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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-04-27 |
Harnessing promoter elements to enhance gene editing in plants: perspectives and advances
2025-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14533
PMID:40013512
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综述 | 本文综述了利用启动子元件增强植物基因编辑的策略与进展 | 强调了组织/器官特异性及诱导型启动子在时空特异性基因编辑中的应用潜力,并探讨了合成生物学与生物信息学工具在启动子设计与优化中的创新应用 | 未涉及具体作物品种中启动子编辑的应用案例验证 | 提升植物基因编辑的精准性、效率与特异性以应对气候变化 | 植物基因编辑中的启动子调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因编辑(GE)、合成启动子设计、生物信息学分析 | NA | 基因组调控元件数据 | NA |
2 | 2025-04-27 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-Apr-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
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research paper | 本文综述了光遗传学在糖尿病管理中的应用,探讨了通过光激活工程细胞实现胰岛素分泌的技术 | 光遗传学作为一种新兴的合成生物学方法,能够通过光刺激精确控制细胞活动,为糖尿病管理提供了用户控制的激素分泌方式 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用,以实现光遗传学在临床上的全面应用 | 探讨光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力 | 胰腺和非胰腺来源的转基因细胞 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | 小鼠模型 |
3 | 2025-04-27 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-Apr-25, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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review | 本文综述了人类合成生物学领域的最新进展,特别是可编程基因调控控制工具的开发 | 强调了多层级基因表达控制工具的发展及其在治疗应用中的潜力 | NA | 探讨人类合成生物学在基因表达控制和细胞行为操纵方面的应用 | 人类细胞及其基因调控系统 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学技术 | NA | NA | NA |
4 | 2025-04-27 |
Marine Fungal Metabolites as Potential Antidiabetic Agents: A Comprehensive Review of Their Structures and Enzyme Inhibitory Activities
2025-Mar-26, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23040142
PMID:40278263
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review | 本文系统评估了来自66种海洋真菌菌株的181种生物活性化合物对糖尿病相关关键酶的抑制活性 | 强调了海洋真菌代谢物作为新型抗糖尿病药物的潜力,特别是其结构新颖性和多样化的作用机制 | 未来研究需要解决产量和提取方面的挑战 | 评估海洋真菌代谢物作为抗糖尿病药物的潜力 | 181种来自66种海洋真菌菌株的生物活性化合物 | 药物发现 | 糖尿病 | 酶抑制活性测试 | NA | 化合物结构数据 | 181种化合物来自66种海洋真菌菌株 |
5 | 2025-04-27 |
Producing multiple chemicals through biological upcycling of waste poly(ethylene terephthalate)
2025-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.10.018
PMID:39581772
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研究论文 | 本文描述了开发用于Rhodococcus jostii RPET菌株的遗传工具,以从废弃PET瓶中生产多种化学品 | 开发了针对非模式微生物RPET的遗传工具,包括可诱导和可滴定表达系统以及基于丝氨酸整合酶的重组工具,用于基因组编辑,实现了从废弃PET瓶中生产多种化学品 | 缺乏专门为非模式微生物设计的合成生物学工具,限制了微生物细胞工厂的开发 | 开发可持续生产多样化化学品的塑料升级回收方法 | Rhodococcus jostii RPET菌株和废弃PET瓶 | 合成生物学 | NA | 遗传工程、基因组编辑 | NA | NA | NA |
6 | 2025-04-27 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-Mar, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文全面综述了玉米中氮素吸收、同化和再分配的遗传与分子调控机制,重点探讨了关键基因和代谢途径在提高氮素利用效率(NUE)中的作用 | 整合了根际微生物组对NUE的影响以及植物-微生物互作调控玉米NUE的复杂机制,并倡导利用遗传多样性和合成生物学的综合研究方法 | 未涉及具体田间试验数据验证相关分子机制的实际应用效果 | 阐明玉米氮素利用效率的遗传与分子机制,为可持续农业提供理论依据 | 玉米植株的氮素代谢过程及相关基因/蛋白 | 植物分子生物学 | NA | 高通量微生物组研究技术 | NA | 分子生物学数据 | NA |
7 | 2025-04-27 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2025-Feb-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
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综述 | 本文综述了合成生物分子凝聚物的最新进展,包括其相分离控制、细胞模拟建模及其在生物医学中的潜在应用 | 合成凝聚物通过动态相分离控制模拟自然生物分子凝聚物的生物物理原理和动态特征,为细胞过程和复杂生物途径的调控提供了新见解 | NA | 探索合成凝聚物在合成生物学、材料科学和生物医学中的应用潜力 | 合成共聚物液滴及其在细胞模拟建模和活性材料工程中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
8 | 2025-04-27 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNIPR的合成受体平台,能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能,用于疾病感知和细胞间通讯 | 开发了可被天然和合成可溶性因子激活的SNIPR受体平台,具有低基线活性和高倍数激活特性,并通过内吞和pH依赖性切割机制实现功能 | 目前仅在小鼠模型中验证了其治疗潜力,尚未进行人体临床试验 | 开发模块化合成受体以增强工程化治疗细胞的调控能力 | 合成受体(SNIPR)和CAR-T细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学技术、CAR-T细胞技术 | SNIPR受体平台 | NA | NA |
9 | 2025-04-27 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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研究论文 | 介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的遗传编码工具,用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列,发现聚苏氨酸丙氨酸(poly-TA)因其在任意选择的浓度阈值下形成淀粉样蛋白样组装体的独特能力而成为理想候选 | 未提及具体限制 | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系 | 蛋白质浓度阈值 | 合成生物学 | NA | 遗传编码工具 | NA | NA | NA |
10 | 2025-04-27 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2025-Jan, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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research paper | 该研究揭示了丹参根皮层细胞中ABC转运蛋白SmABCG1介导丹参酮类化合物输出的机制 | 首次发现ABC转运蛋白SmABCG1参与丹参酮IIA和丹参酮I的外排,并揭示了其与二萜生物合成基因簇的基因组位置关系 | 研究主要基于丹参毛状根系统,尚未在完整植株中验证转运机制 | 探究植物次生代谢产物丹参酮的转运机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根皮层细胞及其产生的丹参酮类化合物 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、异源表达(非洲爪蟾卵母细胞系统) | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 丹参毛状根培养系统 |
11 | 2025-04-26 |
Synthetic Forms Most Beautiful: Engineering Insights into Self-Organization
2025-Jul-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00064.2024
PMID:39938118
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research paper | 探讨合成生物学在构建新生命系统中如何扩展我们对生命自组织基本设计原则的理解 | 提出在生物活动中施加长度或时间尺度是自组织在进化系统中的基本策略,并指出这是当前合成生物学在各个尺度上实现的关键设计目标 | NA | 探索生命自组织的根本设计原则 | 生命系统,从细胞到有机体水平 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
12 | 2025-04-26 |
Harnessing flavonoids to control probiotic function: in situ application of a naringenin-responsive genetic circuit
2025-Apr-25, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02890-24
PMID:40277392
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research paper | 该研究开发了一种基于柚皮素响应的遗传电路,用于增强益生菌的功能,并在小鼠肠道中进行了应用测试 | 首次在宿主-微生物条件下应用黄酮类化合物响应的遗传电路,展示了通过外部化合物给药编程益生菌表型的潜力 | 需要评估更低剂量的柚皮素和富含柚皮素的食物作为替代输入 | 通过合成生物学方法增强益生菌的功能 | 益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN)和小鼠肠道 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | 生物发光数据 | 小鼠实验 |
13 | 2025-04-26 |
Removing redundancy of the NCN codons in vitro for maximal sense codon reassignment
2025-Apr-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06740a
PMID:40271033
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研究论文 | 本文探讨了通过消除NCN密码子的冗余性来实现最大程度的意义密码子重新分配 | 提出了一种评估密码子重新分配潜力的通用方法,并将16个密码子分配给10种不同的氨基酸,显著提高了编码潜力 | NA | 扩展遗传密码以增强合成生物学、蛋白质功能研究和多样化肽库创建的能力 | NCN密码子和相关tRNA | 合成生物学 | NA | 体外实验 | NA | NA | NA |
14 | 2025-04-26 |
Regulatory and retrograde signaling networks in the chlorophyll biosynthetic pathway
