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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-06-16 |
An old dog with new tricks - the value of photorespiration as a central metabolic hub with implications for environmental acclimation
2025-Jun-14, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf258
PMID:40515676
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research paper | 本文探讨了光呼吸作为中心代谢枢纽的价值及其对环境适应的意义 | 揭示了光呼吸途径中的新代谢参与者、复杂的细胞器间相互作用和新的调控网络,以及光呼吸在保卫细胞中的新作用 | NA | 增强光合效率,提高植物对未来气候的适应能力 | 光呼吸及其在光合作用中的作用 | 植物生理学 | NA | 同位素标记研究、反向遗传学、合成生物学方法 | NA | NA | NA |
2 | 2025-06-16 |
'Intelligent' proteins
2025-Jun-14, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05770-1
PMID:40515853
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research paper | 提出了一种挑战传统蛋白质分子观点的新理念,认为蛋白质表现出一种基本的‘智能’形式 | 结合集成信息理论(IIT)、网络理论和变构效应,重新定义蛋白质智能,探索其信息处理、环境适应和记忆行为 | 将智能概念应用于分子系统存在挑战,且如何创造适应性‘智能’蛋白质仍需探索 | 通过集成信息理论(IIT)理解蛋白质的动态和适应性本质 | 蛋白质分子 | 生物化学 | NA | 集成信息理论(IIT)、网络理论、变构效应分析 | NA | 理论分析 | NA |
3 | 2025-06-16 |
DNA-programmed responsive microorganism assembly with controlled patterns and behaviors
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads8651
PMID:40512851
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研究论文 | 该研究展示了利用功能性DNA作为可编程表面受体来调控微生物群落的模式和行为 | 通过代谢标记和疏水插入方法,将DNA修饰到多种微生物上,实现了对微生物组装的精确空间控制和刺激响应性聚集 | NA | 开发可编程的微生物粘附方法以构建具有可控模式和行为的微生物群落 | 革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和休眠孢子等多种微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢标记、疏水插入、DNA编程 | NA | NA | 多种微生物(包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌) |
4 | 2025-06-16 |
Establishing Halomonas as a chassis for industrial biotechnology: advances in synthetic biology tool development and metabolic engineering strategies
2025-Jun-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02757-2
PMID:40506695
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综述 | 本文综述了Halomonas作为工业生物技术底盘生物的最新进展,包括合成生物学工具开发和代谢工程策略 | 突出了Halomonas在高盐条件下生长的独特优势及其在开放、非无菌条件下培养的潜力 | 转化困难等工具应用面临的挑战 | 探讨Halomonas作为工业生物技术底盘生物的潜力 | Halomonas菌种 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学工具、代谢工程 | NA | NA | NA |
5 | 2025-06-16 |
Bridging biomedicine and technology: the impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-12, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 本文探讨了生成式人工智能(GenAI)在生命科学和农业商业中的多方面影响 | GenAI在药物发现、蛋白质折叠预测、基因组学研究、生物标志物识别以及作物育种优化等方面展现出创新应用 | 未提及具体的技术实现细节或实验验证结果 | 探讨GenAI在生命科学和农业商业中的应用及其潜在影响 | 生命科学和农业商业领域的技术应用 | 人工智能 | NA | 生成式人工智能(GenAI) | NA | 基因组数据、生态数据 | NA |
6 | 2025-06-16 |
Fungal bioconversion of lignin-derived aromatics: Pathways, enzymes, and biotechnological potential
2025-Jun-10, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108624
PMID:40505753
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综述 | 本文综述了真菌对木质素衍生芳香化合物的生物转化途径、酶及其生物技术潜力 | 系统性整合了芳香族分解代谢途径的最新研究进展,强调了真菌转运系统在芳香化合物吸收和外排中的关键作用 | 对芳香族分解代谢途径的系统整合仍显零散 | 推动基于真菌的平台用于可再生芳香族化合物的可持续生产 | 木质素衍生芳香化合物(如肉桂酸、没食子酸、阿魏酸和香草醛) | 生物技术 | NA | 合成生物学、计算建模和系统生物学 | NA | NA | NA |
7 | 2025-06-16 |
