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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2001 | 2024-08-07 |
Chalkophomycin Biosynthesis Revealing Unique Enzyme Architecture for a Hybrid Nonribosomal Peptide Synthetase and Polyketide Synthase
2024-Apr-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29091982
PMID:38731473
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研究论文 | 本文研究了来自sp. CB00271的chalkophomycin的生物合成机制,揭示了其独特的非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的酶结构 | 首次揭示了chalkophomycin生物合成中独特的酶结构,涉及非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的混合体系 | NA | 阐明chalkophomycin的生物合成机制,并为通过合成生物学方法工程化chalkophomycin类似物奠定基础 | chalkophomycin的生物合成基因簇及其编码的酶 | 生物化学 | NA | 基因替换 | NA | DNA序列 | 涉及约31 kb的DNA区域,包含19个开放阅读框 |
2002 | 2024-08-07 |
Efficient biosynthesis of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis via systematic engineering strategies
2024, Current research in food science
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.crfs.2024.100756
PMID:38736907
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研究论文 | 本研究通过系统工程策略在重组的smL2020菌株中高效合成转谷氨酰胺酶(TGase) | 通过多重工程策略,包括启动子工程、优化信号肽和重组位点以及增加表达盒的拷贝数,实现了TGase活性的显著提升,达到了迄今为止报道的最高水平 | NA | 提高转谷氨酰胺酶在食品工业中的应用范围 | 转谷氨酰胺酶的合成与应用 | 生物技术 | NA | 系统工程策略 | NA | 酶活性数据 | 1000升发酵罐 |
2003 | 2024-08-07 |
Programming microbial population dynamics by engineered cell-cell communication
2011-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201100132
PMID:21681967
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review | 本文综述了通过工程化细胞间通信来编程微生物种群动态的最新进展 | 探讨了从单一物种到多物种、从单向到双向通信的工程化微生物生态系统中的细胞间通信 | NA | 旨在通过工程化基因电路编程细胞行为,特别是种群层面的细胞行为 | 工程化细胞间通信在微生物种群动态中的应用 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
2004 | 2024-08-07 |
Tailored UPRE2 variants for dynamic gene regulation in yeast
2024-May-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315729121
PMID:38687789
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研究论文 | 本文通过创建UPRE2突变体库,筛选出具有增强响应性和更宽动态范围的元素,并研究了其与转录因子Hac1的相互作用,以提高酵母中重组蛋白和天然产物合成的效率 | 开发了新的UPRE2突变体,增强了与Hac1的结合亲和力,提高了基因表达的动态调控能力 | NA | 研究如何通过合成生物学方法优化酵母中的基因调控,以提高化学品和重组蛋白的生产效率 | UPRE2突变体及其在酵母细胞中的基因调控作用 | 合成生物学 | NA | 分子建模,定点突变 | NA | 基因序列 | 多个UPRE2突变体元素 |
2005 | 2024-08-07 |
OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558349
PMID:37808818
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能,采用模块化附件和中央旋转无刷电机,设计紧凑且具有多种安全特性 | NA | 降低预算有限的实验室进行DNA提取的成本 | OpenCell设备的开发及其在DNA提取中的应用 | 合成生物学 | NA | 3D打印 | NA | NA | 使用OpenCell成功从菠菜中提取DNA,平均产量为2.3 μg |
2006 | 2024-08-07 |
OpenCell: A low-cost, open-source, 3-in-1 device for DNA extraction
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298857
PMID:38696375
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能,采用模块化附件和磁性连接,以及冗余安全特性 | NA | 解决预算有限的实验室进行高成本DNA提取的问题 | OpenCell设备及其在DNA提取中的应用 | 生物技术 | NA | DNA提取 | NA | DNA | 从Spinacia oleracea(菠菜)中成功分离DNA,平均产量为2.3 μg |
2007 | 2024-08-07 |
Mining the Utricularia gibba genome for insulator-like elements for genetic engineering
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1279231
PMID:38023853
