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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-06-12 |
Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013
PMID:40487243
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研究论文 | 研究通过补充产色氨酸细菌修复骨质疏松小鼠的肠道屏障功能并减轻骨质流失 | 揭示了色氨酸代谢在骨质疏松与肠道功能障碍之间的关联,并提出了一种基于合成生物学的治疗策略 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探索肠道微生物代谢物色氨酸在骨质疏松和肠道功能障碍中的作用 | 骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 微生物代谢组学 | NA | NA | 小鼠模型 |
42 | 2025-06-12 |
Establishing a Serine Integrase-Based Genetic Memory System In Vitro
2025-Jul, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28986
PMID:40171936
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研究论文 | 本研究开发了一种基于丝氨酸整合酶的体外遗传记忆系统,用于DNA信息存储和处理 | 利用三种正交丝氨酸整合酶设计模块化、正交且可量化的体外遗传记忆系统,并成功应用于级联生物转化过程 | NA | 开发先进的体外遗传记忆系统以存储和处理遗传信息 | 基于丝氨酸整合酶的遗传记忆系统 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶技术 | NA | DNA | NA |
43 | 2025-06-12 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
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review | 本文综述了托鲁烯的微生物生产方法及其潜在应用 | 总结了当前提高托鲁烯产量的上游和下游工艺策略,并探讨了其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 托鲁烯的研究仍然有限,其商业化潜力尚未充分开发,微生物生产中的挑战需要解决 | 探讨托鲁烯的微生物生产方法及其在多个行业的潜在应用 | 托鲁烯及其生产菌株,特别是红酵母 | 生物技术 | NA | 系统生物学和合成生物学 | NA | NA | NA |
44 | 2025-06-12 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-Jun-11, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微流控技术的平台,用于基于大小的叶绿体分离 | 该平台整合了四个平行的确定性侧向位移(DLD)阵列,能够在一个设备中同时分离不同大小的叶绿体,提高了分离效率和纯度 | 分离效率在50-85%之间,回收部分的纯度在17-66%之间,仍有提升空间 | 开发一种快速、自动化和可扩展的叶绿体分离方法,以应用于植物研究、生物技术和合成生物学 | 叶绿体 | 生物技术 | NA | 微流控技术,确定性侧向位移(DLD) | NA | NA | NA |
45 | 2025-06-12 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA under Multifactorial Conditions
2025-Jun-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 本文通过开发高通量5DFRETMA方法,研究了环境与序列因素对三链DNA稳定性的影响 | 开发了高通量5DFRETMA方法,首次预测了不同pH/温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性 | NA | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA的稳定性 | 三链DNA | 生物化学 | NA | 5DFRETMA | 预测模型 | 荧光共振能量转移数据 | 414组缓冲条件 |
46 | 2025-06-12 |
Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature
2025-Jun-06, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479
PMID:40482852
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研究论文 | 研究极端多环境适应菌Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温的交叉与独特适应策略 | 首次揭示了N. thermophilus对碱性pH和热应激的分子机制,填补了碱性特异性调控过程和热适应机制的研究空白 | 对碱性适应的机制仍不够充分,对热适应的理解仅限于基因组分析 | 解析N. thermophilus对高盐、碱性和热应激的响应机制,揭示其生存策略 | 极端多环境适应菌Natranaerobius thermophilus | 微生物学 | NA | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
47 | 2025-06-12 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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research paper | 该论文介绍了一种基于拉曼流式细胞术的无标记高通量活细胞分选技术,用于代谢特征的基因组范围随机诱变库筛选 | 提出了一种新型的pDEP-DLD-RACS技术,能够以高精度、高通量和高效率分选代谢特征突变的活细胞,相比传统方法具有显著的时间和成本优势 | NA | 开发高效筛选代谢特征突变细胞的技术平台 | 产色素和油脂的酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术(RACS), 正介电泳诱导确定性横向位移(pDEP-DLD) | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机诱变库中超过10^7个酵母突变体 |
48 | 2025-06-12 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jun-03, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
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综述 | 本文全面分析了基于支架的递送系统在癌症免疫治疗中的最新进展,重点介绍了工程化蛋白质支架作为多功能平台的设计原则、合成方法和治疗应用 | 整合了结构生物学、计算建模和合成生物学的见解,利用AI驱动的生成模型和强化学习算法革新支架设计,同时通过无细胞蛋白质合成系统和正交翻译机制实现复杂结构的按需生产 | 在将这些有前景的平台转化为临床实践方面仍面临挑战 | 开发能够同时解决系统性毒性、肿瘤穿透不足和免疫抑制性肿瘤微环境治疗不足等问题的平台,并提供实时监测能力 | 工程化蛋白质支架 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动的生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | NA | NA | NA |
49 | 2025-06-12 |
Toehold Switch-Based Approach for Engineering Acid-Tolerance Modules to Enhance Production Robustness of Industrial E. coli Strains at Low pH
2025-Jun, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70175
PMID:40485106
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研究论文 | 本研究提出了一种基于toehold switch的合成生物学方法,用于增强工业大肠杆菌菌株在低pH条件下的酸耐受性 | 利用toehold switch构建酸耐受模块,整合多种酸响应启动子和抗酸基因,显著提高工业菌株在低pH条件下的生产稳定性 | 研究仅针对特定工业赖氨酸生产菌株,未验证在其他工业菌株中的普适性 | 提高工业微生物的酸耐受性以增强发酵效率和可持续性 | 工业大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | toehold switch技术 | NA | 基因表达数据 | 约10个构建模块,包含4种酸响应启动子和18个抗酸基因 |
50 | 2025-06-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文综述了微流控系统中软物质和多相系统(如液滴和囊泡)在电场调控下的传输动力学 | 系统地研究了电场强度、流体特性和膜特性对软物质传输动力学的耦合影响,并探讨了囊泡与简单液滴在电动力学行为上的独特差异 | 存在稳定性、可扩展性和可重复性等挑战 | 研究电场调控下软物质和多相系统在微流控系统中的传输行为 | 液滴和囊泡 | 微流控 | NA | 高精度成像、微操作和复杂计算建模 | NA | NA | NA |
51 | 2025-06-12 |
Intranodal injection of neoantigen-bearing engineered Lactococcus lactis triggers epitope spreading and systemic tumor regressions
2025-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.02.041
PMID:40486831
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research paper | 该研究开发了一种携带新抗原的工程化乳酸乳球菌(Ag-FOLactis),通过淋巴结注射触发表位扩散和系统性肿瘤消退 | 利用Plug-and-Display系统在FOLactis表面展示肿瘤抗原,显著增强树突状细胞呈递和新抗原特异性细胞免疫,诱导局部反应性T细胞数量增加45倍并引发表位扩散 | NA | 开发一种基于益生菌的个性化肿瘤免疫治疗平台 | 工程化乳酸乳球菌(FOLactis)及其携带的新抗原肽(Ag-FOLactis) | 免疫治疗 | 肿瘤 | Plug-and-Display系统 | 皮下和转移性肿瘤模型 | NA | NA |
52 | 2025-06-12 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
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research paper | 探讨利用天然产物、合成生物学和人工智能技术开发下一代治疗方法 | 结合eXchange Unit between Thiolation domains方法和AI驱动工具(如Synthetic Intelligence)改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程,创造新型生物活性化合物 | NA | 解决抗生素耐药性和癌症等关键挑战,扩展化学空间并优化生物合成途径 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程 | synthetic biology, artificial intelligence | antibiotic resistance, cancer | eXchange Unit between Thiolation domains approach, Synthetic Intelligence | NA | NA | NA |
53 | 2025-06-12 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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research paper | 该研究利用合成生物学方法开发了一种能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程细菌,这种细菌能够增强光的聚焦 | 通过工程化细菌表达硅酸盐生物矿化酶,使其能够自组装聚硅酸盐外壳,形成具有可调结构特性的活体微透镜,其光聚焦能力比未修饰细菌强近一个数量级 | NA | 开发一种环境友好、具有可调结构特性的活体微透镜,用于光聚焦和操纵 | 工程化细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
54 | 2025-06-11 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Jun-10, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 介绍了一种名为DASH的多功能高容量基因堆叠系统,用于植物合成生物学 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种更高效、灵活的基因组装工具,用于植物合成生物学 | 植物基因组装系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、重组工程、位点特异性重组酶系统 | NA | DNA序列 | 一个116 kb的DNA构建体,包含35个转录单元 |
55 | 2025-06-11 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Jun-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
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研究论文 | 该研究开发了一个用于识别宿主诱导细菌生物传感器的发现平台,扩展了生物传感器筛选的灵活性和能力 | 利用细菌记忆电路构建了来自多种肠道细菌的传感器组件库,并通过超变DNA条形码实现并行追踪数千个独特克隆 | 研究中使用的传感器组件库可能仍有限,且需要进一步验证其在不同环境中的稳定性和可靠性 | 开发合成生物学工具,用于复杂环境中的部署,如肠道内的合成功能自主控制和炎症性疾病的非侵入性监测 | 肠道微生物及其传感器组件 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | 双组分系统识别和克隆流程,超变DNA条形码技术 | NA | 基因序列数据 | 数千个独特克隆,对应约150个潜在生物传感器 |
56 | 2025-06-11 |
Synthetic CRISPR Networks Driven by Transcription Factors via Structure-Switching DNA Translators
2025-Jun-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06913
PMID:40491004
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research paper | 该研究介绍了一个利用转录因子(TFs)通过工程DNA翻译器调控CRISPR-Cas12a反式切割活性的平台 | 通过动态DNA结构响应TF结合并调控Cas12a活性,建立了TF作为CRISPR-Cas系统有效调控因子的新方法 | 研究中仅使用了TATA结合蛋白和Myc-Max作为TF模型,可能不适用于所有类型的转录因子 | 开发一种新型的CRISPR-Cas系统调控平台,用于合成生物学应用 | 转录因子(TFs)和CRISPR-Cas12a系统 | synthetic biology | NA | CRISPR-Cas12a, DNA翻译器技术 | NA | NA | NA |
57 | 2025-06-11 |
Codes across (life)sciences
2025-Jun-07, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
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综述 | 本文探讨了“代码”在不同学科中的含义、意图和形式化,并试图构建一个跨学科的代码研究框架 | 提出了一个跨学科的视角,探讨代码在生物学、心理学、文化等领域的作用,并展望了生物代码与机器逻辑的未来融合 | 文章更多是概念性讨论,缺乏具体的实验验证或数据分析 | 探索代码在不同学科中的共性和潜在的统一理论 | 代码在数学、计算机科学、心理学、生物学等领域的应用和影响 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | NA | NA |
58 | 2025-06-11 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台,用于在大肠杆菌中实现模块化和信号响应的转录调控 | 整合了转录因子生物传感器与FnCas12a CRISPR系统,利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应的mRNA转录物处理crRNA,实现了精确的信号依赖性转录调控 | NA | 克服现有转录调控工具的局限性,扩展合成生物学中转录调控工具的功能 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a CRISPR系统 | NA | NA | NA |
59 | 2025-06-11 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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research paper | 利用迭代深度学习设计人类增强子,利用浓缩序列语法实现细胞类型特异性 | 应用迭代深度学习设计合成增强子,实现两种人类细胞系之间的强差异活性,并通过实验验证和模型再优化提高特异性 | 仅针对两种人类细胞系进行研究,未涉及更广泛的细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型的基因表达问题 | 人类增强子序列 | synthetic biology | NA | iterative deep learning | deep learning | sequence data | two human cell lines |
60 | 2025-06-11 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
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研究论文 | 本文描述了三种小分子和两种细胞接触诱导系统在小鼠胚胎干细胞(mESCs)中用于基因表达和分化的特性 | 在小鼠胚胎干细胞中首次详细表征了小分子和细胞接触诱导系统的功能,并展示了这些系统在驱动mESCs直接分化为神经元中的应用 | 现有合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的表征较少 | 研究合成发育生物学方法,以理解多细胞性并控制细胞行为 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成生物学 | NA | 基因表达控制系统 | NA | NA | NA |