合成生物学相关文章
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当前共找到 4711 篇文献，本页显示第 3801 - 3820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3801 | 2024-08-07 |
Spontaneous Emergence of Multicellular Heritability
2023-08-17, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14081635
PMID:37628687
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研究论文 | 本文通过分析模型、合成生物学和生物学模拟探索了多细胞性进化过程中性状遗传性的自发出现 | 本文证实了在多细胞群体形成时，集体层面的遗传性不仅存在，而且通常比基础的细胞层面性状更具遗传性 | NA | 探索多细胞性进化过程中性状遗传性的出现 | 多细胞生物的性状遗传性 | NA | NA | 分析模型、合成生物学、生物学模拟 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3802 | 2024-08-07 |
Rapid screening of engineered microbial therapies in a 3D multicellular model
2019-04-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1820824116
PMID:30996123
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研究论文 | 本文介绍了一种细菌-球状体共培养（BSCC）平台，用于在多细胞球状体中同时测试宿主物种、治疗有效载荷和工程细菌的合成基因回路，并在几周的时间尺度上进行长期监测。 | 该平台能够高吞吐量地筛选工程微生物疗法，并动态分析多种微生物物种及其在不同宿主细胞类型中的作用。 | NA | 加速合成生物学在临床应用中的发展，并深入理解疾病部位的宿主-微生物相互作用。 | 工程细菌的宿主物种、治疗有效载荷和合成基因回路。 | 合成生物学 | 炎症、感染、代谢紊乱、癌症 | NA | NA | 多细胞球状体 | 多种微生物物种和宿主细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 3803 | 2024-08-07 |
XPORT ENTRAP: A droplet microfluidic platform for enhanced DNA transfer between microbial species
2024-Jul-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.02.003
PMID:38408724
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研究论文 | 本文介绍了一种基于液滴微流控平台的DNA增强转移系统（DNA ENTRAP），用于提高微生物间DNA转移的效率 | 利用液滴微流控技术，通过细胞封装的水-油乳液滴作为皮升体积的生物反应器，实现了XPORT介导的遗传转移效率的提升 | NA | 解决合成生物学中DNA高效引入微生物的挑战 | 微生物间的DNA转移效率 | 生物技术 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 微生物细胞 | 使用了两种不同的枯草芽孢杆菌（供体和受体） | NA | NA | NA | NA |
| 3804 | 2024-08-07 |
Multiomics unravels potential molecular switches in the C3 to CAM transition of Mesembryanthemum crystallinum
2024-May-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2024.105145
PMID:38431086
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研究论文 | 本研究利用转录组学、蛋白质组学和靶向代谢组学分析了Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用的分子变化 | 发现了新的发现，如转录本的昼夜节律调控比蛋白质更强，氧化磷酸化和肌醇甲基化可能在转变中起重要作用，V型H-ATP酶在质子泵送中的作用，以及蛋白磷酸酶2C在ABA信号通路中的潜在触发作用 | NA | 揭示Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用转变中的潜在分子开关 | Mesembryanthemum crystallinum的分子变化 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、靶向代谢组学 | NA | 转录组、蛋白质组、代谢组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3805 | 2024-08-07 |
Exploring the frontier of rapid prototyping technologies for plant synthetic biology and what could lie beyond
2024-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19650
PMID:38426415
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综述 | 本文综述了近期研究中展示的各种快速原型技术，这些技术克服了植物合成生物学中的一些瓶颈，加速了进展 | 探讨了将不同快速原型技术结合的可能性，以实现植物合成生物学的快速和可扩展部署 | 每种技术都有其局限性，限制了它们的广泛应用 | 实现植物合成生物学的全部潜力，阐明基因型与表型之间的关系，并应用这些见解来工程化性状 | 植物合成生物学中的快速原型技术 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3806 | 2024-08-07 |
Exploiting synthetic biology platforms for enhanced biosynthesis of natural products in Yarrowia lipolytica
2024-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.130614
PMID:38513925
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综述 | 本文主要回顾了合成生物学技术在Yarrowia lipolytica中的发展，并总结了近期在Y. lipolytica中合成天然产品的研究进展 | 利用合成生物学平台设计、修改甚至从头合成微生物，赋予微生物非自然功能，促进功能产品的开发 | NA | 解决天然产品供应不足的关键问题，如低产量、长生产周期和繁琐的程序 | Yarrowia lipolytica中的合成生物学技术和天然产品合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3807 | 2024-08-07 |
Two Cytochrome P450 Enzymes Form the Tricyclic Nested Skeleton of Meroterpenoids by Sequential Oxidative Reactions
2024-Apr-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c01943
PMID:38602511
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研究论文 | 本文研究了两种细胞色素P450酶在形成三环嵌套骨架过程中的氧化反应作用 | 首次发现并证明了ClaR和ClaT两种酶在clavilactone生物合成中的关键作用，特别是ClaR作为大环酶催化非萜类部分的氧化环化 | NA | 探索并阐明在clavilactone生物合成中形成10/5/3三环嵌套骨架的自然酶机制 | clavilactone的生物合成机制及其在真菌中的基因簇 | NA | NA | 细胞色素P450单加氧酶 | NA | 基因簇 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3808 | 2024-08-07 |
