |
Bottom-up assembly of viral replication cycles
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33661-7
PMID:36323671
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review | 本文总结了通过自下而上的合成生物学方法构建病毒复制周期的途径及其伦理考量 | NA | NA | 探讨如何通过自下而上的合成生物学方法研究传染病 | 病毒复制周期 | 合成生物学 | 传染病 | NA | NA | NA | NA |
1884 | 2024-08-07 |
Design Automation in Synthetic Biology
2017-Apr-03, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a023978
PMID:28246188
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综述 | 本文综述了合成生物学中的生物设计自动化(BDA)工具,涵盖设计、构建、测试和学习等领域的软件工具,并详细介绍了这些工具的功能及其在合成遗传调控网络中的应用 | NA | NA | 探讨合成生物学中生物设计自动化工具的应用 | 生物设计自动化工具及其在合成遗传调控网络中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1885 | 2024-08-07 |
A de novo protein confers copper resistance in Escherichia coli
2016-07, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.2871
PMID:26748884
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法设计了一种全新的蛋白质,该蛋白质能够使大肠杆菌在铜浓度较高的环境中生存 | 首次证明生物系统能够利用非自然来源的全新蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | NA | 探讨生物系统是否能利用非生物来源的蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | 大肠杆菌及一种名为Construct K (ConK)的全新蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计 | NA | DNA序列 | 约1.5 × 10(6)个二元模式的新蛋白质编码DNA序列 |
1886 | 2024-08-07 |
The fed-batch principle for the molecular biology lab: controlled nutrient diets in ready-made media improve production of recombinant proteins in Escherichia coli
2016-Jun-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-016-0513-8
PMID:27317421
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综述 | 本文综述了在分子生物学和生物化学实验室中应用分批补料原理,通过预制的培养基实现对营养物质的控制,从而提高大肠杆菌中重组蛋白产量的最新进展和应用 | 介绍了新的预制生长培养基,通过生物催化释放葡萄糖从聚合物中,为摇瓶和摇板培养提供了一种简单的分批补料解决方案 | NA | 探讨分批补料技术在实验室规模重组蛋白生产中的应用及其对细胞密度和蛋白产量的影响 | 大肠杆菌中的重组蛋白生产 | 分子生物学 | NA | 分批补料技术 | NA | NA | NA |
1887 | 2024-08-07 |
ssDNA and the Argonautes: The Quest for the Next Golden Editor
2016-06, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2016.071
PMID:27230540
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研究论文 | 本文探讨了基于单链DNA(ssDNA)的Argonaute(NgAgo)在基因编辑中的应用 | NgAgo作为一种新的基因编辑工具,使用24碱基的5'磷酸化ssDNA进行DNA靶向,具有高特异性和潜在的更易获取的基因编辑系统 | NA | 探索和开发新的基因编辑工具 | Argonaute(NgAgo)及其在基因编辑中的应用 | 基因编辑 | NA | 基因编辑技术 | NA | DNA | NA |
1888 | 2024-08-07 |
Identification and use of an alkane transporter plug-in for applications in biocatalysis and whole-cell biosensing of alkanes
2014-Jul-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep05844
PMID:25068650
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研究论文 | 本文展示了Pseudomonas putida GPo1中的AlkL蛋白作为烷烃转运蛋白,在工业相关速率下摄取C7-C16正烷烃的能力,并通过共表达AlkL作为转运插件,显著提高了生物氧化和烷烃生物传感器的特定产量。 | 首次展示了AlkL蛋白直接促进C10-C16烷烃的增强摄取,并实现了由此带来的最高报告产品产量增益。 | AlkL蛋白在过量表达时对宿主有毒性,需要通过可控诱导的载体来表达以避免负面影响。 | 探索和优化全细胞设备在合成生物学和生物催化中的应用,特别是分子摄取过程。 | AlkL蛋白作为烷烃转运蛋白的功能及其在生物转化和生物传感器激活中的应用。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1889 | 2024-08-07 |
Enzyme-assisted high throughput sequencing of an expanded genetic alphabet at single base resolution
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48408-9
PMID:38744910
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研究论文 | 本文报道了一种酶辅助的扩展遗传字母序列(ESEGA)方法,用于在单碱基分辨率下测序六字母的AEGIS DNA | 开发了一种新的酶辅助序列方法ESEGA,用于测序扩展的遗传字母DNA,并展示了其在优化条件下的六核苷酸PCR中的应用 | NA | 开发适用于扩展DNA的分析工具,以支持其在生物技术中的进一步应用 | 扩展的遗传字母DNA(AEGIS DNA)及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 酶辅助序列方法(ESEGA) | NA | DNA序列 | 涉及六核苷酸PCR的优化条件及多种DNA聚合酶的保真性评估 |
1890 | 2024-08-07 |
N-Terminal Amino Acid Affects the Translation Efficiency at Lower Temperatures in a Reconstituted Protein Synthesis System
2024-May-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105264
PMID:38791303
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研究论文 | 研究了N端氨基酸序列对基于PURE系统的蛋白质合成效率的影响,特别是在低温条件下 | 发现N端单个氨基酸替换显著改变了PURE系统中的翻译效率,尤其是在低温条件下 | NA | 探讨N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白质合成系统 | NA | 氨基酸序列 | NA |
1891 | 2024-08-07 |
Is Life Binary or Gradual?
2024-Apr-27, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life14050564
PMID:38792586
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研究论文 | 本文探讨了生命本质的二元性和非二元性概念,特别是在微生物学、病毒学、合成生物学和系统化学等领域中,中间实体对生命与非生命简单分类的挑战 | 提出生命可能是一个渐进的光谱,而非简单的二元区分 | 目前科学状态下,是否存在一个明确的界限仍未确定 | 探索生命的定义及其在生命起源研究和天体生物学中的应用 | 生命的本质及其分类 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1892 | 2024-08-07 |
Characterizing Strain Variation in Engineered E. coli Using a Multi-Omics-Based Workflow
2016-05-25, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.04.004
PMID:27211860
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研究论文 | 本文介绍了一种整合代谢组学、蛋白质组学和基因组规模模型的流程,用于研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 该流程结合了计算系统生物学、代谢工程和合成生物学的互补方法,提供了宿主微环境因途径工程而变化的分子见解,并展示了如何利用与菌株变异相关的生物机制作为提高产品产量的工程策略 | NA | 理解异源和原生生化途径之间的复杂相互作用 | 研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 代谢工程 | NA | 代谢组学、蛋白质组学 | 基因组规模模型 | 代谢组学数据、蛋白质组学数据 | 分析了八种工程菌株,生产三种生物燃料:异戊二醇、柠檬烯和双环烯 |
1893 | 2024-08-07 |
CRISPR-mediated control of the bacterial initiation of replication
2016-05-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw214
PMID:27036863
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR/dCas9结合复制起始位点来控制细菌细胞周期的新系统 | 首次展示了CRISPR/dCas9结合复制起始位点可以精确控制细菌染色体的复制起始,并发现提高温度可以解除这种抑制作用 | NA | 开发一种简单且稳健的方法来控制细菌细胞周期,为合成生物学和DNA复制研究提供工具 | 细菌细胞周期和DNA复制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9 | NA | NA | NA |
1894 | 2024-08-07 |
Towards self-assembled hybrid artificial cells: novel bottom-up approaches to functional synthetic membranes
2015-Sep-01, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.201501229
PMID:26149747
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研究论文 | 本文探讨了利用自下而上的方法开发合成细胞,特别是通过功能化合成膜与生物系统的整合来构建“混合”人工细胞的最新进展和现状 | 研究通过控制高度有序的膜结构的自组装,精确模拟活细胞的结构和/或功能,为合成生物学提供了新的合成底盘 | NA | 深入理解生命系统的本质,探索细胞生命的起源,并为合成生物学的发展提供新的合成底盘 | 混合人工细胞及其合成膜的构建和功能 | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 膜结构 | NA |
