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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-05 |
Molecular Mechanisms of Herbicide Resistance in Rapeseed: Current Status and Future Prospects for Resistant Germplasm Development
2025-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178292
PMID:40943213
|
综述 | 系统总结油菜除草剂抗性分子机制及抗性种质开发策略 | 首次系统整合非靶标抗性机制、多组学与AI技术在抗除草剂油菜育种中的应用潜力 | NA | 为抗除草剂油菜的可持续发展提供安全有效的创新方法指导 | 油菜及其除草剂抗性机制 | 农业生物技术 | NA | 基因编辑、合成生物学、定向蛋白进化、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 油菜 | NA | 农业 |
| 302 | 2025-10-05 |
Unlocking Casein Bioactivity: Lactic Acid Bacteria and Molecular Strategies for Peptide Release
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178119
PMID:40943047
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综述 | 本文综述了利用乳酸菌和分子生物学策略释放牛β-酪蛋白中生物活性肽的方法 | 系统整合合成生物学、分子生物技术和系统生物学方法增强β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现与生产 | NA | 提高β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现和生产效率 | 牛β-酪蛋白中的生物活性肽 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统、多组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | 诱导型表达平台、无细胞系统 | 食品, 医药 |
| 303 | 2025-10-05 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
|
研究论文 | 开发了一种能够检测和治疗肠道炎症的微生物生物传感器 | 首次开发了针对临床验证生物标志物钙卫蛋白的合成生物传感器,兼具诊断记录和治疗功能 | NA | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物系统 | 肠道炎症生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症疾病 | 合成生物学技术 | NA | 生物分子数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 锌摄取调节因子(Zur)控制启动子与记忆电路耦合的生物传感器,结合抗炎细胞因子IL10产生系统 | 医学 |
| 304 | 2025-10-05 |
A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM
2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.17678
PMID:39552172
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研究论文 | 本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全和生物安保风险进行定量分析 | 将传统定性风险分析扩展为定量评估,构建了针对iGEM项目的攻击树模型 | 主要针对中低风险场景,且参与者经验相对不足可能影响评估准确性 | 评估合成生物学项目中的生物安全和生物安保风险 | 2022年iGEM竞赛项目 | 合成生物学 | NA | 攻击树分析 | 攻击树模型 | 项目风险评估数据 | 2022年iGEM项目 | iGEM | NA | NA | 生物安全 |
| 305 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2025-Sep-12, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法异源表达和纯化肠球菌素A,开发了一种生产抗菌肽的有效策略 | 首次从头设计合成完整的肠球菌素A基因盒,建立从包涵体高效回收活性抗菌肽的优化工艺 | 表达产物主要形成包涵体,需要复杂的变复性过程 | 开发替代抗生素的新型抗菌策略 | 肠球菌素A及其对多重耐药病原菌的抗菌活性 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因合成,PCR,DNA测序,Ni-NTA亲和层析 | NA | NA | 5种病原菌:金黄色葡萄球菌ATCC 25923、铜绿假单胞菌ATCC 27853、鲁氏不动杆菌GPE 3002、藤黄微球菌GPE 3001、蜡样芽孢杆菌GPE 3003 | Gibson Assembly | 大肠杆菌BL21(DE3) | 包含功能调控元件和N端His标签的肠球菌素A基因盒 | 医药,食品 |
| 306 | 2025-10-05 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2025-Sep-12, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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研究论文 | 本文综述了在本氏烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略 | 开发了响应化学和电磁信号的新型传感器系统、与可编程转录因子整合的合成启动子、基于重组酶的处理器以及病毒衍生复制子 | 存在转基因沉默、产量低和代谢毒性等限制可扩展性的挑战 | 实现本氏烟草中转基因的精确表达控制和代谢途径优化 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、病毒衍生复制子、重组酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成基因电路、传感器系统、合成启动子、逻辑门、生物传感器 | 农业,工业生物技术,环境 |
| 307 | 2025-10-05 |
Development of a modified RNA circularization system to improve circRNA-based protein expression in mammalian cells
2025-Sep-11, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080733.125
PMID:40935594
|
研究论文 | 开发了一种改进的RNA环化系统,显著提高哺乳动物细胞中基于环状RNA的蛋白质表达 | 通过优化IRES与CMV启动子间距、揭示HRV-B3 IRES的双重功能、整合HIV-1 LTR和WPRE元件来增强Tornado系统的环化效率和转录效率 | NA | 开发新型策略增强哺乳动物细胞中RNA环化效率 | 环状RNA在哺乳动物细胞中的蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | RNA环化技术 | NA | 分子生物学数据 | NA | Tornado系统 | 哺乳动物细胞 | 改进的RNA环化系统,包含IRES、CMV启动子、HIV-1 LTR和WPRE调控元件 | 医学 |
| 308 | 2025-10-05 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
|
研究论文 | 本研究揭示了乳酸菌中醌类前体DHNA生物合成的双相调控机制及其与底物限制的协同作用 | 发现MenF和MenD酶通过可逆通量和变构反馈抑制形成双相调控模式,并首次阐明底物可用性对DHNA过量生产的限制作用 | 研究聚焦于乳酸菌中的DHNA调控机制,在其他微生物中的普适性仍需验证 | 阐明微生物调控醌类水平的分子机制,为代谢工程改造微生物生产醌类提供理论基础 | 乳酸菌中醌类前体1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的生物合成调控机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学模型 | 数学模型 | 酶活性数据、代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 乳酸菌 | 醌类生物合成途径调控网络 | 工业生物技术 |
| 309 | 2025-10-05 |
Advancing biomaterial innovation for tissue engineering through microbial synthetic biology: A review
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146771
PMID:40803465
|
综述 | 本文综述了微生物合成生物学在组织工程生物材料创新中的应用与前景 | 系统阐述了利用工程化微生物生产生物材料的新策略及其在组织工程中的创新应用 | 面临技术挑战,具体限制未详细说明 | 探讨微生物合成生物学在组织工程生物材料开发中的应用 | 工程化微生物及其生产的生物材料 | 合成生物学 | NA | 微生物基因组改造、代谢调控 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物宿主 | 代谢途径工程 | 医学 |
| 310 | 2025-10-05 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
|
综述 | 本文综述了高通量和基因组规模动力学建模的最新进展与未来发展方向 | 整合机器学习与机制性代谢模型、开发新型动力学参数数据库、使用定制化参数化策略 | NA | 推动动力学建模在系统和合成生物学、代谢工程及医学研究中的应用 | 动力学建模方法 | 机器学习 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机制性代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 311 | 2025-10-05 |
Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01512-w
PMID:39259478
|
研究论文 | 通过启动子捕获方法从南极微生物群落中鉴定出在多种假单胞菌门细菌中具有功能的广宿主范围启动子序列 | 首次从南极微生物群落中发现能在多种假单胞菌门细菌中工作的广宿主范围启动子序列 | 仅构建了约2000个克隆的文库,样本规模相对有限 | 扩展合成生物学可用生物元件的目录 | 南极微生物群落中的启动子序列 | 合成生物学 | NA | 启动子捕获方法 | NA | 基因序列数据 | 约2000个克隆,从中鉴定出13个功能启动子序列 | 启动子捕获 | Pseudomonas putida KT2440, Escherichia coli DH5α, Cupriavidus taiwanensis R1, Paraburkholderia phymatum STM 815, Ensifer meliloti 1021, Pseudomonas sp. UYIF39 | 启动子元件 | 工业生物技术 |
| 312 | 2025-10-05 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
|
研究论文 | 本文提出了两种用于精确工程化遗传传感器的互补方法:计算机筛选和机器学习辅助的正向工程 | 开发了基于大规模基因型-表型数据集的计算机筛选方法,以及可解释机器学习与生物物理模型相结合的正向工程方法 | NA | 开发能够定量精确工程化生物传感功能的方法 | 遗传传感器及其剂量响应特性 | 机器学习 | NA | 计算机筛选、机器学习 | 可解释机器学习模型、生物物理模型 | 基因型-表型数据集 | 大规模数据集 | NA | NA | 遗传传感器、剂量响应曲线、灵敏度(EC50)调节、反向剂量响应 | 工业生物技术 |
| 313 | 2025-10-05 |
The path to biotechnological singularity: Current breakthroughs and outlook
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108667
PMID:40744238
|
综述 | 探讨生物技术领域突破性进展及其向生物技术奇点发展的路径与展望 | 系统阐述基因编辑、合成生物学、人工智能等多技术融合带来的生物技术范式变革 | 未涉及具体实验数据支撑,主要基于现有技术发展的宏观分析 | 分析生物技术融合发展趋势及其社会影响 | 基因编辑、合成生物学、人工智能等前沿生物技术 | 生物技术 | 遗传疾病、癌症、退行性疾病 | CRISPR基因编辑、深度学习、干细胞技术、脑机接口 | 深度学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药、环境、工业生物技术 |
| 314 | 2025-10-05 |
Microalgal bioengineering for futuristic applications in synthetic and space biology
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108665
PMID:40738416
|
