合成生物学相关文章
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当前共找到 193 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-07 |
Coiled-Coil Interaction Toolbox for Engineering Mammalian Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_3
PMID:38441756
|
研究论文 | 本文介绍了用于哺乳动物细胞工程的卷曲螺旋（CC）肽设计工具箱及其在构建哺乳动物细胞中CC介导的逻辑电路的协议 | 卷曲螺旋肽作为调节蛋白质-蛋白质相互作用的独特有效工具，其结合特异性和亲和力可以被设计和控制 | NA | 开发用于合成生物学工具的卷曲螺旋肽，以调节蛋白质相互作用 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 卷曲螺旋肽设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-07 |
Mechanistic Model-Driven Biodesign in Mammalian Synthetic Biology
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_6
PMID:38441759
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综述 | 本文综述了数学模型在哺乳动物合成生物学中的应用，包括设计优化电路和工程生物过程，预测行为，以及指导实验设计 | 讨论了基因组规模模型、机器学习和网络遗传学在扩展模型驱动哺乳动物细胞生物设计能力中的机会 | NA | 探讨数学模型在哺乳动物合成生物学中的应用及其未来发展 | 哺乳动物合成生物学中的数学模型 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-07 |
A Directed Evolution Protocol for Engineering Minimal Transcription Factors, Based on CIS Display
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_1
PMID:38441754
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CIS展示的定向进化方法，用于从非结合蛋白池中高效筛选功能性DNA结合蛋白 | 首次使用CIS展示技术筛选DNA结合蛋白，该技术避免了传统的克隆步骤，允许更大的文库规模 | 目前仅在筛选最小转录因子Cro中进行了验证，尚未广泛应用于其他DNA结合蛋白或转录因子的工程化 | 开发一种新的定向进化方法，用于高效筛选和工程化DNA结合蛋白 | DNA结合蛋白和转录因子 | 生物技术 | NA | CIS展示技术 | NA | DNA | 从低起始频率（1 in 10）中筛选最小转录因子Cro | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-07 |
A Computational Modeling Approach for the Design of Genetic Control Systems that Respond to Transcriptional Activity
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_8
PMID:38441761
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研究论文 | 本文介绍了一种基于预测数学模型的系统方法，用于指导基于基因活性的传感器的设计和构建 | 该方法通过敏感性分析和参数扫描的迭代，实现用户驱动的电路优化，提供了一种通用的工程化方法来制造感应和响应细胞 | NA | 设计并优化能够响应转录活性的遗传控制系统 | 遗传电路在哺乳动物细胞中的实现 | 合成生物学 | NA | 预测数学建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-07 |
A Mammalian-Based Synthetic Biology Toolbox to Engineer Membrane-Membrane Interfaces
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_4
PMID:38441757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于哺乳动物的合成生物学平台，用于在细胞间区域工程化功能性膜-膜界面 | 开发了一种新的合成生物学平台，利用一对二聚化蛋白在无细胞和细胞环境中工程化功能性膜-膜界面 | NA | 旨在为合成生物学家提供一个工具，用于工程化新的细胞间信号传导和通信系统 | 细胞间膜-膜界面及其在细胞过程中的功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | 二聚化蛋白 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-07 |
RNA Switches Using Cas Proteins
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_12
PMID:38441765
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研究论文 | 本文探讨了利用CRISPR-Cas系统中的Cas蛋白作为RNA结合蛋白（RBPs），通过在mRNA的5'UTR插入crRNA/sgRNA序列，实现基因翻译的可调控性 | 利用Cas蛋白的多样性作为触发蛋白，极大地扩展了合成生物学中的可用工具 | NA | 扩展哺乳动物细胞中可用的RNA结合蛋白数量，建立转录后调控电路 | CRISPR-Cas系统中的Cas蛋白及其在mRNA调控中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | 使用HEK293FT细胞作为示例 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-07 |
Detection of MicroRNAs Using Synthetic Toehold Switch in Mammalian Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_16
PMID:38441769
