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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-09-17 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2025-Sep-16, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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系统综述 | 本文系统综述虫媒病毒病在变化世界中的进化动态、宿主-媒介相互作用及新型控制策略 | 整合基因组分析、元流行病学综合与预测建模,强调CRISPR基因驱动和RNAi抗病毒等创新控制方法 | 基因编辑和微生物干预存在伦理、生态及监管问题需审慎考虑 | 理解虫媒病毒的进化机制、宿主-媒介相互作用及疾病控制策略 | 虫媒病毒(如登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗河病毒)及其传播媒介(蚊、蜱等) | 传染病学与公共卫生 | 虫媒病毒性疾病 | 基因组分析、预测建模、CRISPR基因驱动、RNAi技术 | 预测模型 | 基因组数据、流行病学数据 | 从16,320条记录中筛选出12项高质量研究 |
2 | 2025-09-16 |
De novo biosynthesis of Asperosaponin VI in Saccharomyces cerevisiae
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.007
PMID:40951686
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研究论文 | 本研究在酿酒酵母中首次实现了Asperosaponin VI的从头生物合成 | 首次在微生物中完整重建ASA VI生物合成途径,采用模块化合成生物学策略 | 产量仍处于痕量水平(395 ng/L),下游糖基化步骤和UDP-Ara供应可能是主要限速因素 | 开发微生物平台用于可持续生产ASA VI及相关阿拉伯糖基化皂苷 | Asperosaponin VI(ASA VI)生物活性化合物 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学策略、LC-MS分析、异源表达 | NA | 代谢物分析数据 | 微生物培养体系 |
3 | 2025-09-15 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications
2025-Oct-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学原理设计变构调控及其在生物医学领域的应用潜力 | 整合人工智能生成式蛋白质设计方法开发新型变构调控策略 | NA | 通过合成生物学方法实现蛋白质功能的变构调控 | 蛋白质变构调控机制与合成生物学设计策略 | 合成生物学 | NA | 结构域插入、从头蛋白质开关设计、工程化变构机制 | AI生成式蛋白质设计 | 蛋白质结构数据 | NA |
4 | 2025-09-15 |
Multivalent engineering of bio interfaces with DNA-based nanomaterials
2025-Oct, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115681
PMID:40865643
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综述 | 本文综述了基于DNA纳米材料的多价工程在生物界面设计中的原理、进展与应用 | 提出了'多价工程'概念,通过DNA纳米技术实现配体空间编程以调控生物功能 | 在复杂体内环境中应用仍面临挑战 | 探讨多价相互作用在生物界面工程中的设计与应用 | 生物界面(细胞信号传导、免疫识别、粘附等过程) | 生物纳米技术 | NA | DNA纳米材料技术 | NA | NA | NA |
5 | 2025-09-15 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Sep-12, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
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综述 | 本文回顾了CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的挑战与突破性策略 | 重点介绍了整合合成生物学和基因工程的新一代CAR-T疗法,以增强细胞适应性、效力和持久性,并重编程肿瘤微环境 | NA | 探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤中的应用障碍及解决方案 | 实体瘤患者及临床前模型(如人源化异种移植小鼠) | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | 合成生物学、基因工程 | NA | 临床实验数据及临床前模型数据 | NA |
6 | 2025-09-15 |
From marsh to market: taming Vibrio natriegens for sustainable bioproduction
2025-Sep-11, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103353
PMID:40945411
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研究论文 | 探讨利用Vibrio natriegens作为可持续生物生产底盘的发展潜力 | 提出通过系统生物技术方法结合菌株和工艺工程,实现可扩展的下一代生物制造 | 在实现高产物产量和处理难降解底物方面仍存在重要限制 | 开发可持续生物生产技术 | Vibrio natriegens细菌 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、合成生物学工具、系统水平分析 | NA | NA | NA |
7 | 2025-09-15 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Sep-11, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
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研究论文 | 本研究通过构建启动子库和新型杂交启动子扩展了群体感应工具箱,用于动态遗传电路的精细调控 | 创建了自然界不存在的新型杂交启动子(需两种自诱导剂激活)并构建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库 | NA | 扩展群体感应系统的调控能力,开发动态遗传电路设计工具 | 群体感应系统、遗传电路、启动子调控元件 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计、启动子工程 | NA | 遗传元件性能数据 | NA |
8 | 2025-09-15 |
A highly biosimilar synthetic Calculus Bovis enhances cerebral blood flow and provides neuroprotection against ischemic stroke
2025-Sep-11, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120602
PMID:40945882
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研究论文 | 本研究评估了一种高度生物相似性的人工合成牛黄(HBSCB)在减轻缺血性脑损伤和增强脑血流方面的功效 | 首次通过合成生物学方法制备高度生物相似性的人工牛黄,并证实其在缺血性卒中后4小时内给药具有神经保护作用和改善脑血流的效果 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型,未涉及其他物种或性别差异分析 | 评估人工合成牛黄对缺血性卒中的治疗潜力 | 雄性C57BL/6J小鼠(经tMCAO模型处理) | 神经药理学 | 缺血性卒中 | 合成生物学、色谱指纹图谱、激光散斑对比成像、FJB染色、尼氏染色 | NA | 实验数据 | 使用不同剂量HBSCB(35.95, 71.9, 143.8 mg/kg)处理的tMCAO模型小鼠 |
9 | 2025-09-15 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文综述了可编程DNA纳米结构在刺激响应药物递送和多模式生物传感中的最新进展与应用 | 聚焦DNA纳米结构(如瓦片组装体、折纸框架、球形核酸)对肿瘤微环境(pH、酶活性等)的动态响应能力,并整合多模式检测技术(FRET、电化学发光等) | 存在规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等转化挑战 | 推动精准医疗中靶向药物递送和生物医学成像的发展 | DNA纳米结构(包括瓦片组装体、折纸框架、球形核酸、刺激响应水凝胶等) | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术、FRET、电化学发光、SERS | NA | 生物分子数据(如ctDNA、外泌体) | NA(预临床研究,未明确样本量) |
10 | 2025-09-15 |
Introduction to "Biomolecular Technologies"
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb90031j
PMID:40843437
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评论 | 本期专题集合介绍了基于工程化生物分子的技术及其在生物催化、生物传感和合成生物学等领域的应用 | NA | NA | 概述生物分子技术的最新进展和应用领域 | 工程化生物分子(包括小分子、核酸和蛋白质) | 生物技术 | NA | 生物分子工程 | NA | NA | NA |
11 | 2025-09-15 |
Gene duplication and clustering underlie the conservation and diversification of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in plants
2025-Aug-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63175-x
PMID:40826018
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研究论文 | 本研究揭示了植物中苯基异喹啉生物碱(BIA)生物合成保守性与多样性的基因复制与聚类机制 | 首次在木兰类植物中发现CYP80G介导的异波尔定生物合成中的酚偶联反应,并揭示基因动态聚类与生化功能的协同进化关系 | NA | 探究开花植物中苯基异喹啉生物碱生物合成的进化机制与保守性 | 蕺菜(Houttuynia cordata)及被子植物中的基因与酶系统 | 植物分子生物学 | NA | 功能分析、全基因组分析 | NA | 基因组数据、酶功能数据 | NA |
12 | 2025-09-15 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
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研究论文 | 提出一种基于生物分子自适应控制器的合成生物学方法,用于优化干细胞分化过程以提高特定细胞命运的产量 | 设计了一种类似IFFL拓扑结构的自适应控制器,无需参考信号即可工作,且对内在调控网络机制知识要求极低 | NA | 开发合成基因电路以增强干细胞分化疗法中特定细胞类型的产出效率 | 干细胞分化过程及多稳态生物系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、自适应控制、计算分析 | 自适应控制器(IFFL类似拓扑) | 理论模型与计算模拟数据 | NA |
13 | 2025-09-15 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌Kay病毒进行结构修饰,用于成像和生物传感应用 | 首次报道了葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,通过在尾鞘蛋白暴露环中插入多组氨酸标签实现 | NA | 开发基因编辑的噬菌体用于生物技术和医学应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、同源重组、荧光显微镜、生物层干涉技术、ELISA、流式细胞术 | NA | 生物分子数据、图像数据 | NA |
14 | 2025-09-15 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 本研究优化了用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性的丙二酰辅酶A生物传感器,在重构的无细胞系统中实现了宽检测范围和高度灵敏的定量分析 | 通过改造T7启动子与FapO操作子间的间隔序列,开发出检测范围更宽(50-1500 μM)的无细胞生物传感器系统,并筛选出对低浓度丙二酰辅酶A敏感的FapR/FapO同源对 | 研究基于无细胞系统,可能无法完全模拟体内环境的复杂性;传感器性能仍需在实际代谢工程应用中进一步验证 | 优化丙二酰辅酶A生物传感器,以支持乙酰辅酶A羧化酶的高通量筛选和定向进化 | 丙二酰辅酶A生物传感器(FapR/FapO系统)和乙酰辅酶A羧化酶(ACC) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统、定向进化、高通量筛选 | NA | 荧光信号数据 | 使用多种芽孢杆菌门的FapR/FapO同源对进行筛选,检测灵敏度达100 pM ACC编码DNA模板 |
15 | 2025-09-15 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 本研究利用生物发光技术优化基于双生病毒的植物合成生物学载体,评估其表达特性和应用潜力 | 采用自体生物发光作为实时报告系统,对三种双生病毒载体进行系统比较和优化,提高调控精度 | 仅针对三种特定双生病毒载体进行评估,未涵盖其他病毒系统 | 优化植物合成生物学中使用的双生病毒载体,提升重组蛋白生产和基因调控能力 | 基于豆黄矮病毒(BeYDV)、番茄黄叶卷曲病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 合成生物学 | NA | 生物发光报告系统 | NA | 生物发光信号数据 | 三种病毒复制子系统(BeYDV、TYLCV、BCTV) |
16 | 2025-09-15 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
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研究论文 | 利用工程化细胞分裂素调节因子理性调控植物根系发育 | 通过理性设计B型响应调节因子,实现对细胞分裂素依赖性状的可预测调控,并降低其对细胞分裂素的敏感性 | NA | 开发合成生物学工具以精确控制植物定量发育表型 | 植物根系发育(侧根数量) | 合成生物学 | NA | 组织特异性启动子、转录因子工程化 | NA | NA | NA |
17 | 2025-09-15 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
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研究论文 | 本文开发了结合预印本批判性分析和探究式实验的主动学习工作流,以提升合成生物学的教学效果 | 利用预印本与最终发表论文的对比分析作为教学资源,并设计CRISPRi基因电路实践环节,使学生完整参与设计-构建-测试-学习循环 | NA | 改进合成生物学教学方法,提升学生的批判性分析能力和跨学科知识掌握 | 大学生 | 合成生物学 | NA | CRISPRi基因电路技术 | NA | 文本数据(预印本与论文)、实验数据 | 学生群体(具体数量未明确),90%报告批判分析技能提升,80%认为掌握了广泛概念 |
18 | 2025-09-15 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
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研究论文 | 提出一种机器学习引导的框架Toehold-VISTA,用于快速设计高性能RNA传感器 | 整合生物物理建模与机器学习(PLS-DA),通过序列-结构特征提取预测RNA传感器性能 | NA | 加速RNA传感器的设计与筛选过程,提升其对特定RNA靶标的响应性能 | RNA传感器(特别是toehold开关)与靶标RNA(如SARS-CoV-2 RNA)的相互作用 | 机器学习 | 传染病(如COVID-19) | 高通量实验测量、序列-结构特征提取、PLS-DA机器学习 | PLS-DA(偏最小二乘判别分析) | RNA序列与结构数据 | NA |
19 | 2025-09-15 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 本文开发了针对蛋白质结构预测与设计工具的容器化解决方案,以提升计算效率和部署便捷性 | 提出了跨多种计算架构优化的容器化方案及OmniFold包装平台,支持多工具并行运行并自动生成质控报告 | 未明确说明容器性能的具体提升指标或在不同硬件环境下的兼容性测试范围 | 降低高性能蛋白质结构预测与设计工具的计算部署门槛,促进科研可重复性和可及性 | 蛋白质结构预测工具(AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2)和设计平台(RFdiffusion) | 计算生物学 | NA | 容器化技术(如Docker/Singularity)、GPU优化计算 | NA | 蛋白质结构数据、分子相互作用数据 | NA |
20 | 2025-09-15 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 本研究通过分析Pepper RNA变体,揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦现象 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦,并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度有显著影响 | NA | 定量评估单个核苷酸对HBC530结合亲和力、镁结合亲和力和荧光强度的贡献 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建与定量分析 | NA | 生化测定数据 | 53种Pepper变体 |