本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-05 |
Bioprinting and synthetic biology approaches to engineer functional endocrine pancreatic constructs
2025-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.005
PMID:40185667
|
综述 | 本文探讨了生物打印和合成生物学在构建功能性内分泌胰腺组织中的最新进展 | 将合成生物学、细胞工程与生物打印技术相结合,为开发先进体外模型和可移植移植物开辟新途径 | NA | 开发能够模拟器官功能的内分泌胰腺组织构建体,为糖尿病治疗提供新方案 | 内分泌胰腺组织构建体 | 组织工程 | 糖尿病 | 生物打印 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 362 | 2025-10-05 |
Bottom-up development of lipid-based synthetic cells for practical applications
2025-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.009
PMID:40263003
|
综述 | 全面概述自下而上构建脂质基合成细胞的当前技术状态及其实际应用前景 | 系统总结了从概念验证到实际应用过渡阶段的关键设计原则、材料和制造技术 | NA | 推动合成细胞技术从概念验证向实际应用转化 | 脂质基合成细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 生物传感器, 生物生产, 疫苗开发, 环境修复 |
| 363 | 2025-10-05 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
|
研究论文 | 开发了一种基于细菌记忆电路的生物传感器筛选平台,用于从多种肠道细菌中识别宿主诱导的生物传感器 | 使用超变DNA条形码并行追踪数千个独特克隆,扩展了生物传感器筛选平台的灵活性和能力 | 肠道内感知健康和疾病相关条件的特征化电路组件仍然有限 | 促进快速生物传感器工程,推进复杂环境中合成生物学工具的开发 | 肠道细菌来源的传感组件和生物传感器 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | 双组分系统识别和克隆流程,超变DNA条形码标记 | NA | NA | 约150个推定的生物传感器,数千个独特克隆 | 细菌记忆电路 | 肠道细菌,小鼠模型 | 双组分系统,生物传感器,感应-响应治疗 | 医学,临床研究 |
| 364 | 2025-10-05 |
The Global Decarbonisation Potential of Synthetic Biology
2025-Sep, Global change biology
IF:10.8Q1
DOI:10.1111/gcb.70478
PMID:40905760
|
综述 | 评估合成生物学技术在实现全球脱碳目标方面的潜力及其量化分析 | 采用自上而下的方法量化不同合成生物学应用的脱碳潜力,并首次系统比较各技术路径对碳价格和土地价格的敏感性 | 采用宏观层面的估算方法,未涉及具体技术实施细节和区域差异性分析 | 评估合成生物学技术对气候变化减缓的长期贡献潜力 | 合成生物学在能源、农业、工业等领域的脱碳应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业, 能源 |
| 365 | 2025-10-05 |
Construction of complex bacteriogenic protocells from living material assembly
2025-Sep, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01148-6
PMID:40044914
|
研究论文 | 提出利用原核生物作为构建模块制备细菌源原细胞的新方法 | 开发基于空间分离细菌菌落捕获的活材料组装策略,构建具有高复杂度的膜结合合成细胞 | 实验周期较长(约27天),需要微生物学、相分离、生物化学和分子生物学等多领域专业知识 | 构建具有高度组织和功能复杂度的类生命合成细胞 | 细菌源原细胞 | 合成生物学 | NA | 相分离、微生物培养、分子生物学技术 | NA | NA | NA | 活材料组装 | 原核生物 | 具有多种原始细胞器的合成细胞结构,包括核样DNA/组蛋白凝聚体、膜结合水泡、F-肌动蛋白原细胞骨架和原线粒体 | 工程合成生物学, 生物医学 |
| 366 | 2025-10-05 |
Combing Directed Enzyme Evolution with Metabolic Engineering to Develop Efficient Microbial Cell Factories
2025-Aug-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00002
PMID:40901576
|
综述 | 本文综述了将定向酶进化与代谢工程相结合开发高效微生物细胞工厂的策略与方法 | 系统整合传统与数据驱动的定向进化策略(包括随机文库设计、半理性设计、智能文库设计和连续进化)与代谢工程方法,突破经典代谢工程仅关注基因表达水平的局限 | 未具体说明应用案例的详细实验数据,主要聚焦于方法论层面的讨论 | 开发高效微生物细胞工厂以实现可再生原料的可持续化学生产 | 微生物细胞工厂中的酶蛋白和代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向进化、蛋白质工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 367 | 2025-10-05 |
Yeasts in traditional Baijiu fermentation: diversity, functions, microbial interactions and applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1652173
PMID:40901081
|
综述 | 系统总结中国传统白酒发酵过程中酵母菌的多样性、功能、微生物互作及应用研究进展 | 整合多组学技术揭示非酿酒酵母功能特性及微生物互作机制,提出合成生物学指导菌株开发的新方向 | 主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证 | 深入理解白酒发酵过程中酵母菌的生态功能并推动优质智能化白酒生产 | 白酒发酵过程中的酵母菌群落 | 微生物生态学 | NA | 高通量测序,宏基因组学,多组学技术 | NA | 基因组数据,代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 酵母菌 | NA | 食品,工业生物技术 |
| 368 | 2025-10-05 |
Advances in adaptive laboratory evolution applications for Escherichia coli
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.07.011
PMID:40893470
|
综述 | 本文综述了大肠杆菌适应性实验室进化(ALE)应用的最新进展 | 整合高通量组学和分子工具与ALE技术,显著增强基因型-表型关系图谱构建和突变景观表征 | NA | 探讨ALE在大肠杆菌研究中的方法原理、实验设计范式和应用进展 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 下一代测序, 分子生物学, 高通量组学 | NA | NA | NA | 适应性实验室进化(ALE) | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 369 | 2025-10-05 |
Current advancements in the investigation of mitochondria-targeting organic sensitizers in cancer immunotherapy
2025-Sep-05, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm01193k
PMID:40910367
|
综述 | 系统总结线粒体靶向有机敏化剂在癌症免疫治疗中的最新研究进展 | 聚焦2023-2025年新兴的线粒体靶向有机敏化剂,揭示其通过破坏线粒体稳态诱导多种程序性细胞死亡并协调抗肿瘤免疫应答的创新机制 | 存在线粒体靶向效率受跨膜转运和肿瘤微环境pH波动影响、金属有机复合物非特异性金属离子释放的全身毒性风险、长期生物相容性评估不足、以及主要依赖简化肿瘤模型未能充分反映临床异质性等问题 | 探讨线粒体靶向有机敏化剂在癌症免疫治疗中的应用潜力 | 线粒体靶向有机敏化剂及其介导的免疫调节机制 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 370 | 2025-10-05 |
Structural basis of the RNA-mediated Retron-Eco2 oligomerization
2025-Sep-02, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00823-y
PMID:40897710
|
研究论文 | 本研究揭示了Retron-Eco2抗噬菌体防御系统的结构与功能机制 | 首次解析了Retron-Eco2形成自抑制性三聚体组装的分子机制,并发现其效应结构域具有RNase活性 | NA | 阐明Retron-Eco2抗噬菌体防御系统的结构与功能机制 | Retron-Eco2复合物(包含ncRNA、msDNA和RT-Toprim融合蛋白) | 结构生物学 | NA | 结构生物学分析 | NA | 结构数据 | NA | NA | 细菌 | 抗噬菌体防御系统 | 生物技术,合成生物学 |
| 371 | 2025-10-05 |
AlphaDesign: a de novo protein design framework based on AlphaFold
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00119-z
PMID:40527958
|
研究论文 | 介绍基于AlphaFold的从头蛋白质设计框架AlphaDesign,能够快速生成具有可控相互作用、构象和寡聚状态的蛋白质 | 将AlphaFold与自回归扩散模型相结合,无需类别依赖的模型重新训练或微调即可实现蛋白质设计 | NA | 开发通用的从头蛋白质设计框架 | 蛋白质设计与细菌噬菌体防御系统抑制剂 | 合成生物学 | NA | 自回归扩散模型 | AlphaFold, 扩散模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 372 | 2025-10-05 |
Scale-dependent analysis of structure and electrical activity in kombucha mats and proteinoid-actin assemblies
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146385
PMID:40796039
|
研究论文 | 本研究详细分析了康普茶菌膜和类蛋白-肌动蛋白组装体在不同尺度下的结构特性和电活动模式 | 揭示了生物系统中类分形模式与真实分形几何的关键区别,证明复杂组织和电活动可在不具备完全自相似性的情况下产生 | NA | 探索生物和预生物系统中尺度依赖的结构特性和电活动模式 | 康普茶菌膜和类蛋白-肌动蛋白组装体 | 复杂系统生物学 | NA | 非线性热感应响应分析,电活动模式分析 | NA | 结构数据,电活动数据 | NA | NA | NA | NA | 仿生材料科学,合成生物学 |
| 373 | 2025-10-05 |
Synthetic biology: pioneering the next bio revolution for a sustainable planet
2025-Sep-01, Journal of applied microbiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jambio/lxaf202
PMID:40833632
|
综述 | 本文探讨微生物合成生物学在推动生物基经济发展和应对环境挑战中的作用 | 系统整合微生物合成生物学在多领域的应用案例,强调其向生物基经济转型的变革潜力 | NA | 阐明微生物合成生物学在解决污染、粮食安全、能源需求等全球挑战中的贡献 | 微生物合成生物学的技术应用和发展趋势 | 合成生物学 | NA | 基因工程、生物合成 | NA | 多学科研究数据 | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 藻类, 异养微生物, 米曲霉, 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 生物传感器, 代谢通路工程 | 环境, 能源, 农业, 医药, 材料, 工业生物技术 |
| 374 | 2025-10-05 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2025-Sep-01, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
|
综述 | 本文综述了微生物来源抗癌化合物的发现、生物工程改造及治疗应用的最新进展 | 整合人工智能与纳米技术加速微生物来源抗癌药物的发现和递送系统开发 | 缺乏体内验证和全面的药代动力学数据,临床转化面临挑战 | 加速微生物来源抗癌化合物的发现和临床应用 | 微生物代谢产物及其衍生的抗癌化合物 | 机器学习 | 癌症 | 人工智能、机器学习、分子对接、定量构效关系建模 | QSAR模型 | 化学结构数据、生物活性数据 | NA | 合成生物学 | 微生物菌株 | 生物活性化合物增强生产途径 | 医药 |
| 375 | 2025-10-05 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671382
PMID:40894645
|
研究论文 | 开发了一种基于机器学习的细胞游离生物传感器优化方法,用于饮用水铅检测 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离基因表达工作流程,通过定向标记捕获aTF突变对性能的影响 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器性能,用于环境监测和人类健康 | PbrR变构转录因子及其在铅检测中的应用 | 合成生物学 | 重金属污染相关健康风险 | 机器学习,细胞游离基因表达,定向进化 | 机器学习模型 | 序列到功能数据 | NA | 细胞游离系统 | 无细胞表达系统 | 基于aTF的生物传感器,铅检测电路 | 环境,医疗诊断 |
| 376 | 2025-10-05 |
Toward a monocot SynBio toolkit: assessing regulatory element performance and eudicot compatibility
2025-Aug-08, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03583-x
PMID:40779074
|