Characterization of CYP82 genes involved in the biosynthesis of structurally diverse benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis yanhusuo
2024-Mar-07, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-023-01397-7
PMID:38453737
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研究论文 | 本研究探讨了CYP82基因在Corydalis yanhusuo中苯并异喹啉生物碱（BIAs）生物合成中的催化功能 | 首次鉴定并表征了Corydalis yanhusuo中的CyCYP82基因，这些基因在BIAs的合成生物学中具有重要作用 | NA | 研究CYP82基因在苯并异喹啉生物碱生物合成中的作用 | Corydalis yanhusuo中的CYP82基因及其在BIAs生物合成中的功能 | 生物化学 | NA | 基因克隆 | NA | 基因序列 | 20个CyCYP82编码基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3809 | 2024-08-07 |
Adhesion of Active Cytoskeletal Vesicles
2018-12-18, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2018.10.013
PMID:30455042
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计了一个最小实验模型，用于理解形状重塑在粘附过程中的作用，特别是通过调整细胞骨架囊泡的大小、体积和细胞骨架收缩性来实现强粘附。 | 首次展示了细胞骨架囊泡在主动重塑肌动蛋白皮质的情况下能够维持与固体基质的强粘附，并揭示了变形性和粘附强度之间的平衡是实现粘附的关键。 | NA | 理解形状重塑在粘附过程中的作用 | 细胞骨架囊泡的粘附机制 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 囊泡 | 有限数量的构建块 | NA | NA | NA | NA |
| 3810 | 2024-08-07 |
Design of a Biohybrid Materials Circuit with Binary Decoder Functionality
2024-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202308092
PMID:38118057
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研究论文 | 本文设计了一种基于蛋白酶的生物混合材料电路，具有二进制解码功能 | 开发了一组可通过诱导或抑制其生物活性来调控的蛋白酶基生物混合模块，并将其应用于材料中进行信息处理 | NA | 将合成生物学中的计算功能转移到材料系统中，实现高级信息处理电路的实现 | 蛋白酶基生物混合模块及其在材料中的应用 | 生物技术 | NA | 生物工程 | NA | 生物分子 | 2输入/4输出二进制解码器 | NA | NA | NA | NA |
| 3811 | 2024-08-07 |
Multiplex Functional Characterization of Protein Variant Libraries in Mammalian Cells with Single-Copy Genomic Integration and High-Throughput DNA Sequencing
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_10
PMID:38441763
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研究论文 | 本文开发了一种利用Bxb1噬菌体DNA重组酶在细胞基因组中预设的“着陆垫”位点插入单个无启动子质粒的哺乳动物合成生物学平台，以实现大规模并行遗传分析 | 该平台通过基因组整合的启动子确保每个细胞只表达一个转基因，保持严格的基因型-表型联系，并能对选定的细胞进行测序以赋予每个变体表型评分 | NA | 开发一种新的方法来同时表征编码数千种独特蛋白质变体的库的基因型-表型关系 | 蛋白质变体库在哺乳动物细胞中的功能表征 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序 | NA | DNA序列 | 数千种独特蛋白质变体 | NA | NA | NA | NA |
| 3812 | 2024-08-07 |
A Unifying Mathematical Framework for Genetic Robustness, Environmental Robustness, Network Robustness and their Trade-offs on Phenotype Robustness in Biological Networks. Part III: Synthetic Gene Networks in Synthetic Biology
2013, Evolutionary bioinformatics online
DOI:10.4137/EBO.S10686
PMID:23515190
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研究论文 | 本文提出了一种统一的数学框架，用于研究合成生物学中合成基因网络的鲁棒稳定性和环境干扰抑制原理 | 提出了一个统一的数学框架，用于分析合成基因网络中的鲁棒性和环境干扰抑制，并定义了表型鲁棒性的标准 | NA | 研究生物网络中的鲁棒稳定性和环境干扰抑制，并探讨其在合成生物学中的应用 | 合成生物学中的合成基因网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3813 | 2024-08-07 |
Neural network-derived Potts models for structure-based protein design using backbone atomic coordinates and tertiary motifs
2023-02, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4554
PMID:36564857
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研究论文 | 本文结合基于骨干坐标和三级模体（TERMs）的神经网络模型，提出了一种新的蛋白质设计方法，通过生成Potts模型来优化蛋白质序列设计。 | 本文创新地将基于骨干坐标的特征与TERMs数据结合，提出两种神经网络架构（TERMinator和COORDinator），用于生成序列空间的Potts模型，并展示了TERMs在提高神经模型原生序列恢复性能方面的应用。 | NA | 设计新型蛋白质以执行特定功能，如结合或催化。 | 蛋白质设计方法及其在合成生物学中的应用。 | 机器学习 | NA | 神经网络模型 | Potts模型 | 骨干坐标和三级模体数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3814 | 2024-08-07 |
The genome sequence of Propionibacterium acidipropionici provides insights into its biotechnological and industrial potential
2012-Oct-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/1471-2164-13-562
PMID:23083487
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研究论文 | 本文分析了产丙酸菌Propionibacterium acidipropionici的基因组，探讨其在生物技术和工业应用中的潜力 | 发现了P. acidipropionici基因组中编码蛋白基因数量增加，涉及基因组完整性维护的基因增多，以及存在与碳代谢调控相关的基因 | 未发现磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶编码基因，但确认了丙酮酸羧化酶基因及其酶的存在 | 研究P. acidipropionici的基因组特征，评估其在化学品生产中的应用潜力 | Propionibacterium acidipropionici的基因组及其生物学功能 | NA | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 单个微生物样本Propionibacterium acidipropionici (ATCC 4875) | NA | NA | NA | NA |
| 3815 | 2024-08-07 |
CRISPRi-induced transcriptional regulation of IAH1 gene and its influence on volatile compounds profile in Kluyveromyces marxianus DU3
2024-Mar-05, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-023-03811-0
PMID:38441729
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研究论文 | 本研究利用CRISPR干扰技术下调Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因表达，并分析其对挥发性化合物代谢谱的影响 | 首次在Kluyveromyces marxianus中应用CRISPRi技术进行基因表达的靶向调控，为代谢工程和合成生物学策略提供了新途径 | NA | 研究IAH1基因下调对Kluyveromyces marxianus中挥发性化合物代谢谱的影响 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因及其编码的酯酶 | 代谢工程 | NA | CRISPR干扰技术 | NA | 基因表达数据 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 3816 | 2024-08-07 |
Fast-growing cyanobacterial chassis for synthetic biology application
2024-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2166455
PMID:36842999
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综述 | 本文综述了快速生长的蓝细菌作为合成生物学应用底盘的研究进展 | 介绍了近年来快速生长的蓝细菌新品种及其在将二氧化碳转化为化学品中的应用，以及为这些新蓝细菌底盘开发的遗传工具箱 | 当前蓝细菌底盘的生长速度慢和生物量积累低，导致大多数产品的生产率仍低于大规模商业应用所需的阈值 | 探讨开发具有快速生长和/或更高生物量积累能力的高效蓝细菌底盘 | 快速生长的蓝细菌底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3817 | 2024-08-07 |
The emerging tumor microbe microenvironment: From delineation to multidisciplinary approach-based interventions
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.018
PMID:38572104
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境中的微生物群落，探讨了其在肿瘤发生、转移、免疫监视和预后中的作用，以及多学科方法在肿瘤微生物组干预中的应用。 | 强调了肿瘤微环境中微生物群落的新角色及其对传统肿瘤微环境的多样化影响。 | NA | 深入理解癌症-免疫-微生物的相互作用，并促进基于微生物的肿瘤特异性治疗的发展。 | 肿瘤微环境中的微生物群落及其在不同类型肿瘤中的异质性。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3818 | 2024-08-07 |
BioNexusSentinel: a visual tool for bioregulatory network and cytohistological RNA-seq genetic expression profiling within the context of multicellular simulation research using ChatGPT-augmented software engineering
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae046
PMID:38571784
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研究论文 | 本文介绍了一个集成视觉平台BioNexusSentinel，用于高效探索细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | BioNexusSentinel是一个全新的系统，独特地结合了细胞组织学RNA-seq和生物调节网络探索功能，并利用ChatGPT增强的软件工程技术开发 | NA | 旨在参数化多细胞模拟研究，并开发一个集成视觉平台以提高研究效率 | 多细胞模拟研究中的细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | 基于人类蛋白质图谱数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3819 | 2024-08-07 |
Safely balancing a double-edged blade: identifying and mitigating emerging biosecurity risks in precision medicine
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1364703
PMID:38572161
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研究论文 | 本文探讨了精准医学中新兴生物安全风险的识别与缓解措施 | 提出了一个新兴学科——网络生物安全，旨在保护人类隐私、自主权和安全，与生物医学的科学和技术进步保持同步 | NA | 探讨精准医学中的双重用途风险，并提出相应的生物数据安全措施 | 精准医学中的工具和方法，以及相关的生物数据安全问题 | 精准医学 | NA | 机器学习、人工智能 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3820 | 2024-08-07 |
Engineering Cyborg Bacteria Through Intracellular Hydrogelation
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204175
PMID:36628538
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research paper | 本文首次创建了名为Cyborg Cells的混合材料-细胞实体，通过在每个细菌内部组装合成聚合物网络，使其失去分裂能力，同时保留了细胞代谢、运动、蛋白质合成等基本功能，并获得了抵抗压力因素的新能力，还展示了其对癌细胞的侵入治疗潜力。 | 首次创建了Cyborg Cells，结合了细胞内人造聚合物与活细胞蛋白质网络的相互作用，为细胞生物工程建立了新的范式。 | NA | 探索细胞生物工程的新方法，通过创建Cyborg Cells来实现更可控的生物医学应用。 | Cyborg Cells及其在生物医学应用中的潜力。 | synthetic biology | NA | intracellular hydrogelation | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |