合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-07-29	Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina 2025-Jan-15, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004 PMID:39778579	研究论文	本文提出了一种主动学习方法来训练模型，以区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子	采用主动学习策略结合合成生物学和不确定性采样，迭代训练模型以区分功能相反的CRX结合位点	模型可能仍无法完全解释转录因子在不同背景下激活或抑制转录的具体机制	开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型	光感受器转录因子CRX的结合位点	机器学习	NA	主动学习、合成生物学、大规模并行报告基因检测	深度学习模型	基因组序列	几乎所有基因组中结合的CRX位点
42	2025-07-29	LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling 2024-08-09, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-024-01915-z PMID:39117617	研究论文	研究发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号通路，提高CD8+ T细胞的干细胞样特性及抗肿瘤能力	首次揭示LMO4通过结合JAK1增强STAT3信号传导，促进CD8+ T细胞的干细胞样特性和抗肿瘤功能	研究主要基于体外和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索增强CD8+ T细胞干细胞样特性以提升T细胞疗法效果的分子机制	CD8+ T细胞	免疫治疗	肿瘤	CRISPR激活筛选、合成生物学方法、CRISPR/Cas9基因编辑	NA	基因表达数据、细胞功能实验数据	NA
43	2025-07-29	Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System 2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/66595 PMID:38526087	研究论文	本文展示了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法	提出了一种基于封装和无细胞表达反应的方法，成功在合成细胞中重构膜蛋白	方法仅针对细菌谷氨酸受体进行了验证，未广泛测试其他膜蛋白	开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法	细菌谷氨酸受体(GluR0)和蛋白视紫红质信号肽	合成生物学	NA	无细胞表达系统(CFE)	NA	NA	NA
44	2025-07-29	Activation domains can decouple the mean and noise of gene expression 2022-07-19, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.111118 PMID:35858548	research paper	研究探讨了激活结构域（ADs）如何影响基因表达的平均水平和噪声	揭示了激活结构域的强度和核浓度如何独立调控基因表达噪声，而不依赖于ADs类别的差异	未涉及具体疾病模型或临床应用验证	探索基因表达噪声的调控机制及其潜在应用	基因表达的随机波动（噪声）	合成生物学	NA	NA	NA	理论分析	NA
45	2025-07-28	Recent advances in engineering microbial lipases for industrial applications 2025-Jul-21, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108658 PMID:40701353	review	本文综述了微生物脂肪酶的分类、特性、工业生产及应用，以及通过合成生物学和工程工具设计新型脂肪酶的最新进展	整合合成生物学和工程工具设计新型脂肪酶，以及利用蛋白质工程、固定化技术和AI工具提升脂肪酶催化性能	微生物脂肪酶存在多种异构体，限制了其应用并需要昂贵的纯化过程	开发新型脂肪酶以提升其在工业应用中的稳定性、活性和特异性	微生物脂肪酶及其在农业、生物燃料、化妆品、化工、食品、制药和纺织等工业中的应用	合成生物学	NA	蛋白质工程、固定化技术、AI工具	NA	NA	NA
46	2025-07-28	Revolutionizing keratinase science: Biocatalytic advances, sustainable innovation, and industrial perspectives 2025-Jul-21, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108657 PMID:40701354	综述	本文系统回顾了角蛋白酶的研究历史、分类、催化机制及其在多个领域的应用，并探讨了未来研究方向	整合了蛋白质工程、人工智能辅助酶设计和合成生物学等前沿技术来提升角蛋白酶的性能	工业生产应用仍受限于高成本、酶稳定性不足和监管复杂性	推动角蛋白酶研究及其在可持续发展和资源管理中的转化应用	角蛋白酶及其在环境修复和循环生物经济中的应用	生物催化	NA	蛋白质工程、人工智能辅助酶设计、合成生物学	NA	NA	NA
47	2025-07-28	Unlocking the algae toolbox: Cutting-edge tools for environmental and biotechnological solutions 2025-Jul-20, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108652 PMID:40695391	综述	本文全面评述了藻类研究中的最新工具和方法，特别是在环境管理和生物技术中的应用	整合了CRISPR-Cas9基因编辑、高通量组学、机器学习建模和遥感监测等前沿技术	大规模生产仍面临经济可行性和环境可持续性的挑战	推动藻类生物技术和全球可持续发展	藻类及其在生物技术、环境管理和可持续产业中的应用	生物技术	NA	CRISPR-Cas9, 高通量组学, 机器学习, 遥感, 光学传感器, 流式细胞术, 生物传感器, 环境DNA	机器学习驱动建模	组学数据, 遥感数据, 传感器数据	NA
48	2025-07-26	Isoprenoids in eukaryotic phytoplankton: metabolic diversity, eco-physiology and biotechnological opportunities 2025-Jul-25, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf314 PMID:40707021	综述	本文全面评估了不同微藻类群中异戊二烯类化合物的生物合成与调控，并探讨了其生理生态意义和生物技术潜力	系统比较了叶绿体定位的MEP途径和胞质MVA途径的差异，揭示了藻类特有的酶适应和谱系特异性类胡萝卜素生物合成酶	对异戊二烯类生态功能的认识仍存在未解决的问题	阐明微藻中内源性异戊二烯类生物合成及其调控网络	真核浮游植物（微藻）中的异戊二烯类代谢	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
49	2025-07-26	Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides 2025-Jul-24, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575 PMID:40705854	研究论文	本研究利用合成生物学方法全面调查了丝状真菌中大黄素葡萄糖苷的生物合成，并开发了高效生产大黄素葡萄糖苷的策略	评估了十种高效的大黄素UDP-葡萄糖基转移酶（EUGTs），并开发了一种全细胞催化系统，实现了78.9%的高转化率	植物源蛋白在丝状真菌中的表达存在挑战，进一步优化受到阻碍	开发高效生产大黄素葡萄糖苷的策略	大黄素-6-β-d-葡萄糖苷（E6G）和大黄素-8-β-d-葡萄糖苷（E8G）	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	十种EUGTs
50	2025-07-26	Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens 2025-Jul-23, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00727-25 PMID:40464557	研究论文	研究细胞内c-di-GMP在Geobacter metallireducens细菌胞外电子传递(EET)中的作用	揭示了c-di-GMP通过调控多血红素细胞色素和菌毛蛋白PilA-N的基因表达，影响整个胞外电子传递过程	c-di-GMP如何影响这些基因表达的具体机制尚不清楚	探究c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用	Geobacter metallireducens细菌	微生物学	NA	合成生物学方法	NA	基因表达数据	三种不同c-di-GMP水平的菌株(Gme-H, Gme-C, Gme-L)
51	2025-07-26	Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation 2025-Jul-19, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf703 PMID:40705927	研究论文	本文设计了一种遗传'过期日期'电路，用于控制合成细菌的寿命，以实现安全的生物修复	通过前馈激活网络设计可调节寿命的遗传电路，结合合成小调控RNA和基于asd的辅助营养系统优化电路，降低基因表达泄漏	NA	开发一种生物控制策略，安全部署合成细菌于实际应用中	合成酚清除大肠杆菌	合成生物学	NA	遗传电路设计，合成小调控RNA	NA	NA	NA
52	2025-07-26	Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00482 PMID:39705005	研究论文	该研究设计了一种名为EPDA的合成受体平台，用于实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信	开发了EPDA受体平台，通过肽配体二聚化实现可逆的细胞响应，并利用新型计算算法PETEI筛选最优单抗体	研究中仅测试了30种基于预测结合亲和力的单抗体，可能未涵盖所有潜在有效受体	桥接合成生物学和生物材料领域，开发能够感知和响应生物材料结合配体的跨膜受体	哺乳动物细胞和3D生物材料	合成生物学	NA	硫醇-降冰片烯化学，PETEI计算算法	EPDA受体平台	荧光信号（GFP）	超过2000种候选单抗体，最终测试了30种
53	2025-07-26	Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of Polyhydroxyalkanoates 2025-Jul-17, Letters in applied microbiology IF:2.0Q4 DOI:10.1093/lambio/ovaf096 PMID:40674061	研究论文	本研究通过宏基因组分析和高通量筛选技术，探索海洋环境中生产聚羟基脂肪酸酯（PHA）的微生物资源	结合宏基因组预测和荧光定量技术，有效解决了荧光筛选中的假阳性问题，并成功分离出高效PHA生产菌株	研究仅针对海洋环境，未涉及其他生态系统的PHA生产者	开发可持续生产生物降解材料PHA的微生物资源和技术平台	海洋环境中的微生物群落及其PHA合成潜力	生物技术	NA	宏基因组分析、气相色谱（GC）、高通量筛选	NA	宏基因组数据、荧光定量数据	从不同海洋生境中分离出102株PHA生产菌株