研究论文 | 本研究构建并评估了一个包含80个遗传调控元件的组合库,用于单子叶植物的合成生物学应用 | 开发了新颖的CaMV 35S启动子与病毒5'UTR序列组合,其表达水平接近强病毒启动子融合;新发现的植物小热休克蛋白3'UTR序列能显著增强报告基因表达 | 研究主要基于玉米原生质体和本氏烟的瞬时表达系统,尚未在完整植株中进行长期验证 | 解决禾谷类作物和禾草遗传工程中合适调控元件相对缺乏的问题 | 玉米原生质体和本氏烟叶片 | 合成生物学 | NA | 原生质体转化、农杆菌浸润、荧光测定 | NA | 荧光表达数据 | 80个遗传调控元件组合,在两种植物系统中测试 | 农杆菌浸润 | 玉米, 本氏烟 | 遗传调控元件组合库,包括启动子、5'UTR、启动子-5'UTR融合和3'UTR序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 377 | 2025-10-05 |
Advancements in DNA-Driven Precision Modulation of Cell Surface Receptor for Programmable Cellular Functions
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505073
PMID:40588818
|
综述 | 本文系统总结了基于DNA的受体工程策略在精确调控细胞表面受体功能方面的最新进展 | 整合遗传和非遗传DNA工程策略,利用DNA纳米结构、功能性核酸和可编程动态DNA反应实现受体功能的多维调控 | NA | 开发精确调控细胞表面受体的DNA工程策略,推动智能细胞系统发展 | 细胞表面受体及其信号传导机制 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、DNA折纸、功能性核酸 | NA | NA | NA | DNA纳米结构、DNA逻辑电路、DNA纳米机器人 | 哺乳动物细胞 | DNA逻辑电路、DNA纳米机器人、受体二聚化和寡聚化调控 | 医学 |
| 378 | 2025-10-05 |
A simple and universal quasi-modular cloning system using NEBuilder® HiFi DNA assembly kit
2025 May-Jun, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2542012
PMID:40819309
|
研究论文 | 开发了一种基于NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒的准模块化克隆系统,用于非模式生物的基因工具开发 | 将NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒扩展为使用单链寡核苷酸桥接的准模块化系统,无需限制性内切酶即可组装可重复使用的DNA片段 | NA | 开发适用于非模式生物系统的通用准模块化克隆方法 | 厌氧肠道真核生物ST7-B | 合成生物学 | NA | NEBuilder HiFi DNA组装 | NA | NA | NA | NEBuilder HiFi DNA Assembly Kit | ST7-B | 启动子-终止子组合载体 | 工业生物技术 |
| 379 | 2025-10-05 |
Mapping variation in dual use risk assessments of synthetic biology projects
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1620678
PMID:40895722
|
研究论文 | 本研究通过评估合成生物学项目的双重用途风险,揭示了专家和学生评审员在风险评估和管理策略上的显著差异 | 首次对现实世界合成生物学项目进行双重用途风险评估的实证研究,揭示了评审员间风险评估和管理策略的显著不一致性 | 样本量相对有限(18名专家和49名学生),仅评估了四个合成生物学项目 | 研究合成生物学项目双重用途风险评估的一致性和准确性 | 四个现实世界合成生物学项目的风险评估和管理策略 | 生物安全与风险管理 | NA | 风险评估框架 | NA | 专家评审数据 | 18名经验丰富的DURC评审员和49名合成生物学学生 | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 380 | 2025-10-05 |
Versatile Applications of CRISPR-Based Programmable T-DNA Integration in Plants
2025-Sep-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70353
PMID:40905066
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR的植物靶向T-DNA整合技术CRISTTIN,用于精确的基因功能研究和转基因表达控制 | 开发了CRISPR辅助的靶向T-DNA整合技术,相比传统Cas9具有更高的整合效率,实现了基因敲除和原位互补的并行操作 | 未明确说明该技术在其它植物物种中的适用性范围及整合效率的具体量化数据 | 开发植物基因组中精确的靶向T-DNA整合技术,用于基因功能研究和合成生物学应用 | 拟南芥和水稻植物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Agrobacterium介导的T-DNA整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 水稻 | 靶向T-DNA整合系统,基因敲除和报告基因整合 | 农业, 工业生物技术 |