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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-31 |
Fungal Innovations-Advancing Sustainable Materials, Genetics, and Applications for Industry
2025-Oct-06, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11100721
PMID:41149911
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综述 | 本文综述了真菌在可持续材料开发、遗传工程和工业应用中的创新潜力 | 重点关注合成生物学工具在真菌工程化中的应用,包括可编程调控器、CRISPR基因组编辑和组合通路优化 | 真菌复杂生物系统的控制和优化能力仍存在局限 | 探索真菌在可持续生物基技术中的潜力,促进各行业可持续发展 | 丝状真菌及其产生的刚性和柔性材料 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、组合通路优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 丝状真菌 | 可编程调控器、代谢通路优化 | 材料,能源,工业生物技术,环境 |
| 362 | 2025-10-31 |
From Bench to Bedside: Emerging Paradigms in CAR-T Cell Therapy for Solid Malignancies
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505822
PMID:40855662
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综述 | 本文综述CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的新兴范式与挑战 | 系统总结CRISPR编辑、现货型异体CAR-T、AI驱动靶点发现及合成生物学等前沿技术突破 | 主要基于早期临床试验数据,长期疗效与安全性仍需验证 | 探索提升CAR-T疗法在实体瘤中疗效的策略与方法 | 胃癌、肝癌、胶质瘤等实体恶性肿瘤 | NA | 实体恶性肿瘤 | CRISPR基因编辑、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞、NK细胞、巨噬细胞 | 嵌合抗原受体设计、细胞因子装甲策略 | 医学 |
| 363 | 2025-10-30 |
An efficient CRISPR-Cas12a tool for iterative genome editing, streamlined minimization, and payload engineering of Pseudomonas phage S1
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.09.019
PMID:41141487
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研究论文 | 开发了一种用于假单胞菌噬菌体S1的高效CRISPR-Cas12a基因组编辑工具 | 实现了近乎完全效率的基因编辑,完成了噬菌体领域最大的基因组缩减(13.9 kb) | NA | 推进噬菌体生物技术和治疗开发 | 假单胞菌噬菌体vB_PaeM_SCUT-S1 (S1) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 假单胞菌噬菌体 | 双质粒系统,支持基因删除、点突变、基因插入和替换 | 医药, 工业生物技术 |
| 364 | 2025-10-30 |
Expanding the biocatalytic and oxidative landscape of the old yellow enzyme family
2025-Nov, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70363
PMID:41158077
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和合成生物学技术,系统探索了古老黄色酶家族的自然多样性,显著扩展了其生物催化和氧化功能 | 发现了古老黄色酶家族成员在常温条件下广泛存在的反向氧化化学反应,并鉴定出具有增强催化活性或改变立体选择性的新型酶 | 仅对约115,000个家族成员中的118个酶进行了实验表征,大部分成员仍未探索 | 系统探索古老黄色酶家族的生物催化多样性并发现新型高效生物催化剂 | 古老黄色酶家族的115,000多个成员 | 合成生物学 | NA | 蛋白质相似性网络分析,生物信息学,合成生物学 | NA | 蛋白质序列数据,晶体结构数据 | >115,000个古老黄色酶家族成员,其中118个进行了实验表征 | NA | NA | NA | 工业生物技术,医药 |
| 365 | 2025-10-30 |
Gene silencing regulated by aggregates of Corn aptamer at 3' UTR of mRNA
2025-Oct-28, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00510h
PMID:41148632
|
研究论文 | 开发了一种通过在mRNA 3' UTR引入核酸自组装模块实现基因沉默的新策略 | 首次在mRNA 3' UTR引入核酸自组装模块形成RNA聚集体实现基因沉默,可构建多维转录后调控网络 | NA | 开发新型基因沉默技术并研究其调控机制 | 真核细胞中的mRNA翻译效率调控 | 合成生物学 | NA | 核酸自组装技术 | NA | mRNA和蛋白质表达水平数据 | NA | NA | 真核细胞 | 3' UTR自组装模块与5' UTR元件(如TOP序列)组合的多维转录后调控网络 | 医学 |
| 366 | 2025-10-30 |
A Lactose-Based Kluyveromyces lactis Cell-Free Protein Synthesis System
2025-Oct-23, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00011
PMID:41158605
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸克鲁维酵母的无细胞蛋白质合成平台,使用乳糖作为可持续碳源和能源 | 首次将乳糖作为碳源和能源整合到克鲁维酵母无细胞蛋白质合成系统中,并采用半自动化实验设计方法优化反应条件 | 仅验证了两种模型蛋白的合成效果,需要进一步测试更多蛋白质类型 | 开发可持续且经济高效的酵母无细胞蛋白质合成平台 | 乳酸克鲁维酵母无细胞提取物和蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、实验设计(DoE)、拉丁超立方实验设计 | NA | 蛋白质合成产量数据 | 测试了128种独特的CFPS反应混合物组成 | NA | Kluyveromyces lactis(乳酸克鲁维酵母) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 367 | 2025-10-30 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
|
研究论文 | 评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的影响 | 首次系统评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的协同促进作用,并通过转录组测序揭示其分子机制 | 仅使用纯葡萄糖和木糖作为碳源,未验证其他碳源或实际工业原料的效果 | 探究锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的促进效果及机制 | 土曲霉(Aspergillus terreus)及其衣康酸发酵过程 | 工业生物技术 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据、发酵性能数据 | NA | 合成生物学工具 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 衣康酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 368 | 2025-10-30 |
From single cells to communities: Mathematical perspectives on bacterial quorum sensing
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.09.030
PMID:41142755
|
综述 | 本文从数学角度综述细菌群体感应的建模方法及其应用前景 | 系统整合了从单细胞到群体水平的多种数学建模框架,并展望了在合成生物学和抗菌治疗等领域的应用潜力 | 未涉及具体的实验验证数据,主要聚焦于理论模型框架的讨论 | 探讨数学建模在理解细菌群体感应动力学中的作用 | 细菌群体感应机制及其数学建模方法 | 计算生物学 | NA | 数学建模 | 确定性模型、随机模型、空间模型 | 理论模型 | NA | NA | 细菌 | 群体感应系统 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 369 | 2025-10-30 |
Advances in yeast synthetic biology for human G protein-coupled receptor biology and pharmacology
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103176
PMID:39079313
|
综述 | 回顾酵母合成生物学在推动G蛋白偶联受体(GPCR)研究和药物开发方面的最新进展 | 利用酵母合成生物学技术为GPCR研究提供新的概念突破和技术创新 | NA | 解决GPCR信号传导、药理学和结构生物学研究中的挑战 | 人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学, 生物技术 |
| 370 | 2025-10-29 |
Actin Polymerizing Motors to Assist Cytoskeleton-like Networks Formation in Artificial Cells
2025-Oct-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12624
PMID:41100205
|
研究论文 | 本研究利用肌动蛋白聚合纳米马达辅助人工细胞内细胞骨架网络的形成 | 首次将肌动蛋白聚合纳米马达与人工细胞结合,模仿细菌运动机制实现主动推进 | NA | 开发能够模拟生物细胞机械响应功能的人工细胞系统 | 人工细胞和肌动蛋白聚合纳米马达 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白聚合反应、哺乳动物细胞裂解液环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 肌动蛋白丝聚合形成细胞骨架样网络 | 医学, 生物技术 |
| 371 | 2025-10-29 |
Specialized Pro-Resolving Mediator Loaded Extracellular Vesicles Mitigate Pulmonary Inflammation
2025-Oct-22, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 开发了一种基于合成生物学的策略,将促消退脂质介质加载到细胞外囊泡中,用于减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法在HEK293T细胞中共同表达多种酶,生产并包装促消退介质到细胞外囊泡中 | 未评估长期安全性和在其他炎症模型中的效果 | 开发装载促消退介质的细胞外囊泡用于炎症治疗 | 细胞外囊泡、促消退脂质介质、炎症反应 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体构建、细胞转染、脂质介质分析 | NA | 细胞实验数据、动物模型数据 | HEK293T细胞、THP-1巨噬细胞、LPS处理的小鼠 | 多基因表达载体 | HEK293T细胞 | 共同表达COX-2、5-LOX和15-LOX酶的代谢通路,用于合成Resolvin D和E系列介质 | 医学 |
| 372 | 2025-10-28 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-Oct-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
|
综述 | 本文综述紫杉烷生物合成途径解析及通过合成生物学策略开发可持续生产方法的研究进展 | 提出整合酶工程、代谢工程和人工智能引导的定向进化等策略,构建新型紫杉烷衍生物库 | 仅I型紫杉烷骨架生物合成途径接近完全解析,其他类型骨架途径仍不明确 | 阐明多种紫杉烷骨架生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类二萜天然产物及其生物合成酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因回路、人工智能引导定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢途径工程、基因回路 | 医药 |
| 373 | 2025-10-26 |
Survival by Design: The BWC's Autopoietic Response at Fifty to a Disaggregated Biosecurity Ecosystem
2025 Sep-Oct, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094251381803
PMID:41043961
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评论 | 本文分析《禁止生物武器公约》在日益复杂的全球生物安全生态系统中保持韧性的适应策略 | 将BWC概念化为自创生子系统,提出通过科学技术机制作为结构耦合装置来应对新兴生物技术挑战 | NA | 探讨BWC在生物技术快速发展背景下的适应性和有效性 | 《禁止生物武器公约》及其制度框架 | NA | NA | 合成生物学、生物信息学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2025-10-24 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
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研究论文 | 开发了一种名为MOSAIC的高效一步法重组工程方法,用于质粒编辑和多样化 | 使用单链DNA退火蛋白CspRecT实现高达90%的单靶点编辑效率,并能一次性在质粒四个不同区域生成组合质粒文库 | NA | 开发高效质粒编辑和组合质粒文库构建方法 | 质粒编辑和质粒文库构建 | 合成生物学 | NA | 重组工程,纳米孔测序 | NA | DNA序列数据 | NA | 重组工程,CspRecT | NA | 质粒编辑和多样化 | 分子生物学,合成生物学 |
| 375 | 2025-10-24 |
Broad-Host-Range Synthetic Biology: Rethinking Microbial Chassis as a Design Variable
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00308
PMID:40964802
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观点文章 | 本文探讨广宿主范围合成生物学如何将微生物宿主选择重新定义为设计变量 | 将宿主选择视为关键设计参数而非障碍,强调通过利用微生物多样性扩展生物技术设计空间 | NA | 重新定义微生物宿主在遗传设计中的作用 | 微生物宿主和工程遗传构建体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 模块化载体, 宿主无关遗传设备 | 多种微生物宿主 | 资源分配, 代谢相互作用, 调控串扰 | 生物制造, 环境修复, 治疗 |
| 376 | 2025-10-24 |
Computational Pipeline for Targeted Integration and Variable Payload Expression in Bacteriophage Engineering
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00450
PMID:40982657
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研究论文 | 开发了一种结合计算工具和经典基因组分析的噬菌体工程方法,用于靶向基因组有效载荷整合 | 使用基于机器学习的启动子预测工具PhagePromoter识别具有有利表达特征的基因间位点,建立了计算辅助的工程流程 | 仅在严格裂解性噬菌体K中验证了该方法,尚未在其他噬菌体系统中测试 | 扩展可行的遗传插入位点范围,增强噬菌体的治疗潜力 | 噬菌体基因组和生物发光报告基因 | 机器学习 | NA | 同源重组,启动子预测 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 三个重组噬菌体 | 同源重组 | 噬菌体K | 靶向基因组有效载荷整合系统 | 医药 |
| 377 | 2025-10-24 |
A functional and applied perspective of Vitreoscilla hemoglobin: from oxygen carriage to biotechnological innovation
2025-Sep-04, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03635-y
PMID:40908439
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综述 | 本文从功能和应用角度全面综述了透明颤菌血红蛋白的分子特性及其在生物技术领域的创新应用 | 整合了VHb转录因子相互作用、氧化还原偶联电子传递和定点诱变揭示的结构-功能关系等最新机制见解,并系统总结了vgb启动子作为强调控元件的新兴应用 | NA | 系统梳理透明颤菌血红蛋白的研究进展并展望其未来发展方向 | 透明颤菌血红蛋白(VHb)及其相关生物技术应用 | 合成生物学 | NA | 定点诱变、CRISPR调控表达平台、高细胞密度发酵 | NA | NA | NA | CRISPR | 哺乳动物系统、微生物 | 基于VHb的模块化组件 | 环境修复、精准农业、工业生物技术 |
| 378 | 2025-10-24 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面综述了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成途径及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识为甘草属研究提供独特而全面的视角,系统梳理活性成分生物合成途径与代谢工程策略 | NA | 为甘草分子育种和合成生物学领域的研究开发提供资源基础和理论支撑 | 甘草属植物及其活性成分(三萜类、黄酮类和多糖) | NA | NA | 多组学研究、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 医药 |
| 379 | 2025-10-24 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究开发了一种基于GP1糖蛋白PPSPX基序和pH敏感内含肽的蛋白质锚定与可控释放系统 | 发现PPSPX基序是蛋白质锚定微藻细胞壁的关键信号,并首次将pH敏感内含肽用于可控释放锚定蛋白 | NA | 开发蛋白质空间定位和可控释放的技术平台 | 微藻细胞壁锚定蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、荧光动力学、Western blot分析 | NA | 荧光数据、蛋白质印迹数据 | NA | 内含肽介导的蛋白质融合 | 微藻 | 基于GP1 PPSPX基序的蛋白质锚定系统和pH敏感内含肽介导的释放系统 | 靶向药物递送,环境生物传感,生物催化剂部署 |
| 380 | 2025-10-24 |
Bioactive compounds from deep-sea extremophiles: emerging potential in cosmeceuticals and nutraceuticals
2025-Jan-10, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/femsle/fnaf102
PMID:40996452
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综述 | 系统探讨深海极端微生物生物活性化合物在化妆品和营养保健品领域的应用潜力 | 聚焦深海极端微生物这一未充分开发的生物资源,阐明其活性成分在抗衰老和健康促进方面的独特作用机制 | 规模化生物加工存在技术瓶颈,商业化应用面临法规合规性挑战 | 评估深海极端微生物在化妆品和营养保健品领域的生物技术应用潜力 | 深海极端微生物产生的生物活性化合物(极端酶、胞外多糖、微生物色素等) | 生物技术 | NA | 宏基因组学、高通量筛选、合成生物学、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 化妆品 |