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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-09-15 |
Introduction to "Biomolecular Technologies"
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb90031j
PMID:40843437
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评论 | 本期专题集合介绍了基于工程化生物分子的技术及其在生物催化、生物传感和合成生物学等领域的应用 | NA | NA | 概述生物分子技术的最新进展和应用领域 | 工程化生物分子(包括小分子、核酸和蛋白质) | 生物技术 | NA | 生物分子工程 | NA | NA | NA |
62 | 2025-09-15 |
Gene duplication and clustering underlie the conservation and diversification of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in plants
2025-Aug-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63175-x
PMID:40826018
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研究论文 | 本研究揭示了植物中苯基异喹啉生物碱(BIA)生物合成保守性与多样性的基因复制与聚类机制 | 首次在木兰类植物中发现CYP80G介导的异波尔定生物合成中的酚偶联反应,并揭示基因动态聚类与生化功能的协同进化关系 | NA | 探究开花植物中苯基异喹啉生物碱生物合成的进化机制与保守性 | 蕺菜(Houttuynia cordata)及被子植物中的基因与酶系统 | 植物分子生物学 | NA | 功能分析、全基因组分析 | NA | 基因组数据、酶功能数据 | NA |
63 | 2025-09-15 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
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研究论文 | 提出一种基于生物分子自适应控制器的合成生物学方法,用于优化干细胞分化过程以提高特定细胞命运的产量 | 设计了一种类似IFFL拓扑结构的自适应控制器,无需参考信号即可工作,且对内在调控网络机制知识要求极低 | NA | 开发合成基因电路以增强干细胞分化疗法中特定细胞类型的产出效率 | 干细胞分化过程及多稳态生物系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、自适应控制、计算分析 | 自适应控制器(IFFL类似拓扑) | 理论模型与计算模拟数据 | NA |
64 | 2025-09-15 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌Kay病毒进行结构修饰,用于成像和生物传感应用 | 首次报道了葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,通过在尾鞘蛋白暴露环中插入多组氨酸标签实现 | NA | 开发基因编辑的噬菌体用于生物技术和医学应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、同源重组、荧光显微镜、生物层干涉技术、ELISA、流式细胞术 | NA | 生物分子数据、图像数据 | NA |
65 | 2025-09-15 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 本研究优化了用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性的丙二酰辅酶A生物传感器,在重构的无细胞系统中实现了宽检测范围和高度灵敏的定量分析 | 通过改造T7启动子与FapO操作子间的间隔序列,开发出检测范围更宽(50-1500 μM)的无细胞生物传感器系统,并筛选出对低浓度丙二酰辅酶A敏感的FapR/FapO同源对 | 研究基于无细胞系统,可能无法完全模拟体内环境的复杂性;传感器性能仍需在实际代谢工程应用中进一步验证 | 优化丙二酰辅酶A生物传感器,以支持乙酰辅酶A羧化酶的高通量筛选和定向进化 | 丙二酰辅酶A生物传感器(FapR/FapO系统)和乙酰辅酶A羧化酶(ACC) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统、定向进化、高通量筛选 | NA | 荧光信号数据 | 使用多种芽孢杆菌门的FapR/FapO同源对进行筛选,检测灵敏度达100 pM ACC编码DNA模板 |
66 | 2025-09-15 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 本研究利用生物发光技术优化基于双生病毒的植物合成生物学载体,评估其表达特性和应用潜力 | 采用自体生物发光作为实时报告系统,对三种双生病毒载体进行系统比较和优化,提高调控精度 | 仅针对三种特定双生病毒载体进行评估,未涵盖其他病毒系统 | 优化植物合成生物学中使用的双生病毒载体,提升重组蛋白生产和基因调控能力 | 基于豆黄矮病毒(BeYDV)、番茄黄叶卷曲病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 合成生物学 | NA | 生物发光报告系统 | NA | 生物发光信号数据 | 三种病毒复制子系统(BeYDV、TYLCV、BCTV) |
67 | 2025-09-15 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
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研究论文 | 利用工程化细胞分裂素调节因子理性调控植物根系发育 | 通过理性设计B型响应调节因子,实现对细胞分裂素依赖性状的可预测调控,并降低其对细胞分裂素的敏感性 | NA | 开发合成生物学工具以精确控制植物定量发育表型 | 植物根系发育(侧根数量) | 合成生物学 | NA | 组织特异性启动子、转录因子工程化 | NA | NA | NA |
68 | 2025-09-15 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
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研究论文 | 本文开发了结合预印本批判性分析和探究式实验的主动学习工作流,以提升合成生物学的教学效果 | 利用预印本与最终发表论文的对比分析作为教学资源,并设计CRISPRi基因电路实践环节,使学生完整参与设计-构建-测试-学习循环 | NA | 改进合成生物学教学方法,提升学生的批判性分析能力和跨学科知识掌握 | 大学生 | 合成生物学 | NA | CRISPRi基因电路技术 | NA | 文本数据(预印本与论文)、实验数据 | 学生群体(具体数量未明确),90%报告批判分析技能提升,80%认为掌握了广泛概念 |
69 | 2025-09-15 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
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研究论文 | 提出一种机器学习引导的框架Toehold-VISTA,用于快速设计高性能RNA传感器 | 整合生物物理建模与机器学习(PLS-DA),通过序列-结构特征提取预测RNA传感器性能 | NA | 加速RNA传感器的设计与筛选过程,提升其对特定RNA靶标的响应性能 | RNA传感器(特别是toehold开关)与靶标RNA(如SARS-CoV-2 RNA)的相互作用 | 机器学习 | 传染病(如COVID-19) | 高通量实验测量、序列-结构特征提取、PLS-DA机器学习 | PLS-DA(偏最小二乘判别分析) | RNA序列与结构数据 | NA |
70 | 2025-09-15 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 本文开发了针对蛋白质结构预测与设计工具的容器化解决方案,以提升计算效率和部署便捷性 | 提出了跨多种计算架构优化的容器化方案及OmniFold包装平台,支持多工具并行运行并自动生成质控报告 | 未明确说明容器性能的具体提升指标或在不同硬件环境下的兼容性测试范围 | 降低高性能蛋白质结构预测与设计工具的计算部署门槛,促进科研可重复性和可及性 | 蛋白质结构预测工具(AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2)和设计平台(RFdiffusion) | 计算生物学 | NA | 容器化技术(如Docker/Singularity)、GPU优化计算 | NA | 蛋白质结构数据、分子相互作用数据 | NA |
71 | 2025-09-15 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 本研究通过分析Pepper RNA变体,揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦现象 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦,并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度有显著影响 | NA | 定量评估单个核苷酸对HBC530结合亲和力、镁结合亲和力和荧光强度的贡献 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建与定量分析 | NA | 生化测定数据 | 53种Pepper变体 |
72 | 2025-09-15 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
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综述 | 本文回顾了MultiBac技术的发展过程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | 引入了一种相对较新的MultiBac方法,用于高效生产重组蛋白和研究复杂蛋白质复合物 | MultiBac技术存在一些缺点,研究人员在选择表达系统时需考虑其局限性 | 介绍MultiBac技术的发展和应用,为基础研究人员提供新方法 | 蛋白质表达系统,特别是MultiBac技术在真核细胞中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac技术,合成生物学技术 | NA | NA | NA |
73 | 2025-09-14 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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概念文章 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传学平台的开发、特性、应用及未来挑战,该平台用于在活细胞中操纵质膜信号传导 | 开发了基于自定位配体的蛋白质易位技术,实现快速、可逆且可重复的胞质至质膜蛋白质招募 | NA | 剖析细胞信号网络并工程化细胞功能 | 哺乳动物细胞中的信号蛋白和脂质 | 合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白质易位) | NA | NA | NA |
74 | 2025-09-14 |
Engineering Proteinosomes with Cellular-Like Functionalities
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500448
PMID:40810682
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综述 | 本文综述了蛋白质体(proteinosomes)的构建与功能化策略,重点探讨其作为人工细胞模型的潜力和应用 | 整合界面自组装、聚合物膜模板和混合脂质-聚合物系统,实现可调控渗透性、机械稳定性和刺激响应行为,并强调其在构建原型组织及多室结构中的创新 | NA | 总结蛋白质体的构建方法、功能化策略及其在人工细胞和生物材料中的应用前景 | 蛋白质体及其仿生结构 | 合成生物学 | NA | 界面自组装、聚合物膜模板、混合脂质-聚合物系统 | NA | NA | NA |
75 | 2025-09-14 |
Genetically engineered Escherichia coli: The new recyclers of PET plastic waste
2025-Sep-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108713
PMID:40934993
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综述 | 本文综述了基因工程改造的大肠杆菌作为PET塑料生物降解与转化平台的新兴应用 | 利用合成生物学策略构建多酶级联反应和表面展示系统,提升催化效率并实现PET降解产物向高附加值生物产品的转化 | NA | 探讨工程化微生物平台在PET塑料生物降解与资源化回收中的潜力 | 基因工程改造的大肠杆菌及其表达的PET水解酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
76 | 2025-09-14 |
Peptide Coacervates Can Protect Sequestered Oligonucleotides from Nucleases and Release Them for Transcription and Translation
2025-Sep-08, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c00600
PMID:40802871
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研究论文 | 本文展示了肽共凝聚物通过液-液相分离形成无膜细胞器,能够有效隔离并保护短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因免受多种核酸酶的降解 | 发现基于聚组氨酸肽与ATP静电相互作用的缔合型共凝聚物能高效抑制核酸酶降解,并可通过外部刺激实现可控释放 | 基于sticker-and-spacer模型肽的简单共凝聚物仅表现出有限的保护作用 | 开发能够保护和可控释放功能性遗传材料的生物相容性递送系统 | 短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | 生物分子数据 | NA |
77 | 2025-09-14 |
Engineered microbial production of carotenoids and their cleavage products: Recent advances and prospects
2025-Sep-06, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108708
PMID:40921259
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综述 | 本文总结了类胡萝卜素及其裂解产物微生物合成的最新进展与前景 | 聚焦代谢工程和合成生物学策略提升微生物异源合成效率 | NA | 开发高效可持续的类胡萝卜素及apocarotenoids生物合成方法 | 类胡萝卜素及其裂解产物(apocarotenoids) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源生物合成 | NA | NA | NA |
78 | 2025-09-14 |
Expanding Immunotherapy Beyond CAR T Cells: Engineering Diverse Immune Cells to Target Solid Tumors
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172917
PMID:40941014
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综述 | 本文综述了除CAR T细胞外,多种免疫细胞(如NK细胞、巨噬细胞等)在实体瘤治疗中的工程化应用进展 | 探索γδ T细胞、NKT细胞、病毒特异性T细胞、NK细胞及髓系效应细胞等作为CAR平台的新方向,并整合药理学、合成生物学和人工智能技术优化设计 | NA | 扩展细胞免疫治疗范围,解决实体瘤中抗原异质性、免疫抑制微环境及细胞迁移持久性差等问题 | 多种免疫细胞(γδ T细胞、NKT细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞等) | 免疫治疗 | 实体瘤 | 合成生物学、人工智能、CAR工程化 | NA | NA | NA |
79 | 2025-09-14 |
Synthetic biology meets diagnostics: Engineering biosensing platforms for rapid and accurate pathogen and viral detection
2025-Sep-02, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117946
PMID:40939269
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综述 | 本文综述了合成生物学与生物传感技术结合在病原体和病毒快速精准检测中的进展与应用 | 整合CRISPR系统、Argonaute蛋白和模块化遗传电路等工具,并融合人工智能与纳米技术开发自动化、低成本、高通量诊断平台 | NA | 推动病原体检测和体外诊断技术的发展 | 病原体与病毒 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR-based系统、Argonaute蛋白、模块化遗传电路、无细胞系统、纳米材料增强平台 | NA | 生物分子数据 | NA |
80 | 2025-09-14 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面回顾了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识提供甘草属的独特全面视角,强调合成生物学和代谢工程在资源保护中的创新应用 | 野生甘草资源过度开发导致种质资源退化,现有储备难以满足化学提取和临床应用需求 | 系统梳理甘草属研究现状,为分子育种和合成生物学领域提供理论基础 | 甘草属植物(主要聚焦根和根茎部位)及其活性成分(三萜类、黄酮类、多糖等) | 药用植物学/合成生物学 | NA | 多组学研究(omics)、代谢工程、微生物绿色生产 | NA | 文献数据、组学数据 | NA(文献综述类研究) |