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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2024-08-07 |
RNAi-based Boolean gates in the yeast Saccharomyces cerevisiae
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1392967
PMID:38895554
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研究论文 | 本研究设计并构建了基于RNA干扰途径的布尔逻辑门,主要在酵母细胞中进行实验 | 首次在天然缺乏RNAi途径的酵母细胞中构建基于RNAi的布尔逻辑门 | RNAi基逻辑门对启动子泄漏高度敏感,实施难度较大 | 设计并构建布尔逻辑门以促进合成生物学中的生物传感器和生物计算 | 酵母细胞中的RNA干扰途径 | 合成生物学 | NA | RNA干扰 | 布尔逻辑门 | DNA片段 | 不同表达盒的siRNA前体 |
82 | 2024-08-07 |
Beyond the Organism versus Machine Dichotomy: A Review of Ethical Concerns in Synthetic Biology
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00456
PMID:38070167
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综述 | 本文对合成生物学领域的伦理和社会问题进行了系统性回顾和主题分析 | 探讨了合成生物学中的伦理问题,特别是关于生命操作和生物安全与生物安全的义务论和后果论问题 | 缺乏对实验室日常工作中合成生物学研究人员面临的伦理问题的系统研究 | 分析合成生物学中的伦理和社会问题 | 合成生物学领域的伦理和社会问题 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
83 | 2024-08-07 |
RNA Aptamer-Mediated Gene Activation Systems for Inducible Transgene Expression in Animal Cells
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00472
PMID:38073086
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研究论文 | 本文开发了一种基于RNA适配体的基因激活系统RAMGA,用于在动物细胞中诱导RNA触发的基因表达激活 | 该系统利用合成生物学策略,通过目标RNA连接DNA结合域和转录激活因子,实现对目标mRNA水平的检测和报告基因表达的调控,不影响原始mRNA编码基因的表达 | NA | 开发新的RNA触发基因表达系统,用于建立基因电路、评估内源基因表达和开发新型RNA检测器 | 动物细胞中的RNA表达分析 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | RNA | 重组CHO细胞 |
84 | 2024-08-07 |
A Sirtuin-Dependent T7 RNA Polymerase Variant
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00607
PMID:38117980
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研究论文 | 本文通过遗传密码扩展技术,将T7 RNA聚合酶催化核心中的赖氨酸(K631)替换为N-乙酰-L-赖氨酸(AcK),设计了一种依赖于NAD依赖性去乙酰化酶(sirtuins)的T7 RNA聚合酶变体。 | 该变体需要sirtuins的去乙酰化酶活性来恢复其酶活性,从而在活细胞(包括细菌和哺乳动物细胞)以及体外系统中维持sirtuin依赖的基因转录。 | NA | 探索通过转录调控控制合成生物学和生物工程中的生物过程的新方法。 | T7 RNA聚合酶变体及其在细胞中的转录调控作用。 | 生物工程 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | 包括细菌和哺乳动物细胞以及体外系统 |
85 | 2024-08-07 |
A Novel RNA Aptamer as Synthetic Inducer of DasR Controlled Transcription
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00553
PMID:38127784
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研究论文 | 本文研究了一种新型RNA适配体作为合成诱导DasR控制转录的工具 | 本文通过结合选择和后续筛选,成功选出了一种能够结合细菌抑制因子DasR的RNA适配体,从而激活DasR控制的转录,为合成生物学工具箱增加了新的调控层次 | NA | 开发新的合成电路工程工具,扩展合成生物学领域的应用 | RNA适配体及其在细菌抑制因子DasR控制转录中的应用 | 合成生物学 | NA | 下一代测序 | NA | RNA | NA |
86 | 2024-08-07 |
Cell-Penetrating Peptide Delivery of Nucleic Acid Cargo to Emiliania huxleyi, a Calcifying Marine Coccolithophore
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00670
PMID:38147049
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研究论文 | 本文研究了使用细胞穿透肽(CPP)将核酸货物递送到一种钙化的海洋颗石藻(Emiliania huxleyi)中 | 设计了一种包含高脯氨酸含量的CPP,并评估了其对颗石藻细胞的递送性能 | NA | 探索合成生物学在颗石藻生物矿化中的应用 | 海洋颗石藻(Emiliania huxleyi) | NA | NA | 细胞穿透肽(CPP) | NA | 合成肽核酸(PNA) | NA |
87 | 2024-08-07 |
Fine-Tuned Gene Expression Elements from Hybrid Promoter Libraries in Pichia pastoris
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00534
PMID:38150419
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研究论文 | 本文构建了一个梯度强度启动子库,通过随机杂交和高通量筛选,优化了Pichia pastoris中的基因表达组件。 | 通过构建和筛选新型杂交启动子,实现了基因表达水平的精细调控,并在生物技术生产中验证了其广泛应用性。 | NA | 优化Pichia pastoris中的基因表达组件,扩展其在代谢工程中的应用潜力。 | Pichia pastoris中的启动子和上游调控序列。 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个启动子和调控序列的变体。 |
88 | 2024-08-07 |
Plant Artificial Chromosomes: Construction and Transformation
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00555
PMID:38163256
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综述 | 本文综述了植物人工染色体的结构、构建方法及其在作物改良中的应用潜力 | 介绍了植物人工染色体技术在作物改良和基因功能研究中的进展 | 目前人工染色体技术在合成重复序列和转化大DNA片段方面仍存在局限 | 探讨如何通过人工染色体技术提高作物产量、品质和抗病性 | 植物人工染色体及其在农业革命中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工染色体技术 | NA | NA | NA |
89 | 2024-08-07 |
Cloning and sequencing analysis of whole Spiroplasma genome in yeast
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1411609
PMID:38881660
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研究论文 | 本文通过合成生物学技术,成功在酵母中克隆并测序了螺旋体细菌的全基因组 | 首次在酵母中成功克隆了与昆虫相关的螺旋体细菌的全基因组,并验证了克隆效率高且突变率低 | 文中未明确提及具体的局限性 | 探索在酵母中进行全基因组克隆和移植的可行性,以及其在合成生物学中的应用 | 螺旋体细菌的全基因组 | 合成生物学 | NA | Illumina测序 | NA | DNA序列 | 1.12 Mbp的全基因组 |
90 | 2024-08-07 |
The view of synthetic biology in the field of ethics: a thematic systematic review
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1397796
PMID:38863492
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综述 | 本文通过系统综述方法分析了2000年至2020年间合成生物学领域的伦理辩论,旨在确定伦理在合成生物学中的地位 | NA | NA | 确定伦理在合成生物学中的地位 | 合成生物学领域的伦理问题 | 生物技术 | NA | NA | NA | 文献 | 58篇出版物 |
91 | 2024-08-07 |
Comparative transcriptomic analysis revealed important processes underlying the static magnetic field effects on Arabidopsis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1390031
PMID:38863539
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研究论文 | 本研究通过比较转录组分析,探讨了静磁场对拟南芥生长和发育的影响及其分子机制 | 发现不均匀静磁场通过上调生长素合成和信号转导基因以及维持铁稳态来促进植物生长 | NA | 探究静磁场对植物生长和发育的影响及其分子机制 | 拟南芥 | 植物生物学 | NA | 比较转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
92 | 2024-08-07 |
Simulation and experimental study of a cold atmospheric pressure plasma and comparison of efficiency in boosting recombinant Endoglucanase II production in Pichia pastoris
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303795
PMID:38771745
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研究论文 | 本研究探讨了冷大气压等离子体(CAP)处理对Pichia pastoris中重组内切葡聚糖酶II(EgII)生产效率的影响 | 本研究首次比较了两种不同点火模式(正弦交流电AC和脉冲直流电DC)对蛋白分泌效率的影响,并使用COMSOL软件模拟了等离子体功能 | 细胞工程改善分泌通常是一种试错方法,且改进至少部分特定于所生产的蛋白质 | 研究冷大气压等离子体处理对重组内切葡聚糖酶II生产效率的影响 | 重组内切葡聚糖酶II(EgII)在Pichia pastoris中的生产效率 | 生物工程 | NA | 冷大气压等离子体(CAP) | NA | 光学光谱 | NA |
93 | 2024-08-07 |
Triazole-linked Nucleic Acids: Synthesis, Therapeutics and Synthetic Biology Applications
2024, Current organic synthesis
IF:1.7Q3
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研究论文 | 本文探讨了三氮唑连接的核酸,其中三氮唑连接(TL)取代了天然的磷酸骨架,并详细讨论了两种三氮唑连接(TL1和TL2)及其在治疗和合成生物学中的广泛应用。 | 介绍了三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的新应用,如在反义寡核苷酸(ASO)、小干扰RNA(siRNA)和CRISPR-Cas9技术中的应用。 | NA | 探索三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的应用潜力。 | 三氮唑连接的核酸及其在治疗和合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | 三氮唑连接技术 | NA | 核酸 | 功能性300-mer DNA和335碱基对基因的变体 |
