合成生物学相关文章
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当前共找到 3722 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-02 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
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研究论文 | 本文描述了一种使用高通量培养平台对Komagataella phaffii菌株进行代谢通量分析的详细实验方案 | 开发了基于13C的高通量代谢通量分析方案，能够快速表征大量工程菌株 | NA | 建立高通量代谢通量分析方案以支持合成生物学研究 | Komagataella phaffii（毕赤酵母）菌株 | 代谢系统工程 | NA | 13C标记代谢通量分析（C-MFA）、高通量培养平台 | NA | 代谢通量数据 | 多株工程菌株 |
| 22 | 2025-10-02 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2025-Oct, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
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综述 | 本文全面综述了虾青素生物合成的研究进展，重点关注微生物发酵生产策略 | 系统比较了天然宿主Xanthophyllomyces dendrorhous与异源宿主Yarrowia lipolytica和Saccharomyces cerevisiae在虾青素生物合成中的应用 | 未提供具体实验数据或样本规模信息，主要为文献综述性质 | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法实现虾青素大规模生物合成的技术路径 | 虾青素生物合成途径及相关微生物宿主系统 | 代谢工程 | NA | 合成生物学、代谢工程、微生物发酵 | NA | 文献资料 | NA |
| 23 | 2025-10-02 |
Bio-Photo Dual Action of Intracellular Radical Polymerization
2025-Oct-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c10871
PMID:40977043
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研究论文 | 开发了一种生物标志物和光门控的细胞内自由基聚合策略，用于精确细胞器干预 | 首次实现了生物标志物和光照双重控制的细胞内自由基聚合，通过AND门控机制将聚合反应精确限制在目标细胞内 | NA | 开发能够在活细胞内实现时空控制聚合的化学方法，用于细胞器精确干预 | 细胞内聚合反应、内质网完整性、细胞死亡通路 | 合成生物学 | NA | 光诱导电子/能量转移-可逆加成断裂链转移(PET-RAFT)聚合 | NA | 化学实验数据 | NA |
| 24 | 2025-10-02 |
Rubisco-Centric Strategies for Carbon Conservation in Synthetic Biology
2025-Oct-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04813
PMID:41031513
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综述 | 本文系统总结了Rubisco酶的基础研究及其在合成生物学中提升碳效率的策略 | 首次系统整合了从经典定向进化到人工智能驱动的理性设计等五种酶效率提升策略，并提出了跨尺度设计框架 | 作为综述文章，主要基于现有文献分析，缺乏原始实验数据验证 | 探讨通过Rubisco工程化提升生物制造碳效率的策略 | Rubisco酶及其在自养和异养微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | 定向进化、人工智能驱动设计、结构动力学分析 | NA | 文献资料 | NA |
| 25 | 2025-10-02 |
HUH endonuclease-mediated DNA-protein conjugates: sequence-specific tools and cellular applications
2025-Oct-01, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc04628a
PMID:41032013
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综述 | 本文综述了HUH内切酶作为自标记蛋白标签在序列特异性共价连接未修饰ssDNA方面的最新进展及其在细胞研究中的应用 | 利用HUH内切酶实现序列特异性生物正交连接，并扩展至RNA底物的定向进化策略 | NA | 开发基于HUH内切酶的DNA-蛋白质偶联工具及其在细胞生物学中的应用 | HUH内切酶及其DNA-蛋白质偶联物 | 化学生物学 | NA | HUH内切酶技术、定向进化、计算设计 | NA | NA | NA |
| 26 | 2025-10-02 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-Sep-30, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
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研究论文 | 开发了一种模拟线粒体功能的自供能人工细胞系统，通过酶促级联反应实现自主能量供应 | 构建了具有自放大质子生成功能的人工线粒体，实现了跨膜质子梯度的稳定维持和高效ATP合成 | NA | 为人工生命系统开发连续自主的能量供应平台 | 人工线粒体、人工细胞、酶纳米胶囊 | 合成生物学 | NA | 酶共区室化、纳米胶囊封装、脂质体涂层 | NA | 实验数据 | NA |
| 27 | 2025-10-02 |
Synthetic biology-driven biosensors for healthcare applications: A roadmap toward programmable and intelligent diagnostics
2025-Sep-26, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118036
PMID:41027168
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综述 | 本文探讨了合成生物学驱动的生物传感器在医疗健康领域的创新应用与发展路线 | 整合合成基因电路、CRISPR控制系统和逻辑门架构，实现可编程、模块化的智能诊断系统 | 电路稳定性、生物安全性和大规模部署方面仍存在挑战 | 开发下一代智能生物传感器以满足精准医疗和即时诊断的需求 | 病原体、癌症生物标志物、代谢失衡标志物和环境污染物 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路、CRISPR技术、RNA调控 | 逻辑门架构 | 生物分子数据 | NA |
