合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-09-14	One-pot cloning and protein expression platform for genetic engineering 2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.08.28.672974 PMID:40909620	研究论文	开发了一种集成突变、质粒组装和功能蛋白测试的一锅法克隆与蛋白表达平台	将Golden Gate克隆与无细胞转录翻译结合，无需中间纯化或细菌扩增即可高效生成和筛选遗传变异	NA	为合成生物学提供高通量克隆和蛋白质工程的可推广和自动化方法	荧光蛋白、荧光素酶、抗生素转化酶和紫色素生物合成途径	合成生物学	NA	Golden Gate克隆、无细胞转录翻译	NA	NA	NA
82	2025-09-14	Molecular Mechanisms of Herbicide Resistance in Rapeseed: Current Status and Future Prospects for Resistant Germplasm Development 2025-Aug-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26178292 PMID:40943213	综述	本文系统总结了油菜除草剂抗性的分子机制、抗性种质开发进展及未来精准育种策略	首次系统整合非靶标抗性机制、多组学与AI技术在抗除草剂油菜育种中的潜在应用，并涵盖基因流风险管理策略	NA	阐明油菜除草剂抗性机制并指导抗性种质安全创新开发	油菜（芸薹属油料作物）	植物育种与合成生物学	NA	基因编辑、人工诱变、外源基因导入、定向蛋白进化	NA	多组学数据	NA
83	2025-09-14	Unlocking Casein Bioactivity: Lactic Acid Bacteria and Molecular Strategies for Peptide Release 2025-Aug-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26178119 PMID:40943047	综述	本文综述了利用合成生物学和分子生物技术增强β-酪蛋白源生物活性肽靶向发现与生产的策略	整合CRISPR/Cas基因组编辑、诱导表达平台、无细胞系统及多组学方法优化乳酸菌肽释放策略	NA	提升β-酪蛋白源生物活性肽的靶向生产效率和产量	牛β-酪蛋白及其加密的生物活性肽	合成生物学	NA	CRISPR/Cas系统、多组学（基因组/转录组/蛋白质组/代谢组）分析	NA	分子生物数据	NA
84	2025-09-14	Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation 2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504364 PMID:40323169	研究论文	开发了一种基于合成生物学的微生物生物传感器，用于检测和治疗肠道炎症	利用锌摄取调节器（Zur）控制的启动子与记忆电路结合，首次实现了对临床验证的生物标志物钙卫蛋白的检测与治疗双重功能	研究目前仅限于小鼠模型，尚未进行人体试验	开发具有诊断和治疗功能的肠道炎症生物传感器	肠道炎症（特别是结肠炎）	合成生物学	肠道炎症疾病	合成生物学技术、生物传感器设计	NA	生物分子数据	两个独立的小鼠结肠炎模型
85	2025-09-14	A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM 2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis IF:3.0Q1 DOI:10.1111/risa.17678 PMID:39552172	研究论文	本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全与生物安保风险进行定量分析	将传统定性风险社会理论扩展为定量分析，并针对合成生物学团队构建攻击树模型	NA	评估低至中等风险场景下的生物安全与生物安保问题	2022年iGEM竞赛项目	合成生物学	NA	攻击树分析	NA	风险场景数据	2022年iGEM项目风险点
86	2025-09-13	Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase 2025-Nov, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003 PMID:40774389	研究论文	本研究开发了一种基于SacB的基因编辑系统，用于高效无痕编辑Komagataeibacter xylinus中的细菌纤维素合成酶基因	开发了pK18mobsacB系统，实现高达83.33%的无标记基因编辑效率，并首次系统探索了bcs操纵子在细菌纤维素合成中的作用	NA	提高细菌纤维素生产菌株的基因编辑效率并探索纤维素合成酶功能	Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955菌株及其细菌纤维素合成酶基因	合成生物学	NA	SacB介导的基因编辑系统	NA	基因序列数据、纤维素物理特性数据	使用Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955菌株进行基因操作实验
87	2025-09-13	Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications 2025-Sep-12, Molecular nutrition & food research IF:4.5Q1 DOI:10.1002/mnfr.70260 PMID:40936353	研究论文	本研究通过合成生物学方法异源表达和纯化肠球菌素A，并验证其抗菌活性	开发了包含功能调控元件和His标签的合成基因盒，实现了从包涵体中高效回收具有生物活性的细菌素	NA	开发替代抗生素的抗微生物策略，利用细菌素抑制病原体	肠球菌素A（源自Enterococcus faecium的细菌素）	合成生物学	细菌感染	基因合成、PCR、测序、Ni-NTA亲和色谱	NA	分子生物学数据、抗菌活性数据	针对5种多重耐药病原体（包括金黄色葡萄球菌ATCC 25923等）进行测试
88	2025-09-13	Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana 2025-Sep-12, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.70350 PMID:40937882	研究论文	本文综述了在烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略及其应用潜力	整合了化学/电磁信号响应传感器、可编程转录因子合成启动子、病毒复制子转录放大及重组酶处理器等创新技术	未提及具体实验数据验证，主要基于技术展望和理论分析	开发可控转基因表达系统以提升烟草生物工厂的蛋白和代谢物生产能力	本氏烟草（Nicotiana benthamiana）	合成生物学	NA	合成基因电路、CRISPR系统、重组酶处理技术	NA	NA	NA
89	2025-09-13	Development of a modified RNA circularization system to improve circRNA-based protein expression in mammalian cells 2025-Sep-11, RNA (New York, N.Y.) DOI:10.1261/rna.080733.125 PMID:40935594	研究论文	开发了一种改进的Tornado系统，通过优化IRES与启动子间距及整合调控元件，显著提升哺乳动物细胞中基于circRNA的蛋白表达效率	揭示了HRV-B3 IRES在RNA丰度和环化中的双重作用，并首次将HIV-1 LTR截短体与WPRE组合用于增强Tornado系统的转录效率	未明确说明该系统在体内应用或临床转化中的具体挑战	提高哺乳动物细胞中大片段RNA（含IRES序列）的环化效率及circRNA丰度	哺乳动物细胞中的circRNA蛋白表达系统	合成生物学	NA	RNA环化技术、分子克隆	NA	分子生物学实验数据	NA
90	2025-09-13	The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations 2025-Sep-10, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.00887-25 PMID:40788026	研究论文	本研究揭示了乳酸菌中醌类前体DHNA生物合成的双重调控机制及其与底物限制的平衡关系	发现MenF和MenD酶共同调控DHNA合成，并首次通过数学模型阐明可逆通量和变构反馈抑制形成的两阶段调控模式	研究主要基于乳酸菌模型，机制在其他微生物中的普适性仍需验证	解析微生物调控醌类水平的分子机制，为代谢工程改造提供理论基础	乳酸菌及其醌类前体DHNA的生物合成途径	合成生物学	NA	合成生物学方法、数学建模	数学模型（两阶段调控模式）	酶活性数据、代谢通量数据	NA
91	2025-09-13	Intersecting precision fermentation for global cell-based food production innovation: Challenges and opportunities 2025-Sep-08, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108712 PMID:40930311	综述	本文综述了精准发酵技术在全球细胞基食品生产中的创新应用，探讨了其面临的挑战与机遇	提出了结合合成生物学、代谢工程及计算机辅助工程的跨学科框架，并针对营养性饥饿风险提出缓解策略	存在技术扩展瓶颈、监管碎片化、区域可及性及消费者接受度问题，工具应用仍有局限	推动精准发酵技术在食品生产中的高效可持续应用，解决全球食品创新中的科技与社会挑战	微生物细胞工厂、发酵生产的食品成分、全球食品生产体系	合成生物学与生物工程	NA	合成生物学、代谢工程、计算机辅助工程(CAE)、人工智能(AI)、自动化	NA	案例研究、建模分析数据	NA
92	2025-09-13	Advancing biomaterial innovation for tissue engineering through microbial synthetic biology: A review 2025-Sep, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146771 PMID:40803465	综述	本文回顾了微生物合成生物学在组织工程生物材料创新中的应用与前景	通过微生物合成生物学方法设计先进生物材料，为组织工程提供新方向	面临未来挑战，具体限制未详细说明	促进组织工程领域的生物材料创新	微生物宿主、合成生物学方法及工程微生物生产的生物材料	合成生物学	NA	微生物基因组修饰、代谢过程调控	NA	NA	NA
93	2025-09-13	The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions 2025-Aug-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00868 PMID:40262025	综述	本文回顾了高通量和基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向	整合机器学习与机制性代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数策略	NA	推动系统与合成生物学、代谢工程及医学研究的规模化发展	细胞代谢过程与动态行为	计算生物学	NA	动力学建模、机器学习	机制性代谢模型	代谢参数与模拟数据	NA
94	2025-09-13	Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach 2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s42770-024-01512-w PMID:39259478	研究论文	通过启动子捕获方法从南极微生物群落中鉴定出在多种假单胞菌门中具有广泛宿主范围功能的新型启动子序列	首次从南极微生物群落中发现13个具有广泛宿主范围功能的启动子序列，可在多种假单胞菌门细菌中驱动基因表达	NA	扩展合成生物学中的生物元件库，寻找新型广泛宿主范围启动子	南极微生物群落中的启动子序列	合成生物学	NA	启动子捕获方法	NA	基因序列数据	约2000个克隆组成的文库，从中鉴定出13个功能启动子序列
95	2025-09-13	Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning 2023, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0283548 PMID:36989327	研究论文	本文介绍了两种用于精确设计遗传传感器的互补方法：计算机筛选和机器学习辅助的正向工程	开发了结合大规模基因型-表型数据集与机器学习的方法，能够定量精确设计具有特定剂量响应曲线的遗传传感器	NA	开发定量精确设计生物传感功能的方法	遗传传感器	合成生物学	NA	机器学习，计算机筛选	可解释机器学习模型	基因型-表型数据	大规模数据集
96	2025-09-12	The path to biotechnological singularity: Current breakthroughs and outlook 2025-Nov, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108667 PMID:40744238	综述	本文探讨了生物技术领域当前突破性进展及其向生物技术奇点发展的前景	综合分析了基因编辑、合成生物学、人工智能、再生医学和脑机接口等多领域技术的融合趋势及其潜在影响	未涉及具体实验数据或案例研究，主要基于宏观趋势分析	展望生物技术奇点的实现路径及其对社会的影响	生物技术领域的多学科技术进展	生物技术	NA	CRISPR基因编辑、合成生物学、深度学习、干细胞研究、脑机接口	深度学习模型	NA	NA
97	2025-09-12	Microalgal bioengineering for futuristic applications in synthetic and space biology 2025-Nov, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108665 PMID:40738416	综述	本文综述了微藻生物工程在合成生物学和空间生物学中的前沿应用，重点探讨其在地球和太空极端环境下支持生命系统的潜力	整合CRISPR基因组编辑、合成基因电路、人工智能等创新技术，开发适应太空环境的微藻系统，用于可持续生产氧气、水和营养	NA	探索微藻通过合成生物学技术改造后，在地球和太空极端环境中提供生命支持资源的应用	微藻及其基因工程衍生物	合成生物学	NA	CRISPR基因组编辑、组学技术、合成基因电路、纳米技术、人工智能	NA	NA	NA
98	2025-09-12	Harnessing biological nitrogen fixation: Multi-scale engineering for self-sustaining agroecosystems 2025-Nov, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108687 PMID:40803658	综述	本文综述了利用生物固氮技术替代化学氮肥的多尺度工程策略，旨在构建自维持农业生态系统	提出从微生物底盘到生态系统层面的多尺度集成工程方法，包括固氮回路设计、根际微生物组重编程和工程化固氮作物	NA	提高固氮效率并实现作物的生物固氮能力，以减少农业对化学肥料的依赖	固氮原核微生物、非固氮宿主微生物、工程化作物及农业生态系统	合成生物学	NA	合成生物学方法、微生物工程、根际微生物组重编程	NA	NA	NA
99	2025-09-12	Phage therapy against Klebsiella pneumoniae: An evolving perspective 2025-Nov, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108689 PMID:40840758	综述	本文探讨针对肺炎克雷伯菌的噬菌体疗法，分析其进化挑战并提出结合计算科学的未来策略	整合临床案例与预临床研究，提出利用机器学习进行噬菌体表征和宿主互作预测的计算路线图	NA	评估噬菌体疗法对抗多重耐药肺炎克雷伯菌的可行性及进化障碍应对策略	肺炎克雷伯菌及其与噬菌体的共进化动态	合成生物学与计算微生物学交叉领域	细菌感染性疾病	机器学习、噬菌体基因组工程	NA	临床案例数据、预实验数据、基因组数据	NA
100	2025-09-12	Multidimensional strategies for efficient heterologous protein expression in Aspergillus niger 2025-Nov, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108690 PMID:40845950	综述	本文总结了黑曲霉高效异源蛋白表达的多维策略最新进展	从表达系统、分泌途径、代谢通量、智能发酵和多组学整合五个维度系统探讨提升异源蛋白生产效率的策略	NA	提升黑曲霉中异源蛋白的表达效率	黑曲霉	合成生物学	NA	分子生物学工具、代谢工程策略、多组学整合	NA	NA	NA