94 | 2024-08-07 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
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研究论文 | 本文介绍了利用农杆菌介导的瞬时表达技术在烟草中快速开发萜类化合物合成途径并将其生物合成过程分隔在叶绿体、细胞质或脂滴表面的方法 | 本文采用农杆菌介导的瞬时表达技术,实现了重组和修饰酶的多重表达,并通过合成生物学方法在亚细胞水平上分隔萜类化合物的生物合成 | NA | 探索和工程化更复杂的途径以生产具有商业价值的化学品,如萜类化合物 | 植物中的萜类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA |
95 | 2024-08-07 |
Repeated Decision Stumping Distils Simple Rules from Single-Cell Data
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0613
PMID:38170180
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为重复决策树桩(ReDX)的方法,用于从单细胞数据中提取简单模型 | 提出了一种新的方法重复决策树桩(ReDX),通过构建深度为一的决策树来识别驱动细胞命运转换的基因产物,无需先验知识 | NA | 开发一种方法从单细胞数据中提取简单模型,以识别关键的基因产物 | 单细胞数据中的基因产物 | 机器学习 | NA | 决策树 | 决策树桩 | 单细胞数据 | 不同子样本的实验数据 |
96 | 2024-08-07 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了如何从非生命分子组装中产生生命系统,并通过人工重构最小合成细胞系统展示了递归生长和分裂周期 | 作者开发了基于囊泡系统的合成最小细胞,避免了使用生物细胞复杂的分子机制,并尝试以最简单的形式重新设计细胞 | NA | 探讨生物细胞与合成最小细胞在细胞概念上的异同,为合成生物学、人工细胞和原细胞研究领域的读者提供分子组装的见解 | 生物细胞与合成最小细胞的比较 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
97 | 2024-08-07 |
Regulatory microRNAs and phasiRNAs of paclitaxel biosynthesis in Taxus chinensis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1403060
PMID:38779066
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研究论文 | 本文系统地鉴定了990个转录因子(TFs)、460个微小RNAs(miRNAs)和160个相位小干扰RNAs(phasiRNAs),并探讨了它们在紫杉醇合成中的相互作用和潜在调控作用。 | 本文通过共表达网络分析推断调控TFs,并构建了包括酶基因、TFs、miRNAs和phasiRNAs的调控网络,揭示了紫杉醇生产在转录后水平的层级调控。 | NA | 研究紫杉醇合成的转录和转录后调控机制,以促进通过组织/细胞培养方法提高紫杉醇产量。 | 紫杉醇的生物合成机制及其调控因子。 | NA | 抗癌活性 | NA | NA | 基因表达数据 | 990个转录因子,460个微小RNAs,160个相位小干扰RNAs |
98 | 2024-08-07 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
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研究论文 | 本文介绍了BarMap-QA管道的开发,用于评估共转录折叠模拟的质量,并通过一个详细的例子展示了其应用。 | 开发了用户友好的BarMap-QA管道,用于克服原始BarMap软件在特定场景如共转录折叠中的使用难度。 | 原始的BarMap软件在特定场景如共转录折叠中使用困难。 | 验证设计构造的功能性,避免昂贵的实验室实验。 | 共转录RNA折叠模拟的质量评估。 | NA | NA | BarMap方法 | Markov过程 | RNA二级结构 | 一个合成转录调控的riboswitch |
99 | 2024-08-07 |
Modern Approaches to de novo Synthesis of Extended DNA Fragments: Assembly of a Wide Repertoire of Sequences
2024 Jan-Mar, Acta naturae
IF:2.0Q4
DOI:10.32607/actanaturae.27362
PMID:38738632
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研究论文 | 本文提出了一种用于合成更广泛序列的DNA片段组装方法,并优化了组装条件 | 本文优化了DNA片段组装的条件,使其适用于更广泛的序列合成 | NA | 标准化合成生物学中DNA片段组装方法 | DNA片段的合成与组装 | 合成生物学 | NA | 化学合成寡核苷酸 | NA | DNA序列 | NA |
100 | 2024-08-07 |
Recent advances in CAR T-cell engineering using synthetic biology: Paving the way for next-generation cancer treatment
2024, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2024.02.003
PMID:38762281
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review | 本章节全面探讨了癌症免疫治疗领域中的变革性创新,特别是合成生物学在提升CAR T细胞疗法安全性和有效性中的关键作用 | 强调了合成生物学在定制化CAR T细胞疗法中的应用,通过基因编辑、合成基因电路和分子工程等技术优化CAR T细胞功能 | NA | 探讨合成生物学在CAR T细胞疗法中的应用,以提高癌症治疗的安全性和效果 | CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | NA | cancer | 合成生物学 | NA | NA | NA |