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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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181 | 2025-09-03 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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研究论文 | 开发了一种基于人类蛋白酶的人源化细胞因子调控平台hDIRECT,用于控制细胞因子活性 | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交调控系统,避免免疫原性风险,并通过蛋白酶切割控制细胞因子活性 | NA | 创建安全可控的蛋白质分泌调控系统以支持细胞疗法 | 人类细胞因子(IL-2、IL-6、IL-10)和人源蛋白酶系统 | 合成生物学 | 癌症免疫治疗 | 蛋白质工程、蛋白酶调控技术 | NA | 蛋白质活性数据 | NA |
182 | 2025-09-03 |
Endosymbionts as hidden players in tripartite pathosystem of interactions and potential candidates for sustainable viral disease management
2025-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2449403
PMID:39848650
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综述 | 探讨植物-病毒-节肢动物媒介系统中内共生菌的作用及其在可持续病毒病管理中的潜力 | 提出利用基因工程改造内共生菌来调控三方互作关系,为植物病毒病防控提供创新策略 | NA | 分析内共生菌在植物-病毒-媒介昆虫互作系统中的功能并探索其生物防治应用 | 植物、病毒、节肢动物媒介及内共生菌 | 植物病理学与生物防治 | 植物病毒病 | 基因改造、生物技术、RNA干扰、CRISPR/Cas9、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA |
183 | 2025-09-03 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Sep, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 介绍一种名为DASH的新型基因堆叠系统,用于植物合成生物学,解决现有DNA组装方法的局限性 | 结合Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,实现大片段DNA的高效组装和后期修饰 | NA | 开发高容量且多功能的植物基因组装工具 | 植物合成生物学中的DNA构建体 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、重组工程、PhiC31整合酶、FLP重组酶 | NA | DNA序列数据 | 一个116 kb的DNA构建体,包含35个转录单元 |
184 | 2025-09-03 |
Plant cytochrome P450 enzymes for bioactive metabolites biosynthesis, growth regulation, and stress adaptation
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf297
PMID:40623215
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综述 | 本文综述植物细胞色素P450酶在生物活性代谢物合成、生长调控和胁迫适应中的最新研究进展 | 聚焦2020-2025年间最新研究,系统总结CYP酶在植物关键生物活性化合物合成及生理功能中的重要作用 | 仅涵盖有限时间范围(2020-2025)的研究,且数据库中超过99.8%的CYP酶尚未完成功能表征 | 增强对植物CYP酶功能的理解,为生物技术育种和合成生物学领域的创新应用提供基础 | 植物细胞色素P450酶(CYPs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | 数据库记录超过300,000个CYP酶(仅0.2%经过功能表征) |
185 | 2025-09-03 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-Aug-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
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综述 | 本文聚焦于合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 系统总结了针对蓝藻宿主操作难题的合成生物学创新方法,包括BGC克隆、组合生物合成和宿主工程等技术突破 | NA | 促进蓝藻天然产物的发现和生产 | 蓝藻系统及其天然产物生物合成基因簇 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、组合生物合成、转录调控、翻译调控 | NA | 基因组数据 | 涉及多种蓝藻宿主菌株(如 sp. PCC 6803, UTEX 2973, sp. PCC 7120) |
186 | 2025-09-03 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
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综述 | 本文全面回顾光合作用原理及其工程化策略与应用,探讨其在可持续技术中的潜力 | 系统整合纳米材料、微流体、合成生物学和光生物电化学系统等多种工程策略以增强光合作用效率 | NA | 探讨光合作用工程化策略及其在能源与物质转化领域的应用潜力 | 光合作用系统及其工程化设计 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助、微流体技术、合成生物学、光生物电化学系统(PBESs) | NA | NA | NA |
187 | 2025-09-03 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 本文综述了光合内共生系统的分子与生化特征,探讨内共生体向细胞器演化的关键机制 | 整合自然内共生系统与人工工程化系统的比较研究,揭示内共生演化中的分子变化规律 | NA | 探讨光合内共生系统的演化机制及其对合成生物学的启示 | 线粒体、叶绿体等内共生起源的细胞器及人工构建的光合内共生系统 | 合成生物学 | NA | 比较基因组学、蛋白质导入/导出系统分析 | NA | 分子与生化数据 | NA |
188 | 2025-09-03 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
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研究论文 | 本研究利用金属酚醛网络(MPN)对肽基凝聚体进行可移除膜化,增强其结构稳定性和化学抗性 | 首次使用MPN实现凝聚体的可控膜化与解组装,并展示其氧化还原活性调控膜厚度与渗透性的能力 | NA | 开发稳定且功能化的原始细胞模型,抵御外部化学威胁 | 聚赖氨酸和三磷酸腺苷凝聚体 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱 | NA | 化学分析数据 | NA |
189 | 2025-09-03 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
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综述 | 本文探讨人工智能与基因组编辑的交叉领域,重点介绍AI在提升CRISPR系统精准度、sgRNA设计和功能基因组学中的应用 | 整合深度学习与蛋白质语言模型优化基因组编辑流程,实现更精准的靶向选择和新型Cas蛋白发现 | 存在数据偏见、算法透明度不足以及潜在非预期基因修饰等伦理问题 | 推动精准医疗、遗传疾病治疗和可持续农业领域的突破性进展 | 基因组编辑技术及其在生物医学和农业中的应用 | 机器学习 | 遗传疾病 | CRISPR基因编辑技术 | 深度学习、蛋白质语言模型 | 基因组序列数据 | NA |
190 | 2025-09-03 |
Synergizing CRISPR-Cas9 with Advanced Artificial Intelligence and Machine Learning for Precision Drug Delivery: Technological Nexus and Regulatory Insights
2025, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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综述 | 本文探讨了CRISPR-Cas9基因编辑技术与先进人工智能和机器学习在精准药物递送中的协同作用,并分析了技术整合及监管框架 | 提出将CRISPR-Cas9与AI/ML技术(如DeepCRISPR)相结合,优化gRNA效率并预测编辑结果,推动精准药物递送领域的创新 | 面临脱靶效应、病毒载体免疫反应及生殖系编辑伦理问题等技术与伦理挑战 | 研究CRISPR-Cas9与AI/ML技术在精准药物递送中的协同应用及监管策略 | 基因编辑系统(如CRISPR-Cas9)、计算工具(如E-CRISPR、Azimuth 2.0)及深度学习模型 | 机器学习 | 遗传性疾病(如镰状细胞病、β-地中海贫血) | CRISPR-Cas9基因编辑、NGS、深度学习 | 深度学习模型(如DeepCRISPR) | 遗传数据、计算预测数据 | NA |
191 | 2025-09-03 |
Exploiting protein domain modularity to enable synthetic control of engineered cells
2024-Sep, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100550
PMID:39430298
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综述 | 本文综述了如何利用蛋白质结构域的模块化特性实现工程化细胞的合成控制 | 利用蛋白质结构域的自然进化倾向(融合与分裂)设计多功能合成构建体和可控分裂组件 | NA | 通过合成生物学方法增强细胞疗法的功能性和安全性 | 工程化细胞(特别是免疫受体、碱基编辑器和细胞因子) | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构域工程 | NA | NA | NA |
192 | 2025-09-02 |
Engineered Microbial-Based Therapeutics Nose No Bounds: Extending Innovation to Rhinologic Disease Management
2025-Sep, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23619
PMID:40825097
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综述 | 本文探讨利用合成生物学开发工程化治疗性细菌,用于鼻部疾病的靶向和可控精准治疗 | 提出利用鼻腔天然微生物生态系统的可塑性,开发工程化细菌作为鼻科疾病治疗的新模式,该领域目前尚未充分探索 | NA | 研究工程化微生物在鼻科疾病管理中的创新应用 | 鼻腔黏膜微生物生态系统及鼻部疾病 | 合成生物学 | 鼻科疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
193 | 2025-09-02 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用基因组尺度代谢模型研究植物-微生物相互作用的方法与应用 | 系统整合代谢模型与多组学数据,推动对植物-微生物holobiont系统的量化理解,并探索合成微生物群落的计算机设计 | NA | 通过代谢建模理解植物-微生物相互作用的机制,以支持可持续农业和粮食安全 | 植物宿主及其共生、致病和微生物群落系统中的相关微生物 | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模、基因组学、宏基因组学、表型组学、合成生物学 | 代谢网络模型 | 多组学数据 | NA |
194 | 2025-08-30 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
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综述 | 本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势,重点介绍了定向进化、高通量策略以及新型工程策略 | 涵盖了抗体-蛋白酶融合、外源蛋白互作驱动的特异性切换以及分裂和自抑制蛋白酶的设计原则 | NA | 探讨蛋白酶工程的方法论和策略,以实现对蛋白酶活性和特异性的精确控制 | 蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量筛选 | NA | NA | NA |
195 | 2025-08-30 |
SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05386
PMID:40787351
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研究论文 | 通过SpyRing系统及AlphaFold指导对TEV蛋白酶进行环化,显著提升其热稳定性 | 结合SpyTag/SpyCatcher介导的异肽键环化与AlphaFold结构预测,成功实现远端N/C末端蛋白的理性环化设计 | NA | 开发一种计算引导的蛋白质环化策略以增强酶的热稳定性 | 烟草蚀纹病毒蛋白酶(TEVp)及其工程变体 | 蛋白质工程 | NA | SpyTag/SpyCatcher环化系统,AlphaFold结构预测 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
196 | 2025-08-30 |
Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c03077
PMID:40787363
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综述 | 本文回顾了巴西合成生物学的发展现状,并介绍了国家合成生物学网络的建立及其在推动生物技术能力方面的作用 | 首次系统梳理巴西合成生物学生态系统,并强调利用国家生物多样性优势引领可持续解决方案的创新潜力 | 巴西的科学和监管环境国际认知度低,且国内存在基础设施和关键材料供应不足的限制 | 探讨巴西合成生物学发展机遇与挑战,推动国家生物技术创新 | 巴西合成生物学研究群体及国家网络建设 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
197 | 2025-08-30 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 提出一种名为DySEEP的动态模拟方法,用于评估不同微生物生产PHB的经济潜力 | 开发了结合动态通量平衡分析和经济指标的新方法DySEEP,用于系统评估生物产品生产的经济可行性 | 由于DFBA模拟的性质,无法预测某些关键聚合物特性 | 优化聚-3-羟基丁酸酯(PHB)生物生产工艺的经济性 | 重组大肠杆菌、洋葱伯克霍尔德菌和罗尔斯通氏菌 | 生物过程工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | 代谢网络模型 | 代谢通量数据 | 三种微生物菌株的比较分析 |
198 | 2025-08-30 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 开发一种可被可溶性配体激活的模块化合成受体平台SNIPR,用于调控工程化治疗细胞功能 | 首次将SNIPR受体架构适配于可溶性配体激活,实现低基线活性和高折叠激活,并通过内吞pH依赖性切割机制工作 | NA | 创建模块化合成受体以响应可溶性配体并激活定制细胞功能 | 合成受体SNIPR、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA |
199 | 2025-08-30 |
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 本文提出了一个整合微生物生态学、合成生物学和计算建模的框架,用于理性设计农业合成微生物群落(SynComs)以增强气候韧性 | 引入可编程全息生物概念,整合CRISPR干扰、生物传感器电路和群体感应模块等技术实现动态反馈和跨界信号传导 | NA | 通过微生物组工程提升农业对气候胁迫、土壤退化和产量停滞的韧性 | 植物全息生物(宿主与其微生物组的整合单元) | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA |
200 | 2025-08-30 |
Harnessing synthetic biology to empower a circular plastics economy
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0053
PMID:40638940
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和微生物群落工程降解和升级回收塑料废物的策略,以支持循环塑料经济 | 整合合成生物学与微生物群落工程,提出预处理塑料材料和改造顽固乙烯基聚合物的互补策略,以提升生物处理效率 | NA | 探讨生物技术如何通过低强度生物过程缓解和升级回收塑料废物,推动循环塑料经济的发展 | 塑料废物,特别是工业与环境背景下的塑料材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,微生物群落工程 | NA | NA | NA |