54	2025-07-26	Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy 2025-Jul-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870 PMID:40660814	research paper	探讨细菌疗法作为低成本替代方案在癌症治疗中的应用及其潜力	提出利用合成生物学和人工智能开发下一代细菌疗法，显著降低成本并提高安全性	未提及细菌疗法在临床试验中的具体效果和潜在副作用	解决癌症治疗中高昂费用的问题，探索低成本替代方案	细菌疗法在癌症治疗中的应用	合成生物学	癌症	合成生物学, 人工智能	NA	NA	NA
55	2025-07-26	Enhancing ELISA Sensitivity: From Surface Engineering to Synthetic Biology 2025-Jul-06, Biosensors DOI:10.3390/bios15070434 PMID:40710084	综述	本文综述了提高ELISA敏感性的策略，包括表面修饰、混合与洗涤效率提升、信号生成与放大技术的最新进展，以及合成生物学在其中的新兴作用	强调了无细胞合成生物学在提升ELISA敏感性中的新兴作用，介绍了如表达免疫分析、CRISPR联免分析(CLISA)和T7 RNA聚合酶联免传感分析(TLISA)等新技术	NA	提高ELISA的敏感性，以改善体外诊断(IVD)的准确性	ELISA技术及其敏感性提升策略	生物技术	NA	ELISA, 合成生物学, CRISPR, T7 RNA聚合酶	NA	NA	NA
56	2025-07-26	Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L 2025-Jul, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362 PMID:40541870	研究论文	本研究鉴定了Melia azedarach L.中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶，参与三萜类化合物的生物合成	揭示了CYP88A亚家族酶在五环三萜和柠檬苦素类化合物生物合成中的双重功能，支持了结构保守驱动的功能趋同范式	NA	阐明Melia azedarach L.中五环三萜类化合物生物合成的酶学机制	Melia azedarach L.中的CYP88A亚家族细胞色素P450基因	植物分子生物学	NA	转录组挖掘、烟草瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征	NA	基因序列、酶活性数据	三个CYP88A亚家族基因(MaCYP88A108, MaCYP88A164, MaCYP88A222)和一个氧化角鲨烯环化酶(MaβAS1)
57	2025-07-26	Core biological principles and tools stemming from basic Arabidopsis research 2025-Jul-01, The Plant cell DOI:10.1093/plcell/koaf141 PMID:40479512	综述	本文探讨了拟南芥在植物生物学研究中的核心作用及其对基础生物学过程的贡献	展示了拟南芥研究在免疫机制、基因组变异性、合成生物学和生物生产等领域的突破性进展	主要聚焦于拟南芥的研究，可能未涵盖其他模型生物的最新进展	探讨拟南芥在基础生物学研究中的贡献及其对更广泛生物领域的启示	拟南芥及其在免疫机制、基因组学、合成生物学等领域的应用	植物生物学	弗里德赖希共济失调	泛基因组学、重复扩增研究、合成生物学、生长素诱导降解技术	NA	NA	NA
58	2025-07-26	Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review 2025, The American journal of Chinese medicine DOI:10.1142/S0192415X2550051X PMID:40626404	综述	本文综述了2019年至2024年间发表的具有潜在抗高血压活性的植物源天然产物，探讨了它们通过靶向氧化应激、炎症、血管重塑和神经激素途径来预防高血压发展的机制	系统分类了70种独特的天然产物，并强调了具有双重抗氧化/抗炎特性的天然产物在临床实验中的优先研究价值	未涉及天然产物在人体内的具体药效学及药代动力学研究	探讨植物源天然产物作为抗高血压药物的潜力及其作用机制	70种植物源天然产物（包括黄酮类、萜类、生物碱类和植物提取物）	药理学	心血管疾病	文献综述	NA	文献数据	70种独特的天然产物
59	2025-07-26	Synthetic Circuit-Driven Expression of Heterologous Enzymes for Disease Detection 2021-09-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.1c00133 PMID:34464083	研究论文	本文介绍了一种结合纳米技术和合成生物学的工程生物传感器，用于放大疾病状态的检测信号	设计了一种AND门基因电路，响应癌症相关转录失调，表达异源酶生物标志物，并通过纳米粒子传感器放大检测信号	目前仅在卵巢癌小鼠模型中进行了概念验证，尚未在人类或其他疾病模型中测试	开发新型工程生物传感器，用于疾病检测	卵巢癌细胞和小鼠模型	合成生物学	卵巢癌	基因电路设计和纳米粒子传感器技术	AND门基因电路	生物分子信号	小鼠模型中的卵巢癌细胞
60	2025-07-26	The Future of Virology is Synthetic 2021-Aug-31, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/mSystems.00770-21 PMID:34463577	评论	本文探讨了合成生物学在病毒学领域的应用前景及其对改善人类健康和可持续农业的潜在贡献	提出合成病毒学作为解锁全球病毒基因库和应对耐药微生物威胁的未来策略	NA	探讨合成病毒学在理解微生物生态系统和应对全球健康挑战中的应用	病毒及其在微生物生态系统中的作用	合成生物学	耐药微生物感染	合成生物学技术	NA	NA	NA