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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-04-03 |
Expanding the genetic code: phage-driven evolution of pyrrolysyl-synthetase for site-specific incorporation of synthetic phenylalanine and tyrosine derivatives
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1737987
PMID:41924351
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研究论文 | 本研究利用噬菌体辅助非连续进化技术,优化了来自Methanosarcina mazei的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶,以增强其对酪氨酸和苯丙氨酸衍生物的识别与掺入能力 | 采用PANCE技术高效进化PylRS,显著提高了对目标非经典氨基酸的掺入效率,并识别出结合口袋中的关键突变簇 | NA | 扩展遗传密码,通过工程化PylRS实现合成苯丙氨酸和酪氨酸衍生物的位点特异性掺入 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体辅助非连续进化,荧光掺入测定,质谱分析 | NA | 序列数据,荧光数据,质谱数据 | NA | PANCE | NA | NA | 合成生物学 |
| 202 | 2026-04-03 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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综述 | 本文介绍了利用高通量突变筛选方法来理解、抑制和改造膜转运蛋白的原理、方法及其应用潜力 | 系统阐述了高通量筛选方法在解析多特异性膜转运蛋白分子机制中的独特优势,并提出了其在药物研发和合成生物学中的创新应用方向 | NA | 探讨高通量遗传筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 203 | 2026-04-03 |
Emulating nonribosomal peptides with ribosomal biosynthetic strategies
2023-Jan-04, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d2cb00169a
PMID:36685251
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综述 | 本文综述了通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽的研究进展,比较了两者的结构特征,并强调了合成生物学在核糖体途径工程中的应用 | 揭示了非核糖体肽中曾被认为独特的结构特征也存在于核糖体合成肽中,并利用核糖体途径的简化性和修饰酶的多功能性进行工程化设计 | NA | 探讨如何通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽,以生产具有增强生物活性的类似物 | 非核糖体肽和核糖体合成并翻译后修饰的肽 | 合成生物学 | NA | 核糖体生物合成、翻译后修饰 | NA | NA | NA | 核糖体途径工程 | NA | NA | 医药 |
| 204 | 2026-04-03 |
Multifunctional SEVA shuttle vectors for actinomycetes and Gram-negative bacteria
2020-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1024
PMID:32170856
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研究论文 | 本研究开发了23种遵循SEVA标准架构的多功能穿梭载体,用于放线菌和革兰氏阴性菌的基因工程 | 开发了结合革兰氏阴性菌和放线菌(特别是链霉菌)复制起点的多功能SEVA穿梭载体,并引入了新的安普霉素抗性选择标记 | 未明确说明载体在所有放线菌物种中的通用性测试范围,也未讨论长期遗传稳定性 | 扩大链霉菌及其他放线菌的遗传工具库,促进其作为合成生物学通用底盘的应用 | 链霉菌属(特别是Streptomyces albus J1074)及其他放线菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | SEVA (Standard European Vector Architecture), Gibson Assembly | Streptomyces albus J1074, Escherichia coli, 放线菌, 革兰氏阴性菌 | 穿梭载体(含整合型、低拷贝数、中高拷贝数复制起点),异源表达系统(用于GFP和芹菜素生产) | 工业生物技术 |
| 205 | 2026-04-02 |
Advances in Ene-Reductase Engineering: Dynamic Structure, Catalytic System Innovation, and Green Application Prospects
2026-Apr-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14585
PMID:41873156
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综述 | 本文综述了烯还原酶(ERs)的动态结构调控、定向进化、固定化技术及其在药物合成和环境修复中的应用 | 重点阐述了构象变化对催化选择性的影响、光酶协同系统以及AI辅助设计,并展望了低成本固定化、连续流工艺和多场耦合催化系统等新兴方向 | NA | 总结烯还原酶的研究进展,并为未来研究提供理论参考 | 烯还原酶(ERs) | 合成生物学 | NA | 定向进化、固定化技术、AI辅助设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物合成, 环境修复 |
| 206 | 2026-04-02 |
Oncolytic Virotherapy for Solid Tumors: Clinical Advances and Future Directions
2026-04, Surgical oncology clinics of North America
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.soc.2025.10.011
PMID:41903995
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综述 | 本文综述了溶瘤病毒疗法治疗实体瘤的生物学基础、临床应用、组合疗法、新一代病毒平台的发展以及临床转化面临的主要障碍和应对策略 | 系统性地概述了溶瘤病毒疗法的最新临床进展、新兴组合策略以及基于合成生物学和免疫肿瘤学发展的下一代病毒平台,并指出了克服临床转化障碍的新兴策略 | NA | 总结溶瘤病毒疗法在实体瘤治疗中的现状、挑战与未来发展方向 | 溶瘤病毒及其在实体瘤治疗中的应用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 207 | 2026-04-02 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Mar-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 本文报道了从Faustovirus中发现的FvPolX DNA聚合酶,并通过蛋白质工程改造,显著提升了其催化活性,用于从头DNA合成 | 首次发现并工程化微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,使其在催化活性和结构最小化方面超越传统动物来源的聚合酶 | 研究主要集中于酶学特性,未涉及大规模工业应用或体内验证 | 开发高效酶工具用于合成生物学中的从头DNA合成 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶催化 | NA | 酶活性数据 | NA | 蛋白质工程 | Faustovirus(病毒) | NA | 工业生物技术 |
| 208 | 2026-04-02 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
|
研究论文 | 本文通过实验和分子动力学模拟,探讨了核酸在生物分子凝聚体相分离和有序化中的作用,并提出了一个评估凝聚体稳定性的指标 | 首次系统研究了核酸长度和杂交程度对相分离行为的影响,并揭示了液滴中液晶有序性的形成条件及其对动力学的不同影响 | 研究基于模型系统,可能无法完全反映自然生物系统中的复杂性 | 填补核酸在液-液相分离(LLPS)中作用的研究空白,为合成生物学和生物医学应用提供设计指导 | 由寡核苷酸和适度带电无序肽组成的模型系统 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据和模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 合成生物学 |
| 209 | 2026-04-02 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台,用于活细胞中RNA的可视化 | 通过将荧光激活直接与靶RNA识别相连接,并利用degron介导的降解来抑制背景信号,实现了比传统方法更低的背景和更高的特异性 | NA | 开发一种用于活细胞中RNA精确可视化的新型成像平台 | RNA分子,包括NEAT1_2 lncRNA和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13-tDeg技术 | NA | 图像数据 | NA | CRISPR-Cas13 | 哺乳动物细胞 | 通过工程化crRNA支架嵌入Pepper RNA基序,实现靶向诱导的荧光激活系统 | 医学, 合成生物学 |
| 210 | 2026-04-02 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 本研究利用CsrA蛋白与uxuB mRNA转录本之间的新型转录后相互作用,设计了一种生物转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白在uxuB mRNA上的异质性调控特性,通过5' UTR + 100 nt CDS序列作为支架,实现基于蛋白质浓度的ON/OFF状态转换,减少了合成电路组件数量 | NA | 开发基于转录后调控的合成生物电路,以减少细胞负担并简化调控组件 | uxuB mRNA转录本(特别是5' UTR + 100 nt CDS序列)与CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控系统设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于CsrA与uxuB mRNA相互作用的转录后带通滤波器,采用分级结合策略实现剂量依赖性调控 | 合成生物学 |
| 211 | 2026-04-02 |
Engineering Toehold-Mediated Switches for Native RNA Detection and Regulation in Bacteria
2022-09-30, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167689
PMID:35717997
|
综述 | 本文综述了基于RNA toehold介导的开关在细菌中用于天然RNA检测和调控的工程应用 | 重点讨论了将RNA toehold开关应用于体内天然RNA检测的挑战,包括跨生物体的可转移性,并展望了结构预测算法在提升RNA开关体内功能方面的潜力 | NA | 探讨RNA toehold介导的开关在合成生物学中用于传感和调控的应用,特别是在细菌环境中 | RNA toehold介导的开关及其在天然RNA检测和调控中的设计 | 合成生物学 | NA | RNA toehold介导的开关设计 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | RNA toehold介导的开关,通过链置换控制开关状态转换,用于传感和调控 | 工业生物技术 |
| 212 | 2026-04-02 |
RNP-Based Control Systems for Genetic Circuits in Synthetic Biology Beyond CRISPR
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2421-0_1
PMID:35666436
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综述 | 本文综述了基于核糖核蛋白(RNP)的遗传电路控制系统在合成生物学中的应用,并提供了系统选择标准 | 系统性地回顾了CRISPR之外的工程化RNP控制系统,并提出了针对不同生物过程的优化选择框架 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且未来应用部分基于推测 | 评估和总结工程化RNP控制系统在合成生物学中的发展现状与应用潜力 | 核糖核蛋白(RNP)复合物及其工程化控制系统 | 合成生物学 | NA | 工程化RNP系统设计 | NA | NA | NA | CRISPR, 其他RNP工程工具 | 原核生物, 真核生物 | 遗传电路控制, 生物传感器, 逻辑门 | 工业生物技术, 医学, 环境, 农业 |
| 213 | 2026-04-01 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Mar-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 本文开发了一种在E. coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统,用于缺氧环境生物传感和合成生物学应用 | 开发了紧密调控、可滴定的Cre重组酶系统,实现低重组率和最小基础活性,并在质粒和染色体上实施,后者显示出跨代遗传记忆的优越保留 | NA | 开发一种用于环境生物传感和合成生物学的可调控基因组重组工具 | Escherichia coli(大肠杆菌) | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 基于Cre重组酶的遗传记忆系统,用于生物传感 | 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 214 | 2026-04-01 |
A general strategy to enhance aptamer affinity by suppressing dissociation through symmetric assembly
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag268
PMID:41873762
|
研究论文 | 本文提出了一种通过对称组装抑制解离来增强适体亲和力的通用策略 | 采用对称引导的组装方法,通过快速再结合实现动力学协同性,显著降低解离速率常数 | NA | 增强适体亲和力以克服快速靶标解离的限制 | 针对SARS-CoV-2刺突蛋白、VEGF165和心脏肌钙蛋白I的适体 | 合成生物学 | NA | 对称组装方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 三价柔性组装体 | 诊断、治疗、合成生物学 |
| 215 | 2026-04-01 |
Aptamer- and Ribozyme-Engineered sgRNAs for Conditional Control of CRISPR/Cas9 Function
2026-Mar-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47300
PMID:41914300
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综述 | 本文综述了通过将功能性核酸元件(如适配体、核酶和适配酶)整合到sgRNA特定结构区域中,开发条件响应性CRISPR/Cas9系统的设计策略与应用 | 通过工程化sgRNA实现CRISPR/Cas9系统的条件响应性控制,使其能响应小分子、蛋白质和内源性代谢物等多种分子信号 | 当前系统在特异性、效率和适用性方面仍面临挑战,需要进一步改进 | 开发条件响应性CRISPR/Cas9系统,用于合成生物学、疾病建模和治疗开发 | 工程化的单导RNA(sgRNA)和CRISPR/Cas9系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统,功能性核酸元件整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核细胞,真核细胞 | 条件响应性基因编辑、激活、抑制和成像系统 | 医学 |
| 216 | 2026-04-01 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种基于Cre-lox系统的可调控低速率基因组重组工具,用于环境生物传感和合成生物学应用 | 开发了紧密调控、可滴定Cre重组酶系统,实现低重组率和最小基础活性,并应用于染色体以增强遗传记忆跨代保留 | NA | 开发一种可调控低速率基因组重组工具,用于环境生物传感和合成生物学 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组系统 | NA | NA | NA | Cre-lox | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的遗传记忆系统,用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 217 | 2026-03-31 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-Mar-30, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
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综述 | 本文综述了CRISPR功能基因组学与合成生物学在抗病毒策略设计中的结合应用 | 将CRISPR筛选从静态命中列表转向基于单细胞读数、成像、空间表型分析和类器官模型的上下文映射,并转化为可编程干预策略 | 讨论了从筛选机制转化为有效且安全抗病毒策略的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计,总结跨病毒家族的通用原则 | 病毒-宿主相互作用、宿主依赖性和限制性因子 | 合成生物学 | 病毒感染 | CRISPR扰动筛选、单细胞读数、成像、空间表型分析、类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因回路,将感染感知与定制响应耦合 | 医学 |
| 218 | 2026-03-31 |
Plant oil body engineering: A roadmap from multiscale structures to next-generation food systems
2026-Mar-25, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149010
PMID:41905230
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综述 | 本文构建了一个全面的植物油体多尺度工程框架,旨在通过跨学科策略将其转化为可编程功能单元,以推动下一代智能食品系统的发展 | 提出了一个整合物理场、界面工程和合成生物学的多尺度工程框架,建立了清晰的“分子结构-界面性质-宏观功能”关系,用于理性设计植物油体 | 成功转化依赖于克服规模化挑战以及解决技术经济和监管障碍 | 通过系统工程方法将植物油体转化为可编程功能单元,以应用于下一代智能食品系统 | 植物油体 | NA | NA | 物理场、界面工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 219 | 2026-03-31 |
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsphyschemau.5c00109
PMID:41909145
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研究论文 | 本研究利用光镊单分子力谱技术,测量了茶碱适配体RNA开关在有无配体存在时的折叠动力学,揭示了其通过能量稳定而非结构重塑实现基因调控的机制 | 首次通过单分子力测量揭示了茶碱适配体RNA开关的能量稳定机制(约2.1 kcal/mol),并支持构象选择模型,否定了配体结合引发大结构重排的假设 | 研究仅聚焦于茶碱适配体这一特定RNA开关,未验证其他RNA适配体是否遵循相同机制;单分子实验条件可能与体内生理环境存在差异 | 探究茶碱适配体RNA开关在合成基因网络中实现配体响应调控的热力学与动力学基础 | 茶碱适配体RNA分子及其与茶碱小分子配体的相互作用 | 合成生物学 | NA | 光镊单分子力谱 | NA | 单分子力学数据 | NA | NA | NA | 配体响应型RNA开关(用于合成基因网络调控) | 合成生物学、基因治疗 |
| 220 | 2026-03-31 |
On-Demand Droplet Routing and Splitting Using Independently Addressable Interdigitated Electrodes
2026-Mar-20, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17030375
PMID:41900261
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研究论文 | 本文介绍了一种低电压微流控平台,通过集成倾斜叉指电极和非对称Y型结,实现电可调液滴分裂与分选 | 采用独立寻址的倾斜叉指电极阵列,在中等电压下产生局部电场梯度,实现动态液滴路由和确定性分裂,结构简单且控制灵活 | NA | 开发一种低电压微流控平台,用于精确控制液滴的分裂和分选操作 | 皮升至纳升级液滴的操纵 | 微流控技术 | NA | 介电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、单细胞分析、分子诊断、合成生物学 |