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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-03-31 |
Dynamic Coordination: How ERF Transcription Factors Coordinate Plant Development and Adaptive Stress Responses
2026-03-19, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16030466
PMID:41897400
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综述 | 本文综述了乙烯响应因子(ERF)转录因子在协调植物生长发育与逆境适应性响应中的核心调控作用 | 强调了ERF-VII等特定亚群在整合发育程序与胁迫响应中的双重功能,并探讨了利用CRISPR和合成生物学工具精准调控ERF网络以改良作物的新策略 | NA | 阐明ERF转录因子如何动态协调植物资源在生长与抗逆之间的分配机制 | 植物乙烯响应因子(ERF)转录因子家族 | NA | NA | CRISPR基因组编辑、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 作物(植物) | ERF调控网络 | 农业 |
| 222 | 2026-03-31 |
Photo-Oxidative Stress in Plants: ROS Signaling, Damage Propagation, and Systems-Level Resilience
2026-Mar-15, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox15030371
PMID:41897517
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综述 | 本文综述了植物光氧化应激中活性氧信号传导、损伤传播和系统水平恢复力的最新进展,并提出了一个整合框架 | 超越将ROS视为有毒副产物的传统观点,将其定位为复杂互连网络中的中心枢纽,并强调从增强单一组分转向“优化网络”的未来策略 | NA | 阐明植物光氧化应激的机制,并提出作物改良的整合策略 | 植物(特别是作物)的光氧化应激反应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(作物) | NA | 农业 |
| 223 | 2026-03-31 |
From Gene Knockouts to Genome Remodeling: Large DNA Fragment Deletion Technologies in Plants
2026-Mar-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15060909
PMID:41901428
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综述 | 本文系统比较了植物中应用的主要大片段DNA缺失技术,并讨论了其机制、效率、优势、局限及未来发展方向 | 系统性地比较了多种植物大片段DNA缺失技术,并强调了植物特异性染色质组织和DNA修复机制对缺失效率的限制,同时提出了AI辅助设计、蛋白质定向进化等未来发展方向 | 当前技术在不同作物基因组中实现高效、精确、可预测的大片段缺失仍存在瓶颈 | 探讨植物中大片段DNA缺失技术的机制、应用及未来发展方向,以推动其在功能基因组学、性状工程和理性基因组设计中的应用 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | 大片段DNA缺失技术 | NA | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR/Cas systems (Cas9, Cas12a, Cas3), 位点特异性重组酶, 转座子系统, 先导编辑衍生策略 | 植物 | NA | 农业 |
| 224 | 2026-03-31 |
Engineered Bacteriophages: A Next-Generation Platform for Precision Antimicrobials and Therapeutics
2026-Mar-13, Viruses
DOI:10.3390/v18030355
PMID:41902263
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为下一代精准抗菌和治疗平台的进展、应用与挑战 | 系统总结了工程化噬菌体的制备技术(基因修饰、化学偶联、物理封装)及其在多重耐药感染、肠道疾病和癌症治疗中的创新应用,提出了精准噬菌体医学的概念 | 面临监管审批、大规模生产和长期安全性等关键挑战 | 探讨工程化噬菌体作为应对抗菌素耐药性和开发新型疗法的平台 | 工程化噬菌体 | 合成生物学 | 多重耐药感染、胃肠道疾病、癌症 | 基因修饰、化学偶联、物理封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌(作为噬菌体宿主) | 生物传感器、靶向递送载体、免疫佐剂 | 医学 |
| 225 | 2026-03-31 |
Unintended Creation or Insertion of Antisense Promoter Motifs During Codon Optimization: A Cyber-Biosecurity Risk
2026-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14030638
PMID:41900397
|
研究论文 | 本研究探讨了密码子优化过程中可能无意引入反义启动子基序的风险,并开发了相应的计算工具进行检测和防御 | 首次系统揭示了密码子优化可能意外引入反义启动子基序的网络安全风险,并开发了可保留氨基酸序列的沉默插入算法 | 研究主要基于计算分析,需要后续实验验证反义启动子的实际生物学影响 | 评估密码子优化过程中的网络安全风险,开发预防性计算工具 | 密码子优化序列、反义启动子基序 | 合成生物学 | NA | 密码子优化、计算分析 | 计算分析流程 | DNA序列数据 | 484,741个蛋白质编码序列 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 226 | 2026-03-31 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2026-Mar, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 本研究使用文献计量和知识图谱方法,探索了亚胺还原酶(IREDs)的研究格局和演变历程 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示,揭示了研究趋势和新兴主题 | 研究基于已发表的文献数据,可能未涵盖所有未发表或正在进行的研究,且分析范围限于2010年至2024年 | 探索IREDs的研究景观和演变,以提供对该领域的全面评估 | 亚胺还原酶(IREDs)及其在合成手性胺中的应用 | 合成生物学 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法(如CiteSpace、VOSviewer、Pajek、Scimago Graphica) | NA | 文本数据(研究文章和综述) | 239篇研究文章和综述 | NA | NA | NA | 医药 |
| 227 | 2026-03-31 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
|
研究论文 | 本文探讨了DNA小沟四联体作为增强i-motif结构稳定性和多功能性的新型结构元件 | 揭示了小沟四联体能够作为封端平台,强化半质子化C:C⁺堆叠,使i-motif在中性pH下折叠,并展示了其可调拓扑结构和结构可塑性 | NA | 研究小沟四联体对i-motif DNA结构的稳定性和功能调控作用 | 含有小沟四联体的i-motif结构 | 结构生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 228 | 2026-03-31 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
|
综述 | 本文综述了细菌表面展示技术在药物递送领域的重新利用,探讨了其作为治疗平台的演变、优势、机制、应用及未来发展方向 | 提出将细菌表面展示技术重新用于药物递送,并规划了利用AlphaFold等计算工具理性设计下一代展示平台的未来路线图 | 仍面临监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 探索细菌工程在医学应用中的演变,重点研究细菌表面展示技术实现的药物递送策略 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的表面展示系统 | 合成生物学 | 癌症 | 细菌表面展示技术 | NA | NA | NA | NA | 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌 | 表面展示系统(包括外膜蛋白、分选酶介导锚定和基于孢子的系统) | 医学 |
| 229 | 2026-03-31 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-05-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
|
综述 | 本文综述了利用微生物系统异源合成倍半萜醇的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了包括适应性倍半萜醇合酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及应对萜类化合物毒性的耐受性策略在内的多种创新方法 | NA | 推进倍半萜醇生物合成研究,以克服其工业化应用面临的产量低、成本高等挑战 | 倍半萜醇化合物及其微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇生物合成途径 | 制药, 食品, 化妆品 |
| 230 | 2026-03-31 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-11-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
|
综述 | 本文综述了从分子电路到群落的功能性微生物生态系统组装,包括交叉通讯和正交调控模块,并提出了一个全面的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了基于不同调控电路协调微生物生态系统的策略,提出了一个更全面的微生物群落组装框架,整合了遗传电路、通讯工具和工程应用 | NA | 解密、模拟或重建微生物群落,以促进基于联盟的应用 | 微生物生态系统,包括微生物群落及其相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 交叉通讯和正交调控模块,涉及代谢物、转录、翻译和翻译后水平 | 工业生物技术, 环境, 农业, 医学 |
| 231 | 2026-03-31 |
Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013
PMID:36738860
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综述 | 本文综述了用于促进多能干细胞来源肝细胞成熟以进行疾病建模的工程化平台的设计、特征及应用 | 系统总结了多种先进技术(如蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控装置和合成生物学)在提升肝细胞样细胞成熟度方面的创新应用 | 未提供具体实验数据验证各平台效果,主要基于现有文献进行归纳分析 | 开发更成熟的人类肝细胞体外模型,用于疾病机制研究、药物开发和细胞治疗 | 人多能干细胞(包括诱导多能干细胞和胚胎干细胞)分化产生的肝细胞样细胞 | 合成生物学与组织工程 | 肝脏疾病(包括病毒性肝炎、脂肪肝、疟疾、单基因疾病和药物性肝损伤等) | 蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 人类多能干细胞 | 通过遗传修饰加速和增强肝细胞样细胞成熟的合成生物学回路 | 医学(疾病建模、药物开发、细胞治疗) |
| 232 | 2026-03-30 |
Dual-promoter control of gene expression: from transcriptional fine-tuning to antibiotic resistance
2026-Mar-27, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102747
PMID:41903510
|
综述 | 本文综述了双启动子如何调控基因表达,从转录微调延伸到抗生素耐药性机制 | 系统总结了双启动子在微生物中的组合调控策略,并将其与合成生物学应用及抗生素耐药性预测联系起来 | NA | 探讨双启动子对基因表达的调控机制及其在抗生素耐药性和合成生物学中的应用 | 微生物中的启动子调控机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双启动子调控电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 233 | 2026-03-30 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Mar-26, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
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综述 | 本文综述了植物对热应激响应的分子机制,重点关注表观遗传调控与信号网络的整合 | 整合了表观遗传调控(如H2A.Z动态和组蛋白修饰重编程)与信号网络(光、昼夜节律和激素信号通路)在植物热适应中的作用,并强调了HSFA2介导的染色质重塑和siRNA依赖的跨代热记忆机制 | 关于温度感知、HSFA1s激活动力学和应激信号整合的基本问题仍待解决 | 解析植物热响应的分子机制,为气候智能型作物提供理论基础和分子育种策略 | 植物(特别是作物)的热应激响应机制 | 植物生物学 | NA | 多组学和合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 234 | 2026-03-30 |
A Rapid, High-Throughput Method for the Construction of Mutagenesis Libraries
2025-10-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111511
PMID:41301429
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研究论文 | 本文开发了一种基于芯片寡核苷酸合成的高通量、精确控制突变库构建方法,用于大规模功能筛选 | 利用芯片寡核苷酸合成技术实现高通量、精确控制的突变库构建,突变覆盖率达93.75%,并评估了多种聚合酶以优化文库质量 | 未映射读数的分析揭示了寡核苷酸合成错误和嵌合序列形成等技术因素,需改进PCR条件和加强寡核苷酸合成质量控制 | 开发一种高效、可扩展、精确控制的突变库构建策略,以支持高通量功能研究 | 以模型系统构建全长度琥珀密码子扫描突变库 | 合成生物学 | NA | 芯片寡核苷酸合成、PCR、突变库构建 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 235 | 2026-03-30 |
Protein Translocation Control in E. coli via Temperature-Dependent Aggregation: Application to a Conditionally Lethal Enzyme, Levansucrase
2025-08-20, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081199
PMID:40867643
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研究论文 | 本文提出了一种基于温度响应性弹性蛋白样多肽(ELP)的系统,用于调控大肠杆菌中条件致死酶(levansucrase)的转运,实现蛋白质定位和分泌的可逆控制 | 利用ELP标签的温度依赖性聚集特性,设计了一种可逆调控蛋白质分泌的策略,应用于条件致死酶系统,为合成生物学和生物安全提供新方法 | NA | 开发一种温度响应性蛋白质转运控制系统,用于合成生物学和蛋白质工程 | 大肠杆菌中的条件致死酶levansucrase及其ELP融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、ELP标签技术 | NA | NA | NA | ELP标签 | 大肠杆菌 | 温度响应性蛋白质分泌控制系统,基于ELP聚集机制 | 合成生物学、代谢工程、生物安全 |
| 236 | 2026-03-29 |
Biomimetic Construction of Abiotic Membranes Through Acylation of Cationic Diamino Acids
2026-Mar-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500978
PMID:41869751
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研究论文 | 本文提出了一种通过阳离子二氨基氨基酸的酰化反应仿生构建非生物膜的简单模块化策略 | 开发了一种单步合成胆碱模拟非生物磷脂类似物的方法,利用Girard试剂T引入三甲基铵头部基团,并通过预生物相关的硫酯进行N-酰化,实现了头部基团电荷和组成的系统调控 | NA | 开发功能更广泛的人工膜构建方法,扩展合成生物学和原始细胞研究的工具包 | 非生物磷脂类似物及其自组装形成的囊泡结构 | 合成生物学 | NA | 羧酸盐共轭反应、N-酰化反应、自组装技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 分子递送 |
| 237 | 2026-03-29 |
Engineering smart bacteria for the next generation
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102681
PMID:41850245
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综述 | 本文综述了智能细菌的理性设计及其在合成生物学中的进展,重点介绍了其在疾病诊断与治疗中的临床应用 | 通过整合复杂的基因回路,实现了微生物传感与信号处理的时空精确控制,并将其应用于原位治疗递送和远程激活 | NA | 总结智能细菌在基因回路工程和临床应用方面的最新进展,并讨论其转化为下一代精准医学的关键挑战与未来方向 | 智能细菌(工程化微生物系统) | 合成生物学 | NA | 基因回路工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 传感与信号处理基因回路,可响应化学、物理或病理信号 | 医学 |
| 238 | 2026-03-29 |
Quorum sensing in bacteria: insights into communication and inhibition strategies-a review
2026-Feb-02, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04610-x
PMID:41627464
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综述 | 本文全面综述了细菌群体感应机制及其抑制策略,涵盖不同细菌类型的信号系统、合成生物学进展和多种抑制剂的应用 | 系统整合了群体感应抑制剂的多样类别,包括天然、合成、抗体、酶、CRISPR介导及临床试验中的抑制剂,并强调其在抗微生物耐药性背景下的无耐药性潜力 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且可能未涵盖所有最新研究进展 | 探讨细菌群体感应机制及其抑制策略,以开发可持续的抗微生物控制工具 | 革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及其群体感应信号分子(如AHLs、寡肽、AI-2) | NA | NA | 合成生物学、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 工程化群体感应电路 | 医疗保健, 农业, 水产养殖, 食品工业, 医疗器械生物膜管理 |
| 239 | 2026-03-29 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
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研究论文 | 本研究利用基于酵母的转化相关重组技术,开发了一个伪狂犬病毒基因组组装平台,成功拯救并表征了功能性病毒 | 首次应用TAR技术组装伪狂犬病毒基因组,并结合CRISPR/Cas9编辑插入外源基因,实现了快速、灵活的基因组修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株,且在小鼠中仍能引起致死性感染,表明毒力未完全减弱 | 开发伪狂犬病毒基因组编辑平台,以促进基础研究和疫苗载体开发 | 伪狂犬病毒PRV-GX-2011株 | 合成生物学 | 伪狂犬病 | 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组序列 | 使用Vero细胞进行病毒拯救,并在BALB/c小鼠中进行感染实验 | CRISPR-Cas9, TAR | 酵母, Vero细胞 | 在UL23和UL22基因间的非编码区插入egfp基因的合成生物电路 | 医学 |
| 240 | 2026-03-29 |
De novo chemoenzymatic construction of lipid membranes
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.013
PMID:41895902
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研究论文 | 本文提出了一种化学酶促策略,在水溶液中从头构建磷脂和膜 | 开发了一种模块化方法,通过天然化学连接将脂肪酸合成与磷脂组装结合,实现无预存双层的膜构建 | NA | 为自下而上的合成生物学和生命起源研究提供从头构建膜的平台 | 磷脂和膜 | 合成生物学 | NA | 化学酶促合成,天然化学连接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,生命起源研究 |