本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2025-10-05 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-Jul, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
|
研究论文 | 开发基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 设计出能够自凝聚形成液滴的极简二肽结构,并发现其在不同pH下可形成具有催化功能的纤维形态 | NA | 开发具有酶催化功能的极简肽类超分子材料 | 由疏水残基和极性组氨酸残基组成的二肽分子 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶学, 合成生物学 |
| 2202 | 2025-10-05 |
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61160-y
PMID:40593699
|
研究论文 | 开发了BioPKS自动化逆向生物合成流程,结合I型聚酮合酶和单功能酶进行化学物质生物合成设计 | 首次将计算设计的嵌合I型聚酮合酶与酶催化途径相结合,创建了自动化逆向生物合成工具BioPKS | NA | 开发自动化生物合成途径设计工具以扩展生物制造化学品的可及空间 | I型聚酮合酶(PKSs)和单功能酶的组合系统 | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成,计算设计 | NA | 化学结构数据,酶催化反应数据 | 155种生物制造候选化合物 | BioPKS, RetroTide, DORAnet | NA | 嵌合I型聚酮合酶与单功能酶的组合生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 2203 | 2025-10-05 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
|
研究论文 | 提出一种抽象层次结构来定义生物铸造厂工作流程和操作,以促进可互操作的合成生物学研究与应用 | 首次提出将生物铸造厂活动组织为项目、服务/能力、工作流程和单元操作四个互操作层次的抽象框架 | NA | 解决生物铸造厂标准化不足问题,提高合成生物学研究的可扩展性和效率 | 生物铸造厂工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | 抽象层次框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 2204 | 2025-10-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
|
研究论文 | 本研究开发了一种无标记瞬态红外纳米显微镜技术,用于解析单个光开关脂质体在水中的毫秒级动态变化 | 首次结合散射型扫描近场光学显微镜的化学识别和高时空分辨率,实现了对单个光开关脂质体的无标记中红外成像和光谱分析 | 方法尚未在更复杂的生物环境中验证,采样时间虽快但仍可能错过某些超快动力学过程 | 开发非破坏性无标记技术研究纳米载体的生物物理化学性质 | 偶氮苯基光开关脂质体形成的单个脂质体 | 纳米光学成像 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜,中红外成像和光谱 | NA | 红外光谱图像,动态时间序列数据 | 单个脂质体样品 | NA | NA | NA | 医学,药物递送,纳米诊疗,合成生物学 |
| 2205 | 2025-10-05 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
|
研究论文 | 本研究创建了一个包含超过32万实验验证实例的综合性RNA数据集,为RNA设计和建模算法建立了新的社区基准 | 提供了首个来自实验验证来源的大规模标准化RNA设计基准数据集,包含许多对现有RNA逆向折叠工具具有挑战性的结构 | NA | 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战,推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术领域的应用 | RNA分子及其二级结构 | 计算生物学 | NA | 机器学习 | NA | RNA序列和结构数据 | 超过320,000个实验验证实例 | NA | NA | NA | 医学,合成生物学,生物技术 |
| 2206 | 2025-10-05 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
|
研究论文 | 本研究通过挖掘乌头属植物转录组发现多个萜类合酶和细胞色素P450单加氧酶,揭示了它们在三萜类化合物生物合成中的多功能催化作用 | 发现了14种功能分化的P450酶,其中8种具有多功能催化特性,能够在支架的七个不同位点进行氧化反应,并揭示了雷公藤甲素在乌头属植物中的趋同生物合成 | NA | 探究乌头属植物中P450酶如何驱动二萜类化合物的结构和功能多样化 | 乌头属植物(Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum)中的萜类合酶和细胞色素P450单加氧酶 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、功能验证、蛋白质分析、定点突变 | NA | 转录组数据、酶活性数据 | NA | NA | 乌头属植物 | 组合生物合成途径,用于生产雷公藤甲素、冠芙二萜A和14种新型阿替瑟类化合物 | 医药 |
| 2207 | 2025-10-05 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了鳗弧菌NB10中一个新型极端碱性诱导启动子,该启动子能显著增强FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一个位于鳗弧菌肽酰脯氨酰顺反异构酶五端上游区域的新型极端碱性诱导启动子,在pH 10条件下能实现2.88倍的基因表达上调 | 研究目前仅在大肠杆菌中验证了启动子功能,尚未在原宿主鳗弧菌或其他微生物系统中进行广泛测试 | 鉴定和表征鳗弧菌NB10中响应极端碱性条件的启动子区域 | 鳗弧菌NB10的FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶及其上游启动子区域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学分析、β-半乳糖苷酶报告基因系统 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | NA | 报告基因构建 | 大肠杆菌 | 碱性诱导启动子系统 | 工业生物技术 |
| 2208 | 2025-10-05 |
Identification of Thermoregulatory Factors Involved in Validamycin Biosynthesis and Reconstitution of a Thermoregulated Expression System
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70068
PMID:40611707
|
研究论文 | 本研究在链霉菌中鉴定到参与有效霉素生物合成的温度调控因子,并重建了一个温度调控表达系统 | 首次在链霉菌中发现P启动子的温度调控机制,并成功构建了更高效的短启动子温度调控系统 | 研究仅限于两种链霉菌宿主,未在其他微生物中验证系统的普适性 | 研究链霉菌中温度调控系统在有效霉素生物合成中的作用 | 吸水链霉菌TL01和白色链霉菌J1074 | 合成生物学 | NA | DNA亲和层析,启动子工程,基因过表达 | NA | 基因表达数据,代谢产物产量数据 | 多种工程化链霉菌菌株 | 启动子工程,基因过表达 | Streptomyces albus J1074, Streptomyces hygroscopicus TL01 | 温度调控表达系统,包含改造的短启动子和调控蛋白SHJG_5852、SHJG_6392 | 工业生物技术 |
| 2209 | 2025-10-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
|
综述 | 探讨生成式人工智能在生命科学和农业综合企业中的多层面影响 | 系统阐述生成式AI在药物发现、蛋白质结构预测、作物育种及合成生物学等前沿领域的创新应用 | 未具体说明数据隐私、算法偏见和利益公平分配等伦理问题的解决方案 | 分析生成式AI与生物科学交叉融合的技术影响与发展前景 | 生成式人工智能技术在生命科学和农业领域的应用场景 | 机器学习 | NA | 生成式人工智能 | 大型语言模型(LLM) | 基因组数据、生态数据、分子数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 2210 | 2025-10-05 |
Advancing sustainable practices with Paenibacillus polymyxa: From soil health to medical applications and molecular engineering
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025016
PMID:40600215
|
综述 | 本文全面分析了多粘类芽孢杆菌在农业、环境、医学和工业等领域的可持续应用潜力 | 强调该细菌作为蛋白质表达、代谢工程和合成生物学多功能平台的潜力,并指出针对该菌的特异性基因编辑技术开发需求 | 天然多粘类芽孢杆菌生物资源的广泛利用受到遗传操作能力和工具的限制 | 深入理解多粘类芽孢杆菌的特性、遗传资源和代谢能力,推动可持续实践发展 | 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa) | 合成生物学 | NA | 遗传编辑技术、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 多粘类芽孢杆菌 | NA | 农业,环境,医学,工业生物技术 |
| 2211 | 2025-10-05 |
Synthetic Forms Most Beautiful: Engineering Insights into Self-Organization
2025-Jul-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00064.2024
PMID:39938118
|
综述 | 探讨合成生物学如何通过构建新生命系统来理解生物自组织的基本设计原则 | 提出将长度或时间尺度强加于生物活动是自组织的基本策略,并展示如何在合成系统中实现这一设计目标 | NA | 扩展对生命自组织设计原则的理解 | 生物自组织系统,从细胞到有机体水平 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自组织系统设计 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 2212 | 2025-10-05 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-Jun, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
|
综述 | 提出通过工程化人工微生物群落实现个性化肠道微生物组调控和疾病治疗的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计具有特定功能的人工微生物群落 | 需要开展严格的临床试验评估安全性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组治疗疾病 | 人工微生物群落和肠道微生物组 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 具有治疗分子生产、免疫调节和病原菌竞争等功能的工程化群落 | 医学 |
| 2213 | 2025-10-05 |
Design Principles Of Inorganic-Protein Hybrid Materials for Biomedicine
2025-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240182
PMID:40585774
|
综述 | 本文系统综述了无机-蛋白质杂化材料在生物医学领域的设计原理、结构基础及应用前景 | 提出原位杂化材料合成新思路,从合成生物学角度分析杂化材料反应体系构建策略 | NA | 探讨无机-蛋白质杂化材料的设计原理及其在生物医学领域的应用 | 无机-蛋白质杂化材料(IPHMs) | 材料科学 | NA | 生物医学光学成像、多模式治疗 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 2214 | 2025-10-05 |
Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review
2024-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-024-03998-5
PMID:38841267
|
综述 | 综述了微生物脂肪酶在丝状真菌黑曲霉中表达的相关研究进展 | 整合了微生物脂肪酶的最新数据,重点讨论了通过CRISPR/Cas9基因编辑技术提高脂肪酶表达效率的策略 | NA | 提高微生物脂肪酶在黑曲霉中的表达效率 | 微生物脂肪酶及其在黑曲霉中的表达系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 脂肪酶表达系统 | 能源,食品,日化,制药,工业生物技术 |
| 2215 | 2025-10-05 |
Expressing exogenous gene in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast with viral replication elements
2025-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132784
PMID:40490158
|
研究论文 | 开发了一种基于双生病毒的莱茵衣藻叶绿体表达平台,用于提高外源基因表达效率和化合物产量 | 首次在莱茵衣藻叶绿体中应用甜菜曲顶病毒的复制机制,建立了病毒启发的表达平台,实现长期稳定高表达 | NA | 解决莱茵衣藻叶绿体合成生物学中产物产量低的问题 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 病毒复制元件技术 | NA | NA | NA | 病毒复制元件 | Chlamydomonas reinhardtii(莱茵衣藻) | 病毒启发的表达平台,包含细菌类胡萝卜素生成基因 | 工业生物技术 |
| 2216 | 2025-10-05 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-11-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
|
研究论文 | 开发了一种基于DNA折纸体素的可重构纳米材料系统,通过可编程三维连接实现多种结构的快速重构 | 提出了模块化DNA折纸体素系统,实现了局部连接在柔性和刚性状态间的可编程切换,以及通过柔性链中间体组装提高产率的新方法 | 当前合成系统在分层组装中产率较低,在不同结构间快速高效重构仍面临挑战 | 开发可重构的DNA纳米材料组装系统 | DNA折纸体素及其组装结构 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | 12种独特体素原型构建50种结构 | DNA折纸 | NA | 可编程三维连接系统,柔性链中间体组装路径 | 合成生物学, 无机材料组装, 纳米医学 |
| 2217 | 2025-10-05 |
Switchable RNA motifs for dynamic transcriptional control of RNA condensates
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf497
PMID:40539511
|
研究论文 | 本研究开发了可通过RNA入侵链动态调控的RNA凝聚体系统 | 首次实现了通过RNA入侵链和反入侵链对星形RNA基序形成的凝聚体进行可逆调控 | 目前仅在体外实验中验证了系统功能,尚未在活细胞环境中测试 | 开发可动态调控的RNA相分离系统 | 星形RNA基序(纳米星)形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 体外转录 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 基于RNA入侵链和反入侵链的可逆调控开关 | 合成生物学, 生物材料 |
| 2218 | 2025-10-05 |
Plant Microbiomes Alleviate Abiotic Stress-Associated Damage in Crops and Enhance Climate-Resilient Agriculture
2025-Jun-19, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14121890
PMID:40573878
|
综述 | 探讨植物微生物组在缓解非生物胁迫中的作用及其在气候智慧农业中的应用前景 | 系统阐述微生物组工程策略(合成生物学、微生物群落设计等)在增强农业气候韧性的创新应用 | 实验室研究成果向田间实际应用的转化仍面临植物-微生物互作复杂性的挑战 | 研究植物微生物组如何增强作物对非生物胁迫的抵抗能力并推动可持续农业发展 | 植物微生物组(细菌、真菌、古菌、微藻等)及其与作物的互作关系 | 农业生物技术 | NA | 宏基因组学, CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 合成生物学工具 | 作物相关微生物 | 微生物群落设计 | 农业 |
| 2219 | 2025-10-05 |
Next-Generation Vaccine Platforms: Integrating Synthetic Biology, Nanotechnology, and Systems Immunology for Improved Immunogenicity
2025-May-30, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13060588
PMID:40573919
|
综述 | 探讨整合合成生物学、纳米技术和系统免疫学的下一代疫苗平台技术 | 将合成生物学、纳米技术和系统免疫学三大前沿领域整合应用于疫苗开发 | 存在可扩展性、安全性评估和数据驱动疫苗设计的伦理问题等挑战 | 开发具有改进免疫原性的下一代疫苗平台 | SARS-CoV-2、EB病毒等病原体及癌症免疫治疗 | 生物医学工程 | 传染病、癌症 | 多组学数据分析、计算建模、纳米工程 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 哺乳动物细胞 | 自扩增结构、抗原递送系统、免疫激活回路 | 医学 |
| 2220 | 2025-10-05 |
Scientists' Views on the Ethics, Promises and Practices of Synthetic Biology: A Qualitative Study of Australian Scientific Practice
2023-12-11, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-023-00461-1
PMID:38082028
|
研究论文 | 通过访谈澳大利亚合成生物学中心的科学家,探讨合成生物学领域的伦理问题和实践挑战 | 首次通过实证访谈揭示合成生物学家实际面临的日常伦理问题,与文献中推测性伦理讨论形成鲜明对比 | 研究仅局限于澳大利亚一个合成生物学中心的科学家,样本代表性有限 | 理解合成生物学领域的实际伦理挑战及其与伦理文献讨论的差异 | 澳大利亚合成生物学中心的在职合成生物学家 | NA | NA | 定性访谈研究 | NA | 访谈文本数据 | 澳大利亚合成生物学中心的科学家群体 | NA | NA | NA | NA |