合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-04-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在玉米胚胎发育研究中的联合应用及其协同效果 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学两种技术研究玉米胚胎发育，提供单细胞分辨率和空间背景的基因表达模式 | 单细胞技术难以识别特定细胞簇，空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 理解玉米胚胎发育的基本机制，促进农业改良、体细胞胚胎发生条件的优化和植物合成生物学 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22 | 2025-04-25 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红光和远红光组合能够增强本氏烟草中异源蛋白和代谢物的生产 | 首次探索了光质对瞬时表达效率的影响，并发现红远光组合能显著提高异源蛋白和代谢物的产量 | 研究仅在本氏烟草中进行，未在其他植物中验证 | 探索光质对植物瞬时表达系统效率的影响 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | 未明确说明样本数量 |
| 23 | 2025-04-25 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
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research paper | 该研究结合扩散模型和Transformer模型，用于增强合成启动子的设计和强度预测 | 首次将扩散模型应用于合成启动子设计，并结合Transformer模型进行强度预测，相比传统方法表现更优 | 研究仅针对模型细菌和蓝藻细菌进行验证，未在其他生物体中测试 | 优化外源基因表达和代谢途径效率，开发高性能合成启动子 | 合成启动子序列 | synthetic biology | NA | deep learning | diffusion model, Transformer, CNN, variational autoencoder | biological sequence data | NA |
| 24 | 2025-04-25 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Apr-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
|
research paper | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用及其对鱼类免疫力的提升作用 | 利用合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动基于微藻的疫苗创新 | NA | 探索和开发可持续的水产养殖疫苗以增强鱼类免疫力和减少疾病爆发 | 微藻基疫苗及其在水产养殖中的应用 | 生物技术 | 水产养殖疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-04-25 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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research paper | 该研究通过电子传递工程优化人工设计的细胞工厂，实现了胆固醇和孕烯醇酮的高效生物合成 | 阐明了NADPH依赖酶的电子传递机制，并系统性地改造了酿酒酵母的电子传递链，显著加速了去质子化和质子耦合电子传递过程 | 未提及具体实验规模的限制或潜在的应用障碍 | 提高类固醇生物合成的效率和产量 | 人工设计的细胞工厂（酿酒酵母）及其电子传递系统 | 合成生物学 | NA | 电子传递工程（ETE） | NA | NA | NA |
| 26 | 2025-04-25 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
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research paper | 该研究调查了四种常用质粒骨架在克隆和野生型大肠杆菌菌株中形成多聚体的情况，并提出了避免多聚体产生的解决方案 | 首次系统调查了不同质粒骨架在多聚体形成方面的差异，并提出了通过单基因敲除避免多聚体产生的方法 | 研究仅针对大肠杆菌的两种菌株(JM109和MG1655)，未在其他宿主系统中验证 | 优化基于质粒的合成生物学电路设计和可靠性 | 四种常用质粒骨架在JM109和MG1655大肠杆菌菌株中的多聚体形成情况 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的测试 |
| 27 | 2025-04-25 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
|
研究论文 | 本文提出了一种多层自催化反馈策略，用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 引入多层反馈策略，实现了种群水平的积分反馈和多细胞积分器，控制功能通过不同细胞群体间的协调互动产生 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和跨尺度环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和细胞群体控制 | 合成生物学 | NA | 数学建模、多层反馈控制 | 自催化积分反馈控制器 | 数学模型、基因表达数据 | NA |
