合成生物学相关文章
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当前共找到 3097 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-04-26 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
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research paper | 提出了一种通过从线性模型分析中推断非线性Hill函数型模型的动力学参数的反向工程方法，以设计实现完美适应的生物控制器 | 结合线性系统理论和非线性建模，设计能够实现完美适应的基因电路 | 理论分析在保证非线性模型（如Hill函数）的控制器特性方面仍具挑战性 | 为合成生物学设计具有完美适应能力的生物控制器 | 生物网络基序控制器 | synthetic biology | NA | reverse engineering, Hill function-type models | linear models, nonlinear models | simulation data | three biological network motif-based controllers |
| 182 | 2025-04-26 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
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综述 | 本文综述了叶绿体在植物生长、发育和防御机制中的多面性作用，以及其在应对全球农业挑战中的核心地位 | 独特整合了叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学的最新进展，提出了优化植物生长和胁迫耐受的整体视角 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于文献综述 | 探讨叶绿体在植物生长与防御平衡中的调控作用，以及其在可持续农业中的应用潜力 | 叶绿体及其在植物中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学）、合成生物学、纳米技术 | NA | 组学数据 | NA |
| 183 | 2025-04-26 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
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research paper | 介绍了一个名为BioTRY的综合知识库，用于收集生物合成的滴度、速率和产量(TRY)数据 | BioTRY是首个可用的生物合成TRY数据数据库，包含超过52,000条TRY条目 | NA | 评估发酵过程的经济可行性，并帮助研究人员和决策者了解生物合成的发展现状 | 生物合成的滴度、速率和产量(TRY)数据 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物合成数据 | >5,000种生化物质和>3,800种菌株，以及超过52,000条TRY条目 |
| 184 | 2025-04-26 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
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研究论文 | 该研究利用合成模块化方法在植物中合成动物来源的氨基酸衍生物，以增强植物性饮食的营养价值 | 利用合成模块化框架在植物中成功合成通常仅存在于动物中的肌酸、肌肽和牛磺酸，展示了植物作为可持续生物工厂的潜力 | 引入牛磺酸模块意外抑制了植物半胱氨酸的生物合成，揭示了引入外源途径可能导致的复杂代谢调整 | 开发可持续且环保的方法，通过植物合成动物来源的氨基酸衍生物以增强植物性饮食的营养价值 | 植物代谢途径及动物来源的氨基酸衍生物（肌酸、肌肽和牛磺酸） | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | NA | NA |
| 185 | 2025-04-26 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
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研究论文 | 本文展示了一种铱催化的方法，能够直接将简单烯烃和甘氨酸衍生物转化为具有优异区域和立体选择性的β-取代α-氨基酸 | 利用甘氨酸衍生的N-H单元的本征导向能力，促进铱催化的相邻羰基烯醇化，实现了两个连续立体中心的构建 | NA | 开发一种合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法 | 简单烯烃和甘氨酸衍生物 | 有机化学 | NA | 铱催化 | NA | NA | NA |
| 186 | 2025-04-26 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
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研究论文 | 本文报道了利用生物催化聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达能力的聚合物基人工细胞 | 首次利用生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成人工细胞，并展示其蛋白质表达能力 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并探索其功能特性 | 基于聚合物的仿生人工细胞 | 合成生物学 | NA | 生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA |
| 187 | 2025-04-26 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本文设计了一种基于PYR1的正交化CID模块，具有可重新编程的配体结合特异性 | 开发了正交化的PYR1*/HAB1*模块，具有纳摩尔级敏感度，可用于活体生物传感器和多输入/输出遗传电路 | 未明确提及具体限制 | 扩展PYR1系统，用于植物和真核合成生物学中的多通道CID系统 | 拟南芥和酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化和体内分析 | NA | NA | NA |
| 188 | 2025-04-26 |
Designing microbial consortia with defined social interactions
2018-08, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0091-7
PMID:29942078
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研究论文 | 该研究通过社会互动工程设计合成微生物群落，结合模块化路径重构与模型创建，开发了具有不同互动模式的六种双菌株群落 | 提出了一种通过社会互动工程设计合成微生物群落的新方法，并展示了如何将双菌株群落的模型扩展到三菌株和四菌株生态系统 | 研究主要局限于实验室条件下的双菌株群落，尚未在更复杂的自然环境中验证 | 开发可预测行为的合成微生物生态系统，以促进微生物组工程的应用 | 微生物群落及其社会互动模式 | 合成生物学 | NA | 模块化路径重构与模型创建 | 社会互动编程框架 | 微生物种群动态数据 | 六种双菌株群落，以及扩展的三菌株和四菌株生态系统 |
| 189 | 2025-04-25 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了抗生素偶联物作为克服抗生素耐药性的新策略的研究现状 | 提出利用'特洛伊木马'策略将抗生素与生物活性成分偶联，以增强抗生素对耐药病原体的效果 | 抗生素偶联物的临床转化面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对抗生素耐药性危机 | 抗生素与单克隆抗体(mAbs)、抗菌肽(AMPs)和铁螯合载铁体的偶联物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学和生物信息学 | NA | NA | NA |
| 190 | 2025-04-25 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-Apr-24, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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research paper | 该研究设计并构建了一种能够与活细胞进行高阶组装的合成治疗性原细胞，用于靶向消除癌细胞 | 通过宿主-客体化学构建正交多糖基原细胞，并引入细胞靶向配体和催化活性纳米颗粒，形成具有完全功能的细胞靶向生物催化杀手原细胞 | 研究目前仅限于体外实验，尚未进行体内验证 | 开发一种新型的合成治疗性原细胞系统，用于癌症治疗 | 癌细胞 | 合成生物学与生物工程 | 癌症 | 宿主-客体化学，电静力驱动自组装 | NA | 实验数据 | NA |
| 191 | 2025-04-25 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-Apr-24, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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review | 本文综述了深度突变扫描和CRISPR基因组编辑技术在病毒基因组研究中的应用 | 结合深度突变扫描和CRISPR技术，实现对病毒蛋白的全面突变和功能表征 | NA | 探讨病毒进化与适应的分子机制，为疫苗开发和治疗策略提供新见解 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
| 192 | 2025-04-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在玉米胚胎发育研究中的联合应用及其协同效果 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学两种技术研究玉米胚胎发育，提供单细胞分辨率和空间背景的基因表达模式 | 单细胞技术难以识别特定细胞簇，空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 理解玉米胚胎发育的基本机制，促进农业改良、体细胞胚胎发生条件的优化和植物合成生物学 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 193 | 2025-04-25 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红光和远红光组合能够增强本氏烟草中异源蛋白和代谢物的生产 | 首次探索了光质对瞬时表达效率的影响，并发现红远光组合能显著提高异源蛋白和代谢物的产量 | 研究仅在本氏烟草中进行，未在其他植物中验证 | 探索光质对植物瞬时表达系统效率的影响 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | 未明确说明样本数量 |
| 194 | 2025-04-25 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
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research paper | 该研究结合扩散模型和Transformer模型，用于增强合成启动子的设计和强度预测 | 首次将扩散模型应用于合成启动子设计，并结合Transformer模型进行强度预测，相比传统方法表现更优 | 研究仅针对模型细菌和蓝藻细菌进行验证，未在其他生物体中测试 | 优化外源基因表达和代谢途径效率，开发高性能合成启动子 | 合成启动子序列 | synthetic biology | NA | deep learning | diffusion model, Transformer, CNN, variational autoencoder | biological sequence data | NA |
| 195 | 2025-04-25 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Apr-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
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research paper | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用及其对鱼类免疫力的提升作用 | 利用合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动基于微藻的疫苗创新 | NA | 探索和开发可持续的水产养殖疫苗以增强鱼类免疫力和减少疾病爆发 | 微藻基疫苗及其在水产养殖中的应用 | 生物技术 | 水产养殖疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 196 | 2025-04-25 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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research paper | 该研究通过电子传递工程优化人工设计的细胞工厂，实现了胆固醇和孕烯醇酮的高效生物合成 | 阐明了NADPH依赖酶的电子传递机制，并系统性地改造了酿酒酵母的电子传递链，显著加速了去质子化和质子耦合电子传递过程 | 未提及具体实验规模的限制或潜在的应用障碍 | 提高类固醇生物合成的效率和产量 | 人工设计的细胞工厂（酿酒酵母）及其电子传递系统 | 合成生物学 | NA | 电子传递工程（ETE） | NA | NA | NA |
| 197 | 2025-04-25 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
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research paper | 该研究调查了四种常用质粒骨架在克隆和野生型大肠杆菌菌株中形成多聚体的情况，并提出了避免多聚体产生的解决方案 | 首次系统调查了不同质粒骨架在多聚体形成方面的差异，并提出了通过单基因敲除避免多聚体产生的方法 | 研究仅针对大肠杆菌的两种菌株(JM109和MG1655)，未在其他宿主系统中验证 | 优化基于质粒的合成生物学电路设计和可靠性 | 四种常用质粒骨架在JM109和MG1655大肠杆菌菌株中的多聚体形成情况 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的测试 |
| 198 | 2025-04-25 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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研究论文 | 本文提出了一种多层自催化反馈策略，用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 引入多层反馈策略，实现了种群水平的积分反馈和多细胞积分器，控制功能通过不同细胞群体间的协调互动产生 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和跨尺度环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和细胞群体控制 | 合成生物学 | NA | 数学建模、多层反馈控制 | 自催化积分反馈控制器 | 数学模型、基因表达数据 | NA |
| 199 | 2025-04-25 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的敏感性和稳健性，通过五个示例电路分析了生物反馈的准确性 | 提出了多目标优化框架来研究生物反馈的性能权衡，填补了生物反馈理论框架的空白 | 仅分析了五种示例电路，可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 研究生物反馈系统的稳健性和准确性，为合成生物学和系统生物学提供理论支持 | 五种生物反馈电路（正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈） | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
| 200 | 2025-04-25 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-Apr-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自重楼(Paris polyphylla)的4'-O-鼠李糖基转移酶(UGT73DY2)，并揭示了其在甾体皂苷生物合成中的作用 | 首次发现并表征了UGT73DY2酶，阐明了4'-O-鼠李糖基化过程，并通过合成生物学方法建立了重楼甾体皂苷的生物合成系统 | 酶催化效率仍有提升空间，生物合成系统产量相对较低 | 阐明重楼甾体皂苷糖链生物合成机制并开发其生物合成方法 | 重楼(Paris polyphylla)中的甾体皂苷及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶催化、分子动力学模拟、代谢工程 | NA | 生物化学数据 | NA |