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13837
PMID:39853950
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研究论文 | 本文综述了叶绿素生物合成途径中的调控和逆行信号网络 | 深入探讨了叶绿素合成中的调控机制,包括TBS酶的活性和稳定性控制、TBS途径的转录和翻译后调控,以及叶绿体到细胞质和细胞核的逆行信号传导 | NA | 研究叶绿素生物合成途径的调控机制及其在合成生物学和农业中的应用潜力 | 植物、藻类和光合细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
15 | 2025-04-26 |
Leveraging the versatile properties of bacterial spores in materials
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.018
PMID:39472253
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综述 | 本文综述了基于细菌孢子的材料的最新进展,并讨论了开发高性能、时间和成本效益高的孢子基材料的未来挑战 | 利用细菌孢子的休眠和抗恶劣条件特性,克服了传统工程活材料(ELMs)寿命短和需要冷链物流的缺点 | 未提及具体的实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探讨细菌孢子在材料科学中的应用及其未来发展方向 | 细菌孢子及其在材料中的应用 | 材料科学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
16 | 2025-04-26 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
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research paper | 提出了一种通过从线性模型分析中推断非线性Hill函数型模型的动力学参数的反向工程方法,以设计实现完美适应的生物控制器 | 结合线性系统理论和非线性建模,设计能够实现完美适应的基因电路 | 理论分析在保证非线性模型(如Hill函数)的控制器特性方面仍具挑战性 | 为合成生物学设计具有完美适应能力的生物控制器 | 生物网络基序控制器 | synthetic biology | NA | reverse engineering, Hill function-type models | linear models, nonlinear models | simulation data | three biological network motif-based controllers |
17 | 2025-04-26 |
Microbial Transcription Factor-Based Biosensors: Innovations from Design to Applications in Synthetic Biology
2025-Mar-31, Biosensors
DOI:10.3390/bios15040221
PMID:40277535
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综述 | 本文综述了基于转录因子的微生物生物传感器在合成生物学中的设计创新与应用 | 探讨了转录因子生物传感器在灵敏度、特异性和动态范围方面的最新进展,以及计算工具如Cello在复杂遗传电路设计中的应用 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要集中于理论和技术发展的综述 | 探索转录因子生物传感器在合成生物学和工业生物技术中的应用及其未来发展 | 微生物生物传感器及其在代谢工程和适应性进化中的应用 | 合成生物学 | NA | 转录因子生物传感器技术、计算工具Cello | NA | NA | NA |
18 | 2025-04-26 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
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综述 | 本文综述了叶绿体在植物生长、发育和防御机制中的多面性作用,以及其在应对全球农业挑战中的核心地位 | 独特整合了叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学的最新进展,提出了优化植物生长和胁迫耐受的整体视角 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于文献综述 | 探讨叶绿体在植物生长与防御平衡中的调控作用,以及其在可持续农业中的应用潜力 | 叶绿体及其在植物中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学)、合成生物学、纳米技术 | NA | 组学数据 | NA |
19 | 2025-04-26 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
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research paper | 介绍了一个名为BioTRY的综合知识库,用于收集生物合成的滴度、速率和产量(TRY)数据 | BioTRY是首个可用的生物合成TRY数据数据库,包含超过52,000条TRY条目 | NA | 评估发酵过程的经济可行性,并帮助研究人员和决策者了解生物合成的发展现状 | 生物合成的滴度、速率和产量(TRY)数据 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物合成数据 | >5,000种生化物质和>3,800种菌株,以及超过52,000条TRY条目 |
20 | 2025-04-26 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
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研究论文 | 该研究利用合成模块化方法在植物中合成动物来源的氨基酸衍生物,以增强植物性饮食的营养价值 | 利用合成模块化框架在植物中成功合成通常仅存在于动物中的肌酸、肌肽和牛磺酸,展示了植物作为可持续生物工厂的潜力 | 引入牛磺酸模块意外抑制了植物半胱氨酸的生物合成,揭示了引入外源途径可能导致的复杂代谢调整 | 开发可持续且环保的方法,通过植物合成动物来源的氨基酸衍生物以增强植物性饮食的营养价值 | 植物代谢途径及动物来源的氨基酸衍生物(肌酸、肌肽和牛磺酸) | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | NA | NA |