合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-09-10	Targeted metabolomics-guided rational refinement of cyanobacterial metabolism enables enhanced photosynthetic production of L-lysine 2025-Nov, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.07.015 PMID:40754064	研究论文	本研究通过靶向代谢组学指导蓝藻代谢优化，显著提高了光合作用驱动的L-赖氨酸生产效率	首次结合靶向代谢组学与合成生物学方法系统识别并解除蓝藻赖氨酸生物合成的限速步骤，实现碳通量向目标产物定向重编程	研究仅针对Synechococcus sp. PCC 7002菌株，未验证在其他蓝藻系统中的普适性	开发碳负排放的赖氨酸光合生物合成平台	聚球藻Synechococcus sp. PCC 7002	合成生物学	NA	靶向代谢组学，合成生物学，代谢工程	NA	代谢物浓度数据，碳通量数据	工程化蓝藻菌株（具体数量未明确说明）
122	2025-09-10	Genome mining of tailoring enzymes from biosynthetic gene clusters for synthetic biology: A case study with fungal methyltransferases 2025-Nov, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.001 PMID:40774411	研究论文	本研究开发了一种基于机器学习的基因组挖掘方法，用于从真菌生物合成基因簇中高效识别甲基转移酶	采用机器学习方法优先筛选功能未知的甲基转移酶，成功实现11/15测试酶对底物的甲基化修饰	NA	通过合成生物学手段优化天然产物生物合成，促进药物和生物工业应用	真菌天然产物生物合成基因簇中的甲基转移酶	合成生物学	NA	基因组挖掘、机器学习	机器学习	基因组数据	101,321个真菌BGCs中的16,748个推定甲基转移酶
123	2025-09-10	Advances in metabolic engineering of Vibrio natriegens as an unconventional host for biotechnology 2025-Nov, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.008 PMID:40834994	综述	本文综述了利用海洋细菌Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的代谢工程进展	重点介绍了该细菌的高生长速率、多用途代谢特性及天然感受态能力，这些特性促进了先进基因工程工具箱的开发	NA	探讨Vibrio natriegens在生物技术应用中作为新一代宿主的潜力	Vibrio natriegens细菌及其代谢工程应用	合成生物学	NA	代谢工程、基因工程、合成生物学	NA	代谢与调控数据	NA
124	2025-09-10	The future of cultured meat: focusing on multidisciplinary, digitization, and nutritional customization 2025-Nov, Food research international (Ottawa, Ont.) DOI:10.1016/j.foodres.2025.117005 PMID:40922220	综述	本文综述了培养肉领域的前沿工程方法、生物材料及未来发展趋势，重点关注营养定制与安全保障	强调多学科融合、数字化技术及人工智能在培养肉开发中的应用前景	未提及具体技术实施障碍或规模化生产的实际限制	推动智能细胞农业发展，实现定制化肉制品生产	培养肉生产技术体系	生物工程与食品技术	NA	组织工程、生物技术、合成生物学、人工智能	NA	NA	NA
125	2025-09-10	Modular RNAi Pathway Engineering Enhances Plasmid Copy Number Control in Yeast Bioproduction System 2025-Oct, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.70014 PMID:40583249	研究论文	本研究开发了一种基于RNA干扰的可诱导质粒拷贝数调控系统，用于酵母生物生产系统中的基因剂量动态控制	首次在酿酒酵母中通过重建正交RNAi系统实现质粒拷贝数7.13倍扩增，并创建了可动态编程的合成生物学底盘	NA	优化微生物细胞工厂的代谢通量控制，提高生物合成效率	酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）	合成生物学	NA	RNA干扰（RNAi）、合成生物学技术	NA	分子生物学数据	NA
126	2025-09-10	Engineered Coenzyme A Biosynthesis and Butyrate Transporter Drives High-Efficient Butyrate Synthesis in Escherichia coli 2025-Oct, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.70018 PMID:40641096	研究论文	本研究通过代谢工程改造大肠杆菌，显著提高了丁酸的合成效率	通过增强辅酶A生物合成和优化丁酸转运蛋白，实现了丁酸产量11.1倍和产率86%的提升	研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他宿主中验证适用性	提高丁酸在大肠杆菌中的生物合成效率和产量	大肠杆菌JH016菌株	合成生物学	NA	代谢工程、基因工程	NA	生物化学数据	实验菌株JH016
127	2025-09-10	Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting 2025-Sep-09, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d5lc00348b PMID:40497380	研究论文	开发了一种基于微流控的并行DLD平台，用于按尺寸分离和分选叶绿体	集成四个具有不同临界直径的并行DLD阵列，实现单设备内多种尺寸叶绿体的同时分离和带通过滤	分离效率50-85%，纯度17-66%，仍有提升空间	解决叶绿体分离的技术挑战，提供自动化可扩展的分离方案	植物叶绿体	微流控技术	NA	确定性侧向位移(DLD)	NA	NA	叶绿体尺寸范围3-8μm
128	2025-09-10	Synthetic biology-driven design and bioproduction of mechanical proteins 2025-Sep-09, Biomaterials science IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d5bm00646e PMID:40827630	综述	本文全面总结了结构蛋白异源生物合成工程的最新进展，包括表达宿主改造、分子设计方法和培养条件优化	重点突出了表达宿主的关键修饰、创新分子设计方法及优化培养条件等策略，为高性能结构蛋白的生产提供新见解	NA	克服高分子量结构蛋白异源生物合成面临的产量低、结构缺陷和机械性能受损等挑战	结构蛋白及其异源生物合成系统	合成生物学	NA	异源生物合成、生物合成工程	NA	NA	NA
129	2025-09-10	Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products 2025-Sep-09, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d5np00036j PMID:40923873	综述	本文全面分析了2004至2024年间使用链霉菌作为异源表达平台生产微生物天然产物的研究进展	首次对二十年间的450多项研究进行数据驱动的定量分析，揭示表达趋势并整合合成生物学工具与案例研究	NA	评估链霉菌作为异源表达平台在天然产物生物合成中的应用与进展	微生物生物合成基因簇（BGCs）及其异源表达	合成生物学	NA	异源表达、基因组工程、组合生物合成	NA	文献数据	450多项同行评审研究
130	2025-09-10	Engineering Motile Coacervate Droplets via Nanomotor Stabilization 2025-Sep-03, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.5c09366 PMID:40834351	研究论文	通过纳米马达稳定化技术设计具有运动能力的凝聚液滴人工细胞	首次通过金纳米颗粒涂覆的纳米马达与三元聚合物膜协同稳定凝聚相界面，实现了人工细胞的光驱动运动控制	未提及具体实验规模或应用场景的限制	开发具有运动功能的仿生人工细胞系统	凝聚液滴人工细胞与纳米马达复合系统	合成生物学	NA	纳米马达稳定化、表面等离子体热效应	NA	实验观测数据	未明确样本数量
131	2025-09-10	Isoprenoids in eukaryotic phytoplankton: Metabolic diversity, eco-physiology, and biotechnological opportunities 2025-Sep-01, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf314 PMID:40707021	综述	本文全面评估了真核浮游植物中类异戊二烯的生物合成、调控机制及其生态生理和生物技术应用	系统比较了不同微藻类群中MEP和MVA途径的区室化差异、酶适应性及调控网络，并连接了生理基础与生物技术应用	NA	探讨真核浮游植物类异戊二烯代谢的多样性、生态生理功能及生物技术潜力	真核浮游植物（微藻）	NA	NA	NA	NA	NA	NA
132	2025-09-10	Reinforcement Learning-Based Target-Specific De Novo Design of Cyclic Peptide Binders 2025-Aug-28, Journal of medicinal chemistry IF:6.8Q1 DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00789 PMID:40824037	研究论文	提出基于强化学习的框架CYC_BUILDER，用于靶向特异性从头设计环肽结合剂	采用蒙特卡洛树搜索指导片段选择、肽链生长和结构优化，实现高效环化组装	实验验证样本量较小（仅测试9个设计肽），需进一步扩大验证范围	开发计算设计环肽结合剂的新方法以靶向蛋白质-蛋白质相互作用	环肽与靶蛋白（如TNFα）的相互作用	机器学习	NA	reinforcement learning, Monte Carlo Tree Search	强化学习框架	分子结构数据	9个设计肽的实验验证（其中4个显示活性）
133	2025-09-10	Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14 PMID:38780738	研究论文	本文介绍了一种用户友好的BarMap-QA流程，用于改进共转录折叠模拟的质量评估	开发了专门针对共转录折叠场景的简化工作流程，通过迭代方法和质量监控提高模拟可靠性	原始BarMap方法在特定场景如共转录折叠中难以使用，需要进一步简化近似	改进RNA共转录折叠模拟方法，为合成生物学中的核糖开关设计提供计算验证工具	RNA分子，特别是位于初级转录本5'区域的核糖开关和RNA温度计	计算生物学	NA	BarMap方法，粗粒度表示，马尔可夫过程建模	NA	RNA二级结构数据	NA
134	2025-09-09	In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease 2025-Sep-08, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1 DOI:10.1093/brain/awaf330 PMID:40916343	研究论文	本研究开发了一种基于合成生物学的方法，通过体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白，改善神经退行性疾病的病理状况	利用内源性小RNA加工机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡，并借助宿主天然循环系统实现siRNA向中枢神经系统的递送	研究基于小鼠模型，临床转化效果尚需进一步验证	开发针对TDP-43相关神经退行性疾病的基因治疗策略	TDP-43蛋白异常积累的肌萎缩侧索硬化(ALS)和额颞叶变性(FTLD)疾病模型	基因治疗	神经退行性疾病	siRNA技术、小细胞外囊泡(sEVs)递送、腺相关病毒(AAV)载体	动物模型	体内实验数据	TDP-43病理小鼠模型
135	2025-09-09	Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside 2025-Aug-20, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00712-25 PMID:40668011	研究论文	通过代谢工程改造酿酒酵母实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成	开发了高效生产羟基酪醇和红景天苷的酵母工程菌株，并通过优化前体供应和糖基化策略显著提高了产量	NA	实现两种具有工业应用价值的苯乙醇化合物（羟基酪醇和红景天苷）的高效生物合成	酿酒酵母工程菌株	合成生物学	NA	代谢工程、发酵优化、基因工程	NA	NA	实验室规模（摇瓶发酵）和15 L生物反应器规模
136	2025-09-09	Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment 2025-Aug-18, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202501918 PMID:40545445	研究论文	开发具有多酶活性的仿生脂质体，用于调控外源植入物引发的炎症反应并促进组织再生	通过CeO纳米酶与仿内皮细胞膜的自组装，首次构建能同时水解ATP/ADP和调节生化微环境稳态的多功能脂质体	未提及临床前或临床试验数据，体外和体内验证细节未充分说明	设计能模拟天然细胞功能、调控移植微环境稳态的治疗性脂质体	仿生脂质体、炎症因子、血小板聚集、组织再生	合成生物学	移植相关疾病	纳米酶技术、脂质体自组装	NA	生化实验数据	NA
137	2025-09-09	Hydrogel-Immobilized Multienzyme Systems for Cell-Free Chemical Bioproduction 2025-Aug-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00234 PMID:40689784	研究论文	本文开发了一种基于水凝胶固定多酶系统的无细胞化学生物生产方法	首次将无细胞表达酶与PEGDA-甘油水凝胶固定技术结合，实现酶的高效固定和重复使用，并证明固定化酶活性提高1.6倍、寿命延长2倍	研究仅针对特定酶系统（丙酮酸到苹果酸的生物转化），未验证其他酶系的普适性	开发可重复使用、稳定且耐用的多酶系统用于无细胞生物生产	多酶系统、PEGDA-甘油水凝胶、无细胞表达酶	合成生物学	NA	小角X射线散射(SAXS)、荧光测量、光交联固定	NA	生物化学数据、散射数据、荧光数据	涉及三种异源无细胞酶的系统验证
138	2025-09-09	Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications 2025-Aug-13, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d5np00018a PMID:40392103	综述	本文综述了过去十年中涉及核糖体合成肽骨架翻译后修饰的酶，重点关注导致结构重排的修饰机制	强调通过肽骨架重塑产生结构复杂性和多样性的新型PTM酶，超越传统二十种氨基酸的限制	NA	推动治疗剂发现和生物工具开发，应对合成方法挑战	核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）天然产物	合成生物学	NA	基因组挖掘，翻译后修饰（PTM）	NA	NA	NA
139	2025-09-09	Dendritic Membranized Coacervate Microdroplets: A Robust Platform for Synthetic-Living Cell Consortia 2025-Aug-13, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.5c09772 PMID:40751679	研究论文	本研究开发了一种基于树枝状聚合物的膜化凝聚微滴平台，用于构建合成-天然细胞联合体	利用树枝状聚合物的刚性和球状结构，显著提高了凝聚微滴在生理盐浓度下的稳定性，临界盐浓度比传统多肽或支化聚电解质形成的凝聚体提高两倍以上	NA	构建在生物环境中结构稳定的合成细胞平台，用于治疗性酶的选择性递送和组织工程应用	树枝状聚合物与多肽形成的膜化凝聚微滴	合成生物学	NA	树枝状聚合物自组装技术	NA	NA	NA
140	2025-09-09	An old dog with new tricks-the value of photorespiration as a central metabolic hub with implications for environmental acclimation 2025-Aug-04, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf258 PMID:40515676	综述	本文探讨光呼吸作为核心代谢枢纽的新功能及其在植物环境适应中的价值	揭示了光呼吸与气孔代谢调控的关联，并展示了合成生物学改造光呼吸以提升光合效率的创新策略	NA	阐明光呼吸在代谢调控和环境适应中的新兴功能	光养生物（主要为植物）的光呼吸代谢途径	植物生理学	NA	同位素标记、反向遗传学、合成生物学	NA	代谢数据、遗传数据	NA