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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-10-03 |
KDBI-RP: Kinetic Data of RNA-Protein Interactions Database
2025-Nov-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169357
PMID:40716733
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研究论文 | 介绍专门针对RNA-蛋白质相互作用动力学的数据库KDBI-RP | 首个专注于RNA-蛋白质相互作用动力学的专用数据库,提供全面的动力学常数和注释信息 | 未提及具体的数据覆盖范围限制或数据质量限制 | 建立RNA-蛋白质相互作用动力学数据库以满足RNA中心动力学研究需求 | RNA-蛋白质相互作用及其动力学数据 | 生物信息学 | NA | 数据库构建与数据整合 | NA | 动力学数据、序列数据、结构数据 | 包含3657个结合速率常数条目、3761个解离速率常数条目和175,932个平衡解离常数条目 |
2 | 2025-10-03 |
AI-directed gene fusing prolongs the evolutionary half-life of synthetic gene circuits
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx0796
PMID:41032600
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3 | 2025-10-03 |
How hard is it to encapsulate life? The general constraints on encapsulation
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0297
PMID:41035324
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研究论文 | 本文探讨生命系统封装面临的一般性约束条件,通过分析现有生物化学系统和通用自催化系统揭示封装挑战 | 首次系统量化分析生命封装的基本限制条件,揭示核糖体速率与细胞大小的关键关系 | 基于地球现有生物系统进行分析,可能不适用于所有可能的生命形式 | 研究生命系统封装过程中面临的一般性约束条件 | 地球现有生物化学系统、通用自催化系统、信息与功能分子分离系统 | 生命起源研究 | NA | 理论建模、数学分析 | 理论模型 | 理论参数 | NA |
4 | 2025-10-03 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
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研究论文 | 探讨从地球化学到生物化学的转变过程,通过计算方法和系统化学研究原始生化系统的演化 | 提出将LUCA代谢反应规则映射到前生物反应的创新方法,建立非生物化学与早期生命之间的可能联系 | 连接原始地球化学与LUCA复杂代谢能力仍存在挑战 | 探索生命起源过程中代谢系统的化学根源和演化机制 | 原始生化系统、前生物反应、最后普遍共同祖先(LUCA) | 计算生物学 | NA | 生成模型、系统化学、计算建模 | 生成模型 | 化学反应数据、热力学数据 | NA |
5 | 2025-10-03 |
Towards origins of virtual artificial life: an overview
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0298
PMID:41035322
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综述 | 本文概述了人工生命领域特别是虚拟生命在定义、检测和起源机制方面的研究现状 | 提出了以工程化视角定义生命的框架,包括抽象需求、通用设计和具体实现机制 | 目前尚未展示出完全满足所有工程要求的虚拟人工生命系统 | 探讨人工生命的定义、检测方法和起源机制 | 人工生命系统,特别是虚拟生命形式 | 人工生命 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2025-10-03 |
Origins of life: the possible and the actual
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0281
PMID:41035333
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综述 | 本文综述了生命起源研究的关键理论框架和实验方法,探讨生命形成的可能性与多样性 | 整合多学科视角探讨原始细胞系统的形成与演化,强调能量、物质和信息共同演化的研究框架 | NA | 探索生命起源的基本原理、限制条件和可能的替代生物化学途径 | 原始细胞系统、化学系统到信息承载可进化实体的转变过程 | 生命起源研究 | NA | 地球化学、统计物理学、系统生物学、合成生物学、信息理论等多学科方法 | NA | 理论框架和实验数据 | NA |
7 | 2025-10-03 |
Synthetic Biology and Biomaterials Strategies to Deceive the Tumor Microenvironment in CAR-T Immunotherapy
2025-Oct, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506429
PMID:40888234
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综述 | 本文综述了合成生物学和生物材料在改善CAR-T免疫疗法对抗实体瘤效果中的创新策略 | 将生物材料不仅用作精准递送载体,还开发为人工抗原呈递细胞、高通量筛选平台和肿瘤微环境生物力学景观模拟工具 | NA | 探索如何利用合成生物学和生物材料策略增强CAR-T细胞在实体瘤治疗中的疗效并减少副作用 | CAR-T细胞免疫疗法、实体瘤肿瘤微环境 | 合成生物学、生物材料 | 实体瘤癌症 | 合成生物学技术、生物材料工程 | NA | NA | NA |
8 | 2025-10-03 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2025-Sep-30, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
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综述 | 本文探讨受控环境农业如何加速植物科学成果向农业应用的转化 | 提出受控环境农业作为连接基础科学研究与农业实际产出的创新平台,能够突破季节和昼夜节律限制实现持续高效生产 | NA | 分析受控环境农业在促进植物科学成果转化方面的潜力与挑战 | 作物设计与农业生产系统 | 农业生物技术 | NA | 育种技术、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
9 | 2025-10-03 |
Beyond Purification: Evolving Roles of Fusion Tags in Biotechnology
2025-Sep-17, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090768
PMID:41020890
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综述 | 本文总结了融合标签在生物技术中的多样化应用及发展趋势 | 系统阐述了融合标签从传统纯化功能向实时成像、空间定位、靶向递送和蛋白质活性调控等多功能工具的演变 | 未完全涵盖所有相关研究内容 | 帮助研究人员针对特定目标设计合适的标签形式 | 蛋白质和肽类标签及其去除方法 | 生物技术 | NA | 重组表达技术、下拉实验、免疫沉淀分析 | NA | NA | NA |
10 | 2025-10-03 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程 | 首次将微流控调制光谱技术应用于蛋白质-配体相互作用研究,并建立了针对孤儿PAS结构域的综合分析流程 | 仅使用了约760种化合物的片段库进行筛选,可能遗漏其他潜在配体 | 开发筛选小分子增强蛋白质稳定性的方法,并寻找孤儿PAS受体的新型配体 | CU228蛋白(一种来自细菌的PAS-HTH转录因子) | 合成生物学 | NA | 差异扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差异NMR | NA | 生物物理数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库,鉴定出3种有效配体 |
11 | 2025-10-03 |
Metabolic Engineering of Terpenoid Biosynthesis in Medicinal Plants: From Genomic Insights to Biotechnological Applications
2025-Sep-05, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090723
PMID:41020846
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综述 | 本文综述了药用植物中萜类化合物生物合成的代谢工程策略及其生物技术应用 | 提出'从基因组见解到生物技术应用'范式,整合多组学技术和CRISPR工具实现萜类化合物产量的显著提升 | 面临代谢通量平衡、细胞毒性和规模化经济性等持续挑战 | 加速萜类化合物生物制造从发现到商业化应用的转化 | 药用植物中的萜类化合物生物合成 | 合成生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、代谢组学)、CRISPR、酶工程 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA |
12 | 2025-10-03 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 本文提出DySEEP方法,通过动态通量平衡分析和经济指标评估微生物生产PHB的经济潜力 | 开发了结合动态通量平衡分析和经济指标评估的新方法DySEEP,用于系统分析生物产品生产的经济潜力 | 由于DFBA模拟的性质,无法预测某些关键聚合物性质 | 评估不同微生物生产PHB的经济潜力并优化生产工艺 | 重组微生物(包括大肠杆菌、谷氨酸棒杆菌和恶臭假单胞菌) | 代谢工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA)、代谢工程 | 动态模拟模型 | 代谢通量数据、实验数据 | 三种重组微生物的PHB生产分析 |
13 | 2025-10-03 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜解析了蓝藻噬菌体A4的完整结构,揭示了其双稳定衣壳内的五聚体预喷射体结构 | 首次在噬菌体衣壳核心发现由四个喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构,并观察到基因组DNA沿带正电荷裂隙分布的特殊构型 | 提出的DNA包装和喷射机制仍为假设性模型,需要进一步实验验证 | 探究噬菌体衣壳内预喷射体的精细组装机制和基因组传递过程 | 蓝藻噬菌体A4的结构组成 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜技术 | NA | 结构图像数据 | 单个蓝藻噬菌体A4颗粒的结构分析 |
14 | 2025-10-03 |
From nonexistence to novel applications: Nullomers and related k-mer based concepts in bioinformatics
2025, Advances in clinical chemistry
DOI:10.1016/bs.acc.2025.06.009
PMID:41033729
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综述 | 本章系统探讨了生物信息学中未被充分代表的k-mer序列(如nullomers和neomers)的理论基础、分析方法及应用前景 | 提出了基于缺失序列(nullomers和neomers)的创新分析框架,为癌症检测、组织溯源和进化研究提供了新视角 | 讨论了分析缺失序列时面临的计算挑战,但未提出具体的解决方案 | 系统梳理k-mer缺失序列在生物信息学中的理论基础和应用价值 | 基因组和蛋白质组中的k-mer缺失序列 | 生物信息学 | 癌症 | k-mer分析 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据 | NA |
15 | 2025-10-03 |
Technological and industrial trends in China's pharmaceutical sector
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1579037
PMID:41035909
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研究论文 | 全面分析中国医药行业的关键趋势,重点关注新兴技术对药物开发的影响 | 从人口老龄化、产业结构和国际化视角探讨工业转型的驱动因素和障碍 | 未提及具体研究方法或数据来源的局限性 | 分析中国医药行业的技术和工业趋势,推动高质量药物研发和制造发展 | 中国医药行业的技术发展、市场需求和产业转型 | 医药产业研究 | 慢性疾病、罕见疾病 | 精准医疗、合成生物学 | NA | 行业分析数据 | NA |
16 | 2025-10-03 |
Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01677-3
PMID:38977789
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研究论文 | 开发基于邻近触发蛋白质反式剪接技术的时控蛋白质合成方法,用于解析细胞信号传导的动态过程 | 利用蛋白质反式剪接技术实现时控蛋白质合成,能够区分起始材料和产物的细胞定位及活性状态 | NA | 开发合成生物学工具以操纵细胞状态,解析细胞信号传导的动态过程 | 多种蛋白质包括BCR-ABL和DNAJ-PKAc激酶癌融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 邻近触发蛋白质反式剪接技术 | NA | 蛋白质活性数据 | 多种蛋白质案例研究 |
17 | 2025-10-03 |
Transcriptional regulation of living materials via extracellular electron transfer
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01628-y
PMID:38783133
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研究论文 | 本研究展示了如何利用细胞外电子转移过程调控工程活体材料的机械性能 | 首次将微生物胞外电子转移过程作为连接活细胞代谢与合成材料特性的可调控桥梁,实现了基于基因电路设计的材料性能编程控制 | NA | 探索利用微生物胞外电子转移过程调控合成材料性能的新方法 | 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)、铜催化剂、水凝胶、成纤维细胞 | 合成生物学 | NA | 胞外电子转移(EET)、合成生物学、荧光参数化、转录布尔逻辑门 | NA | NA | NA |
18 | 2025-10-03 |
De Novo Synthesis of Error-Free Long Oligos
2024-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70028
PMID:39422193
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研究论文 | 介绍无错误长寡核苷酸从头合成的完整方案 | 结合CBP纯化方法与克隆测序技术,首次实现长达401-mer的无错误长寡核苷酸合成 | 未明确说明合成效率与错误率的具体数据 | 开发高精度长寡核苷酸合成技术 | 寡核苷酸(最长401-mer) | 合成生物学 | NA | 固相合成、CBP纯化、克隆、Sanger测序 | NA | NA | NA |
19 | 2025-10-03 |
ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799
PMID:39301026
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综述 | 本文全面探讨了如何通过合成生物学、工程学和经济视角解决CAR-T细胞疗法面临的挑战 | 整合合成生物学、工程学和经济洞察来填补CAR-T细胞疗法的技术空白,提出协同策略提升治疗安全性、有效性和可及性 | NA | 克服CAR-T细胞疗法在实体瘤疗效、安全性和规模化生产方面的障碍 | CAR-T细胞疗法及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学 | 血液恶性肿瘤 | CAR T-cell engineering | NA | NA | NA |
20 | 2025-10-03 |
Dynamic Gene Expression Mitigates Mutational Escape in Lysis-Driven Bacteria Cancer Therapy
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0049
PMID:39301524
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研究论文 | 本研究探讨如何通过动态基因表达策略优化工程化细菌在癌症治疗中的持续定植和有效载荷释放 | 首次发现PFO表达会导致细菌裂解并引发突变逃逸,并提出通过短时重复诱导的动态策略来维持治疗性细菌种群 | 研究主要基于实验室培养和微流体系统,尚未进行体内动物模型验证 | 优化工程化细菌在癌症治疗中的持久定植和持续有效载荷释放策略 | 表达Perfringolysin O毒素的非致病性工程化细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 分子动力学模拟、数学建模、微流体系统、基因测序 | 种群动态数学模型 | 实验数据、测序数据、模拟数据 | NA |