| 28 | 2025-04-25 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的敏感性和稳健性，通过五个示例电路分析了生物反馈的准确性 | 提出了多目标优化框架来研究生物反馈的性能权衡，填补了生物反馈理论框架的空白 | 仅分析了五种示例电路，可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 研究生物反馈系统的稳健性和准确性，为合成生物学和系统生物学提供理论支持 | 五种生物反馈电路（正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈） | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-04-25 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-Apr-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种来自重楼(Paris polyphylla)的4'-O-鼠李糖基转移酶(UGT73DY2)，并揭示了其在甾体皂苷生物合成中的作用 | 首次发现并表征了UGT73DY2酶，阐明了4'-O-鼠李糖基化过程，并通过合成生物学方法建立了重楼甾体皂苷的生物合成系统 | 酶催化效率仍有提升空间，生物合成系统产量相对较低 | 阐明重楼甾体皂苷糖链生物合成机制并开发其生物合成方法 | 重楼(Paris polyphylla)中的甾体皂苷及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶催化、分子动力学模拟、代谢工程 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 30 | 2025-04-25 |
Designing live bacterial therapeutics for cancer
2025-Apr-12, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115579
PMID:40228606
|
review | 本文综述了利用活细菌作为癌症治疗手段的全面指南，包括细菌选择、药物递送策略及未来挑战 | 探讨了合成生物学在编程细菌生产治疗药物中的应用，以及如何精确控制药物递送以优化治疗效果 | 未提及具体的临床试验数据或治疗效果的具体量化指标 | 探索利用活细菌治疗癌症的新策略 | 肿瘤微环境中的细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-04-25 |
Effect of Local Heterogeneities on Single-Layer DNA-Directed Protein Lattices Through Non-Averaged Single-Molecule 3D Structure Determination
2025-Apr-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6095207/v1
PMID:40235486
|
research paper | 该研究通过非平均单分子3D结构确定，探讨了局部异质性对单层DNA导向蛋白质晶格的影响 | 利用个体粒子冷冻电子断层扫描（IPET）技术分析DNA折纸八面体笼子形成的2D晶格的3D结构，揭示了晶格缺陷的分子起源 | 研究主要关注DNA笼子的柔软性和粒子间连接对晶格缺陷的影响，未涉及其他可能的结构异质性来源 | 探究DNA导向蛋白质晶格的结构异质性及其改进方法 | DNA折纸八面体笼子及其形成的2D蛋白质晶格 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子断层扫描（cryo-ET），分子动力学模拟 | NA | 3D结构数据 | 不同铁蛋白负载百分比（100%、70%、0%）的DNA笼子 |
| 32 | 2025-04-25 |
Treatment of neurological pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA
2025-Mar-06, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae304
PMID:39315766
|
research paper | 该研究开发了一种合成生物学策略，通过重编程宿主肝脏作为组织底盘，诱导和递送体内自组装siRNA以靶向ATXN3基因，从而治疗Machado-Joseph病 | 利用合成生物学策略重编程肝脏作为组织底盘，实现体内自组装siRNA的生成和递送，克服了siRNA递送效率低的障碍 | 研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 开发一种针对Machado-Joseph病的有效治疗方法 | YACMJD84.2转基因小鼠 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | siRNA技术 | NA | NA | YACMJD84.2转基因小鼠 |
| 33 | 2025-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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review | 本文综述了CRISPR/Cas基因编辑技术的发展与创新，特别是非DSB编辑器BE和PE的进展，以及其在基因治疗等领域的应用 | 重点讨论了基于CRISPR系统的非DSB编辑器BE和PE的创新策略，包括“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路 | 未提及具体的实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 探讨CRISPR/Cas基因编辑技术的创新策略及其在基因治疗等领域的应用前景 | 非DSB编辑器BE和PE | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA |
| 34 | 2025-04-25 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
|