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研究论文 | 本文通过分析Utricularia gibba(驼峰狸藻)的基因组,寻找潜在的绝缘子样序列,用于遗传工程 | 本文发现了两个与已发表元素(EXOB)性能相当且尺寸显著较小的绝缘子样元素 | 本文未能识别出选定间隔区与现有植物绝缘子样元素之间的保守基序 | 寻找新的绝缘子样序列,以精确控制多基因遗传工程和合成生物学中的转录 | Utricularia gibba的基因组中的绝缘子样序列 | 遗传工程 | NA | 基因组分析 | NA | 基因组数据 | 4,656个间隔区,10个选定的间隔区 |
2008 | 2024-08-07 |
Design and implementation of a biomolecular concentration tracker
2015-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500024b
PMID:24847683
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研究论文 | 本文设计并实现了一种生物分子浓度跟踪器,利用合成蛋白质支架作为模块化和可调的负反馈机制,实现动态蛋白质浓度跟踪。 | 本文创新性地使用合成蛋白质支架作为模块化和可调的机制,通过负反馈实现生物分子浓度的动态跟踪。 | NA | 研究目的是开发一种动态和自适应的方法,以确保在活细胞中人工系统的恒定相对活性,不受内在和外在噪声的影响。 | 研究对象是合成蛋白质支架和其在生物分子浓度跟踪中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 研究在Escherichia coli中进行,具体样本数量未提及。 |
2009 | 2024-08-07 |
Bacterial quorum sensing and metabolic incentives to cooperate
2012-Oct-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1227289
PMID:23066081
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研究论文 | 研究了机会性病原体铜绿假单胞菌如何利用群体感应系统控制公共产品的生产,并探讨了这种系统如何通过代谢约束防止社会欺骗行为 | 展示了群体感应控制的私人产品表达如何对社会欺骗行为施加代谢约束,防止公共资源的悲剧 | NA | 探讨群体感应系统在控制公共产品生产和防止社会欺骗行为中的作用 | 铜绿假单胞菌的群体感应系统和其控制的细胞酶 | NA | NA | 群体感应 | NA | NA | NA |
2010 | 2024-08-07 |
Reversing the directionality of reactions between non-oxidative pentose phosphate pathway and glycolytic pathway boosts mycosporine-like amino acid production in Saccharomyces cerevisiae
2024-May-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02365-6
PMID:38725068
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研究论文 | 研究通过改变非氧化戊糖磷酸途径与糖酵解途径之间的反应方向性,提高酵母中类海藻氨基酸的生产 | 提出了一种新的代谢工程策略,通过逆转糖酵解与非氧化戊糖磷酸途径之间的通量方向,增强类海藻氨基酸的生产 | NA | 探索调控类海藻氨基酸生产的细胞因子 | 类海藻氨基酸在酵母中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2011 | 2024-08-07 |
Sender-receiver systems and applying information theory for quantitative synthetic biology
2015-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2014.08.005
PMID:25282688
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研究论文 | 本文探讨了发送-接收(S-R)系统在生物学中的应用,并利用信息论进行定量分析,特别是在合成生物学领域。 | 结合信息论和合成生物学,提供了对人工S-R系统的定量控制,并探讨了如何最大化信号传递的鲁棒性。 | 需要进一步发展更复杂的电路设计,以解释生物学意义。 | 研究如何通过信息论和合成生物学的结合,推动合成生物学的发展。 | 自然遗传、酶促和神经网络中的S-R系统。 | 合成生物学 | NA | 信息论 | NA | NA | NA |
2012 | 2024-08-07 |
Complex function by design using spatially pre-structured synthetic microbial communities: degradation of pentachlorophenol in the presence of Hg(ii)
2011-Feb, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1039/c0ib00019a
PMID:20717565
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研究论文 | 本文通过微流控层流技术构建了一种具有空间结构的合成微生物群落,以实现对五氯苯酚(PCP)和汞离子(Hg(ii))的共同降解。 | 利用空间结构设计合成微生物群落,保护对汞敏感的PCP降解菌,使其能在汞存在下有效降解PCP。 | 文章未提及具体的局限性。 | 研究空间结构在合成微生物群落中实现多重功能的作用。 | 五氯苯酚(PCP)和汞离子(Hg(ii))的降解。 | NA | NA | 微流控层流技术 | NA | 微生物群落 | 使用了Sphingobium chlorophenolicum和Ralstonia metallidurans两种微生物 |
2013 | 2024-08-07 |
Paradigm shifts versus fashion shifts? Systems and synthetic biology as new epistemic entities in understanding and making 'life'
2009-Aug, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/embor.2009.130
PMID:19636303
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2014 | 2024-08-07 |
Expanded hammerhead ribozymes containing addressable three-way junctions
2009-May, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.1220309
