合成生物学相关文章
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当前共找到 3058 篇文献，本页显示第 2301 - 2320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2024-08-07 |
Toward Engineering Biosystems With Emergent Collective Functions
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00705
PMID:32671054
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研究论文 | 本文探讨了如何利用多智能体建模作为合成生物学中的设计框架，以克服工程涌现集体功能面临的挑战 | 提出使用多智能体建模来捕捉复杂多尺度系统的核心特征，并提供对指导跨尺度涌现功能的基础机制的新见解 | NA | 探索如何通过多智能体建模在合成生物学中实现具有涌现集体功能的生物系统 | 复杂生物系统中的涌现集体功能 | 合成生物学 | NA | 多智能体建模 | 多智能体模型 | NA | NA |
| 2302 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering Employing Escherichia coli for C2-C6 Bioalcohol Production
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00710
PMID:32719784
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综述 | 本文综述了利用大肠杆菌进行C2-C6生物酒精生产的合成生物学和代谢工程研究进展 | 探讨了生物酒精作为替代化石燃料的潜力，特别是在减少温室气体排放方面的优势 | 分析了当前提高工业应用生产率的挑战 | 旨在增强生物酒精的生产，支持更环保的能源过程 | 利用大肠杆菌进行C2-C6生物酒精的生产 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2303 | 2024-08-07 |
Riboflow: Using Deep Learning to Classify Riboswitches With ∼99% Accuracy
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00808
PMID:32760712
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研究论文 | 本文使用深度学习框架，特别是卷积神经网络（CNN）和双向循环神经网络（RNN）与长短期记忆（LSTM），对32种配体类别的综合数据集进行分类，以高精度识别核糖开关的配体特异性 | 本文提出的双向LSTM RNN模型在识别核糖开关配体特异性方面表现出>0.99的准确率和0.96的宏平均F分数，且不需要预先的特征工程，模型具有动态更新功能以适应新发现的核糖开关 | NA | 解决核糖开关特性识别的计算难题，并推动合成生物学中遗传回路设计的精确翻译控制 | 核糖开关及其配体特异性 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM | 数据集 | 32种配体类别 |
| 2304 | 2024-08-07 |
Cell-Free Systems: A Proving Ground for Rational Biodesign
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00788
PMID:32793570
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观点 | 本文探讨了无细胞基因表达系统在合成生物学中的应用，并提出这些系统是测试理性生物设计策略的理想平台 | 无细胞基因表达系统利用非活体生物化学反应来控制生物基因表达，其开放性质使得所有组件可直接访问，便于模型构建和验证 | 这些系统存在反应寿命有限和缺乏稳态等独特困难 | 提出无细胞系统是测试理性生物设计策略的理想平台，并期望从这一方法中获得的进展有助于更可靠和系统地工程化无细胞及活细胞系统 | 无细胞基因表达系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2305 | 2024-08-07 |
Are Antisense Proteins in Prokaryotes Functional?
2020, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2020.00187
PMID:32923454
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研究论文 | 本文探讨了原核生物中反义蛋白的功能性问题 | 研究揭示了大量新发现的蛋白质对生物体有用，并提出了这些蛋白质应被添加到基因组注释中，以及预测它们的方法应标准化 | 确定这些蛋白质产品的功能部分仍需进一步研究，包括分子相互作用的研究和详细的进化分析 | 旨在揭示大量新型蛋白质，这些蛋白质具有极其多样化的潜在实际应用 | 原核生物中的反义蛋白 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2306 | 2024-08-07 |
Emerging Cellular Therapies for Cancer
2019-04-26, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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研究论文 | 本文探讨了基因工程改造的T细胞作为新型抗癌药物的潜力及其在癌症治疗中的应用 | 介绍了合成生物学方法在细胞工程中的应用，为免疫细胞编程提供了更广泛的工具集 | NA | 探索基因工程T细胞在癌症治疗中的应用及其潜在的扩展领域 | 基因工程T细胞及其在癌症、传染病、器官移植和自身免疫疾病中的应用 | NA | 癌症 | 基因编辑 | NA | NA | NA |
| 2307 | 2024-08-07 |
Bioengineering Strategies for Protein-Based Nanoparticles
2018-Jul-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070370
PMID:30041491
|
综述 | 本文综述了基于蛋白质的纳米颗粒（PNPs）在生物工程和生物偶联方面的最新进展，以及如何利用合成生物学概念来开发和增强PNPs的固有特性并赋予其新功能 | PNPs具有独特的自组装、高稳定性、生物相容性和可生物降解性，以及可通过化学或遗传策略操纵的外部组件和包封特性 | NA | 探讨基于蛋白质的纳米颗粒在药物递送、疫苗开发和生物催化等领域的应用潜力 | 基于蛋白质的纳米颗粒及其在纳米生物技术中的应用 | 生物工程 | NA | 生物偶联 | NA | NA | NA |
| 2308 | 2024-08-07 |
Applications of Yeast Synthetic Biology Geared towards the Production of Biopharmaceuticals
2018-Jul-06, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070340
PMID:29986380
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综述 | 本文综述了合成生物学在酵母异源生物合成生物制药中的应用，并展示了酵母细胞工厂的潜力和能力 | 近年来，合成生物学和天然代谢途径的阐明推动了这一领域的新发展 | NA | 探讨合成生物学在酵母生物制药生产中的应用及其未来趋势 | 酵母作为生物制药的生产平台 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2309 | 2024-08-07 |
Noise control for molecular computing
2018-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0199
PMID:29997258
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研究论文 | 本文开发了一种算法，用于在保持确定性动力学的同时，在基于质量作用动力学的反应网络中引入可控的状态依赖性噪声。 | 该算法能够在不改变确定性动力学的情况下，引入可控的噪声，从而在生物化学网络设计中起到重要作用。 | NA | 旨在开发一种方法，用于在生物化学网络设计中控制内在噪声。 | 生物化学反应网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2310 | 2024-08-07 |
Heterologous Production of Flavour and Aroma Compounds in Saccharomyces cerevisiae
2018-Jun-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070326
PMID:29958445
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review | 本文综述了利用酵母作为微生物细胞工厂生产风味和香气化合物的方法 | 利用合成生物学领域的进展，通过异源途径在酵母中生产通常稀有且昂贵的植物源化学品 | NA | 探讨酵母作为生产风味和香气化合物的可持续高效方法 | 风味和香气化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2311 | 2024-08-07 |
Boosting Secondary Metabolite Production and Discovery through the Engineering of Novel Microbial Biosensors
2018, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2018/7021826
PMID:30079350
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研究论文 | 本文介绍了通过工程化新型微生物生物传感器来促进细菌中次级代谢产物生产和发现的最新进展 | 开发了新型合成生物学方法，用于提高次级代谢产物的生产率和在异源宿主中挖掘及重建新的生物合成基因簇 | 讨论了当前开发方法的潜力和局限性，并指出了该领域可能的新方向 | 旨在通过工程化微生物生物传感器和合成启动子及表达系统，构建微生物细胞工厂以生产次级代谢产物 | 细菌中的次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因簇 | NA |
| 2312 | 2024-08-07 |
Auxotrophy to Xeno-DNA: an exploration of combinatorial mechanisms for a high-fidelity biosafety system for synthetic biology applications
2018, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-018-0105-8
PMID:30123321
|
研究论文 | 本文探讨了合成生物学应用中用于提高生物安全性的多种组合机制，包括从营养缺陷型到最小基因组的方法 | 提出了使用Xeno-DNA和非经典氨基酸等方法来消除构建细胞的遗传信息，以及基于Xeno-DNA的无细胞系统的最终生物安全系统 | NA | 研究并改进合成生物学中的生物安全系统，特别是在iGEM竞赛的背景下 | 合成生物学中的生物安全系统，包括营养缺陷型、毒素-抗毒素系统、无细胞系统等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2313 | 2024-08-07 |
De novo design of modular peptide-binding proteins by superhelical matching
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05909-9
PMID:37020023
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研究论文 | 本文介绍了一种通过超螺旋匹配设计模块化肽结合蛋白的新方法 | 利用几何哈希技术识别与双齿氢键兼容的蛋白骨架和肽对接排列，并通过优化蛋白序列以实现折叠和肽结合 | NA | 设计具有序列特异性的肽结合蛋白，以应用于蛋白质组学和合成生物学 | 模块化肽结合蛋白及其与肽的相互作用 | 蛋白质工程 | NA | 几何哈希技术 | NA | 蛋白质结构 | 设计了六种不同的三肽重复序列结合蛋白 |
| 2314 | 2024-08-07 |
The interplay of spatial organization and biochemistry in building blocks of cellular signalling pathways
2020-05, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0251
PMID:32453980
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研究论文 | 本文探讨了空间组织与生化途径之间的相互作用，重点关注了共价修饰循环和双组分系统等基本构建模块 | 分析了不同类型的空间组织对修饰动力学的影响，以及空间组织与化学反应之间的相互作用 | NA | 理解空间组织在生化途径中的作用，并为合成生物学中的途径空间组织工程提供见解 | 共价修饰循环和双组分系统等生化途径的基本构建模块 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2315 | 2024-08-07 |
Structural organization of biocatalytic systems: the next dimension of synthetic metabolism
2019-Nov-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190015
PMID:33523157
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综述 | 本文综述了体外合成代谢网络（SIVMNs）的结构组织及其在提高效率和生产力方面的重要性 | 探讨了如何通过结构组织优化合成代谢网络，以减少有害副反应、有效利用可再生能源并提高生产力 | NA | 探讨如何进一步发展体外合成代谢网络，通过结构组织优化其性能 | 体外合成代谢网络（SIVMNs）及其反应的结构组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2316 | 2024-08-07 |
Physicochemical considerations for bottom-up synthetic biology
2019-11-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190017
PMID:33523159
|
综述 | 文章综述了从分子组件构建合成细胞的挑战性研究领域，特别是生物系统在合成囊泡中限制的影响 | NA | NA | 探讨构建合成细胞所需的物理化学考虑 | 合成细胞的内部pH、离子强度、大分子拥挤、氧化还原状态及代谢能量守恒 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2317 | 2024-08-07 |
Modeling population dynamics in a microbial consortium under control of a synthetic pheromone-mediated communication system
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800107
PMID:32625018
|
研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一个由两种菌株组成的模型共生体，其中接收菌株的生长和荧光标记蛋白EGFP的表达受发射菌株产生的α-因子信息素浓度控制，并开发了一个定量的实验和理论框架来描述模型共生体中的种群动态 | 本文开发了一个定量的实验和理论框架，用于描述受合成信息素介导的通信系统控制的微生物共生体中的种群动态 | NA | 研究如何通过合成生物学方法控制微生物共生体的行为，以应用于复杂的生物转化过程 | 由两种菌株组成的模型共生体，其中一种菌株产生α-因子信息素，另一种菌株受信息素浓度控制生长和表达荧光标记蛋白EGFP | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | 数学模型 | 生物数据 | 两种菌株的共生体在不同培养条件下的实验数据 |
| 2318 | 2024-08-07 |
Recent advances in natural products exploitation in Streptomyces via synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800137
PMID:32625022
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学在链霉菌中开发天然产物的新进展 | 合成生物学作为一种新的生物工程平台，被用于发现新的生物活性化合物并扩大生物活性天然产物的多样性和生产 | NA | 探讨合成生物学在天然产物开发中的应用 | 链霉菌中的天然产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 2319 | 2024-08-07 |
Lignin valorization meets synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800133
PMID:32625023
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综述 | 本文综述了合成生物技术在木质素转化中的应用，特别是生产高价值产品如芳香化学品、环裂解化学品和生物活性物质 | 合成生物技术为木质素的高值化利用提供了新的潜在策略，包括优化木质素降解酶、构建新型人工转化途径和改进模型微生物底盘 | NA | 探讨合成生物技术在木质素转化中的应用，以实现木质素的高值化利用 | 木质素及其转化产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA |
| 2320 | 2024-08-07 |
Advances in bio-based production of dicarboxylic acids longer than C4
2018-Sep, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800023
PMID:32624947
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综述 | 本文综述了利用生物方法特别是合成生物学技术生产C4以上直链二羧酸的最新进展 | 设计并验证了多种生产二羧酸的路径，包括C5至C15范围的二羧酸，并通过工程化微生物宿主和优化生物催化元件的性质来提高目标二羧酸的代谢通量 | 讨论了相关路径的当前优势和局限性，并提出了合成路径设计和优化以实现二羧酸超量生产的展望 | 探讨生物基生产化学品的方法，特别是二羧酸的生产 | C4以上直链二羧酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |