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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-28 |
Biotic Stress Resistance in Sweet Potato: Mechanisms, Perspectives, and Sustainable Production Strategies
2026-May-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101504
PMID:42197638
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综述 | 综述了甘薯应对生物胁迫的最新进展,包括防御机制、多胁迫互作及新兴技术应用策略 | 从多个维度解析甘薯防御机制,提出生物胁迫抗性基因调控网络的新见解,并整合人工智能、基因编辑、新型组学和合成生物学等新兴技术制定十年品种改良路线图 | NA | 总结甘薯生物胁迫抗性机制,提出可持续生产策略和品种改良路线图 | 甘薯中的生物胁迫(真菌、病毒、线虫、虫害和细菌) | 数字病理学 | 植物病害 | 基因编辑、新型组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 甘薯 | NA | 农业 |
| 22 | 2026-05-28 |
Synthetic biology-driven bioinspired delivery systems for RNA therapeutics in neural repair
2026-May-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-01801
PMID:42199149
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综述 | 综述基于合成生物学的仿生递送系统在RNA神经修复治疗中的应用 | 提出了将RNA递送转化为可编程生物机器的系统工程框架,融入设计-构建-测试-学习循环和人工智能辅助工具 | 未详细说明具体实验验证结果和定量比较分析 | 探讨合成生物学在神经修复中RNA治疗递送系统的前沿应用与挑战 | 基于合成生物学的仿生递送系统、RNA疗法、神经修复 | 机器学习 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 生物电路、递送系统、可编程生物机器 | 医学 |
| 23 | 2026-05-28 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-May-12, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了基于簇定位调节因子的八种链霉菌自诱导物生物传感器及其合成路径 | 首次系统开发了八种基于CSR的AR生物传感器,并研究了非同源CSR与AR间的串扰以及CSR调节替代启动子的能力,创建了12种正交信号系统 | 仅涉及链霉菌属,未涵盖其他土壤细菌;生物传感器性能评估主要限于实验室培养条件 | 开发用于天然产物调控中群体感应小分子检测的基于自诱导物的生物传感器平台 | 链霉菌中的簇定位调节因子及相关自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 小分子配体、基因表达数据 | 8种生物传感器及其对应的自诱导物配体 | NA | 链霉菌,大肠杆菌 | 自诱导物生物传感器、基于群体感应的遗传回路 | 工业生物技术,医学 |
| 24 | 2026-05-28 |
Advances in Functional Genomics and Biotechnology for Enhancing Therapeutic Potential of Medicinal Plants
2026-May-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104245
PMID:42196225
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综述 | 综合探讨功能基因组学和植物生物技术在增强药用植物治疗潜力方面的最新进展 | 构建了一个整合功能基因组发现、通路工程、合成生物学、人工智能辅助预测和可扩展生产系统的框架 | 基因组发现与通路工程、可扩展生产系统及医疗应用之间缺乏整合性理解,限制了分子见解转化为可持续生产 | 提供药用植物研究中前沿方法的全面概述,聚焦提高重要生物活性化合物的产量 | 药用植物,包括青蒿、大麻、人参和红豆杉等,及其产生的青蒿素、大麻素、人参皂苷和紫杉醇等化合物 | 机器学习和数字病理学 | NA | RNA-seq, CRISPR-Cas9, 合成生物学, 代谢工程 | 机器学习, 人工智能 | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学, 代谢工程 | 药用植物(青蒿、大麻、人参、红豆杉) | 代谢通路工程和合成途径设计 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 25 | 2026-05-28 |
Rethinking Microbial Chemical Ecology: Secondary Metabolites as Concentration-Dependent Signaling Hubs with Implications for Anti-Virulence Intervention
2026-May-09, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14051074
PMID:42197459
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review | 提出一个整合信号网络框架,将次级代谢物视为连接微生物集体行为和环境适应的关键节点 | 打破传统对群体感应信号分子和细胞毒性次级代谢物的严格区分,提出次级代谢物在低浓度下具有双重功能的信号枢纽新视角 | 未涉及具体的实验验证或模型数据支持 | 重建微生物化学生态学为动态信号网络,并探讨其在抗毒力干预、抗生素耐药性应对和工业生物技术中的应用 | 微生物次级代谢物及其在化学生态中的信号功能 | 微生物生态学、化学生态学 | 抗生素耐药性 | 空间组学、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | 整合信号网络、代谢物信号枢纽 | 工业生物技术, 环境生物修复, 医学 |
| 26 | 2026-05-28 |
Expanding the Microbial Genomic Landscape and Biotechnological Applications of CRISPR-Cas Systems
2026-May-08, Biology
DOI:10.3390/biology15100748
PMID:42187710
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综述 | 系统回顾CRISPR-Cas系统的多样性、微生物基因组分布及其在生物技术中的前沿应用 | 全面总结新型CRISPR效应因子的计算挖掘进展,包括微型结构、RNA靶向和混杂切割活性,以及碱基编辑、先导编辑等衍生技术的多样化应用 | 复杂1类系统的递送挑战尚未完全解决,伦理和生物安全问题仍需深入探讨 | 概述CRISPR-Cas系统的多样性及其在合成生物学、治疗、诊断、环境修复和农业中的转化潜力 | 微生物(细菌和古菌)中的CRISPR-Cas系统 | 机器学习,计算生物学 | NA | CRISPR-Cas系统,计算挖掘,宏基因组分析 | NA | 基因组和宏基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas9,CRISPR-Cas12,CRISPR-Cas13 | 细菌,古菌 | 基因组编辑,转录调控,表观遗传编辑,核酸检测,基因敲入/敲除,活细胞DNA/RNA成像 | 医学,农业,环境修复,工业生物技术 |
| 27 | 2026-05-28 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
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综述 | 提出受发育启发的合成肾脏工程策略,利用胚胎肾脏发育原理进行多尺度结构体外构建 | 首次提出'发育工程'策略,将体内发育的空间和时间线索用于引导体外多尺度结构形成,并结合合成生物学、空间图案化和组织微环境控制等新兴工具 | 临床转化受限于结果变异性、细胞类型缺失、功能成熟度不足和可扩展性差,且该蓝图需进一步验证 | 开发可规模化生产且适用于肾脏替代治疗的工程组织策略 | 基于干细胞的肾组织及胚胎肾脏发育原理 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 干细胞来源的肾组织 | 发育工程引导的组织基序(motif)构建与串联 | 医学 |
| 28 | 2026-05-28 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
|
综述 | 系统综述了生物分子凝聚体液-固转变的分子机制、工程调控策略及其在合成生物学中的应用 | 首次将液-固转变作为设计原则整合到系统化学和合成生物学中 | 当前对液-固转变的时空控制仍面临挑战,需进一步探索其在实际生物系统中的可靠性 | 阐明液-固转变的分子语法及工程策略,推动其在合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体的液-固转变过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 液-固转变调控回路 | 医学,系统化学,合成生物学 |
| 29 | 2026-05-28 |
Virtual cell: Current perspectives and future prospects
2026-May, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605261425080
PMID:42200280
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综述 | 虚拟细胞技术通过整合生物学、计算机科学和人工智能等多学科,模拟细胞结构与功能,并展望其未来应用 | 提出虚拟细胞作为整体性方法,集成单细胞测序、亚细胞成像和计算能力,实现多尺度仿真 | 面临数据整合、模型可解释性和计算成本等挑战 | 探讨虚拟细胞技术的现状、潜力及未来发展方向 | 虚拟细胞模型及其在多领域的应用 | 计算机科学 | NA | 单细胞测序、亚细胞成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 精准医学、药物发现、合成生物学 |
| 30 | 2026-05-28 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
|
综述 | 本文综述了噬菌体在抗生素耐药时代作为抗菌替代疗法的生物学基础、治疗应用及挑战 | 整合了噬菌体生物学、基因工程进展(如CRISPR-Cas系统、重组工程和合成基因组重启)及多领域应用(临床治疗、食品安全、环境消毒和生物膜控制),并系统讨论了监管框架和宿主抗性动态等关键问题 | 未提供具体实验数据或案例研究的量化结果,主要基于现有文献的理论总结 | 评估噬菌体疗法作为抗生素替代方案的潜力和可持续性,应对全球抗菌耐药性危机 | 噬菌体及其在细菌感染治疗、生物控制中的应用 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体重组工程、合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | NA | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 31 | 2026-05-28 |
Engineering and Biological Mechanisms of Microalgal CO2 Fixation: A Review from Molecular Regulation to System Optimization
2026-Apr-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14050999
PMID:42197385
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综述 | 该综述综合分析了微藻固碳的工程和生物学机制,从分子调控到系统优化涵盖多个层面 | 首次从多尺度视角整合气体-液体传质、CO2同化途径、关键酶系统、代谢调控和环境控制,并提出合成生物学、人工智能和系统工程融合的未来路线图 | 综述侧重于机制总结和展望,未提供具体的实验验证或定量比较不同策略的实际性能 | 为开发高效、智能和可持续的微藻固碳系统提供统一的理论框架和前瞻性视角 | 微藻及其固碳机制 | 机器学习和合成生物学 | NA | 代谢通量分析、系统建模 | NA | 文本和知识综述 | NA | 合成生物学、人工智能 | 微藻 | CO2固定途径、碳浓缩机制、RUBISCO和碳酸酐酶系统 | 能源、环境、工业生物技术 |
| 32 | 2026-05-28 |
Marine Polysaccharides Modulating the Gut Microbiota-Immune Axis in Digestive Tract Tumors: An Update
2026-Apr-23, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md24050148
PMID:42188283
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综述 | 系统综述了海洋多糖通过调节肠道菌群-免疫轴在消化道肿瘤治疗中的最新研究进展 | 首次基于多糖结构、菌群调控、免疫激活、肿瘤抑制和递送优化的逻辑框架,系统阐述了海洋多糖对肠道菌群-免疫轴的调控作用及核心机制,并分析了结构决定因素、修饰策略及纳米递送系统开发 | 海洋多糖的结构-活性关系(SARs)尚不明确,口服生物利用度低,现有研究存在关键空白 | 探讨海洋多糖作为新型治疗剂在消化道肿瘤中的应用潜力,并为未来研究方向提供指导 | 海洋多糖(藻类、动物和微生物来源)及其对肠道菌群-免疫轴的调控 | NA | 消化道肿瘤 | 多组学分析、合成生物学技术、纳米递送策略 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医学 |
| 33 | 2026-05-28 |
Assetizing Diversity: Microbial Culture Collections in an Age of Biotechnology, Biodiversity, and Speculative Value Generation (1972-2022)
2026-Mar, Journal of the history of biology
IF:0.7Q2
DOI:10.1007/s10739-026-09853-y
PMID:42118395
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综述 | 追溯1972至2022年微生物资源保藏中心的历史,探讨微生物多样性保护与生物技术价值化的演变 | 将微生物价值资产化进程与全球微生物公地圈占联系起来,分析保藏中心在生物技术产业全球化中的双重角色 | 未解决全球异地保护基础设施分布不均及微生物价值生成的不对称问题,遗漏2010年名古屋议定书后的实质性进展 | 揭示微生物资源从公共物品向资产化转变的过程及其对保护、商业和全球治理的影响 | 欧洲、美洲、亚洲的微生物培养物保藏中心及世界培养物保藏联合会 | 数字病理学 | NA | 测序技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术、农业、环境 |
| 34 | 2026-05-28 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
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综述 | 综述了用于开发重组活体生物治疗药物的最新技术进展 | 综合运用合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计重组活体生物治疗药物,以提升疗效、监管接受度和临床转化 | 在规模化生产、安全性和临床应用方面仍存在重大挑战 | 探讨重组活体生物治疗药物的开发进展及其在人类健康中的治疗潜力 | 重组活体生物治疗药物 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物物种 | NA | 医学 |
| 35 | 2026-05-28 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
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综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为新型活体生物治疗剂来源的潜力 | 提出将生殖道微生物组作为活体生物治疗候选菌的新来源,并强调了合成生物学和基因工程在开发下一代活体生物治疗剂中的应用 | 未明确说明具体局限性,但作为章节综述可能缺乏实验验证和临床数据支持 | 探索人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂来源的潜力,并总结相关研究进展 | 人类生殖道微生物组,特别是女性阴道微生物群落 | 微生物医学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、妊娠并发症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类(女性生殖道) | NA | 医学 |
| 36 | 2026-05-28 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 综述蛋白质工程在医学、食品和环境领域的最新进展 | 重点介绍了蛋白质工程在人类疾病和生物医学中的最新进展,包括定向进化、理性设计、半理性设计及混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程应用中的当前挑战和伦理考虑 | 概述蛋白质工程在人类疾病(尤其是癌症治疗)中的变革潜力 | 蛋白质工程方法及其在治疗性蛋白质、抗体工程、酶合成中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | 医学, 食品, 环境 |
| 37 | 2026-05-28 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
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综述 | 综述了基础技术(如合成生物学、CRISPR-Cas9、NGS/组学、人工智能等)与计算机科学协同如何推进用于生物医学基因工程的微生物表达系统 | 强调了多种基础技术与计算机科学的协同效应及其在微生物表达系统中的应用潜力 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等问题 | 探讨和总结基础技术与计算机科学如何协同推进微生物表达系统在生物医学基因工程中的应用 | 微生物表达系统 | NA | NA | 合成生物学, CRISPR-Cas9, NGS, 组学技术, 人工智能, 系统生物学, 代谢建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 微生物表达系统 | 医学 |
| 38 | 2026-05-28 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
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研究论文 | 本文展示了一个双蛋白系统McdAB可被重新编程以实现对细菌多种细胞器的空间控制 | 首次证明McdAB系统可以重新编程以控制所有已知类型的细菌细胞器(包括类囊体、包囊体、生物分子凝聚体和膜结合细胞器)的空间组织,为合成生物学建立了新的设计原理 | 未明确说明局限性 | 研究细菌细胞器的空间组织是否可以被工程化控制 | McdAB双蛋白系统和细菌细胞器(羧酶体、包囊体、生物分子凝聚体、膜结合细胞器) | 合成生物学 | NA | 异源表达、蛋白重新编程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | McdAB系统用于细胞器空间定位调控 | 工业生物技术 |
| 39 | 2026-05-28 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
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研究论文 | 提出了一种基于自发光真菌生物发光循环的定量报告系统,用于植物合成生物学中的基因表达测量 | 首次利用Neonothopanus nambi真菌全生物发光循环构建自维持报告系统,无需外源供应荧光素酶底物,并通过设置HispS基因作为转录入口点显著提高动态范围 | 未明确说明,但可能包括植物中自发光系统的长期稳定性和组织特异性表达等潜在问题 | 开发低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统,以优化合成基因回路 | 本氏烟草(N. benthamiana)和拟南芥(推测) | 植物合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 发光和荧光数据 | 涉及多种合成基因回路,包括植物激素传感器和光遗传传感器等,具体样本数量未明确 | NA | 本氏烟草(N. benthamiana) | 自发光报告回路(NeoLuc/eGFP系统),包括激素传感器、光遗传传感器和化学/光双开关 | 农业、工业生物技术 |
| 40 | 2026-05-28 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
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研究论文 | 结合大规模测量和机器学习,提出了两种精确设计遗传传感器的方法:计算机模拟选择和机器学习前向工程 | 首次将计算机模拟选择与机器学习相结合,实现遗传传感器剂量响应的定量精确工程,包括多目标优化和反向剂量响应工程 | NA | 开发定量精确工程生物功能的方法,特别是遗传传感器的编程响应 | 遗传传感器及其DNA序列 | 机器学习 | NA | 大规模基因型-表型数据集分析 | 机器学习模型 | 序列数据 | 大规模基因型-表型数据集 | NA | NA | 遗传传感器(剂量响应电路) | 工业生物技术 |