合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4236 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-12-26 |
Reprogramming the SARS-CoV-1 Neutralizing Antibody S230 to SARS-CoV-2 via Directed Evolution and Molecular Docking-Based Binding Mode Analysis
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00425
PMID:41236374
|
研究论文 | 本研究通过定向进化和分子对接分析，成功将SARS-CoV-1中和抗体S230重编程为可中和SARS-CoV-2的抗体 | 结合定向进化与分子对接分析，通过有限协同突变实现跨物种抗原特异性重编程，并建立了基于合成生物学原理的可进化抗体重编程平台 | 未在动物模型中进行体内验证，且仅针对RBD结构域进行改造 | 开发针对新兴病原体的抗体快速适配技术 | SARS-CoV-1中和抗体S230及其重编程变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 定向进化、分子对接模拟、细菌展示筛选 | 分子对接模型 | 蛋白质序列与结构数据 | NA | 定向进化 | 细菌（用于展示筛选） | 抗体亲和力成熟与特异性重编程 | 医学 |
| 202 | 2025-12-26 |
Genetically Reprogramming Crops and Rhizobacteria for Nutritional Iron Biofortification
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00614
PMID:41252749
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学方法对作物和根际细菌进行基因重编程，以增强铁营养生物强化的策略 | 提出利用植物和细菌合成生物学精确调控铁稳态和获取机制，作为模块化组件在遗传电路设计中应用，并强调跨宿主途径转移的潜力 | NA | 通过基因工程和微生物组方法改善作物铁获取，以对抗铁缺乏和贫血，提升全球营养安全 | 作物和根际细菌 | 合成生物学 | 贫血 | 基因重编程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物, 根际细菌 | 铁稳态和获取机制，包括螯合和还原介导的土壤铁溶解途径 | 农业, 医学 |
| 203 | 2025-12-26 |
A Reporter System for Assessment of Transcription from Divergently Oriented Promoters in Pseudomonas putida
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00723
PMID:41367291
|
研究论文 | 本文开发了一种针对恶臭假单胞菌的质粒基双报告系统，用于同时监测含有反向启动子的启动子区域的基因表达 | 开发了优化的双报告系统，结合荧光蛋白选择、质粒骨架工程和毒素-抗毒素模块，支持无抗生素选择和动态转录评估 | 在测试条件下，基于excludon的转录抑制效率有限 | 研究恶臭假单胞菌的基因调控，开发基因表达监测工具 | 恶臭假单胞菌的启动子区域和基因表达 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、荧光报告系统、共聚焦显微镜 | NA | 荧光图像、基因表达数据 | NA | 质粒构建、毒素-抗毒素模块 | 恶臭假单胞菌 | 双报告系统，用于监测反向启动子的转录活动 | 工业生物技术 |
| 204 | 2025-12-26 |
Site-Specific OaAEP1 Mediated Functional Proteins Immobilization on Magnetic Nanoparticles and the Recyclings
2025-Dec-17, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502540
PMID:41273006
|
研究论文 | 本文开发了一种基于肽连接酶OaAEP1的位点特异性蛋白质固定化策略，用于在磁性纳米颗粒上实现功能蛋白质的定向高效固定 | 利用OaAEP1酶催化N端GL和C端NGL基序的连接，实现了蛋白质在纳米颗粒表面的可控定向固定，避免了传统方法的非特异性结合和活性损失 | NA | 开发一种精确稳定的蛋白质固定化方法，以推进生物催化、生物传感和合成生物学领域的应用 | 功能蛋白质和酶（如荧光蛋白、TEV蛋白酶、Taq聚合酶）在FeO和FeO@SiO磁性纳米颗粒上的固定化 | 合成生物学 | NA | 肽连接酶催化技术 | NA | NA | NA | OaAEP1 | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 205 | 2025-12-26 |
Research progress on the evaluation, screening, and mechanisms of salinity tolerance in Azolla
2025-Dec, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202512.035
PMID:41445342
|
综述 | 本文综述了红萍耐盐性评价、耐盐种质筛选及其生理与分子机制的研究进展 | 系统总结了红萍-固氮蓝藻共生体系在盐碱地可持续修复中的潜力，并提出了整合基因编辑、合成生物学及共生互作等技术的未来研究方向 | 当前研究存在缺乏统一的评价标准、对耐盐遗传基础理解不完整、对复合胁迫及其机制探索有限等问题 | 筛选和培育耐盐植物，以实现盐碱地的可持续利用 | 红萍及其与固氮蓝藻形成的专性共生体系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因编辑, 合成生物学 | 红萍, 固氮蓝藻 | NA | 农业, 环境 |
| 206 | 2025-12-25 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2025-Dec-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
|
研究论文 | 本文通过高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组，开发了一种基于噬菌体的生物传感器，用于饮用水中大肠杆菌的浓缩和检测 | 利用HC-GGA技术直接合成噬菌体基因组，实现生物正交反应，结合磁珠和荧光素酶表达，提高检测灵敏度和效率 | 未提及具体实验规模或潜在交叉反应性等限制 | 开发快速、低成本检测饮用水中病原体和指示生物的方法 | 大肠杆菌作为粪便污染指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装（HC-GGA） | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 噬菌体生物传感器，包含生物正交反应模块和荧光素酶表达通路 | 环境监测, 公共卫生 |
| 207 | 2025-12-25 |
Systemic engineering and global regulation enabling high-level bilirubin biosynthesis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67804-3
PMID:41436472
|
研究论文 | 本研究通过系统性工程和全局调控，开发了一种高效体外合成胆红素的途径 | 揭示了Fe²⁺诱导中间体氧化降解的隐藏挑战，并通过竞争性铁螯合、质子状态调控及引入一氧化碳脱氢酶解决了关键瓶颈 | 研究基于体外系统，在体内应用效果需进一步验证 | 提高胆红素生物合成的产量和效率 | 血红素到胆红素的转化途径及相关酶系统 | 合成生物学 | NA | 酶筛选、机理分析、DFT计算 | NA | 实验数据、计算化学数据 | NA | Gibson Assembly | 体外无细胞系统 | 血红素转化途径、NADPH循环系统 | 医药、工业生物技术 |
| 208 | 2025-12-25 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2025-Dec-23, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA-Diffusion的生成式人工智能框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用基于DNA可及性数据的机器学习生成紧凑调控元件，在平衡功能活性与细胞类型特异性方面优于现有计算方法 | NA | 系统设计调控元件以实现精确的基因表达控制 | 合成调控元件及其在基因调控中的应用 | 机器学习 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式AI框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件库在三种细胞系中验证 | NA | 多种细胞系 | 紧凑调控元件设计 | 医学 |
| 209 | 2025-12-25 |
Antisense transcription can induce expression memory via stable promoter repression
2025-Dec-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03875-1
PMID:41422243
|
研究论文 | 本研究探讨了反义转录如何通过稳定启动子抑制诱导基因表达记忆，结合数学模型、基因组学和合成生物学方法 | 建立了定量框架预测反义介导的顺式记忆在生理相关条件下产生，并揭示干细胞在分化过程中调整记忆能力 | 未具体说明实验模型的局限性或样本量不足等问题 | 理解反义转录生成表达记忆的条件和机制 | 反义基因对、小鼠胚胎干细胞（mESCs） | 合成生物学 | NA | 数学模型、基因组学分析、合成生物学方法 | NA | 基因组数据、实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs） | 反义基因对形成的切换开关，涉及启动子抑制和染色质状态 | 医学 |
| 210 | 2025-12-25 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Dec, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
|
综述 | 本文探讨了构建模拟生物细胞基本功能的合成细胞时，脂质多样性与简约性在定义膜需求方面的作用 | 对比了自下而上和自上而下两种构建合成细胞的方法，并强调了膜蛋白与其周围脂质环境之间关键相互作用的重要性 | NA | 定义自繁殖合成细胞所需的最小脂质组要求 | 合成细胞的脂质膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 环境科学 |
| 211 | 2025-12-25 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Nov-17, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
|
综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战与未来方向 | 系统总结了利用合成生物学和基因工程改造细菌，使其靶向肿瘤微环境并作为局部递送治疗药物的创新平台，以及与传统疗法结合的协同策略 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用潜力与发展方向 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计与应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 细菌 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 医学 |
| 212 | 2025-12-25 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PIONEER的模块化平台，用于在酵母周质空间展示肽、蛋白质和纳米抗体，以直接研究膜蛋白功能 | 通过优化分泌信号和展示支架，实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导，能够通过信号传导而非单纯结合来评估配体活性，这是功能优先筛选的关键进展 | 尽管已在GPCRs上得到验证，但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白的适用性仍需进一步测试 | 开发一种用于合成生物学筛选的周质展示平台，以研究基因编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体以及人类G蛋白偶联受体（GPCRs） | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、自分泌信号传导 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 膜蛋白功能筛选平台 | 医学、工业生物技术 |
| 213 | 2025-12-25 |
An alternative view on the ethics of synthetic biology: an Indian Hindu perspective
2025, Global bioethics = Problemi di bioetica
DOI:10.1080/11287462.2025.2518798
PMID:41425232
|
评论 | 本文从印度教哲学的非二元世界观出发，重新审视合成生物学的伦理问题，提出一种强调互联性、责任感和对所有生命形式尊重的伦理框架 | 首次将印度教哲学的非二元世界观应用于合成生物学的伦理讨论，突破了传统二元对立（如自然/人工、人类/机器）的伦理框架限制 | NA | 为合成生物学的伦理讨论提供一种非二元、更全面包容的哲学视角 | 合成生物学的伦理框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 环境 |
| 214 | 2025-12-24 |
Structure prediction and engineering of de novo proteins
2026-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics
DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100
PMID:40962101
|
综述 | 本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义及研究方法，涵盖自然进化与合成设计两类 | 强调自然进化过程与理性蛋白质工程之间的日益融合，突显其在生物学发现和人类创新中的重要性 | NA | 概述从头蛋白质的研究领域，包括其结构预测与工程应用 | 从头蛋白质，包括自然进化与合成设计两类 | 合成生物学 | NA | 计算与实验方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2025-12-24 |
A high-throughput heterologous expression platform for plant synthetic biology based on Arabidopsis suspension cells
2025-Dec-23, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf545
PMID:41432110
|
研究论文 | 本文开发了一种基于拟南芥悬浮细胞的高通量异源表达平台，用于植物合成生物学 | 建立了一种无需特殊设备或耗材的高通量瞬时和稳定转化系统，可快速生成大量转基因细胞并表达多个堆叠基因 | NA | 开发高效异源表达平台以促进植物合成生物学，特别是复杂多基因途径的工程化 | 拟南芥悬浮细胞 | 合成生物学 | NA | 植物细胞包渗入法 | NA | NA | NA | NA | 拟南芥悬浮细胞 | 氮酶铁钼辅因子成熟酶NifB模块组件（NifU、NifS、FdxN和NifB）的多基因表达途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 216 | 2025-12-24 |
A Dual CRISPR-Cas/Cre-loxP Genome Engineering Strategy for Stable Uricase Expression in Food-Grade Probiotics
2025-Dec-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00774
PMID:41432353
|
研究论文 | 本文提出了一种结合CRISPR-Cas9敲入和Cre-loxP驱动基因组缩减的双重基因组工程策略，用于在食品级益生菌NZ9000中稳定表达高活性尿酸酶变体 | 创新点在于整合CRISPR-Cas和Cre-loxP系统，实现了基因组精简和异源基因稳定表达，构建了遗传稳定且生物安全的益生菌底盘 | NA | 开发具有定制代谢功能的稳健食品级微生物底盘，以推进合成生物学在健康和营养领域的应用 | 乳酸乳球菌NZ9000菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑，Cre-loxP重组系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cre-loxP | 乳酸乳球菌 | 尿酸酶表达系统 | 医药，食品 |
| 217 | 2025-12-24 |
A Novel Salicylaldehyde Dehydrogenase from Alpine Soil Metagenome Reveals a Unique Catalytic Mechanism
2025-Dec, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05445-4
PMID:41182549
|
研究论文 | 本研究从高山土壤宏基因组中发现并全面表征了一种新型水杨醛脱氢酶（SALD），揭示了其独特的催化机制和生态意义 | 首次实验表征了Alphaproteobacterial来源的SALD，发现其形成独特的进化分支，并提出了涉及ASN-137等残基的非经典催化配置模型 | 高浓度金属和溶剂会抑制酶活性，且对脂肪醛的催化效率较低 | 探索高山土壤宏基因组中新型酶的催化机制及其生态和生物技术应用 | 从高山土壤宏基因组中获得的SALD酶 | NA | NA | 宏基因组学、系统发育分析、动力学分析、差示扫描荧光法、结构比对和分子对接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物修复、合成生物学 |
| 218 | 2025-12-24 |
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189476
PMID:41130540
|
综述 | 本文系统综述了肠道菌群及其代谢微环境在调节结直肠癌免疫检查点抑制剂疗效中的关键研究进展 | 聚焦于肠道菌群及其代谢产物如何影响免疫检查点抑制剂疗效，并探讨了基于微生物组的靶向干预策略，如益生菌/益生元组合、优化的抗生素使用时机、改进的粪菌移植方案以及基于合成生物学的工程菌疗法 | NA | 为开发新型个性化结直肠癌免疫治疗策略提供理论基础，重点是通过调节微生物组来优化免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 结直肠癌患者、肠道菌群及其代谢产物 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 219 | 2025-12-24 |
MULTIMODAL CELL CONTEXT INSTRUCTION TUNING FOR CONDITIONAL DNA REGULATORY SEQUENCE GENERATION WITH LARGE LANGUAGE MODELS
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084625
PMID:41426347
|
研究论文 | 提出了一种名为Leonine的新型框架，通过多模态细胞上下文指令调优，利用大型语言模型生成条件性DNA调控序列 | 将增强子序列设计重新定义为细胞上下文中的多模态问答任务，整合DNA序列、启动子序列、基因表达谱和细胞类型信息 | NA | 设计具有细胞类型特异性的生物合理调控序列，特别是增强子 | DNA调控序列（增强子） | 合成生物学 | NA | 大型语言模型（LLMs） | LLM | DNA序列、启动子序列、基因表达谱、细胞类型信息 | 超过150万个细胞类型特异性启动子-增强子对 | NA | NA | 增强子设计 | 医学 |
| 220 | 2025-12-24 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
|
研究论文 | 本研究揭示了人工酒精依赖性半萜（ADH）途径中PhoN酶和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛底物特异性，并成功在体内合成了非天然烷基化色氨酸衍生物 | 首次将ADH模块与异戊二烯基转移酶的底物宽泛性相结合，实现了非天然烷基化色氨酸衍生物的体内生物合成 | 未明确说明该途径的产率、规模化生产可行性及对其他下游酶普适性的系统验证 | 拓展异戊二烯类天然产物的结构多样性，推动合成生物学在萜类化合物生物合成中的应用 | 人工酒精依赖性半萜（ADH）途径中的PhoN酶、IPK激酶及芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 酶促反应、体内生物合成 | NA | 酶学特性数据、代谢产物分析数据 | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌（E. coli） | 人工酒精依赖性半萜（ADH）代谢途径，包含PhoN磷酸酶、IPK激酶和芳香族异戊二烯基转移酶模块 | 工业生物技术 |