Complexity Meets Risk-The Next Generation of Genome-Edited Plants Challenges Established Concepts for Environmental Risk Assessment in the EU
2025-Jun-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14111723
PMID:40508397
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research paper | 该论文探讨了新一代基因组编辑植物对欧盟环境风险评估(ERA)现有概念的挑战,并提出了一种假设驱动的评估方法 | 提出了针对复杂基因组编辑植物的假设驱动评估方法,补充现有比较评估方法的不足 | 研究主要基于案例分析,可能缺乏广泛的实证支持 | 评估欧盟现行的环境风险评估方法在处理复杂基因组编辑植物时的适用性 | 基因组编辑植物(GMPs)及其环境风险评估 | 生物技术 | NA | 基因组编辑技术 | NA | 案例分析数据 | NA |
8 | 2025-06-16 |
Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV) for Modulating Cell Death and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_15
PMID:40515910
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研究论文 | 该文章综述了水泡性口炎病毒(VSV)在调节细胞死亡和抗肿瘤免疫中的工程应用 | 文章介绍了通过分子生物学技术,特别是反向遗传学和合成生物学,精确改造VSV基因组,以增强其在癌症治疗中的应用,特别是通过引入促凋亡基因XAF1来提高抗肿瘤效果 | 文章未提及具体的实验数据或临床结果,可能缺乏实际应用效果的验证 | 提高VSV在抗肿瘤免疫和其他治疗领域的疗效 | 水泡性口炎病毒(VSV)及其工程改造 | 分子生物学 | 肿瘤 | 反向遗传学、合成生物学 | NA | NA | NA |
9 | 2025-06-16 |
Engineering of the WSN Strain for Investigating Antiviral and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_18
PMID:40515913
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研究论文 | 本文描述了基于甲型流感病毒反向遗传系统对H1N1毒株WSN进行基因工程改造的方法,并详细探讨了其在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | 利用反向遗传学和合成生物学技术对流感病毒进行基因工程改造,以更有效地控制病毒复制并增强疫苗安全性和宿主免疫反应,同时探索其在肿瘤免疫治疗中的应用 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 研究基因工程改造流感病毒在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | H1N1毒株WSN | 合成生物学 | 流感 | 反向遗传学 | NA | NA | NA |
10 | 2025-06-16 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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research paper | 该研究展示了通过编程控制基因可用性时间来解决合成生物学中基因电路瞬时传递的挑战 | 利用位点特异性重组酶通过编程控制基因可用性时间,显著减少了基因电路的基底泄漏,并提高了传感器的动态范围 | 未提及具体的技术实施细节和可能的体内应用限制 | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 基因电路和microRNA传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
11 | 2025-06-15 |
From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.005
PMID:40510533
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review | 该文章回顾了生物合成途径设计中的关键计算工具 | 整合了生物大数据、逆合成方法和酶工程三个关键组件,显著提高了生物合成途径设计的效率和准确性 | NA | 提高生物合成途径设计的效率和准确性 | 生物合成途径设计中的计算工具 | 合成生物学 | NA | 数据挖掘、逆合成方法 | NA | 生物大数据(包括化合物、反应/途径和酶) | NA |
12 | 2025-06-15 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
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research paper | 本文讨论了利用干细胞技术和工程工具整合的工程模型在研究人类发育早期阶段中的应用 | 整合了工程技术和合成生物学工具,提高了模型的精确度,为人类早期发育阶段的研究提供了新视角 | NA | 研究人类发育早期阶段的细胞分化和组织形成 | 人类早期发育阶段的细胞和组织 | synthetic biology | NA | stem cell technology, micropatterned substrates, microfluidic systems, synthetic biology tools | blastoids, 2D micropatterned systems, 3D gastruloid constructs, somitoids | NA | NA |
13 | 2025-06-15 |
Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf511
PMID:40503683
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选和表征酵母中的双向启动子(BDPs),揭示了其调控机制并应用于代谢通量的精细调控 | 利用DREAM-CNN AI预测模型识别BDPs中的保守激活剂结合热点,并通过实验验证这些热点对BDP功能的关键作用 | 研究仅针对酵母Saccharomyces cerevisiae,未在其他生物体中验证BDPs的普适性 | 探索双向启动子的调控机制并应用于合成生物学中的基因共表达和代谢通量调控 | 酵母Saccharomyces cerevisiae中的749个双向启动子候选者 | 合成生物学 | NA | 全基因组筛选、转录组分析、荧光报告分析、计算机模拟突变 | DREAM-CNN | 基因组数据、转录组数据、荧光报告数据 | 749个双向启动子候选者 |
14 | 2025-06-15 |
Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture
2025-Jun-03, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04279-x
PMID:40459729
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌MCCB 117中绿脓菌素产量的前景,以作为水产养殖中的首选药物 | 提出了利用合成生物学工具增强绿脓菌素生物合成的分子机制和基因水平操作的新方法 | 未提及具体实验数据或实施细节 | 研究如何通过合成生物学方法提高绿脓菌素的产量,以应用于可持续水产养殖生产系统 | 铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径 | 合成生物学 | 弧菌病 | 基因水平操作 | NA | NA | NA |
15 | 2025-06-15 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
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研究论文 | 介绍了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用微生物进行安全信息存储和传输 | 结合DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态性,提供数据加密和存储的创新平台 | NA | 开发一种安全可控的信息存储和传输系统 | 利用合成生物学改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | DNA编码信息 | NA |
16 | 2025-06-15 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
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综述 | 本文全面综述了类黄酮生物合成的代谢工程策略及其应用前景 | 整合植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和AI驱动的代谢工程,提出可持续高产类黄酮的新路线图 | 未提及具体实验验证数据或案例研究 | 探索提高类黄酮产量的综合代谢工程策略 | 植物类黄酮生物合成途径及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、AI驱动的代谢工程 | NA | 代谢组学数据 | NA |
17 | 2025-06-15 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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research paper | 提出了一种开放式的合成生物学设计方法,强调设计的新颖性与实现目标同等重要 | 提出将新颖性作为生物设计的重要考量,而不仅仅是优化单一最佳设计,以突破工程生物学中性能提升的瓶颈 | 未具体说明开放式设计方法在实际应用中的具体操作步骤或验证案例 | 探索合成生物学中更具创造性的设计方法,以克服当前系统复杂性瓶颈和实验室到实际应用的转化难题 | 合成生物学设计方法 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
18 | 2025-06-14 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学和预测工具,鉴定了疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶,并验证了其中14种的定位,揭示了6种对寄生虫生存至关重要的酶 | 首次系统鉴定了疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合,并确定了其中6种对寄生虫生存和顶质体功能至关重要的酶 | 有2个基因无法被敲除,其中一个具有双重定位,可能在其他细胞器中具有必需功能,另一个可能具有无法通过代谢旁路绕过的关键作用 | 研究疟原虫顶质体中最小翻译系统所需的tRNA修饰酶及其功能 | 疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 分子生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶,其中14种被实验验证 |
19 | 2025-06-14 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
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review | 探讨糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出临时糖基化支架策略,为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 研究糖基化对蛋白质折叠的影响及其在生物技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质折叠及糖基化修饰 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA |
20 | 2025-06-14 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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research paper | 该研究描述了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,用于微生物生物合成苯乙烯 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1,能够在微生物中高效催化反式肉桂酸脱羧生成苯乙烯,并解析了其晶体结构 | NA | 开发更环保的苯乙烯生物合成方法以替代传统石化工艺 | 反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |