合成生物学相关文章
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当前共找到 4691 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-02-26 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Feb-25, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 本研究基于反刍动物胃肠道宏基因组样本，构建了一个全面的反刍动物微生物基因组目录（CRMC），并系统揭示了维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在反刍动物与人类肠道中的趋同选择模式 | 构建了迄今为止最全面的反刍动物胃肠道微生物基因组目录（CRMC），并首次系统揭示了跨反刍动物宿主的维生素合成微生物在关键合成途径和基因节点上的趋同选择模式 | 研究主要基于宏基因组组装基因组（MAGs），可能无法完全覆盖低丰度或难培养的微生物类群 | 阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其跨宿主分布模式 | 反刍动物胃肠道微生物组，特别是维生素合成微生物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组序列数据 | 2,325个宏基因组样本，来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（8种） | NA | 农业，工业生物技术 |
| 362 | 2026-02-26 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 本文对精准发酵技术在可持续食品生产中的应用进行了系统综述，整合了微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度等多个方面 | 提供了一个整合微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度的统一框架，弥补了以往仅关注产品或特定生物的综述的不足 | 面临高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度以及监管不确定性等挑战 | 评估精准发酵技术在可持续食品生产中的应用、技术经济可行性和环境影响 | 精准发酵过程及其在食品生产中的应用 | NA | NA | 精准发酵、代谢途径工程 | NA | 文献数据 | 37项符合纳入标准的研究（包括实验室研究、工业案例研究、技术经济分析和生命周期评估） | 合成生物学 | 微生物宿主 | 代谢途径工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 363 | 2026-02-26 |
The rise and future of peptide-based antimicrobials
2026-Jan-30, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2510002
PMID:41736369
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综述 | 本文综述了肽类抗生素的兴起与未来，涵盖其发现、优化和应用的最新进展，包括结构分类、作用机制以及人工智能和合成生物学等新兴策略 | 整合了人工智能、合成生物学和现代递送技术等新兴策略，以应对抗菌素耐药性挑战，并系统分类肽类抗生素以指导其治疗潜力 | NA | 探讨肽类抗生素作为传统小分子药物替代品的潜力，以应对日益严重的抗菌素耐药性威胁 | 肽类抗生素，包括天然、半合成和全合成类型，以及其结构分类如α-螺旋、β-折叠、环状和延伸形式 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 364 | 2026-02-26 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 本文综述了生物铸造厂如何通过整合自动化、人工智能和标准化工作流程，推动高通量酵母工程向自主化和规模化方向发展 | 探讨了从DBTL（设计-构建-测试-学习）循环向自主优化的“自动驾驶实验室”和Design-Build-Deploy（设计-构建-部署）循环的转变趋势 | 仍存在协议可变性、AI工具整合不足以及国际标准、数据治理和伦理保障需要协调等关键障碍 | 推动酵母工程的高通量、自主化和规模化发展，以实现经济、可持续的大规模生物制造 | 酵母工程、生物铸造厂及其在菌株开发中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | 预测模型（AI驱动） | NA | NA | CRISPR-Cas9（提及基因组编辑，但未明确指定工具） | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 365 | 2026-02-26 |
Structure and encapsulation of carbonic anhydrase within the α-carboxysome
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523723122
PMID:41223214
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研究论文 | 本研究解析了α-羧化体内部碳酸酐酶的结构及其封装机制 | 首次揭示了CsoSCA的六聚体三聚体结构，证明其封装不依赖锌离子和连接蛋白CsoS2，并阐明了其在羧化体内部连接Rubisco与外壳的桥梁作用 | 研究主要基于合成微型外壳和细菌模型，体内完整羧化体的动态组装过程仍需进一步验证 | 阐明α-羧化体中碳酸酐酶的结构特征及其在微区室内的封装机制 | 化能自养细菌Halothiobacillus neapolitanus的α-羧化体碳酸酐酶CsoSCA | 结构生物学 | NA | 分子结构解析、合成微型外壳技术 | NA | 结构数据、生化实验数据 | NA | 合成生物学技术 | Halothiobacillus neapolitanus（化能自养细菌） | 羧化体微区室封装系统（包含Rubisco和碳酸酐酶的半透性蛋白质外壳） | 合成生物学、生物技术 |
| 366 | 2026-02-26 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文通过化学探测和荧光淬灭实验，揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证调控机制 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 结构探测数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 367 | 2026-02-26 |
Compliant DNA Origami Nanoactuators as Size-Selective Nanopores
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405104
PMID:39014922
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研究论文 | 本文介绍了一种可重构的DNA折纸纳米孔，其孔径可通过分子触发器调节，实现了尺寸选择性跨膜运输 | 结合DNA折纸纳米技术、机械启发设计和合成生物学，创建了具有可调孔径和可逆构象变化的纳米孔，克服了传统生物纳米孔孔径固定的限制 | NA | 开发一种可调节孔径的纳米孔技术，以扩展其在生物物理学和生物技术中的应用 | DNA折纸纳米孔（MechanoPore）及其在脂质体膜中的重构与功能 | 合成生物学 | NA | DNA折纸纳米技术、3D-DNA-PAINT超分辨率成像、染料流入测定、倒置乳液cDICE技术、共聚焦成像 | NA | 图像数据（超分辨率和共聚焦成像） | NA | DNA折纸 | 脂质体（人工膜系统） | 可重构纳米孔（MechanoPore），具有三个稳定状态和可调孔径的机械开关 | 药物递送, 生物分子分选, 传感, 合成生物学 |
| 368 | 2026-02-26 |
Synthetic biology: at the crossroads of genetic engineering and human therapeutics-a Keystone Symposia report
2021-12, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.14710
PMID:34786712
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会议报告 | 本文总结了2021年5月3日至4日举行的Keystone eSymposium，探讨了合成生物学在细胞和基因疗法中的潜在应用 | 强调合成生物学在人类治疗中的临床应用，而非技术细节，并讨论了多种疗法（如T细胞、基因、病毒疗法和益生菌）的工程化改进 | NA | 探索合成生物学如何转化细胞和基因疗法以治疗多种疾病 | 真核和原核细胞，包括T细胞、基因疗法、病毒疗法和益生菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 真核细胞, 原核细胞 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢途径 | 医学 |
| 369 | 2026-02-25 |
Exploring marine-derived compounds as potential anti-cancer agents: Mechanisms and therapeutic implications
2026-May, Cancer pathogenesis and therapy
DOI:10.1016/j.cpt.2025.08.004
PMID:41732213
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综述 | 本文全面综述了海洋来源化合物作为潜在抗癌剂的机制、治疗应用及临床发展 | 系统总结了海洋来源化合物的多样化抗癌机制，并强调了通过海洋生物技术、合成生物学及新型给药系统克服其应用限制的未来方向 | 海洋来源化合物存在产量低、结构复杂、水溶性差和生物利用度有限等挑战，阻碍了其更广泛的临床应用 | 探索海洋来源化合物作为抗癌剂的潜力，包括其作用机制、治疗应用及临床转化 | 海洋来源的化合物（如生物碱、多糖、肽类、萜类、聚酮类）及其抗癌活性 | NA | 癌症 | 基因组挖掘、合成生物学、发酵技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 370 | 2026-02-25 |
Toehold-VISTA: a machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag097
PMID:41693568
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研究论文 | 提出一种名为Toehold-VISTA的机器学习框架，用于快速设计高性能RNA传感器，并成功应用于SARS-CoV-2 RNA检测 | 结合生物物理建模与机器学习（偏最小二乘判别分析），通过高通量实验数据训练预测模型，实现对RNA传感器性能关键决定因素的捕获 | 未明确说明模型在其他RNA传感器类型或更广泛靶标中的泛化能力 | 加速RNA传感器的设计与工程化，解决当前设计、生产和筛选高性能RNA传感器耗时长的挑战 | RNA传感器（以toehold switches为模型）与靶标RNA（如SARS-CoV-2 RNA）的相互作用 | 机器学习 | NA | 高通量实验测量、序列-结构特征提取 | 偏最小二乘判别分析（PLS-DA） | RNA序列与结构数据 | NA | NA | NA | RNA传感器（toehold switches） | 生物技术、诊断 |
| 371 | 2026-02-25 |
Genetic make-up and regulation of the L-lysine biosynthesis pathway in Vibrio natriegens
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.02.867
PMID:41732680
