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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-05-28 |
Decoding heavy metal tolerance in rice: Nucleic acid-based technologies shaping global food security
2026-May-25, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152693
PMID:42190784
|
综述 | 综述了核酸技术在水稻重金属耐受性研究中的应用,从发现到部署的全过程 | 系统梳理了从QTL定位、群体GWAS、泛基因组学到CRISPR基因编辑的核酸技术演进,并探讨了其从学术工具向实际解决方案的转化,强调了对食品安全和二次绿色革命的推动作用 | 特异性与必需性矛盾、多金属拮抗(Cd/As氧化还原冲突)及全球监管差异(如SDN-1豁免与GMO分类)仍然构成重大障碍 | 探讨核酸技术如何重塑水稻重金属耐受性的研究与应用管线,以保障全球粮食安全 | 水稻(Oryza sativa)及其重金属(镉和砷)耐受机制 | 基因组学与生物技术 | NA | QTL定位, GWAS, 泛基因组学, CRISPR基因编辑, 转录组学, 表观基因组学, 宏基因组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 分子标记辅助选择 | 水稻(Oryza sativa) | NA | 农业, 食品安全 |
| 202 | 2026-05-28 |
Synthetic biology-driven bioinspired delivery systems for RNA therapeutics in neural repair
2026-May-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-01801
PMID:42199149
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综述 | 综述基于合成生物学的仿生递送系统在RNA神经修复治疗中的应用 | 提出了将RNA递送转化为可编程生物机器的系统工程框架,融入设计-构建-测试-学习循环和人工智能辅助工具 | 未详细说明具体实验验证结果和定量比较分析 | 探讨合成生物学在神经修复中RNA治疗递送系统的前沿应用与挑战 | 基于合成生物学的仿生递送系统、RNA疗法、神经修复 | 机器学习 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 生物电路、递送系统、可编程生物机器 | 医学 |
| 203 | 2026-05-28 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-May-12, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了基于簇定位调节因子的八种链霉菌自诱导物生物传感器及其合成路径 | 首次系统开发了八种基于CSR的AR生物传感器,并研究了非同源CSR与AR间的串扰以及CSR调节替代启动子的能力,创建了12种正交信号系统 | 仅涉及链霉菌属,未涵盖其他土壤细菌;生物传感器性能评估主要限于实验室培养条件 | 开发用于天然产物调控中群体感应小分子检测的基于自诱导物的生物传感器平台 | 链霉菌中的簇定位调节因子及相关自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 小分子配体、基因表达数据 | 8种生物传感器及其对应的自诱导物配体 | NA | 链霉菌,大肠杆菌 | 自诱导物生物传感器、基于群体感应的遗传回路 | 工业生物技术,医学 |
| 204 | 2026-05-28 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
|
综述 | 提出受发育启发的合成肾脏工程策略,利用胚胎肾脏发育原理进行多尺度结构体外构建 | 首次提出'发育工程'策略,将体内发育的空间和时间线索用于引导体外多尺度结构形成,并结合合成生物学、空间图案化和组织微环境控制等新兴工具 | 临床转化受限于结果变异性、细胞类型缺失、功能成熟度不足和可扩展性差,且该蓝图需进一步验证 | 开发可规模化生产且适用于肾脏替代治疗的工程组织策略 | 基于干细胞的肾组织及胚胎肾脏发育原理 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 干细胞来源的肾组织 | 发育工程引导的组织基序(motif)构建与串联 | 医学 |
| 205 | 2026-05-28 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
|
综述 | 系统综述了生物分子凝聚体液-固转变的分子机制、工程调控策略及其在合成生物学中的应用 | 首次将液-固转变作为设计原则整合到系统化学和合成生物学中 | 当前对液-固转变的时空控制仍面临挑战,需进一步探索其在实际生物系统中的可靠性 | 阐明液-固转变的分子语法及工程策略,推动其在合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体的液-固转变过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 液-固转变调控回路 | 医学,系统化学,合成生物学 |
| 206 | 2026-05-28 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
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综述 | 本文综述了噬菌体在抗生素耐药时代作为抗菌替代疗法的生物学基础、治疗应用及挑战 | 整合了噬菌体生物学、基因工程进展(如CRISPR-Cas系统、重组工程和合成基因组重启)及多领域应用(临床治疗、食品安全、环境消毒和生物膜控制),并系统讨论了监管框架和宿主抗性动态等关键问题 | 未提供具体实验数据或案例研究的量化结果,主要基于现有文献的理论总结 | 评估噬菌体疗法作为抗生素替代方案的潜力和可持续性,应对全球抗菌耐药性危机 | 噬菌体及其在细菌感染治疗、生物控制中的应用 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体重组工程、合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | NA | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 207 | 2026-05-28 |
Assetizing Diversity: Microbial Culture Collections in an Age of Biotechnology, Biodiversity, and Speculative Value Generation (1972-2022)
2026-Mar, Journal of the history of biology
IF:0.7Q2
DOI:10.1007/s10739-026-09853-y
PMID:42118395
|
综述 | 追溯1972至2022年微生物资源保藏中心的历史,探讨微生物多样性保护与生物技术价值化的演变 | 将微生物价值资产化进程与全球微生物公地圈占联系起来,分析保藏中心在生物技术产业全球化中的双重角色 | 未解决全球异地保护基础设施分布不均及微生物价值生成的不对称问题,遗漏2010年名古屋议定书后的实质性进展 | 揭示微生物资源从公共物品向资产化转变的过程及其对保护、商业和全球治理的影响 | 欧洲、美洲、亚洲的微生物培养物保藏中心及世界培养物保藏联合会 | 数字病理学 | NA | 测序技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术、农业、环境 |
| 208 | 2026-05-28 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
|
综述 | 综述了用于开发重组活体生物治疗药物的最新技术进展 | 综合运用合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计重组活体生物治疗药物,以提升疗效、监管接受度和临床转化 | 在规模化生产、安全性和临床应用方面仍存在重大挑战 | 探讨重组活体生物治疗药物的开发进展及其在人类健康中的治疗潜力 | 重组活体生物治疗药物 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物物种 | NA | 医学 |
| 209 | 2026-05-28 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
|
综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为新型活体生物治疗剂来源的潜力 | 提出将生殖道微生物组作为活体生物治疗候选菌的新来源,并强调了合成生物学和基因工程在开发下一代活体生物治疗剂中的应用 | 未明确说明具体局限性,但作为章节综述可能缺乏实验验证和临床数据支持 | 探索人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂来源的潜力,并总结相关研究进展 | 人类生殖道微生物组,特别是女性阴道微生物群落 | 微生物医学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、妊娠并发症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类(女性生殖道) | NA | 医学 |
| 210 | 2026-05-28 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
|
研究论文 | 本文展示了一个双蛋白系统McdAB可被重新编程以实现对细菌多种细胞器的空间控制 | 首次证明McdAB系统可以重新编程以控制所有已知类型的细菌细胞器(包括类囊体、包囊体、生物分子凝聚体和膜结合细胞器)的空间组织,为合成生物学建立了新的设计原理 | 未明确说明局限性 | 研究细菌细胞器的空间组织是否可以被工程化控制 | McdAB双蛋白系统和细菌细胞器(羧酶体、包囊体、生物分子凝聚体、膜结合细胞器) | 合成生物学 | NA | 异源表达、蛋白重新编程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | McdAB系统用于细胞器空间定位调控 | 工业生物技术 |
| 211 | 2026-05-28 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
|
研究论文 | 提出了一种基于自发光真菌生物发光循环的定量报告系统,用于植物合成生物学中的基因表达测量 | 首次利用Neonothopanus nambi真菌全生物发光循环构建自维持报告系统,无需外源供应荧光素酶底物,并通过设置HispS基因作为转录入口点显著提高动态范围 | 未明确说明,但可能包括植物中自发光系统的长期稳定性和组织特异性表达等潜在问题 | 开发低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统,以优化合成基因回路 | 本氏烟草(N. benthamiana)和拟南芥(推测) | 植物合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 发光和荧光数据 | 涉及多种合成基因回路,包括植物激素传感器和光遗传传感器等,具体样本数量未明确 | NA | 本氏烟草(N. benthamiana) | 自发光报告回路(NeoLuc/eGFP系统),包括激素传感器、光遗传传感器和化学/光双开关 | 农业、工业生物技术 |
| 212 | 2026-05-28 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
|
研究论文 | 结合大规模测量和机器学习,提出了两种精确设计遗传传感器的方法:计算机模拟选择和机器学习前向工程 | 首次将计算机模拟选择与机器学习相结合,实现遗传传感器剂量响应的定量精确工程,包括多目标优化和反向剂量响应工程 | NA | 开发定量精确工程生物功能的方法,特别是遗传传感器的编程响应 | 遗传传感器及其DNA序列 | 机器学习 | NA | 大规模基因型-表型数据集分析 | 机器学习模型 | 序列数据 | 大规模基因型-表型数据集 | NA | NA | 遗传传感器(剂量响应电路) | 工业生物技术 |
| 213 | 2026-05-27 |
Engineering quorum sensing: new directions for antimicrobial therapy
2026-May-26, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2026.05.006
PMID:42185145
|
综述 | 探讨群体感应工程在抗菌治疗中的应用,包括干扰QS信号和工程化微生物 | 将合成生物学工具与QS机制结合,推动从基础微生物学向转化生物技术的转变 | NA | 探索QS和QS干扰在工程化群体感应回路中的应用,并将其转化为治疗微生物等应用 | 病原微生物中的群体感应机制 | NA | 感染性疾病 | 群体感应干扰, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 群体感应回路(如干扰QS信号、检测和消除病原体) | 医学 |
| 214 | 2026-05-27 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
|
综述 | 该综述总结了CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的新兴应用及最新研究进展 | 提出CRISPR增强CAR和基于合成生物学的异体系统,以提升CAR-T疗法的效力和可及性,并聚焦于近两年内的创新 | NA | 总结2015年以来的人体试验和成果,探讨克服耐药性、提高安全性和可及性的策略,推动肿瘤学领域向持久治愈发展 | 血液恶性肿瘤(包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急性髓系白血病和T细胞白血病) | NA | 血液恶性肿瘤 | CAR-T | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、CRISPR增强CAR、基于合成生物学的异体系统 | 医学 |
| 215 | 2026-05-27 |
Machine learning-assisted single-cell Raman imaging for rapid, sensitive detection and intracellular mapping of carotenoids in plant cell cultures
2026-May-23, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03858-x
PMID:42176120
|
研究论文 | 将拉曼成像与多层感知机神经网络结合,实现基于类胡萝卜素含量的烟草BY-2细胞非破坏性、无标记分类 | 首次将拉曼成像与多层感知机神经网络结合,实现单细胞水平类胡萝卜素的无标记快速检测及细胞内分布成像,提供高分类精度和分选潜力 | 未提及在实际复杂生物样品中的泛化能力及大规模应用验证 | 开发一种非破坏性、无标记的单细胞分析平台,用于植物细胞培养中类胡萝卜素的快速检测和细胞内定位 | 烟草BY-2细胞(野生型和转基因品系)以及类胡萝卜素标准品(虾青素、角黄素、β-胡萝卜素) | 机器学习和数字病理学 | NA | 拉曼成像、表面增强拉曼散射、高效液相色谱、多层感知机神经网络 | 多层感知机神经网络 | 拉曼光谱图像 | 烟草BY-2细胞(包含野生型和多个转基因品系)及类胡萝卜素标准品 | NA | 烟草(BY-2细胞) | NA | 农业和工业生物技术 |
| 216 | 2026-05-27 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-May-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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研究论文 | 提出一种线性混合效应模型来评估合成基因电路的性能,并验证了其在布尔逻辑门上的应用 | 首次提出使用线性混合效应模型来标准化评估合成基因电路的布尔逻辑门性能,并通过模拟和实验验证了该方法的有效性 | 未提及具体局限性 | 标准化评估合成基因电路的统计方法,提出线性混合效应模型用于量化布尔逻辑门性能 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 机器学习 | NA | NA | 线性混合效应模型,k-means聚类 | 模拟数据和实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门,模拟数据,嵌套抑制器OR门系列 | NA | NA | 布尔逻辑门,如OR门,3输入门 | 合成生物学 |
| 217 | 2026-05-27 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Mar-27, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
|
综述 | 综述植物对中度和急性热胁迫响应分子机制的最新进展,重点关注表观遗传调控与信号网络的整合 | 整合了光信号、昼夜节律和激素信号通路交叉调控的转录因子PIF4与HSFA1s,以及组蛋白变体H2A.Z动力学和siRNA依赖的跨代表观遗传热记忆机制 | 温度感知、HSFA1s激活动态及胁迫信号整合等根本问题尚未解决 | 揭示植物热适应机制,为气候智能型作物提供理论基础和分子育种策略 | 植物热响应信号转导与表观遗传调控 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 218 | 2026-05-27 |
Energy-driven innovations in computational de novo protein engineering
2026-03, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.01.005
PMID:41570866
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综述 | 系统分析能量驱动计算方法在从头蛋白质工程中的应用,整合经典力场、量子力学和人工智能以加速蛋白质设计 | 提出基于准确度-成本-通量权衡的方法选择决策框架,并阐明物理模型与数据驱动策略的协同作用机制 | 未涉及最新高精度实验验证方法的集成效果量化分析 | 综述能量模型在计算性从头蛋白质工程中的关键作用,提供方法选择指导 | 蛋白质 | 计算生物学 | NA | 分子动力学(MD)、热力学积分、蒙特卡洛采样、机器学习(ML)、深度学习(DL) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学, 合成生物学 |
| 219 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part Two
2026-Feb-25, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00524-5
PMID:42183020
|
评论文章 | 提出一个基于心智概念的框架来概念化生物学及其他领域的目标导向性 | 从新兴领域“多元智能”出发,强调经验可检验性、新能力发现的丰产性、术语的操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性,为生物学的目的论提供新的心智化方法 | 文章未明确讨论其框架在具体实验中可能遇到的实践挑战或局限性 | 发展一种受心智概念启发的生物学目的论方法,以更好地理解系统如何工作并指导实验和应用 | 生物系统(包括进化、工程或混合系统)的目标导向性、智能、认知和意向性 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物工程 |
| 220 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part One
2026-Feb-01, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00523-6
PMID:42183019
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研究论文 | 提出一个框架来概念化生物及其他领域中的目标导向性,强调经验可检验性、新能力的发现、术语操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性 | 从多元智能领域出发,反对生物学中对目标导向性的最小化倾向,倡导用心理概念如智能、认知和意向性来理解生物学中的目的论,并强调经验可检验性和研究工具的操作化 | 可能面临传统还原论者的反对,且框架的经验验证和实际应用仍需进一步证据 | 建立一种基于心理概念的目标导向性框架,以更好地理解生命系统中的智能和目标导向行为,推动哲学思考及生物医学和生物工程应用 | 生物系统中的目标导向性,包括形态发生、合成生物学和生物电网络等领域中细胞行为的协调 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物工程 |