| 28 | 2025-10-02 |
Synthetic Whole-Cell Bioelectronic Chemical Sensing with In Situ Genetic Computing
2025-Sep-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00015
PMID:41031321
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了结合全细胞细菌生物传感器与电化学检测技术的生物电子化学传感器 | 将全细胞生物传感器的多功能性与电化学传感的灵敏度相结合，开发了具有遗传计算能力的模块化生物电子传感器 | NA | 开发低成本、可现场部署的化学传感设备 | 汞污染物检测和双输入逻辑计算 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、电化学传感、遗传模块构建 | T7 RNAP信号放大器、布尔逻辑计算 | 电化学信号 | NA |
| 29 | 2025-10-02 |
Molecular Paleontology Meets Drug Discovery: The Case for De-extinct Antimicrobials
2025-Sep-23, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05530
PMID:41018632
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综述 | 本文探讨通过古基因组学和古蛋白质组学技术从灭绝生物中复活抗菌分子的新兴研究领域 | 首次系统提出'灭绝复活'抗菌剂的概念，将古生物学与现代药物发现相结合，开辟新型抗菌药物来源 | 涉及技术挑战和伦理考量，实际应用仍面临诸多障碍 | 探索从灭绝生物中开发新型抗菌剂以应对抗生素耐药性问题 | 从灭绝生物中重建的生物活性肽、抗生素和其他生物活性剂 | 生物信息学 | 传染病 | 高通量DNA测序、质谱分析、计算生物学、古基因组学、古蛋白质组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、蛋白质序列数据 | NA |
| 30 | 2025-10-02 |
Synthetic antimicrobial peptides: Combatting antimicrobial resistance for sustainable aquaculture
2025-Sep-16, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108029
PMID:40967516
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综述 | 本文综述了合成抗菌肽在水产养殖中作为抗生素替代品的设计策略、计算工具应用及环境意义 | 系统整合合成生物学与计算建模方法开发具有增强稳定性和靶向抗菌活性的合成抗菌肽 | NA | 探索合成抗菌肽作为可持续水产养殖疾病控制解决方案 | 抗菌肽及其合成类似物 | 计算生物学 | 水产养殖疾病 | 机器学习、计算建模、合成生物学 | 机器学习方法 | 肽序列数据 | NA |
| 31 | 2025-10-02 |
Streamline automated biomedical discoveries with agentic bioinformatics
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf505
PMID:41016012
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综述 | 本文探讨了基于大语言模型的智能代理在计算生物学中的应用，介绍了智能生物信息学这一新兴领域的核心原理、方法和应用 | 提出了智能生物信息学这一新研究范式，强调自主、自适应智能代理在解决复杂生物问题中的变革性作用 | NA | 探索智能生物信息学在推动生物医学发现和临床应用的潜力 | 智能生物信息学系统及其在生物医学领域的应用 | 计算生物学 | NA | 大语言模型、智能代理系统 | NA | 生物数据集 | NA |
| 32 | 2025-10-02 |
Targeting the gut-liver axis in cholangiocarcinoma: mechanisms, therapeutic advances, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1646897
PMID:41018102
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综述 | 探讨肠道-肝脏轴在胆管癌中的作用机制、治疗进展及未来研究方向 | 系统阐述肠道微生物群失调、胆汁酸代谢紊乱和免疫微环境重塑在胆管癌进展中的驱动作用，并提出合成生物学、多组学和人工智能等新兴治疗策略 | 面临微生物群异质性和受体信号双重性等挑战，需要更深入的机制研究和标准化方案 | 研究肠道-肝脏轴在胆管癌发病机制中的作用并开发靶向治疗策略 | 胆管癌患者及其肠道微生物群、胆汁酸代谢和肿瘤微环境 | 肿瘤学研究 | 胆管癌 | 多组学分析、合成生物学、人工智能 | NA | 临床证据、微生物组数据、代谢组数据 | NA |
| 33 | 2025-10-02 |
Therapeutic potential of the gut commensal bacterium Parabacteroides goldsteinii in human health and disease treatment
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1618892
PMID:41019532
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综述 | 系统探讨肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的治疗潜力 | 首次系统评估该菌株通过短链脂肪酸分泌、胆汁酸转化和免疫调节对抗多种疾病的机制，并展望工程益生菌等新兴应用 | 存在转化挑战，如优化培养方法、剂量效应表征和遗传工具开发不足 | 评估Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的治疗潜力 | 肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii及其与宿主互作机制 | 微生物组研究 | 代谢性疾病、神经系统疾病、炎症性疾病、恶性肿瘤 | 系统综述方法 | NA | 文献证据 | NA |
| 34 | 2025-10-02 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本研究通过编程控制基因可用性时间，利用位点特异性重组酶改善多基因电路性能 | 首次使用位点特异性重组酶通过可编程时间控制基因可用性来优化基因电路性能 | NA | 开发通过时间控制基因可用性来改善合成生物学基因电路性能的方法 | 内源性microRNA和细胞类型 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | 比例传感器电路 | 基因表达数据 | NA |
| 35 | 2025-10-01 |
A fragment in the 5' untranslated region of alcohol oxidase 1 promoter significantly influencing gene expression of Komagataella phaffii
2025-Oct-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149745
PMID:40902693
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii的醇氧化酶1启动子5'非翻译区鉴定出一个负调控元件D3片段 | 首次发现并验证了13bp的D3片段作为顺式作用负调控元件，敲除该片段可使异源蛋白表达提高3.5倍 | NA | 研究醇氧化酶1启动子调控元件对异源蛋白表达的影响 | Komagataella phaffii微生物及其醇氧化酶1启动子 | 合成生物学 | NA | 基因片段敲除、转录组分析、电泳迁移率变动分析、DNA pull-down、液相色谱-质谱联用 | NA | 基因表达数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | NA |
| 36 | 2025-10-01 |
A tool for modeling gene regulatory networks (GRN_modeler) and its applications to synthetic biology
2025-Sep-29, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00148-8
PMID:41023501
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研究论文 | 开发了一个用于基因调控网络建模的用户友好工具GRN_modeler，并展示了其在合成生物学中的应用 | 开发了具有图形用户界面的GRN_modeler工具，使非编程用户能够创建现象学模型，同时支持命令行操作，能够分析动态行为和空间模式形成 | NA | 开发易于使用的基因调控网络建模工具，促进合成生物学研究 | 基因调控网络、合成生物学系统 | 合成生物学 | NA | 基因调控网络建模与仿真 | 现象学模型 | 网络模型、生物系统数据 | 多个合成生物学案例，包括新型振荡器家族和大肠杆菌光检测生物传感器 |
| 37 | 2025-10-01 |
A Modular and Customizable CRISPR/Cas Toolkit for Epigenome Editing of Cis-regulatory Modules
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503917
PMID:41024337
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研究论文 | 开发模块化CRISPR/Cas表观基因组编辑工具包用于顺式调控模块的表观遗传编辑 | 创建了模块化表观基因组编辑框架(dCd和dCm系统)，可在原位或异位编程解析和改造CRM活性，并在无DNA甲基化的酵母中重建甲基化依赖性CRM | NA | 解码和重编程顺式调控表观遗传逻辑，开发表观基因组编辑工具 | 顺式调控模块(CRMs)、表观遗传标记、基因调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas表观基因组编辑、DNA甲基化/去甲基化、光遗传学 | dCd系统、dCm系统 | 表观遗传数据、基因表达数据 | 植物和酿酒酵母系统 |
| 38 | 2025-10-01 |
Advances in Genetic Transformation of Lactic Acid Bacteria: Overcoming Barriers and Enhancing Plasmid Tools
2025-Sep-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189146
PMID:41009708
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综述 | 综述乳酸菌遗传转化的最新进展，包括DNA导入方法和载体工具的开发 | 系统总结了拓宽菌株适用性的最新方法，包括无残留选择标记的食品级性状改造策略 | 存在菌株间变异性和宿主特异性障碍，仍需定制化解决方案 | 克服乳酸菌DNA摄取障碍并增强质粒工具的开发 | 乳酸菌 | 合成生物学 | NA | 自然感受态、电穿孔、接合、噬菌体介导转导、基因枪技术 | NA | NA | NA |
| 39 | 2025-10-01 |
Smart Phages: Leveraging Artificial Intelligence to Tackle Prosthetic Joint Infections
2025-Sep-19, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090949
PMID:41009927
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综述 | 本文探讨如何利用人工智能和机器学习技术改进噬菌体疗法以应对假体关节感染 | 首次系统提出将AI/ML技术应用于噬菌体疗法开发，通过提升可扩展性、效率和精准度来克服传统疗法障碍 | NA | 研究人工智能在噬菌体疗法研究、开发和临床应用中的潜在价值 | 噬菌体疗法及其在假体关节感染治疗中的应用 | 机器学习 | 假体关节感染 | 基因组学、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-01 |
Protein and Peptide in Cancer Research: From Biomarker to Biotherapeutics
2025-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17183031
PMID:41008874
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综述 | 全面概述基于蛋白质和肽的癌症诊断与治疗策略的最新研究进展 | 系统整合了蛋白质和肽在癌症精准诊疗中的最新技术进展，包括合成生物学、计算设计和多组学整合分析等新兴技术 | 肽类存在稳定性差、易被酶降解和递送效率低等局限性 | 探讨蛋白质和肽在癌症诊断与治疗中的应用潜力 | 蛋白质和肽类生物分子 | 生物医学研究 | 癌症 | ELISA、质谱分析、CyTOF、合成生物学、计算设计、多组学整合分析 | NA | 生物分子数据 | NA |