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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2025-05-08 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-May, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展和前景,包括生产燃料、化学品、蛋白质和肽的酵母菌株开发 | 强调了合成生物学工具和数学建模在酵母代谢工程中的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏具体案例支持 | 探讨酵母作为微生物细胞工厂在工业生物技术中的应用 | 酵母菌株 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、数学建模 | NA | NA | NA |
142 | 2025-05-08 |
Unraveling the hydroxylation and methylation mechanism in polymethoxylated flavones biosynthesis in Dracocephalum moldavica
2025-Apr, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109571
PMID:39919496
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研究论文 | 本研究揭示了Dracocephalum moldavica中多甲氧基黄酮(PMFs)生物合成中的羟基化和甲基化机制 | 鉴定了三种黄酮羟基化酶(DmFH1/2/3)和四种黄酮O-甲基转移酶(DmOMT1/2/3/4),并阐明了它们在PMFs生物合成中的作用 | 研究仅基于转录组数据库分析,未进行更深入的体内功能验证 | 阐明Dracocephalum moldavica中多甲氧基黄酮生物合成的羟基化和甲基化机制 | Dracocephalum moldavica植物及其多甲氧基黄酮生物合成相关酶 | 植物生物化学 | NA | 转录组分析、异源表达 | NA | 转录组数据 | NA |
143 | 2025-05-08 |
Progress on production of malic acid and succinic acid by industrially-important engineered microorganisms
2025-Apr, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.02.001
PMID:39923900
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综述 | 本文总结了通过代谢工程改进有机酸生物合成的最新研究进展,重点关注L-苹果酸(L-MA)和琥珀酸(SA) | 结合合成生物学和高通量筛选等新技术,探讨了代谢工程在提高有机酸产量方面的应用 | 微生物发酵的产量低和发酵周期长限制了其工业应用 | 改进有机酸的生物合成方法,提高产量和效率 | L-苹果酸(L-MA)和琥珀酸(SA) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、高通量筛选 | NA | NA | NA |
144 | 2025-05-08 |
Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids
2025-Mar-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00799a
PMID:39936337
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综述 | 本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展,特别是在治疗应用、异源核酸(XNAs)开发及核酸病因学研究方面 | 强调了糖修饰在改善核酸性质方面的作用,特别是在治疗应用和异源核酸开发中的最新进展 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用 | 核酸中的碳水化合物修饰 | 生物化学 | NA | 核酸和碳水化合物化学、蛋白质工程、递送方法 | NA | NA | NA |
145 | 2025-05-08 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-Feb-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
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研究论文 | 开发了一种基于无细胞脚趾开关技术的生物传感器,用于快速、灵敏地检测寨卡病毒 | 结合脚趾开关技术和核酸序列扩增技术(NASBA),显著提高了检测灵敏度和特异性 | 脚趾开关在检测低丰度目标时存在固有局限性 | 开发快速、灵敏的寨卡病毒诊断工具 | 寨卡病毒 | 合成生物学 | 传染病 | 脚趾开关技术, 核酸序列扩增技术(NASBA) | NA | 核酸 | NA |
146 | 2025-05-08 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2025-Feb-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98110
PMID:39937081
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research paper | 该研究提出了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化的双组分引导RNA将蛋白质-蛋白质接近性连接到功能性CRISPR-Cas9系统的形成 | 通过工程化crRNA:tracrRNA相互作用,将已知的蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导的二聚化作为激活基因编辑的触发器 | NA | 增强CRISPR基因编辑在合成分子电路中的可控性 | 人类细胞中的基因编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 双组分引导RNA, ADAR-based RNA传感器 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