研究论文 | 开发了一种在不改变内源基因编码序列的情况下集成遗传生物传感器的方法 | 通过将单导RNA插入基因终止子区域来激活下游电路，从而在不改变内源基因编码序列的情况下集成遗传生物传感器 | NA | 开发一种在不改变内源基因编码序列的情况下集成遗传生物传感器的方法，以更准确地监测和响应细胞状态变化 | CHO-K1细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | 数学模型 | 基因表达数据 | NA |
| 35 | 2025-04-25 |
Bioengineering lipid-based synthetic cells for therapeutic protein delivery
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.08.004
PMID:39209601
|
review | 本文综述了基于脂质的合成细胞（SCs）作为治疗性蛋白质递送平台的潜力 | 结合合成生物学和药物递送原理，利用脂质双层膜设计合成细胞，实现组织特异性靶向和免疫逃逸 | 讨论了脂质基SCs在转化应用中的挑战和潜在问题 | 探索合成细胞作为治疗性蛋白质递送平台的可行性和优势 | 脂质基合成细胞（SCs） | 合成生物学 | NA | 细胞游离蛋白质合成系统 | NA | NA | NA |
| 36 | 2025-04-25 |
Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01512-w
PMID:39259478
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研究论文 | 通过启动子捕获方法在Pseudomonadota多样菌种中鉴定新型广宿主范围启动子序列 | 利用南极微生物群落发现新型广宿主范围启动子序列，扩展了合成生物学的遗传工具包 | 研究中仅使用了约2000个克隆，可能未覆盖所有潜在的启动子序列 | 扩展合成生物学中可用的生物部件目录，特别是广宿主范围启动子序列 | 南极微生物群落中的Pseudomonadota多样菌种 | 合成生物学 | NA | 启动子捕获方法 | NA | 基因序列数据 | 约2000个克隆，鉴定出13个功能性启动子序列 |
| 37 | 2025-04-25 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT架构的预测工具TeaTFactor，用于识别茶树转录因子 | 利用预训练策略和BERT架构，首次应用于茶树转录因子的预测，开发了在线服务器 | 未明确提及模型在跨物种应用中的泛化能力 | 开发高效准确的茶树转录因子预测工具 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练模型 | BERT | 蛋白质序列数据 | 使用UniProt数据库的蛋白质数据和收集的茶树转录因子数据进行训练 |
| 38 | 2025-04-24 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-Jun-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统总结了2004年至2023年间报道的105种大环内酰胺的来源、结构、生物活性及其生物合成途径 | 首次系统讨论了大环内酰胺家族的最新进展，特别是结构-活性关系和新发现的偏离传统共线性规则的生物合成途径 | 仅涵盖了2004年至2023年间报道的105种大环内酰胺，可能未包含所有相关研究 | 为大环内酰胺的发现和通过合成生物学方法实现可持续生产提供参考 | 大环内酰胺 | 生物化学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | 105种大环内酰胺 |
| 39 | 2025-04-24 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-May, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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研究论文 | 研究濒危物种橙腹鹦鹉基因组多样性和免疫遗传多样性的长期丧失 | 利用高质量长读长参考基因组和历史及当代重测序基因组，追踪了该物种长期的基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降 | 样本量较小（当代19个，历史16个），且仅针对单一物种进行研究 | 评估濒危物种橙腹鹦鹉的基因组多样性和免疫遗传多样性丧失情况，为保护措施提供依据 | 橙腹鹦鹉（Neophema chrysogaster） | 基因组学 | 禽流感 | 长读长基因组测序，重测序 | NA | 基因组数据 | 当代样本19个，历史样本16个（最早可追溯至1829年） |
| 40 | 2025-04-24 |
Ultrasound-Energized OX40L-Expressing Biohybrid for Multidimensional Mobilization of Sustained T Cell-Mediated Antitumor Immunity and Potent Sono-Immunotherapy
2025-Apr-23, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02025
PMID:40200836
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research paper | 开发了一种超声激活的生物杂交体，通过表达OX40L和聚合物声敏剂，实现T细胞介导的抗肿瘤免疫和声免疫治疗 | 结合合成生物学和超声技术，设计了一种新型生物杂交体，通过OX40L表达和声动力效应实现多维免疫激活 | 未提及临床前或临床试验的具体结果，可能尚处于实验室研究阶段 | 开发一种新型的癌症声免疫治疗策略，通过多维免疫激活实现持久的抗肿瘤效果 | 肿瘤模型和T细胞介导的免疫反应 | 生物医学工程 | 癌症 | 合成生物学、超声技术 | 生物杂交体 | 实验数据 | NA |