合成生物学相关文章
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当前共找到 3043 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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review | 本文综述了CRISPR/Cas基因编辑技术的发展与创新，特别是非DSB编辑器BE和PE的进展，以及其在基因治疗等领域的应用 | 重点讨论了基于CRISPR系统的非DSB编辑器BE和PE的创新策略，包括“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路 | 未提及具体的实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 探讨CRISPR/Cas基因编辑技术的创新策略及其在基因治疗等领域的应用前景 | 非DSB编辑器BE和PE | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA |
| 42 | 2025-04-25 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 开发了一种在不改变内源基因编码序列的情况下集成遗传生物传感器的方法 | 通过将单导RNA插入基因终止子区域来激活下游电路，从而在不改变内源基因编码序列的情况下集成遗传生物传感器 | NA | 开发一种在不改变内源基因编码序列的情况下集成遗传生物传感器的方法，以更准确地监测和响应细胞状态变化 | CHO-K1细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | 数学模型 | 基因表达数据 | NA |
| 43 | 2025-04-25 |
Bioengineering lipid-based synthetic cells for therapeutic protein delivery
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.08.004
PMID:39209601
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review | 本文综述了基于脂质的合成细胞（SCs）作为治疗性蛋白质递送平台的潜力 | 结合合成生物学和药物递送原理，利用脂质双层膜设计合成细胞，实现组织特异性靶向和免疫逃逸 | 讨论了脂质基SCs在转化应用中的挑战和潜在问题 | 探索合成细胞作为治疗性蛋白质递送平台的可行性和优势 | 脂质基合成细胞（SCs） | 合成生物学 | NA | 细胞游离蛋白质合成系统 | NA | NA | NA |
| 44 | 2025-04-25 |
Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01512-w
PMID:39259478
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研究论文 | 通过启动子捕获方法在Pseudomonadota多样菌种中鉴定新型广宿主范围启动子序列 | 利用南极微生物群落发现新型广宿主范围启动子序列，扩展了合成生物学的遗传工具包 | 研究中仅使用了约2000个克隆，可能未覆盖所有潜在的启动子序列 | 扩展合成生物学中可用的生物部件目录，特别是广宿主范围启动子序列 | 南极微生物群落中的Pseudomonadota多样菌种 | 合成生物学 | NA | 启动子捕获方法 | NA | 基因序列数据 | 约2000个克隆，鉴定出13个功能性启动子序列 |
| 45 | 2025-04-25 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT架构的预测工具TeaTFactor，用于识别茶树转录因子 | 利用预训练策略和BERT架构，首次应用于茶树转录因子的预测，开发了在线服务器 | 未明确提及模型在跨物种应用中的泛化能力 | 开发高效准确的茶树转录因子预测工具 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练模型 | BERT | 蛋白质序列数据 | 使用UniProt数据库的蛋白质数据和收集的茶树转录因子数据进行训练 |
| 46 | 2025-04-24 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-Jun-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统总结了2004年至2023年间报道的105种大环内酰胺的来源、结构、生物活性及其生物合成途径 | 首次系统讨论了大环内酰胺家族的最新进展，特别是结构-活性关系和新发现的偏离传统共线性规则的生物合成途径 | 仅涵盖了2004年至2023年间报道的105种大环内酰胺，可能未包含所有相关研究 | 为大环内酰胺的发现和通过合成生物学方法实现可持续生产提供参考 | 大环内酰胺 | 生物化学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | 105种大环内酰胺 |
| 47 | 2025-04-24 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-May, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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研究论文 | 研究濒危物种橙腹鹦鹉基因组多样性和免疫遗传多样性的长期丧失 | 利用高质量长读长参考基因组和历史及当代重测序基因组，追踪了该物种长期的基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降 | 样本量较小（当代19个，历史16个），且仅针对单一物种进行研究 | 评估濒危物种橙腹鹦鹉的基因组多样性和免疫遗传多样性丧失情况，为保护措施提供依据 | 橙腹鹦鹉（Neophema chrysogaster） | 基因组学 | 禽流感 | 长读长基因组测序，重测序 | NA | 基因组数据 | 当代样本19个，历史样本16个（最早可追溯至1829年） |
| 48 | 2025-04-24 |
Ultrasound-Energized OX40L-Expressing Biohybrid for Multidimensional Mobilization of Sustained T Cell-Mediated Antitumor Immunity and Potent Sono-Immunotherapy
2025-Apr-23, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02025
PMID:40200836
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research paper | 开发了一种超声激活的生物杂交体，通过表达OX40L和聚合物声敏剂，实现T细胞介导的抗肿瘤免疫和声免疫治疗 | 结合合成生物学和超声技术，设计了一种新型生物杂交体，通过OX40L表达和声动力效应实现多维免疫激活 | 未提及临床前或临床试验的具体结果，可能尚处于实验室研究阶段 | 开发一种新型的癌症声免疫治疗策略，通过多维免疫激活实现持久的抗肿瘤效果 | 肿瘤模型和T细胞介导的免疫反应 | 生物医学工程 | 癌症 | 合成生物学、超声技术 | 生物杂交体 | 实验数据 | NA |
| 49 | 2025-04-24 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-Apr-22, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
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综述 | 本文回顾了高通量和基因组规模动力学建模的最新进展，并探讨了未来发展方向 | 整合机器学习与机制代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制参数化策略 | NA | 推动系统和合成生物学、代谢工程及医学研究的进步 | 动力学模型 | 系统生物学 | NA | 机器学习、动力学建模 | 机制代谢模型 | NA | NA |
| 50 | 2025-04-24 |
Bottom-up development of lipid-based synthetic cells for practical applications
2025-Apr-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.009
PMID:40263003
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review | 本文综述了自下而上开发的脂质基合成细胞（SCs）的当前技术状态及其潜在应用 | 强调了合成细胞在药物递送、生物传感器、生物生产、疫苗开发及环境修复等领域的创新应用 | 讨论了合成细胞在实施过程中面临的挑战 | 探索合成细胞的设计原理、材料及制造技术，以推动其从概念验证到实际应用的过渡 | 脂质基合成细胞（SCs） | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
| 51 | 2025-04-24 |
Comparative Analysis of Codon Optimization Tools: Advancing toward a Multi-Criteria Framework for Synthetic Gene Design
2025-Apr-10, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2411.11066
PMID:40223268
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研究论文 | 本文对广泛使用的密码子优化工具进行了全面的比较分析，提出了一种多标准框架用于合成基因设计 | 揭示了不同密码子优化工具在序列设计和聚类模式上的显著差异，并提出了一个整合CAI、GC含量、mRNA折叠能量和密码子对考虑的多标准框架 | 研究仅评估了、和CHO细胞中的工业相关靶蛋白，可能不适用于其他宿主系统 | 比较不同密码子优化工具的性能，并推进合成基因设计的多标准框架 | 工业相关靶蛋白在、和CHO细胞中的表达 | 合成生物学 | NA | 密码子优化 | NA | 基因序列数据 | 多个工业相关靶蛋白在三种不同细胞系中的评估 |
| 52 | 2025-04-24 |
Engineering carbon assimilation in plants
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13825
PMID:39783795
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review | 本文综述了植物碳同化工程的最新进展，包括合成生物学、基因工程、代谢途径优化和人工智能在提高光合效率中的应用 | 探讨了通过改进RuBisCO或引入替代途径来提高碳固定效率的创新方法 | RuBisCO的低动力学效率、低底物特异性和高温度敏感性限制了碳固定通量 | 优化植物碳同化过程以提高光合效率 | 植物、藻类和蓝细菌的碳同化机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、代谢途径优化、人工智能 | NA | NA | NA |
| 53 | 2025-04-24 |
Synthetic Biology Strategies and Tools to Modulate Photosynthesis in Microbes
2025-Mar-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26073116
PMID:40243859
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略和工具调控微生物光合作用的最新进展 | 总结了通过合成生物学增强光能吸收、优化电子传递链和改善碳同化的策略，并提出了AI辅助代谢工程、合成微生物群落和下一代光生物反应器设计等潜在解决方案 | 需要进一步研究以完善遗传策略和开发可扩展的生产系统 | 提高光合微生物的光合效率以解决全球资源短缺和污染问题 | 蓝藻和微藻 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI辅助代谢工程 | NA | NA | NA |
| 54 | 2025-04-24 |
New strategies to study in depth the metabolic mechanism of astaxanthin biosynthesis in Phaffia rhodozyma
2025-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2344578
PMID:38797672
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综述 | 本文综述了虾青素在法夫酵母中生物合成的代谢机制及其提高产量的策略 | 提出了包括组学、基因组编辑、蛋白质结构活性分析和合成生物学在内的前沿方法，以深入理解虾青素合成机制并提高产量 | 当前对虾青素合成的复杂代谢调控机制理解仍不全面，关键基因的具体功能、双功能酶的作用机制以及代谢流的调控需要进一步研究 | 深入理解虾青素的生物合成代谢机制并探索提高其产量的新策略 | 法夫酵母中的虾青素生物合成 | 合成生物学 | NA | 组学、基因组编辑、蛋白质结构-活性分析、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 55 | 2025-04-24 |
Self-pigmenting textiles grown from cellulose-producing bacteria with engineered tyrosinase expression
2025-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02194-3
PMID:38565971
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research paper | 研究通过基因工程改造细菌生产自着色纤维素纺织品 | 通过基因工程使细菌表达酪氨酸酶，生产自着色纤维素纺织品，并结合光遗传学工具实现基因表达的模式化 | 未提及大规模生产的成本或效率问题 | 开发可持续的纺织品染色方法 | 细菌纤维素（BC）和基因工程改造的Komagataeibacter rhaeticus菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程、光遗传学 | NA | NA | NA |
| 56 | 2025-04-24 |
Bacillus methanolicus: an emerging chassis for low-carbon biomanufacturing
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.06.013
PMID:39033040
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research paper | 本文探讨了如何利用合成生物学方法改造Bacillus methanolicus，以提高其在低碳生物制造中的效率 | 提出了利用代谢建模和基因组编辑等合成生物学方法对Bacillus methanolicus进行重新编程的创新思路 | 目前Bacillus methanolicus的效率尚不足以满足工业化需求 | 提高Bacillus methanolicus在低碳生物制造中的效率 | Bacillus methanolicus | 合成生物学 | NA | 代谢建模, 基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 57 | 2025-04-24 |
Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01454-3
PMID:38985434
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研究论文 | 研究从印度阿萨姆邦Pobitora野生动物保护区的森林根际土壤中分离出的Streptomyces sp. PBR19的抗菌活性和生物合成潜力 | 发现PBR19可能是一个新的分类单元，并展示了其对ESKAPE病原体的显著抗菌活性，以及含有与抗生素合成相关的PKS type II基因 | 研究仅针对有限的病原体进行了测试，且未进行体内实验验证抗菌效果 | 探索森林根际土壤中放线菌的抗菌潜力及其在药物开发中的应用 | Streptomyces sp. PBR19及其抗菌活性 | 微生物学 | 细菌感染 | 扫描电子显微镜(SEM)、基因测序 | NA | 微生物样本、基因数据 | 单一分离菌株PBR19 |
| 58 | 2025-04-24 |
Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00251-w
PMID:39322757
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研究论文 | 本文提出了一种结合合成生物学和系统生物学的方法，用于在体内测量酶学参数 | 开发了一种通用的体内酶学参数测量方法，克服了传统体外实验条件与生理条件不符的局限性 | 目前仅应用于酵母合成类胡萝卜素途径中的特定酶类 | 开发一种在真实细胞条件下测量酶动力学参数的新方法 | 酿酒酵母中的合成类胡萝卜素途径（重点关注植烯合酶和三种植烯去饱和酶） | 合成生物学 | NA | 代谢组学、通量组学和蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | 一组经过基因改造的酵母菌株（通过操纵GGPP合酶表达来模拟底物浓度变化） |
| 59 | 2025-04-23 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-Apr-21, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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research paper | 该研究开发了一种在活细胞内精确合成近红外量子点（QDs）的方法，通过控制前体耦合和抑制ROS爆发，显著提高了细胞存活率和荧光强度 | 提出了一种细胞适应性硒代胱氨酸（(Cys-Se)）还原为生物相容性低价硒前体的策略，并通过与Ag-谷胱甘肽（AgSG）的及时耦合，实现了细胞内近红外AgSe QDs的高效合成，同时抑制了细胞毒性Se物种和ROS的产生 | NA | 探索在活细胞内高效合成无机纳米晶体（如量子点）的方法，以用于细胞标记和生物成像 | 活细胞内的无机纳米晶体合成 | 合成生物学 | NA | 细胞内量子点合成技术 | NA | 荧光成像数据 | NA |
| 60 | 2025-04-23 |
Angle-controllable RNA tiles for programable array assembly and RNA sensing
2025-Apr-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58938-5
PMID:40253384
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research paper | 本文介绍了一种新型人工设计的RNA瓦片，通过整合反平行交叉和T型连接，实现了65度或90度的可控角度，并探索了22种不同的瓦片，显著扩展了人工设计多链RNA瓦片的集合 | 引入了一种新型RNA瓦片设计方法，通过整合反平行交叉和T型连接实现角度可控，并成功将split broccoli RNA适配体整合到多链单体瓦片中，实现了可编程RNA传感 | NA | 开发具有定制特性和功能性的RNA纳米结构生物材料 | 人工设计的RNA瓦片及其自组装阵列 | 分子工程 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | 22种不同的RNA瓦片 |