1895 | 2024-08-07 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-May-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
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研究论文 | 构建了一个基于网络的植物合成生物学数据库(PSBD),用于分类和提供植物合成生物学研究中的生物部件和化学物质信息 | PSBD数据库整合了1677个催化生物部件和384个调控元件,并提供了在线生物信息学工具,以辅助植物基因表达的合理设计 | NA | 开发一个集成且用户为中心的平台,为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物部件和化学物质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 1677个催化生物部件,384个调控元件,309个物种,850种化学物质 |
1896 | 2024-08-07 |
Integrated (Meta) Genomic and Synthetic Biology Approaches to Develop New Biocatalysts
2016-Mar-21, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md14030062
PMID:27007381
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综述 | 本文综述了利用(元)基因组学和合成生物学方法开发新型生物催化剂的研究进展 | 结合基因组学序列分析和合成分子生物学的发展,加速发现和改进新一代海洋生物催化剂 | NA | 探讨如何利用基因组学和合成生物学技术加速新型海洋生物催化剂的发现和改进 | 海洋环境中的生物活性化合物和生物催化剂 | 生物技术 | NA | 基因组学, 合成生物学 | NA | 序列数据 | NA |
1897 | 2024-08-07 |
Smart DNA Fabrication Using Sound Waves: Applying Acoustic Dispensing Technologies to Synthetic Biology
2016-Feb, Journal of laboratory automation
DOI:10.1177/2211068215593754
PMID:26163567
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研究论文 | 本文首次将声波喷射技术应用于合成生物学领域,用于纳米级规模的DNA合成和组装 | 成功将PCR和流行的Golden Gate及Gibson组装方法从微升级别缩小到纳米级别,显著降低了试剂成本 | NA | 探索声波喷射技术在合成生物学中的应用,特别是在DNA合成和组装方面 | 声波喷射技术在DNA合成和组装中的应用 | 合成生物学 | NA | 声波喷射技术 | NA | NA | NA |
1898 | 2024-08-07 |
Predicting complex phenotype-genotype interactions to enable yeast engineering: Saccharomyces cerevisiae as a model organism and a cell factory
2013-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201300138
PMID:24031036
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综述 | 本文综述了利用系统生物学、合成生物学和进化工程工具来解释基因型与表型之间复杂关系的研究进展,并探讨了其在酵母工程和药物筛选中的应用 | 本文提出通过改进对复杂基因型-表型相互作用的理解和预测,可以更有效地进行酵母工程和药物筛选 | 环境因素对基因型-表型关系的影响增加了研究的复杂性,目前仍存在理解细胞机制的挑战 | 旨在通过揭示基因型与表型之间的复杂关系,促进生物医学和生物技术领域的应用 | 研究对象为酵母Saccharomyces cerevisiae,作为模型生物和生产生物 | 生物技术 | NA | 系统生物学、合成生物学、进化工程 | NA | NA | NA |
1899 | 2024-08-07 |
Advances and perspectives in genetic expression and operation for the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.05.003
PMID:38784195
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综述 | 本文综述了油脂酵母Yarrowia lipolytica在遗传表达和操作方面的最新进展,特别是基因表达、染色体操作、基于CRISPR的工具和动态生物传感器 | 介绍了合成生物学在开发新型细胞工厂方面的新机遇 | NA | 为开发微生物工厂提供有价值的参考 | 油脂酵母Yarrowia lipolytica的遗传表达和操作 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
1900 | 2024-08-07 |
Special issue: Manipulation/regulation of secondary metabolites in medicinal plants
2024-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108549
PMID:38538457
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特刊 | 本特刊汇集了多篇原创研究文章和综述,旨在揭示药用植物中次生代谢物生物合成的复杂调控机制 | 利用基因组学、代谢组学和微生物组表征等尖端技术,探索药用植物中次生代谢物的生物合成、调控和操纵 | NA | 揭示药用植物中次生代谢物生物合成的调控机制,并探索优化其生产的方法 | 药用植物中的次生代谢物 | NA | NA | 基因组学、代谢组学、微生物组表征 | NA | NA | NA |