147 | 2025-05-08 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 研究大肠杆菌中ATP能量循环系统的框架,特别是通过CRISPR-Cas9技术进行基因编辑以优化ATP合成路径 | 发现单个ppk基因(No.8)能够完成循环反应,并通过MUCICAT技术将其插入大肠杆菌基因组的不同位置和拷贝数,实现不同活性水平 | 研究仅针对大肠杆菌,未涉及其他生物体,且插入基因的难度和表达水平可能受基因组位置影响 | 开发一种快速、无标记、多位点和多拷贝的基因组编辑系统,以推动合成生物学的发展 | 大肠杆菌及其ATP合成路径中的ppk基因(No.8) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT | NA | 基因组数据 | NA |
148 | 2025-05-08 |
A synthetic chronogenetic gene circuit for programmed circadian drug delivery
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56584-5
PMID:39920119
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学和组织工程的昼夜节律基因电路,用于程序化昼夜节律药物递送 | 结合合成生物学和组织工程技术,开发了名为“chronogenetics”的昼夜节律基因电路,能够根据核心时钟基因Period2 (Per2)的启动子表达预设的转基因 | 研究目前仅在体外和小鼠模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发一种基于细胞的昼夜节律疗法,用于昼夜节律医学中的各种应用 | 诱导多能干细胞、软骨构建物 | 合成生物学、组织工程 | 类风湿性关节炎、炎症性疾病 | 合成生物学、组织工程 | NA | NA | NA |
149 | 2025-05-08 |
The evolution of sequences and spatial conformation in vertebrate chromosomes
2025-Feb, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-212
PMID:39924699
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review | 本文综述了脊椎动物染色体的序列和空间构象的进化过程,探讨了染色体重排在物种形成中的作用、分子机制、进化模式以及性染色体作为研究染色体进化的一般范例的意义 | 利用高通量测序技术革新了对染色体变异的理解,并探讨了合成生物学为染色体进化研究带来的新机遇和挑战 | NA | 理解和研究脊椎动物染色体进化 | 脊椎动物染色体 | 基因组学 | NA | 高通量测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
150 | 2025-05-08 |
Model-guided gene circuit design for engineering genetically stable cell populations in diverse applications
2025-Feb, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0602
PMID:39933591
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研究论文 | 本文提出了一种生物分子控制器,用于在合成生物学中维持工程细胞群体的遗传稳定性 | 开发了一种独立于突变合成基因身份的通用生物分子控制器,可广泛应用于不同合成基因电路而不需重新设计 | 未提及具体的实验验证或实际应用中的潜在问题 | 解决合成生物学中工程细胞群体遗传稳定性问题 | 工程细胞群体 | 合成生物学 | NA | 生物分子控制器设计 | 资源感知细胞模型 | 模拟数据 | NA |
151 | 2025-05-08 |
[Function of flavoprotein monooxygenases in natural product biosynthesis]
2025-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文全面综述了黄素蛋白单加氧酶(FPMOs)在天然产物生物合成中的功能及其最新研究进展 | 系统分析了植物Class B FPMOs的分类、催化反应及机制,并总结了其在天然产物合成中的应用潜力 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于文献综述 | 深化对FPMOs的理解,促进其从基础研究向实际应用的转化 | 植物Class B FPMOs及其在天然产物生物合成中的作用 | 生物化学与分子生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA |
152 | 2025-05-08 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化的双组分引导RNA将蛋白质-蛋白质接近性连接到功能性CRISPR-Cas9系统的形成 | 提出了一种将蛋白质-蛋白质接近性与CRISPR-Cas9基因组编辑功能连接的新策略,增强了基因组编辑的可控性 | NA | 开发可编程的合成分子电路,将分子事件(如蛋白质相互作用)与基因组编辑联系起来 | 人类细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导的二聚化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基础编辑, 主要编辑 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
153 | 2025-05-08 |
Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43451-4
PMID:38030603