综述 | 探讨微藻生物工程在合成生物学和空间生物学中的前沿应用 | 整合CRISPR基因编辑与多组学、合成基因电路、人工智能等创新技术,开发适应太空环境的微藻系统 | NA | 通过合成生物学技术改造微藻,解决地球和太空环境中的生命支持资源短缺问题 | 微藻及其基因工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑、多组学技术、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 合成基因电路、代谢通路工程 | 环境,能源,太空探索 |
| 315 | 2025-10-05 |
Harnessing biological nitrogen fixation: Multi-scale engineering for self-sustaining agroecosystems
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108687
PMID:40803658
|
综述 | 探讨通过多尺度工程方法利用生物固氮技术构建自维持农业生态系统的研究进展 | 提出从微生物底盘固氮回路设计到根际微生物组重编程,再到工程固氮作物及生态系统水平田间应用的多尺度集成工程方法 | NA | 提高固氮效率并使作物具备生物固氮能力,以替代化学氮肥 | 固氮酶活性分子机制、非固氮宿主中的固氮效率提升策略、合成生物学固氮系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物底盘, 工程作物 | 固氮回路设计, 生物传感器, 代谢通路 | 农业 |
| 316 | 2025-10-05 |
Phage therapy against Klebsiella pneumoniae: An evolving perspective
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108689
PMID:40840758
|
综述 | 本文系统探讨了针对肺炎克雷伯菌的噬菌体疗法,分析了细菌-噬菌体协同进化动态,并提出了结合计算科学的综合治疗策略 | 整合临床案例与临床前研究评估联合策略,提出利用机器学习进行噬菌体表征和宿主互作预测的计算路线图 | NA | 推动噬菌体疗法从实验性治疗向标准化干预转变,解决抗菌素耐药性问题 | 肺炎克雷伯菌及其噬菌体 | NA | 细菌感染 | 噬菌体疗法、机器学习、合成生物学 | 机器学习 | NA | NA | NA | 肺炎克雷伯菌 | NA | 医学 |
| 317 | 2025-10-05 |
Multidimensional strategies for efficient heterologous protein expression in Aspergillus niger
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108690
PMID:40845950
|
综述 | 本文总结并讨论了通过多维度策略提高黑曲霉异源蛋白表达效率的最新进展 | 从表达系统、分泌途径、代谢通量、智能发酵和多组学整合五个维度系统优化黑曲霉异源蛋白生产 | 由于不同蛋白质特性各异,构建通用的黑曲霉底盘细胞仍面临挑战 | 提高黑曲霉异源蛋白表达效率 | 黑曲霉异源蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程策略、多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | NA | 工业生物技术 |
| 318 | 2025-10-05 |
Engineering plant hosts for high-efficiency accumulation of flavonoids: Advances, challenges and perspectives
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108692
PMID:40850536
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综述 | 本文总结了利用系统和合成生物学方法改造植物宿主以实现高效黄酮类化合物积累的研究进展、挑战与前景 | 提出通过系统和合成生物学方法精确调控黄酮类化合物生物合成路径的创新策略 | 当前在构建下一代高效黄酮生物合成植物宿主方面仍存在技术限制 | 为利用系统和合成生物学方法改造植物黄酮类化合物生物合成提供理论指导 | 植物黄酮类化合物的分布、生物合成途径及调控机制 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学、蛋白质工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 黄酮类化合物生物合成路径改造、代谢通量重平衡 | 农业 |
| 319 | 2025-10-05 |
Machine learning in predictive biocatalysis: A comparative review of methods and applications
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108698
PMID:40885347
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综述 | 比较分析机器学习在预测生物催化领域的方法与应用 | 系统比较了深度神经网络、卷积网络、图架构和Transformer等不同机器学习方法在生物催化预测中的优劣 | NA | 探讨机器学习在预测生物催化中的应用前景 | 酶功能预测、生物催化剂发现、反应建模和代谢途径优化 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 神经网络, 卷积网络, 图架构, Transformer | 生化数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 绿色生物催化 |
| 320 | 2025-10-05 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Sep-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
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研究论文 | 通过靶向染色质编辑揭示模拟表观遗传记忆机制 | 首次证明染色质修饰可维持连续梯度基因表达水平,揭示模拟表观遗传记忆的存在 | 未明确说明实验模型系统的具体局限性 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态 | DNA甲基化与组蛋白修饰的表观遗传调控系统 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、表观遗传效应器工程 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因组报告系统与表观遗传效应器 | 合成生物学 |