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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-28 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Jun, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
|
综述 | 探讨利用基于RNA折纸的纳米管构建人工细胞骨架的新兴概念 | 系统阐述了RNA相比DNA在构建细胞骨架模拟物中的独特优势,包括共转录折叠能力、复杂三级相互作用及与细胞机器对接的功能 | 体内稳定性和高效递送等重大挑战尚未解决 | 为RNA纳米技术与合成细胞工程的交叉领域提供基础性理解 | RNA折纸纳米管 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | NA | NA | NA | RNA折纸 | NA | 人工细胞骨架(微管和肌动蛋白丝模拟结构) | 纳米技术、合成生物学、医学 |
| 2 | 2026-05-28 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
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综述 | 探讨人工智能和机械建模在表征天然产物生物合成途径中的应用 | 全面分析2020至2025年间人工智能与机械建模在预测生物合成途径和酶-底物相互作用中的最新进展,并讨论整合这些策略以加速天然产物发现、工程和应用的未来方向 | 该领域仍面临复杂基因型-表型关系带来的挑战,且整合不同计算方法存在技术障碍 | 揭示天然产物生物合成途径以加速药物发现、生物技术和合成生物学应用 | 天然产物及其生物合成途径相关数据库、AI方法及机械模拟 | 机器学 | NA | AI, 机械建模 | NA | 文本(数据库) | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |
| 3 | 2026-05-28 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
|
综述 | 系统总结了利用微生物细胞工厂生产L-酪氨酸及其衍生物的工程策略 | 聚焦酪醇、对香豆酸和左旋多巴三大关键节点,综述近五年在酶、代谢和细胞水平上的前沿工程策略 | 未深入探讨工业放大中的工艺瓶颈和成本问题 | 为加速L-酪氨酸衍生物的绿色生物制造提供战略路线图 | L-酪氨酸及其衍生物(酪醇、对香豆酸、左旋多巴) | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母 | 代谢通路 | 食品, 医药, 化工 |
| 4 | 2026-05-28 |
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-May-27, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00402
PMID:42130031
|
研究论文 | 提出一种基于囊泡模板的自组装方法,用于构建可编程的独立多微米DNA壳结构 | 利用表面活性剂去除脂质体模板,成功释放出保持膜模板几何形状的独立DNA壳,并展示了两种不同DNA构造模块(DNA折纸和纳米星基序)的适用性,实现了多层壳的可控形成 | NA | 开发一种简单且广泛适用的方法,用于创建独立、模拟膜的DNA壳结构,为合成生物学提供新型区室化方案 | DNA壳结构及其自组装过程 | 合成生物学 | NA | DNA自组装, 脂质体模板化 | NA | NA | NA | DNA折纸, DNA纳米结构自组装 | NA | NA | 合成生物学 |
| 5 | 2026-05-28 |
Bioethics-in-Science : An Invitation
2026-May-27, Journal of bioethical inquiry
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11673-025-10533-5
PMID:42201630
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研究论文 | 提出“科学中的生物伦理学”概念,探讨将生物伦理探究直接融入科学实践的方法论途径 | 重新定义伦理与科学关系,将科学实践视为内在地承载价值,并开发具体方法(如伦理笔记本、协作研讨会、概念映射)实现持续伦理反思而非外部评估 | 跨学科边界挑战与操作实践中的困难分析 | 为生物伦理探究提供超越科学边缘位置、积极参与知识生产规范维度的新路径 | 合成生物学、神经多样性研究、蛋白质组学案例 | 生物伦理学 | NA | NA | NA | 案例研究 | 三个案例(合成生物学、神经多样性、蛋白质组学) | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-05-28 |
Powering next-generation precision therapeutics through integrated synthetic transcriptional systems
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117308
PMID:42035420
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综述 | 综述了通过整合合成启动子和合成转录因子系统推动下一代精准治疗的发展 | 提出整合合成启动子与合成转录因子的协同设计,借助人工智能从经验试错转向理性预测设计,实现动态、时空精准调控 | 未明确讨论系统在体内应用的稳定性、长期安全性以及大规模临床试验验证 | 综述合成转录系统在哺乳动物合成生物学中的进展,及其在精准治疗中的应用 | 合成启动子与合成转录因子系统及其在疾病治疗中的整合应用 | 机器学 | 复杂疾病 | 合成启动子工程、模块化合成转录因子设计、人工智能辅助设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 逻辑门、反馈回路、可调系统、多输入感知回路 | 医学 |
| 7 | 2026-05-28 |