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研究论文 | 本研究通过计算技术和合成生物学方法,揭示了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin的结构及其抗生素活性,探索了自然界如何通过进化优化这类抗生素 | 结合计算技术和合成生物学方法,成功预测并复活了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin,揭示了其结构和抗生素活性 | 研究主要依赖于计算预测和合成生物学技术,可能无法完全还原自然进化过程中的所有细节 | 探索脂质II靶向糖肽抗生素的进化起源及其优化策略 | 脂质II靶向糖肽抗生素(如teicoplanin和vancomycin)及其祖先分子paleomycin | 合成生物学 | 抗生素耐药性细菌感染 | 计算技术、合成生物学技术 | NA | NA | NA |
154 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-May-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) |
155 | 2025-05-07 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
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综述 | 本文综述了植物光感受器在调节农艺重要性状中的作用、植物光感受器工程的现状、光遗传学和合成生物学的应用及其在作物改良中的实际考虑 | 探讨了通过工程化光感受器活动或光感受器途径来增强作物生产力的潜在途径,以及光遗传学工具在实时操控植物细胞反应中的应用 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要集中于理论和技术前景的讨论 | 探索通过光感受器工程和光遗传学技术提高植物生产力的方法和潜力 | 植物光感受器及其在作物改良中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、合成生物学 | NA | NA | NA |
156 | 2025-05-07 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 本文综述了细胞色素P450在植物源性天然产物生物合成中的关键作用 | 重点探讨了细胞色素P450在天然产物下游合成途径和结构修饰中的重要作用,并总结了天然产物生物合成和合成生物学研究的最新进展 | NA | 深入了解细胞色素P450酶在天然产物合成途径中的作用,促进天然产物的开发和合成生物学研究 | 植物源性天然产物及其生物合成途径中的细胞色素P450酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
157 | 2025-05-07 |
Future-proofing ornamental plants: Cutting-edge strategies for drought resistance and sustainability
2025 May-Jun, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70255
PMID:40325615
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review | 本文综述了观赏植物抗旱性研究的最新进展,探讨了干旱胁迫对植物形态、生理、生化及美学价值的影响,并介绍了CRISPR/Cas9、合成生物学和数字表型分析等前沿技术在培育抗旱观赏植物中的应用 | 整合了多组学方法、先进育种技术和数字工具,加速关键抗旱基因和性状的鉴定,并探讨了表观遗传工程、合成生物学和高通量表型分析在培育更具抗逆性和美学价值的观赏植物中的潜力 | 虽然对植物干旱胁迫响应的理解取得了显著进展,但如何将这些知识有效转化为观赏植物的实际育种策略仍存在空白 | 开发抗旱观赏植物,以应对干旱胁迫对观赏园艺的挑战,满足对美观且可持续景观日益增长的需求 | 观赏植物 | 园艺学 | NA | CRISPR/Cas9, 合成生物学, 数字表型分析, 多组学方法 | NA | NA | NA |
158 | 2025-05-07 |
QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion
2025-Apr-28, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202500817
PMID:40296212
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研究论文 | 本研究通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白在亚硝酸盐还原过程中的分子机制 | 揭示了活性位点的结构重组对亚硝酸盐还原机制的关键作用,特别是氢键网络和HONO中间体配位转换的影响 | 研究主要基于计算模拟,缺乏实验验证 | 阐明YtfE蛋白在亚硝酸盐还原中的催化机制 | 大肠杆菌铁中心修复蛋白(YtfE) | 计算生物学 | NA | QM/MM, QM/MM MD, QM计算 | NA | 计算模拟数据 | NA |
159 | 2025-05-07 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 开发了一种高效的转化方法,显著提高了转化效率,并减少了所需的DNA和受体细胞数量 | NA | 改进最小细胞的转化方法,以促进基因工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 小于0.2 mL的培养物,约1×10^10细胞和10 ng质粒DNA |
160 | 2025-05-07 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-Mar-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略构建人工酵母群落的最新进展,特别是光遗传学在调控群落表型中的应用 | 强调了光遗传学技术在合成酵母群落中实现时空调控的创新应用 | NA | 探索合成微生物群落的构建及其在生态动力学和代谢工程中的应用 | 合成酵母群落 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |