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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-05 |
Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335
PMID:40628054
|
综述 | 本文综述藻类在食品生物技术中的进展,重点关注其在营养和肠道微生物健康方面的应用 | 系统阐述合成生物学和发酵技术在藻类营养强化及新型功能食品开发中的应用创新 | NA | 探讨藻类作为可持续食品资源的生物技术应用潜力 | 藻类及其生物活性成分 | 食品生物技术 | NA | 合成生物学、发酵技术、酶水解 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物系统 | NA | 食品、营养 |
| 422 | 2025-10-05 |
Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology
2024-04, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003
PMID:38355356
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综述 | 本文综述了靶向实体瘤抗原的嵌合抗原受体T细胞疗法,结合癌症生物学与合成免疫学视角探讨其发展现状 | 从癌症生物学和基因调控角度系统分析实体瘤靶抗原,并整合新兴合成生物学策略在细胞免疫治疗中的应用 | NA | 探讨实体瘤靶向CAR-T细胞疗法的发展现状和未来方向 | 实体瘤靶抗原和嵌合抗原受体T细胞疗法 | 合成免疫学 | 实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA | NA | T细胞 | 嵌合抗原受体设计 | 医学 |
| 423 | 2025-10-05 |
Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots
2025-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01133-5
PMID:40097832
|
研究论文 | 开发了一种在活细胞内合成生物相容性量子点的新方法 | 通过精确时空序列耦合细胞内代谢途径实现活细胞合成量子点,并建立仿细胞内环境的无细胞合成系统 | NA | 开发生物相容性量子点的合成方法 | 量子点 | 合成生物学 | NA | 活细胞合成,无细胞合成系统 | NA | NA | 酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞、MDCK细胞 | 代谢工程 | 酿酒酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞、MDCK细胞 | 代谢途径耦合 | 医学 |
| 424 | 2025-10-05 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-12, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
|
研究论文 | 开发了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的方案,制造出无法分裂但能抵抗环境压力的细胞-材料混合体 | 首次实现了细菌细胞内合成聚合物网络的组装,创造了兼具合成材料工程简易性和天然细胞功能性的新型细胞底盘 | 需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术等专业知识,功能化扩展需要合成基因电路工程和水凝胶聚合化学技能 | 开发结合合成材料工程简易性和天然细胞功能性的新型细胞底盘 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | NA | NA | 细胞内水凝胶化 | 细菌 | 合成聚合物网络 | 生物技术、生物医学工程、活体治疗 |
| 425 | 2025-10-05 |
Computational tools for plant genomics and breeding
2024-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2578-6
PMID:38676814
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综述 | 本文综述了植物基因组学和作物育种领域的计算工具及其应用进展 | 整合高通量测序与数据科学技术,在基因组组装、注释和表观遗传分析等方面取得突破,并推动作物复杂性状遗传解析、比较基因组学及深度学习生物序列设计三大发展方向 | NA | 探讨计算工具在植物基因组学与育种中的应用与发展方向 | 植物基因组与作物育种技术 | 生物信息学 | NA | 高通量测序, 深度学习 | 深度学习 | 基因组数据, 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 426 | 2025-10-05 |
Molecular logic gates based on programmable self-assembly of DNA origami triangles for the detection of nucleic acid molecules
2025-Aug-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15119-0
PMID:40783588
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA折纸三角形自组装的分子逻辑门平台,用于检测核酸分子 | 将DNA折纸纳米结构与分子逻辑门集成,实现了目标驱动的层次自组装和布尔逻辑运算 | NA | 开发可编程核酸检测平台,推动动态分子计算领域发展 | DNA折纸三角形结构、核酸分子生物标志物 | 分子纳米技术 | 肺癌 | DNA折纸、原子力显微镜(AFM)、链置换技术 | 布尔逻辑门(YES、AND、OR) | 纳米尺度图像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 基于DNA折纸三角形的分子逻辑门(YES、AND、OR)、可重置自适应反馈系统 | 医学诊断、合成生物学、纳米医学 |
| 427 | 2025-10-05 |
Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of polyhydroxyalkanoates
2025-Aug-04, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovaf096
PMID:40674061
|
研究论文 | 本研究通过宏基因组分析和定向培养基开发,从海洋环境中筛选出102株PHA生产菌株,并建立了高通量筛选平台 | 开发了结合尼罗红荧光强度与PHA含量定量关联的高通量筛选方法,有效解决荧光筛选假阳性问题,并发现一株高性能新菌株Halomonas olivaria | NA | 开发可持续生产生物可降解材料聚羟基脂肪酸酯的微生物资源和生产技术 | 海洋环境微生物群落和PHA生产菌株 | 工业生物技术 | NA | 宏基因组分析, 气相色谱, 荧光定量, 高通量筛选 | NA | 基因组数据, 化学分析数据 | 102株PHA生产菌株,来自不同海洋栖息地包括咸淡水界面和深海沉积物 | NA | Halomonas olivaria | NA | 材料, 环境, 工业生物技术 |
| 428 | 2025-10-05 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
|
研究论文 | 提出了一个合成生物学市场框架以统一对其商业潜力的理解 | 区分专业合成生物学市场与更广泛的产品市场,并提出专门的市场框架 | NA | 构建合成生物学市场框架以明确其商业潜力 | 合成生物学市场及其商业潜力 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 429 | 2025-10-05 |
The XNA alphabet
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf635
PMID:40650979
|
综述 | 本文系统综述了糖修饰的异源核酸(XNA)的结构分类、构象特性及其在生物技术和合成生物学中的应用前景 | 提出了XNA字母表的概念,系统分类了能与天然核酸相互作用和正交的两类XNA系统,阐明了糖组分对XNA构象空间和杂交特性的决定性作用 | NA | 总结糖修饰XNA系统的构象行为原理及其在合成遗传学、核酸治疗等领域的应用潜力 | 糖修饰的异源核酸(XNA)系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学诊断, 纳米技术 |
| 430 | 2025-10-05 |
Direct and quantitative analysis of tRNA acylation using intact tRNA liquid chromatography-mass spectrometry
2025-05, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01086-9
PMID:39762443
|
研究论文 | 开发了一种基于完整tRNA液相色谱-质谱联用技术的直接定量分析tRNA酰化方法 | 首次使用完整tRNA的LC-MS方法直接监测aaRS活性,可检测低至0.23%的反应产率,并能检测传统方法无法检测的flexizyme酰化产物 | 需要分子生物学、液相色谱-质谱和无RNase技术的基础专业知识,完成实验至少需要5小时 | 开发定量分析tRNA酰化的新方法 | 氨基酰-tRNA合成酶(aaRSs)催化的tRNA酰化反应 | 分析化学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS),离子对反相色谱,高分辨率飞行时间质谱 | NA | 质谱数据 | NA | flexizyme | NA | NA | 合成生物学,基础研究 |
| 431 | 2025-10-05 |
Words Are Essential, but Underexamined, Research Tools for Microbes and Microbiomes
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00769-21
PMID:34463574
|
研究论文 | 本文探讨语言和隐喻在微生物及微生物组研究中作为科学建构工具的作用 | 首次系统分析隐喻如何塑造合成生物学和微生物组研究中与微生物工作的可能性 | NA | 研究语言工具如何构建科学观察和期望,确保所选工具适合研究目标 | 微生物研究中的语言和隐喻工具 | NA | NA | NA | NA | 文本分析 | NA | NA | 酵母, 细菌 | NA | 合成生物学, 微生物组研究 |
| 432 | 2025-10-05 |
Retooling Microbiome Engineering for a Sustainable Future
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00925-21
PMID:34463582
|
评论 | 讨论如何利用系统生物学和合成生物学工具重新设计微生物组工程方法以应对未来可持续发展挑战 | 提出将系统生物学、合成生物学、自动化和机器学习相结合的新工程范式,实现对微生物组的精确操控 | NA | 探讨如何改进微生物组工程方法以更好地应对可持续发展需求 | 微生物群落及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 非模式微生物、微生物组 | 代谢网络 | 环境,工业生物技术 |
| 433 | 2025-10-05 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-Aug-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
|
研究论文 | 本研究通过开发高通量5DFRETMA方法,系统解析了环境因素和序列特征对三链DNA稳定性的影响 | 开发了高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法,首次实现了多因素条件下三链DNA热稳定性和pH稳定性的预测 | NA | 揭示环境和序列因素如何调控三链DNA稳定性 | 三链DNA | 合成生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光共振能量转移数据 | 测试了414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 434 | 2025-10-05 |
Chemistry and biology of natural stilbenes: an update
2025-02-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00033a
PMID:39711130
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综述 | 系统回顾2009-2023年间发现的409种天然二苯乙烯类化合物,重点分析寡聚二苯乙烯的结构分类、仿生合成及生物活性 | 首次系统梳理近15年新发现的二苯乙烯类化合物,特别关注具有独特骨架的寡聚二苯乙烯及其绝对立体化学研究 | 仅涵盖2009-2023年间报道的化合物,未涉及更早期的研究成果 | 总结天然二苯乙烯类化合物的化学结构与生物活性研究进展 | 天然二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯 | 天然产物化学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 文献数据 | 409种新二苯乙烯化合物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 435 | 2025-10-05 |
Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00022f
PMID:39129507
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观点文章 | 介绍诺华公司在天然产物药物发现领域的工具、挑战和成功经验 | 整合基因组工程和数据科学等新技术,探索抗体药物偶联物、放射性配体疗法和xRNA药物等新治疗模式 | NA | 推动天然产物从早期研究向开发和临床应用转化 | 微生物菌株和分离的天然产物 | 药物发现 | NA | 基因组工程、数据科学、计算生物学、合成生物学 | NA | NA | 90,000个微生物菌株和20,000个分离的天然产物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 436 | 2025-10-05 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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综述 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法研究玫瑰孢链霉菌中达托霉素生物合成的调控机制 | 发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域存在两个突变,并鉴定出十个可用于代谢工程调控的正负调控基因 | NA | 通过基因组分析和合成生物学方法加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 玫瑰孢链霉菌及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 革兰氏阳性菌感染 | 基因组测序、代谢工程、合成生物学、诱变育种 | NA | 基因组序列数据 | 两种菌株(野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株) | 代谢工程,合成生物学,定向诱变 | 玫瑰孢链霉菌 | 达托霉素生物合成基因簇,包含九个翻译偶联基因 | 医药 |
| 437 | 2025-10-05 |
Strategies for developing phages into novel antimicrobial tailocins
2024-10, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.03.003
PMID:38580606
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综述 | 本文综述了利用噬菌体作为支架开发新型尾蛋白抗生素的策略 | 提出通过合成生物学方法以具有收缩尾的噬菌体为支架开发尾蛋白,释放其抗菌潜力 | NA | 开发新型尾蛋白抗生素以解决天然尾蛋白多样性有限的问题 | 噬菌体尾部和尾蛋白的结构与功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 尾蛋白生物合成途径 | 医药 |
| 438 | 2025-10-05 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-09, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文总结了微生物进化工程领域的最新进展,重点介绍了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术增强微生物遗传多样性的方法 | 系统比较了多种现代诱变技术,特别强调通过合成生物学和CRISPR-Cas技术实现突变类型和位置的可控性 | 主要聚焦于模式微生物,未全面涵盖非模式工业微生物的应用 | 开发高效微生物进化工程技术以优化工业微生物性能 | 工业微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 寡核苷酸介导诱变, 重组酶技术, 聚合酶工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 模式微生物 | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 439 | 2025-10-05 |
Unveiling Amaryllidaceae alkaloids: from biosynthesis to antiviral potential - a review
2024-05-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00044c
PMID:38131392
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综述 | 本文综述了石蒜科生物碱从生物合成到抗病毒潜力的研究进展 | 整合了2017-2023年最新研究成果,强调合成和对映选择性研究在验证生物合成结论中的关键作用,并确立其作为抗病毒先导化合物的潜力 | 生物合成途径尚未完全阐明,需要进一步跨学科研究来理解结构-活性关系 | 系统梳理石蒜科生物碱的生物合成途径及其抗病毒应用潜力 | 石蒜科生物碱及其生物合成途径 | 天然产物化学与合成生物学 | 病毒性疾病 | 天然产物化学、合成有机化学、生物化学、系统生物学、合成生物学 | NA | 文献资料与实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 440 | 2025-10-05 |
Bacterial cyclophane-containing RiPPs from radical SAM enzymes
2024-05-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00030c
PMID:38047390
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综述 | 本文重点介绍由自由基SAM/SPASM酶催化的细菌单芳基环烷结构RiPPs天然产物的生物合成途径、发现方法和应用前景 | 系统总结了2016-2023年间细菌环烷结构RiPPs的研究进展,重点关注其独特的生物合成机制和药物开发潜力 | 仅聚焦于细菌来源的单芳基环烷RiPPs,未涵盖其他类型环烷结构或真核生物来源的RiPPs | 探讨含环烷结构的核糖体合成后修饰肽(RiPPs)的生物合成途径、酶学机制和应用价值 | 细菌来源的环烷结构RiPPs天然产物及其生物合成酶 | 天然产物化学 | 细菌感染 | 自由基SAM/SPASM酶催化 | NA | 文献综述 | NA | NA | 细菌 | NA | 药物发现, 合成生物学 |