PMID:19304923
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研究论文 | 本文介绍了一种新型扩展的全长锤头核酶(HHR)设计,该设计允许在核酶上附加额外的功能,从而构建出在细菌中非常高效的人工核糖开关 | 通过在HHR的茎I上附加额外的螺旋(IV)并维持快速的切割速率,设计了一种新型的核酶支架,并将其整合到细菌mRNA中,实现了通过核酶的自催化切割来控制基因表达 | NA | 扩展锤头核酶工具箱,为合成生物学应用提供额外的位置以附加调控模块,实现体内基因表达的控制 | 锤头核酶的设计及其在细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | RNA | NA |
2015 | 2024-08-07 |
Self-Assembly of Heterogeneous Ferritin Nanocages for Tumor Uptake and Penetration
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309271
PMID:38368258
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的方法,用于制造具有高度可控性和可重复性的蛋白质基纳米粒子,并探讨了这些纳米粒子与肿瘤目标和渗透之间的相互作用。 | 开发了一种新的合成生物学策略,用于精确控制纳米粒子的异质成分,并展示了这种策略在肿瘤积累和渗透中的应用。 | NA | 研究纳米粒子的异质性如何影响其在生物系统中的命运。 | 研究了不同密度的铁蛋白重链和轻链混合纳米笼(FHn)在肿瘤细胞摄取、体内肿瘤积累和组织渗透中的作用。 | 纳米技术 | 肿瘤 | 合成生物学 | NA | 纳米粒子 | NA |
2016 | 2024-08-07 |
Synthetic development: building mammalian multicellular structures with artificial genetic programs
2019-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2019.03.016
PMID:31128430
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研究论文 | 本文探讨了使用人工遗传程序构建哺乳动物多细胞结构的方法 | 介绍了合成发育程序在多细胞哺乳动物系统中的应用,利用工程化的细胞间通信、多细胞基因调控网络和效应基因 | NA | 探索合成生物学在发育生物学和组织发育领域的新应用 | 哺乳动物多细胞结构 | 合成生物学 | NA | 人工遗传程序 | NA | NA | NA |
2017 | 2024-08-07 |
Modular extracellular sensor architecture for engineering mammalian cell-based devices
2014-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400128g
PMID:24611683
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研究论文 | 本文介绍了一种名为模块化胞外传感器架构(MESA)的新技术,用于工程化哺乳动物细胞设备,以监测和治疗调节人体生理 | MESA技术是一个自包含的受体和信号转导平台,与细胞内天然过程最大限度地正交,并包含独立的、可调节的蛋白质模块,便于性能优化和新MESA的直接工程化 | NA | 开发新技术以实现工程化细胞对生理相关信号的感知和响应 | 工程化哺乳动物细胞设备 | 合成生物学 | NA | 模块化胞外传感器架构(MESA) | NA | 蛋白质模块 | NA |
2018 | 2024-08-07 |
Steps towards the synthetic biology of polyketide biosynthesis
2014-Feb, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/1574-6968.12365
PMID:24372666
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研究论文 | 本文讨论了通过合成生物学方法优化和改造聚酮类化合物,以发现和生成新型及自然界未见化合物的潜力 | 利用合成生物学方法,基于聚酮合成酶的经典工程经验,探索新型化合物的发现和可控过量表达 | NA | 通过合成生物学方法推动次级代谢产物药物开发 | 聚酮类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2019 | 2024-08-07 |
De novo production of bioactive sesterterpenoid ophiobolins in Saccharomyces cerevisiae cell factories
2024-May-06, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02406-0
PMID:38711040
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,在酵母细胞工厂中成功合成了具有生物活性的sesterterpenoid ophiobolins | 首次在酵母中实现了sesterterpenoid ophiobolins的异源生物合成,为新药开发提供了有价值的解决方案 | NA | 开发一种细胞工厂,用于ophiobolin的生物合成,以满足药物开发的需求 | sesterterpenoid ophiobolins及其氧化衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2020 | 2024-08-07 |
A Biosynthetic Hybrid Spidroin-Amyloid-Mussel Foot Protein for Underwater Adhesion on Diverse Surfaces
2021-Oct-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c14182
PMID:34633172
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research paper | 本文通过合成生物学方法设计并合成了一种新型混合蛋白,该蛋白由淀粉样蛋白的拉链形成域、灵活的蜘蛛丝序列和含有二羟基苯丙氨酸(DOPA)的贻贝足蛋白(Mfp)组成,用于水下粘附 | 该混合蛋白能够自组装成半结晶水凝胶,具有高强度和韧性以及强大的水下粘附力,适用于多种表面,包括难以粘附的塑料、肌腱和皮肤 | NA | 开发一种新型水下粘附材料,用于生物医学愈合和水下修复 | 新型混合蛋白及其在水下粘附中的应用 | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | 蛋白质 | NA |