合成生物学相关文章
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当前共找到 3097 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-03-20 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jan-13, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感器信号放大电路，该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入 | 开发了一种新型的无细胞生物传感器信号放大电路PSR，通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收，显著提高了生物传感器的灵敏度 | 未提及具体的局限性 | 扩展无细胞生物传感器的功能，提高其检测小分子的灵敏度 | 无细胞系统中的基因表达和传感 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收（PSR） | NA | 核酸 | NA |
| 422 | 2025-03-20 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
|
研究论文 | 本文揭示了一种包含N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-His-1-羧酸盐（HExxH）结构域的单一翻译后修饰酶的结构和功能 | 首次展示了自由基SAM结构域和HExxH结构域在单一酶中的融合，并揭示了这种酶催化三残基环芳烃形成和β-羟基化的功能 | NA | 研究一种新型翻译后修饰酶的结构和功能 | 包含N端自由基SAM结构域和C端HExxH结构域的酶 | 酶学 | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | NA |
| 423 | 2025-03-20 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
|
研究论文 | 本文介绍了一种改进的Tn7转座子载体，用于控制染色体基因的表达 | 通过添加诱导型和组成型启动子，增强了mini-Tn插入载体的功能，实现了染色体上基因的差异转录控制 | 研究主要针对革兰氏阴性菌，未涉及其他类型细菌或真核生物 | 开发一种更灵活的染色体基因表达控制系统，以替代质粒在基因互补中的应用 | K-12菌株MG1655的染色体 | 合成生物学 | NA | 染色体整合技术 | NA | NA | NA |
| 424 | 2025-03-19 |
Development of CRISPR-Cas9-based genome editing tools for non-model microorganism Erwinia persicina
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.006
PMID:40092160
|
研究论文 | 本研究开发了基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具，用于非模式微生物Erwinia persicina的基因操作 | 成功应用CRISPR-Cas9系统于Erwinia persicina，通过优化gRNA设计和单质粒系统实现高效基因组编辑，并展示了其在合成生物学中的应用潜力 | 研究主要针对Erwinia persicina，未涉及其他非模式微生物的适用性验证 | 开发适用于非模式微生物Erwinia persicina的基因组编辑工具 | Erwinia persicina细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | NA |
| 425 | 2025-03-19 |
A dual light-controlled co-culture system enables the regulation of population composition
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.012
PMID:40092159
|
研究论文 | 本研究开发了一种双光控共培养系统，能够动态调节种群比例，为代谢工程和合成生物学提供通用工具包 | 利用优化的色适应传感器/调节器（CcaS/R）系统和蓝光激活的YF1-FixJ-PhlF系统作为诱导模块，结合正交群体感应系统和毒素-抗毒素系统，实现了种群比例的动态调控 | NA | 开发一种能够动态调节种群比例的双光控共培养系统，以优化生物生产性能 | 微生物共培养系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学系统，群体感应系统，毒素-抗毒素系统 | NA | NA | NA |
| 426 | 2025-03-19 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-Mar-17, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
|
研究论文 | 本文介绍了在合成细胞中直接表达RNA折纸细胞骨架模拟物的方法，以替代依赖化学合成和热退火的DNA纳米结构 | 使用RNA折纸技术直接在合成细胞中表达细胞骨架模拟物，实现了在等温条件下自组装成微米级三维RNA折纸纳米管 | NA | 探索基于RNA的活性、可进化的合成细胞 | 合成细胞中的RNA折纸细胞骨架模拟物 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | 分子动力学模拟数据 | NA |
| 427 | 2025-03-19 |
Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots
2025-Mar-17, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01133-5
PMID:40097832
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研究论文 | 本文开发了一种在活细胞中合成量子点（QDs）的方法，并验证了其在多种细胞中的可行性 | 通过耦合细胞内代谢途径，实现了在活细胞中精确时空序列下合成量子点，解决了传统有机溶剂中合成的量子点生物相容性差的问题 | 需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该过程 | 开发一种生物相容性更好的量子点合成方法，以扩展其在生物医学领域的应用 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae）、金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）、MCF-7细胞和MDCK细胞 | 材料科学 | NA | 活细胞合成、准生物合成 | NA | NA | 多种细胞类型（酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞和MDCK细胞） |
| 428 | 2025-03-19 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
|
研究论文 | 本文展示了如何将来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST重新用于人类细胞基因组中的可编程DNA整合 | 使用单Cas12k效应器的V-K CAST系统进行可编程DNA整合，相比需要三个Cas蛋白的Cascade系统更为简化 | 尽管脱靶事件较少，但仍会在特定基因组区域中重复出现 | 加速基因组编辑在治疗开发、生物技术和合成生物学中的应用 | 人类细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-associated (Cas) transposases (CAST) | NA | DNA | 多种人类细胞类型 |
| 429 | 2025-03-19 |
Magnetizing Biotech-Advances in (In Vivo) Magnetic Enzyme Immobilization
2025-Mar, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.70000
PMID:40083857
|
综述 | 本文综述了磁性酶固定化的现有和新兴方法，特别关注体内固定化解决方案 | 结合合成生物学和多功能材料（如磁性纳米材料）的发展，提出了新的酶固定化方法，提高了分离和纯化过程的效率 | NA | 提高工业生物催化中酶的稳定性和活性，改善酶的使用效率 | 酶固定化方法，特别是磁性蛋白固定化 | 生物技术 | NA | 磁性纳米材料 | NA | NA | NA |
| 430 | 2025-03-19 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
|
研究论文 | 本文介绍了一种快速、自动化、可扩展的高通量植物生物工程管道（FAST-PB），用于玉米和本氏烟草的基因组编辑和产物表征 | FAST-PB整合了自动化生物工厂工程与单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱（MALDI-MS），显著提高了合成生物学、基因组编辑和代谢工程的通量 | NA | 提高植物细胞中的脂质产量 | 玉米（Zea mays）和本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 合成生物学 | NA | CRISPR编辑、单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱（MALDI-MS） | NA | 单细胞脂质组学数据 | 96个载体并行构建 |
| 431 | 2025-03-19 |
Cyanobacterial type I CRISPR-Cas systems: distribution, mechanisms, and genome editing applications
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1552030
PMID:40084131
|
研究论文 | 本文深入分析了蓝藻基因组中的内源性CRISPR-Cas系统，特别是分布最广的I型系统，并总结了其在基因组编辑中的应用 | 首次全面总结了蓝藻I型CRISPR-Cas系统的DNA防御机制及其在基因组编辑中的应用，并展望了其在合成生物学中的潜力 | 未提及具体的实验验证或应用案例，主要基于已有文献的总结和分析 | 探索蓝藻I型CRISPR-Cas系统的分布、机制及其在基因组编辑中的应用 | 蓝藻及其内源性CRISPR-Cas系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 432 | 2025-03-19 |
Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1547974
PMID:40093602
|
综述 | 本文综述了植物细菌病原体诊断的现状和未来展望，从基于培养的策略发展到无培养检测 | 介绍了微拉曼光谱技术在单细胞水平上快速、无标记、非侵入性地鉴别活但不可培养病原体的创新应用 | 光谱学方法在检测先前未知的植物病原体方面存在不足 | 探讨植物细菌病原体诊断技术的发展及其应用 | 植物细菌病原体 | 植物病理学 | NA | 微拉曼光谱技术、单细胞测序、合成生物学 | NA | 光谱数据 | NA |
| 433 | 2025-03-19 |
Fungi: Pioneers of chemical creativity - Techniques and strategies to uncover fungal chemistry
2025, IMA fungus
IF:5.2Q1
DOI:10.3897/imafungus.16.142462
PMID:40093757
|
review | 本文综述了真菌在药物开发和新型化学物质发现中的重要作用，并探讨了从过去到现在天然产物发现和药物先导物识别的分析及战略框架 | 强调了利用合成生物学系统探索真菌基因组的努力，并提出了合作与协作的必要性以充分利用真菌次级代谢物的潜力 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨真菌在药物开发和新型化学物质发现中的应用及其技术进展 | 真菌及其次级代谢物 | 生物化学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 434 | 2025-03-19 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感信号放大电路，通过利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录来回收DNA链置换电路中的核酸输入 | 开发了PSR电路，扩展了无细胞生物传感的能力，实现了高特异性和低检测限的RNA目标直接传感 | NA | 扩展无细胞电路的能力，通过PSR实现信号放大，用于生物技术中的多种应用 | RNA目标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收（PSR），DNA链置换电路 | 双平衡模型 | 核酸 | NA |
| 435 | 2025-03-18 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CasGen的新型生成模型，用于设计CRISPR Cas蛋白，通过分类和基于边缘的优化来提高新生成Cas9和Cas12蛋白的质量 | CasGen是一种基于Transformer的深度生成模型，结合了分类、贝叶斯优化和AlphaFold结构验证，以增强新生成Cas蛋白的功能性和结构相似性 | 研究依赖于现有的Cas9和Cas12蛋白序列数据，可能限制了生成蛋白的多样性 | 扩展基因组编辑工具包，设计更多样化的Cas蛋白，以应用于合成生物学和治疗领域 | Cas9和Cas12蛋白 | 合成生物学 | NA | AlphaFold结构预测、BLAST序列比对 | Transformer | 蛋白质序列 | 3,021个Cas9、597个Cas12和597个非Cas蛋白序列 |
| 436 | 2025-03-18 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 本研究构建了一个微生物平台，用于高效生产具有强杀菌活性的植物源倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建了用于可持续生产这种抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂 | 关键酶TPS18的催化活性限制了5-epi-jinkoheremol的进一步产量 | 开发一种可持续的生物杀菌剂生产方法 | 5-epi-jinkoheremol | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA |
| 437 | 2025-03-17 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Mar-14, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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评论 | 本文描述了一个分析学术界与产业界在合成生物学领域接口的研讨会 | 强调了从学术研究到成功生物技术企业的转化过程中各组成部分的必要性和协作性 | 未提及具体的研究数据或案例 | 探讨如何将学术研究转化为成功的生物技术企业 | 学术界与产业界在合成生物学领域的合作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2025-03-16 |
Systematic Characterization and Analysis of the Freeze-Thaw Tolerance Gene Set in the Budding Yeast, Saccharomyces cerevisiae
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052149
PMID:40076774
|
研究论文 | 本文对酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的冻融耐受基因集进行了系统表征和分析，以优化低温培养条件下的生物合成效率 | 首次在统一的遗传背景下（BY4741实验室菌株）对冻融耐受基因家族进行标准化表征，揭示了这些基因在冻融和热激应激下的生存能力增强 | 研究仅限于BY4741实验室菌株，未涵盖其他遗传背景的酵母菌株 | 研究冻融耐受基因在低温培养条件下对酵母生存能力的影响，以优化生物合成效率 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的冻融耐受基因 | 合成生物学 | NA | 基因突变技术（KanMX6抗性盒） | NA | 基因表达数据 | BY4741实验室菌株及其突变体 |
| 439 | 2025-03-16 |
Structural Features of 5' Untranslated Region in Translational Control of Eukaryotes
2025-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051979
PMID:40076602
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综述 | 本文综述了真核生物中5'非翻译区（5' UTR）在翻译控制中的结构特征及其功能影响 | 详细阐述了5' UTR的结构特征如何独立或通过反式作用因子调节翻译，并探讨了其在合成生物学和基于mRNA的靶向治疗中的潜在应用 | NA | 探讨5' UTR在真核生物翻译控制中的作用及其在生物医学中的潜在应用 | 真核生物的5'非翻译区（5' UTR） | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2025-03-16 |
Global and gene-specific translational regulation in Escherichia coli across different conditions
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010641
PMID:36264977
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研究论文 | 本文研究了在不同条件下大肠杆菌中全局和基因特异性翻译调控的机制 | 揭示了基因特异性翻译调控的多样性，并发现许多调控翻译的基因自身也受到翻译调控，提出了可能的反馈机制 | 研究主要集中在大肠杆菌，未涉及其他细菌或更复杂的生物系统 | 探讨mRNA转录水平与蛋白质丰度之间的关系，特别是在不同环境下的翻译调控机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 全基因组转录组分析 | 随机森林模型 | mRNA和蛋白质数据 | 12种不同条件下的大肠杆菌样本 |