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研究论文 | 本研究分析了Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径的组成与调控，为将其开发为氨基酸过量生产菌株提供基础 | 发现了一种新的单功能天冬氨酸激酶同工酶Vn.LysC2，该酶对所有L-天冬氨酸家族氨基酸的变构抑制不敏感，并鉴定了L-天冬氨酸半醛脱氢酶和二氢二吡啶酸合酶的功能重复基因 | NA | 分析Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关氨基酸生物合成途径的遗传组成与调控机制，以支持未来的代谢工程应用 | Vibrio natriegens DSM759菌株及其L-赖氨酸和L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | RNA测序、基因删除突变体生长表型分析、酶活性测定 | NA | 基因组测序数据、转录组数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 372 | 2026-02-25 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
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研究论文 | 本文提出了一种名为Toehold-VISTA的机器学习框架，用于快速设计高性能RNA传感器，并成功应用于针对SARS-CoV-2 RNA的传感器设计 | 结合生物物理建模与机器学习（PLS-DA框架），通过高通量实验数据训练预测模型，实现了对RNA传感器性能关键决定因素的捕捉与优化设计 | NA | 加速RNA传感器的设计与工程化，解决传统设计方法耗时长的挑战 | RNA传感器（以toehold switches为模型）与靶标RNA（如SARS-CoV-2 RNA）的相互作用 | 机器学习 | NA | 高通量实验测量、序列-结构特征提取、生物物理建模 | PLS-DA（偏最小二乘判别分析） | RNA序列与结构数据 | NA | NA | NA | RNA传感器（toehold switches） | 生物技术、诊断应用 |
| 373 | 2026-02-24 |
Construction and analysis of a cell factory for terpenoid biosynthesis in Pichia pastoris via metabolic engineering and metabolomics
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.015
PMID:41725898
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和代谢组学方法，在毕赤酵母中构建并分析了一个用于萜类化合物生物合成的通用细胞工厂 | 开发了一种“即插即用”的细胞工厂，通过增强MVA途径表达和减少分支途径分流策略，实现了多种萜类化合物的高效合成，并利用系统生物学分析揭示了关键蛋白拷贝数增加对精氨酸等代谢途径的影响 | 菌株的鲁棒性和紧密调控的代谢网络限制了理性代谢工程改造的潜力 | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 毕赤酵母作为宿主细胞，用于生产β-榄香烯、β-法尼烯、(+)-瓦伦烯、(-)-α-红没药醇等萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、代谢组学、系统生物学分析 | NA | 代谢物数据 | 不同工程菌株 | 代谢工程 | 毕赤酵母 | 增强MVA途径表达和减少分支途径分流的通用萜类化合物生物合成细胞工厂 | 医药、保健品、香料 |
| 374 | 2026-02-24 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Feb-22, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
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研究论文 | 本文报道了通过共递送短双链非同源寡核苷酸（dsNHO）可显著提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率 | 发现了非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，可将基因敲除效率提高高达100倍，并揭示了其通过干扰DNA双链断裂传感通路来促进易错修复的机制 | 研究主要基于莱茵衣藻模型，在其他生物中的普适性需进一步验证 | 提高CRISPR/Cas系统在莱茵衣藻中的基因敲除效率，以促进合成生物学应用 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | NA | 工业生物技术 |
| 375 | 2026-02-24 |
Harnessing endophytes and Multi-Omics for sustainable Colchicine biosynthesis
2026-Feb-18, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04790-8
PMID:41706338
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综述 | 本文综述了利用内生菌和多组学技术促进濒危药用植物Gloriosa superba可持续生产秋水仙碱的系统性策略 | 提出将内生菌生物学与多组学技术、合成生物学整合的系统级合成框架，将秋水仙碱生物合成重新定义为植物-微生物协同代谢网络 | NA | 开发可持续、可扩展的秋水仙碱生产方法，同时支持Gloriosa superba的保护 | Gloriosa superba（植物）、其相关的内生真菌和细菌 | 合成生物学 | 痛风、关节炎、癌症、炎症性疾病 | 多组学分析（转录组学、蛋白质组学、代谢组学）、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | 异源微生物宿主 | 秋水仙碱合成途径重建 | 医药 |
| 376 | 2026-02-24 |
T Cell Receptor Co-Stimulation Through Magnetogenetic Tools: A Platform for Wireless Rewiring of Cellular Signaling
2026-Feb-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c10000
PMID:41726657
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研究论文 | 本文介绍了一种用于T细胞受体共刺激的磁遗传学平台，利用磁场实现T细胞的无创激活 | 开发了一种无线、磁控的磁遗传学工具，作为TCR信号的可调共刺激器，结合抗原刺激增强T细胞激活 | NA | 探索合成生物学策略以控制细胞功能，用于治疗应用，特别是免疫细胞行为的精确调控 | HEK293细胞、Jurkat细胞和原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | 钙成像、qPCR、蛋白质组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | HEK293, Jurkat, 原代人T细胞 | 磁遗传学平台，涉及工程化TRPV1、TRPV4和电磁感知基因（EPG）构建体 | 医学 |
| 377 | 2026-02-24 |
APMSR: an intelligent QA system for synthetic biology empowered by adaptive prompting and multi-source knowledge retrieval
2026-Feb-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38006-8
PMID:41644613
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研究论文 | 本文提出了一种名为APMSR的优化策略，通过自适应提示生成与多源知识检索相结合，构建了一个面向合成生物学领域的智能问答系统 | 提出了结合自适应提示生成与基于LinUCB算法的动态多源知识检索的优化策略，有效平衡探索与利用，提升了领域特定信息检索的相关性和精确度 | NA | 解决合成生物学领域专业问答中大型语言模型存在的知识鸿沟和幻觉问题，提升问答系统的准确性和鲁棒性 | 面向合成生物学领域的智能问答系统 | 自然语言处理 | NA | 自适应提示生成、多源知识检索、LinUCB算法 | 大型语言模型 | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 378 | 2026-02-24 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 本研究在嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了高通量核基因组工程框架，并验证了基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了C. merolae中40个基因间位点作为中性整合位点，并建立了机器人辅助的高通量转化方法 | 研究仅针对C. merolae这一特定藻类物种，结论在其他生物中的普适性尚未验证 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响，建立合成生物学底盘生物的基因组工程平台 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间位点（覆盖16条染色体），验证了38个位点 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae（嗜热嗜酸红藻） | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 379 | 2026-02-24 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程化细菌在癌症治疗中的最新进展，重点探讨了遗传电路设计如何提升肿瘤特异性、调控治疗递送和激活宿主免疫系统 | 通过组合遗传电路策略实现细菌疗法的可编程时空控制和群体行为调控，推动细菌从简单定植剂向多功能治疗平台的转变 | 未提及具体实验数据或临床转化中的具体技术障碍细节 | 探讨如何通过理性工程化设计下一代微生物癌症疗法 | 工程化细菌及其遗传电路在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤特异性靶向电路、治疗载荷释放调控电路、免疫调节电路、时空控制电路和群体行为电路 | 医学 |
| 380 | 2026-02-24 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-03, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子，系统表征了Komagataella phaffii中Mxr1转录因子的九个氨基酸反式激活结构域（9aaTADs）的功能与机制 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面鉴定21个推测的9aaTADs，发现其中10个具有功能，并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制激活转录 | 研究主要基于Δmxr1突变株的体外功能验证，体内生理环境下的调控网络及与其他转录因子的相互作用尚未完全阐明 | 探究K. phaffii中Mxr1转录因子的9aaTADs结构域的功能特性与分子机制 | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母）的Mxr1转录因子及其9aaTADs结构域 | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除株功能互补、靶基因转录激活分析 | NA | 分子生物学实验数据 | 21个推测的9aaTADs结构域（包括TAD A-V） | 合成生物学设计（合成转录因子构建） | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母） | 由Mxr1ZF DNA结合域与串联9aaTADs组成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |