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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2024-08-07 |
Simulation and experimental study of a cold atmospheric pressure plasma and comparison of efficiency in boosting recombinant Endoglucanase II production in Pichia pastoris
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303795
PMID:38771745
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研究论文 | 本研究探讨了冷大气压等离子体(CAP)处理对Pichia pastoris中重组内切葡聚糖酶II(EgII)生产效率的影响 | 本研究首次比较了两种不同点火模式(正弦交流电AC和脉冲直流电DC)对蛋白分泌效率的影响,并使用COMSOL软件模拟了等离子体功能 | 细胞工程改善分泌通常是一种试错方法,且改进至少部分特定于所生产的蛋白质 | 研究冷大气压等离子体处理对重组内切葡聚糖酶II生产效率的影响 | 重组内切葡聚糖酶II(EgII)在Pichia pastoris中的生产效率 | 生物工程 | NA | 冷大气压等离子体(CAP) | NA | 光学光谱 | NA |
82 | 2024-08-07 |
Triazole-linked Nucleic Acids: Synthesis, Therapeutics and Synthetic Biology Applications
2024, Current organic synthesis
IF:1.7Q3
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研究论文 | 本文探讨了三氮唑连接的核酸,其中三氮唑连接(TL)取代了天然的磷酸骨架,并详细讨论了两种三氮唑连接(TL1和TL2)及其在治疗和合成生物学中的广泛应用。 | 介绍了三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的新应用,如在反义寡核苷酸(ASO)、小干扰RNA(siRNA)和CRISPR-Cas9技术中的应用。 | NA | 探索三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的应用潜力。 | 三氮唑连接的核酸及其在治疗和合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | 三氮唑连接技术 | NA | 核酸 | 功能性300-mer DNA和335碱基对基因的变体 |
83 | 2024-08-07 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
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研究论文 | 本文介绍了利用农杆菌介导的瞬时表达技术在烟草中快速开发萜类化合物合成途径并将其生物合成过程分隔在叶绿体、细胞质或脂滴表面的方法 | 本文采用农杆菌介导的瞬时表达技术,实现了重组和修饰酶的多重表达,并通过合成生物学方法在亚细胞水平上分隔萜类化合物的生物合成 | NA | 探索和工程化更复杂的途径以生产具有商业价值的化学品,如萜类化合物 | 植物中的萜类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA |
84 | 2024-08-07 |
Repeated Decision Stumping Distils Simple Rules from Single-Cell Data
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0613
PMID:38170180
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为重复决策树桩(ReDX)的方法,用于从单细胞数据中提取简单模型 | 提出了一种新的方法重复决策树桩(ReDX),通过构建深度为一的决策树来识别驱动细胞命运转换的基因产物,无需先验知识 | NA | 开发一种方法从单细胞数据中提取简单模型,以识别关键的基因产物 | 单细胞数据中的基因产物 | 机器学习 | NA | 决策树 | 决策树桩 | 单细胞数据 | 不同子样本的实验数据 |
85 | 2024-08-07 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了如何从非生命分子组装中产生生命系统,并通过人工重构最小合成细胞系统展示了递归生长和分裂周期 | 作者开发了基于囊泡系统的合成最小细胞,避免了使用生物细胞复杂的分子机制,并尝试以最简单的形式重新设计细胞 | NA | 探讨生物细胞与合成最小细胞在细胞概念上的异同,为合成生物学、人工细胞和原细胞研究领域的读者提供分子组装的见解 | 生物细胞与合成最小细胞的比较 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
86 | 2024-08-07 |
Regulatory microRNAs and phasiRNAs of paclitaxel biosynthesis in Taxus chinensis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1403060
PMID:38779066
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研究论文 | 本文系统地鉴定了990个转录因子(TFs)、460个微小RNAs(miRNAs)和160个相位小干扰RNAs(phasiRNAs),并探讨了它们在紫杉醇合成中的相互作用和潜在调控作用。 | 本文通过共表达网络分析推断调控TFs,并构建了包括酶基因、TFs、miRNAs和phasiRNAs的调控网络,揭示了紫杉醇生产在转录后水平的层级调控。 | NA | 研究紫杉醇合成的转录和转录后调控机制,以促进通过组织/细胞培养方法提高紫杉醇产量。 | 紫杉醇的生物合成机制及其调控因子。 | NA | 抗癌活性 | NA | NA | 基因表达数据 | 990个转录因子,460个微小RNAs,160个相位小干扰RNAs |
87 | 2024-08-07 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
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研究论文 | 本文介绍了BarMap-QA管道的开发,用于评估共转录折叠模拟的质量,并通过一个详细的例子展示了其应用。 | 开发了用户友好的BarMap-QA管道,用于克服原始BarMap软件在特定场景如共转录折叠中的使用难度。 | 原始的BarMap软件在特定场景如共转录折叠中使用困难。 | 验证设计构造的功能性,避免昂贵的实验室实验。 | 共转录RNA折叠模拟的质量评估。 | NA | NA | BarMap方法 | Markov过程 | RNA二级结构 | 一个合成转录调控的riboswitch |
88 | 2024-08-07 |
Modern Approaches to de novo Synthesis of Extended DNA Fragments: Assembly of a Wide Repertoire of Sequences
2024 Jan-Mar, Acta naturae
IF:2.0Q4
DOI:10.32607/actanaturae.27362
PMID:38738632
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研究论文 | 本文提出了一种用于合成更广泛序列的DNA片段组装方法,并优化了组装条件 | 本文优化了DNA片段组装的条件,使其适用于更广泛的序列合成 | NA | 标准化合成生物学中DNA片段组装方法 | DNA片段的合成与组装 | 合成生物学 | NA | 化学合成寡核苷酸 | NA | DNA序列 | NA |
89 | 2024-08-07 |
Recent advances in CAR T-cell engineering using synthetic biology: Paving the way for next-generation cancer treatment
2024, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2024.02.003
PMID:38762281
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review | 本章节全面探讨了癌症免疫治疗领域中的变革性创新,特别是合成生物学在提升CAR T细胞疗法安全性和有效性中的关键作用 | 强调了合成生物学在定制化CAR T细胞疗法中的应用,通过基因编辑、合成基因电路和分子工程等技术优化CAR T细胞功能 | NA | 探讨合成生物学在CAR T细胞疗法中的应用,以提高癌症治疗的安全性和效果 | CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | NA | cancer | 合成生物学 | NA | NA | NA |
90 | 2024-08-07 |
Computational analysis into the potential of azo dyes as a feedstock for actinorhodin biosynthesis in Pseudomonas putida
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299128
PMID:38437212
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研究论文 | 研究探讨了利用偶氮染料作为原料在铜绿假单胞菌中合成阿特拉津的可能性 | 首次探索了偶氮染料作为非传统原料在合成生物学中用于生产高价值化学品的可能性,并发现偶氮染料在阿特拉津生物合成中比葡萄糖更具优势 | NA | 探索和优化铜绿假单胞菌利用偶氮染料作为原料进行阿特拉津生物合成的能力 | 铜绿假单胞菌KT2440对偶氮染料的利用及其在阿特拉津生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 约束最小割集(cMCS)方法 | NA | 代谢通量分布 | NA |
91 | 2024-08-07 |
Efficient biosynthesis of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis via systematic engineering strategies
2024, Current research in food science
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.crfs.2024.100756
PMID:38736907
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研究论文 | 本研究通过系统工程策略在重组的smL2020菌株中高效合成转谷氨酰胺酶(TGase) | 通过多重工程策略,包括启动子工程、优化信号肽和重组位点以及增加表达盒的拷贝数,实现了TGase活性的显著提升,达到了迄今为止报道的最高水平 | NA | 提高转谷氨酰胺酶在食品工业中的应用范围 | 转谷氨酰胺酶的合成与应用 | 生物技术 | NA | 系统工程策略 | NA | 酶活性数据 | 1000升发酵罐 |
92 | 2024-08-07 |
OpenCell: A low-cost, open-source, 3-in-1 device for DNA extraction
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298857
PMID:38696375
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能,采用模块化附件和磁性连接,以及冗余安全特性 | NA | 解决预算有限的实验室进行高成本DNA提取的问题 | OpenCell设备及其在DNA提取中的应用 | 生物技术 | NA | DNA提取 | NA | DNA | 从Spinacia oleracea(菠菜)中成功分离DNA,平均产量为2.3 μg |
93 | 2024-08-07 |
Brief History of Placozoa
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_3
PMID:38668963
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研究论文 | 本文介绍了形态上最简单的自由生活动物——扁形动物门,并强调了其在理解动物组织起源和未来系统与合成生物学规则中的独特价值 | 扁形动物门为理解动物组织的起源和生命规则提供了独特的视角 | 尽管对扁形动物的研究已超过100年,但对其组织、自然栖息地和生活策略的了解仍然有限 | 介绍扁形动物门并强调其在拓宽生物医学科学前沿中的重要性 | 扁形动物的基因组基础、细胞身份、连接性、繁殖和行为的细胞基础 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
94 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach for the treatment of pollutants with microalgae
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1379301
PMID:38646010
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法通过微藻处理污染物的最新进展 | 合成生物学有望通过扩大处理目标范围和提高污染物去除率来增强基于微藻的技术 | 需要扩展工具,包括开发通用克隆工具包和适应更广泛的微藻物种的遗传工程工具 | 探讨合成生物学在微藻污染物去除中的应用 | 微藻及其在污染物去除中的作用 | NA | NA | CRISPR/Cas9, TALENs | NA | NA | NA |
95 | 2024-08-07 |
To be or not to be a cytochrome: electrical characterizations are inconsistent with Geobacter cytochrome 'nanowires'
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1397124
PMID:38633696
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研究论文 | 本文通过电学特性分析,对Geobacter细胞色素'纳米线'的身份进行了探讨 | 结合先前的结构计算和动力学分析,提出了至少需要约7条细胞色素'纳米线'来承载细胞的呼吸通量 | 文章指出先前的电学和光谱结构表征可能因实验伪影和样品杂质而不适用于已知的细胞色素纤维 | 阐明生理金属-微生物相互作用的机制,并推进合成生物学努力以优化这些相互作用 | Geobacter细胞色素的'纳米线' | 生物学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 电学和光谱数据 | NA |
96 | 2024-08-07 |
Large DNA fragment knock-in and sequential gene editing in Plasmodium falciparum: a preliminary study using suicide-rescue-based CRISPR/Cas9 system
2024-Jan, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04711-5
PMID:37004637
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研究论文 | 本文通过改进自杀-救援型CRISPR/Cas9系统,在恶性疟原虫中实现了大DNA片段的敲入和连续基因编辑 | 本文首次成功利用改进的自杀-救援型CRISPR/Cas9系统在恶性疟原虫中实现大DNA片段的敲入和连续基因编辑 | 连续基因插入的可行性需要进一步确认 | 提高恶性疟原虫基因编辑效率,深入理解基因功能,并促进基于活疟原虫的合成生物学策略和疫苗开发 | 恶性疟原虫 | 基因编辑 | 疟疾 | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | NA |
97 | 2024-08-07 |
Modular assembly of an artificially concise biocatalytic cascade for the manufacture of phenethylisoquinoline alkaloids
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44420-7
PMID:38167860
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研究论文 | 本文建立了一个人工简化的四酶生物催化级联系统,用于合成苯乙基异喹啉生物碱(PEIAs),避免了植物来源的P450修饰 | 通过酶发现和酶工程,实现了从易得底物高效合成多样化的天然和非天然PEIAs,并通过插拔策略替代了限速步骤的O-甲基化,实现了高产量的秋水仙碱前体(S)-秋水仙碱的规模化制备 | NA | 解决生物碱合成挑战,通过合成生物学构建更多人工生物催化级联系统,用于多样化生物碱的制造 | 苯乙基异喹啉生物碱(PEIAs)的合成 | 生物技术 | NA | 生物催化级联 | NA | NA | NA |
98 | 2024-08-07 |
Dipeptide coacervates as artificial membraneless organelles for bioorthogonal catalysis
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44278-9
PMID:38169470
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研究论文 | 本文报道了二肽凝聚物作为人工无膜细胞器用于生物正交催化的设计 | 设计了具有增强稳定性、生物相容性和疏水微环境的二肽凝聚物,促进了疏水物种的包封,提高了其在水环境中的催化效率 | 二肽凝聚物作为人工细胞器的应用受限于其复杂的分子结构、对内部微环境属性的有限控制和固有的胶体不稳定性 | 开发具有疏水微环境的凝聚物,为仿生材料领域在催化与合成生物学中的应用开辟新途径 | 二肽凝聚物及其在细胞内作为活性人工细胞器的应用 | 仿生材料 | NA | NA | NA | NA | NA |
99 | 2024-08-07 |
A toolbox for manipulating the genome of the major goat pathogen, Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae
2024-01, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001423
PMID:38193814
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研究论文 | 本文介绍了一种用于操作主要山羊病原体Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae基因组的工具箱 | 首次将合成生物学技术应用于Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae,实现了基因的同时克隆和工程化,以及基因敲除和Cre-lox重组系统的应用 | NA | 开发改进的疫苗以控制传染性山羊胸膜肺炎(CCPP) | Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae的基因组 | 合成生物学 | 传染性山羊胸膜肺炎 | CReasPy-Cloning, Cre-lox重组系统 | NA | 基因组序列 | NA |
100 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Approaches to Posttranslational Regulation in Plants
2024-Jan, Biochemistry. Biokhimiia
DOI:10.1134/S0006297924140165
PMID:38621756
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在翻译后水平调控植物代谢的最新进展及其未来方向 | 重点介绍了在翻译后水平控制植物遗传机制的方法,减少了对植物基因组的非靶向干扰效应 | NA | 探讨植物合成生物学在翻译后水平调控植物代谢的进展 | 植物合成生物学方法及其在功能基因组学和农业作物产量增加中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |