合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-09-18	Accurate prediction of thermoresponsive phase behavior of disordered proteins 2025-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.70284 PMID:40944421	研究论文	开发了一种名为Mpipi-T的残基分辨率模型，用于预测蛋白质的热响应性LCST型相变行为	整合原子尺度溶剂化自由能数据与实验浊点测量，参数化短程非键相互作用以捕捉加热驱动的熵驱动相分离，并解析缩放长程静电相互作用作为温度函数	NA	定量预测蛋白质的LCST型相行为并探索其在热应激响应中的潜在机制	无序蛋白质，特别是hTau40、Pab1和ELF3三种关键蛋白质	计算生物学	阿尔茨海默病	原子尺度溶剂化自由能计算，实验浊点测量	Mpipi-T（残基分辨率模型）	蛋白质序列数据，热力学数据	三种关键蛋白质（hTau40、Pab1、ELF3）的分析
42	2025-09-18	DNA Flipping as Facile Mechanism for Transmembrane Signaling in Synthetic Cells 2025-Sep-17, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.5c09188 PMID:40923324	研究论文	本文报道了一种基于胆固醇修饰单链DNA的跨膜信号传导机制，用于合成细胞中的内部信号处理	发现胆固醇修饰单链DNA可通过成核驱动、缺陷介导的过程自发翻转跨越合成细胞膜，实现高效的跨膜信号传导	NA	开发合成细胞中的跨膜信号传导机制	巨型单层脂质囊泡（GUVs）和胆固醇修饰单链DNA	合成生物学	NA	荧光显微镜、核酸酶降解实验、膜通透性实验	NA	实验数据	NA
43	2025-09-18	Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor 2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3 DOI:10.1002/cbic.202500254 PMID:40400447	研究论文	本研究通过工程化改造NADH氧化酶，实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化	首次设计出能够选择性氧化非天然辅因子NCDH的突变酶，催化效率和选择性分别提高14倍和107倍	NA	开发用于氧化反应的非天然辅因子再生工具	NADH氧化酶（EfNOX）及其突变体	合成生物学	NA	酶工程、分子对接分析	NA	酶学数据、分子模拟数据	NA
44	2025-09-18	A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor 2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.07.03.663076 PMID:40631274	研究论文	本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程，并鉴定出三种有效配体	首次将微量热泳动、微流控调制光谱和饱和转移差示NMR技术整合用于孤儿PAS蛋白的配体筛选与验证	研究仅针对单一模型蛋白CU228，配体结合亲和力处于微摩尔级别（片段水平）	开发蛋白质-配体相互作用分析工具并设计合成化学遗传变体	Candidatus Solibacter usitatus来源的PAS-HTH转录因子CU228	合成生物学	NA	差示扫描荧光法(DSF), 微流控调制光谱(MMS), 饱和转移差示NMR(STD-NMR)	NA	生物物理检测数据	约760种化合物片段库筛选
45	2025-09-18	Synthetic C1 metabolism in Pseudomonas putida enables strict formatotrophy and methylotrophy via the reductive glycine pathway 2025-Sep-10, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.01976-25 PMID:40824035	研究论文	通过合成生物学和适应性实验室进化改造恶臭假单胞菌，使其能够通过还原甘氨酸途径严格利用甲酸盐和甲醇作为唯一碳源和能源	首次在任何假单胞菌物种中实现严格的合成甲酸营养和甲醇营养，扩展了C1底物利用的细菌宿主范围	研究局限于实验室环境，尚未在工业规模验证其稳定性和效率	开发能够高效利用甲酸盐和甲醇作为唯一碳源的细菌宿主，用于生物技术应用	恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida）	合成生物学	NA	适应性实验室进化（ALE）、代谢工程、基因编辑	NA	微生物生长数据、基因序列数据	工程化菌株（包括rG·F和rG·M突变株）
46	2025-09-18	Engineering chimeric polyhydroxyalkanoate synthases for enhanced copolymerization of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate): A promising biotechnological approach 2025-Sep-10, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.133307 PMID:40939657	研究论文	通过工程化嵌合PHA合酶增强聚(3-羟基丁酸酯-co-3-羟基己酸酯)共聚能力的研究	通过交换N端结构域构建嵌合酶，实现高3HHx掺入与可控颗粒形态的结合，并避免β链干扰的历史难题	NA	开发高性能生物可降解共聚物的生物技术方法	聚羟基脂肪酸酯(PHA)合酶	合成生物学	NA	结构预测、蛋白质工程	NA	酶活性数据、颗粒形态数据	多种嵌合酶变体（具体数量未明确说明）
47	2025-09-18	DNA Vaccines in the Post-mRNA Era: Engineering, Applications, and Emerging Innovations 2025-Sep-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26178716 PMID:40943636	综述	本文探讨DNA疫苗在mRNA疫苗时代的技术进展、应用领域及创新方向	提出合成基因电路、自扩增DNA和DNA编码单克隆抗体等创新技术，显著提升免疫原性与精准性	NA	评估DNA疫苗的技术基础、临床潜力及在全球疫苗战略中的未来角色	DNA疫苗技术及其在传染病预防、癌症免疫治疗等领域的应用	合成生物学	传染病与癌症	合成基因电路、电穿孔、冻干技术	NA	NA	NA
48	2025-09-18	Design principles of gene circuits for longevity 2025-Mar-12, Trends in cell biology IF:13.0Q1 DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006 PMID:40082090	综述	本文探讨影响长寿的基因回路及其反馈机制在维持细胞稳态中的作用	从基因回路和反馈环路的角度系统解析衰老机制，并提出通过合成生物学策略稳定回路以延长寿命	主要基于酵母模型，哺乳动物系统的直接适用性尚需验证	揭示基因回路设计原则及其在调控衰老过程中的作用	基因调控网络（GRNs）、反馈环路、酵母SIR2-HAP回路	合成生物学	衰老相关疾病	系统生物学与合成生物学策略	NA	理论分析与模型推导	NA
49	2025-09-18	Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells 2025-02-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00569 PMID:39898483	研究论文	本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶变体，在人类细胞系和原代T细胞中实现了差异化的甲基化与基因沉默活性	通过在DNMT3A催化核心引入突变，稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白表达而不牺牲功能，并首次在原代人类T细胞中成功应用	研究主要局限于特定细胞类型（Jurkat T细胞和原代T细胞），尚未在更广泛细胞类型或体内环境中验证	开发新型表观遗传编辑工具，用于可编程DNA甲基化和基因沉默调控	人类细胞系（包括Jurkat T细胞）和供体来源的原代人类T细胞	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9, DNA甲基化编辑	dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白变体	表观遗传数据（DNA甲基化谱），基因表达数据	多种人类细胞系和供体来源的原代人类T细胞
50	2025-09-18	Exploring the diversity and antimicrobial potential of actinomycetes isolated from different environments in Saudi Arabia: a systematic review 2025, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2025.1568899 PMID:40207161	综述	本文系统回顾了沙特阿拉伯不同环境中放线菌的多样性及其抗菌潜力，探讨了其在应对抗菌素耐药性中的价值	聚焦沙特独特生态系统（如极端环境）中放线菌的多样性，并整合基因组挖掘、AI生物信息学等前沿技术挖掘新型抗菌化合物	培养稀有菌株困难、基因组表征有限以及生产成本高	探索放线菌的多样性及其抗菌潜力，以发现新型抗菌剂应对抗菌素耐药性	沙特阿拉伯不同环境（陆地、水生、极端环境等）中的放线菌	微生物学与生物技术	抗菌素耐药性相关感染	基因组挖掘、宏基因组学、AI驱动的生物信息学、CRISPR基因激活、质谱、液相色谱、NMR	NA	微生物多样性数据、基因组数据、化合物结构数据	NA（系统综述，未指定具体样本数量）
51	2025-09-18	Yarrowia lipolytica as a promising cell factory for microbial production of value-added nutraceuticals 2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2025.1673169 PMID:40948964	综述	本文综述了利用解脂耶氏酵母作为细胞工厂生产高附加值营养保健品的近期进展和工程策略	强调了细胞器区室化和生物传感器驱动筛选等先进工具在提高反应效率和加速菌株开发中的应用	NA	探讨解脂耶氏酵母作为微生物生产高价值营养保健品的有前景的细胞工厂	解脂耶氏酵母及其代谢工程改造	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学、多组学数据分析	NA	多组学数据	NA
52	2025-09-18	Reprogramming cancer immunity with next-generation combination therapies 2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2025.1652047 PMID:40950404	综述	本文全面分析下一代癌症免疫联合疗法的多模式策略、机制基础和临床整合	整合免疫学、合成生物学和系统医学创新，提出从转化性干预向跨恶性肿瘤治愈范式过渡	免疫相关不良事件和治疗反应变异性需要预测性生物标志物和改进的患者分层	克服癌症免疫治疗耐药性，通过多层面免疫调节策略提升疗效	恶性肿瘤患者及免疫微环境	肿瘤免疫学	癌症	多组学分析、纳米技术、免疫工程、AI驱动建模	NA	生物标志物数据、多组学数据	NA
53	2025-09-18	Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability 2014-Dec, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/nchembio.1680 PMID:25306443	研究论文	本研究通过编程控制基因可用性时间，利用位点特异性重组酶减少多基因电路中的泄漏效应，显著提升生物传感器性能	首次使用位点特异性重组酶实现基因可用性的可编程时序控制，有效解决多基因电路部署中的去同步化问题	NA	开发通过时序控制基因可用性来优化合成生物学基因电路性能的新方法	内源性microRNA的生物传感器电路和细胞类型分类	合成生物学	NA	位点特异性重组酶技术	NA	基因表达数据	NA
54	2025-09-17	Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies 2025-Sep-16, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.) DOI:10.1177/15303667251376450 PMID:40955762	系统综述	本文系统综述虫媒病毒病在变化世界中的进化动态、宿主-媒介相互作用及新型控制策略	整合基因组分析、元流行病学综合与预测建模，强调CRISPR基因驱动和RNAi抗病毒等创新控制方法	基因编辑和微生物干预存在伦理、生态及监管问题需审慎考虑	理解虫媒病毒的进化机制、宿主-媒介相互作用及疾病控制策略	虫媒病毒（如登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗河病毒）及其传播媒介（蚊、蜱等）	传染病学与公共卫生	虫媒病毒性疾病	基因组分析、预测建模、CRISPR基因驱动、RNAi技术	预测模型	基因组数据、流行病学数据	从16,320条记录中筛选出12项高质量研究
55	2025-09-15	Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications 2025-Oct-15, Journal of molecular biology IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225 PMID:40409706	综述	本文探讨了利用合成生物学原理设计变构调控及其在生物医学领域的应用潜力	整合人工智能生成式蛋白质设计方法开发新型变构调控策略	NA	通过合成生物学方法实现蛋白质功能的变构调控	蛋白质变构调控机制与合成生物学设计策略	合成生物学	NA	结构域插入、从头蛋白质开关设计、工程化变构机制	AI生成式蛋白质设计	蛋白质结构数据	NA
56	2025-09-15	Multivalent engineering of bio interfaces with DNA-based nanomaterials 2025-Oct, Advanced drug delivery reviews IF:15.2Q1 DOI:10.1016/j.addr.2025.115681 PMID:40865643	综述	本文综述了基于DNA纳米材料的多价工程在生物界面设计中的原理、进展与应用	提出了'多价工程'概念，通过DNA纳米技术实现配体空间编程以调控生物功能	在复杂体内环境中应用仍面临挑战	探讨多价相互作用在生物界面工程中的设计与应用	生物界面（细胞信号传导、免疫识别、粘附等过程）	生物纳米技术	NA	DNA纳米材料技术	NA	NA	NA
57	2025-09-15	CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs 2025-Sep-12, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353 PMID:40945517	综述	本文回顾了CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的挑战与突破性策略	重点介绍了整合合成生物学和基因工程的新一代CAR-T疗法，以增强细胞适应性、效力和持久性，并重编程肿瘤微环境	NA	探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤中的应用障碍及解决方案	实体瘤患者及临床前模型（如人源化异种移植小鼠）	肿瘤免疫治疗	实体瘤	合成生物学、基因工程	NA	临床实验数据及临床前模型数据	NA
58	2025-09-15	From marsh to market: taming Vibrio natriegens for sustainable bioproduction 2025-Sep-11, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2025.103353 PMID:40945411	研究论文	探讨利用Vibrio natriegens作为可持续生物生产底盘的发展潜力	提出通过系统生物技术方法结合菌株和工艺工程，实现可扩展的下一代生物制造	在实现高产物产量和处理难降解底物方面仍存在重要限制	开发可持续生物生产技术	Vibrio natriegens细菌	合成生物学	NA	基因组工程、合成生物学工具、系统水平分析	NA	NA	NA
59	2025-09-15	Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits 2025-Sep-11, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004 PMID:40945582	研究论文	本研究通过构建启动子库和新型杂交启动子扩展了群体感应工具箱，用于动态遗传电路的精细调控	创建了自然界不存在的新型杂交启动子（需两种自诱导剂激活）并构建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库	NA	扩展群体感应系统的调控能力，开发动态遗传电路设计工具	群体感应系统、遗传电路、启动子调控元件	合成生物学	NA	遗传电路设计、启动子工程	NA	遗传元件性能数据	NA
60	2025-09-15	Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing 2025-Aug-27, RSC chemical biology IF:4.2Q2 DOI:10.1039/d5cb00057b PMID:40585578	综述	本文综述了可编程DNA纳米结构在刺激响应药物递送和多模式生物传感中的最新进展与应用	聚焦DNA纳米结构（如瓦片组装体、折纸框架、球形核酸）对肿瘤微环境（pH、酶活性等）的动态响应能力，并整合多模式检测技术（FRET、电化学发光等）	存在规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等转化挑战	推动精准医疗中靶向药物递送和生物医学成像的发展	DNA纳米结构（包括瓦片组装体、折纸框架、球形核酸、刺激响应水凝胶等）	合成生物学	癌症	DNA纳米技术、FRET、电化学发光、SERS	NA	生物分子数据（如ctDNA、外泌体）	NA（预临床研究，未明确样本量）