合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-05-02	Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics 2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/67659 PMID:39803963	研究论文	介绍了一种基于开放硬件的微流体工作流程，用于通过培养单细胞在凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落来分析质粒保留	采用开源硬件微流体工作流程，提供精确的流量控制和温度管理，增强易用性、稳健性和可访问性	研究以大肠杆菌为实验模型，方法的普适性有待进一步验证	分析质粒保留，为合成生物学提供技术支持	质粒和单细胞微菌落	合成生物学	NA	微流体技术、荧光显微镜	NA	图像数据	大量微滴和微菌落
142	2025-05-02	[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius] 2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica DOI:10.19540/j.cnki.cjcmm.20240911.102 PMID:39805756	研究论文	本研究从石栎属植物中克隆了查尔酮合成酶基因，并进行了生物信息学分析和功能表征	首次从石栎属植物中鉴定出两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2)，并验证了其催化合成根皮素的功能	仅在大肠杆菌中验证了基因功能，未在植物体内进行验证	探索石栎属植物中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能	石栎属植物的CHS基因(LlCHS1和LlCHS2)	合成生物学	NA	转录组数据分析、生物信息学分析、大肠杆菌异源表达	NA	基因序列数据	2个CHS基因
143	2025-05-01	Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients 2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724 PMID:40254844	research paper	该文章探讨了利用合成生物学和代谢工程优化微生物细胞工厂生产萜类食品成分的方法	提出了通过优化异源合成途径、底盘前体供应和整合合成调控电路来提升萜类食品成分的生产效率	未提及具体的实验数据或样本规模，可能缺乏实际应用的验证	提高萜类食品成分的微生物生产效率	微生物细胞工厂和萜类食品成分	合成生物学	NA	合成生物学和代谢工程	NA	NA	NA
144	2025-05-01	Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets 2025-Apr-30, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d5lc00149h PMID:40302460	research paper	提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相生成细胞大小脂质体的新方法	采用高速激光诱导微射流技术可靠且重复地生成细胞大小脂质体，实现了按需生产	未提及方法的具体产量和成本效益分析	开发一种新型细胞大小脂质体生成技术	细胞大小脂质体	合成生物学	NA	激光诱导微射流技术	NA	高速摄像数据	未明确说明样本数量
145	2025-05-01	Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation 2025-Apr-22, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101268 PMID:40300599	research paper	介绍了一种通过细菌接合实现基于整合酶的细胞间DNA信息传递的策略	首次利用整合酶通过细菌接合实现细胞间DNA信息传递及其调控	未提及具体实验规模或应用场景的限制	探索整合酶在细胞间DNA信息传递和系统合成生物学中的应用	细菌（E. coli）及其接合质粒	合成生物学	NA	细菌接合、整合酶介导的DNA重组	布尔逻辑门	DNA序列数据	未明确提及具体样本数量
146	2025-05-01	Structural dynamics of a designed peptide pore under an external electric field 2025-Mar, Biophysical chemistry IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.bpc.2024.107380 PMID:39752811	研究论文	研究通过分子动力学模拟和实验记录探讨了设计肽孔在外部电场下的结构动态	在GENESIS MD模拟包中实现了均匀外部电场功能，用于研究设计肽孔的结构动态	NA	研究膜电位对设计肽孔结构稳定性和动态的影响	设计肽孔	合成生物学	NA	分子动力学模拟(MD), 单通道电流记录实验	NA	模拟数据, 实验数据	NA
147	2025-05-01	Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells 2025-Mar, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01783-2 PMID:39753704	研究论文	开发了一种正交RNA复制系统，用于在哺乳动物细胞中进行定向进化和达尔文适应	设计了一个正交的RNA复制系统，克服了现有哺乳动物定向进化方法的瓶颈，如宿主基因组干扰、文库规模小和不可控突变	未提及具体的技术限制或应用范围限制	推进合成生物学和细胞工程应用	哺乳动物细胞中的RNA设备	合成生物学	NA	正交RNA复制系统	NA	RNA序列数据	未提及具体样本数量
148	2025-05-01	Advances in bacterial glycoprotein engineering: A critical review of current technologies, emerging challenges, and future directions 2025 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108514 PMID:39755221	review	本文综述了细菌糖蛋白工程领域的最新进展，重点关注合成生物学和代谢工程视角下的新技术、挑战及未来方向	强调了利用合成生物学技术开发微生物糖工厂和无细胞系统进行高效糖蛋白生产的新方法	未具体提及当前技术的具体局限性，但指出了天然糖基化途径的不足	探讨细菌糖蛋白工程在合成生物学应用中的潜力，特别是在新型糖蛋白治疗药物和疫苗开发方面	细菌糖基化系统及其在糖蛋白生产中的应用	合成生物学	NA	蛋白糖偶联技术	NA	NA	NA
149	2025-05-01	New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza 2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384 PMID:39756484	review	本文综述了丹参中丹参酮生物合成的生物技术工程策略的最新进展	总结了丹参酮的生物活性、生物合成途径及调控、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学的最新进展	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证研究支持	提高丹参中丹参酮的产量，开发高质量的丹参资源	丹参（Salvia miltiorrhiza Bunge）及其主要生物活性成分丹参酮	生物技术	心血管和脑血管疾病	合成生物学、表观遗传修饰	NA	NA	NA
150	2025-05-01	Customized design of host-independent T7 expression system (HITES) for a broad host range 2025-Feb, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.12.012 PMID:39778814	研究论文	本文开发了一种定制设计方法，利用宿主独立的T7表达系统（HITES），促进T7表达系统的合理设计和快速构建	发现了EL值在T7表达系统成功构建中的关键作用，并提出了测量EL值的方法，同时展示了在不同宿主菌株中高效表达蛋白质的能力	研究主要集中在E. coli DH5α宿主菌株，对其他宿主菌株的应用可能还需要进一步验证	开发一种通用的T7表达系统构建方法，以促进合成生物学和代谢工程中的蛋白质表达和目标化学品生产	T7表达系统及其在不同宿主菌株中的应用	合成生物学	NA	T7表达系统构建	NA	NA	13种宿主菌株
151	2025-05-01	Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications 2025-Jan-22, Chemical reviews IF:51.4Q1 DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216 PMID:39737807	review	本文综述了遗传密码扩展（GCE）技术在化学和合成生物学领域的最新发展和应用	详细介绍了GCE技术的优化和进展，包括aaRS/tRNA系统的优化、筛选方法的改进以及非经典氨基酸的生物合成	作为综述文章，未涉及具体实验数据或样本分析	探讨GCE技术在生物学和医学研究中的应用潜力	遗传密码扩展技术及其在合成生物学和医学中的应用	合成生物学	NA	遗传密码扩展（GCE）技术	NA	NA	NA
152	2025-05-01	Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation 2025-Jan-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00551 PMID:39754601	研究论文	本研究通过改变核糖体结合位点组成和宿主环境，探索了遗传开关的设计空间，并展示了如何通过这些变化来精细调节开关的性能	将宿主环境重新概念化为合成生物学家工具箱中的重要部分，展示了通过结合核糖体结合位点和宿主环境调节来精细调节遗传开关性能的新方法	仅测试了9种核糖体结合位点组成和3种宿主环境，设计空间的探索可能不够全面	探索遗传开关的设计空间，并开发精细调节其性能的方法	遗传开关（toggle switch）	合成生物学	NA	遗传电路工程	NA	遗传性能数据	27种电路变体（9种核糖体结合位点×3种宿主环境）
153	2025-05-01	ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System 2025-Jan-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00697 PMID:39754602	研究论文	本研究通过整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统，扩展了PURE系统的功能	提出了一种新的ATP再生途径，能够独立或与现有肌酸系统结合使用，显著提高蛋白质合成效率	需要高初始浓度的磷酸盐缓冲液（约10 mM）	工程化改造PURE系统，提高其蛋白质合成能力	PURE系统（无细胞蛋白质合成系统）	合成生物学	NA	ATP再生系统	NA	生物化学数据	多批次自制PURE系统及商业PURExpress系统
154	2025-05-01	Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System 2025-Jan-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00618 PMID:39757539	研究论文	本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统，用于延长PURE无细胞系统中的蛋白质合成时间和提高产量	利用商业可得组件构建的简易透析系统，显著延长了PURE系统的蛋白质合成时间并提高了产量	需要定期更换喂养溶液，可能增加操作复杂性	解决PURE无细胞系统反应寿命短和产量低的问题	PURE无细胞系统中的蛋白质合成	合成生物学	NA	透析系统	NA	实验数据	NA
155	2025-05-01	Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina 2025-Jan-15, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004 PMID:39778579	研究论文	本文开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分增强子和沉默子的模型，这些模型由光感受器转录因子CRX的结合位点组成	采用主动学习策略结合合成生物学和不确定性采样，迭代训练模型以区分具有相同序列但功能相反的CRX位点	模型训练依赖于CRX结合位点的基因组数据，可能无法完全解释转录因子在不同上下文中的激活或抑制机制	开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型，以更好地理解顺式调控元件的功能	光感受器转录因子CRX的结合位点	机器学习	NA	主动学习、合成生物学、大规模并行报告基因检测	深度学习模型	基因组序列数据	几乎所有基因组中结合的CRX位点
156	2025-04-29	A systematic study of regulating inorganic polyphosphates production in Saccharomyces cerevisiae 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.04.004 PMID:40291979	研究论文	本文系统地研究了酵母中无机多磷酸盐生产的遗传调控机制	通过CRISPR/Cas9介导的过表达技术，构建了高产多磷酸盐的酵母菌株PP2，并揭示了其分子机制	研究仅针对Saccharomyces cerevisiae，未在其他微生物中进行验证	探究酵母中多磷酸盐代谢的遗传调控机制，并开发高产多磷酸盐的工程菌株	Saccharomyces cerevisiae（酿酒酵母）	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9, qRT-PCR	NA	基因表达数据	55个单基因敲除菌株
157	2025-04-29	Emerging ultrafast technologies in biotechnology 2025-May, 3 Biotech IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s13205-025-04309-2 PMID:40292246	综述	本文综述了超快技术在生物技术中的变革性应用，包括实时可视化和精确操控生物分子过程	飞秒激光提高了基因编辑的精确度，减少了脱靶效应；超快光谱学增进了对蛋白质折叠途径、酶活性和能量转移机制的理解	光损伤、与复杂生物系统的整合以及伦理问题	探讨超快技术在生物技术中的应用及其潜力	生物分子过程、蛋白质折叠、酶活性、基因编辑、细胞动力学	生物技术	NA	飞秒激光、超快光谱学、泵浦探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射(CARS)、阿秒光谱学	NA	NA	NA
158	2025-04-29	Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies 2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-025-04342-6 PMID:40289223	review	本文综述了利用耐盐微生物和先进技术恢复盐渍土壤的创新策略	结合耐盐微生物与基因组编辑、合成生物学、高级组学工具及数字技术，提出了一种变革性的盐渍土壤恢复策略	需要未来研究协调这些技术和方法，以最大化植物-微生物相互作用	缓解盐分胁迫，恢复盐渍土壤，保障粮食安全	耐盐微生物及其与植物的协同作用	农业生物技术	NA	CRISPR-Cas9, 合成生物学, 宏基因组学, 宏转录组学, 纳米技术, 机器学习, AI	NA	NA	NA
159	2025-04-29	Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications 2025-Apr-27, Molecular nutrition & food research IF:4.5Q1 DOI:10.1002/mnfr.70080 PMID:40289452	综述	本文系统综述了食用药用真菌(EMFs)的抗抑郁潜力，重点关注其生物活性成分和作用机制	探讨了EMFs通过调节神经递质系统、色氨酸-犬尿氨酸通路、HPA轴和神经炎症等机制发挥抗抑郁作用，并提出了利用3D食品打印和合成生物学等创新技术	存在标准化不足和缺乏临床验证等挑战	评估食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及其营养学意义	食用药用真菌(如灵芝、猴头菇、茯苓和蛹虫草)及其生物活性成分	营养学与神经科学交叉领域	抑郁症	系统综述方法，包括人工智能建模	NA	文献数据	NA
160	2025-04-29	New Insight into Microbial Exploitation to Produce Bioactive Molecules from Agrifood and By-Products' Fermentation 2025-Apr-21, Foods (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/foods14081439 PMID:40282840	综述	探讨微生物在食品及其副产品发酵中生产具有生物活性分子的最新研究	综述了微生物在食品工业中生产高营养价值分子的最新应用，强调了合成生物学在这一领域的战略作用	NA	探索微生物在食品工业中生产具有促进健康效应的营养品	微生物及其在食品和副产品发酵中的应用	食品科学	NA	发酵技术、合成生物学	NA	NA	NA