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研究论文 | 本文设计了一种新型合成脚趾开关，用于检测CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞中表达的外源和内源miRNAs | 首次设计和利用miRNA基的脚趾开关，特别是在真核翻译控制方面 | NA | 开发基于RNA的开关平台，用于报告细胞发展和疾病中的动态细胞机制 | miR-155和miR-21的检测 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 合成脚趾开关 | NA | RNA | CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-07 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序（scRNA-seq）在植物系统和合成生物学中的应用进展 | scRNA-seq技术能够揭示植物细胞层面上的高分辨率基因表达模式和细胞类型异质性，为植物系统设计和合成生物学提供新知识 | 目前scRNA-seq技术在植物中的应用仅限于少数物种，未来技术进步将降低成本并加速其在植物中的应用 | 探讨scRNA-seq在植物系统生物学和植物合成生物学研究中的应用，并讨论其挑战和机遇 | 植物系统和合成生物学 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 已应用于有限数量的植物物种，包括模型植物、农作物和生物能源作物 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-07 |
Engineering status of protein for improving microbial cell factories
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108282
PMID:37939975
|
综述 | 本文综述了通过工程化蛋白质状态来提高微生物细胞工厂效率的策略 | 总结了代谢蛋白质状态的工程化策略，包括蛋白质工程提高微生物催化效率、蛋白质修饰调节微生物代谢能力及蛋白质组装增强微生物合成能力 | 未提及具体限制 | 探讨通过工程化蛋白质状态来提高微生物细胞工厂的效率 | 微生物细胞工厂中的蛋白质状态 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-07 |
Artificial carbon assimilation: From unnatural reactions and pathways to synthetic autotrophic systems
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108294
PMID:38013126
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综述 | 本文综述了人工碳同化途径设计和人工自养菌株构建的代表性工作，并提出了基于现有研究结果和模式的可行设计方案 | 介绍了人工碳同化途径从理论到实践的进展，并提出了新的设计方案 | 仍需探索途径多样性、操作效率和宿主适应性 | 推动人工自养的发展和应用 | 人工碳同化途径和人工自养菌株 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-07 |
Utilization of gene manipulation system for advancing the biotechnological potential of halophiles: A review
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108302
PMID:38101552
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综述 | 本文综述了利用基因操作技术提升嗜盐菌在工业生物技术中的应用潜力 | 介绍了当前基因操作技术在嗜盐菌工业应用中的积极影响，并探讨了其在合成生物学等创新研究领域的前景 | 文中指出，有效的基因操作系统和基因编辑工具对于加速嗜盐菌工程化过程至关重要 | 探讨嗜盐菌基因操作工具包的扩展如何促进生物技术的发展及其在生产改进中的应用 | 嗜盐菌及其在工业生物技术中的应用 | 工业生物技术 | NA | 基因操作技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-07 |
Strategies for the biological production of ectoine by using different chassis strains
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108306
PMID:38157997
|
综述 | 本文综述了利用不同底盘菌株进行ectoine生物生产的策略 | 介绍了ectoine合成的代谢途径，并全面评估了野生型和基因改造菌株在ectoine生产中的应用 | NA | 提高ectoine生产的效率和简化生产过程 | ectoine的生物生产 | 合成生物学 | NA | 发酵工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-07 |
Synthetic biology enables mushrooms to meet emerging sustainable challenges
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1337398
PMID:38414763
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研究论文 | 本文综述了合成生物学在蘑菇培育和发酵中的应用，旨在解决日益增长的可持续性挑战 | 利用合成生物学策略，蘑菇在循环经济、人类健康、制药以及新兴领域如素食肉类、蘑菇基材料和污染治理中的应用潜力 | NA | 探讨合成生物学在蘑菇技术中的应用，强调其在未来的重要性和必要性 | 蘑菇及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-07 |
[Research progress on development and utilization of minor ginsenosides]
2024-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
综述 | 本文综述了次级人参皂苷的结构类型、药理活性、获取来源及转化途径，并提出了现有制备方法中存在的问题，探讨了未来的研究与利用前景 | 结合合成生物学方法，利用微生物作为宿主生产皂苷，为次级人参皂苷的工业化提供了新的可能性 | 目前研究主要集中在转化制备、工艺优化和药理活性，工业分析方面存在不足 | 总结次级人参皂苷的相关研究，提出存在的问题，并探讨未来的研究与利用前景，为提升其基础研究和推动工业化提供理论依据 | 次级人参皂苷的结构类型、药理活性、获取来源及转化途径 | NA | NA | 合成代谢工程方法 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-07 |
Mesoplasma florum: a near-minimal model organism for systems and synthetic biology
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1346707
PMID:38404664
|
研究论文 | 本文探讨了Mesoplasma florum作为一种近似最小模型生物在系统和合成生物学中的应用 | 首次发表Mesoplasma florum的基因组，并开发了多种分子工具和代谢模型，为未来的基因组工程和合成细胞设计提供了基础 | 由于技术限制和缺乏专用分子工具，该细菌的许多生物学特性长期未被研究 | 探索Mesoplasma florum在系统和合成生物学中的应用潜力 | Mesoplasma florum的基因组、调控元件、质粒开发、比较基因组学、转座子诱变等 | 系统和合成生物学 | NA | 基因组克隆、基因组移植、代谢模型开发 | NA | 基因组数据 | 单个细菌物种Mesoplasma florum | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-07 |
Nannochloropsis as an Emerging Algal Chassis for Light-Driven Synthesis of Lipids and High-Value Products
2024-Jan-24, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md22020054
PMID:38393025
|
综述 | 本文综述了Nannochloropsis作为新兴微藻底盘在光驱动合成脂质和高价值产品方面的应用现状和潜力 | 介绍了基因工具和合成生物学领域的最新进展，将Nannochloropsis转化为强大的生物工厂 | NA | 探讨Nannochloropsis在生物燃料和高价值产品生产中的应用潜力 | Nannochloropsis的培养、利用及其代谢途径 | 生物技术 | NA | 基因操作技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-07 |
A MoClo-Compatible Toolbox of ECF Sigma Factor-Based Regulatory Switches for Proteobacterial Chassis
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0025
PMID:38384496
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研究论文 | 本文展示了alpha变形菌作为植物相关合成生物学底盘的潜力，并识别了一组可在两种细菌宿主中使用的正交ECF基调控因子，用于创建2步延迟电路。 | 本文首次在alpha变形菌中应用ECF sigma因子作为正交调控元件，并提供了一个与Golden Gate (MoClo)克隆标准兼容的工具箱，以促进ECF基电路在不同物种中的构建。 | NA | 构建一个上下文无关且跨物种的ECF基工具箱，用于合成生物学应用。 | alpha变形菌和gamma变形菌中的ECF sigma因子调控元件。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate (MoClo)克隆 | NA | 基因电路 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-07 |
Efficient assembly of a synthetic attenuated SARS-CoV-2 genome in Saccharomyces cerevisiae using multi-copy yeast vectors
2024, Journal of genetics
IF:1.4Q4
PMID:38379228
|
研究论文 | 本文研究了在多拷贝酵母载体中高效组装合成减毒SARS-CoV-2基因组的方法 | 首次尝试在多拷贝载体中进行大型多片段组装，并开发了一套工具包，使研究人员能够在单拷贝和多拷贝载体之间无缝过渡 | NA | 评估在单拷贝和多拷贝载体系统中组装28 kb减毒SARS-CoV-2基因组的效率 | SARS-CoV-2减毒基因组的组装 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | DNA | 10个片段 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-07 |
Strategies on biosynthesis and production of bioactive compounds in medicinal plants
2024-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2023.01.007
PMID:38375043
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综述 | 本文总结了药用植物中天然产物生物合成和生产的策略与方法 | 介绍了基于多种“OMICS”技术的遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程和合成生物学在药用植物天然产物生物合成中的应用 | NA | 促进药用植物的保护和可持续利用 | 药用植物中的天然产物 | NA | NA | 遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-07 |
Use of Cas9 Targeting and Red Recombination for Designer Phage Engineering
2024-Jan, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.1007/s12275-024-00107-2
PMID:38300409
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研究论文 | 本文报道了一种直接的基因组工程方法，用于在模型细菌病原体铜绿假单胞菌中高效获得工程噬菌体 | 利用Streptococcus pyogenes Cas9和λRed重组系统开发了一种新的设计噬菌体工程方法 | NA | 开发一种高效的基因组工程方法，用于创建设计噬菌体 | 铜绿假单胞菌中的工程噬菌体 | 合成生物学 | NA | Cas9靶向和Red重组 | NA | 基因组数据 | 使用了铜绿假单胞菌PAO1菌株和温和噬菌体MP29 | NA | NA | NA | NA |