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00148
PMID:42186953
|
研究论文 | 在酵母中构建从浆果赤霉素III生成紫杉醇的人工生物合成途径 | 通过仅需三步酶促反应的人工途径,绕过天然紫杉醇生物合成中复杂的调控网络,实现了从浆果赤霉素III到紫杉醇的高效转化,并利用β-苯丙氨酰辅酶A连接酶的广泛底物范围 | 目前的知识不足以实现可扩展的生物技术生产,需系统性代谢工程克服多个瓶颈,且人工途径可能无法完全模拟天然合成的所有方面 | 利用合成生物学实现紫杉醇的可持续生产 | 酵母细胞中的人工紫杉醇生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程、结构活性分析 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 人工紫杉醇生物合成途径,利用β-苯丙氨酰辅酶A连接酶和Baccatin III:3-氨基-3-苯基丙酰转移酶 | 医学 |
| 8 | 2026-05-28 |
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-May-26, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00013d
PMID:42187150
|
综述 | 综述了齐墩果烷型五环三萜生物合成的最新进展,涵盖关键酶、转录调控、合成生物学及人工智能应用 | 系统整合组学技术、合成生物学工具与人工智能在OPT生物合成中的应用前景,强调从经验试错向预测优化的范式转变 | 静态综述,未提供实验验证数据或定量比较不同策略的优劣 | 总结OPT生物合成基因发现、调控机制及合成生物学策略的研究进展,实现可持续高效生产 | 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径相关基因和调控元件 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 组学技术, 基因组编辑, 异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 微生物, 植物 | 合成生物电路、代谢途径工程 | 医药, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-05-28 |
Extrachromosomally co-encoded toxin-immunity pairs in yeast and their application potential
2026-May-26, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13876-0
PMID:42189293
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综述 | 本文综述了酵母中由染色体外元件共编码的毒素-免疫因子对的研究进展及其在合成生物学和生物技术中的应用潜力 | 系统总结了酵母毒素-免疫因子对的分子机制、克隆和研究方法,并类比细菌毒素-抗毒素系统,提出其在合成生物学中的开发前景 | 目前对多数免疫因子的保护机制了解尚少,限制了实际应用 | 推动对酵母毒素-免疫因子对的分子理解,并促进其在合成生物学和生物技术中的应用 | 酵母中的染色体外毒素-免疫因子对(包括dsRNA真菌病毒卫星和DNA病毒样元件) | 合成生物学 | NA | 基因克隆、分子生物学研究、工程改造 | NA | 文本 | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 毒素-免疫因子对(如毒素分泌系统、自我保护回路) | 食品防腐剂, 医药, 生物技术, 合成生物学 |
| 10 | 2026-05-28 |
Microbial production of xanthohumol driven by synthetic biology approaches
2026-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05037-2
PMID:42189397
|
综述 | 本文总结了通过合成生物学方法实现黄腐酚微生物生产的生物策略,并评估了其技术经济可行性 | 提出了利用微生物合成生物学实现黄腐酚可持续大规模生产的创新路径,并首次进行了技术经济可行性评估 | 仍需进一步努力实现黄腐酚的合成生物学生产 | 发展黄腐酚的商业化规模生物生产策略 | 黄腐酚 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 化妆品、医药、营养保健品、食品 |
| 11 | 2026-05-28 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-May-26, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
|
评论文章 | 探讨在Genesis Mission时代,从设计-构建-测试-学习循环转向AI驱动的数字孪生技术以加速生物制造工艺放大的前景与挑战 | 提出将合成生物学与AI生态系统整合,并开发共享的AI就绪生物系统数据库和混合数字细胞模型来克服工业放大中的不确定性 | 研究仍处于概念阶段,缺乏具体的实验验证和实际应用案例 | 促进生物制造工艺放大的多尺度优化和数字孪生发展 | 微生物菌株在工业生物反应器中的性能 | 机器学习 | NA | 合成生物学, 机器学习, 大语言模型 | 迁移学习, 强化学习, 贝叶斯优化 | 文献数据, 实时数据 | NA | NA | 微生物 | 混合数字细胞模型 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-05-28 |
Advances in the heterologous biosynthesis of QS saponins: a review
2026-May-26, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03034-6
PMID:42192394
|
综述 | 系统综述QS皂苷的异源生物合成进展,重点探讨利用微生物细胞工厂生产QS-21等化合物的合成生物学策略 | 全面梳理了最具有前景的QS皂苷QS-21的作用机制和应用,并深入探索了微生物合成QS皂苷的合成生物学策略,同时针对当前研究挑战提出了靶向应对策略 | 未具体说明,但综述性质决定了其受限于已有文献的覆盖范围和数据可用性 | 为促进QS皂苷的医学应用和可持续生产奠定理论基础 | QS皂苷(特别是QS-21)及其生物合成途径和异源生产策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、异源生物合成 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂(具体种类未指明) | QS皂苷的生物合成途径(包括QS-21的代谢通路设计) | 医学、疫苗学、食品、化妆品、洗涤剂 |
| 13 | 2026-05-28 |
Decoding heavy metal tolerance in rice: Nucleic acid-based technologies shaping global food security
2026-May-25, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152693
PMID:42190784
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综述 | 综述了核酸技术在水稻重金属耐受性研究中的应用,从发现到部署的全过程 | 系统梳理了从QTL定位、群体GWAS、泛基因组学到CRISPR基因编辑的核酸技术演进,并探讨了其从学术工具向实际解决方案的转化,强调了对食品安全和二次绿色革命的推动作用 | 特异性与必需性矛盾、多金属拮抗(Cd/As氧化还原冲突)及全球监管差异(如SDN-1豁免与GMO分类)仍然构成重大障碍 | 探讨核酸技术如何重塑水稻重金属耐受性的研究与应用管线,以保障全球粮食安全 | 水稻(Oryza sativa)及其重金属(镉和砷)耐受机制 | 基因组学与生物技术 | NA | QTL定位, GWAS, 泛基因组学, CRISPR基因编辑, 转录组学, 表观基因组学, 宏基因组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 分子标记辅助选择 | 水稻(Oryza sativa) | NA | 农业, 食品安全 |
| 14 | 2026-05-28 |
Current Progress and Future Outlook for Synthetic Gene Circuits in Cardiovascular Therapy
2026-May-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16050754
PMID:42194102
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综述 | 本文综述了合成基因电路在心血管治疗中的应用进展,涵盖直接心脏应用、间接靶向风险因素以及未来潜在应用领域 | 提出了改进的设计-构建-测试-学习框架以克服转化瓶颈,并讨论了计算工具(包括基因调控网络推断和基础模型)在加速靶点发现中的作用 | 未明确指出具体局限,但基于综述性质,可能包括对现有电路在临床转化中的挑战缺乏深入分析 | 探讨合成基因电路在心血管治疗中的当前进展和未来前景,提出加速临床转化的策略 | 合成基因电路及其在心血管疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 合成基因电路技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞(基于电路应用于心脏治疗背景) | 可诱导开关、分类器系统、基因调控网络 | 医学 |
| 15 | 2026-05-28 |
Synthetic Biology-Enabled Biosensing Platforms for Point-of-Care In Vitro Diagnostics: Programmable Modules, Clinical Applications, and Translational Challenges
2026-May-20, Biosensors
DOI:10.3390/bios16050297
PMID:42187493
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综述 | 综述合成生物学驱动的即时诊断体外检测平台,涵盖可编程模块、临床应用及转化挑战 | 将合成生物学驱动的体外诊断系统解构为四个功能层(分子识别、信号转导与放大、输出生成和系统集成),并系统总结了2021至2025年间在传染病检测、癌症生物标志物分析和药物代谢/毒性筛查中的代表性临床应用 | 除分析灵敏度外,还需考虑基质耐受性、工作流程复杂度、可制造性、定量能力和监管就绪度等实际因素 | 综述合成生物学在即时诊断体外检测中的应用进展,并指出未来方向 | 合成生物学驱动的生物传感平台及其在体外诊断中的应用 | 数字病理学 | 传染病, 癌症 | 无细胞蛋白质合成系统, CRISPR-Cas, 适配体与核糖开关传感器, 微流控集成技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas | 无细胞系统 | 生物传感器(适配体、核糖开关、CRISPR-Cas诊断平台) | 医学 |
| 16 | 2026-05-28 |
Bioengineered Silver Nanoparticles: Next-Generation Biogenic Synthesis Strategies for Precision Biomedical Applications
2026-May-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050587
PMID:42194344
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综述 | 本文综述了利用生物工程策略合成生物源性银纳米颗粒的下一代方法及其在精准生物医学中的应用 | 区别于传统绿色合成综述,本文重点突出了代谢工程、合成生物学、微流控辅助合成和人工智能优化等新兴生物工程范式,实现可编程、可扩展和精准可控的生物源性银纳米颗粒制造 | 纳米-生物相互作用机制、毒理学安全性、监管合规性和转化可扩展性方面仍存在关键挑战 | 系统审视下一代生物源性银纳米颗粒合成策略,阐明其形成分子机制,探讨新兴功能化和生物医学应用范式及转化障碍 | 生物源性银纳米颗粒及其合成策略 | 机器学习 | NA | 代谢工程,合成生物学,微流控辅助合成,人工智能优化,连续流生物制造 | NA | NA | NA | NA | 植物,微生物,真菌,藻类 | NA | 医学 |
| 17 | 2026-05-28 |
Synergistic Integration of Enzyme and Microbial Platforms for Sustainable Management of Pharmaceutical Pollutants: Towards a Greener Pharmaceutical Lifecycle
2026-May-19, Biology
DOI:10.3390/biology15100804
PMID:42187767
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综述 | 探讨酶与微生物协同平台用于制药污染物可持续管理,构建绿色制药生命周期 | 提出三种协同机制(级联降解、共生保护、功能互补)及构建策略(共固定化技术、工程生物膜、合成生物学改造工程菌),实现高效催化与深度矿化的统一 | 未明确讨论技术规模化应用、成本效益及实际环境中的长期稳定性问题 | 为制药污染的可持续管理提供理论基础和科学参考,推动绿色制药生命周期 | 抗生素、抗炎药、激素、抗病毒药物和农药等制药污染物 | 合成生物学 | NA | 共固定化技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(工程菌) | 级联降解、共生保护、功能互补回路 | 环境, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-05-28 |
Classical Phytohormones and Peptide Plant Hormones in Abiotic Stress Tolerance: Crosstalk, Physiological Integration, and Crop Improvement
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101538
PMID:42197671
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综述 | 本文综述了经典植物激素与多肽植物激素在非生物胁迫耐受中的串扰、生理整合及作物改良应用 | 系统梳理了植物褪黑素作为关键整合节点的新作用,以及转录组学、蛋白质组学等多组学技术揭示的调控网络动态关系 | 多数组学候选基因尚未通过遗传和生化实验验证,存在田间应用转化差距,对复合胁迫条件下肽激素作用机制理解不完整 | 阐明经典激素与肽激素信号网络在非生物胁迫适应中的整合机制,并探索作物改良策略 | 植物经典激素(脱落酸、生长素、赤霉素等)和肽激素(C端编码肽CEPs等)的调控网络 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、代谢组学、系统生物学、CRISPR基因编辑 | NA | 多组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组等) | NA | CRISPR-Cas9 | 植物(作物) | 激素信号调控网络(包括褪黑素介导的活性氧清除级联反应、CEPs通路等) | 农业 |
| 19 | 2026-05-28 |
The NRT1.1-NLP7 Nexus: An Integrative Signaling Nexus from Nitrate Sensing to Systemic Adaptation and Structure-Guided Engineering
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101539
PMID:42197673
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综述 | 本文综述了硝酸盐传感器NRT1.1与转录因子NLP7形成的整合信号中枢,及其在硝酸盐感知、系统适应和结构引导工程中的作用 | 揭示了NRT1.1-NLP7作为整合信号中枢的新概念,提出基于结构引导的三层理性设计框架,将结构生物学与合成生物学相结合 | 未讨论该中枢在不同环境条件下的动态调控机制及潜在副作用 | 重新编程硝酸盐反应以增强氮利用效率 | 高等植物中的硝酸盐传感器NRT1.1与转录因子NLP7 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 结构引导设计 | 作物物种 | 硝酸盐响应重新编程的合成生物回路 | 农业 |
| 20 | 2026-05-28 |
Mycogenic Nanomaterials: What Fungal Nanoparticles Promise and What Still Holds Them Back
2026-May-16, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12050366
PMID:42187848
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综述 | 该综述采用“承诺与障碍”框架,系统分析了真菌纳米材料在生物合成机制、真菌多样性、纳米材料扩展、生物医学应用、环境农业效用及工业规模化方面的前景与挑战 | 首次采用结构化的“承诺与障碍”框架,跨越六个相互关联的主题支柱,同时整合机制前沿、生物多样性空白和转化障碍,提供首个综合性关键综合 | 机制知识差距、非模式真菌基因工具包有限、缺乏标准化协议,以及临床验证、长期毒性数据、制造可重复性和监管清晰度方面的关键缺陷 | 全面评估真菌纳米技术的非比寻常前景和持续障碍,并提出分层路线图以弥合实验室承诺与实际应用之间的差距 | 真菌纳米材料(真菌合成的纳米颗粒) | 机器学习 | NA | 多组学(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、基因组挖掘、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 医学、农业、环境 |