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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-27 |
Engineering quorum sensing: new directions for antimicrobial therapy
2026-May-26, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2026.05.006
PMID:42185145
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综述 | 探讨群体感应工程在抗菌治疗中的应用,包括干扰QS信号和工程化微生物 | 将合成生物学工具与QS机制结合,推动从基础微生物学向转化生物技术的转变 | NA | 探索QS和QS干扰在工程化群体感应回路中的应用,并将其转化为治疗微生物等应用 | 病原微生物中的群体感应机制 | NA | 感染性疾病 | 群体感应干扰, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 群体感应回路(如干扰QS信号、检测和消除病原体) | 医学 |
| 42 | 2026-05-27 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 全面总结了利用紫色非硫光合细菌Rhodobacter sphaeroides进行代谢工程改造以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的策略与方法 | 系统阐述了Rhodobacter sphaeroides作为底盘微生物在辅酶Q10和卟啉衍生物生物合成中的代谢特性、天然调控网络及工程改造策略,突出其代谢灵活性和工业应用潜力 | 未指明当前工程改造策略的具体局限性或瓶颈问题 | 总结Rhodobacter sphaeroides在代谢工程和合成生物学中的进展,展示其作为生产多种生物活性化合物平台菌株的潜力 | Rhodobacter sphaeroides紫色非硫光合细菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 43 | 2026-05-27 |
Engineering of β-glucosidase for rare ginsenoside biosynthesis via distal conformational fine-tuning and sequential degradation control
2026-May-24, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134967
PMID:42184941
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研究论文 | 通过计算重新设计β-葡萄糖苷酶,实现稀有人参皂苷F的高水平生物制造,并揭示远程突变和顺序降解机制 | 整合进化适应度景观与热力学稳定性梯度,发现远端突变Q7D/G189A通过长程别构效应重塑活性位点,将底物结合模式从非特异性疏水相互作用转变为精确的“分子镊子”模式,并揭示控制区域选择性的顺序降解机制 | NA | 实现稀有人参皂苷F的高水平生物制造,并为复杂糖苷水解酶的理性工程提供通用框架 | 来源于叶栖类芽孢杆菌的β-葡萄糖苷酶BglPp及其突变体 | 合成生物学 | NA | 计算蛋白质设计、进化适应度景观、热力学稳定性梯度分析 | NA | 序列数据、结构数据、生化表征数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 44 | 2026-05-27 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
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综述 | 该综述总结了CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的新兴应用及最新研究进展 | 提出CRISPR增强CAR和基于合成生物学的异体系统,以提升CAR-T疗法的效力和可及性,并聚焦于近两年内的创新 | NA | 总结2015年以来的人体试验和成果,探讨克服耐药性、提高安全性和可及性的策略,推动肿瘤学领域向持久治愈发展 | 血液恶性肿瘤(包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急性髓系白血病和T细胞白血病) | NA | 血液恶性肿瘤 | CAR-T | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、CRISPR增强CAR、基于合成生物学的异体系统 | 医学 |
| 45 | 2026-05-27 |
Machine learning-assisted single-cell Raman imaging for rapid, sensitive detection and intracellular mapping of carotenoids in plant cell cultures
2026-May-23, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03858-x
PMID:42176120
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研究论文 | 将拉曼成像与多层感知机神经网络结合,实现基于类胡萝卜素含量的烟草BY-2细胞非破坏性、无标记分类 | 首次将拉曼成像与多层感知机神经网络结合,实现单细胞水平类胡萝卜素的无标记快速检测及细胞内分布成像,提供高分类精度和分选潜力 | 未提及在实际复杂生物样品中的泛化能力及大规模应用验证 | 开发一种非破坏性、无标记的单细胞分析平台,用于植物细胞培养中类胡萝卜素的快速检测和细胞内定位 | 烟草BY-2细胞(野生型和转基因品系)以及类胡萝卜素标准品(虾青素、角黄素、β-胡萝卜素) | 机器学习和数字病理学 | NA | 拉曼成像、表面增强拉曼散射、高效液相色谱、多层感知机神经网络 | 多层感知机神经网络 | 拉曼光谱图像 | 烟草BY-2细胞(包含野生型和多个转基因品系)及类胡萝卜素标准品 | NA | 烟草(BY-2细胞) | NA | 农业和工业生物技术 |
| 46 | 2026-05-27 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-May-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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研究论文 | 本文报道了一种通过将蛋白-脂质缀合物后插入预成型脂质体来自下而上生成病毒样颗粒的方法 | 提出了一种自下而上构建病毒样颗粒的新策略,通过SNAP-tag/BG生物正交反应将蛋白质共价偶联到脂质上,实现无洗涤剂插入脂质体,并成功应用于SARS-CoV-2刺突蛋白,实现了对病毒样颗粒的快速系统优化 | 未明确提及局限性 | 开发一种自下而上的方法来生成脂质体病毒样颗粒,用于疫苗、药物递送和合成生物学应用 | 病毒样颗粒、蛋白-脂质缀合物、脂质体 | 合成生物学 | NA | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染透射电子显微镜、ACE2平板结合实验 | NA | 图像、荧光数据 | NA | SNAP-tag | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质缀合物后插入系统 | 医学、合成生物学 |
| 47 | 2026-05-27 |
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-May-15, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04434
PMID:42139459
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研究论文 | 提出一种基于DNA纳米管瓦片和DNA环状支架的模块化组装策略,用于构建高阶DNA纳米管瓦片纳米结构 | 通过整合DNA瓦片和DNA折纸的优势,利用多个DNA环状支架互连短DNA基序,实现了超过99%组装效率的稳定高阶结构,并展示了布尔逻辑门和动态可重构性 | 现有DNA组装策略的模块化潜力未完全实现,仍需克服高阶结构制造的局限性 | 开发可编程、稳定且逻辑可控的模块化DNA纳米结构组装方法 | DNA纳米管瓦片和DNA环状支架 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术,DNA瓦片,DNA折纸 | 布尔逻辑门 | NA | NA | NA | NA | DNA布尔逻辑门和电路 | 纳米技术,合成生物学 |
| 48 | 2026-05-27 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-May-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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研究论文 | 提出一种线性混合效应模型来评估合成基因电路的性能,并验证了其在布尔逻辑门上的应用 | 首次提出使用线性混合效应模型来标准化评估合成基因电路的布尔逻辑门性能,并通过模拟和实验验证了该方法的有效性 | 未提及具体局限性 | 标准化评估合成基因电路的统计方法,提出线性混合效应模型用于量化布尔逻辑门性能 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 机器学习 | NA | NA | 线性混合效应模型,k-means聚类 | 模拟数据和实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门,模拟数据,嵌套抑制器OR门系列 | NA | NA | 布尔逻辑门,如OR门,3输入门 | 合成生物学 |
| 49 | 2026-05-27 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Mar-27, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
|
综述 | 综述植物对中度和急性热胁迫响应分子机制的最新进展,重点关注表观遗传调控与信号网络的整合 | 整合了光信号、昼夜节律和激素信号通路交叉调控的转录因子PIF4与HSFA1s,以及组蛋白变体H2A.Z动力学和siRNA依赖的跨代表观遗传热记忆机制 | 温度感知、HSFA1s激活动态及胁迫信号整合等根本问题尚未解决 | 揭示植物热适应机制,为气候智能型作物提供理论基础和分子育种策略 | 植物热响应信号转导与表观遗传调控 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 50 | 2026-05-27 |
Energy-driven innovations in computational de novo protein engineering
2026-03, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.01.005
PMID:41570866
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综述 | 系统分析能量驱动计算方法在从头蛋白质工程中的应用,整合经典力场、量子力学和人工智能以加速蛋白质设计 | 提出基于准确度-成本-通量权衡的方法选择决策框架,并阐明物理模型与数据驱动策略的协同作用机制 | 未涉及最新高精度实验验证方法的集成效果量化分析 | 综述能量模型在计算性从头蛋白质工程中的关键作用,提供方法选择指导 | 蛋白质 | 计算生物学 | NA | 分子动力学(MD)、热力学积分、蒙特卡洛采样、机器学习(ML)、深度学习(DL) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学, 合成生物学 |
| 51 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part Two
2026-Feb-25, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00524-5
PMID:42183020
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评论文章 | 提出一个基于心智概念的框架来概念化生物学及其他领域的目标导向性 | 从新兴领域“多元智能”出发,强调经验可检验性、新能力发现的丰产性、术语的操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性,为生物学的目的论提供新的心智化方法 | 文章未明确讨论其框架在具体实验中可能遇到的实践挑战或局限性 | 发展一种受心智概念启发的生物学目的论方法,以更好地理解系统如何工作并指导实验和应用 | 生物系统(包括进化、工程或混合系统)的目标导向性、智能、认知和意向性 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物工程 |
| 52 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part One
2026-Feb-01, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00523-6
PMID:42183019
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研究论文 | 提出一个框架来概念化生物及其他领域中的目标导向性,强调经验可检验性、新能力的发现、术语操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性 | 从多元智能领域出发,反对生物学中对目标导向性的最小化倾向,倡导用心理概念如智能、认知和意向性来理解生物学中的目的论,并强调经验可检验性和研究工具的操作化 | 可能面临传统还原论者的反对,且框架的经验验证和实际应用仍需进一步证据 | 建立一种基于心理概念的目标导向性框架,以更好地理解生命系统中的智能和目标导向行为,推动哲学思考及生物医学和生物工程应用 | 生物系统中的目标导向性,包括形态发生、合成生物学和生物电网络等领域中细胞行为的协调 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物工程 |
| 53 | 2026-05-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
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综述 | 该文章概述了无细胞系统及其在合成生物学中的应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜屏障、实现高通量蛋白质合成、非规范氨基酸掺入、生物传感、药物发现和代谢工程中的创新应用 | 未明确提及局限性 | 突出无细胞系统的基础及其在生物技术和工业中的快速、适应性解决方案 | 无细胞系统及其应用案例 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 54 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
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章节综述 | 综述了基于无细胞系统的生物传感器设计、功能及应用,涵盖基因回路构建、信号输出策略和设备格式 | 系统总结了无细胞生物传感器在即时检测和低资源环境中的优势,并探讨了AI辅助设计、分子优化和先进材料集成等工程解决方案 | 当前局限性包括保质期、灵敏度和可扩展性等问题 | 介绍无细胞生物传感器的设计原则、功能及应用前景 | 无细胞系统及基于其构建的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 体外转录翻译 | NA | NA | NA | NA | NA | 基因回路,信号输出策略 | 医疗,环境科学,农业,食品质量保障 |
| 55 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
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综述 | 研究无细胞系统与自动化及机器人技术结合在生物技术和生物工程领域中的应用 | 详细探讨了机器人平台利用无细胞蛋白质合成及其他可编程无细胞生物机制的前沿领域 | 面临标准化、开发更稳健经济的无细胞提取物以及整合人工智能和机器学习等挑战 | 加速发现、促进创新生物材料开发并扩大先进生物技术工具的获取 | 无细胞系统及其与自动化机器人技术的集成 | 机器学习 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | NA | 可编程无细胞生物回路 | 生物技术, 生物工程 |
| 56 | 2026-05-27 |
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.11.001
PMID:41581987
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综述 | 探讨利用无细胞系统进行生物分子高通量筛选的原理、平台和应用 | 无细胞系统规避了细胞生理约束,可实现从DNA或RNA模板快速可调表达生物分子,并整合微孔板、微流控和纸基装置等平台进行高通量筛选 | 高试剂成本和有限的翻译后修饰 | 综述无细胞系统在高通量筛选中的应用,推动合成生物学、药物发现、诊断和蛋白质工程发展 | 无细胞系统(如大肠杆菌、小麦胚芽、兔网织红细胞和PURE系统)结合高通量平台进行生物分子筛选 | 合成生物学 | 不适用 | 高通量筛选、无细胞系统 | 不适用 | 荧光、发光、质谱、数字PCR | 不适用 | 不适用 | 大肠杆菌、小麦胚芽、兔网织红细胞 | 无细胞转录-翻译系统 | 医学、药物发现、诊断、蛋白质工程 |
| 57 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
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综述 | 全面概述基于无细胞系统的低成本诊断技术的原理、设计方法和突破 | 系统性地总结了无细胞诊断平台在资源贫乏环境中的应用,包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物和PURE系统,并融合合成生物学基因回路、CRISPR-Cas工具和RNA适体以提高诊断灵敏度和特异性 | 试剂稳定性、可扩展性和监管问题仍是主要挑战 | 阐明无细胞系统在低成本诊断中的潜力,推动即时诊断和全球健康改善 | 基于无细胞表达的诊断平台 | 数字病理学 | 未提及 | 无细胞表达,CRISPR-Cas,RNA适体 | 未提及 | 未提及 | 未提及 | CRISPR-Cas | 大肠杆菌,小麦,纯化系统 | 基因回路,生物传感器 | 医学 |
| 58 | 2026-05-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
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研究论文 | 提供无细胞蛋白合成系统的制备方案,包括细胞提取物制备、反应优化及蛋白质表征方法 | 详细阐述了从宿主菌选择、机械裂解到能量离子平衡优化的完整流程,并整合了常见瓶颈的解决方案,为无细胞系统在合成生物学和诊断领域的应用提供了可复现的标准化方法 | 未涉及大规模生产中的成本控制问题,且对复杂蛋白质(如膜蛋白)的合成效率优化讨论有限 | 建立高效制备无细胞蛋白合成系统的标准化协议,并展望其与机器学习结合的未来应用 | 无细胞蛋白合成系统(细胞提取物、反应体系优化及蛋白质功能分析) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 实验数据(蛋白质表达与功能分析) | NA | NA | 大肠杆菌 | 无细胞表达反应体系(代谢通路) | 合成生物学,诊断,生物制造,食品,医疗 |
| 59 | 2026-05-27 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
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综述 | 综述了无细胞转录翻译系统的发展历程、优势、应用及未来挑战 | NA | 高成本、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰、提取物不稳定性 | 概述无细胞转录翻译系统的现状并展望未来发展 | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母, 真核生物 | NA | 合成生物学, 生物制药 |
| 60 | 2026-05-27 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
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综述 | 该文章探讨了人工智能与无细胞系统的整合,涵盖近期进展、工业应用及未来方向 | 通过深度学习、主动学习和贝叶斯优化等AI方法,在无细胞系统中实现了抗菌肽发现、蛋白质产量提升34倍以及代谢途径简化等突破 | 面临数据需求、模型可迁移性和可扩展性等挑战 | 研究AI如何优化无细胞系统,推动合成生物学在生物制造、制药和诊断中的应用 | 无细胞系统中的蛋白质合成、代谢途径设计和反应条件优化 | 机器学习 | NA | 深度学习、主动学习、贝叶斯优化 | 神经网络、生成模型 | 实验数据和蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 生物制造, 制药, 诊断 |